Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A5 F50 I1 R1
|
141 |
76.7 |
2402765 |
98.4% |
2364320 |
150.1 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,750,344 |
T→C |
Y87H (TAT→CAT) |
sgbE → |
L‑ribulose‑5‑phosphate 4‑epimerase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,750,344 | 0 | T | C | 98.6%
| 243.5
/ ‑4.2
| 70 | Y87H (TAT→CAT) | sgbE | L‑ribulose‑5‑phosphate 4‑epimerase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/1); new base C (36/33); total (36/34) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.86e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.61e-01 |
ATGGATGGTAATCAAACCTTCCGGCGTCGAGTACGACGTGATGACCGCCGACGATATGGTGGTGGTTGAGATAGCCAGCGGTAAGGTGGTGGAAGGCAGCAAAAAACCCTCTTCCGATACACCAACGCATCTGGCGCTCTACCGTCGCTATGCCGAAATTGGCGGTATTGTGCATACCCACTCGCGCCACGCCACCATCTGGTCACAGGCCGGGCTGGATCTCCCCGCCTGGGGCACCACCCACGCCGATTATTTTTACGGTGCCATCCCCTGCACGCGACAGATGACCGCAGAGG > NC_000913/3750196‑3750491
|
atggatggTAATCAAACCTTCCGGCGTCGAGTACGACGTGATGACCGCCGACGATATGGTGGTGGTTGAGATAGCCAGCGGTAAGGTGGTGGAAGGCAGCAAAAAACCCTCTTCCGATACACCAACGCATCTGGCGCTCTACCGTCGCCAt < 1:552505/151‑1 (MQ=255)
ggatggTAATCAAACCTTCCGGCGTCGAGTACGACGTGATGACCGCCGACGATATGGTGGTGGTTGAGATAGCCAGCGGTAAGGTGGTGGAAGGCAGCAAAAAACCCTCTTCCGATACACCAACGCATCTGGCGCTCTACCGTCGCCATGc > 1:987056/1‑151 (MQ=255)
ggatggTAATCAAACCTTCCGGCGTCGAGTACGACGTGATGACCGCCGACGATATGGTGGTGGTTGAGATAGCCAGCGGTAAGGTGGTGGAAGGCAGCAAAAAACCCTCTTCCGATACACCAACGCATCTGGCGCTCTACCGTCGCCATGc > 2:217644/1‑151 (MQ=255)
ggTAATCAAACCTTCCGGCGTCGAGTACGACGTGATGACCGCCGACGATATGGTGGTGGTTGAGATAGCCAGCGGTAAGGTGGTGGAAGGCAGCAAAAAACCCTCTTCCGATACACCAACGCATCTGGCGCTCTACCGTCGCCATGCCGa < 1:561538/150‑1 (MQ=255)
gTAATCAAACCTTCCGGCGTCGAGTACGACGTGATGACCGCCGACGATATGGTGGTGGTTGAGATAGCCAGCGGTAAGGTGGTGGAAGGCAGCAAAAAACCCTCTTCCGATACACCAACGCATCTGGCGCTCTACCGTCGCCATGCCGaaa < 2:282491/151‑1 (MQ=255)
gTAATCAAACCTTCCGGCGTCGAGTACGACGTGATGACCGCCGACGATATGGTGGTGGTTGAGATAGCCAGCGGTAAGGTGGTGGAAGGCAGCAAAAAACCCTCTTCCGATACACCAACGCATCTGGCGCTCTACCGTCGCCATGCCGaa > 1:377457/1‑150 (MQ=255)
aaTCAAACCTTCCGGCGTCGAGTACGACGTGATGACCGCCGACGATATGGTGGTGGTTGAGATAGCCAGCGGTAAGGTGGTGGAAGGCAGCAAAAAACCCTCTTCCGATACACCAACGCATCTGGCGCTCTACCGTCGCCATGCCGAAAtt < 2:1179924/151‑1 (MQ=255)
tCAAACCTTCCGGCGTCGAGTACGACGTGATGACCGCCGACGATATGGTGGTGGTTGAGATAGCCAGCGGTAAGGTGGTGGAAGGCAGCAAAAAACCCTCTTCCGATACACCAACGCATCTGGCGCTCTACCGTCGCCATGCCGAAATTgg > 1:739760/1‑151 (MQ=255)
tCAAACCTTCCGGCGTCGAGTACGACGTGATGACCGCCGACGATATGGTGGCGGTTGAGATAGCCAGCGGTAAGGTGGTGGAAGGCAGCAAAAAACCCTCTTCCGATACACCAACGCATCTGGCGCTCTACCGTCGCCATGCCGAAATTgg > 2:294951/1‑151 (MQ=255)
tCAAACCTTCCGGCGTCGAGTACGACGGGATGACCGCCGACGATATGGTGGTGGTGGAGATAGCCAGCGGTAAGGGGGTGGAAGGCAGCAAAAAACCCTCTTCCGATACACCAACGCATCTGGCGCTCTACCGGCGCCATGCCGAAATTgg > 1:974035/1‑151 (MQ=255)
aaaCCTTCCGGCGTCGAGTACGACGTGATGACCGCCGACGATATGGTGGTGGTTGAGATAGCCAGCGGTAAGGTGGTGGAAGGCAGCAAAAAACCCTCTTCCGATACACCAACGCATCTGGCGCTCTACCGTCGCCATGCCGAAATTGGCg < 2:792713/151‑1 (MQ=255)
aaaCCTTCCGGCGTCGAGTACGACGTGATGACCGCCGACGATATGGTGGTGGTTGAGATAGCCAGCGGTAAGGTGGTGGAAGGCAGCAAAAAACCCTCTTCCGATACACCAACGCATCTGGCGCTCTACCGTCGCCATGCCGAAATTGGCg > 1:870882/1‑151 (MQ=255)
aaCCTTCCGGCGTCGAGTACGACGTGATGACCGCCGACGATATGGTGGTGGTTGAGATAGCCAGCGGTAAGGTGGTGGAAGGCAGCAAAAAACCCTCTTCCGATACACCAACGCATCTGGCGCTCTACCGTCGCCATGCCGAAATTGGCgg > 1:1089617/1‑151 (MQ=255)
ggCGTCGAGTACGACGTGATGACCGCCGACGATATGGTGGTGGTTGAGATAGCCAGCGGTAAGGTGGGGGAAGGCAGCAAAAAACCCTCTTCCGATACACCAACGCATCTGGCGCTCTACCGTCGCCATGCCGAAATTGGCGGTATTGTGc > 1:104795/1‑151 (MQ=255)
aGTACGACGTGATGACCGCCGACGATATGGTGGTGGTTGAGATAGCCAGCGGTAAGGTGGTGGAAGGCAGCAAAAAACCCTCTTCCGATACACCAACGCATCTGGCGCTCTACCGTCGCCATGCCGAAATTGGCGGTATTGTGCATACCCa < 1:926479/151‑1 (MQ=255)
acgacgTGATGACCGCCGACGATATGGTGGTGGTTGAGATAGCCAGCGGTAAGGTGGTGGAAGGCAGCAAAAAACCCTCTTCCGATACACCAACGCATCTGGCGCTCTACCGTCGCCATGCCGAAATTGGCGGTATTGTGCATACCCACTc > 2:475864/1‑151 (MQ=255)
acgacgTGATGACCGCCGACGATATGGTGGTGGTTGAGATAGCCAGCGGTAAGGTGGTGGAAGGCAGCAAAAAACCCTCTTCCGATACACCAACGCATCTGGCGCTCTACCGTCGCCATGCCGAAATTGGCGGTATTGTGCATACCCACTc > 2:998955/1‑151 (MQ=255)
acgacgTGATGACCGCCGACGATATGGTGGTGGTTGAGATAGCCAGCGGTAAGGTGGTGGAAGGCAGCAAAAAACCCTCTTCCGATACACCAACGCATCTGGCGCTCTACCGTCGCCATGCCGAAATTGGCGGTATTGTGCATACCCACTc < 2:987079/151‑1 (MQ=255)
cgacgTGATGACCGCCGACGATATGGTGGTGGTTGAGATAGCCAGCGGTAAGGTGGTGGAAGGCAGCAAAAAACCCTCTTCCGATACACCAACGCATCTGGCGCTCTACCGTCGCCATGCCGAAATTGGCGGTATTGTGCATACCCACTcg < 1:766117/151‑1 (MQ=255)
gacgTGATGACCGCCGACGATATGGTGGTGGTTGAGATAGCCAGCGGTAAGGTGGTGGAAGGCAGCAAAAAACCCTCTTCCGATACACCAACGCATCTGGCGCTCTACCGTCGCCATGCCGAAATTGGCGGTATTGTGCATACCCACTcg > 1:308511/1‑150 (MQ=255)
gacgTGATGACCGCCGACGATATGGTGGTGGTTGAGATAGCCAGCGGTAAGGTGGGGGAAGGCAGCAAAAAACCCTCTTCCGATACACCAACGCATCTGGCGCTCTACCGTCGCCATGCCGAAATTGGCGGTATTGTGCAAAccc > 1:353943/1‑145 (MQ=255)
acgTGATGACCGCCGACGATATGGTGGTGGTTGAGATAGCCAGCGGTAAGGTGGTGGAAGGCAGCAAAAAACCCTCTTCCGATACACCAACGCATCTGGCGCTCTACCGTCGCCATGCCGAAATTGGCGGTATTGTGCATACCCACTcgc > 2:591715/1‑150 (MQ=255)
gTGATGACCGCCGACGATATGGTGGTGGTTGAGATAGCCAGCGGTAAGGTGGTGGAAGGCAGCAAAAAACCCTCTTCCGATACACCAACGCATCTGGCGCTCTACCGTCGCCATGCCGAAATTGGCGGTATTGTGCATACCCACTCgcgc < 1:394170/150‑1 (MQ=255)
cgccgACGATATGGTGGTGGTTGAGATAGCCAGCGGTAAGGTGGTGGAAGGCAGCAAAAAACCCTCTTCCGATACACCAACGCATCTGGCGCTCTACCGTCGCCATGCCGAAATTGGCGGTATTGTGCATACCCACTCGCGCCACGccacc > 1:488796/1‑151 (MQ=255)
ccgACGATATGGTGGTGGTTGAGATAGCCAGCGGTAAGGTGGTGGAAGGCAGCAAAAAACCCTCTTCCGATACACCAACGCATCTGGCGCTCTACCGTCGCCATGCCGAAATTGGCGGTATTGTGCATACCCACTCGCGCCACGccacc > 1:720177/1‑149 (MQ=255)
ccgACGATATGGTGGTGGTTGAGATAGCCAGCGGTAAGGTGGTGGAAGGCAGCAAAAAACCCTCTTCCGATACACCAACGCATCTGGCGCTCTACCGTCGCCATGCCGAAATTGGCGGTATTGTGCATACCCACTCGCGCCACGCCACCAt < 2:585880/151‑1 (MQ=255)
cgacgaTATGGTGGTGGTTGAGATAGCCAGCGGTAAGGTGGTGGAAGGCAGCAAAAAACCCTCTTCCGATACACCAACGCATCTGGCGCTCTACCGTCGCCATGCCGAAATTGGCGGTATTGTGCATACCCACTCGCGCCACGCCACCATc < 1:1100763/151‑1 (MQ=255)
cgaTATGGTGGTGGTTGAGATAGCCAGCGGTAAGGTGGTGGAAGGCAGCAAAAAACCCTCTTCCGATACACCAACGCATCTGGCGCTCTACCGTCGCCATGCCGAAATTGGCGGTATTGTGCATACCCACTCGCGCCACGCCACCATCTgg > 2:152431/1‑151 (MQ=255)
gaTATGGTGGTGGTTGAGATAGCCAGCGGTAAGGTGGTGGAAGGCAGCAAAAAACCCTCTTCCGATACACCAACGCATCTGGCGCTCTACCGTCGCCATGCCGAAATTGGCGGTATTGTGCATACCCACTCGCGCCACGCCACCATCTGGt < 1:683485/151‑1 (MQ=255)
tatGGTGGTGGTTGAGATAGCCAGCGGTAAGGTGGTGGAAGGCAGCAAAAAACCCTCTTCCGATACACCAACGCATCTGGCGCTCTACCGTCGCCATGCCGAAATTGGCGGTATTGTGCATACCCACTCGCGCCACGCCACCATCTGGTc > 1:970494/1‑150 (MQ=255)
gtggtggtTGAGATAGCCAGCGGTAAGGTGGTGGAAGGCAGCAAAAAACCCTCTTCCGATACACCAACGCATCTGGCGCTCTACCGTCGCCATGCCGAAATTGGCGGTATTGTGCATACCCACTCGCGCCACGCCACCATCTGGTCACAgg > 2:960332/1‑151 (MQ=255)
gtTGAGATAGCCAGCGGTAAGGTGGTGGAAGGCAGCAAAAAACCCTCTTCCGATACACCAACGCATCTGGCGCTCTACCGTCGCCATGCCGAAATTGGCGGTATTGTGCATACCCACTCGCGCCACGCCACCATCTGGTCACAGGCCgg > 1:614657/1‑149 (MQ=255)
tGAGATAGCCAGCGGTAAGGTGGTGGAAGGCAGCAAAAAACCCTCTTCCGATACACCAACGCATCTGGCGCTCTACCGTCGCCATGCCGAAATTGGCGGTATTGTGCATACCCACTCGCGCCACGCCACCATCTGGTCACAGGCCGGGCt < 1:171605/150‑1 (MQ=255)
cAGCGGTAAGGTGGTGGAAGGCAGCAAAAAACCCTCTTCCGATACACCAACGCATCTGGCGCTCTACCGTCGCCATGCCGAAATTGGCGGTATTGTGCATACCCACTCGCGCCACGCCACCATCTGGTCACAGGCCGGGCTGGATCTcccc < 2:1050781/151‑1 (MQ=255)
aaGGTGGTGGAAGGCAGCAAAAACCCCTCTTCCGATACACCAACGCATCTGGCGCTCTACCGTCGCCATGCCGAAATTGGCGGTATTGTGCATACCCACTCGCGCCACGCCACCATCTGGTCACAGGCCGGGCTGGATCTCCCCGCCTgg < 1:70715/150‑1 (MQ=255)
aaGGTGGTGGAAGGCAGCAAAAAACCCTCTTCCGATACACCAACGCATCTGGCGCTCTACCGTCGCCATGCCGAAATTGGCGGTATTGTGCATCCCCACTCGCGCCACGCCACCATCTGGTCACAGGCCGGGCTGGATCTCCCCGCCTggg < 2:547295/151‑1 (MQ=255)
ggAAGGCAGAAAAAAACCCTCTTCCGATCCACCAACGCATCTGGCGCTCTACCGTCGCCATGCCGAAATTGGCGGTATTGTGCATACCCACTCGCGCCACGCCACCATCTGTTCACAGGCCGGGCTGGATCTCCCCGCCTGGGGcaccac < 2:589533/150‑1 (MQ=255)
agcaAAAAACCCTCTTCCGATACACCAACGCATCTGGCGCTCTACCGTCGCCATGCCGAAATTGGCGGTATTGTGCATACCCACTCGCGCCACGCCACCATCTGGTCACAGGCCGGGCTGGATTTCCCCGCCTGGGGCACCACCCACGcc < 1:1150612/150‑1 (MQ=255)
agcaAAAAACCCTCTTCCGATACACCAACGCATCTGGCGCTCTACCGTCGCCATGCCGAAATTGGCGGTATTGTGCATACCCACTCGCGCCACGCCACCATCTGGTCACAGGCCGGGCTGGATCTCCCCGCCTGGGGCACCACCCACGCCg > 2:1094225/1‑151 (MQ=255)
agcaAAAAACCCTCTTCCGATACACCAACGCATCTGGCGCTCTACCGTCGCCATGCCGAAATTGGCGGTATTGTGCATACCCACTCGCGCCACGCCACCATCTGGTCACAGGCCGGGCCGGATCTCCCCGCCTGGGGCACCACCCACGCCg > 2:430527/1‑151 (MQ=255)
caAAAAACCCTCTTCCGATACACCAACGCATCTGGCGCTCTACCGTCGCCATGCCGAAATTGGCGGTATTGTGCATACCCACTCGCGCCACGCCACCATCTGGTCACAGGCCGGGCTGGATCTCCCCGCCTGGGGCACCACCCACGCCGa < 2:931955/150‑1 (MQ=255)
aaaaaaCCCTCTTCCGATACACCACCGCATCTGGCGCTCTACCGTCGCCATGCCGAAAGTGGCGGTATTGTGCGTACCCCCTCGCGCCACGCCACCATCTGGTCACAGGCGGGCCTGGATCTCCCCGCCTGGGGCCCCACCCACGCCGatt < 1:622446/151‑1 (MQ=255)
aaaaaaCCCTCTTCCGATACACCAACGCATCTGGCGCTCTACCGTCGCCATGCCGAAATTGGCGGTATTGTGCATACCCACTCGCGCCACGCCACCATCTGGTCACAGGCCGGGCTGGATCTCCCCGCCTGGGGCACCACCCACGCCGatt < 2:947488/151‑1 (MQ=255)
aaaaaaCCCTCTTCCGATACACCAACGCATCTGGCGCTCTACCGTCGCCATGCCGAAATTGGCGGTATTGTGCATACCCACTCGCGCCACGCCACCATCTGGTCACAGGCCGGGCTGGATCTCCCCGCCTGGGGCACCACCCACGCCGatt > 1:535303/1‑151 (MQ=255)
aaaaCCCTCTTCCGATACACCAACGCATCTGGCGCTCTACCGTCGCCATGCCGAAATTGGCGGTATTGTGCATACCCACTCGCGCCACGCCACCATCTGGTCACAGGCCGGGCTGGATCTCCCCGCCTGGGGCACCACCCACGCCGattat > 2:562783/1‑151 (MQ=255)
ccTCTTCCGATACACCAACGCATCTGGCGCTCTACCGTCGCCATGCCGAAATTGGCGGTATTGTGCATACCCACTCGCGCCACGCCACCATCTGGTCACAGGCCGGGCTGGATCTCCCCGCCTGGGGCACCACCCACGCCGATTAttttt > 2:1093141/1‑150 (MQ=255)
ccTCTTCCGATACACCAACGCATCTGGCGCTCTACCGTCGCCATGCCGAAATTGGCGGTATTGTGCATACCCACTCGCGCCACGCCACCATCTGGTCACAGGCCGGGCTGGATCTCCCCGCCTGGGGCACCACCCACGCCGATTAttttt > 2:483790/1‑150 (MQ=255)
ctTCCGATACACCAACGCATCTGGCGCTCTACCGTCGCCATGCCGAAATTGGCGGTATTGTGCATACCCACTCGCGCCACGCCACCATCTGGTCACAGGCCGGGCTGGATCTCCCCGCCTGGGGCACCACCCACGCCGATTATTTTTACgg > 1:509362/1‑151 (MQ=255)
ccGATACGCCAACGCATCTGGCGCTCTACCGTCGCTATGCCGAAATTGGCGGTATTGTGCATACCCACTGGCGCCACGCCACAATCTGGTCACAGGCCGGGCGGGATCTCCCCGCCTGGGGCACCACCCACGCCGATTATTTTTACGGTg < 2:988687/150‑1 (MQ=255)
cGATACACCAACGCATCTGGCGCTCTACCGTCGCCATGCCGAAATTGGCGGTATTGTGCATACCCACTCGCGCCACGCCACCATCTGGTCACAGGCCGGGCTGGATCTCCCCGCCTGGGGCACCACCCACGCCGATTATTTTTACGGTGcc > 2:388286/1‑151 (MQ=255)
caccacCGCATCTGGCGCTCTCCCGTCGCCATGCCGAAATTGGCGTTATTGTGCATCCCCACTCGCGCCACGCCACCATCTGGTCACAGGCCGGGCTGGATCTCCCCGCCTGGGGCACCACCCACGCCGATTATTTTTACGGTGCCATcc < 1:156846/150‑1 (MQ=255)
cacCAACGCATCTGGCGCTCTACCGTCGCCATGCCGAAATTGGCGGTATTGTGCATACCCACTCGCGCCACGCCACCATCTGGTCACAGGCCGGGCTGGATCTCCCCGCCTGGGGCACCACCCACGCCGATTATTTTTACGGTGCCATccc < 2:502171/151‑1 (MQ=255)
cacCAACGCATCTGGCGCTCTACCGTCGCCATGCCGAAATTGGCGGTATTGTGCATACCCACTCGCGCCACGCCACCATCTGGTCACAGGCCGGGCTGGATCTCCCCGCCTGGGGCACCACCCACGCCGATTATTTTTACGGTGCCATccc > 1:746767/1‑151 (MQ=255)
cacCAACGCATCTGGCGCTCTACCGTCGCCATGCCGAAATTGGCGGTATTGTGCATACCCACTCGCGCCACGCCACCATCTGGTCACAGGCCGGGCTGGATCTCCCCGCCTGGGGCACCACCCACGCCGATTATTTTTACGGTGCCATcc < 1:695649/150‑1 (MQ=255)
ccAACGCATCTGGCGCTCTACCGTCGCCATGCCGAAATTGGCGGTATTGTGCATACCCACTCGCGCCACGCCACCATCTGGTCACAGGCCGGGCTGGATCTCCCCGCCTGGGGCACCACCCACGCCGATTATTTTTACGGTGCCATCCCCt < 2:739770/151‑1 (MQ=255)
ccAACGCATCTGGCGCTCTACCGTCGCCATGCCGAAATTGGCGGTATTGTGCATACCCACTCGCGCCACGCCACCATCTGGTCACAGGCCGGGCTGGATCTCCCCGCCTGGGGCACCACCCACGCCGATTATTTTTACGGTGCCATCCCCt < 1:252770/151‑1 (MQ=255)
ccAACGCATCTGGCGCTCTACCGTCGCCATGCCGAAATTGGCGGTATTGTGCATACCCACTCGCGCCACGCCACCATCTGGTCACAGGCCGGGCTGGATCTCCCCGCCTGGGGCACCACCCACGCCGATTATTTTTACGGTGCCATCCCCt > 2:419735/1‑151 (MQ=255)
cAACGCATCTGGCGCTCTACCGTCGCCATGCCGAAATTGGCGGTATTGTGCATACCCACTCGCGCCACGCCACCATCTGGTCACAGGCCGGGCTGGATCTCCCCGCCTGGGGCACCCCCCACGCCGATTATTTTTACGGTGCCATCCCCt > 1:145677/1‑150 (MQ=255)
aaCGCATCTGGCGCTCTACCGTCGCCATGCCGAAATTGGCGGTATTGTGCATACCCACTCGCGCCACGCCACCATCTGGTCACAGGCCGGGCTGGATCTCCCCGCCTGGGGCACCACCCACGCCGATTATTTTTACGGTGCCATCCCCTGc > 1:782052/1‑151 (MQ=255)
cGCATCTGGCGCTCTACCGTCGCCATGCCGAAATTGGCGGTATTGTGCATACCCACTCGCGCCACGCCACCATCTGGTCACAGGCCGGGCTGGATCTCCCCGCCTGGGGCACCACCCACGCCGATTATTTTTACGGTGCCATCCCCTGCa < 2:625781/150‑1 (MQ=255)
cGCATCTGGCGCTCTACCGTCGCCATGCCGAAATTGGCGGTATTGTGCATACCCACTCGCGCCACGCCACCATCTGGTCACAGGCCGGGCTGGATCTCCCCGCCTGGGGCACCACCCACGCCGATTATTTTTACGGTGCCATCCCCTGCAc < 1:1129668/151‑1 (MQ=255)
aTCTGGCGCTCTACCGTCGCCATGCCGAAATTGGCGGTATTTTGCATACCCACTCGCGCCACGCCACCATCTGGTCACAGGCCGGGCTGGATCTCCCCGCCTGGGGCACCACCCACGCCGATTATTTTTACGGTGCCATCCCCTGCAcgc > 2:677515/1‑150 (MQ=255)
tCTGGCGCTCTACCGTCGCCATGCCGAAATTGGCGGCATTGAGCATACCCACTCGCGCCACGCCACCATCTGGTCACAGGCCGGGCTGGATCTCCCCGCCTGGGGCACCACCCACGCCGATTATTTTTACGGTGCCATCCCCTGCAcgcg > 1:127921/1‑150 (MQ=255)
tGGCGCTCTACCGTCGCCATGCCGAAATTGGCGGTATTGTGCATACCCACTCGCGCCACGCCACCATCTGGTCACAGGCCGGGCTGGATCTCCCCGCCTGGGGCACCACCCACGCCGATTATTTTTACGGTGCCATCCCCTGCACGCGAc > 1:663372/1‑150 (MQ=255)
aCCGTCGCCATGCCGAAATTGGCGTTATTGTGCATACCCACTCGCGCCACGCCACCATCTGGTCACAGGCCGGGCTGGATCTCCCCGCCTGGGGCACCACCCACGCCGATTATTTTTACGGTGCCATCCCCTGCACGCGACAGATGACCg < 1:341675/150‑1 (MQ=255)
aCCGTCGCCATGCCGAAATTGGCGGTATTGTGCATACCCACTCGCGCCACGCCACCATCTGGTCACAGGCCGGGCTGGATCTCCCCGCCTGGGGCACCACCCACGCCGATTATTTTTACGGTGCCATCCCCTGCACGCGACAGATGAc < 2:368218/148‑1 (MQ=255)
ccGTCGCCATGCCGAAATTGGCGGTTTTGTGCATACCCACTCCTGCCCGGCCTCCATCTGCTCCCAGGCCGGCGTGGATCTCCCCGCCTGGGGCACCACCCACGCCGATTATTTTTACGGTGCCATCCCCTGCACGCGACAGATGACCg < 1:270593/149‑1 (MQ=255)
ccGTCGCCATGCCGAAATTGGCGGTATTGTGCATACCCACTCGCGCCACGCCACCATCTGGTCACAGGCCGGGCTGGATCTCCCCGCCTGGGGCACCACCCACGCCGATTATTTTTACGGTGCCATCCCCTGCACGCGACAGATGACCg > 1:548351/1‑149 (MQ=255)
cGCCATGCCGAAATTGGCGGTATTGTGCATACCCACTCGCGCCACGCCACCATCTGGTCACAGGCCGGGCTGGATCTCCCCGCCTGGGGCACCACCCACGCCGATTATTTTTACGGTGCCATCCCCTGCACGTGACAGATGACCGCAgagg < 2:82301/151‑1 (MQ=255)
cGCCATGCCGAAATTGGCGGTATTGTGCATACCCACTCGCGCCACGCCACCATCTGGTCACAGGCCGGGCTGGATCTCCCCGCCTGGGGCACCACCCACGCCGATTATTTTTACGGTGCCATCCCCTGCACGCGACAGATGACCGCagag < 2:835576/150‑1 (MQ=255)
|
ATGGATGGTAATCAAACCTTCCGGCGTCGAGTACGACGTGATGACCGCCGACGATATGGTGGTGGTTGAGATAGCCAGCGGTAAGGTGGTGGAAGGCAGCAAAAAACCCTCTTCCGATACACCAACGCATCTGGCGCTCTACCGTCGCTATGCCGAAATTGGCGGTATTGTGCATACCCACTCGCGCCACGCCACCATCTGGTCACAGGCCGGGCTGGATCTCCCCGCCTGGGGCACCACCCACGCCGATTATTTTTACGGTGCCATCCCCTGCACGCGACAGATGACCGCAGAGG > NC_000913/3750196‑3750491
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
