Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F50 I2 R1
|
121 |
82.0 |
2593086 |
97.7% |
2533445 |
150.3 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,808,515 |
T→C |
pseudogene (200/261 nt) |
ygaY → |
pseudogene, major facilitator transporter superfamily;putative transport; Not classified; putative transport protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,808,515 | 0 | T | C | 100.0%
| 251.9
/ NA
| 71 | pseudogene (200/261 nt) | ygaY | pseudogene, major facilitator transporter superfamily;putative transport; Not classified; putative transport protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (28/43); total (28/43) |
CACCGGTCTGGCGGTAGCCAGTAACTATTACGCCCAGCCATTGCTCGACACCATCGCGCGTAACTTTTCCCTTTCCGCCAGTTCGGCAGGCTTTATTGTTACCGCCGCGCAGTTGGGCTATGCCGCAGGTCTACTGTTTCTTGTTCCCCTCGGTGATATGTTTGAACGCCGCCGCCTGATTGTCTCGATGACCTTACTGGCGGCATGTTGATTACCGCCAGCAGTCAGTCGCTGGCGATGATGATCCTCGGTACGGCATTAACCGGTTTATTCTCAGTCGTGGCACA > NC_000913/2808372‑2808658
|
cACCGGTCTGGCGGTAGCCAGTAACTATTACGCCCAGCCATTGCTCGACACCATCGCGCGTAACTTTTCCCTTTCCGCCAGTTCGGCAGGCTTTATTGTTACCGCCGCGCAGTTGGGCTATGCCGCAGGTCTACTGTTTCTTGCTCCCCTc < 1:1263008/151‑1 (MQ=255)
cACCGGTCTGGCGGTAGCCAGTAACTATTACGCCCAGCCATTGCTCGACACCATCGCGCGTAACTTTTCCCTTTCCGCCAGTTCGGCAGGCTTTATTGTTACCGCCGCGCAGTTGGGCTATGCCGCAGGTCTACTGTTTCTTGCTCCCCTc < 2:766916/151‑1 (MQ=255)
aCCGGTCTGGCGGTAGCCAGTAACTATTACGCCCAGCCATTGCTCGACACCATCGCGCGTAACTTTTCCCTTTCCGCCAGTTCGGCAGGCTTTATTGTTACCGCCGCGCAGTTGGGCTATGCCGCAGGTCTACTGTTTCTTGCTCCCCTCg < 2:610987/151‑1 (MQ=255)
ccGGTCTGGCGGTAGCCAGTAACTATTACGCCCAGCCATTGCTCGCCACCATCGCGCGTAACTTTTCCCTTTCCGCCAGTTCGGCAGGCTTTATTGTTACCGCCGCGCAGTTGGGCTATGCCGCAGGTCTACTGTTTCTTGCTCCCCTCg < 1:1202499/150‑1 (MQ=255)
ccGGTCTGGCGATAGCCAGTAACTATTACGCCCAGCCATTGCTCGACACCATCGCGCGTAACTTTTCCCTTTCCGCCAGTTCGGCAGGCTTTATTTTTACCGCCGCGCAGTTGGGCTATGCCGCAGGTCTACTGTTTCTTGCTCCCCTCgg < 2:171460/151‑1 (MQ=255)
gTCTGGCGGTAGCCAGTAACTATTACGCCCAGCCATTGCTCGACACCATCGCGCGTAACTTTTCCCTTTCCGCCAGTTCGGCAGGCTTTATTGTTACCGCCGCGCAGTTGGGCTATGCCGCAGGTCTACTGTTTCTTGCTCCCCTCGGTGa < 1:214873/151‑1 (MQ=255)
ggCGGTAGCCAGTAACTATTACGCCCAGCCATTGCTCGACACCATCGCGCGTAACTTTTCCCTTTCCGCCAGTTCGGCAGGCTTTATTGTTACCGCCGCGCAGTTGGGCTATGCCGCAGGTCTACTGTTTCTTGCTCCCCTCGGTGATATg < 1:725194/151‑1 (MQ=255)
gCCAGTAACTATTACGCCCAGCCATTGCTCGACACCATCGCGCGTAACTTTTCCCTTTCCGCCAGTTCGGCAGGCTTTATTGTTACCGCCGCGCAGTTGGGCTATGCCGCAGGTCTACTGTTTCTTGCTCCCCTCGGTGATATGTTTGaa < 1:37105/150‑1 (MQ=255)
gCCAGTAACTATTACGCCCAGCCATTGCTCGACACCATCGCGCGTAACTTTTCCCTTTCCGCCAGTTCGGCAGGCTTTATTGTTACCGCCGCGCAGTTGGGCTATGCCGCAGGTCTACTGTTTCTTGCTCCCCTCGGTGATATGTTTGAAc < 1:896983/151‑1 (MQ=255)
aCTATTACGCCCAGCCATTGCTCGACACCATCGCGCGTAACTTTTCCCTTTCCGCCAGTTCGGCAGGCTTTATTGTTACCGCCGCGCAGTTGGGCTATGCCGCAGGTCTACTGTTTCTTGCTCCCCTCGGTGATATGTTTGAAcgccgccg > 2:822963/1‑151 (MQ=255)
aTTACGCCCAGCCATTGCTCGACACCATCGCGCGTAACTTTTCCCTTTCCGCCAGTTCGGCAGGCTTTATTGTTACCGCCGCGCAGTTGGGCTATGCCGCAGGTCTACTGTTTCTTGCTCCCCTCGGTGATATGTTTGAACgccgccgcc < 1:435751/150‑1 (MQ=255)
aTTACGCCCAGCCATTGCTCGACACCATCGCGCGTAACTTTTCCCTTTCCGCCAGTTCGGCAGGCTTTATTGTTACCGCCGCGCAGTTGGGCTATGCCGCAGGTCTACTGTTTCTTGCTCCCCTCGGTGATATGTTTGAACGCCGCCGCCt > 2:429725/1‑151 (MQ=255)
aCGCCCAGCCATTGCTCGACACCATCGCGCGTAACTTTTCCCTTTCCGCCAGTTCGGCAGGCTTTATTGTTACCGCCGCGCAGTTGGGCTATGCCGCAGGTCTACTGTTTCTTGCTCCCCTCGGTGATATGTTTGAACGCCGCCGCCTGAt > 1:1109446/1‑151 (MQ=255)
aCGCCCAGCCATTGCTCGACACCATCGCGCGTAACTTTTCCCTTTCCGCCAGTTCGGCAGGCTTTATTGTTACCGCCGCGCAGTTGGGCTATGCCGCAGGTCTACTGTTTCTTGCTCCCCTCGGTGATATGTTTGAACGCCGCCGCCTGAt > 2:289106/1‑151 (MQ=255)
gCCCAGCCATTGCTCGACACCATCGCGCGTAACTTTTCCCTTTCCGCCAGTTCGGCAGGCTTTATTGTTACCGCCGCGCAGTTGGGCTATGCCGCAGGTCTACTGTTTCTTGCTCCCCTCGGTGATATGTTTGAACGCCGCCGCCTGATTg > 2:264224/1‑151 (MQ=255)
gCCATTGCTCGACACCATCGCGCGTAACTTTTCCCTTTCCGCCAGTTCGGCAGGCTTTATTGTTACCGCCGCGCAGTTGGGCTATGCCGCAGGTCTACTGTTTCTTGCTCCCCTCGGTGATATGTTTGAACGCCGCCGCCTGATTGTCTCg < 1:975904/151‑1 (MQ=255)
aTTGCTCGACACCATCGCGCGTAACTTTTCCCTTTCCGCCAGTTCGGCAGGCTTTATTGTTACCGCCGCGCAGTTGGGCTATGCCGCAGGTCTACTGTTTCTTGCTCCCCTCGGTGATATGTTTGAACGCCGCCGCCTGATTGTCTCGATg < 1:1052809/151‑1 (MQ=255)
aTTGCTCGACACCATCGCGCGTAACTTTTCCCTTTCCGCCAGTTCGGCAGGCTTTATTGTTACCGCCGCGCAGTTGGGCTATGCCGCAGGTCTACTGTTTCTTGCTCCCCTCGGTGATATGTTTGAACGCCGCCGCCTGATTGTCTCGATg < 2:751501/151‑1 (MQ=255)
gCTCGACACCATCGCGCGTAACTTTTCCCTTTCCGCCAGTTCGGCAGGCTTTATTGTTACCGCCGCGCAGTTGGGCTATGCCGCAGGTCTACTGTTTCTTGCTCCCCTCGGTGATATGTTTGAACGCCGCCGCCTGATTGTCTCGATGAcc > 1:603410/1‑151 (MQ=255)
cTCGACACCATCGCGCGTAACTTTTCCCTTTCCGCCAGTTCGGCAGGCTTTATTGTTACCGCCGCGCAGTTGGGCTATGCCGCAGGTCTACTGTTTCTTGCTCCCCTCGGTGTTATGTTTGAACGCCGCCGCCTGATTGTCTCGATGACCt > 2:428059/1‑151 (MQ=255)
tCGACACCATCGCGCGTAACTTTTCCCTTTCCGCCAGTTCGGCAGGCTTTATTGTTACCGCCGCGCAGTTGGGCTATGCCGCAGGGCTACTGTTTCTTGCTCCCCTCGGTGATATGTTTGAACGCCGCCGCCTGATTGTCTCGATGACCtt > 2:160346/1‑151 (MQ=255)
cGACACCATCGCGCGTAACTTTTCCCTTTCCGCCAGTTCGGCAGGCTTTATTGTTACCGCCGCGCAGTTGGGCTATGCCGCAGGTCTACTGTTTCTTGCTCCCCTCGGTGATATGTTTGAACGCCGCCGCCTGATTGTCTCGATGACCtt < 1:1022970/150‑1 (MQ=255)
cGACAACACCGCGCGAACCTTTTCCCTTCGCGCGGGTTGGGCAGGCTTTACTGTCAAGGCCGCGCAGTTGGGCTATGCCGCAGGTCTACTGTTTCTTGCTCCCCTCGGTGATATGTTTGAACGCCGCCGGCTGATTGTCTCGATGa < 1:571726/146‑1 (MQ=255)
cATCGCGCGTAACTTTTCCCTTTCCGCCAGTTCGGCAGGCTTTATTGTTACCGCCGCGCAGTTGGGCTATGCCGCAGGTCTACTGTTTCTTGCTCCCCTCGGTGATATGTTTGAACGCCGCCGCCTGATTGTCTCGATGACCTTACTggcg > 2:41537/1‑151 (MQ=255)
tCGCGCGTAACTTTTCCCTTTCCGCCAGTTCGGCAGGCTTTATTGTTACCGCCGCGCAGTTGGGCTATGCCGCAGGTCTACTGTTTCTTGCTCCCCTCGGTGATATGTTTGAACGCCGCCGCCTGATTGTCTCGATGACCTTACTggcggc > 1:355905/1‑151 (MQ=255)
cgcgcgTAACTTTTCCCTTTCCGCCAGTTCGGCAGGCTTTATTGTTACCGCCGCGCAGTTGGGCTATGCCGCAGGTCTACTGTTTCTTGCTCCCCTCGGTGATATGTTTGAACGCCGCCGCCTGATTGTCTCGATGACCTTACTGGCGGCa < 1:815994/151‑1 (MQ=255)
gcgcgTAACTTTTCCCTTTCCGCCAGTTCGGCAGGCTTTATTGTTACCGCCGCGCAGTTGGGCTATGCCGCAGGTCTACTGTTTCTTGCTCCCCTCGGTGATATGTTTGAACGCCGCCGCCTGATTGTCTCGATGACCTTACTGGCGGCAt > 1:577360/1‑151 (MQ=255)
gcgcgTAACTTTTCCCTTTCCGCCAGTTCGGCAGGCTTTATTGTTACCGCCGCGCAGTTGGGCTATGCCGCAGGTCTACTGTTTCTTGCTCCCCTCGGTGATATGTTTGAACGCCGCCGCCTGATTGTCTCGATGACCTTACTGGCGGCAt > 1:296277/1‑151 (MQ=255)
cgTAACTTTTCCCTTTCCGCCAGTTCGGCAGGCTTTATTGTTACCGCCGCGCAGTTGGGCTATGCCGCAGGTCTACTGTTTCTTGCTCCCCTCGGTGATATGTTTGAACGCCGCCGCCTGATTGTCTCGATGACCTTACTGGCGGCATGtt > 1:292694/1‑151 (MQ=255)
aCTTTTCCCTTTCCGCCAGTTCGGCAGGCTTTATTGTTACCGCCGCGCAGTTGGGCTATGCCGCAGGTCTACTGTTTCTTGCTCCCCTCGGTGATATGTTTGAACGCCGCCGCCTGATTGTCTCGATGACCTTACTGGCGGCATGTTGAtt < 2:1080343/151‑1 (MQ=255)
ttttCCCTTTCCGCCAGTTCGGCAGGCTTTATTGTTACCGCCGCGCAGTTGGGCTATGCCGCAGGTCTACTGTTTCTTGCTCCCCTCGGTGATATGTTTGAACGCCGCCGCCTGATTGTCTCGATGACCTTACTGGCGGCATGTTGATTAc > 2:830062/1‑151 (MQ=255)
ttCCCTTTCCGCCAGTTCGGCAGGCTTTATTGTTACCGCCGCGCAGTTGGGCTATGCCGCAGGCCTACTGTTTCTTGCTCCCCTCGGTGATATGTTTGAACGCCGCCGCCTGATTGTCTCGATGACCTTACTGGCGGCATGTTGATTAcc > 2:485296/1‑150 (MQ=255)
tCCCTTTCCGCCAGTTCGGCAGGCTTTATTGTTACCGCCGCGCAGTTGGGCTATGCCGCAGGTCTACTGTTTCTTGCTCCCCTCGGTGATATGTTTGAACGCCGCCGCCTGATTGTCTCGATGACCTTACTGGCGGCATGTTGATTACCGc > 1:1011691/1‑151 (MQ=255)
ttCCGCCAGTTCGGCAGGCTTTATTGTTACCGCCGCGCAGTTGGGCTATGCCGCAGGTCTACTGTTTCTTGCTCCCCTCGGTGATATGTTTGAACGCCGCCGCCTGATTGTCTCGATGACCTTACTGGCGGCATGTTGATTACCGCcagc > 2:1159510/1‑150 (MQ=255)
ccAGTTCGGCAGGCTTTATTGTTACCGCCGCGCAGTTGGGCTATGCCGCAGGTCTACTGTTTCTTGCTCCCCTCGGTGATATGTTTGAACGCCGCCGCCTGATTGTCTCGATGACCTTACTGGCGGCATGTTGATTACCGCCAGcagtca < 1:705884/150‑1 (MQ=255)
aGTTCGGCAGGCTTTATTGTTACCGCCGCGCAGTTGGGCTATGCCGCAGGTCTACTGTTTCTTGCTCCCCTCGGTGATATGTTTGAACGCCGCCGCCTGATTGTCTCGATGACCTTACTGGCGGCATGTTGATTACCGCCAGCagtcagtc > 2:756864/1‑151 (MQ=255)
cGGCAGGCTTTATTGTTACCGCCGCGCAGTTGGGCTATGCCGCAGGTCTACTGTTTCTTGCTCCCCTCGGTGATATGTTTGAACGCCGCCGCCTGATTGTCTCGATGACCTTACTGGCGGCATGTTGATTACCGCCAGCAGTCAGTCGc < 2:249205/149‑1 (MQ=255)
gCAGGCTTTATTGTTACCGCCGCGCAGTTGGGCTATGCCGCAGGTCTACTGTTTCTTGCTCCCCTCGGTGATATGTTTGAACGCCGCCGCCTGATTGTCTCGATGACCTTACTGGCGGCATGTTGATTACCGCCAGCAGTCAGTCGCTGGc > 1:1141550/1‑151 (MQ=255)
cAGGCTTTATTGTTACCGCCGCGCAGTTGGGCTATGCCGCAGGTCTACTGTTTCTTGCTCCCCTCGGTGATATGTTTGAACGCCGCCGCCTGATTGTCTCGATGACCTTACTGGCGGCATGTTGATTACCGCCAGCAGTCAGTCGCTGGCg < 1:1157531/151‑1 (MQ=255)
cAGGCTTTATTGTTACCGCCGCGCAGTTGGGCTATGCCGCAGGTCTACTGTTTCTTGCTCCCCTCGGTGATATGTTTGAACGCCGCCGCCTGATTGTCTCGATGACCTTACTGGCGGCATGTTGATTACCGCCAGCAGTCAGTCGCTGGCg > 2:1220901/1‑151 (MQ=255)
ggCTTTATTGTTACCGCCGCGCAGTTGGGCTATGCCGCAGGTCTACTGTTTCTTGCTCCCCTCGGTGATATGTTTGAACGCCGCCGCCTGATTGTCTCGATGACCTTACTGGCGGCATGTTGATTACCGCCAGCAGTCAGTCGCTGGCgat < 2:538636/151‑1 (MQ=255)
ggCTTTATTGTTACCGCCGCGCAGTTGGGCTATGCCGCAGGTCTACTGTTTCTTGCTCCCCTCGGTGATATGTTTGAACGCCGCCGCCTGATTGTCTCGATGACCTTACTGGCGGCATGTTGATTACCGCCAGCAGTCAGTCGCTGGCgat < 2:655391/151‑1 (MQ=255)
tATTGTTACCGCCGCGCAGTTGGGCTATGCCGCAGGTCTACTGTTTCTTGCTCCCCTCGGTGATATGTTTGAACGCCGCCGCCTGATTGTCTCGATGACCTTACTGGCGGCATGTTGATTACCGCCAGCAGTCAGTCGCTGGCgatgatg > 1:416256/1‑150 (MQ=255)
ttGTTACCGCCGCGCAGTTGGGCTATGCCGCAGGTCTACTGTTTCTTGCTCCCCTCGGTGATATGTTTGAACGCCGCCGCCTGATTGTCTCGATGACCTTACTGGCGGCATGTTGATTACCGCCAGCAGTCAGTCGCTGGCgatgatgat < 2:932707/150‑1 (MQ=255)
ttGTTACCGCCGCGCAGTTGGGCTATGCCGCAGGTCTACTGTTTCTTGCTCCCCTCGGTGATATGTTTGAACGCCGCCGCCTGATTGTCTCGATGACCTTACTGGCGGCATGTTGATTACCGCCAGCAGTCAGTCGCTGGCgatgatgat < 1:1028961/150‑1 (MQ=255)
ttGTTACCGCCGCGCAGTTGGGCTATGCCGCAGGTCTACTGTTTCTTGCTCCCCTCGGTGATATGTTTGAACGCCGCCGCCTGATTGTCTCGATGACCTTACTGGCGGCATGTTGATTACCGCCAGCAGTCAGTCGCTGGCgatgatga < 1:1192868/149‑1 (MQ=255)
tGTTACCGCCGCGCAGTTGGGCTATGCCGCAGGTCTACTGTTTCTTGCTCCCCTCGGTGATATGTTTGAACGCCGCCGCCTGATTGTCTCGATGACCTTACTGGCGGCATGTTGATTACCGCCAGCAGTCAGTCGCTGGCgatgatga < 1:1005181/148‑1 (MQ=255)
ccgccgCGCAGTTGGGCTATGCCGCAGGTCTACTGTTTCTTGCTCCCCTCGGTGATATGTTTGAACGCCGCCGCCTGATTGTCTCGATGACCTTACTGGCGGCATGTTGATTACCGCCAGCAGTCAGTCGCTGGCGATGATGATCCTCGGt < 2:634016/151‑1 (MQ=255)
cgccgcGCAGTTGGGCTATGCCGCAGGTCTACTGTTTCTTGCTCCCCTCGGTGATATGTTTGAACGCCGCCGCCTGATTGTCTCGATGACCTTACTGGCGGCATGTTGATTACCGCCAGCAGTCAGTCGCTGGCGATGATGATCCTCGGTa < 2:599411/151‑1 (MQ=255)
ccgcGCAGTTGGGCTATGCCGCAGGTCTACTGTTTCTTGCTCCCCTCGGTGATATGTTTGAACGCCGCCGCCTGATTGTCTCGATGACCTTACTGGCGGCATGTTGATTACCGCCAGCAGTCAGTCGCTGGCGATGATGATCCTCGGTAc < 2:1269799/150‑1 (MQ=255)
cgcgCAGTTGGGCTATGCCGCAGGTCTACTGTTTCTTGCTCCCCTCGGTGATATGTTTGAACGCCGCCGCCTGATTGTCTCGATGACCTTACTGGCGGCATGTTGATTACCGCCAGCAGTCAGTCGCTGGCGATGATGATCCTCGGTACgg > 2:1101342/1‑151 (MQ=255)
cgcAGTTGGGCTATGCCGCAGGTCTACTGTTTCTTGCTCCCCTCGGTGATATGTTTGAACGCCGCCGCCTGATTGTCTCGATGACCTTACTGGCGGCATGTTGATTACCGCCAGCAGTCAGTCGCTGGCGATGATGATCCTCGGTACGGCa < 1:64351/151‑1 (MQ=255)
gcAGTTGGGCTATGCCGCAGGTCTACTGTTTCTTGCTCCCCTCGGTGATATGTTTGAACGCCGCCGCCTGATTGTCTCGTTGACCTTACTGGCGCCATGTTGATTACCGCCAGCAGTCAGTCGCTGGCGATGCTGATCCTCGGTACGGc > 1:843108/1‑149 (MQ=255)
gcAGTTGGGCTATGCCGCAGGTCTACTGTTTCTTGCTCCCCTCGGTGATATGTTTGAACGCCGCCGCCTGATTGTCTCGATGACCTTACTGGCGGCATGTTGATTACCGCCAGCAGTCAGTCGCTGGCGATGATGATCCTCGGTACGGCAt > 1:48837/1‑151 (MQ=255)
cAGTTGGGCTATGCCGCAGGTCTACTGTTTCTTGCTCCCCTCGGTGATATGTTTGAACGCCGCCGCCTGATTGTCTCGATGACCTTACTGGCGGCATGTTGATTACCGCCAGCAGTCAGTCGCTGGCGATGATGATCCTCGGTACGGCAtt < 1:637542/151‑1 (MQ=255)
aGTTGGGCTATGCCGCAGGTCTACTGTTTCTTGCTCCCCTCGGTGATATGTTTGAACGCCGCCGCCTGATTGTCTCGATGACCTTACTGGCGGCATGTTGATTACCGCCAGCAGTCAGTCGCTGGCGATGATGATCCTCGGTACGGCAtt < 1:1239690/150‑1 (MQ=255)
aGTTGGGCTATGCCGCAGGTCTACTGTTTCTTGCTCCCCTCGGTGATATGTTTGAACGCCGCCGCCTGATTGTCTCGATGACCTTACTGGCGGCATGTTGATTACCGCCAGCAGTCAGTCGCTGGCGATGATGATCCTCGGTACGGCATTa < 1:1175877/151‑1 (MQ=255)
aGTTGGGCTATGCCGCAGGTCTACTGCTTCTTGCTCCCCTCGGAGATATGTTTGAACGCCGCCGCCTGATTGTCTCGATGACCTTACAGGCGGCATGTTGATTACCGCCAGCAGTCAGTCGCTGGCGATGATGATCCTCGGTACGGCCtt > 1:1071075/1‑150 (MQ=255)
gTTGGGCTATGCCGCAGGTCTACTGTTTCTTGCTCCCCTCGGTGATATGTTTGAACGCCGCCGCCTGATTGTCTCGATGACCTTACTGGCGGCATGTTGATTACCGCCAGCAGTCAGTCGCTGGCGATGATGATCCTCGGTACGGCATTaa < 2:1185867/151‑1 (MQ=255)
gggCTATGCCGCAGGTCTACTGTTTCTTGCTCCCCTCGGTGATATGTTTGAACGCCGCCGCCTGATTGTCTCGATGACCTTACTGGCGGCATGTTGATTACCGCCAGCAGTCAGTCGCTGGCGATGATGATCCTCGGTACGGCATTAACCg > 2:791136/1‑151 (MQ=255)
ggCTATGCCGCAGGTCTACTGTTTCTTGCTCCCCTCGGTGATATGTTTGAACGCCGCCGCCTGATTGTCTCGATGACCTTACTGGCGGCATGTTGATTACCGCCAGCAGTCAGTCGCTGGCGATGATGATCCTCGGTACGGCATTAACCgg < 2:184744/151‑1 (MQ=255)
gCTATGCCGCAGGTCTACTGTTTCTTGCTCCCCTCGGTGATATGTTTGAACGCCGCCGCCTGATTGTCTCGATGACCTTACTGGCGGCATGTTGATTACCGCCAGCAGTCAGTCGCTGGCGATGATGATCCTCGGTACGGCATTAACCGGt < 2:833322/151‑1 (MQ=255)
aTGCCGCAGGTCTACTGTTTCTTGCTCCCCTCGGTGATATGTTTGAACGCCGCCGCCTGATTGTCTCGATGACCTTACTGGCGGCATGTTGATTACCGCCAGCAGTCAGTCGCTGGCGATGATGATCCTCGGTACGGCATTAACCGGttt < 1:683199/150‑1 (MQ=255)
aTGCCGCAGGTCTACTGTTTCTTGCTCCCCTCGGTGATATGTTTGAACGCCGCCGCCTGATTGTCTCGATGACCTTACTGGCGGCATGTTGATTACCGCCAGCAGTCAGTCGCTGGCGATGATGATCCTCGGTACGGCATTAACCGGttt < 2:1086548/150‑1 (MQ=255)
cGCAGGTCTACTGTTTCTTGCTCCCCTCGGTGATATGTTTGAACGCCGCCGCCTGATTGTCTCGATGACCTTACTGGCGGCATGTTGATTACCGCCAGCAGTCAGTCGCTGGCGATGATGATCCTCGGTACGGCATTAACCGGTTTATtct < 1:925421/151‑1 (MQ=255)
ttcTGTTTCTTGCTCCCTACGTTGATATGTTTAAACGCGTCTGCCTGTTGGTCTCGATGACCTTTTTGGCGGCATTTTAATTGCCGCCAGCAGTCAGTCGCTGGCGATGATGATCCTCGGTACGGCAGTAACCTGTTTa < 1:700276/137‑1 (MQ=255)
aCTGTTTCTTGCTCCCCTCGGTGATATGTTTGAACGCCGCCGCCTGATTGTCTCGATGACCTTACTGGCGGCATGTTGATTACCGCCAGCAGTCAGTCGCTGGCGATGATGATCCTCGGTACGGCATTAACCGGTTTATTCTCAGTCg < 2:697022/148‑1 (MQ=255)
gTTTCTTGCTCCCCTCGGTGATATGTTTGAACGCCGCCGCCTGATTGTCTCGATGACCTTACTGGCGGCATGTTGATTACCGCCAGCAGTCAGTCGCTGGCGATGATGATCCTCGGTACGGCATTAACCGGTTTATTCTCAGTCGTGGca < 1:658453/150‑1 (MQ=255)
tttCTTGCTCCCCTCGGTGATATGTTTGAACGCCGCCGCCTGATTGTCTCGATGACCTTACTGGCGGCATGTTGATTACCGCCAGCAGTCAGTCGCTGGCGATGATGATCCTCGGTACGGCATTAACCGGTTTATTCTCAGTCGTGGcac > 1:946533/1‑150 (MQ=255)
ttCTTGCTCCCCTCGGTGATATGTTTGAACGCCGCCGCCTGATTGTCTCGATGACCTTACTGGCGGCATGTTGATTACCGCCAGCAGTCAGTCGCTGGCGATGATGATCCTCGGTACGGCATTAACCGGTTTATTCTCAGTCGTGGcaca > 1:963766/1‑150 (MQ=255)
ttCTTGCTCCCCTCGGTGATATGTTTGAACGCCGCCGCCTGATTGTCTCGATGACCTTACTGGCGGCATGTTGATTACCGCCAGCAGTCAGTCGCTGGCGATGATGATCCTCGGTACGGCATTAACCGGTTTATTCTCAGTCGTGGcaca < 1:91916/150‑1 (MQ=255)
|
CACCGGTCTGGCGGTAGCCAGTAACTATTACGCCCAGCCATTGCTCGACACCATCGCGCGTAACTTTTCCCTTTCCGCCAGTTCGGCAGGCTTTATTGTTACCGCCGCGCAGTTGGGCTATGCCGCAGGTCTACTGTTTCTTGTTCCCCTCGGTGATATGTTTGAACGCCGCCGCCTGATTGTCTCGATGACCTTACTGGCGGCATGTTGATTACCGCCAGCAGTCAGTCGCTGGCGATGATGATCCTCGGTACGGCATTAACCGGTTTATTCTCAGTCGTGGCACA > NC_000913/2808372‑2808658
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
