Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A5 F50 I2 R1
|
139 |
64.5 |
2139856 |
92.7% |
1983646 |
149.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,775,762 |
T→C |
pseudogene (39/93 nt) |
ypjI → |
pseudogene, CP4‑57 putative prophage remnant;Phage or Prophage Related |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,775,762 | 0 | T | C | 100.0%
| 266.1
/ NA
| 67 | pseudogene (39/93 nt) | ypjI | pseudogene, CP4‑57 putative prophage remnant;Phage or Prophage Related |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (32/35); total (32/35) |
TGCGTAGCAGGGCCACTGGTATCTGCCGGTATCACCGACATTAACATTGAAGACGACCAGGGCATTCACGTCCGCCTGATAGTTCGTGATGCCGAAGGTCGGATGGTTGGCGGGCATGGAACTTTGAACCGGACGCCGGTGAAGGTTTTAACCGCTATATCCACAGGTCAGGCATCCGCACCGACACCTTCCCCCGCTGACTCCGAATCATTTACCAGCAACATTTCACCTTCCCAAACGCGCTTTATTACCTCATACGCCAGCCATCGCCGCTGGCGTTTTTT > NC_000913/2775617‑2775900
|
tGCGTAGCAGGGCCACTGGTATCTGCCGGTATCACCGACATTAACATTGAAGACGACCAGGGCATTCACGTCCGCCTGATAGTGCGTGATGCCGAAGGTCGGATGGTTGGCGGGCATGGAACTTTGAACCGGACGCCGGTGAAGGCTTTa < 2:937513/150‑1 (MQ=255)
tAGCAGGGCCACTGGTATCTGCCGGTATCACCGACATTAACATTGAAGACGACCAGGGCATTCACGTCCGCCTGATAGTTCGTGATGCCGAAGGTCGGATGGTTGGCGGGCATGGAACTTTGAACCGGACGCCGGTGAAGGCTTTAACCGc > 2:85190/1‑151 (MQ=255)
aGCAGGGCCACTGGTATCTGCCGGTATCACCGACATTAACATTGAAGACGACCAGGGCATTCACGTCCGCCTGATAGTTCGTGATGCCGAAGGTCGGATGGTTGGCGGGCATGGAACTTTGAACCGGACGCCGGTGAAGGCTTTAACCGc < 2:742815/150‑1 (MQ=255)
cAGGGCCACTGGTATCTGCCGGTATCACCGACATTAACATTGAAGACGACCAGGGCATTCACGTCCGCCTGATAGTTCGTGATGCCGAAGGTCGGATGGTTGGCGGGCATGGAACTTTGAACCGGACGCCGGTGAAGGCTTTAACCGCtat < 1:114576/151‑1 (MQ=255)
aGGGCCACTGGTATCTGCCGGTATCACCGACATTAACATTGAAGACGACCAGGGCATTCACGTCCGCCTGATAGTTCGTGATGCCGAAGGTCGGATGGTTGGCGGGCATGGAACTTTGAACCGGACGCCGGTGAAGGCTTTAACCGCtat < 2:173227/150‑1 (MQ=255)
ccACTGGTATCTGCCGGTATCACCGACATTAACATTGAAGACGACCAGGGCATTCACGTCCGCCTGATAGTTCGTGATGCCGAAGGTCGGATGGTTGGCGGGCATGGAACTTTGAACCGGACGCCGGTGAAGGCTTTAACCGCTATATCca < 2:101898/151‑1 (MQ=255)
aCTGGGATCTGCCGGTATCACCGACATTAACATTGAAGACGACCAGGGCATTCACGTCCGCCTGATAGTTCGTGATGCCGAAGGTCGGATGGTTGGCGGGCATGGAACTTTGAACCGGACGCCGGTGAAGGCTTTAACCGCTATATCcac > 1:26905/1‑150 (MQ=255)
ggTATCTGCCGGTATCACCGACATTAACATTGAAGACGACCAGGGCATTCACGTCCGCCTGATAGTTCGTGATGCCGAAGGTCGGATGGTTGGCGGGCATGGAACTTTGAACCGGACGCCGGTGAAGGCTTTAACCGCTATATCCACAGGt > 1:378894/1‑151 (MQ=255)
gTATCTGCCGGTATCACCGACATTAACATTGAAGACGACCAGGGCATTCACGTCCGCCTGATAGTTCGTGATGCCGAAGGTCGGATGGTTGGCGGGCATGGAACTTTGAACCGGACGCCGGTGAAGGCTTTAACCGCTATATCCACAGGTc < 2:361514/151‑1 (MQ=255)
gTATCTGCCGGTATCACCGACATTAACATTGAAGACGACCAGGGCATTCACGTCCGCCTGATAGTTCGTGATGCCGAAGGTCGGATGGTTGGCGGGCATGGAACTTTGAACCGGACGCCGGTGAAGGCTTTAACCGCTATATCCACAGGTc < 1:155891/151‑1 (MQ=255)
tATCTGCCGGTATCACCGACATTAACATTGAAGACGACCAGGGCATTCACGTCCGCCTGATAGTTCGTGATGCCGAAGGTCGGATGGTTGGCGGGCATGGAACTTTGAACCGGACGCCGGTGAAGGCTTTAACCGCTATATCCACAGGt > 2:829578/1‑149 (MQ=255)
tCTGCCGGTATCACCGACATTAACATTGAAGACGACCAGGGCATTCACGTCCGCCTGATAGTTCGTGATGCCGAAGGTCGGATGGTTGGCGGGCATGGAACTTTGAACCGGACGCCGGTGAAGGCTTTAACCGCTATATCCACAGGTCAgg > 1:203907/1‑151 (MQ=255)
gCCGGTATCACCGACATTAACATTGAAGACGACCAGGGCATTCACGTCCGCCTGATAGTTCGTGATGCCGAAGGTCGGATGGTTGGCGGGCATGGAACTTTGAACCGGACGCCGGTGAAGGCTTTAACCGCTATATCCACAGGTCAGGCa < 2:432593/150‑1 (MQ=255)
tATCACCGACATTAACATTGAAGACGACCAGGGCATTCACGTCCGCCTGATAGTTCGTGATGCCGAAGGTCGGATGGTTGGCGGGCATGGAACTTTGAACCGGACGCCGGTGAAGGCTTTAACCGCTATATCCACAGGTCAGGCATCCGc > 2:660573/1‑150 (MQ=255)
tCACCGACATTAACATTGAAGACGACCAGGGCATTCACGTCCGCCTGATAGTTCGTGATGCCGAAGGTCGGATGGTTGGCGGGCATGGAACTTTGAACCGGACGCCGGTGAAGGCTTTAACCGCTATATCCACAGGTCAGGCATCCGCAcc > 2:820825/1‑151 (MQ=255)
aTTAACATTGAAGACGACCAGGGCATTCACGTCCGCCTGATAGTTCGTGATGCCGAAGGTCGGATGGTTGGCGGGCATGGAACTTTGAACCGGACGCCGGTGAAGGCTTTAACCGCTATATCCACAGGTCAGGCATCCGCACCGACACCtt < 1:526540/151‑1 (MQ=255)
tAACATTGAAGACGACCAGGGCATTCACGTCCGCCTGATAGTTCGTGATGCCGAAGGTCGGATGGTTGGCGGGCATGGAACTTTGAACCGGACGCCGGTGAAGGCTTTAACCGCTATATCCACAGGTCAGGCATCCGCACCGACACCTTcc > 1:513129/1‑151 (MQ=255)
cATTGAAGACGACCAGGGCATTCACGTCCGCCTGATAGTTCGTGATGCCGAAGGTCGGATGGTTGGCGGGCATGGAACTTTGAACCGGACGCCGGTGAAGGCTTTAACCGCTATATCCACAGGTCAGGCATCCGCACCGACACCTTccccc < 1:524484/151‑1 (MQ=255)
cATTGAAGACGACCAGGGCATTCACGTCCGCCTGATAGTTCGTGATGCCGAAGGTCGGATGGTTGGCGGGCATGGAACTTTGAACCGGACGCCGGTGAAGGCTTTAACCGCTATATCCACAGGTCAGGCATCCGCACCGACACCTTccccc < 1:284069/151‑1 (MQ=255)
aTTGAAGACGACCAGGGCATTCACGTCCGCCTGATAGTTCGTGATGCCGAAGGTCGGATGGTTGGCGGGCATGGAACTTTGAACCGGACGCCGGTGAAGGCTTTAACCGCTATATCCACAGGTCAGGCATCCGCACCGACACCTTCCCCCg > 2:436297/1‑151 (MQ=255)
aaGACGACCAGGGCATTCACGTCCGCCTGATAGTTCGTGATGCCGAAGGTCGGATGGTTGGCGGGCATGGCACTTTGAACCGGACGCCGGTGAAGGCTTTAACCGCTATATCCACAGGTCAGGCATCCGCACCGACACCTTCCCCCGCTg > 2:187850/1‑150 (MQ=255)
aaGACGACCAGGGCATTCACGTCCGCCTGATAGTTCGTGATGCCGAAGGTCGGATGGTTGGCGGGCATGGAACTTTGAACCGGACGCCGGTGAAGGCTTTAACCGCTATATCCACAGGTCAGGCATCCGCACCGACACCTTCCCCCGCTGa < 1:515738/151‑1 (MQ=255)
aGACGACCAGGGCATTCACGTCCGCCTGATATTTCGTGATGCCGAAGGTCGGATGGTTGGCGGGCATGGAACTTTGAACCGGACGCCGGTGAAGGCTTTAACCGCTATATCCACAGGTCAGGCATCCGCACCGACACCTTCCCCCGCTGAc < 2:40389/151‑1 (MQ=255)
cgacCAGGGCATTCACGTCCGCCTGATAGTTCGTGATGCCGAAGGTCGGATGGTTGGCGGGCATGGAACTTTGAACCGGACGCCGGTGAAGGCTTTAACCGCTATATCCACAGGTCAg > 2:748085/1‑118 (MQ=255)
cgacCAGGGCATTCACGTCCGCCTGATAGTTCGTGATGCCGAAGGTCGGATGGTTGGCGGGCATGGAACTTTGAACCGGACGCCGGTGAAGGCTTTAACCGCTATATCCACAGGTCAg < 1:748126/118‑1 (MQ=255)
gacCAGGGCATTCACGTCCGCCTGATAGTTCGTGATGCCGAAGGTCGGATGGTTGGCGGGCATGGAACTTTGAACCGGACGCCGGTGAAGGCTTTAACCGCTATATCCACAGGTCAGGCATCCGCACCGACACCTTCCCCCGCTGACTCCg > 2:41762/1‑151 (MQ=255)
gacCAGGGCATTCACGTCCGCCTGATAGTTCGTGATGCCGAAGGTCGGATGGTTGGCGGGCATGGAACTTTGAACCGGACGCCGGTGAAGGCTTTAACCGCTATATCCACAGGTCAGGCATCCGCACCGACACCTTCCCCCGCTGACTCCg > 1:697480/1‑151 (MQ=255)
acCAGGGCATTCACGTCCGCCTGATAGTTCGTGATGCCGAAGGTCGGATGGTTGGCGGGCATGGAACTTTGAACCGGACGCCGGTGAAGGCTTTAACCGCTATATCCACAGGTCAGGCATCCGCACCGACACCTTCCCCCGCTGACTCCg > 2:25145/1‑150 (MQ=255)
acCAGGGCATTCACGTCCGCCTGATAGTTCGTGATGCCGAAGGTCGGATGGTTGGCGGGCATGGAACTTTGAACCGGACGCCGGTGAAGGCTTTAACCGCTATATCCACAGGTCAGGCATCCGCACCGACACCTTCCCCCGCTGACTCCg > 1:401472/1‑150 (MQ=255)
cAGGGCATTCACGTCCGCCTGATAGTTCGTGATGCCGAAGGTCGGATGGTTGGCGGGCATGGAACTTTGAACCGGACGCCGGTGAAGGCTTTAACCGCTATATCCACAGGTCAGGCATCCGCACCGTCACCTTCCCCCGCTGACTCCGAAt < 2:472415/151‑1 (MQ=255)
cAGGGCATTCACGTCCGCCTGATAGTTCGTGATGCCGAAGGTCGGATGGTTGGCGGGCATGGAACTTTGAACCGGACGCCGGTGAAGGCTTTAACCGCTATATCCACAGGTCAGGCATCCGCACCGACACCTTCCCCCGCTGACTCCGAAt > 1:173775/1‑151 (MQ=255)
gCATTCACGTCCGACTGATAGTTCGTGATGCCGAAGGTCGGATGGTTGGCGGGCATGGAACTTTGAACCGGACGCCGGTGAAGGCTTTAACCGCTATATCCACAGGTCAGGCATCCGCCCCGACACCTTCCCCCGCTGACTCCGAATCAtt < 2:909395/151‑1 (MQ=255)
tCACGTCCGCCTGATAGTTCGTGATGCCGAAGGTCGGATGGTTGGCGGGCATGGAACTTTGAACCGGACGCCGGTGAAGGCTTTAACCGCTATATCCACAGGTCAGGCATCCGCACCGACACCTTCCCCCGCTGACTCCGAATCATTTAcc > 2:8215/1‑151 (MQ=255)
cGTCCGCCTGATAGTTCGTGATGCCGAAGGTCGGATGGTTGGCGGGCATGGAACTTTGAACCGGACGCCGGTGAAGGCTTTAACCGCTATATCCACAGGTCAGGCATCCGCACCGACACCTTCCCCCGCTGACTCCGAATCATTTACCAGc > 2:540654/1‑151 (MQ=255)
cGCCTGATAGTTCGTGATGCCGAAGGTCGGATGGTTGGCGGGCATGGAACTTTGAACCGGACGCCGGTGAAGGCTTTAACCGCTATATCCACAGGTCAGGCATCCGCACCGACACCTTCCCCCGCTGACTCCGAATCATTTACCAGCAACa < 1:569775/151‑1 (MQ=255)
gCCTGATAGTTCGTGATGCCGAAGGTCGGATGGTTGGCGGGCATGGAACTTTGAACCGGACGCCGGTGAAGGCTTTAACCGCTATATCCACAGGTCAGGCATCCGCACCGACACCTTCCCCCGCTGACTCCGAATCATTTACCAGCAACAt < 2:830084/151‑1 (MQ=255)
gCCTGATAGTTCGTGATGCCGAAGGTCGGATGGTTGGCGGGCATGGAACTTTGAACCGGACGCCGGTGAAGGCTTTAACCGCTATATCCACAGGTCAGGCATCCGCACCGACACCTTCCCCCGCTGACTCCGAATCATTTACCAGCAACAt > 2:33984/1‑151 (MQ=255)
ccTGATAGTTCGTGATGCCGAAGGTCGGATGGTTGGCGGGCATGGAACTTTGAACCGGACGCCGGTGAAGGCTTTAACCGCTATATCCACAGGTCAGGCATCCGCACCGACACCTTCCCCCGCTGACTCCGAATCATTTACCAGCAACAtt > 1:621323/1‑151 (MQ=255)
cTGATAGTTCGTGATGCCGAAGGTCGGATGGTTGGCGGGCATGGAACTTTGAACCGGACGCCGGTGAAGGCTTTAACCGCTATATCCACAGGTCAGGCATCCGCACCGACACCTTCCCCCGCTGACTCCGAATCATTTACCAGCAACAttt > 2:628434/1‑151 (MQ=255)
gATAGTTCGTGATGCCGAAGGTCGGATGGTTGGCGGGCATGGAACTTTGAACCGGACGCCGGTGAAGGCTTTAACCGCTATATCCACAGGTCAGGCATCCGCACCGACACCTTCCCCCGCTGACTCCGAATCATTTACCAGCAACAttt < 1:799760/149‑1 (MQ=255)
tAGTTCGTGATGCCGAAGGTCGGATGGTTGGCGGGCATGGAACTTTGAACCGGACGCCGGTGAAGGCTTTAACCGCTATATCCACAGGTCAGGCATCCGCACCGACACCTTCCCCCGCTGACTCCGAATCATTTACCAGCAACATTTCAcc > 1:1035451/1‑151 (MQ=255)
aGTTCGTGATGCCGAAGGTCGGATGGTTGGCGGGCATGGAACTTTGAACCGGACGCCGGTGAAGGCTTTAACCGCTATATCCACAGGTCAGGCATCCGCACCGACACCTTCCCCCGCTGACTCCGAATCATTTACCAGCAACATTTCAcc < 2:329322/150‑1 (MQ=255)
gTTCGTGATGCCGAAGGTCGGATGGTTGGCGGGCATGGAACTTTGAACCGGACGCCGGTGAAGGCTTTAACCGCTATATCCACAGGTCAGGCATCCGCACCGACACCTTCCCCCGCTGACTCCGAATCATTTACCAGCAACATTTCACCtt < 1:833396/151‑1 (MQ=255)
cGTGATGCCGAAGGTCGGATGGTTGGCGGGCATGGAACTTTGAACCGGACGCCGGTGAAGGCTTTAACCGCTATATCCACAGGTCAGGCATCCGCTCCGACACCTTCCCCCGCTGACTCCGAATCATTTACCAGCAACATTTCACCTTcc < 1:288053/150‑1 (MQ=255)
gATGCCGAAGGTCGGATGGTTGGCGGGCATGGAACTGTGAACCGGACGCCGGTGAAGGCTTTAACCGCTATATCCACAGGTCAGGCATCCGCACCGACACCTTCCCCCGCTGACTCCGAATCATTTACCAGCAACATTTCACCTTCCCaa < 2:656815/150‑1 (MQ=255)
aTGCCGAAGGTCGGATGGTTGGCGGGCATGGAACTTTGAACAGGACGCCGGTGAAGGCTTTAACCGCTATATCCACAGGTCAGGCATCCGCACCGACACCTTCCCCCGCTGACTCCGAATCATTTACCAGCAACATTTCACCTTCCCAAAc > 1:101757/1‑151 (MQ=255)
ccGAAGGTCGGATGGTTGGCGGGCATGGAACTTTGAACCGGACGCCGGTGAAGGCTTTAACCGCTATATCCACAGGTCAGGCATCCGCACCGACACCTTCCCCCGCTGACTCCGAATCATTTACCAGCAACATTTCACCTTCCCAAAcgcg < 2:930291/151‑1 (MQ=255)
aaGGTCGGATGGTTGGCGGGCATGGAACTTTGAACCGGACGCCGGTGAAGGCTTTAACCGCTATATCCACAGGTCAGGCATCCGCACCGACACCTTCCCCCGCTGACTCCGAATCATTTACCAGCAACATTTCACCTTCCCAAACGCGCtt > 2:1003631/1‑151 (MQ=255)
aGGTCGGATGGTTGGCGGGCATGGAACTTTGAACCGGACGCCGGTGAAGGCTTTAACCGCTATATCCACAGGTCAGGCATCCGCACCGACACCTTCCCCCGCTGACTCCGAATCATTTACCAGCAACATTTCACCTTCCCAAACGCGCttt < 1:820871/151‑1 (MQ=255)
ggTCGGATGGTTGGCGGGCATGGAACTTTGAACCGGACGCCGGTGAAGGCTTTAACCGCTATATCCACAGGTCAGGCATCCGCACCGACACCTTCCCCCGCTGACTCCGAATCATTTACCAGCAACATTTCACCTTCCCAAACGCGCttt > 1:83284/1‑150 (MQ=255)
ggTCGGATGGTTGGCGGGCATGGAACTTTGAACCGGACGCCGGTGAAGGCTTTAACCGCTATATCCACAGGTCAGGCATCCGCACCGACACCTTCCCCCGCTGACTCCGAATCATTTACCAGCAACATTTCACCTTCCCAAACGCGCTtta < 2:412154/151‑1 (MQ=255)
gATGGTTGGCGGGCATGGAACTTTGAACCGGACGCCGGTGAAGGCTTTAACCGCTATATCCACAGGTCAGGCATCCGCACCGACACCTTCCCCCGCTGACTCCGAATCATTTACCAGCAACATTTCACCTTCCCAAACGCGCTTTATTAcc < 1:453971/151‑1 (MQ=255)
gATGGTTGGCGGGCATGGAACTTTGAACCGGACGCCGGTGAAGGCTTTAACCGCTATATCCACAGGTCAGGCATCCGCACCGACACCTTCCCCCGCTGACTCCGAATCATTTACCAGCAACATTTCACCTTCCCAAACGCGCTTTATTAcc > 1:410287/1‑151 (MQ=255)
gATGGTTGGCGGGCATGGAACTTTGAACCGGACGCCGGTGAAGGCTTTAACCGCTATATCCACAGGTCAGGCATCCGCACCGACACCTTCCCCCGCTGACTCCGAATCATTTACCAGCAACATTTCACCTTCCCAAACGCGCTTTATTAcc > 2:227115/1‑151 (MQ=255)
aTGGTTGGCGGGCATGGAACTTTGAACCGGACGCCGGTGAAGGCTTTAACCGCTATATCCACAGGTCAGGCATCCGCACCGACACCTTCCCCCGCTGACTCCGAATCATTTACCAGCAACATTTCACCTTCCCAAACGCGCTTTATTACCt > 2:66375/1‑151 (MQ=255)
tGGCGGGCATGGAACTTTGAACCGGACGCCGGTGAAGGCTTTAACCGCTATATCCACAGGTCAGGCATCCGCACCGACACCTTCCCCCGCTGACTCCGAATCATTTACCAGCAACATTTCACCTTCCCAAACGCGCTTTATTACCTCATa < 2:193349/150‑1 (MQ=255)
ggCGGGCATGGAACTTTGAACCGGACGCCGGTGAAGGCTTTAACCGCTATATCCACAGGTCAGGCATCCGCACCGACACCTTCCCCCGCTGACTCCGAATCATTTACCAGCAACATTTCACCTTCCCAAACGCGCTTTATTACCTCATAc < 1:16625/150‑1 (MQ=255)
gCGGGCATGGAACTTTGAACCGGACGCCGGTGAAGGCTTTAACCGCTATATCCACAGGTCAGGCATCCGCACCGACACCTTCCCCCGCTGACTCCGAATCATTTACCAGCAACATTTCACCTTCCCAAACGCGCTTTATTACCTCATACgc < 2:19759/151‑1 (MQ=255)
gCGGGCATGGAACTTTGAACCGGACGCCGGTGAAGGCTTTAACCGCTATATCCACAGGTCAGGCATCCGCACCGACACCTTCCCCCGCTGACTCCGAATCATTTACCAGCAACATTTCACCTTCCCAAACGCGCTTTATTACCTCATACgc < 2:986491/151‑1 (MQ=255)
cGGGCATGGAACTTTGAACCGGACGCCGGTGAAGGCTTTAACCGCTATATCCACAGGTCAGGCATCCGCACCGACACCTTCCCCCGCTGACTCCGAATCATTTACCAGCAACATTTCACCTTCCCAAACGCGCTTTATTACCTCATACgcc > 2:227232/1‑151 (MQ=255)
gggCATGGAACTTTGAACCGGACGCCGGTGAAGGCTTTAACCGCTATATCCACAGGTCAGGCATCCGCACCGACACCTTCCCCCGCTGACTCCGAATCATTTACCAGCAACATTTCACCTTCCCAAACGCGCTTTATTACCTCATACgcc > 1:152714/1‑150 (MQ=255)
ggCATGGAACTTTGAACCGGACGCCGGTGAAGGCTTTAACCGCTATATCCACAGGTCAGGCATCCGCACCGACACCTTCCCCCGCTGACTCCGAATCATTTACCAGCAACATTTCACCTTCCCAAACGCGCTTTATTACCTCATACgccag < 2:429958/151‑1 (MQ=255)
aaCTTTGAACCGGACGCCGGTGAAGGCTTTAACCGCTATATCCACAGGTCAGGCATCCGCACCGACACCTTCCCCCGCTGACTCCGAATCATTTACCAGCAACATTTCACCTTCCCAAACGCGCTTTATTACCTCATACGCCAGCCATcgc < 2:235882/151‑1 (MQ=255)
aCTTTGAACCGGACGCCGGTGAAGGCTTTAACCGCTATATCCACAGGTCAGGCATCCGCACCGACACCTTCCCCCGCTGACTCCGAATCATTTACCAGCAACATTTCACCTTCCCAAACGCGCTTTATTACCTCATACGCCAGCCATcgcc < 1:556242/151‑1 (MQ=255)
ttGAACCGGACGCCGGTGAAGGCTTTAACCGCTATATCCACAGGTCAGGCATCCGCACCGACACCTTCCCCCGCTGACTCCGAATCATTTACCAGCAACATTTCACCTTCCCAAACGCGCTTTATTACCTCATACGCCAGCCATCGCCGCt > 1:477170/1‑151 (MQ=255)
ccGGACGCCGGTGAAGGCTTTAACCGCTATATCCACAGGTCAGGCATCCGCACCGACACCTTCCCCCGCTGACTCCGAATCATTTACCAGCAACATTTCACCTTCCCAAACGCGCTTTATTACCTCATACGCCAGCCATCGCCGCTGGCGt < 1:207985/151‑1 (MQ=255)
gCCGGTGAAGGCTTTAACCGCTATATCCACAGGTCAGGCATCCGCACCGACACCTTCCCCCGCTGACTCCGAATCATTTACCAGCAACATTTCACCTTCCCAAACGCGCTTTATTACCTCATACGCCAGCCATCGCCGCTGGCGtttttt > 1:301483/1‑150 (MQ=255)
|
TGCGTAGCAGGGCCACTGGTATCTGCCGGTATCACCGACATTAACATTGAAGACGACCAGGGCATTCACGTCCGCCTGATAGTTCGTGATGCCGAAGGTCGGATGGTTGGCGGGCATGGAACTTTGAACCGGACGCCGGTGAAGGTTTTAACCGCTATATCCACAGGTCAGGCATCCGCACCGACACCTTCCCCCGCTGACTCCGAATCATTTACCAGCAACATTTCACCTTCCCAAACGCGCTTTATTACCTCATACGCCAGCCATCGCCGCTGGCGTTTTTT > NC_000913/2775617‑2775900
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
