Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A0 F0 I1 R1
|
4926 |
296.4 |
4517418 |
96.8% |
4372860 |
264.2 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP042583 |
1,577,229 |
3 bp→TCG |
intergenic (–/–) |
– / – |
–/– |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP042583 | 1,577,229 | 0 | A | T | 98.4%
| 589.3
/ NA
| 256 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); major base T (111/139); minor base C (4/0); total (117/139) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.08e-02 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 |
| * | CP042583 | 1,577,230 | 0 | G | C | 99.6%
| 601.1
/ ‑4.8
| 256 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base C (115/139); minor base T (1/0); total (117/139) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.55e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.48e-01 |
| * | CP042583 | 1,577,231 | 0 | C | G | 99.2%
| 602.3
/ NA
| 256 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (2/0); new base G (115/138); total (117/139) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.10e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 |
Only 100 of 256 total aligned reads displayed.
CCGTCGACCGCAACCGGGGTTGTTGCTGACTCAGCGTAGCATTCATCTGCGTAAACACGCTGGACAAGTGGCATTCCCTGGAGGTGCAGTCGATGACACGGACGCAAGTGCTATCGCCGCCGCGCTGCGCGAAGCTGAAGAAGAGGTCGCTATACCGCCTTCCGCCGTTGAAGTTATCGGCGTGCTGCCGCCCGTCGATAGCGTCACTGGCTACCAGGTAACCCCAGTGGTCGGCATTATCCCGCCCGATCTGCCGTATCGCGCCAGTGAAGATGAAGTCAGCGC‑GGTGTTTGAAATGCCGCTCGCCCAGGCATTACATCTGGGTCGTTATCACCCTTTAGATATCTACCGCCGTGGTGATAGTCATCGGGTATGGCTGTCCTGGTACGAACAGTATTTTGTATGGGGAATGACCGCAGGCATAATTCGTGAGCTGGCGCTGCAAATTGGTGTGAAACCCTGACTATAC‑TTATCTTTACATCTACAAAACACTACTTGAGACAATCATCGCAATATTAGTTAAATCGCGGTTTTTGATTAGTTTAATTCATGTGA > CP042583/1576949‑1577503
|||
ccgtcGACCGCAACCGGGGTTGTTGCTGACTCAGCGTTCGATTCATCTGCGTAAACACGCTGGACAAGTGGCATTCCCTGGAGGTGCAGTCGATGACACGGACGCATCAGCTATCGCCGCCGCGCTGCGCGAAGCTGAAGAAGAGGTCGCTATACCGCCTTCCGCCGTTGAAGTTATCGGCGTGCTGCCGCCCGTCGATAGCGTCACTGGCTACCAGGTAACCCCAGTGGTCGGCATTATCCCGCCCGATCTGCCGTATCGCGCCAGTGAAGATGAAGTCTCGGC‑Ggtg < 2:516216/289‑1 (MQ=255)
aCCGGGGTTGTTGCTGACTCAGCGTTCGATTCATCTGCGTAAACACGCTGGACAAGTGGCATTCCCTGGAGGTGCAGTCGATGACACGGACGCATCAGCTATCGCCGCCGCGCTGCGCGAAGCTGAAGAAGAGGTCGCTATACCGCCTTCCGCCGTTGAAGTTATCGGCGTGCTGCCGCCCGTCGATAGCGTCACTGGCTACCAGGTAACCCCAGTGGTCGGCATTATCCCGCCCGATCTGCCGTATCGCGCCAGTGAAGATGAAGTCTCGGC‑GGTGTTTGAAATGCCg < 1:1724381/289‑1 (MQ=255)
gggTTGTTGCTGACTCAGCGTTCGATTCATCTGCGTAAACACGCTGGACAAGTGGCATTCCCTGGAGGTGCAGTCGATGACACGGACGCATCAGCTATCGCCGCCGCGCTGCGCGAAGCTGAAGAAGAGGTCGCTATACCGCCTTCCGCCGTTGAAGTTATCGGCGTGCTGCCGCCCGTCGATAGCGTCACTGGCTACCAGGTAACCCCAGTGGTCGGCATTATCCCGCCCGATCTGCCGTATCGCGCCAGCGAAGCTGAAGTCTCGGC‑GGTGTTTGAAACGCCGCTc > 2:149834/1‑288 (MQ=255)
ttgttgCTGACTCAGCGTTCGATTCATCTGCGTAAACACGCTGGACAAGTGGCATTCCCTGGAGGTGCAGTCGATGACACGGACGCATCAGCTATCGCCGCCGCGCTGCGCGAAGCTGAAGAAGAGGTCGCTATACCGCCTTCCGCCGTTGAAGTTATCGGCGTGCTGCCGCCCGTCGATAGCGTCACTGGCTACCAGGTAACCCCAGTGGTCGGCATTATCCCGCCCGATCTGCCGTATCGCGCCAGTGAAGATGAAGTCTCGGC‑GGTGTTTGAAATGCCGCTCGcc < 1:1573717/288‑1 (MQ=255)
tgttgCTGACTCAGCGTTCGATTCATCTGCGTAAACACGCTGGACAAGTGGCATTCCCTGGAGGTGCAGTCGATGACACGGACGCATCAGCTATCGCCGCCGCGCTGCGCGAAGCTGAAGAAGAGGTCGCTATACCGCCTTCCGCCGTTGAAGTTATCGGCGTGCTGCCGCCCGTCGATAGCGTCACTGGCTACCAGGTAACCCCAGTGGTCGGCATTATCCCGCCCGATCTGCCGTATCGCGCCAGTGAAGATGAAGTCTCGGC‑GGTGTTTGAAATGCCGCTCGCCCa < 2:1983883/289‑1 (MQ=255)
gttgCTGACTCAGCGTTCGATTCATCTGCGTAAACACGCTGGACAAGTGGCATTCCCTGGAGGTGCAGTCGATGACACGGACGCATCAGCAATCGCCGCCGCGCTGCGCGAAGCTGAAGAAGAGGTCGCTATACCGCCTTCCGCCGTTGAAGTTATCGGCGTGCTGCCGCCCGTCGATAGCGTAACTGGCTACCAGGTAACCCCAGTGCTCGGCACTATCCCGCCCGATCCGCCGTCTCGCGCCAGTGAATACGCAGTCCAGGC‑GGTGTTTGAAATGCCGCTTGCCCaa > 2:2069709/1‑288 (MQ=255)
tGACTCAGCGTTCGATTCATCTGCGTAAACACGCTGGACAAGTGGCATTCCCTGGAGGTGCAGTCGATGACACGGACGCATCAGCTATCGCCGCCGCGCTGCGCGAAGCTGAAGAAGAGGTCGCTATACCGCCTTCCGCCGTTGAAGTTATCGGCGTGCTGCCGCCCGTCGATAGCGTCACTGGCTACCAGGTAACCCCAGTGGTCGGCATTATCCCGCCCGATCTGCCGTATCGCGCCAGTGAAGATGAAGTCTCGGC‑GGTGTTTGAAATGCCGCTCGCCCAGGCAt < 1:198951/288‑1 (MQ=255)
tGACTCAGCGTTCGATTCATCTGCGTAAACACGCTGGACAAGTGGCATTCCCTGGAGGTGCAGTCGATGACACGGACGCATCAGCTATCGCCGCCGCGCTGCGCGAAGCTGAAGAAGAGGTCGCTATACCGCCTTCCGCCGTTGAAGTTATCGGCGTGCTGCCGCCCGTCGATAGCGTCACTGGCTACCAGGTAACCCCAGTGGTCGGCATTATCCCGCCCGATCTGCCGTATCGCGCCAGTGAAGATGAAGTCTCGGC‑GGTGTTTGAAATGCCGCTCGCCCAGGCAt < 2:1735850/288‑1 (MQ=255)
gACTCAGCGTTCGATTCATCTGCGTAAACACGCTGGACAAGTGGCATTCCCTGGAGGTGCAGTCGATGACACGGACGCATCAGCTATCGCCGCCGCGCTGCGCGAAGCTGAAGAAGAGGTCGCTATACCGCCTTCCGCCGTTGAAGTTATCGGCGTGCTGCCGCCCGTCGATAGCGTCACTGGCTACCAGGTAACCCCAGTGGTCGGCATTCTCCCGCCCGATCTGCCGTATCGCGCCAGTGAAGATGACGTCACGGC‑GGGGTTTGAAATGCCTCTCGCCCAGGCAtt > 2:656423/1‑288 (MQ=255)
gACTCAGCGTTCGATTCATCTGCGTAAACACGCTGGACAAGTGGCATTCCCTGGAGGTGCAGTCGATGACACGGACGCATCAGCTATCGCCGCCGCGCTGCGCGAAGCTGAAGAAGAGGTCGCTATACCGCCTTCCGCCGTTGAAGTTATCGGCGTGCTGCCGCCCGTCGATAGCGTCACTGGCTACCAGGTAACCCCAGTGGTCGGCATTATCCCGCCCGATCTGCCGTATCGCGCCAGTGAAGATGAAGTCTCGGC‑GGTGTTTGAAATGCCGCTCGCCCAGGCAtt > 1:2203629/1‑288 (MQ=255)
cgttcgaTTCATCTGCGTAAACACGCTGGACAAGTGGCATTCCCTGGAGGTGCAGTCGATGACACGGACGCATCAGCTATCGCCGCCGCGCTGCGCGAAGCTGAAGAAGAGGTCGCTATACCGCCTTCCGCCGTTGAAGTTATCGGCGTGCTGCCGCCCGTCGATAGCGTCACTGGCTACCAGGTAACCCCAGTGGTCGGCATTATCCCGCCCGATCTGCCGTATCGCGCCAGTGAAGATGAAGTCTCGGC‑GGTGTTTGAAATGCCGCTCGCCCAGGCATTACATCTgg > 1:2050671/7‑289 (MQ=255)
cgttcgaTTCATCTGCGTAAACACGCTGGACAAGTGGCATTCCCTGGAGGTGCAGTCGATGACACGGACGCATCAGCTATCGCCGCCGCGCTGCGCGAAGCTGAAGAAGAGGTCGCTATACCGCCTTCCGCCGTTGAAGTTATCGGCGTGCTGCCGCCCGTCGATAGCGTCACTGGCTACCAGGTAACCCCAGTGGTCGGCATTATCCCGCCCGATCTGCCGTATCGCGCCAGTGAAGATGAAGTCTCGGC‑GGTGTTTGAAATGCCGCTCGCCCAGGCATTACATCTgg > 1:1910050/7‑289 (MQ=255)
ttcgaTTCATCTGCGTAAACACGCTGGACAAGTGGCATTCCCTGGAGGTGCAGTCGATGACACGGACGCATCAGCTATCGCCGCCGCGCTGCGCGAAGCTGAAGAAGAGGTCGCTATACCGCCTTCCGCCGTTGAAGTTATCGGCGTGCTGCCGCCCGTCGATAGCGTCACTGGCTACCAGGTAACCCCAGTGGTCGGCATTATCCCGCCCGATCTGCCGTATCGCGCCAGTGAAGATGAAGTCTCGGC‑GGTGTTTGAAATGCCGCTCGCCCAGGCATTACATCTggg < 2:1910050/284‑1 (MQ=255)
tggaTTCATCTGCGTAAACCAGCTTGACCAGTGGCATTACCTGGAGGTGCAGTGGGTGACACGGACGCATCAGCTATCGCCGCCGCGCTGCGCGAAGCTGAAGAAGAGTTCGCTATACCGCCTTCCGCCGTTGAAGTTATCGGCGTGCTGCCGCCCGTCGATAGCGTCACTGGCTACCAGGTAACCGCAGTGGTCGGCATTATCCCGCCCGATCTGCCGTATCGCGCCAGTGAAGATGAAGTCTCGGC‑GGTGTTTGAAATGCCGCTCGCCCAGGCATTACATCTGGGt < 2:1275660/285‑1 (MQ=255)
tcggttCATCTGCGTAAACACGCTGGACAAGTGGCATTCCCTGGAGGTGCAGTCGATGACACGGACGCATCAGCTATCGCCGCCGCGCTGCGCGAAGCTGAAGAAGAGGTCGCTATACCGCCTTCCGCCGTTGAAGTTATCGGCGTGCTGCCGCCCGTCGATAGCGTCACTGGCTACCAGGTAACCCCAGTGGTCGGCATTATCCCGCCCGATCTGCCGTATCGCGCCAGTGAAGATGAAGTCTCGGC‑GGTGTTTGAAATGCCGCTCGCCCAGGCATTACATCTGGGt < 2:223187/284‑1 (MQ=255)
tCATCTGCGTAAACACGCTGGACAAGTGGCATTCCCTGGAGGTGCAGTCGATGACACGGACGCATCAGCTATCGCCGCCGCGCTGCGCGAAGCTGAAGAAGAGGTCGCTATACCGCCTTCCGCCGTTGAAGTTATCGGCGTGCTGCCGCCCGTCGATAGCGTCACTGGCTACCAGGTAACCCCAGTGGTCGGCATTATCCCGCCCGATCTGCCGTATCGCGCCAGTGAAGATGAAGTCTCGGC‑GGTGTTTGAAATGCCGCTCGCCCAGGCATTACATCTGGGTCGTTAt < 1:1934661/289‑1 (MQ=255)
tCATCTACGTAAACGCGCTGGCCAAGTGGCATTCCCTGGAGGTGCAGTCGATGACACGGACGCATCAGCTATCGCCGCCGCGCTGCGCGAAGCTGAAGAAGAGGTCGCTATACCGCCTTCCGCCGTTGAAGTTATCGGCGTGCTGCCGCCCGTCGATAGCGTCACTGGCTACCAGGTAACCCCAGTGGTCGGCATTATCCCGCCCGATCTGCCGTATCGCGCCAGTGAAGATGAAGTCTCGGC‑GGTGTTTGAAATGCCGCTCGCCCAGGCATTACATCTGGGTCGTTAt < 1:2233867/289‑1 (MQ=255)
gaaTCTGGGTAAACACCCTGGAAAGGTGGCATTCCCGGGGGGTGCAGTCGATGACACGGACGCATCAGCTATCGCCGCCGCGCTGCGCGAAGCTGAAGAAGAGGTCGCTATACCGCCTTCCGCCGTTGAAGTTATCGGCGTGCTGCCGCCCGTCGATAGCGTCACTGGCTACCAGGTAACCCCAGTGGTCGGCATTATCCCGCCCGATCTGCCGTATCGCGCCAGTGAAGATGAAGTCTCGGC‑GGTGTTTGAAATGCCGCTCGCCCAGGCATTACATCTGGGTCGTTAt < 2:11622/287‑1 (MQ=255)
atcggggTAAACACGCTGGACAAGTGGCATTCCCGGGAGGGGCAGTCGAGGAGACGGACGCATCAGCTATCGCCGCCGCGCTGCGCGAAGCTGAAGAAGAGGTCGCTATACCGCCTTCCGCCGTTGAAGTTATCGGCGTGCTGCCGCCCGTCGATAGCGTCACTGGCTACCAGGTAACCCCAGTGGTCGGCATTATCCCGCCCGATCTGCCGTATCGCGCCAGTGAAGATGAAGTCTCGGC‑GGTGTTTGAAATGCCGCTCGCCCAGGCATTACATCTGGGTCGTTATCa < 2:2203629/283‑1 (MQ=255)
aTCTGCGTAAACACGCTGGACAAGTGGCATTCCCTGGAGGTGCAGTCGATGACACGGACGCATCAGCTATCGCCGCCGCGCTGCGCGAAGCTGAAGAAGAGGTCGCTATACCGCCTTCCGCCGTTGAAGTTATCGGCGTGCTGCCGCCCGTCGATAGCGTCACTGGCTACCAGGTAACCCCAGTGGTCGGCATTATCCCGCCCGATCTGCCGTATCGCGCCAGTGAAGATGACGTCTCGGC‑GGTGTTTGAAATGCCGCTCGCCCAGGCATTACATCTGGGTCGTTATc > 1:1529527/1‑288 (MQ=255)
tGCGTAAACACGCTGGACAAGTGGCATTCCCTGGAGGTGCAGTCGATGACACGGACGCATCAGCTATCGCCGCCGCGCTGCGCGAAGCTGAAGAAGAGGTCGCTATACCGCCTTCCGCCGTTGAAGTTATCGGCGTGCTGCCGCCCGTCGATAGCGTCACTGGCTACCAGGTAACCCCAGTGGTCGGCATTATCCCGCCCGATCTGCCGTATCGCGCCAGTGAAGATGAAGTCTCGGC‑GGTGTTTGAAATGCCGCTCGCCCAGGCATTACATCTGGGTCGTTATCAc > 1:2127158/1‑287 (MQ=255)
acacGCTGGACAAGTGGCATTCCCTGGAGGTGCAGTCGATGACACGGACGCATCAGCTATCGCCGCCGCGCTGCGCGAAGCTGAAGAAGAGGTCGCTATACCGCCTTCCGCCGTTGAAGTTATCGGCGTGCTGCCGCCCGTCGATAGCGTCACTGGCTACCAGGTAACCCCAGTGGTCGGCATTATCCCGCCCGATCTGCCGTATCGCGCCAGTGAAGATGAAGTCTCGGC‑GGTGTTTGAAATGCCGCTCGCCCAGGCATTACATCTGGGTCGTTATCACCCTTTAGat < 1:149834/289‑1 (MQ=255)
cTGGACAAGTGGCATTCCCTGGAGGTGCAGTCGATGACACGGACGCATCAGCTATCGCCGCCTCGCTGCGCGAAGCTGAAGAAGAGGTCGCTATACCGCCTTCCGCCGTTGAAGTTATCGGCGTGCTGCCGCCCGTCGATAGCGTCACTGGCTACCAGGTAACCCCAGTGGTCGGCATTATCCCGCCCGATCTGCCGTATCGCGCCAGTGACAATGAAGTTCCGGC‑GTGGTTTGACATGCCGCTCCCCCAGGCATTACCTGTGGGTCCTTAGCCCCCTTTAGATATc > 2:1557024/1‑287 (MQ=255)
ggACAAGTGGACTTCCCTGGAGGTGAAGTCGATGACACGGACGCATCGGCTATCGCCGCCGCGCTGCGCGAAGCTGAAGAAGAGGTCGCTATACCGCCTTCCGCCGTTGAAGTTATCGGCGTGCTGCCGCCCGTCGATAGCGTCACTGGCTACCAGGTAACCCCAGTGGTCGGCATTATCCCGCCCGATCTGCCGTATCGCGCCAGTGAAGATGAAGTCTCGGC‑GGTGTTTGAAATGCCGCTCGCCCAGGCATTACATCTGGGTCGTTATCACCCTTTAGATATCTAc < 2:2097617/288‑1 (MQ=255)
gACAAGTGGCGTTCCCGGGGGGTGCAGTCGAGGACACGGAGGCATCAGCTATCGCCGCCGCGCTGCGCGAGGCTGAAGAAGAGGTCGCTATACCGCCTTCCGCCGTTGAAGTTATCGGCGTGCTGCCGCCCGTCGATAGCGTCACTGGCTACCAGGTAACCCCAGTGGTCGGCATTATCCCGCCCGATCTGCCGTATCGCGCCAGTGAAGATGAAGTCTCGGC‑GGTGTTTGAAATGCCGCTCGCCCAGGCATTACATCTGGGTCGTTATCACCCtt < 2:1444099/276‑1 (MQ=255)
gCATTCCCTGGAGGTGCAGTCGATGACACGGACGCATCAGCTATCGCCGCCGCGCTGCGCGAAGCTGAAGAAGAGGTCGCTATACCGCCTTCCGCCGTTGAAGTTATCGGCGTGCTGCCGCCCGTCGATAGCGTCACTGGCTACCAGGTAACCCCAGTGGTCGGCATTATCCCGCCCGATCTGCCGTATCGCGCCAGTGAAGATGAAGTCTCGGC‑GGTGTTTGAAATGCCGCTCGCCCAGGCATTACATCTGGGTCGTTATCACCCTTTAGATATCTACCGCCgtggtg > 1:1759763/1‑289 (MQ=255)
aTTCCCTGGAGGTGCAGTCGATGACACGGACGCATCAGCTATCGCCGCCGCGCTGCGCGAAGCTGAAGAAGAGGTCGCTATACCGCCTTCCGCCGTTGAAGTTATCGGCGTGCTGCCGCCCGTCGATAGCGTCACTGGCTACCAGGTAACCCCAGTGGTCGGCATTATCCCGCCCGATCTGCCGTATCGCGCCAGTGAAGATGAAGTCTCGGC‑GGTGTTTGAAATGCCGCCCGCCCAGGCATTACATCTGGGTCGTTATCACCCCTTAGATATCTACCGCCgtgggtat > 2:451421/1‑285 (MQ=255)
cccTGGAGGTGCAGTCGATGACACGGACGCATCAGCTATCGCCGCCGCGCTGCGCGAAGCTGAAGAAGAGGTCGCTATACCGCCTTCCGCCGTTGAAGTTATCGGCGTGCTGCCGCCCGTCGATAGCGTCACTGGCTACCAGGTAACCCCAGTGGTCGGCATTATCCCGCCCGATCTGCCGTATCGCGCCAGTGAAGATGAAGTCTCGGC‑GGTGTTTGAAATGCCGCTCGCCCAGGCATTACATCTGGGTCGTTATCACCCTTTAGATATCTACCGCCGTGGTGAttc > 1:637314/1‑286 (MQ=255)
cTGGAGGTGCAGTCGATGACACGGACGCATCAGCTATCGCCGCCGCGCTGCGCGAAGCTGAAGAAGAGGTCGCTATACCGCCTTCCGCCGTTGAAGTTATCGGCGTGCTGCCGCCCGTCGATAGCGTCACTGGCTACCAGGTAACCCCAGTGGTCGGCATTATCCCGCCCGATCTGCCGTATCGCGCCAGTGAAGATGAAGTCTCGGC‑GGTGTTTGAAATGCCGCTCGCCCAGGCATTACATCTGGGTCGTTATCACCCTTTAGATATCTACCGCCGTGGTGAttcaca < 1:1401367/289‑6 (MQ=255)
gCAGTCGATGACACGGACGCATCAGCTATCGCCGCCGCGCTGCGCGAAGCTGAAGAAGAGGTCGCTATACCGCCTTCCGCCGTTGAAGTTATCGGCGTGCTGCCGCCCGTCGATAGCGTCACTGGCTACCAGGTAACCCCAGTGGTCGGCATTATCCCGCCCGATCTGCCGTATCGCGCCAGTGAAGATGAAGTCTCGGC‑GGTGTTTGAAATGCCGCTCGCCCAGGCATTACATCTGGGTCGTTATCACCCTTTAGATATCTACCGCCGTGGTGATTCACATCGGGTAt > 1:249008/1‑289 (MQ=255)
gCAGGCGAGGACGCAGACGCATGAGCTATCGGCACCGCTCGTGGCGAGGCGGAAGAAGAGGGCGCTATGCCGCGTTGCGCCGGAGAGGTTAGCGGCGTGCTGCCGCCCGTCGATAGCGTCACTGGCTACCAGGTAACCGCAGTGGTCGGCATTATCCGGCCAGATCTGCCGTGTCGAGCCAGTGAAGATGAAGTCTCGGC‑GGTTGTTGAAATGCCGCTCGCCCAGGCATTACATCTGGGTCGTTATCACCCTTGAGATATCTACCGCCGTGGTGATTCACATCGGGTAt < 2:1933121/289‑1 (MQ=255)
cAGTCGATGACACGGACGCATCAGCTATCGCCGCCGCGCTGCGCGAAGCTGAAGAAGAGGTCGCTATACCGCCTTCCGCCGTTGAAGTTATCGGCGTGCTGCCGCCCGTCGATAGCGTCACTGGCTACCAGGTAACCCCAGTGGTCGGCATTATCCCGCCCGATCTGCCGTATCGCGCCAGTGAAGATGAAGTCTCGGC‑GGTGTTTGAAATGCCGCTCGCCCAGGCATTACATCTGGGTCGTTATCACCCTTTAGATATCTACCGCCGTGGTGATTCACATCGGGTATg > 2:559339/1‑289 (MQ=255)
cAGTCGATGACACGGACGCATCAGCTATCGCCGCCGCGCTGCGCGAAGCTGAAGAAGAGGTCGCTATACCGCCTTCCGCCGTTGAAGTTATCGGCGTGCTGCCGCCCGTCGATAGCGTCACTGGCTACCAGGTAACCCCAGTGGTCGGCATTATCCCGCCCGATCTGCCGTATCGCGCCAGTGAAGATGAAGTCTCGGC‑GGTGTTTGAAATGCCGCTCGCCCAGGCATTACATCTGGGTCGTTATCACCCTTTAGATATCTACCGCCGTGGTGATTCACATCGGGTATg > 1:874685/1‑289 (MQ=255)
cAGTCGATGACACGGACGCATCAGCTATCGCCGCCGCGCTGCGCGAAGCTGAAGAAGAGGTCGCTATACCGCCTTCCGCCGTTGAAGTTATCGGCGTGCTGCCGCCCGTCGATAGCGTCACTGGCTACCAGGTAACCCCAGTGGTCGGCATTATCCCGCCCGATCTGCCGTATCGCGCCAGTGAAGATGAAGTCTCGGC‑GGTGTTTGAAATGCCGCTCGCCCAGGCATTACATCTGGGTCGTTATCACCCTTTAGATATCTACCGCCGTGGTGATTCACATCGGGTATg > 2:2014826/1‑289 (MQ=255)
cGATGACACGGACGCATCAGCTATCGCCGCCGCGCTGCGCGAAGCTGAAGAAGAGGTCGCTATACCGCCTTCCGCCGTTGAAGTTATCGGCGTGCTGCCGCCCGTCGATAGCGTCACTGGCTACCAGGTAACCCCAGTGGTCGGCATTATCCCGCCCGATCTGCCGTATCGCGCCAGTGAAGATGAAGTCTCGGC‑GGTGTTTGAAATGCCGCTCGCCCAGGCATTACATCTGGGTCGTTATCACCCTTTAGATATCTACCGCCGTGGTGATTCACATCGGGTATgg < 1:1157992/286‑1 (MQ=255)
cGATGACACGGACGCATCAGCTATCGCCGCCGCGCTGCGCGAAGCTGAAGAAGAGGTCGCTATACCGCCTTCCGCCGTTGAAGTTATCGGCGTGCTGCCGCCCGTCGATAGCGTCACTGGCTACCAGGTAACCCCAGTGGTCGGCATTATCCCGCCCGATCTGCCGTATCGCGCCAGTGAAGATGAAGTCTCGGC‑GGTGTTTGAAATGCCGCTCGCCCAGGCATTACATCTGGGTCGTTATCACCCTTTAGATATCTACCGCCGTGGTGATTCACATCGGGTATgg < 1:1300669/286‑1 (MQ=255)
cggctccgCTATCCCCGCATGGCGGCGGGAAGCTTACGAGGAGGTCGCTAGACCGCCTTCCGCCGTTGAAGTTATCGGCGTGCTGCCGCCCGTCGATAGCGTCACTGGCTACCAGGTAACCCCAGTGGTCGGCATTATCCCGCCCGATCTGCCGTATCGCGCCAGTGAAGATGAAGTCTCGGC‑GGTGTTTGAAATGCCGCTCGCCCAGGCATTACATCTGGGTCGTTATCACCCTTTAGATATCTACCGCCGTGGTGATTCACATCGGGTATGGCTGTCCTGGTACGa < 2:1019120/281‑1 (MQ=255)
cgcatcagCTATCGCCGCCGCGCTGCGCGAAGCTGAAGAAGAGGTCGCTATACCGCCTTCCGCCGTTGAAGTTATCGGCGTGCTGCCGCCCGTCGATAGCGTCACTGGCTACCAGGTAACCCCAGTGGTCGGCATTATCCCGCCCGATCTGCCGTATCGCGCCAGTGAAGATGAAGTCTCGGC‑GGTGTTTGAAATGCCGCTCGCCCAGGCATTACATCTGGGTCGTTATCACCCTTTAGATATCTACCGCCGTGGTGATTCACATCGGGTATGGCTGTCCTGGTACGa < 1:2014826/281‑1 (MQ=255)
catcagCTCTCGCCGACGCGCTGGACGAAGCTGAAGAAGAGGTCGCACTACCCCCTTCCTCCGTTGATGTTATCGGCGTGCTGCCGCACGTAGATAGCGTCACTGGCTACCAGGTAACCCCAGTGGTCGGCATTCGCCCGCCCGATCTGCCGTATCGCGCCAGTGAAGATGAAGTCTCGGC‑GGTGTTTGAAATGCCGCTCGCCCAGGCATTACATCTGGGTCGTTATCACCCTTTAGATATCTACCGCCGTGGTGATTCACATCGGGTATGGCTGTCCTGGTACGAAc < 2:177237/283‑1 (MQ=255)
atcagCTATCGCCGCCGCGCTGCGCGAAGCTGAAGAAGAGGTCGCTATACCGCCTTCCGCCGTTGAAGTTATCGGCGTGCTGCCGCCCGTCGATAGCGTCACTGGCTACCAGGTAACCCCAGTGGTCGGCATTATCCCGCCCGATCTGCCGTATCGCGCCAGTGAAGATGAAGTCTCGGC‑GGTGTTTGAAATGCCGCTCGCCCAGGCATTACATCTGGGTCGTTATCACCCTTTAGATATCTACCGCCGTGGTGATTCACATCGGGTATGGCTGTCCTGGTACGAACAg > 1:1980569/5‑289 (MQ=255)
gccgccgcGCTGCGCGATGCTGAAGAAGAGGTCGCTATACCGCCTTCCGCCGTTGAAGTTATCGGCGTGCTGCCGCCCGTCGATAGCGTCACTGGCTACCAGGTAACCCCAGTGGTCGGCATTATCCCGCCCGATCTGCCGTATCGCGCCAGTGAAGATGAAGTCTCGGC‑GGTGTTTGAAATGCCGCTCGCCCAGGCATTACATCTGGGTCGTTATCACCCTTTAGATATCTACCGCCGTGGTGATTCACATCggg < 1:493755/256‑1 (MQ=255)
gccgccgcGCTGCGCGAAGCTGAAGAAGAGGTCGCTATACCGCCTTCCGCCGTTGAAGTTATCGGCGTGCTGCCGCCCGTCGATAGCGTCACTGGCTACCAGGTAACCCCAGTGGTCGGCATTATCCCGCCCGATCTGCCGTATCGCGCCAGTGAAGATGAAGTCTCGGC‑GGTGTTTGAAATGCCGCTCGCCCAGGCATTACATCTGGGTCGTTATCACCCTTTAGATATCTACCGCCGTGGTGATTCACATCGGGTATGGCTGTCCTGGTACGAACAGTATTTTGTAt > 1:678966/1‑289 (MQ=255)
gccgccgcGCTGCGCGAAGCTGAAGAAGAGGTCGCTATACCGCCTTCCGCCGTTGAAGTTATCGGCGTGCTGCCGCCCGTCGATAGCGTCACTGGCTACCAGGTAACCCCAGTGGTCGGCATTATCCCGCCCGATCTGCCGTATCGCGCCAGTGAAGATGAAGTCTCGGC‑GGTGTTTGAAATGCCGCTCGCCCAGGCA‑TACATCTGGGTCGTTATCACCCTTTAGATATCTACCGCCGTGGTGATTCACATCGGGTATgg < 1:29854/260‑1 (MQ=255)
cgcgCTGCGCGAAGCTGAAGAAGAGGTCGCTATACCGCCTTCCGCCGTTGAAGTTATCGGCGTGCTGCCGCCCGTCGATAGCGTCACTGGCTACCAGGTAACCCCAGTGGTCGGCATTATCCCGCCCGATCTGCCGTATCGCGCCAGTGAAGATGAAGTCTCGGC‑GGTGTTTGAAATGCCGCTCGCCCAGGCATTACATCTGGGTCGTTATCACCCTTTAGATATCTACCGCCgtggt > 1:1106643/1‑238 (MQ=255)
gcTGCGCGAAGCTGAAGAAGAGGTCGCTATACCGCCTTCCGCCGTTGAAGTTATCGGCGTGCTGCCGCCCGTCGATAGCGTCACTGGCTACCAGGTAACCCCAGTGGTCGGCATTATCCCGCCCGATCTGCCGTATCGCGCCAGTGAAGATGAAGTCTCGGC‑GGTGTTTGAAATGCCGCTCGCCCAGGCATTACATCTGGGTCGTTATCACCCTTTAGATATCTACCGCCGTGGTGATTCACATCGGGTATGGCTGTCCTGGTACGAACAGTATTTTGTATGGGGAAt < 1:451421/288‑1 (MQ=255)
gcgAAGCTGAAACAGAGGTCGCTATACCGCCTTCAGCCGTTGAAGTTATCGGCGTGCTGCCGCCCGTCGATAGCGTCACTGGCTACCAGGTAACCCCAGTGGTCGGCATTATCCCGCCCGATCTGCCGTATCGCGCCAGTGAAGATGAAGTCTCGGC‑GGTGTTTGAAATGCCGCTCGCCCAGGCATTACATCTGGGTCGTTATCACCCTTTAGATATCTACCGCCGTGGTGATTCACATCGGGTATGGCTGTCCTGGTACGAACAGTATTTTGTATGGGGAATGACCg < 1:1218232/288‑1 (MQ=255)
aGCTGAAGAAGAGGTCGCTATACCGCCTTCCGCCGTTGAAGTTATCGGCGTGCTGCCGCCCGTAGATAGCGTCACTGGCTACCAGGTAACCCCAGTGGTCGGCATTATCCCGCCCGATCTGCCGTATCGCGCCAGTGAAGATGAAGTCTCGGC‑GGTGTTTGAAATGCCGCTCGCCCAGGCATTACATCTGGGTCGTTATCACCCTTTAGATATCTACCGCCGTGGTGATTCACATCGGGTATGGCTGTCCTGGTACGAACAGTATTTTGTATGGGGAAt < 1:1199646/279‑1 (MQ=255)
gTCGCTATACCGCCTTCCGCCGTTGAAGTTATCGGCGTGCTGCCGCCCGTCGATAGCGTCACTGGCTACCAGGTAACCCCAGTGGTCGGCATTATCCCGCCCGATCTGCCGTATCGCGCCAGTGAAGATGAAGTCTCGGC‑GGTGTTTGAAATGCCGCTCGCCCAGGCATTACATCTGGGTCGTTATCACCCTTTAGATATCTACCGCCGTGGTGAtt > 2:1221850/1‑216 (MQ=255)
cGCTATACCGCCTTCCGCCGTTGAAGTTATCGGCGTGCTGCCGCCCGTCGATAGCGTCACTGGCTACCAGGTAACCCCAGTGGTCGGCATTATCCCGCCCGATCTGCCGTATCGCGCCAGTGAAGATGAAGTCTCGGC‑GGTGTTTGAAATGCCGCTCGCCCAGGCATTACATCTGGGTCGTTATCACCCTTTAGATATCTACCGCCGTGGTGATTCACATCggg < 2:715066/224‑1 (MQ=255)
cGCTATACCGCCTTCCGCCGTTGAAGTTATCGGCGTGCTGCCGCCCGTCGATAGCGTCACTGGCTACCAGGTAACCCCAGTGGTCGGCATTATCCCGCCCGATCTGCCGTATCGCGCCAGTGAAGATGAAGTCTCGGC‑GGTGTTTGAAATGCCGCTCGCCCAGGCATTACATCTGGGTCGTTATCACCCTTTAGATATCTACCGCCGTGGTGATTCACATCggg > 1:715066/1‑224 (MQ=255)
aCCGCCTTCCGCCGTTGAAGTTATCGGCGTGCTGCCGCCCGTCGATAGCGTCACTGGCTACCAGGTAACCCCAGTGGTCGGCATTATCCCGCCCGATCTGCCGTATCGCGCCAGTGAAGATGAAGTCTCGGC‑GGTGTTTGAAATGCCGCTCGCCCAGGCATTACATCTGGGTCGTTATCACCCTTTAGATATCTACCGCCGTGGTGATTCACATCGGGTATGGCTGTCCTGGTACGaa < 1:2094588/238‑1 (MQ=255)
aCCGCCTTCCGCCGTTGAAGTTATCGGCGTGCTGCCGCCCGTCGATAGCGTCACTGGCTACCAGGTAACCCCAGTGGTCGGCATTATCCCGCCCGATCTGCCGTATCGCGCCAGTGAAGATGAAGTCTCGGC‑GGTGTTTGAAATGCCGCTCGCCCAGGCATTACATCTGGGTCGTTATCACCCTTTAGATATCTACCGCCGTGGTGATTCACATCGGGTATGGCTGTCCTGGTACGAACAGTATTTTGTATGGGGAAt < 2:340819/258‑1 (MQ=255)
gCCTTCCGCCGTTGAAGTTATCGGCGTGCTGCCGCCCGTCGATAGCGTCACTGGCTACCAGGTAACCCCAGTGGTCGGCATTATCCCGCCCGATCTGCCGTATCGCGCCAGTGAAGATGAAGTCTCGGC‑GGTGTTTGAAATGCCGCTCGCCCAGGCATTACATCTGGGTCGTTATCACCCTTTAGATATCTACCGCCGTGGTGATTCACATCGGGTATGGCTGTCCTGGTACGAACAGTATTTTGTATGGGGAATGACCGCAGGCATAATTCGTGAGCTGGCGCTGCaa > 1:1007467/1‑289 (MQ=255)
ccTTCCGCCGTTGAAGTTATCGGCGTGCTGCCGCCCGTCGATAGCGTCACTGGCTACCAGGTAACCCCAGTGGTCGGCATTATCCCGCCCGATCTGCCGTATCGCGCCAGTGAAGATGAAGTCTCGGC‑GGTGTTTGAAATGCCGCTCGCCCAGGCATTACATCTGGGTCGTTATCACCCTTTAGATATCTACCGCCgtg < 1:261791/199‑1 (MQ=255)
ccTTCCGCCGTTGAAGTTATCGGCGTGCTGCCGCCCGTCGATAGCGTCACTGGCTACCAGGTAACCCCAGTGGTCGGCATTATCCCGCCCGATCTGCCGTATCGCGCCAGTGAAGATGAAGTCTCGGC‑GGTGTTTGAAATGCCGCTCGCCCAGGCATTACATCTGGGTCGTTATCACCCTTTAGATATCTACCGCCGTGGTGATTCACATCGGGTATGGCTGTCCTGGTACGAACAGTATTTTGTATGGGGAATGACCGCAGGCATAATTCGTGAGCTGGCGCTGCaaa > 2:688806/1‑289 (MQ=255)
ctgccgccgTTGAAGTTAGCGGCGTGCTGCCGCCCGTCGATAGCGTCACTGGCTCGCAGGTAAACCCAGTGGTCGGAATTATCCCGCCCGGTCTGCCGTAGCGCGGCAGTGAAGATGAAGTCTCGGC‑GGGATTTGAAATGCCGCTCGCCCAGGGATTACATCTGGGTCGGTAGCACCCTTTAGATATCTACCGCCGTGGTGATTCACATCGGGTATGGCTGTCCTGGTACGAACAGTATTGTGTATGGGGAATGACCGCAGGCATAATTCGTGAGCTGGCGCTGCAAAt < 2:1466625/286‑1 (MQ=255)
cTTCCGCCGTTGAAGTTATCGGCGTGCTGCCGCCCGTCGATAGCGTCACTGGCTACCAGGTAACCCCAGTGGTCGGCATTATCCCGCCCGATCTGCCGTATCGCGCCAGTGAAGATGAAGTCTCGGC‑GGTGTTTGAAATGCCGCTCGCCCAGGCATTACATCTGGGTCGTTATCACCCTTTAGATATCTACCGCCGTGGTGATTCACATCGGGTATGGCTGTCCTGGTACGAACAGTATTTTGTATGGGGAATGACCGCAGGCATAATTCGTGAGCTGGCGCTGCAAAt > 1:1368853/1‑289 (MQ=255)
actCCGCGGTTGAAGTTATCGGCGTGCTGCGGCCCGTCGATAGCGTCACTGGCTACCAGGTAACCCCAGTGGTCGGCATTATCCCGCCCGATCTGCCGTATCGCGCCAGTGAAGATGAAGTCTCGGC‑GGTGTTTGAAATGCCGCTCGCCCAGGCATTACATCTGGGTCGTTATCACCCTTTAGATATCTACCGCCGTGGTGATTCACATCGGGTATGGCTGTCCTGGTACGAACAGTATTTTGTATGGGGAATGACCGCAGGCATAATTCGTGAGCTGGCGCTGCAAAt < 2:1812916/287‑1 (MQ=255)
tCCGCCGTTGAAGTTATCGGCGTGCTGCCGCCCGTCGATAGCGTCACTGGCTACCAGGTAACCCCAGTGGTCGGCATTATCCCGCCCGATCTGCCGTATCGCGCCAGTGAAGATGAAGTCTCGGC‑GGTGTTTGAAATGCCGCTCGCCCAGGCATTACATCTGGGTCGTTATCACCCTTTAGATATCTACCGCCGTGGTGATTCACATCGGGTATGGCTGTCCTGGTACGAACAGTATTTTGTATGGGGAATGACCGCCGGCATAATTCGTGAGGTGGCGTTGCCAAtgg > 2:1100305/1‑287 (MQ=255)
tCCGCCGTTGAAGTTATCGGCGTGCTGCCGCCCGTCGATAGCGTCACTGGCTACCAGGTAACCCCAGTGGTCGGCATTATCCCGCCCGATCTGCCGTATCGCGCCAGTGAAGATGAAGTCTCGGC‑GGTGTTTGAAATGCCGCTCGCCCAGGCATTACATCTGGGTCGTTATCACCCTTTAGATATCTACCGCCGTGGTGATTCACATCGGGTATGGCTGTCCTGGTACGAACAGTATTTTGTATGGGGAATGACCGCAGGCATAATTCGTGAGCTGGCGCTGCAAATTg < 1:2069709/289‑1 (MQ=255)
ttGAAGTTATCGGCGTGCTGCCGCCCGTCGATAGCGTCACTGGCTACCAGGTAACCCCAGTGGTCGGCATTATCCCGCCCGATCTGCCGTATCGCGCCAGTGAAGATGAAGTCTCGGC‑GGTGTTTGAAATGCCGCTCGCCCa > 2:257773/1‑142 (MQ=255)
aggtATCGGCGTGCTGCCGCCCTTCGATAGCTTCATTGGCTAGCAGGTAACCCCAGTGGTCGTCATTATCCCGCCCGATCTGCCGCATCGCGCCAGTGAAGATGAAGTCTCGGC‑GGTGTTTGAAATGCCGCTCGCCCAGGCATTACATCTGGGTCGTTATCACCCTTTAGATATCTACCGCCGTGGTGATTCACATCGGGTATGGCTGTCCTGGTACGAACAGTATTTTGTATGGGGAATGACCGCAGGCATAATTCGTGAGCTGGCGCTGCAAATTGGTGTGAAAcc < 2:2147873/285‑1 (MQ=255)
aGTTATCGGCGTGCTGCCGCCCGTCGATAGCGTCACTGGCTACCAGGTAACCCCAGTGGTCGGCATTATCCCGCCCGATCTGCCGTATCGCGCCAGTGAAGATGAAGTCTCGGC‑GGTGTTTGAAATGCCGCTCGCCCAGGCATTACATCTGGGTCGTTATCACCCTTTAGATATCTACCGCCGTGGTGATTCACATCGGGTATGGCTGTCCTGGTACGAACAGTATTTTGTATGGGGAATGACCGCAGGCATAATTCGTGAGCTGGCGCTGCAAATTGGTGTGAAAcc < 1:1695829/288‑1 (MQ=255)
tATCGGCGTGCTGCCGCCCGTCGATAGCGTCACTGGCTACCAGGTAACCCCAGTGGTCGGCATTATCCCGCCCGATCTGCCGTATCGCGCCAGTGAAGATGAAGTCTCGGC‑GGTGTTTGAAATGCCGCTCGCCCAGGCATTACATCTGGGTCGTTATCACCCTTTAGATATCTACCGCCGTGGTGATTCACATCGGGTATGGCTGTCCTGGTACGAACAGTATTTTGTATGGGGAATGACCGCAGGCATAATTCGTGAGCTGGCGCTGCAAATTGGTGTGAAACCCTGa < 2:828628/289‑1 (MQ=255)
tATCGGCGTGCTGCCGCCCGTCGATAGCGTCACTGGCTACCAGGTAACCCCAGTGGTCGGCATTATCCCGCCCGATCTGCCGTATCGCGCCAGTGAAGATGAAGTCTCGGC‑GGTGTTTGAAATGCCGCTCGCCCAGGCATTACATCTGGGTCGTTATCACCCTTTAGATATCTACCGCCGTGGTGATTCACATCGGGTATGGCTGTCCTGGTACGAACAGTATTTTGTATGGGGAATGACCGCAGGCATAATTCGTGAGCTGGCGCTGCAAATTGGTGTGAAACCCTGa < 2:874685/289‑1 (MQ=255)
aTCGGCGTGCTGCCGCCCGTCGATAGCGTCACTGGCTACCAGGTAACCCCAGTGGTCGGCATTATCCCGCCCGATCTGCCGTATCGCGCCAGTGAAGATGAAGTCTCGGC‑GTTGTTTGAAATGCCGCTCGCCCAGGCATTACATCTGGGTCGTTATCACCCTTTAGATATCTACCGCCGTGGTGATTCACATCGGGTATGGCTGTCCTGGTACGAAc < 1:1586135/217‑1 (MQ=255)
aTCGGCGTGCTGCCGCCCGTCGATAGCGTCACTGGCTACCAGGTAACCCCAGTGGTCGGCATTATCCCGCCCGATCTGCCGTATCGCGCCAGTGAAGATGAAGTCTCGGC‑GGTGTTTGAAATGCCGCTCGCCCAGGCATTACATCTGGGTCGTTATCACCCTTTAGATATCTACCGCCGTGGTGATTCACATCGGGTATgg < 2:7574/201‑1 (MQ=255)
aTCGGCGTGCTGCCGCCCGTCGATAGCGTCACTGGCTACCAGGTAACCCCAGTGGTCGGCATTATCCCGCCCGATCTGCCGTATCGCGCCAGTGAAGATGAAGTCTCGGC‑GGTGTTTGAAATGCCGCTCGCCCAGGCATTACATCTGGGTCGTTATCACCCTTTAGATATCTACCGCCGTGGTGATTCACATCGGGTATgg > 1:7574/1‑201 (MQ=255)
aTCGGCGTGCTGCCGCCCGTCGATAGCGTCACTGGCTACCAGGTAACCCCAGTGGTCGGCATTATCCCGCCCGATCTGCCGTATCGCGCCAGTGAAGATGAAGTCTCGGC‑GGTGTTTGAAATGCCGCTCGCCCAGGCATTACATCTGGGTCGTTATCACCCTTTAGATATCTACCGCCGTGGTGATTCACATCGGGTATGGCTGTCCTGGTACGAAc > 2:1586135/1‑217 (MQ=255)
aTCGGCGTGCTGCCGCCCGTCGATAGCGTCACTGGCTACCAGGTAACCCCAGTGGTCGGCATTATCCCGCCCGATCTGCCGTATCGCGCCAGTGAAGATGAAGTCTCGGC‑GGTGTTTGAAATGCCGCTCGCCCAGGCATTACATCTGGGTCGTTATCACCCTTTAGATATCTACCGCCGTGGTGATTCACATCGGGTATGGCTGTCCTGGTACGAACAGTATTTTGTATGGGGAATGACCGCAGGCATAATTCGTGAGCTGGCGCTGCAAATTGGTGTGAAACCCTg > 2:1656277/1‑287 (MQ=255)
ccgccCGTCGATAGCGTCACTGGCTACCAGGTAACCCCAGTGGTCGGCATTATCCCGCCCGATCTGCCGTATCGCGCCAGTGAAGATGAAGTCTCGGC‑GGTGTTTGAAATGCCGCTCGCCCAGGCATTACATCTGGGTCGTTATc > 1:76054/1‑145 (MQ=255)
cccgttgtgcacGTCCCTGGCAACCAGGTAACCCCAGTGGTCGGCATTATCCCGCCCGATCGGCCGTATCGCGCCAGTGAAGTTGAAGTCTCGGC‑GGTGTTTGAAATGCCGCTCGCCCAGGCATTACATCTGGGTCGTTATCACCCTTTAGATATCTACCGCCGTGGTGATTCACATCGGGTATGGCTGTCCTGGTACGAACAGTATTTTGTATGGGGAATGACCGCAGGCATAATTCGTGAGCTGGCGCTGCAAATTGGTGTGAAACCCTGACTATAC‑TTATCTTTAc < 2:844383/278‑1 (MQ=255)
cccGTCGATAGCGTCACTGGCTACCAGGTAACCCCAGTGGTCGGCATTATCCCGCCCGATCTGCCGTATCGCGCCAGTGAAGATGAAGTCTCGGC‑GGTGTTTGAAATGCCGCTCGCCCAGGCATTACATCTGGGTCGTTATCACCCTTTAGATATCTACCGCCGTGGTGATTCACATCGGGTATGGCTGTCCTGGTACGAACAGTATTTTGTATGGGGAATGACCGCAGGCATAATTCGTGAGCTGGCGCTGCAAATTGGTGTGAAACCCTGACTATAC‑TTATCTTTAc > 1:501289/1‑289 (MQ=255)
cGATAGCGTGACTGGGCACCAGGTAACCCCAGTGGTCGGCATTATCCCGCCCGTGCTGCCGTATCGCGCCAGTGAAGATGAAGTCTCGGC‑GGTGTTTGAAATGCCGCTCGCCCAGGCATTACATCTGGGTCGTTATCACCCTTTAGATATCTACCGCCGTGGTGATTCACATCGGGTATGGCTGTCCTGGTACGAACAGTATTTTGTATGGGGAATGACCGCAGGCATAATTCGTGAGCTGGCGCTGCAAATTGGTGTGAAACCCTGACTATAC‑TTATCTTTACATCTa < 2:736579/289‑1 (MQ=255)
tAGCGTCACTGGCTACCAGGTAACCCCAGTGGTCGGCATTATCCCGCCCGATCTGCCGTATCGCGCCAGTGAAGATGAAGTCTCGGC‑GGTGTTTGAAATGCCGCTCGCCCAGGCATTACATCTGGGTCGTTATCACCCTTTAGATATCTACCGCCGTGGTGATTCACATCGGGTATGGCTGTCCTGGTACGAACAGTATTTTGTATGGGGAATGACCGCAGGCATAATTCGTGAGCTGGCGCTGCAAATTGGTGTGAAACCCTGACTATAC‑TTATCTTTACATCTACa < 2:369796/288‑1 (MQ=255)
cGTCACTGGCTACCAGGTAACCCCAGTGGTCGGCATTATCCCGCCCGATCTGCCGTATCGCGCCAGTGAAGATGAAGTCTCGGC‑GGTGTTTGAAATGCCGCTCGCCCAGGCATTACATCTGGGTCGTTATCACCCTTTAGATATCTACCGCCGTGGTGATTCACATCGGGTATGGCTGTCCTGGTACGAACAGTATTTTGTATGGGGAATGACCGCAGGCATAATTCGTGAGCTGGCGCTGCAAATTGGTGTGAAACCCTGACTATAC‑TTATCTTTACATCTACAAAac > 2:1334494/1‑289 (MQ=255)
cGTCACTGGCTACCAGGTAACCCCAGTGGTCGGCATTATCCCGCCCGATCTGCCGTATCGCGCCAGTGAAGATGAAGTC‑TCGCAGGTGTTGGAAATGCCGCTCGACCAGGCTTTACAGCTGGGTCGTTATGACCCTTGAGGTATAAACCGCCGCGGTGATTCACATCGCGTACGGTGGCCCTGGTCTGAACATCATTTTCAATGGGGATTGCACGCCGCCATAATTCGTGAGGTGGCGCTGCCAACTGCTGTGATACTCGAACGCTCC‑CTATCGTTACTTCTACaaaag > 2:47255/1‑288 (MQ=255)
gTCACTGGCTACCAGGTAACCCCGGTGGGCGGCATTCTCCCGCCCGATCTGCCGTATCGCGCCAGTGAAGATGAAGTCTCGGC‑GGTGTTTGAAATGCCGCTCGCCCAGGCATTACATCTGGGTCGTTATCACCCTTTAGATATCTACCGCCGTGGTGATTCACATCGGGTATGGCTGTCCTGGTACGAACAGTATTTTGTATGGGGAATGACCGCAGGCATAATTCGTGAGCTGGCGCTGCAAATTGGTGTGAAACCCTGACTATAC‑TTATCTTTACATCTACAAAaca < 2:1303735/289‑1 (MQ=255)
gTCACTGGCTACCAGGTAACCCCAGTGGTCGGCATTATCCCGCCCGATCTGCCGTATCGCGCCAGTGAAGATGAAGTCTCGGC‑GGTGTTTGAAATGCCGCTCGCCCAGGCATTACATCTGGGTCGTTATCACCCTTTAGATATCTACCGCCGTGGTGATTCACATCGGGTATGGCTGTCCTGGTACGAACAGTATTTTGTATGGGGAATGACCGCAGGCATAATTCGTGAGCTGGCGCTGCAAATTGGTGTGAAACCCTGACTATAC‑TTATCTTTACATCTACAAAaca < 2:60736/289‑1 (MQ=255)
aCTGGCTACCAGGTAACCCCAGTGGTCGGCATTATCCCGCCCGATCTGCCGTATCGCGCCAGTGAAGATGAAGTCTCGGC‑GATGTTTGAAATGCCGCTCGCCCAGGCATTACATCTGGGTCGTTATCACCCTTTAGATATCTACCGCCGTGGTGATTCACATCGGGTATGGCTGTCCTGGTACGAACAGTATTTTGTATGGGGAATGACCGCAGGCATAATTCGTGAGCTGGCGCTGCAAATTGGTGTGAAAc < 2:290452/253‑1 (MQ=255)
aCCAGGTAACCCCAGTGGTCGGCATTATCCCGCCCGATCTGCCGTATCGCGCCAGTGAAGATGAAGTCTCGGC‑GGTGTTTGAAATGCCGCTCGCCCAGGCATTACATCTGGGTCGTTATCACCCTTTAGATATCTACCGCCGTGGTGAttcaca < 1:356608/154‑6 (MQ=255)
ccAGGTAACCCCAGTGGTCGGCATTATCCCGCCCGATCTGCCGTATCGCGCCAGTGAAGATGAAGTCTCGGC‑GGTGTTTGAAATGCCGCTCGCCCAGGCATTACATCTGGGTCGTTATCACCCTTTAGATATCTACCGCCGTGGTGATTCACATCGGGTATGGCTGTCCTGGTACGAACAGTTTTTTGTCTGGGGAATGCCCTCAGGCCTAATTCGTTGGCTTGCGCTGCAAATTGGGGTGAAACCCTCCCT‑TACATTATCTTTCCCTCTAAAAAACACTACATgcac > 2:410739/1‑285 (MQ=255)
aaCCCCAGTGGTCGGCATTATCCCGCCCGATCTGCCGTATCGCGCCAGTGAAGATGAAGTCTCGGC‑GGTGTTTGAAATGCCGCTCGCCCAGGCATTACATCTGGGTCGTTATCACCCTTTAGATATCTACCGCCGTGGTGATTCACATCGGGTATGGCTGTCCTGGTACGAACAGTATTTTGTATGGGGAATGACCGCAGGCATAATTCGTGAGCTGGCGCTGCAAATTGGTGTGAAACCCTGACTATAC‑TTATCTTTACATCTACAAAACACTACTTGAGACAatca > 2:103910/1‑288 (MQ=255)
ccccGGGGGTCGGGTATAGCCCGCCCGATTTGCCGTATTGCGCCAGTGAAGATGAAGGCTCGGG‑GGTGTTTGAAATGCCGCTCGCCCAGGCATTACATCTGGGTCGTTATCACCCTTTAGATATCTACCGCCGTGGTGATTCACATCGGGTATGGCTGTCCTTGTACGAACAGTATTTTGTATGGGGAATGACCGCAGGCATAATTCGTGAGCTGGCGCTGCAAATTGGTGTGAAACCCTGACTATAC‑TTATCTTTACATCTACAAAACACTACTTGAGACAATCATCg < 2:2127158/289‑1 (MQ=255)
ccccAGTGGTCGGCATTATCCCGCCCGATCTGCCGTATCGCGCCAGTGAAGATGAAGTCTCGGC‑GGTGTTTGAAATGCCGCTCGCCCAGGCATTACATCTGGGTCGTTATCACCCTTTAGATATCTACCGCCGTGGTGATTCACATCGGGTATGGCTGTCCTGGTACGAACAGTATTTTGTATGGGGAATGACCGCAGGCATAATTCGTGAGCTGGCGCTGCAAATTGGTGTGAAACCCTGACTATAC‑TTATCTTTACATCTACAAAACACTACTTGAGACAATCATCg < 1:676151/289‑1 (MQ=255)
gTGGTCGGCATTATCCCGCCCGATCTGCCGTATCGCGCCAGTGAAGATGAAGTCTCGGC‑GGTGTTTGAAATGCCGCTCGCCCAGGCATTACATCTGGGTCGTTATCACCCTTTAGATATCTACCGCCGTGGTGAttcaca > 1:697606/1‑135 (MQ=255)
gTGGTCGGCATTATCCCGCCCGATCTGCCGTATCGCGCCAGTGAAGATGAAGTCTCGGC‑GGTGTTTGAAATGCCGCTCGCCCAGGCATTACATCTGGGTCGTTATCACCCTTTAGATATCTACCGCCGTGGTGATTCACATCGGGTATGGCTGTCCTGGTACGAACAGTATTTTGTATGGGGAATGACCGCAGGCAt > 1:1242988/1‑197 (MQ=255)
gTGGTCGGCATTATCCCGCCCGATCTGCCGTATCGCGCCAGTGAAGATGAAGTCTCGGC‑GGTGTTTGAAATGCCGCTCGCCCAGGCATTACATCTGGGTCGTTATCACCCTTTAGATATCTACCGCCGTGGTGATTCACATCGGGTATGGCTGTCCTGGTACGAACAGTATTTTGTATGGGGAATGACCGCAGGCATAATTCGTGAGCTGGCGCTGCAAATTGGTGTGAAACCCTGACTATAC‑TTATCTTTACATCTACAAAACACTACTTGAGACAATCATCGCAata > 1:908379/1‑289 (MQ=255)
ggCATTATCCCGCCCGATCTGCCGTATCGCGCCAGTGAAGATGAAGTCTCGGC‑GGTGTTTGAAATGCCGCTCGCCCAGGCATTACATCTGGGTCGTTATCACCCTTTAGATATCTACCGCCGTGGTGATTCACATCGGGTATGGCTGTCCTGGTACGAACAGTATTTTGTATGGGGAATGACCGCAGGCATAATTCGTGAGCTGGCGCTGCAAATTGGTGTGa < 1:831139/223‑1 (MQ=255)
ggCATTATCCCGCCCGATCTGCCGTATCGCGCCAGTGAAGATGAAGTCTCGGC‑GGTGTTTGAAATGCCGCTCGCCCAGGCATTACATCTGGGTCGTTATCACCCTTTAGATATCTACCGCCGTGGTGATTCACATCGGGTATGGCTGTCCTGGTACGAACAGTATTTTGTATGGGGAATGACCGCAGGCATAATTCGTGAGCTGGCGCTGCAAATTGGTGTGAAACCCTGACTATAC‑TTATCTTTACATCTACAAAACACTACTTGAGACAat > 1:10513/1‑273 (MQ=255)
tATCCCGCCCGATCTGCCGTATCGCGCCAGTGAAGATGAAGTCTCGGC‑GGTGTTTGAAATGCCGCTCGCCCAGGCATTACATCTGGGTCGTTATCACCCTTTAGATATCTACCGCCGTGGTGATTCACATCGGGTATGGCTGTCCTGGTACGAACAGTATTTTGTATGGGGAATGACCGCAGGCATAATTCGTGAGCTGGCGCTGCAAATTGGTGTGAAACCCTGACTATAC‑TTATCTTTACATCTACAAAACACTACTTGAGACAATCATCGCAATATTAGTTAAATc > 1:411997/1‑289 (MQ=255)
cccgATCTGCCGTATCGCGCCAGTGAAGATGAAGTCTCGGC‑GGTGTTTGAAATGCCGCTCGCCCAGGCATTACATCTGGGTCGTTATCACCCTTTAGATATCTACCGCCGTGGTGATTCACCTCGGGTATGGCTGGCCTGGTACGAACAGTATTTTGTATGGGGAATGACCGCAGGCATAATTCGTGAGCTGCCGCTGCAAATTGGTGTGAAACCCTGACTATAC‑TTATCTTTACATCTCCAAACCACTACTTGAGACCATCATCGCACTATTCGTTACATCGCGGttt > 2:2073864/1‑289 (MQ=255)
cccgATCTGCCGTATCGCGCCAGTGAAGATGAAGTCTCGGC‑GGTGTTTGAAATGCCGCTCGCCCAGGCATTACATCTGGGTCGTTATCACCCTTTAGATATCTACCGCCGTGGTGATTCACATCGGGTATGGCTGTCCTGGTACGAACAGTATTTTGTATGGGGAATGACCGCAGGCATAATTCGTGAGCTGGCGCTGCAAATTGGTGTGAAACCCTGACTATAC‑TTATCTTTACATCTACAAAACACTACTTGAGACAATCATCGCAATATTAGTTAAATCGCGGttt > 1:1657805/1‑289 (MQ=255)
cccgATCTGCCGTATCGCGCCAGTGAAGATGAAGTCTCGGC‑GGTGTTTGAAATGCCGCTCGCCCAGGCATTACATCTGGGTCGTTATCACCCTTTAGATATCTACCGCCGTGGTGATTCACATCGGGTATGGCTGTCCTGGTACGAACAGTATTTTGTATGGGGAATGACCGCAGGCATAATTCGTGAGCTGGCGCTGCAAATTGGTGTGAAACCCTGACTATAC‑TTATCTTTACATCTACAAAACACTACTTGAGACAATCATCGCAATATTAGTTAAATCGCGGttt > 1:535999/1‑289 (MQ=255)
tCTGCCGTATCGCGCCAGTGAAGATGAAGTCTCGGC‑GGTGTTTGAAATGCCGCTCGCCCAGGCATTACATCTGGGTCGTTATCACCCTTTAGATATCTACCGCCGTGGTGATTCACATCGGGTATGGCTGTCCTGGTACGAACAGTATTTTGTATGGGGAATGACCGCAGGTATAATTCGTGAGCTGGCGCTGCCAATTGGTGTGAAACCCTGACTATAC‑TTATCTTTACATCTACAACAAATTCCTTGAGACACTCCTCTCAATTTTCGTTAAACCGCGGTTTTCGAt > 2:239757/1‑289 (MQ=255)
tATCGCGCCAGTGAAGATGAAGTCTCGGC‑GGTGTTTGAAATGCCGCTCGCCCAGGCATTACATCTGGGTCGTTATCACCCTTTAGATATCTACCGCCGTGGTGATTCACATCGGGTATGGCTGTCCTGGTACGAACAGTATTTTGTATGGGGAATGACCGCAGGCATAATTCGTGAGCTGGCGCTGCAAATTGGTGTGAAACCCTGACTATAC‑TTATCTTTACATCTACAAAACACTACTTGAGACAATCATCGCAATATTAGTTAAATCGCGGTTTTTGATTAGTTTa > 1:1794672/1‑289 (MQ=255)
aTCGCGCCAGTGAAGATGAAGTCTCGGC‑GGTGTTTGAAATGCCGCTCGCCCAGGCATTACATCTGGGTCGTTATCACCCTTTAGATATCTACCGCCGTGGTGATTCACATCGGGTATGGCTGTCCTGGTACGAACAGTATTTTGTATGGGGAATGACCGCAGGCATAATTCGTGAGCTGGCGCTGCAAATTGGTGTGAAACCCTGACTATAC‑TTATCTTTACATCTACAAAACACTACTTGAGACAATCATCGCAATATTAGTTAAATCGCGGTTTTTGATTAGTTTaa < 1:1334494/289‑1 (MQ=255)
aTCGCGCCAGTGAAGATGAAGTCTCGGC‑GGTGTTTGAAATGCCGCTCGCCCAGGCATTACATCTGGGTCGTTATCACCCTTTAGATATCTACCGCCGTGGTGATTCACATCGGGTATGGCTGTCCTGGTACGAACAGTATTTTGTATGGGGAATGACCGCAGGCATAATTCGTGAGCTGGCGCTGCAAATTGGTGTGAAACCCTGACTATAC‑TTATCTTTACATCTACAAAACACTACTTGAGACAATCATCGCAATATTAGTTAAATCGCGGTTTTTGATTAGTTTaa < 2:1359427/289‑1 (MQ=255)
cgcgCCAGTGAAGATGAAGTCTCGGC‑GGTGTTTGAAATGCCGCTCGCCCAGGCATTACATCTGGGTCGTTATCACCCTTTAGATATCTACCGCCGTGGTGATTCACATCGGGTATGGCTGTCCTGGTACGAACAGTATTTTGTATGGGGAATGACCGCAGGCATAATTCGTGAGCTGGCGCTGCAAATTGGTGTGAAACCCTGACTATAC‑TTATCTTTAc > 1:579846/1‑220 (MQ=255)
cgcgCCAGTGAAGATGAAGTCTCGGC‑GGTGTTTGAAATGCCGCTCGCCCAGGCATTACATCTGGGTCGTTATCACCCTTTAGATATCTACCGCCGTGGTGATTCACATCGGGTATGGCTGTCCTGGTACGAACAGTATTTTGTATGGGGAATGACCGCAGGCATAATTCGTGAGCTGGCGCTGCAAATTGGTGTGAAACCCTGACTATAC‑TTATCTTTACATCTACAAAACACTACTTGAGACAATCATCGCAATATTAGTTAAATCGCGGTTTTTGATTAGTTTAAtt < 1:330982/289‑1 (MQ=255)
|||
CCGTCGACCGCAACCGGGGTTGTTGCTGACTCAGCGTAGCATTCATCTGCGTAAACACGCTGGACAAGTGGCATTCCCTGGAGGTGCAGTCGATGACACGGACGCAAGTGCTATCGCCGCCGCGCTGCGCGAAGCTGAAGAAGAGGTCGCTATACCGCCTTCCGCCGTTGAAGTTATCGGCGTGCTGCCGCCCGTCGATAGCGTCACTGGCTACCAGGTAACCCCAGTGGTCGGCATTATCCCGCCCGATCTGCCGTATCGCGCCAGTGAAGATGAAGTCAGCGC‑GGTGTTTGAAATGCCGCTCGCCCAGGCATTACATCTGGGTCGTTATCACCCTTTAGATATCTACCGCCGTGGTGATAGTCATCGGGTATGGCTGTCCTGGTACGAACAGTATTTTGTATGGGGAATGACCGCAGGCATAATTCGTGAGCTGGCGCTGCAAATTGGTGTGAAACCCTGACTATAC‑TTATCTTTACATCTACAAAACACTACTTGAGACAATCATCGCAATATTAGTTAAATCGCGGTTTTTGATTAGTTTAATTCATGTGA > CP042583/1576949‑1577503
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
