Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A0 F0 I1 R1
|
4926 |
296.4 |
4517418 |
96.8% |
4372860 |
264.2 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP042583 |
1,652,993 |
3 bp→TCA |
intergenic (–/–) |
– / – |
–/– |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP042583 | 1,652,993 | 0 | A | T | 100.0%
| 596.4
/ NA
| 249 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base T (145/104); total (145/104) |
| * | CP042583 | 1,652,994 | 0 | G | C | 100.0%
| 594.6
/ NA
| 249 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base C (145/104); total (145/104) |
| * | CP042583 | 1,652,995 | 0 | T | A | 99.2%
| 592.5
/ NA
| 249 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base A (144/103); minor base C (1/1); total (145/104) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 |
Only 100 of 249 total aligned reads displayed.
ACAGCAACAAATATAACCTTTGTGGAGCACTATCATGCTGAAACCAGAAATGATTGAAAAACTTAATGAGCAGATGAACCTGGAACTGTACTCTAGTCTGCTTTATCAGCAAATGAGCGCCTGGTGCAGCTATCATACCTTCGAAGGTGCTGCCGCGTTCCTGCGCCGTCACGCCCAGGAAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCAGTCTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGAGCAGCATGAAGAAGAGAAACTGTTCAAAAGCATTATTGATAAATTAAGCCTGGCAGGCAAAAGCGGCGAAGGTCTGTATTTTATCGACAAAGAACTCTCTACCCTCGACACAC‑AAAACTAATGCTCTCCGGCGGCAGGTTTACTGCCG > CP042583/1652716‑1653274
|||
acaGCAACAAATATAACCTTTGTGGAGCACTATCATGCTGAAACCAGAAATGATTGAAAAACTTAATGAGCAGATGAACCTGGAACTGTACTCTTCACTGCTTTATCAGCAAATGAGCGCCTGGTGCAGCTATCATACCTTCGAAGGTGCTGCCGCGTTCCTGCGCCGTCACGCCCAGGAAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGaa < 2:144832/289‑1 (MQ=255)
ataACCTTTGTGGAGCACTATCATGCTGAAACCAGAAATGATTGAAAAACTTAATGAGCAGATGAACCTGGAACTGTACTCTTCACTGCTTTATCAGCAAATGAGCGCCTGGTGCAGCTATCATACCTTCGAAGGTGCTGCCGCGTTCCTGCGCCGTCACGCCCAGGAAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGaa > 2:407905/1‑289 (MQ=255)
tttGTGGAGCACTATCATGCTGAAACCAGAAATGATTGAAAAACTTAATGAGCAGATGAACCTGGAACTGTACTCTTCACTGCTTTATCAGCAAATGAGCGCCTGGTGCAGCTATCATACCTTCGAAGGTGCTGCCGCGTTCCTGCGCCGTCACGCCCAGGAAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCtat > 1:2052802/1‑289 (MQ=255)
tgtgGAGCACTATCATGCTGAAACCAGAAATGATTGAAAAACTTAATGAGCAGATGAACCTGGAACTGTACTCTTCACTGCTTTATCAGCAAATGAGCGCCTGGTGCAGCTATCATACCTTCGAAGGTGCTGCCGCGTTCCTGCGCCGTCACGCCCAGGAAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATaa > 1:1009052/1‑289 (MQ=255)
gtgGAGCACTATCATGCTGAAACCAGAAATGATTGAAAAACTTAATGAGCAGATGAACCTGGAACTGTACTCTTCACTGCTTTATCAGCAAATGAGCGCCTGGTGCAGCTATCATACCTTCGAAGGTGCTGCCGCGTTCCTGCGCCGTCACGCCCAGGAAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATaaa > 1:34009/1‑289 (MQ=255)
cTGAAACCAGAAATGATTGAAAAACTTAATGAGCAGATGAACCTGGAACTGTACTCTTCACTGCTTTATCAGCAAATGAGCGCCTGGTGCAGCTATCATACCTTCGAAGGTGCTGCCGCGTTCCTGCGCCGTCACGCCCAGGAAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAgg > 2:316048/1‑262 (MQ=255)
cTGAAACCAGAAATGATTGAAAAACTTAATGAGCAGATGAACCTGGAACTGTACTCTTCACTGCTTTATCAGCAAATGAGCGCCTGGTGCAGCTATCATACCTTCGAAGGTGCTGCCGCGTTCCTGCGCCGTCACGCCCAGGAAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAgg < 1:316048/262‑1 (MQ=255)
cTGAAACCAGAAATGATTGAAAAACTTAATGAGCAGATGAACCTGGAACTGTACTCTTCACTGCTTTATCAGCAAATGAGCGCCTGGTGCAGCTATCATACCTTCGAAGGTGCTGCCGCGTTCCTGCGCCGTCACGCCCAGGAAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATc > 2:338328/1‑288 (MQ=255)
aaaCCAGAAATGATTGAAAAACTTAATGAGCAGATGAACCTGGAATTGTACTCTTCACTGCTTTATCAGCAAATGAGCGCCTGGTGCAGCTATCATAACTTCGAAGGTGCTGCCGCGTTACTGCGCCGTCACGCCCAGGAAGAGATGACGCATCTGCCGCGTCTGTTTGATCATCTGACTGATACCGGCAATTAACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGACTTATTCCAGGAACACTATAAACACGAACAAATCATcccc > 2:1788937/1‑288 (MQ=255)
tGAAAAACTTAATGAGCAGATGAACCTGGAACTGTACTCTTCACTGCTTTATCAGCAAATGAGCGCCTGGTGCAGCTATCATACCTTCGAAGGTGCTGCCGCGTTCCTGCGCCGTCACGCCCAGGAAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGaa < 1:1776405/289‑1 (MQ=255)
tGAAAAACTTAATGAGCAGATGAACCTGGAACTGTACTCTTCACTGCTTTATCAGCAAATGAGCGCCTGGTGCAGCTATCATACCTTCGAAGGTGCTGCCGCGTTCCTGCGCCGTCACGCCCAGGAAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGaa < 2:660837/289‑1 (MQ=255)
tGAACCTGGAACTGTACTCTTCACTGCTTTATCAGCAAATGAGCGCCTGGTGCAGCTATCATACCTTCGAAGGTGCTGCCGCGTTCCTGCGCCGTCACGCCCAGGAAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGa < 2:801487/288‑1 (MQ=255)
tGAACCTGGAACTGTACTCTTCACTGCTTTATCAGCAAATGAGCGCCTGGTGCAGCTATCATACCTTCGAAGGTGCTGCCGCGTTCCTGCGCCGTCACGCCCAGGAAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGa < 2:34009/288‑1 (MQ=255)
tGAACCTGGAACTGTACTCTTCACTGCTTTATCAGCAAATGAGCGCCTGGTGCAGCTATCATACCTTCGAAGGTGCTGCCGCGTTCCTGCGCCGTCACGCCCAGGAAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGAc < 2:710461/289‑1 (MQ=255)
ggAACTGTACTCTTCACTGCTTTATCAGCAAATGAGCGCCTGGTGCAGCTATCATACCTTCGAAGGTGCTGCCGCGTTCCTGCGCCGTCACGCCCAGGAAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGaa < 1:1540287/208‑1 (MQ=255)
ggAACTGTACTCTTCACTGCTTTATCAGCAAATGAGCGCCTGGTGCAGCTATCATACCTTCGAAGGTGCTGCCGCGTTCCTGCGCCGTCACGCCCAGGAAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGaa > 2:1540287/1‑208 (MQ=255)
gTACTCTTCACTGCTTTATCAGCAAATGAGCGCCTGGTGCAGCTATCATACCTTCGAAGGTGCTGCCGCGTTCCTGCGCCGTCACGCCCAGGAAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTa > 1:589369/1‑288 (MQ=255)
tactcttcacTGCTTTATCAGCAAATGAGCGCCTGGTGCAGCTATCATACCTTCGAAGGTGCTGCCGCGTTCCTGCGCCGTCACGCCCAGGAAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGACTATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACTAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAAACGGCTCTAGCTGAAATGCCCAATCAGACCTAc > 2:1379382/10‑288 (MQ=255)
tactcttcacTGCTTTATCAGCAAATGAGCGCCTGGTGCAGCTATCATACCTTCGAAGGTGCTGCCGCGTTCCTGCGCCGTCACGCCCAGGAAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGa > 2:1715540/10‑274 (MQ=255)
tactcttcacTGCTTTATCAGCAAATGAGCGCCTGGTGCAGCTATCATACCTTCGAAGGTGCTGCCGCGTTCCTGCGCCGTCACGCCCAGGAAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGa < 1:1682594/265‑1 (MQ=255)
tactcttcacTGCTTTATCAGCAAATGAGCGCCTGGTGCAGCTATCATACCTTCGAAGGTGCTGCCGCGTTCCTGCGCCGTCACGCCCAGGAAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTAc > 2:1942725/10‑288 (MQ=255)
tactcttcacTGCTTTATCAGCAAATGAGCGCCTGGTGCAGCTATCATACCTTCGAAGGTGCTGCCGCGTTCCTGCGCCGTCACGCCCAGGAAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTAc > 1:1017907/10‑288 (MQ=255)
cacTGCTTTATCAGCAAATGAGCGCCTGGTGCAGCTATCATACCTTCGAAGGTGCTGCCGCGTTCCTGCGCCGTCACGCCCAGGAAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACg < 1:839807/217‑1 (MQ=255)
acTGCTTTATCAGCAAATGAGCGCCTGGTGCAGCTATCATACCTTCGAAGGTGCTGCCGCGTTCCTGCGCCGTCACGCCCAGGAAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACg > 2:1191498/2‑218 (MQ=255)
tGCTTTATCAGCAAATGAGCGCCTGGTGCAGCTATCATACCTTCGAAGGTGCTGCCGCGTTCCTGCGCCGTCACGCCCAGGAAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTaa > 1:1374073/1‑289 (MQ=255)
tATCAGCAAATGAGCGCCTGGTGCAGCTATCATACCTTCGAAGGTGCTGCCGCGTTCCTGCGCCGTCACGCCCAGGAAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGc > 1:695514/1‑245 (MQ=255)
aaaTGAGCGCCTGGTGCAGCTATCATACCTTCGAAGGTGCTGCCGCGTTCCTGCGCCGTCACGCCCAGGAAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATg > 2:608134/1‑289 (MQ=255)
aaaTGAGCGCCTGGTGCAGCTATCATACCTTCGAAGGTGCTGCCGCGTTCCTGCGCCGTCACGCCCAGGAAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCGCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTAGCTCCTGCTGCAATGAACAACCAGGCCTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATg > 2:1847514/1‑289 (MQ=255)
ggcgcCTGGGGAAGTGATCATGCCTTCGAAGGTGCTGCCTCGTTCCTGCGCCGTCACGCCCAGGAAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTa < 2:1917086/286‑1 (MQ=255)
tGCAGCTATCATACCTTCGAAGGTGCTGCCGCGTTCCTGCGCCGTCACGCCCAGGAAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGag < 1:1847514/288‑1 (MQ=255)
tGCAGCTATCATACCTTCGAAGGTGCTGCCGCGTTCCTGCGCCGTCACGCCCAGGAAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGag < 1:1313055/288‑1 (MQ=255)
cTATCATACCTTCGAAGGTGCTGCCGCGTTCCTGCGCCGTCACGCCCAGGAAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCCGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGag > 1:1067279/1‑283 (MQ=255)
tATCATACCTTCGAAGGTGCTGCCGCGTTCCTGCGCCGTCACGCCCAGGAAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGagcagc < 2:2052802/286‑1 (MQ=255)
aTCATACCTTCGAAGGTGCTGCCGCGTTCCTGCGCCGTCACGCCCAGGAAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGAGCAGCATga < 1:1942725/289‑1 (MQ=255)
aTACCTTCGAAGGTGCTGCCGCGTTCCTGCGCCGTCACGCCCAGGAAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATTTTTCCGATCAGCATgaaga > 2:1089660/1‑289 (MQ=255)
tCGAAGGTGCTGCCGCGTTCCTGCGCCGTCACGCCCAGGAAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGa > 2:634384/1‑160 (MQ=255)
tCGAAGGTGCTGCCGCGTTCCTGCGCCGTCACGCCCAGGAAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGa < 1:634384/160‑1 (MQ=255)
tCGAAGGTGCTGCCGCGTTCCTGCGCCGTCACGCCCAGGAAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGa > 1:1954266/1‑222 (MQ=255)
tgctgcCGCGTTCCTGCGCCGTCACGCCCAGGAAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTAcc > 1:1875162/1‑230 (MQ=255)
tgctgcCGCGTTCCTGCGCCGTCACGCCCAGGAAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTa > 1:1060112/1‑255 (MQ=255)
tgctgcCGCGTTCCTGCGCCGTCACGCCCAGGAAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTa < 2:1060112/255‑1 (MQ=255)
gctgcCGCGTTCCTGCGCCGTCACGCCCAGGAAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGag > 2:1979102/1‑264 (MQ=255)
gctgcCGCGTTCCTGCGCCGTCACGCCCAGGAAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGag < 1:1979102/264‑1 (MQ=255)
gcCGCGTTCCTGCGCCGTCACGCCCAGGAAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGAGCAGCATGAAGAAGAGAAACTGTTCaaat < 2:132272/289‑2 (MQ=255)
tgctgcGTCACGCCCTGGACGAGAGGACGCATATTGAGCGTCTGTTTGAGTACCTGACTGATACCAGCAATTTCCCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTCATGAATTAATCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGAGCAGCATGAAGAAGAGAAACTGTTCAAATCGATTATTGa < 2:2080827/284‑1 (MQ=255)
cgcCGTCACGCCCAGGAAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGAGCAGCATGAAGAAGAGAAACTGTTCAAATCGATTATTGaaa > 1:2162779/1‑287 (MQ=255)
ccGTCACGCCCAGGAAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGAGCAGCATGAAGAAGAGAAACTGTTCAAATCGATTATTGATaaa > 1:928741/1‑289 (MQ=255)
tCACGCCCAGGAAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAAt < 2:1577238/192‑1 (MQ=255)
tCACGCCCAGGAAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGAGCAGCATGAAGAAGAGAAACTGTTCAAATCGATTATTGATAAATTa > 2:758678/1‑289 (MQ=255)
tCACGCCCAGGAAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGAGCAGCATGAAGAAGAGAAACTGTTCAAATCGATTATTGATAAATTa > 1:485083/1‑289 (MQ=255)
tCACGCCCAGGAAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGAGCAGCATGAAGAAGAGAAACTGTTCAAATCGATTATTGATAAATTa > 2:495387/1‑289 (MQ=255)
tCACGCCCAGGAAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAA‑GACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGAGCAGCATGAAGAAGAGAAACTGTTCAAATCGATTATTGATAAATTaa > 1:2066999/1‑289 (MQ=255)
aGGAAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGag < 2:197473/236‑1 (MQ=255)
aGGAAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGag < 1:1212941/236‑1 (MQ=255)
gAAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGAGCAGCATGAAGAAGAGAAACTGTTCAAATCGATTATTGATAAATTAAGCCTggcag > 1:241027/1‑289 (MQ=255)
agaTGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGAGCAGCATga < 1:1102022/238‑1 (MQ=255)
agaTGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGAGCAGCATga > 2:1102022/1‑238 (MQ=255)
gACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGag > 2:1269671/1‑226 (MQ=255)
aCGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGc > 2:1525829/1‑161 (MQ=255)
aCGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGc < 1:1525829/161‑1 (MQ=255)
cGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGAGCAGCATGAAGAAGAGAAACTGTTCAAATCGATTATTGATAAATTAAGCCTGGCAGGCAAAAgcgg > 1:1728111/1‑289 (MQ=255)
cATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGAGCAGCATGAAGAAGAGAAACTGTTCAAATCGATTATTGATAAATTAAGCCTGGCAGGCAAAAgcggcg < 1:407905/289‑1 (MQ=255)
tatGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGAGCAGCATGAAGAAGAGAAACTGTTCAAATCGATTATTGATAAATTAAGCCTGGCAGGCAAAAGCGGCGaa > 1:987274/1‑289 (MQ=255)
atGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGAGCAGCATGAAGAAGAGAAACTGTTCAAATCGATTATTGATAAATTAAGCCTGGCAGGCAAAAGCGGCGAAg < 1:751735/289‑1 (MQ=255)
cGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGAGCAGCATGAAGAAGAGAAACTGTTCaa > 1:2219555/1‑239 (MQ=255)
cGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGAGCAGCATGAAGAAGAGAAACTGTTCaa < 2:2219555/239‑1 (MQ=255)
cGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGAGCAGCATGAAGAAGAGAAACTGTTCAAATCGATTATTGATAAATTAAGCCTGGCAGGCAAAAGCGGCGAAGGTCTGt > 1:1137603/1‑289 (MQ=255)
cGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGAGCAGCATGAAGAAGAGAAACTGTTCAAATCGATTATTGATAAATTAAGCCTGGCAGGCAAAAGCGGCGAAGGTCTGt > 2:1008739/1‑289 (MQ=255)
tCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGa < 2:278967/161‑1 (MQ=255)
tCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGa > 1:278967/1‑161 (MQ=255)
tCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGAGCAGCATGAAGAAGATAAACTGTTCAAATCGATTATTGATAAATTAAGCCTGGCAGGCAAAAGGGGCGAAGGTTGGTAt > 2:1307337/1‑289 (MQ=255)
tCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGAGCAGCATGAAGAAGAGAAACTGTTCAAATCGATTATTGATAAATTAAGCCTGGCAGGCAAAAGCGGCGAAGGTCTGTAt > 1:1279933/1‑289 (MQ=255)
tttGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGAGCAGCATGAAGAAGAGAAACTGTTCAAATCGATTATTGATAAATTAAGCCTGGCAGGCAAAAGCGGCGAAGGTCTGTATTTTa > 1:119228/1‑289 (MQ=255)
ccTGACTGATCCCGGAAATTTACCCCGTATAAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGAGCAGCATGAAGAAGAGAAACTGTTCAAATCGATTATTGATAAATTAAGCCTGGCAGGCAAAAGCGGCGAAGGTCTGTATTTTATCGACaaa < 2:1733849/289‑1 (MQ=255)
tgactgaTACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTa > 2:1800671/1‑187 (MQ=255)
gactgaTACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGAGCAGCATGAAGAAGAGAAACTGTTCAAATCGATTATTGATAAATTAAGCCTGGCAGGCAAAAGCGGCGAAGGTCTGTATTTTATCGACAAAGaa < 2:2162779/289‑1 (MQ=255)
gaTACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGAGCAGCATGAAGAAGAGAAACTGTTCAAATCGATTATTGATAAATTAAGCCTGGCAGGCAAAAGCGGCGAAGGTCTGTATTTTATCGACAAAGAActct < 2:1279933/289‑1 (MQ=255)
gaTACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGAGCAGCATGAAGAAGAGAAACTGTTCAAATCGATTATTGATAAATTAAGCCTGGCAGGCAAAAGCGGCGAAGGTCTGTATTTTATCGACAAAGAActct < 1:1790438/289‑1 (MQ=255)
gaTACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGAGCAGCATGAAGAAGAGAAACTGTTCAAATCGATTATTGATAAATTAAGCCTGGCAGGCAAAAGCGGCGAAGGTCTGTATTTTATCGACAAAGAActct < 1:519496/289‑1 (MQ=255)
gCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGAGCAGCATGAAGAAGAGAAACTGTTCAAATCGATTATTGATAAATTAAGCCTGGCAGGCAAAAGCGGCGAAGGTCTGTATTTTATCGACAAAGAACTCTCTAccc > 1:1720163/1‑288 (MQ=255)
aaTTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGAGCAGCATGAAGAAGAGAAACTGTTCAAATCGATTATTGATAAATTAAGCCTGGCAGGCAAAAGCGGCGAAGGTCTGTATTTTATCGACAAAGAACTCTCTACCCTCg < 1:1089660/289‑1 (MQ=255)
ccGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGAGCAGCATGAAGAAGAGAAACTGTTCAAATCGATTATTGATAAATTAAGCCTGGCAGGCAAAAGCGGCGAAGGTCTGTATTTTATCGACAAAGAACTCTCTACCCTCGacacac < 2:563352/289‑1 (MQ=255)
aTTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGAGCAGCATGAAGAAGAGAAACTGTTCAAATCGATTATTGATAAATTAAGCCTGGCAGGCAAAAGCGGCGAAGGTCTGTATTTTATCGACAAAGAACTCTCTACCCTCGACACAC‑AAAACt > 1:2032313/1‑289 (MQ=255)
gTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGag > 2:942492/1‑162 (MQ=255)
gTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGAGCAGCATGAAGAAGAGAAACTGTTCAAATCGATTATTGATAAATTAAGCCTGGCAGGCAAAAGCGGCGAAGGTCTGTATTTTATCGACAAAg > 2:2134251/1‑253 (MQ=255)
gTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGAGCAGCATGAAGAAGAGAAACTGTTCAAATCGATTATTGATAAATTAAGCCTGGCAGGCAAAAGCGGCGAAGGTCTGTATTTTATCGACAAAg < 1:2134251/253‑1 (MQ=255)
gTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGAGCAGCATGAAGAAGAGAAACTGTTCAAATCGATTATTGATAAATTAAGCCTGGCAGGCAAAAGCGGCGAAGGTCTGTATTTTATCGACAAAGAACTCTCTACCCTCGACACAC‑AAAACTAATGctct > 1:574826/1‑288 (MQ=255)
ttGAATCTCCGTTTGCTGAATCTTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGAGCAGCATGAAGAAGAGAAACTGTTCAAATCGATTATTGATAAATTAAGCCTGGCAGGCAAAAGCGGCGAAGGTCTGTATTTTATCGACAAAGAACTCTCTACCCTCGACACAC‑AAAACTAATGCTCTcc > 1:444795/1‑289 (MQ=255)
ttGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGAGCAGCATGAAGAAGAGAAACTGTTCAAATCGATTATTGATAAATTAAGCCTGGCGGGCAAAAGCGGCGAAGGTCTGTATTTTATCGACAAAGAACTCTCTACCCTCGACACAC‑AAAACTAATGCTCTcc > 1:1648378/1‑289 (MQ=255)
ttGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGAGCAGCATGAAGAAGAGAAACTGTTCAAATCGATTATTGATAAATTAAGCCTGGCAGGCAAAAGCGGCGAAGGTCTGTATTTTATCGACAAAGAACTCTCTACCCTCGACACAC‑AAAACTAATGCtctc > 2:1020588/1‑288 (MQ=255)
ttGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGAGCAGCATGAAGAAGAGAAACTGTTCAAATCGATTATTGATAAATTAAGCCTGGCAGGCAAAAGCGGCGAAGGTCTGTATTTTATCGACAAAGAACTCTCTACCCTCGACACAC‑AAAACTAATGCTCTcc > 1:898523/1‑289 (MQ=255)
ttGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGAGCAGCATGAAGAAGAGAAACTGTTCAAATCGATTATTGATAAATTAAGCCTGGCAGGCAAAAGCGGCGAAGGTCTGTATTTTATCGACAAAGAACTCTCTACCCTCGACACAC‑AAAACTAATGCTCTcc > 1:1496814/1‑289 (MQ=255)
ttGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGAGCAGCATGAAGAAGAGAAACTGTTCAAATCGATTATTGATAAATTAAGCCTGGCAGGCAAAAGCGGCGAAGGTCTGTATTTTATCGACAAAGAACTCTCTACCCTCGACACAC‑AAAACTAATGCTCTcc > 2:245964/1‑289 (MQ=255)
ttGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGAGCAGCATGAAGAAGAGAAACTGTTCAAATCGATTATTGATAAATTAAGCCTGGCAGGCAAAAGCGGCGAAGGTCTGTATTTTATCGACAAAGAACTCCCTACCCTCGACACAC‑AAAACTAATGctccc > 2:1223308/1‑286 (MQ=255)
ttGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGAGCAGCATGAAGAAGAGAAACTGTTCAAATCGATTATTGATAAATTAAGCCTGGCAGGCAAAAGCGGCGAAGGTCTGTATTTTAACGACAACGAACTCTCAACCCTCGA‑ACACAAAAAATAATGCtctca > 2:844224/1‑288 (MQ=255)
ttGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGAGCAGCATGAAGAAGAGAAACTGTTCAAATCGATTATTGATAAATTAAGCCTGGCAGGCAAAAGCGGCGAAGGTCTATATTTTATCGACAAAGAACTCTCTACCCTCGACACAC‑AAAACTAATGCtctc > 2:1860380/1‑288 (MQ=255)
aTCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGAGCAGCATGAAGAAGAGAAACTGTTCAAATCGATTATTGATAAATTAAGCCTGGCAGGCAAAAGCGGCGAAGGTCTGTATTTTATCGACAAAGAACTCTCTACCCTCGACACAC‑AAAACTAATGCTCTCcggcg < 1:338328/289‑1 (MQ=255)
tGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGAGCAGCATGAAGAAGAGAAACTGTTCAAATCGATTATTGATAAATTAAGCCTGGCAGGCAAAAGCGGCGAAGGTCTGTATTTTATCGAACAAGAACTCTCTACCCTCGACACAC‑AAAACTAATGCTCTCCGGCGCCAGtttt > 2:1645973/1‑288 (MQ=255)
atatTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGAGCAGCATGAAGAAGAGAAACTGTTCAAATCGATTATTGATAAATTAAGCCTGGCAGGCAAAAGCGGCGAAGGTCTGTATTTTATCGACAAAGAACTCTCTACCCTCGACACAC‑AAAACTAATGCTCTCCGGCGGCAGGTTTACTgccg < 2:960914/289‑1 (MQ=255)
atatTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGAGCAGCATGAAGAAGAGAAACTGTTCAAATCGATTATTGATAAATTAAGCCTGGCAGGCAAAAGCGGCGAAGGTCTGTATTTTATCGACAAAGAACTCTCTACCCTCGACACAC‑AAAACTAATGCTCTCCGGCGGCAGGTTTACTgcc > 1:96546/1‑288 (MQ=255)
|||
ACAGCAACAAATATAACCTTTGTGGAGCACTATCATGCTGAAACCAGAAATGATTGAAAAACTTAATGAGCAGATGAACCTGGAACTGTACTCTAGTCTGCTTTATCAGCAAATGAGCGCCTGGTGCAGCTATCATACCTTCGAAGGTGCTGCCGCGTTCCTGCGCCGTCACGCCCAGGAAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCAGTCTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGAGCAGCATGAAGAAGAGAAACTGTTCAAAAGCATTATTGATAAATTAAGCCTGGCAGGCAAAAGCGGCGAAGGTCTGTATTTTATCGACAAAGAACTCTCTACCCTCGACACAC‑AAAACTAATGCTCTCCGGCGGCAGGTTTACTGCCG > CP042583/1652716‑1653274
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
