Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A4 F210 I1 R1
|
4930 |
262.8 |
3829204 |
96.6% |
3699011 |
272.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP042583 |
576,568 |
3 bp→TCG |
intergenic (–/–) |
– / – |
–/– |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP042583 | 576,568 | 0 | A | T | 99.5%
| 460.6
/ NA
| 195 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base T (71/123); minor base G (1/0); total (72/123) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.69e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
| * | CP042583 | 576,569 | 0 | G | C | 100.0%
| 456.4
/ NA
| 195 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base C (72/123); total (72/123) |
| * | CP042583 | 576,570 | 0 | C | G | 99.0%
| 450.5
/ NA
| 195 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base G (70/123); minor base T (2/0); total (72/123) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.35e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 195 total aligned reads displayed.
TGATTACAGAACATCGGCAGTACAATTTGCAGCAAAATAAAAATACGGCTTGAAACGAGCC‑AAATAGGGTTCTCGTAGGGGGAATAAGATGAATATTTTAGGTTTTTTCCAGCGACTCGGTAGGGCGTTACA‑GCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGAGCAAAGACAGCGCTGGTGCGGCGGCGCTGGCGGGTGCGGTAGGTTACTTTGTGTTAACCAAAGCGATGGTGACCATCAACCCAGAAATTAACATGGGTGTACTGGCGGGTATCATTACCGGTCTGGTTGGTGGCGCAGCCT‑ATAACCGTTGGTCC‑GATATTAAACTGCCGGACTTCCTGAGCTTCTTC‑GGCGGCAAACGCTTTGTGCCGATTGCCACCGGATTCTTCTGCCTGGTGC‑TGGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGGTACAGCACG > CP042583/576288‑576847
|||
ggATTACAGAAGATCGGCAGTACAATTTGCAGCAAAATAAAAATACGGCTTGAAACGAGCC‑AAATAGGGTTCTCGTAGGGGGAATAAGATGAATATTTTAGGTTTTTTCCAGCGACTCGGTAGGGCGTTACA‑GCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGAc > 1:1448858/2‑289 (MQ=255)
aTTACAGAACATCGGCAGTACAATTTGCAGCAAAATAAAAATACGGCTTGAAACGAGCC‑AAATAGGGTTCTCGTAGGGGGAATAAGATGAATATTTTAGGTTTTTTCCAGCGACTCGGTAGGGCGTTACA‑GCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACa > 1:1649110/1‑288 (MQ=255)
cAGAACATCGGCAGTACAATTTGCAGCAAAATAAAAATACGGCTTGAAACGAGCC‑AAATAGGGTTCTCGTAGGGGGAATAAGATGAATATTTTAGGTTTTTTCCAGCGACTCGGTAGGGCGTTACA‑GCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAgc > 1:584014/1‑286 (MQ=255)
aaCATCGGCAGTACAATTTGCAGCAAAATAAAAATACGGCTTGAAACGAGCC‑AAATAGGGTTCTCGTAGGGGGAATAAGATGAATATTTTAGGTTTTTTCCAGCGACTCGGTAGGGCGTTACA‑GCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGt > 1:132210/1‑289 (MQ=255)
aTCGGCAGTACAATTTGCAGCAAAATAAAAATACGGCTTGAAACGAGCC‑AAATAGGGTTCTCGTAGGGGGAATAAGATGAATATTTTAGGTTTTTTCCAGCGACTCGGTAGGGCGTTACA‑GCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTgcg > 2:432000/1‑289 (MQ=255)
cGGCAGTACAATTTGCAGCAAAATAAAAATACGGCTTGAAACGAGCC‑AAATAGGGTTCTCGTAGGGGGAATAAGATGAATATTTTAGGTTTTTTCCAGCGACTCGGTAGGGCGTTACA‑GCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCTAAAGCCAGCCCCGGTgcggc > 2:1665170/1‑289 (MQ=255)
cGGCAGTACAATTTGCAGCAAAATAAAAATACGGCTTGAAACGAGCC‑AAATAGGGTTCTCGTAGGGGGAATAAGATGAATATTTTAGGCTTTTTCCAGCGACTCGGTAGGGCGTTACA‑GCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTgcggc > 1:1029404/1‑289 (MQ=255)
gTACAATTTGCAGCAAAATAAAAATACGGCTTGAAACGAGCC‑AAATAGGGTTCTCGTAGGGGGAATAAGATGAATATTTTAGGTTTTTTCCAGCGACTCGGTAGGGCGTTACA‑GCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATCTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGTCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATCAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGTGCGACAGACAGCGCAgggccggggtgg > 2:205424/1‑278 (MQ=255)
aaaagtggcagcaAAATAAAAATACGGCTTGAAACGAGCC‑AAATAGGGTTCTCGTAGGGGGAATAAGATGAATATTTTAGGTTTTTTCCGTCGACTCGGTAGGGCGTTACA‑GCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTGTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTGCGGCGGCGCTg < 2:1594961/282‑1 (MQ=255)
aTTTGCAGCAAAATAAAAATACGGCTTGAAACGAGCC‑AAATAGGGTTCTCGTAGGGGGAATAAGATGATTATTTTAGGTTTTTTCCAGCGACTCGGTAGGGCGTTACA‑GCTCCCCATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTGTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTGCGGCGGCGCTGGCg < 1:1345804/289‑1 (MQ=255)
tttGCAGCAAAATAAAAATACGGCTTGAAACGAGCC‑AAATAGGGTTCTCGTAGGGGGAATAAGATGAATATTTTAGGTTTTTTCCAGCGACTCGGTAGGGCGTTACA‑GCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTGCGGCGGCGCTGGCgg > 1:1434538/1‑289 (MQ=255)
tGCAGCAAAATAAAAATACGGCTTGAAACGAGCC‑AAATAGGGTTCTCGTAGGGGGAATAAGATGAATATTTTAGGTTTTTTCCAGCGACTCGGTAGGGCGTTACA‑GCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCCTGAATCTTCGCCATCGTGGTGGCGTCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTGCGGCGGCGCTGGCGGGt > 1:614443/1‑289 (MQ=255)
gcagcaAAATAAAAATACGGCTTGAAACGAGCC‑AAATAGGGTTCTCGTAGGGGGAATAAGATGAATATTTTAGGTTTTTTCCAGCGACTCGGTAGGGCGTTACA‑GCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTGCGGCGGCGCTGGCGGGTg < 2:1052610/289‑1 (MQ=255)
agcaAAATAAAAATACGGCTTGAAACGAGCC‑AAATAGGGTTCTCGTAGGGGGAATAAGATGAATATTTTAGGTTTTTTCCAGCGACTCGGTAGGGCGTTACA‑GCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTTATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTGCGGCGGGGCTGGGGGGTggg > 2:1081632/1‑287 (MQ=255)
agcaAAATAAAAATACGGCTTGAAACGAGCC‑AAATAGGGTTCTCGTAGGGGGAATAAGATGAATATTTTAGGTTTTTTCCAGCGACTCGGTAGGGCGTTACA‑GCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTGCGGCGGCGCTGGCGGGTGCg < 2:402400/289‑1 (MQ=255)
caAAATAAAAATACGGCTTGAAACGAGCC‑AAATAGGGTTCTCGTAGGGGGAATAAGATGAATATTTTAGGTTTTTTCCAGCGACTCGGTAGGGCGTTACA‑GCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTGCGGCGGCGCTGGCGGGTGCGGt > 1:865492/1‑289 (MQ=255)
gaaagaaaaatcCGGCTCTAAACGAGCC‑AAATGGGTTTCGCGAATGGGTAATAAGATGAATATTTTAGGTGTTTTCCAGTGAGTCGGTAGGGCGTTACA‑GCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTGCGGCGGCGCTGGCGGGTGCGGt < 2:93159/287‑1 (MQ=255)
aaaataaaaataCGGCTTGAAACGAGCC‑AAATAGGGTTCTCGTAGGGGGAATAAGATGAATATTTTAGGTTTTTTCCAGCGACTCGGTAGGGCGTTACA‑GCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTGCGGCGGCGCTGGCGGGTGCg < 1:1726241/286‑1 (MQ=255)
aaaataaaaataCGGCTTGAAACGAGCC‑AAATAGGGTTCTCGTAGGGGGAATAAGATGAATATTTTAGGTTTTTTCCAGCGACTCGGTAGGGCGTTACA‑GCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTGCGGCGGCGCTGGCGGGTGCg < 1:1081632/286‑1 (MQ=255)
aaaataaaaataAGGCTGGAAACGAGCCAAAATAGGGTTCTCGTAGGGGGAATAAGATGAATATTTTAGGTTTTTTCCAGCGACTCGGTAGGGCGTTACA‑GCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTGCGGCGGCGCTGGCGGGTg < 2:280806/285‑1 (MQ=255)
aataaaaataCGGCTTGAAACGAGCC‑AAATAGGGTTCTCGTAGGGGGAATAAGATGAATATTTTAGGTTTTTTCCAGCGACTCGGTAGGGCGTTACA‑GCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTGCGGCGGCGCTGGCGGGTGCGGTAgg > 1:463190/1‑289 (MQ=255)
aaataCGGCTTGAAACGAGCC‑AAATAGGGTTCTCGTAGGGGGAATAAGATGAATATTTTAGGTTTTTTCCAGCGACTCGGTAGGGCGTTACA‑GCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTGCGGCGGCGCTGGCGGGTGCGGTAGGTTACt < 1:359983/289‑1 (MQ=255)
cGGCTTGAAACGAGCC‑AAATGTGGTTCTCGTAGGGGGAATAATAGGAATGTTTTAGGCTTTTTCCGTCGACTCGGTAGGGCGTTACA‑GCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGGGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTGCGGCGGCGCTGGCGGGTGCGGTAGGTTACTTtgtg < 2:308952/289‑1 (MQ=255)
ggCTTGAAACGAGCC‑AAATAGGGTTCTCGTAGGGGGAATAAGATGAATATTTTAGGTTTTTTCCGGCGACTCGGTAGGGCGTTACA‑GCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTGCGGCGGCGCTGGCGGGTGCGGTAGGTTACTTTgtgt < 1:290538/289‑1 (MQ=255)
cTTGAAACGAGCC‑AAATAGGGTTCTCGTAGGGGGAATAAGATGAATATTTTAGGTTTTTTCCAGCGACTCGGTAGGGCGTTACA‑GCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCCCTGGTTCCGCGGCGCTTGCGGGTTCGGCTGGTTACGTTGTGTTa > 1:682491/1‑289 (MQ=255)
tGAAACGAGCC‑AAATAGGGTTCTCGTAGGGGGAATAAGATGAATATTTTAGGTTTTTTCCAGCGACTCGGTAGGGCGTTACA‑GCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTGCGGCGGCGCTGGCGGGTGCGGTAGGTTACTTTGTGTTAAc < 2:1723827/289‑1 (MQ=255)
aaCGAGCC‑AAATAGGGTTCTCGTAGGGGGAATAAGATGAATATTTTAGGTTTTTTCCAGCGACTCGGTAGGGCGTTACA‑GCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTGCGGCGGCGCTGGCGGGTGCGGTAGGTTACTTTGTGTTAACCa < 1:746107/288‑1 (MQ=255)
gCC‑AAATAGGGTTCTCGTAGGGGGAATAAGATGAATATTTTAGGTTTTTTCCAGCGACTCGGTAGGGCGTTACA‑GCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTGCGGCGGCGCTGGCGGGTGCGGTAGGTTACTTTGTGTTAACCAAAGCg < 1:153521/288‑1 (MQ=255)
gCC‑AAATAGGGTTCTCGTAGGGGGAATAAGATGAATATTTTAGGTTTTTTCCAGCGACTCGGTAGGGCGTTACA‑GCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTGCGGCGGCGCTGGCGGGTGCGGTAGGTTACTTTGTGTTAACCAAAGCg < 1:1894101/288‑1 (MQ=255)
gCC‑AAATAGGGTTCTCGTAGGGGGAATAAGATGAATATTTTAGGTTTTTTCCAGCGACTCGGTAGGGCGTTACA‑GCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTGCGGCGGCGCTGGCGGGTGCGGTAGGTTACTTTGTGTTAACCAAAGCGa > 1:1734273/1‑289 (MQ=255)
cc‑AAATAGGGTTCTCGTAGGGGGAATAAGATGAATATTTTAGGTTTTTTCCAGCGACTCGGTAGGGCGTTACA‑GCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTGCGGCGGCGCTGGCGGGTGCGGTAGGTTACTTTGTGTTAACCAAAGCGa < 2:132210/288‑1 (MQ=255)
tcGTAGGGGGAATAAGATGAATATTTTAGGTTTTTTCCAGCGACTCGGTAGGGCGTTACA‑GCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTGCGGCGGCGCTGGCGGGTGCGGTAGGTTACTTTGTGTTAACCAAAGCGATGGTGACCATCaa > 1:337201/1‑288 (MQ=255)
cGTAGGGGGAATAAGATGAATATTTTAGGTTTTTTCCCGCGACTCGGTAGGGCGTTACA‑GCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGGGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTGCGGCGGCGCTGGCGGGTGCGGTAGGTTACTTTGTGTTAACCAAAGCGATGGTGACCATCAAcc < 2:1367462/289‑1 (MQ=255)
agacaggAATAAGATGAATAGTTTAGGTTTTTACCAGCGAACCGGTAGGGCGTTACA‑GCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTGCGGCGGCGCTGGCGGGTGCGGTAGGTTACTTTGTGTTAACCAAAGCGATGGTGACCATCAAccc < 2:687976/283‑1 (MQ=255)
aaTAAGATGAATATTTTAGGTTTTTTCCAGCGACTCGGTAGGGCGTTACA‑GCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCCTACAGCTGGTCTAAAGACAGCGCTGGTGCGGCGGCGCTGGCGGGTGCGGTAGGTTTCTTTTTGTTAACCCAAGCCTAGGTTACCACTAAcccgataattt > 2:1896700/1‑281 (MQ=255)
aaTAAGATGAATATTTTAGGTTTTTTCCAGCGACTCGGTAGGGCGTTACA‑GCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTGCGGCGGCGCTGGCGGGTGCGGTAGGTTACt < 2:881790/247‑1 (MQ=255)
aaTAAGATGAATATTTTAGGTTTTTTCCAGCGACTCGGTAGGGCGTTACA‑GCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTGCGGCGGCGCTGGCGGGTGCGGTAGGTTACt > 1:881790/1‑247 (MQ=255)
aaTAAGATGAATATTTTAGGTTTTTTCCAGCGACTCGGTAGGGCGTTACA‑GCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTGCGGCGGCGCGGGCGGGTGCGGGTGGTTACTTTGTGTTAACCAAAGCGATGGTGACCATCACCCCAGATAttc > 2:317246/1‑288 (MQ=255)
aTAAGATGAATATTTTAGGTTTTTTCCAGCGACTCGGTAGGGCGTTACA‑GCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTGCGGCGGCGCTGGCGGGTGCGGTAGGTTACTTTGTGTTAACCAAAGCGATGGTGACCATCAACCCAGAAATTaa < 2:1434538/289‑1 (MQ=255)
tAAGATGAATATTTTAGGTTTTTTCCAGCGACTCGGTAGGGCGTTACA‑GCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTGCGGCGGCGCTGGCGGGTGCGGTAGGTTACTTTGTGTTAACCAAAGCGATGGTGACCATCAACCCAGAAATTAAc < 1:1685178/289‑1 (MQ=255)
aaGATGAATATTTTAGGTTTTTTCCAGCGACTCGGTTGGGCGTTACA‑GCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCTGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTGCGGCGGCGCTGGCGGGTGCGGTAGGTTACTTTGTGTTAACCAAAGCGATGGTGACCATCAACCCAGAAATTAACa < 1:1251201/289‑1 (MQ=255)
aaGATGAATATTTTAGGTTTTTTCCAGCGACTCGGTAGGGCGTTACA‑GCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTGCGGCGGCGCTGGCGGGTGCGGTAGGTTACTTTGTGTTAACCAAAGCGATGGTGACCATCAACCCAGAAATTAACa < 1:432000/289‑1 (MQ=255)
agaagaATATTTGAGGTTTTGTCCAGCGACTCGGTAGGGCGTTACA‑GCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTGCGGCGGCGCTGGCGGGTGCGGTAGGTTACTTTGTGTTAACCAAAGCGATGGTGACCATCAACCCAGAAATTAACAt < 2:511556/289‑1 (MQ=255)
aGATGCATATTTTAGGTTTTTTCCAGGGACTCGGTAGGGCGTTACG‑GCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTGCGGCGGCGCTGGCGGGTGCGGTAGGTTACTTTGTGTTAACCAAAGCGATGGTGACCATCAACCCAGAAATTAACAt < 2:758429/289‑1 (MQ=255)
aGATGAATATTTTAGGTTTTTTCCAGCGACTCGGTAGGGCGTTACA‑GCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCGTCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTGCGGCGGCGCTGGCGGGTGCGGTAGGTTACTTTGTGTTAACCAAAGCGATGGTGACCATCAACCCAGAAATTAACAt < 1:420034/289‑1 (MQ=255)
aTGAATATTTTAGGTTTTTTCCAGCGACTCGGTAGGGCGTTACA‑GCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTGCGGCGGCGCTGGCGGGTGCGGTAGGGTACTTTGTGGTAACCAAAGCGACGGTGGGCATCAACCCAGCAATTaaactgg > 2:1565526/1‑284 (MQ=255)
gaaattgttgggTTGTTTCCCGCGACTCGGTAGTG‑GTTTCAGGCTGCCGAACGCGGTGGTGCCGGTTGCGTCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGGTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTGCGGCGGCGCTGGCGGGTGCGGTAGGTTACGTTGTGTTAACCAAAGCGATGGTGACCATCAACCCAGAAATTAACATGGgt < 2:1879084/279‑1 (MQ=255)
gAATATTTTAGGTTTTTTCCAGCGACTCGGTAGGGCGTTACA‑GCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTGCGGCGGCGCTGGCGGGTGCGGTAGGTTACTTTGTGTTAACCAAAGCGATGGTGACCATCAACCCAGAAATTAACATGGgt > 1:554415/1‑289 (MQ=255)
atatTTTAGGTTTTTTCCAGCGACTCGGTAGGGCGTTACA‑GCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTGCGGCGGCGCTGGCGGGTGCGGTAGGTTACTTTGTGTTAACCAAAGCGATGGTGACCATCAACCCAGAAATTAACATGGgtg < 2:1734273/288‑1 (MQ=255)
atatTTTAGGTTTTTTCCAGCGACTCGGTAGGGCGTTACA‑GCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTGCGGCGGCGCTGGCGGGTGCGGTAGGGTACTTTGTGTTAACCAAAGCGATGGTGTCCATCAACCCAGAAATTAACATGGgtgt > 1:47973/1‑289 (MQ=255)
tttAGGTTTTTTCCAGCGACTCGGTAGGGCGTTACA‑GCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAACGACAGCGCTGGTGCGGCGGCGCTTGCGGGTGCGGTAGGGTACTTTGTGTTAACCAAAGCGATGGTGACCATCAACCCAGCAATTAACATTGGTGTACTg > 2:1801092/1‑289 (MQ=255)
tAGGTTTTTTCCAGCGACTCGGTAGGGCGTTACC‑GCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTGCGGCGGCGCTGGCGGGTGCGGTAGGTTACTTTGTGTTAACCAAAGCGATGGTGACCAt < 2:1123003/259‑1 (MQ=255)
tAGGTTTTTTCCAGCGACTCGGTAGGGCGTTACA‑GCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTGCGGCGGCGCTGGCGGGTGCGGTAGGTTACTTTGTGTTAACCAAAGCGATGGTGACCAt > 1:1123003/1‑259 (MQ=255)
agttgttttCCAGCGCCTCGGGAGGGCGTTACA‑GCTCCCTAGCGCGGTTCTGCCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTGCGGCGGCGCTGGCGGGTGCGGTAGGTTACTTTGTGTTAACCAAAGCGATGGTGACCATCAACCCAGAAATTAACATGGGTGTACTGGCg < 2:503520/284‑1 (MQ=255)
cAGCGACTCGGTAGGGCGTTACA‑GCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTGCGGCGGCGCTGGCGGGTGCGGTAGGTTACTTTGTGTTAACCAAAGCGATGGTGACCATCAACCCAGAAATTAACATGGGTGTACTGGCGGGTATCATTa < 1:1280661/289‑1 (MQ=255)
gACTCGGTAGGGCGTTACA‑GCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTGCGGCGGCGCTGGCGGGTGCGGTAGGTTACTTTGTGTTAACCAAAGCGATGGTGACCATCAACCCAGAAATTAACATGGGTGTACTGGCGGGTATCATTAc < 2:337201/286‑1 (MQ=255)
gACTCGGTAGGGCGTTACA‑GCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTGCGGCGGCGCTGGCGGGTGCGGTAGGTTACTTTGTGTTAACCAAAGCGATGGTGACCATCAACCCAGAAATTAACATGGGTGTACTGGCGGGTATCATTACCg < 2:1772161/288‑1 (MQ=255)
aCTCGGTAGGGCGTTACA‑GCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTGCGGCGGCGCTGGCGGGTGCGGTAGGTTACTTTGTGTTAACCAAAGCGATGGTGACCATCAACCCAGAAATTAACCTGGGGGTTCTGGCggggtatactgtcgg > 2:138704/1‑276 (MQ=255)
cTCGGTAGGGCGTTACA‑GCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTGCGGCGGCGCTGGCGGGTGCGGTAGGTTACTTTGTGTTAACCAAAGCGATGGTGACCATCAACCCAGAAATTAACATGGGTGTACTGGCGGGTATCATTACCGGt < 2:1294043/288‑1 (MQ=255)
ttACA‑GCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGGACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTGCGGCGGCGCTGGCGGGTGCGGTAGGTTACTTTGTGTTAACCAAAGCGATGGTGACCATCAACCCAGAAATTAACATGGGTGTACTGGCGGGTATCATTACCGGTCTGGTTGGTGgcg < 2:8726/289‑1 (MQ=255)
tACA‑GCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTGCGGCGGCGCTGGCGGGTGCGGTAGGTTACTTTGTGTTAACCAAAGCGATGGTGACCATCAACCCAGAAATTAACATGGGTGTACTGGCGGGTATCATTACCGGTCTGGTTGGTGgcg < 1:1370144/288‑1 (MQ=255)
tACA‑GCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTGCGGCGGCGCTGGCGGGTGCGGTAGGTTACTTTGTGTTAACCAAAGCGATGGTGACCATCAACCCAGAAATTAACATGGGTGTACTGGCGGGTAGCATTACCGGTCTGGTTGGTGgcgc < 2:823819/289‑1 (MQ=255)
tgcagagcccTACCGAGGGGGTGGCGGGGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGGCAGCCAGATTTGCGTAACGTTGCGTTTATTGCCCCGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCGCGCATTAATCTTCGCCATCGGGGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTGCGGCGGCGCTGGCGGGTGCGGTAGGTTACTTTGTGTTAACCGAAGCGATGGTGACCATCAACCCAGAAATTAACATGGGTGTACTGGCGGGTATCATTACCGGTCTGGTTGGTGgcg < 2:1029404/281‑1 (MQ=255)
cA‑GCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTGCGGCGGCGCTGGCGGGTGCGGTAGGTTACTTTGTGTTAACCAAAGCGATGGTGACCATCAACCCa > 2:674175/1‑234 (MQ=255)
cA‑GCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTGCGGCGGCGCTGGCGGGTGCGGTAGGTTACTTTGTGTTAACCAAAGCGATGGTGACCAACAACCCAGAAATTAACATGGGTGTACTGGCTGGGATTATAACCGGTTTGgtgggtgggccgc > 2:1370144/1‑284 (MQ=255)
cccTCTGGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTGCGGCGGCGCTGGCGGGTGCGGTAGGTTACTTTGTGTTAACCAAAGCGATGGTGACCATCAACCCAGAAATTAACATGGGTGTACTGGCGGGTATCATTACCGGTCTGGTTGGTGGCGCAGCCt‑at < 2:457520/289‑1 (MQ=255)
ccTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTGCGGCGGCGCTGGCGGGTGCGGTAGGTTACTTTGTGTTAACCAAAGCGATGGTGACCATCAACCCAGAAATTAACATGGGTGTACTGGCGGGTATCATTAACGGTCTGGTTGGTGGCGCAGCCt‑att > 1:844719/1‑288 (MQ=255)
gTGCTGCCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTGCGGCGGCGCTGGCGGGTGCGGTAGGTTACTTTGTGTTAACCAAAGCGATGGTGACCATCAACCCAGAAATTAACATGGGTGTACTGGCGGGTATCATTACCGGTCTGGTTGGTGGCGCAGCCT‑ATAACCGTTGGt > 1:982042/1‑289 (MQ=255)
gctgcCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTGCGGCGGCGCTGGCGGGTGCGGTAGGTTACTTTGTGTTAACCAAAGCGATGGTGACCATCAACCCAGAAATTAACATGGGTGTACTGGCGGGTATCATTACCGGTCTGGTTGGTGGCGCAGCCT‑ATAACCGTTGGTc < 1:766939/288‑1 (MQ=255)
ggcggcACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTGCGGCGGCGCTGGCGGGTGCGGTAGGTTAGTTTGTGTTAATCAAAGCGATGGTGACAATCAAACCAGAAATTAAAATGGGTGTACGGGGGGGGATCATTACCGGGCTTGGTGGGGGGGCACCCT‑TTAAACGTTTGTCC‑CGTATTaaa > 1:446114/1‑289 (MQ=255)
cggcACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTGCGGCGGCGCTGGCGGGTGCGGTAGGTTACTTTGTGTTAACCAAAGCGATGGTGACCATCAACCCAGAAATTAACATGGGTGTACTGGCGGGTAACATTTCCCGTCTTGTTTGTTGCGCCGCCC‑ATAACCGGTTGTTC‑GATTTTTAACt > 1:2752/1‑289 (MQ=255)
cACTGTTGCTGCGATTCAGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTGCGGCGGCGCTGGCGGGTGCGGTAGGTTACTTTGTGTTAACCAAAGCGATGGTGACCATCAACCCAGAAATTAACATGGGTGTACTGGCGGGTATCATTAACCGTCTGGTTGGTGGCGCAGCCT‑ATAACCGTTGGTCC‑GATATTAAACTGcc > 1:1225842/1‑289 (MQ=255)
cTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTGCGGCGGCGCTGGCGGGTGCGGTAGGTTACTTTGTGTTAACCAAAGCGATGGTGACCATCAACCCAGAAATTAACATGGGTGTACTGGCGGGTATCATTACCGGTCTGGTTGGTGGCGCAGCCT‑ATAACCGTTGGTCC‑GATATTAAACTGCCgg < 1:1565526/289‑1 (MQ=255)
cTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTGCGGCGGCGCTGGCGGGTGCGGTAGGTTACTTTGTGTTAACCAAAGCGATGGTGACCATCAACCCAGAAATTAACATGGGTGTACTGGCGGGTATCATTACCGGTCTGGTTGGTGGCGCAGCCT‑ATAACCGTTGGTCC‑GATATTAAACTGCCgg < 2:417214/289‑1 (MQ=255)
aTTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTGCGGCGGCGCTGGCGGGTGCGGTAGGTTACTTTGTGTTAACCAAAGCGATGGTGACCATCAACCCAGAAATTAACATGGGTGTACTGGCGGGTATCATTACCGGTCTGGTTGGTGGCGCAGCCT‑ATAACCGTTGGTCC‑GATATTAAACTGCCGGACTTCCTGa > 1:521595/1‑287 (MQ=255)
tCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTGCGGCGGCGCTGGCGGGTGCGGTAGGTTACt > 2:598375/1‑153 (MQ=255)
tttACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTGCGGCGGCGCTGGCGGGTGCGGTAGGTTACTTTGTGTTAACCAAAGCGATGGTGACCATCAACCCAGAAATTAACATGGGTGTACTGGCGGGTATCATTACCGGTCTGGTTGGTGGCGCAGCCT‑ATAACCGTTGGTCC‑GATATTAAACTGCCGGACTTCCTGAGCTTCTTC‑GGCGGCaa < 1:1007751/288‑1 (MQ=255)
cTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATACAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTGCGGCGGCGCTGGCGGGTGCGGTAGGTTACTTTGTGTTAACCAAAGCGATGGTGACCATCAACCCAGAAATTAACATGGGTGTACTGGCGGGTATCATTACCGGTCTGGTTGGTGGCGCAGCCT‑ATAACCGTTGGTCC‑GATATTAAACTGCCGGACTTCCTGAGCTTCTTC‑GGCGGCaa < 1:1133455/284‑1 (MQ=255)
ttAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTGCGGCGGCGCTGGCGGGTGCGGTAGGTTACTTTGTGTTAACCAAAGCGATGGTGACCATCAACCCAGAAATTAACATGGGTGTACTGGCGGGTATCATTACCGGTCTGGTTGGTGGCGCAGCCT‑ATAACCGTTGGTCC‑GATATTAAAATGCCGGACTTCCTGAGCTTCTTC‑GGCGGCAAACGCtt > 1:1655486/1‑289 (MQ=255)
gCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTGCGGCGGCGCTGGCGGGTGCGGTAGGTTACTTTGTGTTAACCAAAGCGATGGTGACCATCAACCCAGAAATTAACATGGGTGTACTGGCGGGTATCATTACCGGTCTGGTTGGTGGCGCAGCCT‑ATAACCGTTGGTCC‑GATATTAAACTGCCGGACTTCCTGAGCTTCTTC‑GGCGGCAAACGCTTTGTGCCGa > 1:185484/1‑289 (MQ=255)
cGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTGCGGCGGCGCTGGCGGGTGCGGTAGGTTACTTTGTGTTAACCAAAGCGATGGTGACCATCAACCCAGAAATTAACATGGGTGTACTGGCGGGTATCATTACCGGTCTGGTTGGTGGCGCAGCCT‑ATAACCGTTGGTCC‑GATATTAAACTGCCGGACTTCCTGAGCTTCTTC‑GGCGGCAAACGCTTTGTGCCGAt > 1:1215585/1‑289 (MQ=255)
cGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATACAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTGCGGCGGCGCTGGCGGGTGCGGTAGGTTACTTTGTGTTAACCAAAGCGATGGTGACCATCAACCCAGAAATTAACATGGGTGTACTGGCGGGTATCATTACCGGTCTGGGTGGTGGCGCAGCCT‑ATAACCGTTTGGCC‑GATATTAAACTTCCGGATTTTCCGAGCTTCTTCTGGCGGCAACCCCttttgccc > 2:1133455/1‑282 (MQ=255)
aTTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTGCGGCGGCGCTGGCGGGTGCGGTAGGTTACTTTGTGTTAACCAAAGCGATGGTGACCATCAACCCAGAAATTAACATGGGTGTACTGGCGGGTATTATTACCGGTCTGGTTGGTGGCGCAGCCC‑ATAACCGTTGGTCC‑TATATTAAACTGCCGGGCTTCCTGTGCTTCTTC‑GGCGGGCAACGCCTTTTTCCGCTTTcc > 2:358084/1‑288 (MQ=255)
ccAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTGCGGCGGCGCTGGCGGGTGCGGTAGGTTACTTTGTGTTAACCAAAGCGATGGTGACCATCAACCCAGAAATTAACATGGGTGTACTGGCGGGTATCATTACCGGTCTGGTTGGTGGCGCAGCCT‑ATAACCGTTGGTCC‑GATATTAAACTGCCGGACTTCCTGAGCTTCTTC‑GGCGGCAAACGCTTTGTGCCGATTGCCACCGGa < 1:1784488/289‑1 (MQ=255)
cggTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTGCGGCGGCGCTGGCGGGTGCGGTAGGTTACTTTGTGTTAACCAAAGCGATGGTGACCATCAACCCAGAAATTAACATGGGTGTACTGGCGGGTATCATTACCGGTCTGGTTGGTGGCGCAGCCT‑ATAACCGTTGGTCC‑GATATTAAACTGCCGGACTTCCTTAGCTTCTTC‑GGCGGCAAACGCTTTGTGCCGATTGCCACCGGATTCTTCTg > 1:695627/1‑288 (MQ=255)
cggTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTGCGGCGGCGCTGGCGGGTGCGGTAGGTTACTTTGTGTTAACCAAAGCGATGGTGACCATCAACCCAGAAATTAACATGGGTGTACTGGCGGGTATCATTACCGGTCTGGTTGGTGGCGCAGCCT‑ATAACCGTTGGTCC‑GATATTAAACTGCCGGACTTCCTGAGGTTCTTC‑GGCGGCAAACGGCTTGTTCCGATTGCCACCGGGTTCCTCTg > 1:57644/1‑288 (MQ=255)
gATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTGCGGCGGCGCTGGCGGGTGCGGTAGGTTACTTTGTGTTAACCAAAGCGATGGTGACCATCAACCCAGAAATTAACCTGGGTGTACTGGCGGGTATCCTTTCCCGTCCGGGTGGTTGCGCCGCCTAATAACAG‑TGGTCCGGCTATTAAA‑TGCCGGACTTCCTGGTCTTCTTT‑CGCGCGAAACCCTTTTTGCCGCTTGCCCCCGGTGTCCTCTGCCTGGTgtcgtcg > 2:901477/1‑282 (MQ=255)
tAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTGCGGCGGCGCTGGCGGGTGCGGTAGGTTACTTTGTGTTAACCAAAGCGATGGTGACCATCAACCCAGAAATTAACATGGGTGTACTGGCGGGTATCATTACCGGTCTGGTTGGTGGCGCAGCCT‑ATAACCGTTGGTCC‑GATATTAAACTGCCGGACTTCCTGAGCTTCTTC‑GGCGGCAAACGCTTTGTGCCGATTGCCACCGGATTCTTCTGCCTGGTGC‑Tggcggc < 1:1258076/288‑1 (MQ=255)
tCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTGCGGCGGCGCTGGCGGGTGCGGTAGGTTACTTTGTGTTAACCAAAGCGATGGTGACCATCAACCCAGAAATTAACATGGGTGTACTGGCGGGTATCATTACCGGTCTGGTTTGTGGCGCAGCCT‑ATAACCGTTGGGCC‑GATATTAAACTTCCGGGCTTCCCTGGCTTCTTC‑GGCGGACAACGCTTTGTTCCGAATTCCACCGGGTTTTTTCGCCCGGGGCGTGGGGGCCTTTTTTGGTTat > 2:978152/1‑287 (MQ=255)
tCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTGCGGCGGCGCTGGCGGGTGCGGTAGGTTACTTTGTGTTAACCAAAGCGATGGTGACCATCAACCCAGAAATTAACATGGGTGTACTGGCGGGTATCATTACCGGGCTGGTTGGTGGCGCAGCCT‑ATAACCGTTGGTCC‑GATATTAAACTGCCGGACTTTCTGAGCTTCTTC‑GGCGGCAAACGCTTTGTGTCGATTGCCCCCGGATTCTTTCGCCTGGTGC‑TGGCGGGCATTTTTGGTTACGt > 1:898237/1‑289 (MQ=255)
tCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTGCGGCGGCGCTGGCGGGTGCGGTAGGTTACTTTGTGTTAACCAAAGCGATGGTGACCATCAACCCAGAAATTAACATGGGTGTACTGGCGGGTATCATTACCGGTCTGGTTGGTGGCGCAGCCT‑ATAACCGTTGGTCC‑GATATTAAACTGCCGGACTTCCTGAGCTTCTTC‑GGCGGCAAACGCTTTGTGCCGATTGCCACCGGATTCTTCTGCCTGGTGC‑TGGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTg < 2:474479/289‑1 (MQ=255)
tCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTGCGGCGGCGCTGGCGGGTGCGGTAGGTTACTTTGTGTTAACCAAAGCGATGGTGACCATCAACCCAGAAATTAACATGGGTGTACTGGCGGGTATCATTACCGGTCTGGTTGGTGGCGCAGCCT‑ATAACCGTTGGTCC‑GATATTAAACTGCCGGACTTCCTGAGCTTCTTC‑GGCGGCAAACGCTTTGTGCCGATTGCCACCGGATTCTTCTGCCTGGTGC‑TGGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTg < 1:1850013/289‑1 (MQ=255)
tCGCCATCGGGGTTGCTTCCAGCTGGTCGAAAGCAAGCGCGGGTGCGGCGGCGCTGGCGGGTGCGGTAGTTTACTTTGTGTTAACCAAAGCGATGGTGACCATCAACCCAGAAATTAACATGGGTGTACTGGCGTGTATCATTACCGGTCTGGTTGGTGGCGCAGCCT‑ATAACCGTTGGTCC‑GATATTAAACTGCCGGACTTCCTGAGCTTCTTC‑GGCGGCAAACGCTTTGTGCCGATTGCCACCGGATTCTTCTGCCTGGTGC‑TGGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTg < 2:614443/289‑1 (MQ=255)
gtgcgacaggggtgGCATCCACATGGTCGGAAGCCGGCGCTGGGGCGGCGGCGCTGGCGGGTGGGGTAGGTTACTTTGTGTTAACCAAAGCGATGGTGACCATCAACCCAGAAATTAACATGGGTGTACTGGCGGGTATCATTACCGGTCTGGTTGGTGGCGCAGCCT‑ATAACCGTTGGTCC‑GATATTAAACTGCCGGACTTCCTGAGCTTCTTC‑GGCAGCAAACGCTTTGTGCCGATTGCCACCGGATTCTTCTGCCTGGTGC‑TGGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTg < 2:140955/278‑1 (MQ=255)
cGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTGCGGCGGCGCTGGCGGGTGCGGTAGGTTACTTTGTGTTAACCAAAGCGATGGTGACCATCAACCCAGAAATTAACATGGGTGTACTGGCGGGTATCATTACCGGTCTGGTTGGTGGCGCAGCCT‑ATAACCGTTGGTCC‑GATATTAAACTGCCGGACTTCCTGAGCTTCTTC‑GGCGGCAAACGCTTTGTGCCGATTGCCACCGGATTCTTCTGcc < 2:1426033/257‑1 (MQ=255)
cGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTGCGGCGGCGCTGGCGGGTGCGGTAGGTTACTTTGTGTTAACCAAAGCGATGGTGACCATCAACCCAGAAATTAACATGGGTGTACTGGCGGGTATCATTACCCGTCCGGTTGGTGGCGCAGCCT‑ATAACCGTTGGGTC‑GCAACTAAAACGCCGGACTTCCTTAGCTTCTTC‑GGCGGCAAAACCCTTTTGCCGATTGCCACCCGATTCTTCTGCCTGGTGC‑TGGCGGCCATTTTTGGTGACGTCTGgccgcc > 2:1768313/1‑288 (MQ=255)
gCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTGCGGCGGCGCTGGCGGGTGCGGTAGGTTACTTTGTGTTAACCAAAGCGATGGTGACCATCAACCCAGAAATTAACATGGGTGTACTGGCGGGTATCATTACCGGTCTGGTTGGTGGCGCAGCCT‑ATAACCGTTGGTCC‑GATATTAAACTGCCGGACTTCCTGAGCTTCTTC‑GGCGGCAAACGCTTTGTGCCGATTGCCACCGGATTCTTCTGCCTGGTGC‑TGGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGGTACa < 1:190394/287‑1 (MQ=255)
aTCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTGCGGCGGCGCTGGCGGGTGCGGTAGGTTACTTTGTGTTAACCAAAGCGATGGTGACCATCAACCCAGAAATTAACATGGGTGTACTGGCGGGTATCATTACCGGTCTGGTTGGTGGCGCAGCCT‑ATAACCGTTGGTCC‑GATATTAAACTGCCGGACTTCCTGAGCTTCTTC‑GGCGGCAAACGCTTTGTGCCGATTGCCACCGGATTCTTCTGCCTGGTGC‑TGGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGGTACAGCa < 1:138704/288‑1 (MQ=255)
aTCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTGCGGCGGCGCTGGCGGGTGCGGTAGGTTACTTTGTGTTAACCAAAGCGATGGTGACCATCAACCCAGAAATTAACATGGGTGTACTGGCGGGTATCATTACCGGTCTGGTTGGTGGCGCAGCCT‑ATAACCGTTGGTCC‑GATATTAAACTGCCGGACTTCCTGAGCTTCTTC‑GGCGGCAAACGCTTTGTGCCGATTGCCACCGGATTCTTCTGCCTGGTGC‑TGGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGGTACAGCAc < 1:1552360/289‑1 (MQ=255)
tCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTGCGGCGGCGCTGGCGGGTGCGGTAGGTTACTTTGTGTTAACCAAAGCGATGGTGACCATCAACCCAGAAATTAACATGGGTGTACTGGCGGGTATCATTACCGGTCTGGTTGGTGGCGCAGCCT‑ATAACCGTTGGTCC‑GATATTAAACTGCCGGACTTCCTGAGCTTCTTC‑GGCGGCAAACGCTTTGTGCCGATTGCCACCGGATTCTTCTGCCTGGTGC‑TGGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGGTACAGCAc > 1:732832/1‑288 (MQ=255)
|||
TGATTACAGAACATCGGCAGTACAATTTGCAGCAAAATAAAAATACGGCTTGAAACGAGCC‑AAATAGGGTTCTCGTAGGGGGAATAAGATGAATATTTTAGGTTTTTTCCAGCGACTCGGTAGGGCGTTACA‑GCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGAGCAAAGACAGCGCTGGTGCGGCGGCGCTGGCGGGTGCGGTAGGTTACTTTGTGTTAACCAAAGCGATGGTGACCATCAACCCAGAAATTAACATGGGTGTACTGGCGGGTATCATTACCGGTCTGGTTGGTGGCGCAGCCT‑ATAACCGTTGGTCC‑GATATTAAACTGCCGGACTTCCTGAGCTTCTTC‑GGCGGCAAACGCTTTGTGCCGATTGCCACCGGATTCTTCTGCCTGGTGC‑TGGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGGTACAGCACG > CP042583/576288‑576847
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A