Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A5 F210 I1 R1
|
4929 |
268.4 |
3907572 |
96.3% |
3762991 |
273.2 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP042583 |
1,586,390 |
3 bp→TCG |
intergenic (–/–) |
– / – |
–/– |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP042583 | 1,586,390 | 0 | A | T | 99.6%
| 595.2
/ NA
| 253 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); new base T (159/91); total (161/92) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 |
| * | CP042583 | 1,586,391 | 0 | G | C | 100.0%
| 589.8
/ NA
| 253 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base C (161/92); total (161/92) |
| * | CP042583 | 1,586,392 | 0 | C | G | 99.6%
| 588.6
/ NA
| 253 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base G (159/92); minor base A (1/0); total (161/92) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 |
Only 100 of 253 total aligned reads displayed.
TTAAGGTTGCGCCCTCATTTGGGGAGTAGCCGATTTCCAGATTCCGGAAATGTACGTGTCAACATACTCGTTGCAAAACGTGGCACGTACGGACTGAATACTTTCAGTCAGGCGAGACCATATGCACATCAATCGCTATGCCTGCATGAACGCGAAAACCATCACGGCTTGTTGTTCATGTATGCATGTTTGCTGGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGAGCATGGATGCATTTGCTGCAAGTATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACC‑GAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATGGAACCACTGGATTGCGTTTGTGCTGCTGATATTCCTCGGCGGGCGAATGATTATTGAGGGTTTTCGTGGCGCAGATGATGAAGATGAAGAGCCGCGCCGTCGACACGGTTTCTGGCT > CP042583/1586112‑1586670
|||
ttAAGGTTGCGCCCTCATTTGGGGAGTAGCCGATTTCCAGATTCCGGAAATGTACGTGTCAACATACTCGTTGCAAAACGTGGCACGTACGGACTGAATACTTTCAGTCAGGCGAGACCATATGCACATCAATCGCTATGCCTGCATGAACGCGAAAACCATCACGGCTTGTTGTTCATGTATGCATGTTTGCTGGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATGGAtt > 2:837390/1‑287 (MQ=255)
gcgcCCTCATTTGGGGAGTAGCCGATTTCCAGATTCCGGAAATGTACGTGTCAACATACTCGTTGCAAAACGTGGCACGTACGGACTGAATACTTTCAGTCAGGCGAGACCATATGCACATCAATCGCTATGCCTGCATGAACGCGAAAACCATCACGGCTTGTTGTTCATGTATGCATGTTTGCTGGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATGGATGCATTtgct > 1:1510977/1‑288 (MQ=255)
cTCATTTGGGGAGTAGCCGATTTCCAGATTCCGGAAATGTACGTGTCAACATACTCGTTGCAAAACGTGGCACGTACCGACTGAATACTTTCAGTCAGGCGAGACCATATGCACATCAATCGCTATGCCTGCATGAACGCGAAAACCATCACGGCTTGTTGTTCATGTATGCATGTTTGCTGGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATGGATGCATTTGCTGCatca < 1:579006/289‑4 (MQ=255)
aTTTGGCGAATAGCCGATTTCAAGATTACGGAACTGTACGTGTCAACATACTCTTTGCAAAACCTGGCACGTACGGACTGAATACTTTCAGTCAGGCGACACCATACGCACATCAATCGCTATGCCTGCATGACCGCGAAAACCATCACGGCTTGTTGTTCACGTATGCATGCTTGCTGGGGGCGATGATGTTTTATATGGCTACCCTGGTCTGGACTTCGTCATGAATATTACGCCTACTGTTCTTCTTGCGTTGGGTATGCCGATGATTGCATTTGCTGCatcaatc > 2:1367611/1‑283 (MQ=255)
ttCCGGAAATGTACGTGTCAACATACGCGTTGCAAAACGGTGCACGTACGGACTGAATACTTTCAGGCAGGCGAGACCATATTCACATCAATCGCTATGCCTGCATGAACGCGAAAACCATCACGGCTTGTTGTTCATGTATGCATGTTTGCTGGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATGGATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATaaa < 2:1027339/288‑1 (MQ=255)
gtCAACATACTCGTTGCAAAACGTGGCACGTACGGACTGAATACTTTCAGTCAGGCGAGACCATATGCACATCAATCGCTATGCCTGCATGAACGCGAAAACCATCACGGCTTGTTGTTCATGTATGCATGTTTGCTGGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATGGATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACC‑GAAATTTTCTGAAGc > 1:270312/1‑289 (MQ=255)
gtCAACATACTCGTTGCAAAACGTGGCACGTACGGACTGAATACTTTCAGTCAGGCGAGACCATATGCACATCAATCGCTATGCCTGCATGAACGCGAAAACCATCACGGCTTGTTGTTCATGTATGCATGTTTGCTGGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATGGATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACC‑GAAATTTTCTGAAGc > 1:923874/1‑289 (MQ=255)
aaCATACTCGTTGCAAAACGTGGCACGTACGGACTGAATACTTTCAGTCAGGCGAGACCATATGCACATCGATCGCTATGCCTGCATGAACGCGAAAACCATCACGGCTTGTTGTTCATGTATGCATGTTTGCTGGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATGGATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACC‑GAAATTTTCTGAAGCAtt < 1:1177673/289‑1 (MQ=255)
aaCATACTCGTTGCAAAACGTGGCACGTACGGACTGAATACTTTCAGTCAGGCGAGACCATATGCACATCAATCGCTATGCCTGCATGAACGCGAAAACCATCACGGCTTGTTGTTCATGTATGCATGTTTGCTGGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATGGATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACC‑GAAATTTTCTGAAGCAtt < 1:1089755/289‑1 (MQ=255)
cATACTCGTTGCAAAACGTGGCACGTACGGACTGAATACTTTCAGTCAGGCGAGACCATATGCACATCAATCGCTATGCCTGCATGAACGCGAAAACCATCACGGCTTGTTGTTCATGTATGCATGTTTGCTGGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATGGATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACC‑GAAATTTTCTGAAGCATTGc > 1:1722090/1‑289 (MQ=255)
cTCGTTGCAAAACGTGGCACGTACGGACTGAATACTTTCAGTCAGGCGAGACCATATGCACATCAATCGCTATGCCTGCATGAACGCGAAAACCATCACGGCTTGTTGTTCATGTATGCATGTTTGCTGGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATGGATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACC‑GAAATTTTCTGAAGCATTGCGAAc < 2:1936199/289‑1 (MQ=255)
tCGTTGCAAAACGTGGCACGTACGGACTGAATACTTTCAGTCAGGCGAGACCATATGCACATCAATCGCTATGCCTGCATGAACGCGAAAACCATCACGGCTTGTTGTTCATGTATGCATGTTTGCTGGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATGGATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCAc > 2:375246/1‑252 (MQ=255)
tGCAAAACGTGGCACGTACGGACTGAATACTTTCAGTCAGGCGAGACCATATGCACATCAATCGCTATGCCTGCATGAACGCGAAAACCATCACGGCTTGTTGTTCATGTATGCATGTTTGCTGGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATGGATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTTCCACCCTCCATAAACC‑GAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGc > 2:501872/1‑288 (MQ=255)
gCAAAACGTGGCACGTACGGACTGAATACTTTCAGTCAGGCGAGACCATATGCACATCAATCGCTATGCCTGCATGAACGCGAAAACCATCACGGCTTGTTGTTCATGTATGCATGTTTGCTGGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATGGATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACC‑GAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCt > 1:434900/1‑289 (MQ=255)
ggCACGTACGGACTGAATACTTTCAGTCAGGCGAGACCATATGCACATCAATCGCTATGCCTGCATGAACGCGAAAACCATCACGGCTTGTTGTTCATGTATGCATGTTTGCTGGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTGGGTATGTCGATGGATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACC‑GAAATTTTCGTAAGCATTGCGAACTGGCCTTATTCTTgg > 2:1601868/1‑289 (MQ=255)
ggCACGTACGGACTGAATACTTTCAGTCAGGCGAGACCATATGCACATCAATCGCTATGCCTGCATGAACCCGAAAACCATCACGGCTTGTTGTTCATGTATGCATGTTTGCTGGGGGCGAGGATGTGTTTTAGGGATAACCACGCCAGGATATTGTCATGAATATTCATTCCACTGGTTTTCTGGAGGTTGGTATGACGAGGGATGCATTGGCTGCATCGATCGGTAATAGTTCCATCCACTATAAACCACAAATTTTCT‑AAGCACTGCAAAACgatctcgattttgg > 2:683703/1‑276 (MQ=255)
aCGGACTGAATACTTTCAGTCAGGCGAGACCATATGCACATCAATCGCTATGCCTGCATGAACGCGAAAACCATCACGGCTTGTTGTTCATGTATGCATGTTTGCTGGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATGGATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACC‑GAAATTTTCTG‑AGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCg > 2:97498/1‑289 (MQ=255)
cTTTCAGTCAGGCGAGACCATATGCACATCAATCGCTATGCCTGCATGAACGCGAAAACCATCACGGCTTGTTGTTCATGTATGCATGTTTGCTGGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATGGATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACC‑GAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGa < 2:19257/287‑1 (MQ=255)
tttCAGTCAGGCGAGACCATATGCACATCAATCGCTATGCCTGCATGAACGCGAAAACCATCACGGCTTGTTGTTCATGTATGCATGTTTGCTGGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGTTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGCTGGATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAACGGTGCCACCCTCCATAAACC‑GAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACAGGCCTTATTTTTGGTGCCGGTGTCACCCTGAcg > 2:1800932/1‑288 (MQ=255)
gtcagGCGAGACCATATGCACATCAATCGCTATGCCTGCATGAACGCGAAAACCATCACGGCTTGTTGTTCATGTATGCATGTTTGCTGGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATGGATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACC‑GAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTg > 1:1305733/1‑289 (MQ=255)
gtcagGCGAGACCATATGCACATCAATCGCTATGCCTGCATGAACGCGAAAACCATCACGGCTTGTTGTTCATGTATGCATGTTTGCTGGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATGGATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACC‑GAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTg > 1:960639/1‑289 (MQ=255)
gtcagGCGAGACCATATGCACATCAATCGCTATGCCTGCATGAACGCGAAAACCATCACGGCTTGTTGTTCATGTATGCATGTTTGCTGGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATGGATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACC‑GAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTg > 2:128475/1‑289 (MQ=255)
gtcagGCGAGACCATATGCACATCAATCGCTATGCCTGCATGAACGCGAAAACCATCACGGCTTGTTGTTCATGTATGCATGTTTGCTGGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATGGATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACC‑GAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTg > 2:940216/1‑289 (MQ=255)
cagGCGAGACCATATGCACATCAATCGCTATGCCTGCATGAACGCGAAAACCATCACGGCTTGTTGTTCATGTATGCATGTTTGCTGGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATGGATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACC‑GAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGAt < 2:5396/289‑1 (MQ=255)
gCGAGACCATATGCACATCAATCGCTATGCCTGCATGAACGCGAAAACCATCACGGCTTGTTGTTCATGTATGCATGTTTGCTGGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATGGATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACC‑GAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCgg > 2:1294454/1‑289 (MQ=255)
ccATATGCACATCAATCGCTATGCCTGCATGAACGCGAAAACCATCACGGCTTGTTGTTCATGTATGCATGTTTGCTGGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATGGATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACC‑GAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGAt < 1:990530/280‑1 (MQ=255)
tatGCACATCAATCGCTATGCCTGCATGAACGCGAAAACCATCACGGCTTGTTGTTCATGTATGCATGTTTGCTGGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATGGATGCATTTGCTGCatcaatc > 1:1353976/1‑179 (MQ=255)
atGCACATCAATCGCTATGCCTGCATGAACGCGAAAACCATCACGGCTTGTTGTTCATGTATGCATGTTTGCTGGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATGGATGCATTTGCTGCATCCATCGGTAAATGTGCCACCCTCCATAAACC‑GAAATTTTCTGAAGCATTTCGAACCGGCCTTATTTTTTGTTCCGTCGAAACCCTGACCCCCCCGATCGGCTGGGGGATg > 2:1896024/1‑289 (MQ=255)
atGCACATCAATCGCTATGCCTGCATGAACGCGAAAACCATCACGGCTTGTTGTTCATGTATGCATGTTTGCTGGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATGGATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACC‑GAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGAt > 1:126103/1‑276 (MQ=255)
atGCACATCAATCGCTATGCCTGCATGAACGCGAAAACCATCACGGCTTGTTGTTCATGTATGCATGTTTGCTGGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATGGATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACC‑GAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGAt < 2:126103/276‑1 (MQ=255)
tGCACATCAATCGCTATGCCTGCATGAACGCGAAAACCATCACGGCTTGTTGTTCATGTATGCATGTTTGCTGGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATGGATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACC‑GAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATgg < 2:1503756/289‑1 (MQ=255)
cAATCGCTATGCCTGCATGAACGCGAAAACCATCACGGCTTGTTGTTCATGTATGCATGTTTGCTGGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATGGATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACC‑GAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGtt > 2:887749/1‑289 (MQ=255)
aaTCGCTATGCCTGCATGAACGCGAAAACCATCACGGCTTGTTGTTCATGTATGCATGTTTGCTGGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATGGATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACC‑GAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTa > 1:1219362/1‑289 (MQ=255)
tCGCTATGCCTGCATGAACGCGAAAACCATCACGGCTTGTTGTTCATGTATGCATGTTTGCTGGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATGGATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACC‑GAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTag > 1:566436/1‑288 (MQ=255)
tCGCTATGCCTGCATGAACGCGAAAACCATCACGGCTTGTTGTTCATGTATGCATGTTTGCTGGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATGGATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACC‑GAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTag > 2:1207465/1‑288 (MQ=255)
cATGAACGCGAAAACCATCACGGCTTGTTGTTCATGTATGCATGTTTGCTGGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATGGATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACC‑GAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCAAGTTAGCCAGCCGGTTTg > 2:108853/1‑288 (MQ=255)
cATGAACGCGAAAACCATCACGGCTTGTTGTTCATGTATGCATGTTTGCTGGGGGCGATGATGTGTTTTATCGATACCCCGGTCAGGGCATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGAATGTCGATGGATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACC‑GAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGACACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTg > 1:1578695/1‑288 (MQ=255)
tGAACGGAAAAACCTGCGCGTCATGTTGTCTATGTATGCGTTTTTGCTGGGGGCGTTGTTGTGTTTTATCGATACTCCGGTCAGTGCACTTTCATGAATACCACTGCTACTGTTCTTCTTTCCTTTGGTATGTCGATGTATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACC‑GAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTcc < 2:1578695/289‑1 (MQ=255)
tGAACGCGAAAACCATCACGGCTTGTTGTTCATGTATGCATGTTTGCTGGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATGGATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACC‑GAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTcc < 1:1896024/289‑1 (MQ=255)
cgcgAAAACCATCACGGCTTGTTGTTCATGTATGCATGTTTGCTGGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATGGATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACC‑GAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGa > 1:171462/1‑289 (MQ=255)
aaaaCCATCACGGCTTGTTGTTCATGTATGCATGTTTGCTGGGGGCGCTGATGTGCTATATGGATACCCCGGTCACGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTAGCGTTTGGTATGTCGATGGATGCATCTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACC‑GAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTGGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCAGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCAAGCCGGTTTGTACTTGACTg > 2:1454248/1‑288 (MQ=255)
aaaaCCATCACGGCTTGTTGTTCATGTATGCATGTTTGCTGGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATGGATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACC‑GAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATgg > 1:201092/1‑289 (MQ=255)
aaaCCATCACGGCTTGTTGTTCATGTATGCATGTTTGCTGGGGGCGATGATGTGTTTTATTGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATGGATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACC‑GAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATgg < 2:1400735/288‑1 (MQ=255)
aaaCCATCACGGCTTGTTGTTCATGTATGCATGTTTGCTGGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATGGATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACC‑GAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATgg < 1:1667610/288‑1 (MQ=255)
cttaccGGCTTGTTGTTCATGTATGCAGGTTTGCTGGGTGCGATGATGTGTTTTATGGTTAACCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTGCTTGCGTTTGGTATGTCGATGGATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACC‑GAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATGGAACCa < 2:637287/284‑1 (MQ=255)
aTCACGGCTTGTTGTTCATGTATGCATGTTTGCTGGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATGGATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACC‑GAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATGGAAcc > 1:1630979/1‑287 (MQ=255)
tCACGGCTTGTTGTTCATGTATGCATGTTTGCTGGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACT‑CTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATGGATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACC‑GAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATGGAACCACTg > 1:1906346/1‑289 (MQ=255)
ggCTTGTTGTTCATGTATGCATGTTTGCTGGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATGGATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACC‑GAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATGGAACCACTGGAt < 1:1619045/289‑1 (MQ=255)
ggCTTGTTGTTCATGTATGCATGTTTGCTGGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATGGATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACC‑GAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATGGAACCACTGGAt < 1:1870392/289‑1 (MQ=255)
tgttgtTCATGTATGCATGTTTGCTGGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATGGATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACC‑GAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATGGAACCACTGGATTGCg > 2:1674696/1‑289 (MQ=255)
tCATGTATGCATGTTTGCTGGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATGGATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACC‑GAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATGGAACCACTGGATTGCGTTtgtg < 2:923874/289‑1 (MQ=255)
cATGTATGCATGTTTGCTGGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATGGATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACC‑GAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTcc > 2:1746253/1‑259 (MQ=255)
cATGTATGCATGTTTCCGTGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGAACATGGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATGGATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACC‑GAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATGGAACCACTGGATTGCGTTTGtgc < 2:581593/289‑1 (MQ=255)
gTATGCATGTTTGCTGGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATGGATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACC‑GAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGa < 2:1185547/200‑1 (MQ=255)
aTGCACGTTTGCTGGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATGGATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACC‑GAAATTTTCTGAAGCATGGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGCATGGGCATGTTCGCCACCCGGTTTGTCCGTGCATGCAACCCTTGGATTGCGTTCGTGatggtg > 2:1509563/1‑289 (MQ=255)
tGCATGTTTGCTGGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATGGATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACC‑GAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCCTGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATGGAACCACTGTATTGCGTTTGtgcctgcgt > 2:1441743/1‑283 (MQ=255)
tttGCTGGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATGGATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACC‑GAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATGGAACCACTGGATTGCGTTTGTGCTGCTGATAtt > 1:249038/1‑287 (MQ=255)
ttGCTGGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATGGATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACC‑GAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATGGAACCACTGGATTGCGTTTGTGCTGCTGATATTcc > 1:724328/1‑288 (MQ=255)
ttGCTGGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTAAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATGGATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGTTGCCACCCTCCATAAACC‑GAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGACACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGGTAGCCAGCCGGTTCGCCCTTGAATGGAACGACTGTATTGCGGTCGTGCTGCTGGTATTcc > 2:1129478/1‑288 (MQ=255)
tGCTGGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATGGATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACC‑GAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATGGAACCACTGGATTGCGTTTGTGCTGCTGATATTCCTc > 1:1073496/1‑289 (MQ=255)
tGCTGGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATGGATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACC‑GAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATGGAACCACTGGATTGCGTTTGGGCTGCTGATATTCCTc > 1:139298/1‑289 (MQ=255)
cTGGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATGGATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACC‑GAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATGGAACCACTGGATTGCGTTTGTGCTGCTGATATTCCTcg > 1:1820226/1‑288 (MQ=255)
tGGGGGCGATGATGTGGTTTATGGATACCCAGGGCAGGACATTGTCATGAATCTCTCTGCTACTGTACTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATGGATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACC‑GAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATGGAACCACTGGATTGCGTTTGTGCTGCTGATATTCCTcgg < 1:122522/288‑1 (MQ=255)
ggagatgatGTTTTTTATGGTGACCCCGGTAAGGACATTGTCATGAATATCACTGTTACTGTTCGTCTTGCGTTTGGTATGTCGATGTATTCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACC‑GAAATTTTCTGAAGCATTGCGACCCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATGGAACCACTGGATTGCGTTTGTGCTGCTGATATTCCTCggcggg < 2:201092/285‑1 (MQ=255)
cGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATGGATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACC‑GAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATGGAACCACTGGATTGCGTTTGTGCTGCTGATATTCCTCggcgggcg < 2:1219362/288‑1 (MQ=255)
gtTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATGGATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACC‑GAAATTTTCTGACGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATGGAACCACTGGATTGCGTTTGTGCTGCTGATATTCCTCGGCGGGCGAATGattat < 1:605236/288‑1 (MQ=255)
ttATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATGGATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACC‑GAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATGGAACCACTGGATTGCGTTTGTGCTGCTGATATTCCTCGGCGGGCGAATGATTATTGAg < 2:438216/289‑1 (MQ=255)
aTACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATGGATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACC‑GAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATGGAACCACTGGATTGCGTTTGTGCTGCTGATATTCCTCGGCGGGCGAATGATTATTGAGGGtttt > 1:1408130/1‑289 (MQ=255)
aCCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATGGATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACC‑GAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATGGAACCACTGGATTGCGTTTGTGCTGCTGATATTCCTCggcggg < 2:1619356/266‑1 (MQ=255)
aCCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATGGATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACC‑GAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATGGAACCACTGGATTGCGTTTGTGCTGCTGATATTCCTCGGCGGGCGAATGATTATTGAGGGTTTTCg < 1:419248/289‑1 (MQ=255)
aCCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATGGATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACC‑GAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATGGAACCACTGGATTGCGTTTGTGCTGCTGATATTCCTCGGCGGGCGAATGATTATTGAGGGTTTTCg > 1:465279/1‑289 (MQ=255)
ccaggTAAGGACATTGTCATGAATATCATTGCTTCTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATGGATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACC‑GAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATGGAACCACTGGATTGCGTTTGTGCTGCTGATATTCCTCGGCGGGCGAATGATTATTGAGGGTTTTCGTg < 2:1902689/286‑1 (MQ=255)
gTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATGGATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACC‑GAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATGGAACCACTGGATTGCGTTTGTGCTGCTGATATTCCTCGGCGGGCGAATGATGATGGAGGGTTTTGGTGgcgc > 2:741528/1‑289 (MQ=255)
tCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATGGATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACC‑GAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATGGAACCACTGGATTGCGTTTGTGCTGCTGATATTCCTCGGCGGGCGAATGATTATTGAGGGTTTTCGTGgcgc < 1:1207465/288‑1 (MQ=255)
tCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATGGATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACC‑GAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATGGAACCACTGGATTGCGTTTGTGCTGCTGATATTCCTCGGCGGGCGAATGATTATTGAGGGTTTTCGTGgcgc < 2:171462/288‑1 (MQ=255)
aCATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATGGATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACC‑GAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATGGAACCACTGGATTGCGTTTGTGCTGCTGATATTCCTCGGCGGGCGAATGATTATTGAGGGTTTTCGTGGCGCAgatga > 1:946463/1‑289 (MQ=255)
tGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATGGATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACC‑GAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATGGAACCACTGGATTGCGTTTGTGCTGCTGATATTCCTCGGCGGGCGAATGATTATTGAGGGTTTTCGTGGCGCAGATgatgaa > 2:1123682/1‑289 (MQ=255)
tGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATGGATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACC‑GAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATGGAACCACTGGATTGCGTTTGTGCTGCTGATATTCCTCGGCGGGCGAATGATTATTGAGGGTTTTCGTGGCGCAGATgatgaa > 1:511069/1‑289 (MQ=255)
gTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATGGATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACC‑GAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATGGAACCACTGGATTGCGTTTGTGCTGCTGATATTCCTCGGCGGGCGAATGATTATTGAGGGTTTTCGTGGCGCAGATgatgaag > 1:1776755/1‑289 (MQ=255)
tGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATGGATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACC‑GAAATTTTCTGCAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGCCTTGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATGGAACCACTGGATTGCGGTTGTGCTGCTGATAGTCCACGGCGGGCGAATGATTATTGAGGGTTTTCGTGGCCCATATgatgaaaatgg > 2:227538/1‑288 (MQ=255)
tGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATGGATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACC‑GAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATGGAACCACTGGATTGCGTTTGTGCTGCTGATATTCCTCGGCGGGCGAATGATTATTGAGGGTTTTCGTGGCGCAGATgatgaagatga > 1:824076/1‑289 (MQ=255)
tCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATGGATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACC‑GAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGTCGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATGGAACCACTGGATTGCGTTTGTGCTGCTGATATTCCTCGGCGGGCGAATGATTATTGAGGGTTTTCGTGGCGCAGATGATGAAGATGAAGAGcc < 2:422756/289‑1 (MQ=255)
cACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATGGATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACC‑GAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGt > 1:1434874/1‑182 (MQ=255)
cACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATGGATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACC‑GAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATGGAACCACTGGATTGCGTTTGTGCTGCTGATATTCCTCGGCGGGCGAATGCTTATTGAGGGTTTTCGTGGCGCAGATGATGAAGATGCAGAGca > 1:849129/1‑287 (MQ=255)
cACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATGGATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACC‑GAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATGGAACCACTGGATTGCGTTTGTGCTGCTGATATTCCTCGGCGGGCGAATGATTATTGAGGGTTTTCGTGGCGCAGATGATGAAGATGAAGAGcc > 1:719155/1‑288 (MQ=255)
aCTGCTCCTGTGCTTCGTGCGTTTGGTATGTCGATGGATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACC‑GAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCGTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATGGAACCACTGGATTGCGTTTGTGCTGCTGATATTCCTCGGCGGGCGAATGATTATTGAGGGTTTTCGTGGCGCAGATGATGAAGATGAAGAGCcgc < 2:270312/289‑1 (MQ=255)
tGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATGGATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACC‑GAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATGGAACCACTGGATTGCGTTTGTGCTGCTGATATTCCTCGGCGGGCGAATGATTATTGAGGGTTTTCGTGGCGCAGATGATGAAGATGAAGAGCCgcgc < 1:144755/289‑1 (MQ=255)
cTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATGGATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACC‑GAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGAt > 2:313527/1‑145 (MQ=255)
cTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATGGATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACC‑GAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGAt < 1:313527/145‑1 (MQ=255)
cTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATGGATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACC‑GAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATGGAACCACTGGATTGCGTTTGtgc < 2:792955/213‑1 (MQ=255)
cTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATGGATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACC‑GAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATGGAACCACTGGATTGCGTTTGTGCTGCTGATATTCCTCGGCGGGCGAATGATTATTGAGGGTTTTCGTGGCGCAg < 1:191795/264‑1 (MQ=255)
ttcttcTTGCGTTTGGTATGTCGATGGATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACC‑GAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATGGAACCACTGGATTGCGTTTGTGCTGCTGATATTCCTCGGCGGGCGAATGATTATTGAGGGTTTTCGTGGCGCAGATGATGAAGATGAAGAGCCGCGCCGTCGaca < 1:929165/289‑1 (MQ=255)
tcttctTGCGTTTGGTATGGCGATGGATGCAGTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCTCCCTCCATAAACC‑GAAATTTTCTTAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGCAGCCGCTGATCGGCTGGAGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATGGAACCACTGGATTGCGTTTGTGCTGCTGATATTCCTCGGCGGGCGAATGATTATTGAGGGTTTTCGGGGCGCAGATGATGAAGATGAAGAGCCGCGCAGTCGaca < 1:784878/288‑1 (MQ=255)
cttGCGTTTGGTATGTCGATGGATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACC‑GAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATGGAACCACTGGATTGCGTTTGTGCTGCTGATATTCCTCGGCGGGCGAATGATTATTGAGGGTTTTCGTTGCGCCGATGATGGAGATGAAGAGTCGCGCCGTCgcaccggtt > 2:648843/1‑281 (MQ=255)
ttGCGTTTGGTATGTCGATGGATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACC‑GAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATGGAACCACTGGATTGCGTTTGTGCTGCTGATATTCCTCGGCGGGCGAATGATTATTGAGGGTTTTCGTGGCGCAGATGATGAAGATGAAGAGCCGCGCCGTCGACACGGttt < 2:511069/289‑1 (MQ=255)
gTTTGGTATGTCGATGGATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACC‑GAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATGGAACCACTGGATTGCGTTTGTGCTGCTGATATTCCTCGGCGGGTGAATGATTATTGAGGGTTTTCGTGGCGCAGATGATGAAGATGAAGAGCCGCGCCGTCGACACGGTTTCTg > 1:761253/1‑288 (MQ=255)
gTTTGGTATGTCGATGGATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACC‑GAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATGGAACCACTGGATTGCGTTTGTGCTGCTGATATTCCTCGGCGGGCGAATGATTATTGAGGGTTTTCGTGGCGCAGATGATGAAGATGAAGAGCCGCGCCGTCGACACGGTTTCTg > 1:1267659/1‑288 (MQ=255)
ttGGTATGTCGATGGATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACC‑GAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATGGAACCACTGGATTGCGTTTGTGCTGCTGATATTCCTCGGCGGGCGAATGATTATTGAGGGTTTTCGTGGCGCAGATGATGAAGATGAAGAGCCGCGCCGTCGACACGGTTTCTGGc < 1:629921/288‑1 (MQ=255)
tGGTATGTCGATGGATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACC‑GAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATGGAACCACTGGATTGCGTTTGTGCTGCTGATATTCCTCGGCGGGCGAATGATTATTGAGGGTTTTCGTGGCGCAGATGCTGAAGATGAAGAGCAGCGCCGGCGAACCGGTTTTGGGCt > 2:954484/1‑288 (MQ=255)
tGGTATGTCGATGGATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACC‑GAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATGGAACCACTGGATTGCGTTTGTGCTGCTGATATTCCTCGGCGGGCGAATGATTATTGAGGGTTTTCGTGGCGCAGATGATGAAGATGAAGAGCCGCGCCGTCGACACGGTTTCTGGCt > 1:39763/1‑288 (MQ=255)
|||
TTAAGGTTGCGCCCTCATTTGGGGAGTAGCCGATTTCCAGATTCCGGAAATGTACGTGTCAACATACTCGTTGCAAAACGTGGCACGTACGGACTGAATACTTTCAGTCAGGCGAGACCATATGCACATCAATCGCTATGCCTGCATGAACGCGAAAACCATCACGGCTTGTTGTTCATGTATGCATGTTTGCTGGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGAGCATGGATGCATTTGCTGCAAGTATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACC‑GAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATGGAACCACTGGATTGCGTTTGTGCTGCTGATATTCCTCGGCGGGCGAATGATTATTGAGGGTTTTCGTGGCGCAGATGATGAAGATGAAGAGCCGCGCCGTCGACACGGTTTCTGGCT > CP042583/1586112‑1586670
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
