Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A5 F210 I1 R1
|
4929 |
268.4 |
3907572 |
96.3% |
3762991 |
273.2 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP042583 |
1,598,391 |
3 bp→TCG |
intergenic (–/–) |
– / – |
–/– |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP042583 | 1,598,391 | 0 | A | T | 99.2%
| 626.9
/ NA
| 267 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base T (125/139); minor base C (1/1); total (127/140) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
| * | CP042583 | 1,598,392 | 0 | G | C | 99.2%
| 619.7
/ NA
| 267 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/2); new base C (127/137); total (127/140) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.99e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
| * | CP042583 | 1,598,393 | 0 | C | G | 99.6%
| 636.7
/ NA
| 267 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base G (127/139); minor base T (0/1); total (127/140) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 267 total aligned reads displayed.
ACTATTCTTGCTGTGGAATGGCTGGACAGCCGCTTACTTTGGGATGCACATGAGAGTGGAAACGCCCGCTTCGACGACTGAATAACCGCTTACTTTGGGATGCACATGAGTCAGGAAACGCCCGCTAGCACGACTGAAGCGCAGATTAAAAATAAACGCCGTATCAGTCCTTTCTGGCTGCTGCCGTTCATCGCGCTAATGATTGCCAGTTGGCTGATTTGGGACAGTTATCAGGACCGGGGTAATACCGTCACCATCGACTTTATGAGCGCGGATGGTATTGTTCCAGGCCGTACGCCTGTTCGTTATCAGGGCGTTGAAGTCGGAACAGTGCAGGATATCAGCCTCAGCGACGATCTTCGTAAGATTGAAGTCAAGGTCAGCATCAAGTCCGATATGAAAGATGCGCTGCGCGAAGAGACTCAGTTCTGGCTGGTGACGCCAAAAGCAAGC‑TTGGCAGGTGTCTCCGGGCTGGACGCCCTCGTCGGTGGGAACTATATCGGCATGATGCCGGGTAAAGGTAAAGAGCAGGATCACTTTGTCGCA > CP042583/1598124‑1598669
|||
tcctcgcttttactatgggaccggctgcgttttatttcggcgcagcggtaattttgactattcttgctgtggaatggctggacagccgcttactttgggatgcacatgagtcaggaaacgcccgcttcgACGACTGAAGCGCAGATTAAAAATAAACGCCGTATCTCACCTTTCTGGCTGCTGCCGTTCATCGCGCTAATGATTGCCAGTTGGCTGATTTGGGACAGTTATCAGGACCGGGGTAATACCGTCACCATCGACTTTATGTCGGCGGATGGTATTGTTCCa < 1:688734‑M2/159‑1 (MQ=255)
gcttttactatgggaccggctgcgttttatttcggcgcagcggtaattttgactattcttgctgtggactggctggacagccgcttactttgggatgcacatgagtcaggaaacgcccgcttcgACGACTGAAGCGCAGATTAAAAATAAACGCCGTATCTCACCTTTCTGGCTGCTGCCGTTCATCGCGCTAATGATTGCCAGTTGGCTGATTTGGGACGGTTATCAGGACCGGGGTAATACCGTCACCATCCACTTTATGGCGGCGGATGGTATTGTTCCCGGCCGt > 2:1014940‑M2/125‑289 (MQ=255)
cttttacgatgggaccggctgcgttttatttcggcgcagcggtaattttgactattcttgctgtggaatggctggacagccgcttactttgggatgcacatgagtcaggaaacgcccgcttcgACGACTGAAGCGCAGATTAAAAATAAACGCCGTATCTCACCTTTCTGGCTGCTGCCGTTCATCGCGCTAATGATTGCCAGTTGGCTGATTTGGGACAGTTATCAGGACCGGGGTAATACCGTCACCATCGACTTTATGTCGGCGGATGGTATTGTTCCAGGCCGTa < 2:89372‑M2/166‑1 (MQ=255)
ttttactatgggaccggctgcgttttatttcggcgcagcggtaattttgactattcttgctgtggaatggctggacagccgcttactttgggatgcacatgagtcaggaaacgcccgcttcgACGACTGAAGCGCAGATTAAAAATAAACGCCGTATCTCACCTTTCTGGCTGCTGCCGTTCATCGCGCTAATGATTGCCAGTTGGCTGATTTGGGACAGTTATCAGGACCGGGGTAATACCGTCACCATCGACTTTATGTCGGCGGATGGTATTGTTCCAGGCCGTa < 1:361312‑M2/166‑1 (MQ=255)
ttagtatgggaccggctgggttgtatttgggggcaggggtaattttgactattcttgctgtggaatggctggacagccgcttactttgggatgcacatgagtcaggaaacgcccgcttcgACGACTGAAGCGCAGATTAAAAATAAACGCCGTATCTCACCTTTCTGGCTGCTGCCGTTCATCGCGCTAATGATTGCCAGTTGGCTGATTTGGGACAGTTATCAGGACCGGGGTAATACCGTCACCATCGACTTTATGTCGGCGGATGGTATTGTTCCAGGCCGTACGc < 2:1576091‑M2/169‑1 (MQ=255)
ttactatgggaccggctgcgttttatttcggcgcagcggtaattttgactattcttgctgtggaatggctggacagccgcttactttgggatgcacatgagtcaggaaacgcccgcttcgACGACTGAAGCGCAGATTAAAAATAAACGCCGTATCTCACCTTTCTGGCTGCTGCCGTTCATCGCGCTAATGATTGCCAGTTGGCTGATTTGGGACAGTTATCAGGACCGGGGTAATACCGTCACCATCGACTTTATGTCGGTGGATTGTATTGTTTCAGGCCTTACg > 2:1838032‑M2/121‑288 (MQ=255)
ttactatgggaccggctgcgttttatttcggcgcagcggtaattttgactattcttgctgtggaatggctggacagccgcttactttgggatgcacatgagtcaggaaacgcccgcttcgACGACTGAAGCGCAGATTAAAAATAAACGCCGTATCTCACCTTTCTGGCTGCTGCCGTTCATCGCGCTAATGATTGCCAGTTGGCTGATTTGGGACAGTTATCAGGACCGGGGTAATACCGTCACCATCGACTTTATGTCGGCGGATGGTATTGTTCCAGGCCGTACg > 2:1253622‑M2/121‑288 (MQ=255)
tactatgggaccggctgcgttttatttcggcgcagcggtaattttgactattcttgctgtggaatggctggacagccgcttactttgggatgcacatgagtcaggaaacgcccgcttcgACGACTGAAGCGCAGATTAAAAATAAACGCCGTATCTCACCTTTCTGGCTGCTGCCGTTCATCGCGCTAATGATTGCCAGTTGGCTGATTTGGGACAGTTATCAGGACCGGGGTAATACCGTCACCATCGACTTTATGTCGGCGGATGGTATTGTTCCAGGCCGTACGcc < 2:210258‑M2/170‑1 (MQ=255)
tactatgggaccggctgcgttttatttcggcgcagcggtaattttgactattcttgctgtggaatggctggacagccgcttactttgggatgcacatgagtcaggaaacgcccgcttcgACGACTGAAGCGCAGATTAAAAATAAACGCCGTATCTCACCTTTCTGGCTGCTGCCGTTCATCGCGCTAATGATTGCCAGTTGGCTGATTTGGGACAGTTATCAGGACCGGGGTAATACCGTCACCATCGACTTTATGTCGGCGGATGGTATTGTTCCAGGCCGTACGcc < 1:1253622‑M2/170‑1 (MQ=255)
tgggaccggctgcgttttatttcggcgcagcggtaattttgactattcttgctgtggaatggctggacagccgcttactttgggatgcacatgagtcaggaaacgcccgcttcgACGACTGAAGCGCAGATTAAAAATAAACGCCGTATCTCACCTTTCTGGCTGCTGCCGTTCATCGCGCTAATGATTGCCAGTTGGCTGATTTGGGACAGTTATCAGGACCGGGGTAATACCGTCACCATCGACTTTATGTCGGCGGATGGTATTGTTCCAGGCCGTACGCCTGTTc > 1:968079‑M2/115‑289 (MQ=255)
ggaccggctgcgttttatttcggcgcagcggtaattttgactattcttgctgtggaatggctggacagccgcttactttgggatgcacatgagtcaggaaacgcccgcttcgACGACTGAAGCGCAGATTAAAAATAAACGCCGTATCTCACCTTTCTGGCTGCTGCCGTTCATCGCGCTAATGATTGCCAGTTGGCTGATTTGGGACAGTTATCAGGACCGGGGTAATACCGTCACCATCGACTTTATGTCGGCGGATGGTATTGTTCCAGGCCGTACGCCTGTTCGt > 1:1781315‑M2/113‑289 (MQ=255)
ccgtctgcggtttatttcggcgcagcgttaattttgactattcttgctgtggaatggctggacagccgcttactttgggatgcacatgagtcaggaaacgcccgcttcgACGACTGAAGCGCAGATTAAAAATAAACGCCGTATCTCACCTTTCTGGCTGCTGCCGTTCATCGCGCTAATGATTGCCAGTTGGCTGATTTGGGACAGTTATCAGGACCGGGGTAATACCGTCACCATCGACTTTATGTCGGCGGATGGTATTGTTCCAGGCCGTACGCCTGTTCGTTAt < 1:1802544‑M2/180‑1 (MQ=255)
ggctgcgttttatttcggcgcagcggtaattttgactattcttgctgtggaatggctggacagccgcttactttgggatgcacatgagtcaggaaacgcccgcttcgACGACTGAAGCGCATATTAAAAATAAACGCCGTATCTCACCTTTCTGGCTGCTGCCGTTCATCGCGCTAATGATTGCCAGTTGGCTGATTTGGGACAGTTATCAGGACCGGGGTAATACCGTCACCATCGACTTTATGTCGGCGGATGGTATTGTTCCAGGCCGTACGCCTGTTCGTTATCa < 1:1894968‑M2/182‑1 (MQ=255)
gctgcgttttatttcggcgcagcggtaattttgactattcttgctgtggaatggctggacagccgcttactttgggatgcacatgagtcaggaaacgcccgcttcgACGACTGAAGCGCAGATTAAAAATAAACGCCGTATCTCACCTTTCTGGCTGCTGCCGTTCATCGCGCTAATGATTGCCAGTTGGCTGATTTGGGACAGTTATCAGGACCGGGGTAATACCGTCACCATCGACTTTATGTCGGCGGATGGTa < 1:387034‑M2/151‑1 (MQ=255)
gctgcgttttatttcggcgcagcggtaattttgactattcttgctgtggaatggctggacagccgcttactttgggatgcacatgagtcaggaaacgcccgcttcgACGACTGAAGCGCAGATTAAAAATAAACGCCGTATCTCACCTTTCTGGCTGCTGCCGTTCATCGCGCTAATGATTGCCAGTTGGCTGATTTGGGACAGTTATCAGGACCGGGGTAATACCGTCACCATCGACTTTATGTCGGCGGATGGTATTGTTCCAGGCCGTACGCCTGTTCGTTATCAg > 2:616840‑M2/107‑289 (MQ=255)
tgcgttttatttcggcgcagcggtaattttgactattcttgctgtggaatggctggacagccgcttactttgggatgcacatgagtcaggaaacgcccgcttcgACGACTGAAGCGCAGATTAAAAATAAACGCCGTATCTCACCTTTCTGGCTGCTGCCGTTCATCGCGCTAATGATTGCCAGTTGGCTGATTTGGGACAGTTATCAGGACCGGGGTAATACCGTCACCATCGACTTTATGTCGGCGGATGGTa < 1:1753995‑M2/151‑1 (MQ=255)
tgcgttttatttcggcgcagcggtaattttgactattcttgctgtggaatggctggacagccgcttactttgggatgcacatgagtcaggaaacgcccgcttcgACGACTGAAGCGCAGATTAAAAATAAACGCCGTATCTCACCTTTCTGGCTGCTGCCGTTCATCGCGCTAATGATTGCCAGTTGGCTGATTTGGGACAGTTATCAGGACCGGGGTAATACCGTCACCATCGACTTTATGTCGGCGGATGGTATTGTTCCAGGCCGTACGCCTGTTCGTTATCAgg < 1:1628503‑M2/184‑1 (MQ=255)
ttttatttcggcgcctgggtaattttgactattcttgctgtggaatggctggacagccgcttactttgggatgcaaatgagtcaggaaacgcccgcttcgACGACTGAAGCGCAGATTAAAAATAAACGCCGTATCTCACCTTTCTGGCTGCTGCCGTTCATCGCGCTAATGATTGCCAGTTGGCTGATTTGGGACAGTTATCAGGACCGGGGTAATACCGTCACCATCGACTTTATGTCGGCGGATGGTATTGTTCCAGGCCGTACGCCTGTTCGTTATCAGGGCGtt < 2:288117‑M2/189‑1 (MQ=255)
ttttatttcggcgcagcggtaattttgactattcttgctgtggaatggctggacagccgcttactttgggatgcacatgagtcaggaaacgcccgcttcgACGACTGAAGCGCAGATTAAAAATAAACGCCGTATCTCACCTTTCTGGCTGCTGCCGTTCATCGCGCTAATGATTGCCAGTTGGCTGATTTGGGACAGTTATCAGGACCGGGGTAATACCGTCACCATCGACTTTATGTCGGCGGATGGTATTGTTCCAGGCCGTACGCCTGTTCGTTATCAGGGCGtt < 1:1849918‑M2/189‑1 (MQ=255)
ttttatttcggcgcagcggtaattttgactattcttgctgtggaatggctggacagccgcttactttgggatgcacatgagtcaggaaacgcccgcttcgACGACTGAAGCGCAGATTAAAAATAAACGCCGTATCTCACCTTTCTGGCTGCTGCCGTTCATCGCGCTAATGATTGCCAGTTGGCTGATTTGGGACAGTTATCAGGACCGGGGTAATACCGTCACCATCGACTTTATGTCGGCGGATGGTATTGTTCCAGGCCGTACGCCTGTTCGTTATCAGGGCGtt < 1:1714022‑M2/189‑1 (MQ=255)
tttatttcggcgcagcggtaattttgactattcgtgctgtggaatggctggacagccgcttactttgggatgcacatgagtcaggaaacgcccgcttcgACGACTGAAGCGCAGATTAAAAATAAACGCCGTATCTCACCTTTCTGGCTGCTGCCGTTCATCGCGCTAATGATTGCCAGTTGGCTGATTTGGGACAGTTATCAGGACCGGGGTAATACCGTCACCATCGACTTTATGTCGGCGGATGGTATTGTTCCAGGCCGTACGCCTGTTCGTTATCAGGGCGtt < 1:160646‑M2/189‑1 (MQ=255)
tttcggcgcagcggtaattttgactattcttgctgtggaatggctggacagccgcttactttgggatgcacatgagtcaggaaacgcccgcttcgACGACTGAAGCGCAGATTAAAAATAAACGCCGTATCTCACCTTTCTGGCTGCTGCCGTTCATCGCGCTAATGATTGCCAGTTGGCTGATTTGGGACAGTTATCAGGACCGGGGTAATACCGTCACCATCGACTTTATGTCGGCGGATGGTATTGTTCCAGGCCGTACGCCTGTTCGTTATCAGGGCGTTGAAGt < 1:86035‑M2/194‑1 (MQ=255)
cggagagggaattttgtctgttcttgctggggaatggctggacagctgctgactttgggatgcaaatgagtcaggaaacggccgcttcgACGACTGGAGCGCAGATTAAAAATAAACGCCGTATCTCACCTTTCTGGCTGCTGCCGTTCATCGCGCTAATGATTGCCAGTTGGCTGATTTGGGACAGTTATCAGGACCGGGGTAATACCGTCACCATCGACTTTATGTCGGCGGATGGTATTGTTCCAGGCCGTACGCCTGTTCGTTATCAGGGCGTTGAAGTCGGaa < 2:1462911‑M2/199‑1 (MQ=255)
cgccgcggtaattttgactattctttctgtggactggctggacagccgcttactttgggctgcacatgagtcaggaaacgcccgcttcgACGACTGAAGCGCAGATTAAAAATAAACGCCGTATCTCACCTTTCTGGCTGCTGCCGTTCATCGCGCTAATGATTGCCAGTTGGCTGATTTGGGACAGTTATCAGGACCGGGGTAATACCGTCACCATCGACTTTATGTCGGCGGATGGTATTGTTCCAGGCCGTACGCCTGTTCGTTATCAGGGCGTTGAAGTCGGaa < 2:51724‑M2/199‑1 (MQ=255)
cgcagcggtaattttgactattcttgctgtggaatggctggacagccgcttactttgggatgcacatgagtcaggaaacgcccgcttcgACGACTGAAGCGCAGATTAAAAATAAACGCCGTATCTCACCTTTCTGGCTGCTGCCGTTCATCGCGCTAATGATTGCCAGTTGGCTGATTTGGGACAGTTATCAGGACCGGGGTAATACCGTCACCATCGACTTTATGTCGGCGGATGGTATTGTTCCAGGCCGTACGCCTGTTCGTTATCAGGGCGTTGAAGTCGGaa < 2:351951‑M2/199‑1 (MQ=255)
cgcagcggtaattttgactattcttgctgtggaatggctggacagccgcttactttgggatgcacatgagtcaggaaacgcccgcttcgACGACTGAAGCGCAGATTAAAAATAAACGCCGTATCTCACCTTTCTGGCTGCTGCCGTTCATCGCGCTAATGATTGCCAGTTGGCTGATTTGGGACAGTTATCAGGACCGGGGTAATACCGTCACCATCGACTTTATGTCGGCGGATGGTATTGTTCCAGGCCGTACGCCTGTTCGTTATCAGGGCGTTGAAGTCGGaa < 1:440863‑M2/199‑1 (MQ=255)
cgcagcggtaattttgactattcttgctgtggaatggctggacagccgcttactttgggatgcacatgagtcaggaaacgcccgcttcgACGACTGAAGCGCAGATTAAAAATAAACGCCGTATCTCACCTTTCTGGCTGCTGCCGTTCATCGCGCTAATGATTGCCAGTTGGCTGATTTGGGACAGTTATCAGGACCGGGGTAATACCGTCACCATCGACTTTATGTCGGCGGATGGTATTGTTCCAGGCCGTACGCCTGTTCGTTATCAGGGCGTTGAAGTCGGaa < 1:736856‑M2/199‑1 (MQ=255)
cgcagcggtaattttgactattcttgctgtggaatggctggacagccgcttactttgggatgcacatgagtcaggaaacgcccgcttcgACGACTGAAGCGCAGATTAAAAATAAACGCCGTATCTCACCTTTCTGGCTGCTGCCGTTCATCGCGCTAATGATTGCCAGTTGGCTGATTTGGGACAGTTATCAGGACCGGGGTAATACCGTCACCATCGACTTTATGTCGGCGGATGGTATTGTTCCAGGCCGTACGCCTGTTCGTTATCAGGGCGTTGAAGTCGGaa < 1:955690‑M2/199‑1 (MQ=255)
cgcagcggtaattttgactattcttgctgtggaatggctggacagccgcttactttgggatgcacatgagtcaggaaacgcccgcttcgACGACTGAAGCGCAGATTAAAAATAAACGCCGTATCTCACCTTTCTGGCTGCTGCCGTTCATCGCGCTAATGATTGCCAGTTGGCTGATTTGGGACAGTTATCAGGACCGGGGTAATACCGTCACCATCGACTTTATGTCGGCGGATGGTATTGTTCCAGGCCGTACGCCTGTTCGTTATCAGGGCGTTGAAGTCGGaa < 2:1595509‑M2/199‑1 (MQ=255)
cgcagcggtaattttgactattcttgctgtggaatggctggacagccgcttactttgggatgcacatgagtcaggaaacgcccgcttcgACGACTGAAGCGCAGATTAAAAATAAACGCCGTATCTCACCTTTCTGGCTGCTGCCGTTCATCGCGCTAATGATTGCCAGTTGGCTGATTTGGGACAGTTATCAGGACCGGGGTAATACCGTCACCATCGACTTTATGTCGGCGGATGGTATTGTTCCAGGCCGTACGCCTGTTCGTTATCAGGGCGTTGAAGTCGGaa < 2:462175‑M2/199‑1 (MQ=255)
gactattcttgctgtggaatggctggacagccgcttactttgggatgcacatgagtcaggaaacgcccgcttcgACGACTGAAGCGCAGATTAAAAATAAACGCCGTATCTCACCTTTCTGGCTGCTGCCGTTCATCGCGCTAATGATTGCCAGTTGGCTGATTTGGGACAGTTATCAGGACCGGGGTAATACCGTCACCATCGACTTTATGTCGGCGGATGGTATTGTTCCAGGCCGTACGCCTGTTCGTTATCAGGGCGTTGAAGTCGGAACAGTGCAGGATATCa > 2:955017‑M2/75‑288 (MQ=255)
tattcttgctgtggaatggctggacagccgcttactttgggatgcacatgagtcaggaaacgcccgcttcgACGACTGAAGCGCAGATTAAAAATAAACGCCGTATCTCACCTTTCTGGCTGCTGCCGTTCATCGCGCTAATGATTGCCAGTTGGCTGATTTGGGACAGTTATCAGGACCGGGGTAATACCGTCACCATCGACTTTATGTCGGCGGATGGTATTGTTCCAGGCCGTACGCCTGTTCGTTATCAGGGCGTTGAAGTCGGAACAGTGCAGGATATCAGCCt < 1:349328‑M2/218‑1 (MQ=255)
tgctgtggaatggctggacagccgcttactttgggatgcacatgagtcaggaaacgcccgcttcgACGACTGAAGCGCAGATTAAAAATAAACGCCGTATCTCACCTTTCTGGCTGCTGCCGTTCATCGCGCTAATGATTGCCAGTTGGCTGATTTGGGACAGTTATCAGGACCGGGGTAATACCGTCACCATCGACTTTATGTCGGCGGATGGTATTGTTCCAGGCCGTACGCCTGTTCGTTATCAGGGCGTTGAAGTCGGAACAGTGCAGGATATCAGCCTCAGcga < 1:1239841‑M2/224‑1 (MQ=255)
tgctgtggaatggctggacagccgcttactttgggatgcacatgagtcaggaaacgcccgcgtcgACGACTGAAGCGCAGATTAAAAATAAACGACGTATCTCACCTTTCTGGCTGCTGCCGTTCATCGCGCTAATGATTGCCAGTTGGCTGATTTGGGACAGTTATCAGGACCGGGGTAATACCGTCACCATCGACTTTATGTCGGCGGATGGTATTGTTCCAGGCCGTACGCCTGTTCGTTATCAGGGCGTTGAAGTCGGAACAGTGCAGGATATCAGCCTCAGcga < 1:1555492‑M2/224‑1 (MQ=255)
gctgtggaatggctggacagccgcttactttgggatgcacatgagtcaggaaacgcccgcttcgACGACTGAAGCGCAGATTAAAAATAAACGCCGTATCTCACCTTTCTGGCTGCTGCCGTTCATCGCGCTAATGATTGCCAGTTGGCTGATTTGGGACAGTTATCAGGACCGGGGTAATACCGTCACCATCGACTTTATGTCGGCGGATGGTATTGTTCCAGGCCGTACGCCTGTTCGTTATCAGGGCGTTGAAGTCGGAACAGTGCAGGAGATACGCCTCAGcgac > 2:1537416‑M2/65‑289 (MQ=255)
tggaatggctggacagccgcttactttgggatgcacatgagtcaggaaacgcccgcttcgACGACTGAAGCGCAGATTAAAAATAAACGCCGTATCTCACCTTTCTGGCTGCTGCCGTTCATCGCGCTAATGATTGCCAGTTGGCTGATTTGGGACAGTTATCAGGACCGGGGTAATACCGTCACCATCGACTTTATGTCGGCGGATGGTATTGTTCCAGGCCGTACGCCTGTTCGTTATCAGGGCGTTGAAGTCGGAACAGTGCAGGATATCAGCCTCAGCGACGAt < 1:232623‑M2/228‑1 (MQ=255)
ggaatggctggacagccgcttactttgggatgcacatgagtcaggaaacgcccgcttcgACGACTGAAGCGCAGATTAAAAATAAACGCCGTATCTCACCTTTCTGGCTGCTGCCGTTCATCGCGCTAATGATTGCCAGTTGGCTGATTTGGGACAGTTATCAGGACCGGGGTAATACCGTCACCATCGACTTTATGTCGGCGGATGGTATTGTTCCAGGCCGTACGCCTGTTCGTTATCAGGGCg > 1:1451411‑M2/60‑246 (MQ=255)
tggctggacagccgcttactttgggatgcacatgagtcaggaaacgcccgcttcgACGACTGAAGCGCAGATTAAAAATAAACGCCGTATCTCACCTTTCTGGCTGCTGCCGTTCATCGCGCTAATGATTGCCAGTTGGCTGATTTGGGACAGTTATCAGGACCGGGGTAATACCGTCACCATCGACTTTATGTCGGCGGATGGTATTGTTCCAGGCCGTACGCCTGTTCGTTATCAGGGCGTTGAAGTCGGAACAGTGCAGGATATCAGCCTCAGCGACGATCTTCGt < 1:1159980‑M2/234‑1 (MQ=255)
ggctggacagtcgcttactttgggatgcacatgaggcaggaaacgcccgcttcgACGACTGAAGCGCAGATTAAAAATAAACGCCGTATCTCACCTTTCTGGCTGCTGCCGTTCATCGCGCTAATGATTGCCAGTTGGCTGATTTGGGACAGTTATCAGGACCGGGGTAATACCGTCACCATCGACTTTATGTCGGCGGATGGTATTGTTCCAGGCCGTACGCCTGTTCGTTATCAGGGCGTTGAAGTCGGAACAGTGCAGGATATCAGCCTCAGCGACGATCTTCGTa < 1:1652621‑M2/235‑1 (MQ=255)
ctggacagccgcttactttgggatgcacatgagtcaggaaacgcccgcttcgACGACTGAAGCGCAGATTAAAAATAAACGCCGTATCTCACCTTTCTGGCTGCTGCCGTTCATCGCGCTAATGATTGCCAGTTGGCTGATTTGGGACAGTTATCAGGACCGGGGTAATACCGTCACTATCGACTTTATGTCGGCGGATGGTATTGTTCCAGGCCGTACGCCTGTTCGTTTTCAGGGCGGTGAAGTCGGAACAGTGCAGGATATCAGCCTCAGCGACGATCTTCGTAAg > 2:1240920‑M2/53‑289 (MQ=255)
ggacagccgcttactttgggatgcacatgagtcaggaaacgcccgcttcgACGACTGAAGCGCAGATTAAAAATAAACGCCGTATCTCACCTTTCTGGCTGCTGCCGTTCATCGCGCTAATGATTGCCAGTTGGCTGATTTGGGACAGTTATCAGGACCGGGGTAATACCGTCACCATCGACTTTATGTCGGCGGATGGTATTGTTCCAGGCTGTACGCCTGTTCGTTATCAGGGCGTTGAAGTCGGAACAGTGCAGGATATCAGCCTCAGCGACGATCTTCGTAAGAt < 1:56363‑M2/239‑1 (MQ=255)
acagccgcttactttgggatgcacatgagtcaggaaacgcccgcttcgACGACTGAAGCGCAGATTAAAAATAAACGCCGTATCTCACCTTTCTGGCTGCTGCCGTTCATCGCGCTAATGATTGCCAGTTGGCTGATTTGGGACAGTTATCAGGACCGGGGTAATACCGTCACCATCGACTTTATGTCGGCGGATGGTATTGTTCCAGGCCGTACGCCTGTTCGTTATCAGGGCGTTGAAGTCGGAACAGTGCAGGATATCAGCCTCAGCGACGATCTTCGTAAGATTg > 1:1526427‑M2/49‑289 (MQ=255)
tgggatgcacatgagtcaggaaacgcccgcttcgACGACTGAAGCGCAGATTAAAAATAAACGCCGTATCTCACCTTTCTGGCTGCTGCCGTTCATCGCGCTAATGATTGCCAGTTGGCTGATTTGGGACAGTTATCAGGACCGGGGTAATACCGTCACCATCGACTTTATGTCGGCGGATGGTATTGTTCCAGGCCGTACGCCTGTTCGTTATCAGGGCGTTGAAGTCGGAACAGTGCAGGATATCAGCCTCAGcgacg > 1:81859‑M2/35‑260 (MQ=255)
cacatgagtcaggaaacgcccgcttcgACGACTGAAGCGCAGATTAAAAATAAACGCCGTATCTCACCTTTCTGGCTGCTGCCGTTCATCGCGCTAATGATTGCCAGTTGGCTGATTTGGGACAGTTATCAGGACCGGGGTAATACCGTCACCATCGACTTTATGTCGGCGGATGGTATTGTTCCAGGCCGTACGCCTGTTCGTTATCAGGGCGTTGAAGTCGGAACAGTGCAGGATATCAGCCTCAGCGACGATCTTCGTAAGATTGAAGTCAAGGTCAGCATCAAg > 2:126049‑M2/28‑288 (MQ=255)
catgagtcaggaaacgcccgcttcgACGACTGAAGCGCAGATTAAAAATAAACGCCGTATCTCACCTTTCTGGCTGCTGCCGTTCATCGCGCTAATGAGTGCCAGTTGGCTGATTTGGGACAGTTATCAGGACCGGGGTAATACCGTCACCATCGACTTTATGTCGGCGGATGGTATTGTTCCAGGCCGTACGCCTGTTCGTTATCAGGGCGTTGAAGTCGGAACAGTGCAGGATATCAGCCTCAGCGACGATCTTCGTAAGATTGAAGTCAAGGTCAGCATCAAGTcc < 2:1507349‑M2/264‑1 (MQ=255)
atgagtcaggacacgcccgcttcgACGACTGAAGCGCAGATTAAAAATAAACGCCGTATCTCACCTTTCTGGCCGCTGCCGTTCATCGCGCTAATGATTGCCAGTTGGCTGATTTGGGACAGTTATCAGGACCGGGGTAATACCGTCACCATCGACTTTATGTCGGCGGATGGTATTGTTCCAGGCCGTACGCCTGTTCGTTATCAGGGCGTTGAAGTCGGAACAGTGCAGGATATCAGCCTCAGCGACGATCTTCGTAAGATTGAAGTCAAGGTCAGCATCAAGTCCg < 1:1115503‑M2/265‑1 (MQ=255)
cttcgACGACTGAAGCGCAGATTAAAAATAAACGCCGTATCTCACCTTTCTGGCTGCTGCCGTTCATCGCGCTAATGATTGCCAGTTGGCTGATTTGGGACAGTTATCAGGACCGGGGTAATACCGTCACCATCGACTTTATGTCGGCGGATGGTATTGTTCCAGGCCGTACGCCTGTTCGTTATCAGGGCGTTGAAGTCGGAACAGTGCAGGATATCAGCCTCAGCGACGATCTTCGTAAGATTGAAGTCAAGGTCAGCATCAAGTCCGATATGAAAGAtgcgctgc > 1:147148‑M2/6‑288 (MQ=255)
cGACTGAAGCGCAGATTAAAAATAAACGCCGTATCTCACCTTTCTGGCTGCTGCCGTTCATCGCGCTAATGATTGCCAGTTGGCTGATTTGGGACAGTTATCAGGACCGGGGTAATACCGTCACCATCGACTTTATGTCGGCGGATGGTATTGTTCCAGGCCGTACGCCTGTTCGTTATCAGGGCGTTGAAGTCGGAACAGTGCAGGATATCAGCCTCAGCGACGATCTTCGTAAGATTGAAGTCAAGGTCAGCATCAAGTCCGATATGAAAGATGCGCTGCGCGAag < 1:1363483/288‑1 (MQ=255)
cTGAAGCGCAGATTAAAAATAAACGCCGTATCTCACCTTTCTGGCTGCTGCCGTTCATCGCGCTAATGATTGCCAGTTGGCTGATTTGGGACAGTTATCAGGACCGGGGTAATACCGTCACCATCGACTTTATGTCGGCGGATGGTATTGTTCCAGGCCGTACGCCTGTTCGTTATCAGGGCGTTGAAGTCGGAACAGTGCAgg > 1:548376/1‑204 (MQ=255)
tGAAGCGCAGATTAAAAATAAACGCCGTATCTCACCTTTCTGGCTGCTGCCGTTCATCGCGCTAATGATTGCCAGTTGGCTGATTTGGGACAGTTATCAGGACCGGGGTAATACCGTCACCATCGACTTTATGTCGGCGGATGGTATTGTTCCAGGCCGTACGCCTGTTCGTTATCAGGGCGTTGAAGTCGGAACAGTGCAGGATATCAGCCTCAGCGACGATCTTCGTAAGATTGAAGTCAAGGTCAGCATCAAGTCCGATATGAAAGATGCGCTGCGCGAAGAGACt < 1:1537416/289‑1 (MQ=255)
gaaGATTAAAAATAAACGCCGTACCTCACCTTGCTGGCTGCTGCCGTTCATCGCGCTAATGATTGCCAGTTGGCTGATTTGGGACAGTTATCAGGACCGGGGTAATACCGTCACCATCGACTTTATGTCGGCGGATGGTATTGTTCCAGGCCGTACGCCTGTTCGTTATCAGGGCGTTGAAGTCGGAACAGTGCAGGATATCAGCCTCAGCGACGATCTTCGTAAGATTGAAGTCAAGGTCAGCATCAAGTCCGATATGAAAGATGCGCTGCGCGAAGAGACTCAGtt < 2:701358/286‑1 (MQ=255)
aGATTAAAAATAAACGCCGTATCTCACCTTTCTGGCTGCTGCCGTTCATCGCGCTAATGATTGCCAGTTGGCTGATTTGGGACAGTTATCAGGACCGGGGTAATACCGTCACCATCGACTTTATGTCGGCGGATGGTATTGTTCCAGGCCGTACGCCTGTTCGTTATCAGGGCGTTGAAGTCGGAACAGTGCAGGATATCAGCCTCAGCGACGATCTTCGTAAGATTGAAGTCAAGGTCAGCATCAAGTCCGATATGAAAGATGCGCTGCGCGAAGAGACTCAGTTctg > 2:504691/1‑289 (MQ=255)
aaaTAAACGCCGTATCTCACCTTTCTGGCTGCTGCCGTTCATCGCGCTAATGATTGCCAGTTGGCTGATTTGGGACAGTTATCAGGACCGGGGTAATACCGTCACCATCGACTTTATGTCGGCGGATGGTATTGTTCCAGGCCGTACGCCTGTTCGTTATCAGGGCGTTGAAGTCGGAACAGTGCAGGATATCAGCCTCAGCGACGATCTTCGTAAGATTGAAGTCAAGGTCAGCATCAAGTCCGATATGAAAGATGCGCTGCGCGAAGAGACTCAGTTCTGGCTGGTg < 2:1781315/289‑1 (MQ=255)
tatctcaccTTTCTGGCTGCTGCCGTTCATCGCGCTAATGATTGCCAGTTGGCTGATTTGGGACAGTTATCAGGACCGGGGTAATACCGTCACCATCGACTTTATGTCGGCGGATGGTATTGTTCCAGGCCGTACGCCTGTTCGTTATCAGGGCGTTGAAGTCGGAACAGTGCAGGATATCAGCCTCAGCGACGATCTTCGTAAGATTGAAGTCAAGGTCAGCATCAAGTCCGATATGAAAGATGCGCTGCGCGAAgaga > 2:1165594/8‑260 (MQ=255)
ttCTGGCTGCTGCCGTTCATCGCGCTAATGATTGCCAGTTGGCTGATTTGGGACAGTTATCAGGACCGGGGTAATACCGTCACCATCGACTTTATGTCGGCGGATGGTATTGTTCCAGGCCGTACGCCTGTTCGTTATCAGGGCGTTGAAGTCGGAACAGTGCAGGATATCAGCCTCAGCGACGATCTTCGTAAGATTGAAGTCAAGGTCAGCATCAAGTCCGATATGAAAGATGCGCTGCGCGAAGAGACTCAGTTCTGGCTGGTGACGCCAAAAGCATCG‑TTGGCAg > 1:1502582/1‑289 (MQ=255)
ttCTGGCTGCTGCCGTTCATCGCGCTAATGATTGCCAGTTGGCTGATTTGGGACAGTTATCAGGACCGGGGTAATACCGCCACCCTCGACTTTATGTCGGCGGATGGTATTGTTCCAGGCCGTACGCCTGTTCGTTATCAGGGCGTTGAAGTCGGAACAGTGCAGGATAACAGCCTCACCGACGATCCTCGTAAGATCGAAGTCAAGGTCAGCACCAAATCCGATCTGCAAGACGCGCTGCACGAAGACACTCAGTTCCGGCCGGTGACGCCAAAAGCATCG‑TTGGCAg > 2:1365297/1‑289 (MQ=255)
cTGGCTGCTGCCGTTCATCGCGCTAATGATTGCCAGTTGGCTGATTTGGGACAGTTATCAGGACCGGGGTAATACCGTCACCATCGACTTTATGTCGGCGGATGGTATTGTTCCAGGCCGTACGCCTGTTCGTTATCAGGGCGTTGAAGTCGGAACAGTGCAGGATATCAGCCTCGTCGACGATCTTCGTAAGATTGAAGTCAAGGTCAGCATCAAGTCCGATATGAAAGATGCGCTGCGGGAAGAGACTCAGTTCTGGCTGGTGACGCCAAAAGCATCG‑TTGGCAGgt > 2:584841/1‑289 (MQ=255)
gctgcCGTTCATCGCGCTAATGATTGCCAGTTGGCTGATTTGGGACAGTTATCAGGACCGGGGTAATACCGTCACCATCGACTTTATGTCGGCGGATGGTATTGTTCCAGGCCGTACGCCTGTTCGTTATCAGGGCGTTGAAGTCGGAACAGTGCAGGATATCAGCCTCAGCCACGATCTTCGTAAGATTGAAGTCAAGGTCAGCATCAAGTCCGATATGAAAGATGCGCTGCGCGAAGAGACTCAGTTCTGGCTGGTGACGCCAAAAGCATCG‑TTGGCAGGTGTCTcc > 2:1285341/1‑289 (MQ=255)
ttCATCGCGCTAATGATTGCCAGTTGGCTGATTTGGGACAGTTATCAGGACCGGGGTAATACCGTCACCATCGACTTTATGTCGGCGGATGGTATTGTTCCAGGCCGTACGCCTGTTCGTTATCAGGGCGTTGAAGTCGGAACAGTGCAGGATATCAGCCTCAGCGACGATCTTCGTAAGATTGAAGTCAAGGTCAGCATCAAGTCCGATATGAAAGATGCGCTGCGCGAAGAGACTCAGTTCTGGCTGGTGACGCCAAAAGCATCG‑TTGGCAGGTGTCTCCGGGCTgg > 2:1002428/1‑289 (MQ=255)
cATCGCGCTAATGATTGCCAGTTGGCTGATTTGGGACAGTTATCAGGACCGGGGTAATACCGTCACCATCGACTTTATGTCGGCGGATGGTATTGTTCCAGGCCGTACGCCTGTTCGTTATCAGGGCGTTGAAGTCGGAACAGTGCCGGATATCAGCCTCAGCGACGATCTTCGCAAGATTGAAGTCAAGGTCAGCATCAAGTCCGATATGAAAGACTCGCTGCGCGAAGAGACTCCGTTCTGGCTGGTGACGCCAAAAGCATCG‑TTGCCAGGTTTCTCCGGCCTgggc > 2:1044840/1‑287 (MQ=255)
cgcTAATGATTGCCAGTTGGCTGATTTGGGACAGTTATCAGGACCGGGGTAATACCGTCACCATCGACTTTATGTCGGCGGATGGTATTGTTCCAGGCCGTACGCCTGTTCGTTATCAGGGCGTTGAAGTCGGAACAGTGCAGGATATCAGCCTCAGCGACGATCTTCGTAAGATTGAAGTCAAGGTCAGCATCAAGTCCGATATGAAAGATGCGCTGCGCGAAGAGACTCAGTTCTGGCTGGTGACGCCAAAAGCATCG‑TTGGCAGGTGTCTCCGGGCTGGACGccc > 2:1270429/1‑288 (MQ=255)
gtgtGCCAGTTGGCTGATTTGGGACAGTTATCAGGACCGGGGTAATACCGTCACCATCGACTTTATGTCGGCGGATGGTATTGTTCCAGGCCGTACGCCTGTTCGTTATCAGGGCGTTGAAGTCGGAACAGTGCAGGATATCAGCCTCAGCGACGATCTTCGTAAGATTGAAGTCAAGGTCAGCATCAAGTCCGATATGAAAGATGCGCTGCGCGAAGAGACTCAGTTCTGGCTGGTGACGCCAAAAGCATCG‑TTGGCAGGTGTCTCCGGGCTGGACGCCCTCGTCGGt < 2:1425066/286‑1 (MQ=255)
gATTGCCAGTTGGCTGATTTGGGACAGTTATCAGGACCGGGGTAATACCGTCACCATCGACTTTATGTCGGCGGATGGTATTGTTCCAGGCCGTACGCCTGTTCGTTATCAGGGCGTTGAAGTCGGAACAGTGCAGGATATCAGCCTCAGCGACGATCTTCGTAAGATTGAAGTCAAGGTCAGCATCAAGTCCGATATGAAAGATGCGCTGCGCGAAGAGACTCAGTTCTGGCTGGTGACGCCAAAAGCATCG‑TTGGCAGGTGTCTCCGGGCTGGACGCCCTCGTCGGt < 1:1002428/289‑1 (MQ=255)
gATTGCCAGTTGGCTGATTTGGGACAGTTATCAGGACCGGGGTAATACCGTCACCATCGACTTTATGTCGGCGGATGGTATTGTTCCAGGCCGTACGCCTGTTCGTTATCAGGGCGTTGAAGTCGGAACAGTGCAGGATATCAGCCTCAGCGACGATCTTCGTAAGATTGAAGTCAAGGTCAGCATCAAGTCCGATATGAAAGATGCGCTGCGCGAAGAGACTCAGTTCTGGCTGGTGACGCCAAAAGCATCG‑TTGGCAGGTGTCTCCGGGCTGGACGCCCTCGTCGGt < 1:595535/289‑1 (MQ=255)
tGCCAGTTGGCTGATTTGGGACAGTTATCAGGACCGGGGTAATACCGTCACCATCGACTTTATGTCGGCGGATGGTATTGTTCCAGGCCGTACGCCTGTTCGTTATCAGGGCGTTGAAGTCGGAACAGTGCAGGATATCAGCCTCAGCGACGATCTTCGTAAGATTGAAGTCAAGGTCAGCATCAAGTCCGATATG‑AAGATGCGCTGCGCGAAGAGACTCAGTTCTGGCTGGTGACGCCAAAAGCATCG‑TTGGCAGGTGTCTCCGGGCTGGACGCCCTCGTCGGTGGGa > 2:1637611/1‑289 (MQ=255)
taGTGGGCTGGTGTGGGACCGTTGTCAGGACAGGGGTAAGACCGTCACCACCGACTTTAGGTCGGCGACTGGTATTGTTCCAGGCCGTACGCCTGTTCGGTATTAGGGCGTTGAAGACGGAACAGTGCAGGATATCAGCCTCAGCGACGATCTTCGTAAGATTGAAGTCAAGGTCAGCATTAAGTCCGAGATGAAAGATGCTCTGCGCGAAGTGACGCAGTTCTGGCTGGTGACGGCAAAAGAATCG‑TTGGCAGGTGTCTCCGGGCTGGACGCCCTCGTCGGTGGGaa < 2:329155/287‑1 (MQ=255)
cAGTTGGCTGATTTGGGACGGTTATCAGGACCGGGGTAATACCGTCACCATCGACTTTATGTCGGCGGATGGTATTGTTCCAGGCCGTACGCCTGTTCGTTATCAGGGCGTTGAAGTCGGAACAGTGCAGGATATCAGCCTCAGCGACGATCTTCGTAAGATTGAAGTCAAGGTCAGCATCAAGTCCGATATGAAAGATGCGCTGCGCGAAGAGACTCAGTTCTGGCTGGTGACGCCAAAAGCATCG‑TTGGCAGGTGTCTCCGGGCTGGACGCCCTCGTCGGTGGGaa < 1:1014940/288‑1 (MQ=255)
cAGTTGGCTGATTTGGGACAGTTATCAGGACCGGGGTAATACCGTCACCATCGACTTTATGTCGGCGGATGGTATTGTTCCAGGCCGTACGCCTGTTCGTTATCAGGGCGTTGAAGTCGGAACAGTGCAGGATATCAGCCTCAGCGACGATCTTCGTAAGATTGAAGTCAAGGTCAGCATCAAGTCCGATATGAAAGATGCGCTGCGCGAAGAGACTCAGTTCTGGCTGGTGACGCCAAAAGCATCG‑TTGGCAGGTGTCTCCGGGCTGGACGCCCTCGTCGGTGGGaa < 2:823351/288‑1 (MQ=255)
gTTGGCTGATTTGGGACAGTTATCAGGACCGGGGTAATACCGTCACCATCGACTTTATGTCGGCGGATGGTATTGTTCCAGGCCGTACGCCTGTTCGTTATCAGGGCGTTGAAGTCGGAACAGTGCAGGATATCAGCCTCAGCGACGATCTTCGTAAGATTGAAGTCAAGGTCAGCATCAAGTCCGATATGAAAGATGCGCTGCGCGAAGAGACTCAGTTCTGGCTGGTGACGCCAAAAGCATCG‑TTGGCAGGTGTCTCCGGGCTGGACGCCCTCGTCGGTGGGAACta > 1:1200232/1‑289 (MQ=255)
ggCTGGTGTGGGACAGTTATCAGGACCGGGGTAATACCGTCACCATCGACGTTATGTCGGCGGATGGTATTGTTCCAGGCCGTACGCCTGTTCGTTGTCAGGGCGTTGAAGTCGGAACAGTGCAGGATATCAGCCTCAGCGACGATCTTCGTAAGATTGAAGTCAAGGTCAGCATCAAGTCCGATATGAAAGATGCGCTGCGCGAAGAGACTCAGTTCTGGCTGGTGACGCCAAAAGCATCG‑TTGGCAGGTGTCTCCGGGCTGGACGCCCTCGTCGGTGGGAACTatat < 2:392889/289‑1 (MQ=255)
ggCTGATTTGGGACAGTTATCAGGACCGGGGTAATACCGTCACCATCGACTTTATGTCGGCGGATGGTATTGTTCCAGGCCGTACGCCTGTTCGTTATCAGGGCGTTGAAGTCGGAACAGTGCAGGATATCAGCCTCAGCGACGATCTTCGTAAGATTGAAGTCAAGGTCAGCATCAAGTCCGATATGAAAGATGCGCTGCGCGAAGAGACt > 1:1070910/1‑212 (MQ=255)
ggCTGATTTGGGACAGTTATCAGGACCGGGGTAATACCGTCACCATCGACTTTATGTCGGCGGATGGTATTGTTCCAGGCCGTACGCCTGTTCGTTATCAGGGCGTTGAAGTCGGAACAGTGCAGGATATCAGCCTCAGCGACGATCTTCGTAAGATTGAAGTCAAGGTCAGCATCAAGTCCGATATGAAAGATGCGCTGCGCGAAGAGACt < 2:1070910/212‑1 (MQ=255)
gACAGTTATCAGGACCGGGGTAATACCGTCACCATCGACTTTATGTCGGCGGATGGTATTGTTCCAGGCCGTACGCCTGTTCGTTATCAGGGCGTTGAAGTCGGAACAGTGCAGGATATCAGCCTCAGCGACGATCTTCGTAAGATTGAAGTCAAGGTCAGCATCAAGTCCGATATGAAAGATGCGCTGCGCGAAGAGACTCAGTTCTGGCTGGTGACGCCAAAAGCATCG‑TTGGCAGGTGTCTCCGGGCTGGACGCCCTCGTCGGTGGGAACTATATCGGCatgatg < 1:1476093/288‑1 (MQ=255)
ttATCAGGACCGGGGTAATACCGTCACCATCGACTTTATGTCGGCGGATGGTATTGTTCCAGGCCGTACGCCTGTTCGTTATCAGGGCGTTGAAGTCGGAACAGTGCAGGATATCAGCCTCAGCGACGATCTTCGTAAGATTGAAGTCAAGGTCAGCATCAAGTCCGATATGAAAGATGCGCTGCGCGAAGAGACTCAGTTCTGGCTGGTGACGCCAAAAGCATCG‑TTGGCAGGTGTCTCCGGGCTGGACGCCCTCGTCGGTGGGAACTATATCGGCa < 1:1578547/278‑1 (MQ=255)
aCCGGGGTAATACCGTCACCATCGACTTTATGTCGGCGGATGGTATTGTTCCAGGCCGTACGCCTGTTCGTTATCAGGGCGTTGAAGTCGGAACAGTGCAGGATATCAGCCTCAGCGACGATCTTCGTAAGATTGAAGTCAAGGTCAGCATCAAGTCCGATATGAAAGATGCGCTGCGCGAAGAGACTCAGTTCTGGCTGGTGACGCCAAAAGCATCG‑TTGGCAGGTGTCTCCGGGCTGGACGCCCTCGTCGGTGGGAACTATATCGGCATGATGCCGggtaaaggta > 1:950930/1‑288 (MQ=255)
cGGGGTAATACCGTCACCATCGACTTTATGTCGGCGGATGGTATTGTTCCAGGCCGTACGCCTGTTCGTTATCAGGGCGTTGAAGTCGGAACAGTGCAGGATATCAGCCTCAGCGACGATCTTCGTAAGCTTGAAGTCAAGGTCAGCATCCAGTCCGATATGAAAGATGCGCTGCGCGAAGAGACTCAGTTAGCGCTGGTGACGCCAAAAG‑AAGCGTTGGCAGGTGTCTCCGGGCTGGACGCAGTCGTCGGGGGGAACTATATCGGCATGAGGCGGGgtaaaggtaaag > 2:432698/1‑289 (MQ=255)
cGGGGTAATACCGTCACCATCGACTTTATGTCGGCGGATGGTATTGTTCCAGGCCGTACGCCTGTTCGTTATCAGGGCGTTGAAGTCGGAACAGTGCAGGATATCAGCCTCAGCGACGATCTTCGTAAGATTGAAGTCAAGGTCAGCATCAAGTCCGATATGAAAGATGCGCTGCGCGAAGAGACTCAGTTCTGGCTGGTGACGCCAAAAGCATCG‑TTGGCAGGTGtctc < 2:1114455/230‑1 (MQ=255)
cGGGGTAATACCGTCACCATCGACTTTATGTCGGCGGATGGTATTGTTCCAGGCCGTACGCCTGTTCGTTATCAGGGCGTTGAAGTCGGAACAGTGCAGGATATCAGCCTCAGCGACGATCTTCGTAAGATTGAAGTCAAGGTCAGCATCAAGTCCGATATGAAAGATGCGCTGCGCGAAGAGACTCAGTTCTGGCTGGTGACGCCAAAAGCATCG‑TTGGCAGGTGTCTCCGGGCTGGACGCCGTCGTCGGTGGGAACTATATCGGCATGATGCCGGgtaacggtaaag > 2:1724846/1‑289 (MQ=255)
cGGGGTAATACCGTCACCATCGACTTTATGTCGGCGGATGGTATTGTTCCAGGCCGTACGCCTGTTCGTTATCAGGGCGTTGAAGTCGGAACAGTGCAGGATATCAGCCTCAGCGACGATCTTCGTAAGATTGAAGTCAAGGTCAGCATCAAGTCCGATATGAAAGATGCGCTGCGCGAAGAGACTCAGTTCTGGCTGGTGACGCCAAAAGCATCG‑TTGGCAGGTGTCTCCGGGCTGGACGCCCTCGTCGGTGGGAACTATATCGGCATGATGCCGGgtaaaggtaaag > 1:802462/1‑289 (MQ=255)
cGGGGTAATACCGTCACCATCGACTTTATGTCGGCGGATGGTATTGTTCCAGGCCGTACGCCTGTTCGTTATCAGGGCGTTGAAGTCGGAACAGTGCAGGATATCAGCCTCAGCGACGATCTTCGTAAGATTGAAGTCAAGGTCAGCATCAAGTCCGATATGAAAGATGCGCTGCGCGAAGAGACTCAGTTCTGGCTGGTGACGCCAAAAGCATCG‑TTGGCAGGTGTCTCCGGGCTGGACGCCCTCGTCGGTGGGAACTATATCGGCATGATGCCGGgtaaaggtaaag > 2:566800/1‑289 (MQ=255)
cGGGGTAATACCGTCACCATCGACTTTATGTCGGCGGATGGTATTGTTCCAGGCCGTACGCCTGTTCGTTATCAGGGCGTTGAAGTCGGAACAGTGCAGGATATCAGCCTCAGCGACGATCTTCGTAAGATTGAAGTCAAGGTCAGCATCAAGTCCGATATGAAAGATGCGCTGCGCGAAGAGACTCAGTTCTGGCTGGTGACGCCAAAAGCATCG‑TTGGCAGGTGTCTCCGGGCTGGACGCCCTCGTCGGTGGGAACTATATCGGCATGATGCC‑ggtaaagggaaaag > 1:104024/1‑287 (MQ=255)
cGGGGTAATACCGTCACCATCGACTTTATGTCGGCGGATGGTATTGTTCCAGGCCGTACGCCTGTTCGTTATCAGGGCGTTGAAGTCGGAACAGTGCAGGATATCAGCCTCAGCGACGATCTTCGTAAGATTGAAGTCAAGGTCAGCATCAAGTCCGATATGAAAGATGCGCTGCGCGAAGAGACTCAGTTCTGGCTGGTGACGCCAAAAGCATCG‑TTGGCAGGTGTCTCCGGGCTGGACGCCCTCGTCGGTGGGAACTATATCGGCATCATGCCGgggaaaggtaact > 2:873856/1‑287 (MQ=255)
cGGGGTAATACCGTCACCATCGACTTTATGTCGGCGGATGGTATTGTTCCAGGCCGTACGCCTGTTCGTTATCAGGGCGTTGAAGTCGGAACAGTGCAGGATATCAGCCTCAGCGACGATCTTCGTAAGATTGAAGTCAAGGTCAGAATCAAGTCCGATAAGAAAGATGCGCTGCGCGAAGAGACTCAGTTCTGGCTGGTGACGACAAAAGCATCG‑GTGGCAGGTGTCTCCGGGCTGGACGCCCTAGTCGGTGGGACCTATCCCGGAAGGTTGCCGGgtaaaggtaaag > 2:747385/1‑289 (MQ=255)
gggTAATACCGTCACCATCGACTTTATGTCGGCGGATGGTATTGTTCCAGGCCGTACGCCTGTTCGTTATCAGGGCGTTGAAGTCGGAACAGTGCAGGATATCAGCCTCAGCGACGATCTTCGTAAGATTGAAGTCAAGGTCAGCATCAAGTCCGATATGAAAGATGCGCTGCGCGAAGAGACTCAGTTCTGGCTGGTGACGCCAAAAGCATCG‑TTGGCAGGTGTCTCCGGGCTGGACGCCCTCGTCGGTGGGaa > 2:257659/1‑255 (MQ=255)
gggTAATACCGTCACCATCGACTTTATGTCGGCGGATGGTATTGTTCCAGGCCGTACGCCTGTTCGTTATCAGGGCGTTGAAGTCGGAACAGTGCAGGATATCAGCCTCAGCGACGATCTTCGTAAGATTGAAGTCAAGGTCAGCATCAAGTCCGATATGAAAGATGCGCTGCGCGAAGAGACTCAGTTCTGGCTGGTGACGCCAAAAGCATCG‑TTGGCAGGTGTCTCCGGGCTGGACGCCCTCGTCGGTGGGAACTATATCGGCATGATGCCGGGTAAAGGTAAaga > 1:277263/1‑288 (MQ=255)
aTACCGTCACCATCGACTTTATGTCGGCGGATGGTATTGTTCCAGGCCGTACGCCTGTTCGTTATCAGGGCGTTGAAGTCGGAACAGTGCAGGATATCAGCCTCAGCGACGATCTTCGTAAGATTGAAGTCAAGGTCAGCATCAAGTCCGATATGAAAGATGCGCTGCGCGAAGAGACTCAGTTCTGGCTGGTGACGCCAAAAGCATCG‑TTGGCAGGTGTCTCCGTGCTGGACGCCCTCGTCGGTGGGAACTATATCGGCATGATGCCGGGTAAAGGTAAAGAGCAGGa > 2:145437/1‑289 (MQ=255)
gTCACCATCGACTTTATGTCGGCGGATGGTATTGTTCCAGGCCGTACGCCTGTTCGTTATCAGGGCGTTGAAGTCGGAACAGTGCAGGATATCAGCCTCAGCGACGATCTTCGTAAGATTGAAGTCAAGGTCAGCATCAAGTCCGATATGAAAGATGCGCTGCGCGAAGAGACTCAGTTCTGGCTGGTGACGCCAAAAGCATCG‑TTGGCAGGTGTCTCCGGGCTGGACGCCCTCGTCGGTGGGAACTATATCGGCATGATGCCGGGTAAAGGTAAAGAGCAGGATCACt > 1:67378/1‑289 (MQ=255)
tCACCATCGACTTTATGTCGGCGGATGGTATTGTTCCAGGCCGTACGCCTGTTCGTTATCAGGGCGTTGAAGTCGGaa < 1:1305678/78‑1 (MQ=255)
tCACCATCGACTTTATGTCGGCGGATGGTATTGTTCCAGGCCGTACGCCTGTTCGTTATCAGGGCGTTGAAGTCGGaa > 2:1305678/1‑78 (MQ=255)
tCACCATCGACTTTATGTCGGCGGATGGTATTGTTCCAGGCCGTACGCCTGTTCGTTATCAGGGCGTTGAAGTCGGAACAGTGCAGGATATCAGCCTCAGCGACGATCTTCGTAAGATTGAAGTCAAGGTCAGCATCAAGTCCGATATGAAAGCTGCGCTGCGCGAAGAGACTCCGTTCTGGCTGGTGACGCCAAAAGCATCG‑TTTGCCGGTGTCTCCGGGCTGGACGCCCTCGTCGGCGGGAACTATATCGGCATGATCCCGGGTAAATGCAACGAGCAGGATCACtt > 2:1674343/1‑289 (MQ=255)
tCACCATCGACTTTATGTCGGCGGATGGTATTGTTCCAGGCCGTACGCCTGTTCGTTATCAGGGCGTTGAAGTCGGAACAGTGCAGGATATCAGCCTCAGCGACGATCTTCGTAAGATTGAAGTCAAGGTCAGCATCAAGTCCGATATGAAAGATGCGCTGCGCGAAGAGACTCAGTTCTGGCTGGTGACGCCAAAAGCATCG‑TTGGCAGGTGTCTCCGGGCTGGACGCCCTCGTCGGTGGGAACTATATCGGCATGATGCCGGGTAAAGGTAAAGAGCAGGATCACtt > 2:378752/1‑289 (MQ=255)
tCACCATCGACTTTATGTCGGCGGATGGTATTGTTCCAGGCCGTACGCCTGTTCGTTATCAGGGCGTTGAAGTCGGAACAGTGCAGGATATCAGCCTCAGCGACGATCTTCGTAAGATTGAAGTCAAGGTCAGCATCAAGTCCGATATGAAAGATGCGCTGCGCGAAGAGACTCAGTTCTGGCTGGTGACGCCAAAAGCATCG‑TTGGCAGGTGTCTCCGGGCTGGACGCCCTCGTCGGTGGGAACTATATCGGCATGATGCCGGGTAAAGGTAAAGAGCAGGATCACtt > 1:638218/1‑289 (MQ=255)
tCACCATCGACTTTATGTCGGCGGATGGTATTGTTCCAGGCCGTACGCCTGTTCGTTATCAGGGCGTTGAAGTCGGAACAGTGCAGGATATCAGCCTCAGCGACGATCTTCGTAAGATTGAAGTCAAGGTCAGCATCAAGTCCGATATGAAAGATGCGCTGCGCGAAGAGACTCAGTTCTGGCTGGTGACGCCAAAAGCATCG‑TTGGCAGGTGTCTCCGGGCTGGACGCCCTCGTCGGTGGGAACTATATCGGCATGATGCCGGGTAAAGGTAAAGAGCAGGATCACtt > 1:1325346/1‑289 (MQ=255)
tCACCATCGACTTTATGTCGGCGGATGGTATTGTTCCAGGCCGTACGCCTGTTCGTTATCAGGGCGTTGAAGTCGGAACAGTGCAGGATATCAGCCTCAGCGACGATCTTCGTAAGATTGAAGTCAAGGTCAGCATCAAGTCCGATATGAAAGATGCGCTGCGCGAAGAGACTCAGTTCTGGCTGGTGACGCCAAAAGCATCG‑TTGGCAGGTGTCTCCGGGCTGGACGCCCTCGTCGGTGGGAACTATACCGGCATGATGCCGGGTAAAGGTAAAGAGCAGGATCACtt > 1:1943091/1‑289 (MQ=255)
tCACCATCGACTTTATGTCGGCGGATGGTATTGTTCCAGGCCGTACGCCTGTTCGTTATCAGGGCGTTGAAGTCGGAACAGTGCAGGATATCAGCCTCAGCGACGATCTTCGTAAGATTGAAGTCAAGGTCAGCATCAAGTCCGATATGAAAGATGAGCTGCGCGAAGAGACTCAGTTCTGGCTGGTCACGCCAAAAGCATAG‑TTGGCAGGTCTCCCCGGCCGGGCAGCACGCGTCGGTGGGCACTAGATCCGCCTGCTTCCGTgtaaagggaaaggtccggactcact > 2:1176239/1‑276 (MQ=255)
aCCATCGACTTTATGTCGGCGGATGGTATTGTTCCAGGCCGTACGCCTGTTCGTTATCAGGGCGTTGAAGTCGGAACAGTGCAGGATATCAGCCTCAGCGACGATCTTCGTAAGATTGAAGTCAAGGTCAGCATCAAGTCCGATATGAAAGATGCGCTGCGCGAAGAGACTCAGTTCTGGCTGGTGACGCCAAAAGCATCG‑TTGGCAGGTGTCTCCGGGCTGGACGCCCTCGTCGGTGGGAACTATATCGGCATGATGCCGGGTAAAGGTAAAGAGCAGGATCACTTTg > 2:1922111/1‑289 (MQ=255)
aCCATCGACTTTATGTCGGCGGATGGTATTGTTCCAGGCCGTACGCCTGTTCGTTATCAGGGCGTTGAAGTCGGAACAGTGCAGGATATCAGCCTCAGCGACGATCTTCGTAAGATTGAAGTCAAGGTCAGCATCAAGTCCGATATGAAAGATGCGCTGCGCGAAGAGACTCAGTTCTGGCTGGTGACGCCAAAAGCATCG‑TTGGCAGGTGTCTCCGGGCTGGACGCCCTCGTCGGTGGGAACTATATCGGCATGATGCCGGGTAAAGGTAAAGAGCAGGATCACTTTg > 2:922281/1‑289 (MQ=255)
aTCGACTTTATGTCGGCGGATGGTATTGTTCCAGGCCGTACGCCTGTTCGTTATCAGGGCGTTGAAGTCGGAACAGTGCAGGATATCAGCCTCAGCGACGATCTTCGTAAGATTGAAGTCAAGGTCAGCATCAAGTCCGATATGAAAGATGCGCTGCGCGAAGAGACTCAGTTCTGGCTGGTGACGCCAAAAGCATCG‑TTGGCAGGTGTCTCCGGGCTGGACGCCCTCGTCGGTGGGAACTATATCGGCATGATGCCGGGTAAAGGTAAAGAGCAGGATCACTTTGTCg < 1:1837010/289‑1 (MQ=255)
aTCGACTTTATGTCGGCGGATGGTATTGTTCCAGGCCGTACGCCTGTTCGTTATCAGGGCGTTGAAGTCGGAACAGTGCAGGATATCAGCCTCAGCGACGATCTTCGTAAGATTGAAGTCAAGGTCAGCATCAAGTCCGATATGAAAGATGCGCTGCGCGAAGAGACTCAGTTCTGGCTGGTGACGCCAAAAGCATCG‑TTGGCAGGTGTCTCCGGGCTGGACGCCCTCGTCGGTGGGAACTATATCGGCATGATGCCGGGTAAAGGTAAAGAGCAGGATCACTTTGTCg < 2:802462/289‑1 (MQ=255)
tCGACTTTATGTCGGCGGATGGTATTGTTCCAGGCCGTACGCCTGTTCGTTATCAGGGCGTTGAAGTCGGAACAGTGCAGGATATCAGCCTCAGCGACGATCTTCGTAAGATTGAAGTCAAGGTCAGCATCAAGTCCGATATGAAAGATGCGCTGCGCGAAGAGACTCAGTTCTGGCTGGTGACGCCAAAAGCATCG‑TTGGCAGGTGTCTCCGGGCTGGACGCCCTCGTCGGTGGGAACTATATCGGCATGATGCCGGGTAAAGGTAAAGAGCAGGATCACTTTGTCGc > 1:586797/1‑289 (MQ=255)
|||
ACTATTCTTGCTGTGGAATGGCTGGACAGCCGCTTACTTTGGGATGCACATGAGAGTGGAAACGCCCGCTTCGACGACTGAATAACCGCTTACTTTGGGATGCACATGAGTCAGGAAACGCCCGCTAGCACGACTGAAGCGCAGATTAAAAATAAACGCCGTATCAGTCCTTTCTGGCTGCTGCCGTTCATCGCGCTAATGATTGCCAGTTGGCTGATTTGGGACAGTTATCAGGACCGGGGTAATACCGTCACCATCGACTTTATGAGCGCGGATGGTATTGTTCCAGGCCGTACGCCTGTTCGTTATCAGGGCGTTGAAGTCGGAACAGTGCAGGATATCAGCCTCAGCGACGATCTTCGTAAGATTGAAGTCAAGGTCAGCATCAAGTCCGATATGAAAGATGCGCTGCGCGAAGAGACTCAGTTCTGGCTGGTGACGCCAAAAGCAAGC‑TTGGCAGGTGTCTCCGGGCTGGACGCCCTCGTCGGTGGGAACTATATCGGCATGATGCCGGGTAAAGGTAAAGAGCAGGATCACTTTGTCGCA > CP042583/1598124‑1598669
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
