Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A3 F210 I1 R1
|
4927 |
250.2 |
4002508 |
96.7% |
3870425 |
266.6 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP042583 |
1,580,032 |
3 bp→TCA |
intergenic (–/–) |
– / – |
–/– |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP042583 | 1,580,032 | 0 | A | T | 99.2%
| 551.6
/ NA
| 237 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (2/0); new base T (119/115); total (121/116) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.98e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 |
| * | CP042583 | 1,580,033 | 0 | G | C | 100.0%
| 551.2
/ NA
| 237 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base C (121/116); total (121/116) |
| * | CP042583 | 1,580,034 | 0 | T | A | 100.0%
| 560.6
/ NA
| 237 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base A (121/116); total (121/116) |
Only 100 of 237 total aligned reads displayed.
TTTCCTTTTACCATTAACGTTAATGGTCCGGGGGCTACGGCGCTGGCATGGCACTATCTTCCAACACAATTACCGCTGGCGGTGCTGCTAAGTTTACTGGTGGGCTACATCGCCTGGCTGGCGACCGCTTACCGAATGAGCTTTTCCCGCGAAATCAATCTGGGCCTGGCGCAACATGAGTTCGAATTGTTCTGTCAGCCTTTGCTTAATGCGCGCAGCCAGCAATGTATTGGTGTAGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTAGTCCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCATTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGAGTAGTCAGTTTCATGTTGGCATTAACGTCGCACCCAGCCATTTTCGCCGTGGTGTGCTGATAAAAGATCTCAATCAGTACTGGTTTAGCGCTCACCCGATTCAGCAACTGATCCTCGAAATCACCGAACGCGATGCCTTACTGGATGTTGATTATCGGATTGCCCGCGAGCTG > CP042583/1579753‑1580310
|||
tCCTTTTACCATTAACGTTACTGGTCCGGGGGCTACGGCGCTGGCATTGCACTATCTTCCAACACAATTACCGCTGGCGGTGCTGCTAAGTTTACTGGTGGGCTACATCGGCTGGCTGGCGACCGCTTACCGAATGAGCTTTTCCCGCGAAATCAATCTGGGCCTGGCGCAACATGAGTTCAAATTGTTCTGTCAGCCTTTGCTTAATGCGCGCAGCCAGCAATGTATTGGTGTAGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGAtgtg < 1:55001/289‑1 (MQ=255)
ttaagtttAATGGTCCGTGGGCTACTGCGCGTGCAGTTCACTATCTTCCAACACAATTACCGCTGTCTGTGTTGCTAAGTTTACGGGTGGGCTACATCGCCTGGCTGGCGACGGCTTACCGAATGAGCTTTTCCCGCGAAATCAATCTGGGCTTGGCGCAACATGAGTTCGAATTGTTCTGTCAGCCTTTGCTTAATGCGCGCAGCCAGCAATGTATTGGTGTAGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTAt < 2:686851/283‑1 (MQ=255)
ttAACGTTAATGGTCCGGGGGCTACGGCGCTGGCATGGCACTATCTTCCAACACAATTACCGCTGGCGGTGCTGCTAAGTTTACTGGTGGGCTACATCGCCTGGCTGGCGACCGCTTACCGAATGAGCTTTTCCCGCGAAATCAATCTGGGCCTGGCGCAACATGAGTTCGAATTGTTCTGTCAGCCTTTGCTTAATGCGCGCAGCCAGCAATGTATTGGTGTAGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTAt < 1:1018514/289‑1 (MQ=255)
tAACGTTAATGGTCCGGGGGCTACGGCGCTGGCATGGCACTATCTTCCAACACAATTACCGCTGGCGGTGCTGCTAAGTTTACTGGTGGGCTACATCGCCTGGCTGGCGACCGCTTACCGAATGAGCTTTTCCCGCGAAATCAATCTGGGCCTGGCGCAACATGAGTTCGAATTGTTCTGTCAGCCTTTGCTTAATGCGCGCAGCCAGCAATGTATTGGTGTAGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTAt > 2:852343/1‑288 (MQ=255)
aaCGTTAATGGTCCGGGGGCTACGGCGCTGGCATGGCACTATCTTCCAACACAATTACCGCTGGCGGTGCTGCTAAGTTTACTGGTGGGCTACATCGCCTGGCTGGCGACCGCTTACCGAATGAGCTTTTCCCGCGAAATCAATCTGGGCCTGGCGCAACATGAGTTCGAATTGTTCTGTCAGCCTTTGCTTAATGCGCGCAGCCAGCAATGTATTGGTGTAGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATcg < 2:220408/289‑1 (MQ=255)
aaCGTTAATGGTCCGGGGGCTACGGCGCTGGCATGGCACTATCTTCCAACACAATTACCGCTGGCGGTGCTGCTAAGTTTACTGGTGGGCTACATCGCCTGGCTGGCGACCGCTTACCGAATGAGCTTTTCCCGCGAAATCAATCTGGGCCTGGCGCAACATGAGTTCGAATTGTTCTGTCAGCCTTTGCTTAATGCGCGCAGCCAGCAATGTATTGGTGTAGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATc > 2:1108156/1‑288 (MQ=255)
tAATGGTCCGGGGGCTACGGCGCTGGCATGGCACTATCTTCCAACACAATTACCGCTGGCGGTGCTGCTAAGTTTACTGGTGGGCTACATCGCCTGGCTGGCGACCGCTTACCGAATGAGCTTTTCCCGCGAAATCAATCTGGGCCTGGCGCAACATGAGTTCGAATTGTTCTGTCAGCCTTTGCTTAATGCGCGCAGCCAGCAATGTATTGGTGTAGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGgaa < 1:1518780/289‑1 (MQ=255)
aaTGGTCCGGGGGCTACGGCGCTGGCATGGCACTATCTTCCAACACAATTACCGCTGGCGGTGCTGCTAAGTTTACTGGTGGGCTACATCGCCTGGCTGGCGACCGCTTACCGAATGAGCTTTTCCCGCGAAATCAATCTGGGCCTGGCGCAACATGAGTTCGAATTGTTCTGTCAGCCTTTGCTTAATGCGCGCAGCCAGCAATGTATTGGTGTAGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGgaag > 2:55123/1‑289 (MQ=255)
aaTGGTCCGGGGGCTACGGCGCTGGCATGGCACTATCTTCCAACACAATTACCGCTGGCGGTGCTGCTAAGTTTACTGGTGGGCTACATCGCCTGGCTGGCGACCGCTTACCGAATGAGCTTTTCCCGCGAAATCAATCTGGGCCTGGCGCAACATGAGTTCGAATTGTTCTGTCAGCCTTTGCTTAATGCGCGCAGCCAGCAATGTATTGGTGTAGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGgaag > 2:830815/1‑289 (MQ=255)
tCCGGGGGCTACGGCGCTGGCATGGCACTATCTTCCAACACAATTACCGCTGGCGGTGCTGCTAAGTTTACTGGTGGGCTACATCGCCTGGCTGGCGACCGCTTACCGAATGAGCTTTTCCCGCGAAATCAATCTGGGCCTGGCGCAACATGAGTTCGAATTGTTCTGTCAGCCTTTGCTTAATGCGCGCAGCCAGCAATGTATTGGTGTAGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAAca < 1:852343/288‑1 (MQ=255)
tCCGGGGGCTACGGCGCTGGCATGGCACTATCTTCCAACACAATTACCGCTGGCGGTGCTGCTAAGTTTACTGGTGGGCTACATCGCCTGGCTGGCGACCGCTTACCGAATGAGCTTTTCCCGCGAAATCAATCTGGGCCTGGCGCAACATGAGTTCGAATTGTTCTGTCAGCCTTTGCTTAATGCGCGCAGCCAGCAATGTATTGGTGTAGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAAca < 2:159653/288‑1 (MQ=255)
ccGGGGGCTACGGCGCTGGCATGGCACTATCTTCCAACACAATTACCGCTGGCGGTGCTGCTAAGTTTACTGGTGGGCTACATCGCCTGGCTGGCGACCGCTTACCGAATGAGCTTTTCCCGCGAAATCAATCTGGGCCTGGCGCAACATGAGTTCGAATTGTTCTGTCAGCCTTTGCTTAATGCGCGCAGCCAGCAATGTATTGGTGTAGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAAcatc > 1:1363069/1‑289 (MQ=255)
cGGGGGCTACGGCGCTGGCATGGCACTATCTTCCAACACAATTACCGCTGGCGGTGCTGCTAAGTTTACTGGTGGGCTACATCGCCTGGCTGGCGACCGCTTACCGAATGAGCTTTTCCCGCGAAATCAATCTGGGCCTGGCGCAACATGAGTTCGAATTGTTCTGTCAGCCTTTGCTTAATGCGCGCAGCCAGCAATGTATTGGTGTAGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAAcatca > 2:1516374/1‑289 (MQ=255)
cGGGGGCTACGGCGCTGGCATGGCACTATCTTCCAACACAATTACCGCTGGCGGTGCTGCTAAGTTTACTGGTGGGCTACATCGCCTGGCTGGCGACCGCTTACCGAATGAGCTTTTCCCGCGAAATCAATCTGGGCCTGGCGCAACATGAGTTCGAATTGTTCTGTCAGCCTTTGCTTAATGCGCGCAGCCAGCAATGTATTGGTGTAGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAAca < 2:445030/286‑1 (MQ=255)
cTACGGCGCTGGCATGGCACTATCTTCCAACACAATTACCGCTGGCGGTGCTGCTAAGTTTACTGGTGGGCTACATCGCCTGGCTGGCGACCGCTTACCGAATGAGCTTTTCCCGCAAAATCAATCTGGGCCTGGCGCAACATGAGTTCGAATTGTTCTGTCAGCCTTTGCTTAATGCGCGCAGCCAGCAATGTATTGGTGTAGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCATTTaa < 2:232417/288‑1 (MQ=255)
tACGGCGCTGGCATGGCACTATCTTCCAACACAATTACCGCTGGCGGTGCTGCTAAGTTTACTGGTGGGCTACATCGCCTGGCTGGCGACCGCTTACCGAATGAGCTTTTCCCGCGAAATCAATCTGGGCCTGGCGCAACATGAGTTCGAATTGTTCTGTCAGCCTTTGCTTAATGCGCGCAGCCAGCAATGTATTGGTGTAGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCATTTAAtt > 1:991164/1‑289 (MQ=255)
aCGGCGCTGGCATGGCACTATCTTCCAACACAATTACCGCTGGCGGTGCTGCTAAGTTTACTGGTGGGCTACATCGCCTGGCTGGCGACCGCTTACCGAATGAGCTTTTCCCGCGAAATCAATCTGGGCCTGGCGCAACATGAGTTCGAATTGTTCTGTCAGCCTTTGCTTAATGCGCGCAGCCAGCAATGTATTGGTGTAGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCATTTAATtg < 1:1925384/289‑1 (MQ=255)
tggcatggcaCTATCTTCCAACACAATTACCGCTGGCGGTGCTGCTAAGTTTACTGGTGGGCTACATCGCCTGGCTGGCGACCGCTTACCGAATGAGCTTTTCCCGCGAAATCAATCTGGGCCTGGCGCAACATGAGTTCGAATTGCTCTGTCAGCCTTTGCTTAATGCGCGCAGCCAGCAATGTATTGGTGTAGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTGTATTcc > 2:1678417/1‑256 (MQ=255)
catggcaCTATCTTCCAACACAATTACCGCTGGCGGTGCTGCTAAGTTTACTGGTGGGCTACATCGCCTGGCTGGCGACCGCTTACCGAATGAGCTTTTCCCGCGAAATCAATCTGGGCCTGGCGCAACATGAGTTCGAATTGTTCTGTCAGCCTTTGCTTAATGCGCGCAGCCAGCAATGTATTGGTGTAGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCATTTAATTGTGCCACTGa < 1:369487/288‑1 (MQ=255)
ggcaCTATCTTCCAACACAATTACCGCTGGCGGTGCTGCTAAGTTTACTGGTGGGCTACATCGCCTGGCTGGCGACCGCTTACCGAATGAGCTTTTCCCGCGAAATCAATCTGGGCCTGGCGCAACATGAGTTCGAATTGTTCTGTCAGCCTTTGCTTAATGCGCGCAGCCAGCAATGTATTGGTGTAGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCATTTAATTGTGCCACTGACCCg < 1:652950/289‑1 (MQ=255)
aTCTTCCAACACAATTACCGCTGGCGGTGCTGCTAAGTTTACTGGTGGGCTACATCGCCTGGCTGGCGACCGCTTACCGAATGAGCTTTTCCCGCGAAATCAATCTGGGCCTGGCGCAACATGAGTTCGAATTGTTCTGTCAGCCTTTGCTTAATGCGCGCAGCCAGCAATGTATTGGTGTAGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCATTTAATTGTGCCACTGACCCGCTAtgt > 2:119369/1‑289 (MQ=255)
aTCTTCCAACACAATTACCGCTGGCGGTGCTGCTAAGTTTACTGGTGGGCTACATCGCCTGGCTGGCGACCGCTTACCGAATGAGCTTTTCCCGCGAAATCAATCTGGGCCTGGCGCAACATGAGTTCGAATTGTTCTGTCAGCCTTTGCTTAATGCGCGCAGCCAGCAATGTATTGGTGTAGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCATTTAATTGTGCCACTGACCCGCTAtgt > 2:182587/1‑289 (MQ=255)
cTTCCAACACAATTACCGCTGGCGGTGCTGCTAAGTTTACTGGTGGGCTACATCGCCTGGCTGGCGACCGCTTACCGAATGAGCTTTTCCCGCGAAATCAATCTGGGCCTGGCGCAACATGAGTTCGAATTGTTCTGTCAGCCTTTGCTTAATGCGCGCAGCCAGCAATGTATTGGTGTAGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCATTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGa < 1:830815/289‑1 (MQ=255)
caATTACCGCTGGCGGTGCTGCTCAGTTTACTGGTCGGCTACATCGCCTGGCTGGCGACCGCTTACCGAATGAGCTTTTCCCGCGAAATCAATCTGGGCCTGGCGCAACATGAGTTCGAATTGTTCTGTCAGCCTTTGCCTGATTCGCGCAGCCAGCAATGTATTGGTGTAGAGATTTTGCTGCGCTGGTACAATCCGCCTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGACGAACATCATTTAATTGTGCCTGTGACCCGCTactgttgggcagaaa > 2:1938110/1‑275 (MQ=255)
caATTACCGCTGGCGGTGCTGCTAAGTTTACTGGTGGGCTACATCGCCTGGCTGGCGACCGCTTACCGAATGAGCTTTTCCCGCGAAATCAATCTGGGCCTGGCGCAACATGAGTTCGAATTGTTCTGTCAGCCTTTGCTTAATGCGCGCAGCCAGCAATGTATTGGTGTAGAGAGTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAAAATCATTTAATTGTGACACTGACCCGCTATGTGATGGCAGaa > 1:1056238/1‑288 (MQ=255)
aTTACCGCTGGCGGTGCTGCTAAGTTTACTGGTGGGCTACATCGCCTGGCTGGCGACCGCTTACCGAATGAGCTTTTCCCGCGAAATCAATCTGGGCCTGGCGCAACATGAGTTCGAATTGTTCTGTCAGCCTTTGCTTAATGCGCGCAGCCAGCAATGTATTGGTGTAGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCATTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAAcc > 1:242574/1‑289 (MQ=255)
ttACCGCTGGCGGTGCTGCTAAGTTTACTGGTGGGCTACATCGCCTGGCTGGCGACCGCTTACCGAATGAGCTTTTCCCGCGAAATCAATCTGGGCCTGGCGCAACATGAGTTCGAATTGTTCTGTCAGCCTTTGCTTAATGCGCGCAGCCAGCAATGTATTGGTGTAGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGgaagaa < 1:1387647/243‑1 (MQ=255)
ttACCGCTGGCGGTGCTGCTAAGTTTACTGGTGGGCTACATCGCCTGGCTGGCGACCGCTTACCGAATGAGCTTTTCCCGCGAAATCAATCTGGGCCTGGCGCAACATGAGTTCGAATTGTTCTGTCAGCCTTTGCTTAATGCGCGCAGCCAGCAATGTATTGGTGTAGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGgaagaa > 2:1387647/1‑243 (MQ=255)
ggCGGTGCTGCTAAGTTTACTGGTGGGCTACATCGCCTGGCTGGCGACCGCTTACCGAATGAGCTTTTCCCGCGAAATCAATCTGGGCCTGGCGCAACATGAGTTCGAATTGTTCTGTCAGCCTTTGCTTAATGCGCGCAGCCAGCAATGTATTGGTGTAGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCATTTAATTGTTCCa > 2:1486864/1‑253 (MQ=255)
ggCGGTGCTGCTAAGTTTACTGGTGGGCTACATCGCCTGGCTGGCGACCGCTTACCGAATGAGCTTTTCCCGCGAAATCAATCTGGGCCTGGCGCAACATGAGTTCGAATTGTTCTGTCAGCCTTTGCTTAATGCGCGCAGCCAGCAATGTATTGGTGTAGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCATTTAATTGTGCCa < 1:1486864/253‑1 (MQ=255)
ggCGGTGCTGCTAAGTTTACTGGTGGGCTACATCGCCTGGCTGGCGACCGCTTACCGAATGAGCTTTTCCCGCGAAATCAATCTGGGCCTGGCGCAACATGAGTTCGAATTGTTCTGTCAGCCTTTGCTTAATGCGCGCAGCCAGCAATGTATTGGTGTAGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCATTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCa > 1:1650144/1‑288 (MQ=255)
aaGTTTACAGGGGGGCTGCATCGCCTGGCTGGCGACGGCGTACCGGATGCGCGTATCCGGCGAGATCAATCTGGGCTGGGCGCAACATGAGTTCGGATTGTTCTGTCAGCCTTGGCCTAATGCGCGCAGCCAGCAATGTATTGGTGTAGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCATTTAATTGTGCCACTGACTCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTATc < 2:1082982/289‑1 (MQ=255)
tttcTGGTGGGCTACATCGCCTGGCTGGCGACCGCTTACCGAATGGGCTTTTCCCGCGAAATCAATCTGGGCCTGGGGCAACATGAGTTCGAATTGTTCTGTCAGCCTTTGCTTAATGCGCGCAGCCAGCAATGTATTGGTGTAGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCATTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTccc < 1:1752841/284‑1 (MQ=255)
aCTGGTGGGCTACATCGCCTGGCTGGCGACCGCTTACCGAATGAGCTTTTCCCGCGAAATCAATCTGGGCCTGGCGCAACATGAGTTCGAATTGTTCTGTCAGCCTTTGCTTAATGCGCGCAGCCAGCAATGTATTGGTGTAGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCATTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGtt < 2:1979342/280‑1 (MQ=255)
cTGGTGGGCTACATCGCCTGGCTGGCGACCGCTTACCGAATGAGCTTTTCCCGCGAAATCAATCTGGGCCTGGCGCAACATGAGTTCGAATTGTTCTGTCAGCCTTTGCTTAATGCGCGCAGCCAGCAATGTATTGGTGTAGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCATTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGa < 1:1121125/289‑1 (MQ=255)
tggtggGCTACATCGCCTGGCTGGCGACCGCTTACCGAATGAGCTTTTCCCGCGAAATCAATCTGGGCCTGGCGCAACATGAGTTCGAATTGTTCTGTCAGCCTTTGCTTAATGCGCGCAGCCAGCAATGTATTGGTGTAGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCATTTAATTGTGCCACTGTCCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGag < 2:1322553/289‑1 (MQ=255)
ggCTACATCGCCTGGCTGGCGACCGCTTACCGAATGGGCTTTTCCCGCGAAATCAATCTGGGCCTGGCGCAACATGAGTTCGAATTGTTCTGTCAGCCTTTGCTTAATGCGCGCAGCCAGCAATGTATTGGTGTAGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCATTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGagtagt < 2:3505/288‑1 (MQ=255)
acgggcacgggtgggcGACCGCTTCACGAATGCACTTTTCCCGCGAAATCAATCTGGGCCTGGCGCAACATGAGTTGGAATTGTTCTGTCAGCCTTTGCGTAATGCGCGCAGCCAGCAATGTATTGGTGTAGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCATTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGAGTAGTCAGtt < 2:1303072/276‑1 (MQ=255)
cATCGCCTGGCTGGCGACCGCTTACCGAATGAGCTTTTCCCGCGAAATCAATCTGGGCCTGGCGCAACATGAGTTCGAATTGTTCTGTCAGCCTTTGCTTAATGCGCGCAGCCAGCAATGTATTGGTGTAGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCATTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGAGTAGTCAGtt > 1:59471/1‑288 (MQ=255)
ccTGGCTGGCGACCGCTTACCGAATGAGCTTTTCCCGCGAAATCAATCTGGGCCTGGCGCAACATGAGTTCGAATTGTTCTGTCAGCCTTTGCTTAATGCGCGCAGCCAGCAATGTATTGGTGTAGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCATTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGagtagt < 1:6710/278‑1 (MQ=255)
ccTGGCTGGCGACCGCTTACCGAATGAGCTTTTCCCGCGAAATCAATCTGGGCCTGGCGCAACATGAGTTCGAATTGTTCTGTCAGCCTTTGCTTAATGCGCGCAGCCAGCAATGTATTGGTGTAGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCATTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGAGTAGTCAGTTTCATGt > 1:493811/1‑289 (MQ=255)
tggcGACCGCTTACCGAATGAGCTTTTCCCGCGAAATCAATCTGGGCCTGGCGCAACATGAGTTCGAATTGTTCTGTCAGCCTTTGCTTAATGCGCGCAGCCAGCAATGTATTGGTGTAGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCATTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGAGTAGTCAGTTTCATGTTGGCAt < 1:1255384/289‑1 (MQ=255)
gACCGCTTACCGAATGAGCTTTTCCCGCGAAATCAATCTGGGCCTGGCGCAACATGAGTTCGAATTGTTCTGTCAGCCTTTGCTTAATGCGCGCAGCCAGCAATGTATTGGTGTAGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCATTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGAGTAGTCAGTTTCATGTTGGCATTaa > 2:784750/1‑288 (MQ=255)
cGCTTACCGAATGAGCTTTTCCCGCGAAATCAATCTGGGCCTGGCGCAACATGAGTTCGAATTGTTCTGTCAGCCTTTGCTTAATGCGCGCAGCCAGCAATGTATTGGTGTAGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCATTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGAGTAGTCAGTTTCATGTTGGCATTAACGTc > 1:1886943/1‑289 (MQ=255)
cTTACCGAATGAGCTTTTCCCGCGAAATCAATCTGGGCCTGGCGCAACATGAGTTCGAATTGTTCTGTCAGCCTTTGCTTAATGCGCGCAGCCAGCAATGTATTGGTGTAGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCATTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGCTTTCCCGATGCGTAGTCAGTTTCATTTTGGCATTAACGTctc > 2:1150404/1‑287 (MQ=255)
tGAGCTTTTCCCGCGAAATCAATCTGGGCCTGGCGCAACATGAGTTCGAATTGTTCTGTCAGCCTTTGCTTAATGCGCGCAGCCAGCAATGTATTGGTGTAGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCATTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGAGTAGTCAGTTTCATGTTGGCATTAACGTCGCACCCAGCCa > 1:1789859/1‑289 (MQ=255)
gAGCTTTTCCCGCGAAATCAATCTGGGCCTGGCGCAACATGAGTTCGAATTGTTCTGTCAGCCTTTGCTTAATGCGCGCAGCCAGCAATGTATTGGTGTAGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCATTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGAGTAGTCAGTTTCATGTTGGCATTAACGTCGCACCCAGCCAt < 1:1760420/289‑1 (MQ=255)
tttCCCGCGAAATCAATCTGGGCCTGGCGCAACATGAGTTCGAATTGTTCTGTCAGCCTTTGCTTAATGCGCGCAGCCAGCAATGTATTGGTGTAGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCATTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGAGTAGTCAGTTTCATGTTGGCATTAACGTCGCACCCAGCCATTTTCg < 1:516780/289‑1 (MQ=255)
aatcaatcTGGGCCTGGCGCAACATGAGTTCGAATTGTTCTGTCAGCCTTTGCTTAATGCGCGCAGCCAGCAATGTATTGGTGTAGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCATTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATTAGTAGTCAGTTTCATGTTGGCATTAACGTCGCACCCAGCCATTTTCGCCGTGGtgtg < 2:972398/289‑1 (MQ=255)
aatcaatcTGGGCCTGGCGCAACATGAGTTCGAATTGTTCTGTCAGCCTTTGCTTAATGCGCGCAGCCAGCAATGTATTGGTGTAGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCATTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGAGTAGTCAGTTTCATGTTGGCATTAACGTCGCACCCAGCCATTTTCGCCGTGGtgtg < 2:644219/289‑1 (MQ=255)
ccTGGCGCAACATGAGTTCGAATTGTTCTGTCAGCCTTTGCTTAATGCGCGCAGCCAGCAATGTATTGGTGTAGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCATTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGAGTAGTCAGTTTCATGTTGGCATTAACGTCGCACCCAGCCATTTTCGCCGTGGTGTGCTGATAAAAGa > 1:1899898/1‑288 (MQ=255)
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gcgcAACATGAGTTCGAATTGTTCTGTCAGCCTTTGCTTAATGCGCGCAGCCAGCAATGTATTGGTGTAGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCATTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGAGTAGTCAGTTTCATGTTGGCATTAACGTCGCACCCAGCCATTTTCGcc < 1:1714421/265‑1 (MQ=255)
gcgcAACATGAGTTCGAATTGTTCTGTCAGCCTTTGCTTAATGCGCGCAGCCAGCAATGTATTGGTGTAGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCATTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGAGTAGTCAGTTTCATGTTGGCATTAACGTCGCACCCAGCCATTTTCGcc > 2:1714421/1‑265 (MQ=255)
gcAACATGAGTTCGAATTGTTCTGTCAGCCTTTGCTTAATGCGCGCAGCCAGCAATGTATTGGTGTAGGGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCATTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGAGTAGTCAGTTTCATGTTGGCATTAACGTCGCACCCAGCCATTTTCGCCGTGGTGTGCTGATAAAAGATCTCAAt < 2:398501/289‑1 (MQ=255)
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cATGAGTTCGAATTGTTCTGTCAGCCTTTGCTTAATGCGCGCAGCCAGCAATGTATTGGTGTAGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCATTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGAGTAGTCAGTTTCATGTTGGCATTAACGTCGCACCCAGCCATTTTCGCCGTGGTGTGCTGATAAAAGATCTCAATCAGt < 1:1960142/289‑1 (MQ=255)
aTGAGTTCGAATTGTTCTGTCTGCCTTTGCTTAATGCGCGCAGCCAGCAATGTATTGGTGTAGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCATTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGAGTAGTCAGTTTCATGTTGGCATTAACGTCGCACCCAGCCATTTTCGCCGTGGTGTGCTGATAAAAGATCTCAATCAGTa < 2:1852285/289‑1 (MQ=255)
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cTTTGCTTAATGCGCGCAGCCAGCAATGTATTGGTGTAGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCATTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGAGTAGTCAGTTTCATGTTGGCATTAACGTCGCACCCAGCCATTTTCGCCGTGGTGTGCTGATAAAAGATCTCAATCAGTACTGGTTTAGCGCTCACCCGATTCa > 2:1355987/1‑289 (MQ=255)
tGCTTAATGCGCGCAGCCAGCAATGTATTGGTGTAGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCATTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGAGTAGTCAGTTTCATGTTGGCATTAACGTCGCACCCAGCCATTTTCGCCGTGGTGTGCTGATAAAAGATCTCAATCAGTACTGGTTTAGCGCTCACCCGATgcagca > 1:228030/1‑289 (MQ=255)
tGCTTAATGCGCGCAGCCAGCAATGTATTGGTGTAGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCATTTAAATGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGAGTAGTCAGTTTCATGTTGGCATTAACGTCGCACCCAGCCATTTTCg < 1:630660/229‑1 (MQ=255)
aTGCGCGCAGCCAGCAATGTATTGGTGTAGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCATTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGAGTAGTCAGTTTCATGTTGGCATTAACGTCGCACCCAGCCATTTTCGCCGTGGTGTGCTGATAAAAGATCTCAATCAGTACTGGTTTAGCGCTCACCCGATTCAGCAACTGa > 1:603692/1‑288 (MQ=255)
aTGCGCGCAGCCAGCAATGTATTGGTGTAGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCATTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGAGTAGTCAGTTTCATGTTGGCATTAACGTCGCACCCAGCCATTTTCGCCGTGGTGTGCTGATAAAAGATCTCAATCAGTACTGGTTTAGCGCTCACCCGATTCAGCAACTGa > 2:1046888/1‑288 (MQ=255)
cgcAGCCAGCAATGTATTGGTGTAGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCATTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGAGTAGTCAGTTTCATGTTGGCATTAACGTCGCACCCAGCCATTTTCGCCGTGGTGTGCTGATAAAAGATCTCAATCAGTACTGGTTTAGCGCTCACCCGATTCAGCAACTGATCCTCg > 1:1682410/1‑289 (MQ=255)
cgcAGCCAGCAATGTATTGGTGTAGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCATTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGAGTAGTCAGTTTCATGTTGGCATTAACGTCGCACCCAGCCATTTTCGCCGTGGTGTGCTGATAAAAGATCTCAATCAGTACTGGTTTAGCGCTCACCCGATTCAGCAACTGATCCTCg > 1:899323/1‑289 (MQ=255)
gcAGCCAGCAATGTATTGGTGTAGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCATTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGAGTAGTCAGTTTCATGTTGGCATTAACGTCGCACCCAGCCATTTTCGCCGTGGTGTGCTGATAAAAGATCTCAATCAGTACTGGTTTAGCGCTCACCCGATTCAGCAACTGATCCTCGa > 1:350145/1‑289 (MQ=255)
gcAGCCAGCAATGTATTGGTGTAGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCATTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGAGTAGTCAGTTTCATGTTGGCATTAACGTCGCACCCAGCCATTTTCGCCGTGGTGTGCTGATAAAAGATCTCAATCAGTACTGGTTTAGCGCTCACCCGATTCAGCAACTGATCCTCGa > 2:1563958/1‑289 (MQ=255)
gTATTGGTGTAGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCATTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGAGTAGTCAGTTTCATGTTGGCATTAACGTCGCACCCAGCCATTTTCGCCGTGGTGTGCTGATAAAAGATCTCAATCAGTACTGGTTTAGCGCTCACCCGATTCAGCAACTGATCCTCGAAATCACCGAAcg < 1:784750/289‑1 (MQ=255)
aTTGGTTTAGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCATTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGAGTAGTCAGTTTCATGTTGGCATTAACGTCGCACCCAGCCATTTTCGCCGTGGTGTGCTGATAAAAGATCTCAATCAGTACTGGTTTAGCGCTCACCCGATTCAGCAACTGATCCTCGAAATCACCGAAcgcg < 1:1670200/289‑1 (MQ=255)
aTTGGTGTAGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCATTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGAGTAGTCAGTTTCATGTTGGCATTAACGTCGCACCCAGCCATTTTCGCCGTGGTGTGCTGATAAAAGa < 1:702090/224‑1 (MQ=255)
aTTGGTGTAGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTAAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCATTTAATTGTGCCGCTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGAGTAGTCAGTTTCATGTTGGCATTAACGTCGCACCCAGCCATTTTCGCCGTGGTGTGCTGATAAAAGATCTCAATCAGTACTGGTTTAGCGCTCACCCGATTCAGCAACTGATCCTCGAAATCACCGAAcgcg < 2:1202520/289‑1 (MQ=255)
tGGTGTAGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCATTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGAGTAGTCAGTTTCATGTTGGCATTAACGTCGCACCCAGCCATTTTCGCCGTGGTGTGCTGATAAAAGATCTCAATCAGTACTGGTTTAGCGCTCACCCGATTCAGCAACTGATCCTCGAAATCACCGAACGCGAt > 1:1892098/1‑289 (MQ=255)
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gtgtAGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCATTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGAGTAGTCAGTTTCATGTTGGCATTAACGTCGCACCCAGCCATTTTCGCCGTGGTGTGCTGATAAAAGATCTCAATCAGTACTGGttt < 2:88653/239‑1 (MQ=255)
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gtgtAGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCATTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGAGTAGTCAGTTTCATGTTGGCATTAACGTCGCACCCAGCCATTTTCGCCGTGGTGTGCTGATAAAAGATCTCAATCAGTACTGGTTTAGCGCTCACCCGATTCAGCAACTGATCCTCGAAATCACCGAACGCGATg > 1:1175333/1‑288 (MQ=255)
gtAGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCATTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGAGTAGTCAGTTTCATGTTGGCATTAACGTCGCACCCAGCCATTTTCGCCGTGGTGTGCTGATAAAAGATCTCAATCAGTACTGGTTTAGCGCTCACCCGATTCAGCAACTGATCCTCGAAATCACCGAACGCGATGcc < 1:1853141/288‑1 (MQ=255)
tAGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCATTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGAGTAGTCAGTTTCATGTTGGCATTAACGTCGCACCCAGCCATTTTCGCCGTGGTGTGCTGATAAAAGATCTCAATCAGTACTGGTTTAGCGCTCACCCGATTCAGCAACTGATCCTCGAAATCACCGAAcgcg > 2:727251/1‑282 (MQ=255)
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tAGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCATTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGAGTAGTCAGTTTCATGTTGGCATTAACGTCGCACCCAGCCATTTTCGCCGTGGTGTGCTGATAAAAGATCTCAATCAGTACTGGTTTAGCGCTCACCCGATTCAGCAACTGATCCTCGAAATCACCGAACGCGATGCCtt > 1:142496/1‑289 (MQ=255)
tAGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCATTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGAGTAGTCAGTTTCATGTTGGCATTAACGTCGCACCCAGCCATTTTCGCCGTGGTGTGCTGATAAAAGATCTCAATCAGTACTGGTTTAGCGCTCACCCGATTCAGCAACTGATCCTCGAAATCACCGAACGCGATGCCtt > 1:1536626/1‑289 (MQ=255)
gagaTTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCATTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGAGTAGTCAGTTTCATGTTGGCATTAACGTCGCACCCAGCCATTTTCGCCGTGGTGTGCTGATAAAAGATCTCa < 1:458810/220‑1 (MQ=255)
gagaTTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCATTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGAGTAGTCAGTTTCATGTTGGCATTAACGTCGCACCCAGCCATTTTCGCCGTGGTGTGCTGATAAAAGATCTCAAt < 2:1889018/222‑1 (MQ=255)
gagaTTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCATTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGAGTAGTCAGTTTCATGTTGGCATTAACGTCGCACCCAGCCATTTTCGCCGTGGTGTGCTGATAAAAGATCTCAAt > 1:1457681/1‑222 (MQ=255)
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ttGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCATTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATTTTTTCCCGATGAGTAGTCAGTTTCATGTTGGCATTAACGTCGAACCCAGCCATTTTCGCCGTGGTGTGCTGATAAAAGATCTCAATCAGTACTGGTTTAGCGCTCACGCGCTTCAGCAAGATATCCTCGAAAACACAGAACGCGATGCCTAACTGGagg > 2:1575075/1‑287 (MQ=255)
ttGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCATTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGAGTAGTCAGTTTCATGTTGGCATTAACGTCGCACCCAGCCATTTTCGCCGTGGTGTGCTGATAAAAGATCTCAAt > 1:826825/1‑216 (MQ=255)
ttGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCATTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGAGTAGTCAGTTTCATGTTGGCATTAACGTCGCACCCAGCCATTTTCGCCGTGGTGTGCTGATAAAAGATCTCAATCAGTACTGGTTTAGCGCTCACCCGATTCAGCAACTGATCCTCGAAATCACCGAACGCGATGCCTTACTGGATg > 1:19864/1‑289 (MQ=255)
ttGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTGCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAAca < 1:561353/71‑1 (MQ=255)
gctgcGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCATTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGAGTAGTCAGTTTCATGTTGGCATTAACGTCGCACCCAGCCATTTTCGCCGTGGTGTGCTGATAAAAGATCTCAATCAGTACTGGTTTAGCGCTCACCCGATTCAGCAACTGATCCTCGAAATCACCGAACGCGATGCCTTACTGGATGtt < 2:145790/289‑1 (MQ=255)
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tCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCATTTGATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGAGTAGTCAGTTTCATGTTGGCATTAACGTCGCACCCAGCCATTTTCGCCGTGGTGTGCTGATAAAAGATCTCAATCAGTACTGGTTTAGCGCTCACCCGATTCAGCAACTGATCCTCGAAATCACCGAACGCGATGCCTTACt < 2:476949/267‑1 (MQ=255)
tCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCATTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGAGTAGTCAGTTTCATGTTGGCATTAACGTCGCACCCAGCCATTTTCGCCGTGGTGTGCTGATAAAAGATCTCAATCAGTACTGGTTTAGCGCTCACCCGATTCAGCAACTGATCCTCGAAATCACCGAACGCGATGCCTTACTGGATGTTGATTATCGGATTGc > 1:953250/1‑288 (MQ=255)
ccGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCATTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGAGTAGTCAGTTTCATGTTGGCATTAACGTCGCACCCAGCCATTTTCGCCGTGGTGTGCTGATAAAAGATCTCAATCAGTACTGGTTTAGCGCTCACCCGATTCAGCAACTGATCCTCGAAATCACCGAACGCGATGCCTTACTGGATGTTGATTATCGGATTGccc < 2:1789859/289‑1 (MQ=255)
ggCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCATTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGAGTAGTCAGTTTCATGTTGGCATTAACGTCGCACCCAGCCATTTTCGCCGTGGTGTGCTGATAAAAGATCTCAATCAGTACTGGTTTAGCGCTCACCCGATTCAGCAACTGATCCTCGAAATCACCGAACGCGATGCCTTACTGGAGGTTGAtt > 2:502508/1‑268 (MQ=255)
gCTGGATTTCACCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCATTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGAGTAGTCAGTTTCATGTTGGCATTAACGTCGCACCCAGCCATTTTCGCCGTGGTGTGCTGATAAAAGATCTCAATCAGTACTGGTTTAGCGCTCACCCGATTCAGCAACTGATCCTCGAAATCACCGAACGCGATGCCTTACTGGATGTTGATTATCGGATTGCCCGCGAGCTg < 2:603692/287‑1 (MQ=255)
|||
TTTCCTTTTACCATTAACGTTAATGGTCCGGGGGCTACGGCGCTGGCATGGCACTATCTTCCAACACAATTACCGCTGGCGGTGCTGCTAAGTTTACTGGTGGGCTACATCGCCTGGCTGGCGACCGCTTACCGAATGAGCTTTTCCCGCGAAATCAATCTGGGCCTGGCGCAACATGAGTTCGAATTGTTCTGTCAGCCTTTGCTTAATGCGCGCAGCCAGCAATGTATTGGTGTAGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTAGTCCGGATGTGTTTATTCCTATCGCGGAAGAACATCATTTAATTGTGCCACTGACCCGCTATGTGATGGCAGAAACCATTCGTCAGCGCCATGTTTTCCCGATGAGTAGTCAGTTTCATGTTGGCATTAACGTCGCACCCAGCCATTTTCGCCGTGGTGTGCTGATAAAAGATCTCAATCAGTACTGGTTTAGCGCTCACCCGATTCAGCAACTGATCCTCGAAATCACCGAACGCGATGCCTTACTGGATGTTGATTATCGGATTGCCCGCGAGCTG > CP042583/1579753‑1580310
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
