Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A3 F210 I1 R1
|
4927 |
250.2 |
4002508 |
96.7% |
3870425 |
266.6 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP042583 |
1,644,172 |
T→C |
intergenic (–/–) |
– / – |
–/– |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP042583 | 1,644,172 | 0 | T | C | 99.2%
| 622.7
/ NA
| 263 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (131/130); minor base A (1/1); total (132/131) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 263 total aligned reads displayed.
GCGCCGATGCTTGAAGATTTACGCAGCGTGATGCATGAAGAAACGCAAAGCTTTCTTGATAAGTTAATTCAGGATGCGGGGTATCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCTACGGTGAGTTAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTAGCCGAGCATCCTGCAGCGCGAAAAGAGTTATTGCCAGTAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCTTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAAGCACTCCTGCCAGTGGTTAATATCGTTTTTCACGATAACGTCCAGCATTTCTGCATGACGGGAAATACGTTCCGCCAGGCTCATAGTCAATGCACGATCCAGCGCAGCTGCAACTTCGTCACGATCGTAGGGGTTAACAATTAACGCGCTCGTTAACTCGTTTGCCGCTCCCGCAAATTGGCTAAGAACAAGAACGC > CP042583/1643887‑1644455
|
gcgcCGATGCTTGAAGATTTACGCAGCGTGATGCATGAAGAAACGCAAAGCTTTCTTGATAAGTTAATTCAGGATGCGGGGTATCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCTACGGTGAGTTAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTa > 2:1918061/1‑288 (MQ=255)
gcCGATGCTTGAAGATTTACGCAGCGTGATGCATGAAGAAACGCAAAGCTTTCTTGATAAGTTAATTCAGGATGCGGGGTATCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCTACGGTGAGTTAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGc < 1:111185/289‑1 (MQ=255)
gcCGATGCTTGAAGATTTACGCAGCGTGATGCATGAAGAAACGCAAAGCTTTCTTGATAAGTTAATTCAGGATGCGGGGTATCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCTACGGTGAGTTAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGc < 1:303012/289‑1 (MQ=255)
gCAGCGTGATGCATGAAGAAACGCAAAGCTTTCTTGATAAGTTAATTCAGGATGCGGGGTATCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCTACGGTGAGTTAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCaa < 2:152748/289‑1 (MQ=255)
cGTGATGCATGAAGAAACGCAAAGCTTTCTTGATAAGTTAATTCAGGATGCGGGGTATCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCTACGGTGAGTTAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCACGCTTTGGAAAGGTAGCAACttt > 2:1756974/1‑289 (MQ=255)
cGTGATGCATGAAGAAACGCAAAGCTTTCTTGATAAGTTAATTCAGGATGCGGGGTATCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCTACGGTGAGTTAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACttt > 1:377770/1‑289 (MQ=255)
gaagaaACGCAAAGCTTTCTTGATAAGTTAATTCAGGATGCGGGGTATCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCTACGGTGAGTTAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCgct > 2:1396670/1‑287 (MQ=255)
agaaACGCAAAGCTTTCTTGATAAGTTAATTCAGGATGCGGGGTATCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCTACGGTGAGTTAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGctgctg > 2:300224/1‑289 (MQ=255)
aaagaCGCAAAGCTTTCTTGGTAAGTTAGTTCAGGTGGGGGGGTATCCCGGTGACACGACGTTTATTGACTAGGGTAAGTTAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCAGAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCGTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGctgctg < 2:699485/285‑1 (MQ=255)
aCGCAAAGCTTTCTTGATAAGTTAATTCAGGATGCGGGGTATCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCTACGGTGAGTTAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCtt > 1:506312/1‑289 (MQ=255)
cGCAAAGCTTTCTTGATAAGTTAATTCAGGATGCGGGGTATCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCTACGGTGAGTTAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGaa < 1:1407740/259‑1 (MQ=255)
cGCAAAGCTTTCTTGATAAGTTAATTCAGGATGCGGGGTATCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCTACGGTGAGTTAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCtt > 1:1607079/1‑288 (MQ=255)
aGCTTTCTTGATAAGTTAATTCAGGATGCGGGGTATCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCTACGGTGAGTTAAGCGAACATATTCTTGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCcgcg < 2:1817858/289‑1 (MQ=255)
cttaGTTCATTACGGATGCTGGGTATCCCGTTGATAATACGATTATTGCCAACGGTGATTGAAGCGAAACTATTAGTGAAGTATGTCACAAGCATCATGTCGATTTGGTGTTTTGCGGTAATCACAATCACAGTGTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGaa < 2:1572261/286‑1 (MQ=255)
gATGCGGGGTATCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCTACGGTGAGTTAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATcg > 1:229047/1‑247 (MQ=255)
gATGCGGGGTATCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCTACGGTGAGTTAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATcg < 2:229047/247‑1 (MQ=255)
cGGGGTATCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCTACGGTGAGTTAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTc > 1:95500/1‑287 (MQ=255)
ggggTATCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCTACGGTGAGTTAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGc < 1:478341/288‑1 (MQ=255)
aTCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCTACGGTGAGTTAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGa > 1:1042619/1‑289 (MQ=255)
tCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCTACGGTGAGTTAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGaa < 1:1018117/289‑1 (MQ=255)
cccGTTGACAAGACGTTTATTGCCTACGGTGAGTTAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCt < 1:1461223/282‑1 (MQ=255)
cccGTTGACAAGACGTTTATTGCCTACGGTGAGTTAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGaa > 1:1913055/1‑288 (MQ=255)
cccGTTGACAAGACGTTTATTGCCTACGGTGAGTTAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAAg < 1:289944/289‑1 (MQ=255)
cccGTTGACAAGACGTTTATTGCCTACGGTGAGTTAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCCCTTCGCGGAACTAt > 2:567915/1‑267 (MQ=255)
ttGACAAGACGTTTATTGCCTACGGTGAGTTAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTcg < 1:1710103/254‑1 (MQ=255)
ttGACAAGACGTTTATTGCCTACGGTGAGTTAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTcg > 2:1710103/1‑254 (MQ=255)
tGACAAGACGTTTATTGCCTACGGTGAGTTAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGt < 2:441061/273‑1 (MQ=255)
tGACAAGACGTTTATTGCCTACGGTGAGTTAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGt > 1:441061/1‑273 (MQ=255)
aCAAGACGTTTATTGCCTACGGTGAGTTAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGACCTATCTGCTTTAGGTCGCTACTGAAGCACt > 2:594026/1‑286 (MQ=255)
gACGTTTATTGCCTACGGTGAGTTAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGTCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCCGCTTTATGTTGCTAATGAAGCCCTCCTGcaa > 2:1676016/1‑287 (MQ=255)
gACGTTTATTGCCTACGGTGAGTTAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAAGCACTCCTGCCa > 1:1958565/1‑289 (MQ=255)
cGTTTATTGCCTACGGTGAGTTAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAACAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAAGCACTCCTGCCa < 2:894431/287‑1 (MQ=255)
taaggTGAGTTAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAAGCACTCCTGCCAGTGGTTAATATCg < 1:1091703/286‑1 (MQ=255)
tACGGTGAGTTAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTa < 1:677845/259‑1 (MQ=255)
tACGGTGAGTTAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTa > 2:677845/1‑259 (MQ=255)
tACGGTGAGTTAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTAAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAAGCACTCCTGCCAGTGGTTAATATCg > 1:1873056/1‑289 (MQ=255)
ggTGATTTAAGCGAACATATTCTTGCAGTATGTCCCACGCATCATTTCGATTTTGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAAGCa < 2:1272512/264‑1 (MQ=255)
ggTGAGTTAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTTCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTTGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAACCACGCCGTCCCTGGGTTAAAATGGttt > 2:912569/1‑289 (MQ=255)
gTTAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAAGCACTCCTGCCAGTGGTTAATATCGTTTTTCAc > 1:254538/1‑289 (MQ=255)
gTTAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAAGCACTCCTGCCAGTGGTTAATATCGTTTTTCAc > 1:1377636/1‑289 (MQ=255)
ttAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTCG‑CGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCcgcg < 2:1434150/219‑1 (MQ=255)
ttAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTCG‑CGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCcgcg > 1:1434150/1‑219 (MQ=255)
tAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCaa < 1:115403/193‑1 (MQ=255)
tAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCaa > 2:115403/1‑193 (MQ=255)
aGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAAGCACTCCTGCCAGTGGTTAATATCGTTTTTCACGATa < 2:506312/289‑1 (MQ=255)
aCATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAAGCACTCCTGCCAGTGGTTAATATTGTTTTTCACGATAACGt > 1:579776/1‑288 (MQ=255)
aCATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAAGCACTCCTGCCAGTGGTTAATATCGTTTTTCACGATAACGt > 2:1980119/1‑288 (MQ=255)
tatttcggAAGTATTTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAAGCACTCCTGCCAGTGGTTAATATCGTTTTTCACGATAACGTCCAg < 2:805450/283‑1 (MQ=255)
gAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGt > 1:566540/1‑227 (MQ=255)
gAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAAGCACTCCTGCCAGTGGt < 1:1249432/254‑1 (MQ=255)
aGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAAGCACTCCTGCCAGTGGTTAATATCGTTTTTCACGATAACGTCCAGCATTTCTGc > 2:76801/1‑289 (MQ=255)
aGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAAGCACTCCTGCCAGTGGTTAATATCGTTTTTCACGATAACGTCCAGCATTTCTGc > 1:539361/1‑289 (MQ=255)
tATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAAGCACTCCTGCCAGTGGTTAATATCGTTTTTCACGATAACGTCCAGCATTTCTGCAt > 2:145796/1‑289 (MQ=255)
aTGTCACAAGCATCATTTCGGTTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTGTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAAGCACTCCTGCCAGTGGTTAATATCGTTTTTCACGATAACGTCCAGCATTTCTGCATg < 1:1519913/289‑1 (MQ=255)
tGTCACGAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAAGCACTCCTGCCa < 2:582546/243‑1 (MQ=255)
tGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGCAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCAGCGCCTCGCGGAACTATCTGCTTTTGGTCGCGCATGAAGCACTCCTGTCAGTGGTTAACATCGTGTTGCACGATAAAGTTACGCATTTCTCCATg > 2:1470533/1‑288 (MQ=255)
tGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCcgcg > 2:1230814/1‑196 (MQ=255)
tGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGaa < 2:118461/231‑1 (MQ=255)
tGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGaa > 1:118461/1‑231 (MQ=255)
tGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAAGCACTCCTGCCAGTGGTTAATATCGTTTTTCACGATAACGTCCAGCATTTCTGCATg > 2:1611933/1‑288 (MQ=255)
tGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAAGCACTCCTGCCAGTGGTTAATATCGTTTTTCACGATAACGTCCAGCATTTCTGCATg > 1:1322696/1‑288 (MQ=255)
aGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAAGCACTCCTGCCAGTGGTTAATATCGTTTTTCACGATAACGTCCAGCATTTCTGCATGACGGGaaa < 1:1496852/289‑1 (MQ=255)
atcatTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAAGCACTCCTGCCAGTGGTTAATATCGTTTTTCACGATAACGTCCAGCATTTCTGCATGACGGGAAATAc > 1:418065/1‑289 (MQ=255)
tcatTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAAGCACTCCTGCCAGTGGTTAATATCGTTTTTCACGATAACGTCCAGCATTTCTGCATGACGGGAAATACg > 1:588725/1‑289 (MQ=255)
catTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAAGCACTCCTGCCAGTGGTTAATATCGTTTTTCACGATAACGTCCAGCATTTCTGCATGACGGGAAATACGt > 2:1642827/1‑289 (MQ=255)
aTTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAAGCACTCCTGCCAGTGGTTAATATCGTTTTTCACGATAACGTCCAGCATTTCTGCAt < 1:705901/268‑1 (MQ=255)
tttGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAAGCACTCCTGCCAGTGGTTAATATCGTTTTTCACGATAACGTCCAGCATTTCTGCATGACGGGAAATACGTTCCGCCa < 2:1605635/288‑1 (MQ=255)
gATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAAGCACTCCTGCCAGTGGTTAATATCGTTTTTCACGATAACGTCCAGCATTTCTGCATGACGGGAAATACGTTCCGCCAgcgacat < 2:1958565/289‑7 (MQ=255)
ttGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAAGCACTCCTGCCAGTGGTTAATATCGTTTTTCACGATAACGTCCAGCATTTCTGCATGACGGGAAATACGTTCCGCCAGCGACATAGt < 1:1224425/289‑1 (MQ=255)
tGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAAGCACTCCTGCCAGTGGTTAATATCGTTTTTCACGATAACGTCCAGCATTTCTGCATGACGGGAAATACGTTCCGCCAGCGACATAGTc > 1:868564/1‑289 (MQ=255)
gCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAAGCACTCCTGCCAGTGGTTAATATCGTTTTTCACGATAACGTCCAGCATTTCTGCATGACGGGAAATACGTTCCGCCAGCGACATAGTCa < 1:1355090/289‑1 (MQ=255)
aatcacaatcacAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAAGCACTCCTGCCAGTGGTTAATATCGTTTTTCACGATAACGTCCAGCATTTCTGCATGACGGGAAATACGTTCCGCCAGCGACATAGTCAATGCa < 2:1487145/289‑1 (MQ=255)
gTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAAGCACTCCTGCCAGTGGTTAATATCGTTTTTCACGATAACGTCCAGCATTTCTGCATGACGGGAAATACGTTCCGCCAGCGACATAGTCAATGCACGATCCAGCGCa > 2:532176/1‑288 (MQ=255)
tcttttcgcGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAAGCACTCCTGCCa > 2:426789/9‑191 (MQ=255)
tcttttcgcGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAAGCACTCCTGCCa < 1:426789/183‑1 (MQ=255)
tcttttcgcGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAAGCACTCCTGCCAGTGGTTAATATCGTTTTTCACGATAACGTCCAGCATTTCTGCATGACGGGAAATACGTTCCGCCAGCGACATAGTCAATGCACGATCCAGCGCAGCt > 2:400474/9‑288 (MQ=255)
cGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAAGCACTCCTGCCAGTGGTTAATATCGTTTTTCACGATAACGTCCAGCATTTCTGCATGACGGGAAATACGTTCCGCCAGCGACATAGTCAATGCACGATCCAGCGCAGCTGCAACTTCg > 1:1854813/1‑289 (MQ=255)
gAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGACTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAAGCACTCCTGCCAGTGGTTAATATCGTTTTTCACGATAACGTCCAGCATTTCTGCATGACGGGAAATACGTTCCGCCAGCGACATAGTCAATGCACGATCCAGCGCAGCTGCAACTTCGt < 1:76801/289‑1 (MQ=255)
aTCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAAGCACTCCTGCCAGTGGTTAATATCGTTTTTCACGATAACGTCCAGCATTTCTGCATGACGGGAAATACGTTCCGCCAGCGACATAGTCAATGCACGATCCAGCGCAGCTGCAACTTCGTCAc < 2:377770/288‑1 (MQ=255)
ctcggcgAAAAGGGTTATTGCCTCAAGTGGGTTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAAGCACTCCTGCCAGTGGTTAATATCGTTTTTCACGATAACGTCCAGCATTTCTGCATGACGGGAAATACGTTCCGCCAGCGACATAGTCAATGCACGATCCAGCGCAGCTGCAACTTCGTCACGATCGTa < 2:1854813/285‑1 (MQ=255)
tcggcgAAAAGAGTTATTGCCTTAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAAGCACTCCTGCCAGTGGTTAATATCGTTTTTCACGATAACGTCCAGCATTTCTGCATGACGGGAAATACGTTCCGCCAGCGACATAGTCAATGCACGATCCAGCGCAGCTGCAACTTCGTCACGATCGTa < 1:983544/285‑1 (MQ=255)
tcggcgAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTAAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAAGCACTCCTGCCAGTGGTTAATATCGTTTTTCACGATAACGTCCAGCATTTCTGCATGACGGGAAATACGTTCCGCCAGCGACATAGTCAATGCACGATCCAGCGCAGCTGCAACTTCGTCACGATCGTa < 2:1873056/285‑1 (MQ=255)
ggcgAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAAGCACTCCTGCCAGTGGTTAata > 1:78403/2‑179 (MQ=255)
cgAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAAGCACTCCTGCCAGTGGTTAATATCGTTTTTCACGATAACGTCCAGCATTTCTGCATGACGGGAAATACGTTCCGCCAGCGACATAGt > 2:958443/1‑242 (MQ=255)
cgAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAAGCACTCCTGCCAGTGGTTAATATCGTTTTTCACGATAACGTCCAGCATTTCTGCATGACGGGAAATACGTTCCGCCAGCGACATAGTCAATGCACGATCCAGCGCAGCTGCAACTTCGTCACGATCGTAGGGGt > 1:1789144/1‑289 (MQ=255)
gcgatgatttATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCGACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAAGCACTCCTGCCAGTGGTTAATATCGTTTTTCACGATAACGTCCAGCATTTCTGCATGACGGGAAATACGTTCCGCCAGCCCCATAGTAAATGCCCTAACCCGCCCAGCTGCAACGTCGTCACGCACGCACGGGtt > 2:730284/9‑289 (MQ=255)
aaaaTAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAAGCACTCCTGCCAGTGGTTAATATCGTTTTTCACGATAACGTCCAGCATTTCTGCATGACGGGAAATACGTTCCGCCAGCGACATAGTCAATGCACGATCCAGCGCAGCTGCAACTTCGTCACGATCGTAGGGGTTa < 2:1770839/289‑1 (MQ=255)
agagTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAAGCACTCCTGCCAGTGGTTAATATCGTTTTTCACGATAACGTCCAGCATTTCTGCATGACGGGAAATACGTTCCGCCAGCGACATAGTCAATGCACGATCCAGCGCAGCTGCAACTTCGTCACGATCGTAGGGGTTAACa > 1:194569/1‑289 (MQ=255)
aGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAAGCACTCCTGCCAGTGGTTAATATCGTTTTTCACGATAACGTCCAGCATTTCTGCATGACGGGAAATACGTTCCGCCAGCGACATAGTCAATGCACGATCCAGCGCAGCTGCAACTTCGTCACGATCGTAGGGGTTAACAATTAACGCCGACGTTAAc < 2:1377636/288‑1 (MQ=255)
gTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAAGCACTCCTGCCAGTGGTTAATATCGTTTTTCACGATAACGTCCAGCATTTCTGCATGACGGGAAATACGTTCCGCCAGCGACATAGTCAATGCACGATCCAGCGCAGCTGCAACTTCGTCACGATCGTAGGGGTTAACAATTAACGCCGACGTTAACTCg > 2:1309114/1‑289 (MQ=255)
gTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAAGCACTCCTGCCAGTGGTTAATATCGTTTTTCACGATAACGTCCAGCATTTCTGCATGACGGGAAATACGTTCCGCCAGCGACATAGTCAATGCACGATCCAGCGCAGCTGCAACTTCGTCACGATCGTAGGGGTTAACAATTAACGCCGACGTTAACTCg > 1:1842837/1‑289 (MQ=255)
gATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAAGCACTCCTGCCAGTGGTTAATATCGTTTTTCACGATAACGTCCAGCATTTCTGCATGACGGGAAATACGTTCCGCCAgcgacat < 1:1613836/210‑7 (MQ=255)
tgtgCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTACCCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAAGCACTCCTGCCAGTGGTTAATATCGTTTTTCACGATAACGTCCAGCATTTCTGCATGACGGGAAATACGTTCCGCCAGCGACATAGTCAATGCACGATCCAGCGCAGCTGCAACTTCGTCACGATCGTAGGGGTTAACAATTAACGCCGACGTTAACTCGTTTGc < 1:1680007/289‑1 (MQ=255)
tgtgCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAAGCACTCCTGCCAGTGGTTAATATCGTTTTTCACGATAACGTCCAGCATTTCTGCATGACGGGAAATACGTTCCGCCAGCGACATAGTCAATGCACGATCCAGCGCAGCTGCAACTTCGTCACGATCGTAGGGGTTAACAATTAAcgccgacgtt < 2:605896/278‑8 (MQ=255)
tgtgCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAAGCACTCCTGCCAGTGGTTAATATCGTTTTTCACGATAACGTCCAGCATTTCTGCATGACGGGAAATACGTTCCGCCAGCGACATAGTCAATGCACGATCCAGCGCAGCTGCAACTTCGTCACGATCGTAGGGGTTAACAATTAAcgccgacgtt > 1:605896/1‑271 (MQ=255)
gTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAAGCACTCCTGCCAGTGGTTAATATCGTTTTTCACGATAACGTCCAGCATTTCTGCATGACGGGAAATACGTTCCGCCAGCGACATAGTCAATGCACGATCCAGCGCAGCTGCAACTTCGTCACGATCGTAGGGGTTACAAATTAACGCCGACGTTAACTCGTTTCCCGccc > 2:1028561/1‑286 (MQ=255)
tAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAAGCACTCCTGCCAGTGGTTAATATCGTTTTTCACGATAACGTCCAGCATTTCTGCATGACGGGAAATACGTTCCGCCAGCGACATAGTCAATGCACGATCCAGCGCAGCTGCAACTTCGTCACGATCGTAGGGGTTAACAATTAACGCCGACGTTAACTCGTTTGCCGCTCCCg < 2:486053/289‑1 (MQ=255)
tACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAAGCACTCCTGCCAGTGGTTAATATCGTTTTTCACGATAACGTCCAGCATTTCTGCATGACGGGAAATACGTTCCGCCAGCGACATAGTCAATGCACGATCCAGCGCAGCTGCAACTTCGTCACGATCGTAGGGGTTAACAATTAACGCCGACGTTAACTCGTTTGCCGCTCCCGCAAATTgcga < 1:1984654/289‑4 (MQ=255)
aTTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAAGCACTCCTGCCAGTGGTTAATATCGTTTTTCACGATAACGTCCAGCATTTCTGCATGACGGGAAATACGTTCCGCCAGCGACATAGTCAATGCACGATCCAGCGCAGCTGCAACTTCGTCACGATCGTAGGGGTTAACAATTAACGCCGACGTTAACTCGTTTGCCGCTCCCGCAAATTGCGAaagaacaa > 2:1660505/1‑289 (MQ=255)
ccGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAAGCACTCCTGCCAGTGGTTAATATCGTTTTTCACGATAACGTCCAGCATTTCTGCATGACGGGAAATACGTTCCGCCAGTGACATAGTCAATGCACGATCCAGCGCAGCTGCAACTTCGTCACGATCGTAGGGGTTAACAATTAACGCCGACGTTAACTCGTTTGCCGCTCCCGCAAATTGCGAaagaacaagaac > 2:245175/1‑288 (MQ=255)
|
GCGCCGATGCTTGAAGATTTACGCAGCGTGATGCATGAAGAAACGCAAAGCTTTCTTGATAAGTTAATTCAGGATGCGGGGTATCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCTACGGTGAGTTAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTAGCCGAGCATCCTGCAGCGCGAAAAGAGTTATTGCCAGTAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCTTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAAGCACTCCTGCCAGTGGTTAATATCGTTTTTCACGATAACGTCCAGCATTTCTGCATGACGGGAAATACGTTCCGCCAGGCTCATAGTCAATGCACGATCCAGCGCAGCTGCAACTTCGTCACGATCGTAGGGGTTAACAATTAACGCGCTCGTTAACTCGTTTGCCGCTCCCGCAAATTGGCTAAGAACAAGAACGC > CP042583/1643887‑1644455
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
