Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A6 F210 I1 R1
|
4928 |
340.1 |
5480506 |
96.9% |
5310610 |
252.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP042583 |
1,643,059 |
3 bp→TCA |
intergenic (–/–) |
– / – |
–/– |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP042583 | 1,643,059 | 0 | A | T | 99.7%
| 829.4
/ NA
| 343 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base T (168/174); minor base C (1/0); total (169/174) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.93e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
| * | CP042583 | 1,643,060 | 0 | G | C | 99.7%
| 823.1
/ NA
| 343 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base C (168/174); minor base A (1/0); total (169/174) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.93e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
| * | CP042583 | 1,643,061 | 0 | T | A | 100.0%
| 832.7
/ NA
| 343 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base A (169/174); total (169/174) |
Only 100 of 343 total aligned reads displayed.
TACGGTTATAGTAAACGACCATGACATTAGTGCCATCAAAGATTGTTGGCAAAAAAATAGTGATGATGATACTGACGTTAACGTGATCAAAAGTTGCCTGCGACAAGAATACAATCTCGTCGATGCGCAATTAAATAAAGCCTATGGTGAAGCTTATCGTTATATAGAACAAGTGCCACGCACAGGTGTAAAAAAACCTGATACCGAACAACTTAACTTGCTTAAAAAAAGTCAGCGAGCCTGGCTGGATTTTAGGGA‑CAAAGAATGTGAATTAATCCTTAGTAATGAGGACGTTCAGGATTTAAGTGACCCTTATTCTGAAAGTGAATGGCTCAGTTGTATGATCATACAGACCAATACGCGAACTCGCCAGTTGCAGCTATACCGT‑AACTCTGAAGATTTTTATCCAAGCCCTTTGACAAGAGGATAATTCACATCTTTTTGGCATGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCACTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAAC > CP042583/1642779‑1643340
|||
tataGTAAACGACCATGACATTTCAGCCATCAAAGATTGTTGGCAAAAAAATTCAGATGATGATACTGACGTTAACGTGATCAAATCATGCCTGCGACAAGAATACAATCTCGTCGATGCGCAATTAAATAAAGCCTATGGTGAAGCTTATCGTTATATAGAACAAGTGCCACGCACAGGTGTAAAAAAACCTGATGCCGAACAACTTAACTTGCTTAAAAAATCACAGCGAGCCTGGCTGGATTTTAGGGA‑CAAAGAATGTGAATTAATCCTTTCAAATGAGGACGtt < 1:772688/289‑1 (MQ=255)
aaaCGACCATGACATTTCAGCCATCAAAGATTGTTGGCAAAAAAATTCAGATGATGATACTGACGTTAATGTGATCAAATCATGCCTGCGACAAGAATACAATCTCGTCGATGCGCAATTAAATAAAGCCTATGGTGAAGCTTATCGTTATATAGAACAAGTGCCACGCACAGGTGTAAAAAAACCTGATACCGAACAACTTAACTTGCTTAAAAAATCACAGCGAGCCTGGCTGGATTTTAGGGA‑CAAAGAATGTGAATTAATCCTTTCAAATGAGGACGTTCAGGAt < 1:1375073/289‑1 (MQ=255)
ccATGACATTTCAGCCATCAAAGATTGTTGGCAAAAAAATTCAGATGATGATACTGACGTTAACGTGATCAAATCATGCCTGCGACAAGAATACAATCTCGTCGATGCGCAATTAAATAAAGCCTATGGTGAAGCTTATCGTTATATAGAACAAGTGCCACGCACAGGTGTAAAAAAACCTGATACCGAACAACTTAACTTGCTTAAAAAATCACAGCGAGCCTGGCTGGATTTTAGGGA‑CAAAGAATGTGAATTAATCCTTTCAAATGAGGACGTTCAGGATTTAAGt > 2:1219766/1‑289 (MQ=255)
caaTGACATTTCAGCCATAAAAGATTGTTGGCAAAAAAAGTCACAAGATGATACGGACGTTAAGGTGATCAAATCATGCCTGCGACAAGAATACAATCTCGTCGATGCGCAATTAAATAAAGCCTAAGGTGAAGCTTATCGTTATATAGAACAAGTGTCACGCACAGGTGTAAAAAAACCTGATACCGAACAACTTAACTTGCTTAAAAAATCACAGCGAGCCTGGCTGGATTTTAGGGA‑CAAAGAATGTGAATTAATCCTTTCAAATGAGGACGTTCAGGATTTAAGt < 2:717204/287‑1 (MQ=255)
ttcagCCATCAAAGATTGTTGGCAAAAAAATTCAGATGATGATACTGACGTTAACGTGATCAAATCATGCCTGCGACAAGAATACAATCTCGTCGATGCGCAATTAAATAAAGCCTATGGTGAAGCTTATCGTTATATAGAACAAGTGCCACGCACAGGTGTAAAAAAACCTGATACCGAACAACTTAACTTGCTTAAAAAATCACAGCGAGCCTGGCTGGATTTTAGGGA‑CAAAGAATGTGAATTAATCCTTTCAAATGAGGACGTTCAGGa > 2:1779739/5‑273 (MQ=255)
ttcagCCATCAAAGATTGTTGGCAAAAAAATTCAGATGATGATACTGACGTTAACGTGATCAAATCATGCCTGCGACAAGAATACAATCTCGTCGATGCGCAATTAAATAAAGCCTATGGTGAAGCTTATCGTTATATAGAACAAGTGCCACGCACAGGTGTAAAAAAACCTGATACCGAACAACTTAACTTGCTTAAAAAATCACAGCGAGCCTGGCTGGATTTTAGGGA‑CAAAGAATGTGAATTAATCCTTTCAAATGAGGACGTTCAGGa < 1:1779739/269‑1 (MQ=255)
tcagCCATCAAAGATTGTTGGCAAAAAAATTCAGATGATGATACTGACGTTAACGTGATCAAATCATGCCTGCGACAAGAATACAATCTCGTCGATGCGCAATTAAATAAAGCCTATGGTGAAGCTTATCGTTATATAGAACAAGTGCCACGCACAGGTGTAAAAAAACCTGATACCGAACAACTTAACTTGCTTAAAAAATCACAGCGAGCCTGGCTGGATTTTAGGGA‑CAAAGAATGTGAATTAATCCTTTCAAATGAGGACGTTCAGGATTTAAGTGACCCTTAtt < 1:2710275/286‑1 (MQ=255)
tcagCCATCAAAGATTGTTGGCAAAAAAATTCAGATGATGATACTGACGTTAACGTGATCAAATCATGCCTGCGACAAGAATACAATCTCGTCGATGCGCAATTAAATAAAGCCTATGGTGAAGCTTATCGTTATATAGAACAAGTGCCACGCACAGGTGTAAAAAAACCTGATACCGAACAACTTAACTTGCTTAAAAAATCACAGCGAGCCTGGCTGGATTTTAGGGA‑CAAAGAATGTGAATTAATCCTTTCAAATGAGGACGTTCAGGATTTAAGTGACCCTTAtt < 1:1590240/286‑1 (MQ=255)
gcagCCATCAAAGATTGTTGGCAAACAAATTCAGATGATGATACAGACGTTAACGTGATCAAATCATGCCTGCGACAAGAATACAATCTCGTCGATGCGCAATTAAATAAAGCCTATGGTGAAGCTTATCGTTATATAGAACAAGTGCCACGAACAGGTGTAAAAAAACCTGATACCGAACAACTTAACTTGCTTAAAAAATCACAGCGAGCCTGACTGGATTTTAGGGA‑CAAAGAATGTGAATTAATCCTTTCAAATGAGGACGTTCAGGATTTAAGTGACCCTTAtt < 2:1660504/286‑1 (MQ=255)
cagCCATCAAAGATTGTTGGCAAAAAAATTCAGATGATGATACTGACGTTAACGTGATCAAATCATGCCTGCGACAAGAATACAATCTCGTCGATGCGCAATTAAATAAAGCCTATGGTGAAGCTTATCGTTATATAGAACAAGTGCCACGCACAGGTGTAAAAAAACCTGATACCGAACAACTTAACTTGCTTAAAAAATCACAGCGAGCCTGGCTGGATTTTAGGGA‑CAAAGAATGTGAATTAATCCTTTCAAATGAGGACGTTCAGGATTTAAGTGACCCTTAt > 1:876276/3‑287 (MQ=255)
aTCAAAGATTGTTGGCAAAAAAATTCAGATGATGATACTGACGTTAACGTGATCAAATCATGCCTGCGACAAGAATACAATCTCGTCGATGCGCAATTAAATAAAGCCTATGGTGAAGCTTATCGTTATATAGAACAAGTGCCACGCACAGGTGTAAAAAAACCTGATACCGAACAACTTAACTTGCTTAAAAAATCACAGCGAGCCTGGCTGGATTTTAGGGA‑CAAAGAATGTGAATTAATCCTTTCAAATGAGGACGTTCAGGATTTAAGTGACCCTTATTCTGaat < 2:119580/289‑2 (MQ=255)
aGATTGTTGGCAAAAAAATTCAGATGATGATACTGACGTTAACGTGATCAAATCATGCCTGCGACAAGAATACAATCTCGTCGATGCGCAATTAAATAAAGCCTATGGTGAAGCTTATCGTTATATAGAACAAGTGCCACGCACAGGTGTAAAAAAACCTGATACCGAACAACTTAACTTGCTTAAAAAATCACAGCGAGCCTGGCTGGATTTTAGGGA‑CAAAGAATGTGAATTAATCCTTTCAAATGAGGACGTTCAGGATTTAAGTGACCCTTATTCTGaatcagaa < 1:2629853/289‑7 (MQ=255)
gttgGCAAAAAAATTCAGATGATGATACTGACGTTAACGTGATCAAATCATGCCTGCGACAAGAATACAATCTCGTCGATGCGCAATTAAATAAAGCCTATGGTGAAGCTTATCGTTATATAGAACAAGTGCCACGCACAGGTGTAAAAAAACCTGATACCGAACAACTTAACTTGCTTAAAAAATCACAGCGAGCCTGGCTGGATTTTAGGGA‑CAAAGAATGTGAATTAATCCTTTCAAATGAGGACGTTCAGGATTTAAGTGACCCTTATTCTGAATCAGAATGGCt < 1:1056375/289‑1 (MQ=255)
gttgGCAAAAAAATTCAGATGATGATACTGACGTTAACGTGATCAAATCATGCCTGCGACAAGAATACAATCTCGTCGATGCGCAATTAAATAAAGCCTATGGTGAAGCTTATCGTTATATAGAACAAGTGCCACGCACAGGTGTAAAAAAACCTGATACCGAACAACTTAACTTGCTTAAAAAATCACAGCGAGCCTGGCTGGATTTTAGGGA‑CAAAGAATGTGAATTAATCCTTTCAAATGAGGACGTTCAGGATTTAAGTGACCCTTATTCTGAATCAGAATGGCt < 1:1219766/289‑1 (MQ=255)
gttgGCAAAAAAATTCAGATGATGATACTGACGTTAACGTGATCAAATCATGCCTGCGACAAGAATACAATCTCGTCGATGCGCAATTAAATAAAGCCTATGGTGAAGCTTATCGTTATATAGAACAAGTGCCACGCACAGGTGTAAAAAAACCTGATACCGAACAACTTAACTTGCTTAAAAAATCACAGCGAGCCTGGCTGGATTTTAGGGA‑CAAAGAATGTGAATTAATCCTTTCAAATGAGGACGTTCAGGATTTAAGTGACCCTTATTCTGAATCAGAATGGCt < 1:815974/289‑1 (MQ=255)
tgGCAAAAAAATTCAGATGATGATACTGACGTTAACGTGATCAAATCATGCCTGCGACAAGAATACAATCTCGTCGATGCGCAATTAAATAAAGCCTATGGTGAAGCTTATCGTTATATAGAACAAGTGCCACGCACAGGTGTAAAAAAACCTGATACCGAACAACTTAACTTGCTTAAAAAATCACAGCGAGCCTGGCTGGATTTTAGGGA‑CAAAGAATGTGAATTAATCCTTTCAAATGAGGACGTTCAGGATTTAAGTGACCCTTATTCTGAATCAGAATGGCTct < 2:2330903/289‑2 (MQ=255)
tgGCAAAAAAATTCAGATGATGATACTGACGTTAACGTGATCAAATCATGCCTGCGACAAGAATACAATCTCGTCGATGCGCAATTAAATAAAGCCTATGGTGAAGCTTATCGTTATATAGAACAAGTGCCACGCACAGGTGTAAAAAAACCTGATACCGAACAACTTAACTTGCTTAAAAAATCACAGCGAGCCTGGCTGGATTTTAGGGA‑CAAAGAATGTGAATTAATCCTTTCAAATGAGGACGTTCAGGATTTAAGTGACCCTTATTCTGAATCAGAATGGCTc < 1:499810/288‑1 (MQ=255)
aaaaaaaTTCAGATGATGATACTGACGTTAACGTGATCAAATCATGCCTGCGACAAGAATACAATCTCGTCGATGCGCAATTAAATAAAGCCTATGGTGAAGCTTATCGTTATATAGAACAAGTGCCACGCACAGGTGTAAAAAAACCTGATACCGAACAACTTAACTTGCTTAAAAAATCACAGCGAGCCTGGCTGGATTTTAGGGA‑CAAAGAATGTGAATTAATCCTTTCAAATGAGGACGTTCAGGATTTAAGTGACCCTTATTCTGAATCAGAATGGCTctcatg < 1:1327764/289‑6 (MQ=255)
aaaaaaaTTCAGATGATGATACTGACGTTAACGTGATCAAATCATGCCTGCGACAAGAATACAATCTCGTCGATGCGCAATTAAATAAAGCCTATGGTGAAGCTTATCGTTATATAGAACAAGTGCCACGCACAGGTGTAAAAAAACCTGATACCGAACAACTTAACTTGCTTAAAAAATCACAGCGAGCCTGGCTGGATTTTAGGGA‑CAAAGAATGTGAATTAATCCTTTCAAATGAGGACGTTCAGGATTTAAGTGACCCTTATTCTGAATCAGAATGGCTctcatg < 1:2458762/289‑6 (MQ=255)
aaaaaaaTTCAGATGATGATACTGACGTTAACGTGATCAAATCATGCCTGCGACAAGAATACAATCTCGTCGATGCGCAATTAAATAAAGCCTATGGTGAAGCTTATCGTTATATAGAACAAGTGCCACGCACAGGTGTAAAAAAACCTGATACCGAACAACTTAACTTGCGTAAAAAATCACAGCGAGCCTGGCTGGATTTTAGGGA‑CAAAGAATGTGAATTAATCCTTTCAAATGAGGACGTTCAGGATTTAAGTGACCCTTATTCTGAATCAGAATGGCTctcatg < 2:471497/289‑6 (MQ=255)
cagatgatgatACTGACGTTAACGTGATCAAATCATGCCTGCGACAAGAATACAATCTCGTCGATGCGCAATTAAATAAAGCCTATGGTGAAGCTTATCGTTATATAGAACAAGTGCCACGCACAGGTGTAAAAAAACCTGATACCGAACAACTTAACTTGCTTAAAAAATCACAGCGAGCCTGGCTGGATTTTAGGGA‑CAAAGAATGTGAATTAATCCTTTCAAATGAGGACGTTCAGGATTTAAGTGACCCTTATTCTGAATCAGAATGGCTCTCATGTATGATCAt < 2:156198/287‑1 (MQ=255)
tgatgatACTGACGTTAACGTGATCAAGTCATGCCTGCGACAAGAATACAATCTCGTCGATGCGCAATTAAATAAAGCCTATGGTGAAGCTTATCGTTATATAGAACAAGTGCCACGCACAGGTGTAAAAAAACCTGATACCGAACAACTTAACTTGCTTAAAAAATCACAGCGAGCCTGGCTGGATTTTAGGGA‑CAAAGAATGTGAATTAATCCTTTCAAATGAGGACGTTCAGGATTTAAGTGACCCTTATTCTGAATCAGAATGGCTCTCATGTATGATCAt < 1:1200291/285‑1 (MQ=255)
gatACTGACGTTAACGTGATCAAATCATGCCTGCGACAAGAATACAATCTCGTCGATGCGCAATTAAATAAAGCCTATGGTGAAGCTTATCGTTATATAGAACAAGTGCCACGCACAGGTGTAAAAAAACCTGATACCGAACAACTTAACTTGCTTAAAAAATCACAGCGAGCCTGGCTGGATTTTAGGGA‑CAAAGAATGTGAATTAATCCTTTCAAATGAGGACGTTCAGGATTTAAGTGACCCTTATTCTGAATCAGAATGGCTCTCATGTATGATCATACAGACCa > 1:330375/1‑289 (MQ=255)
gTTAACGTGATCAAATCATGCCTGCGACAAGAATACAATCTCGTCGATGCGCAATTAAATAAAGCCTATGGTGAAGCTTATCGTTATATAGAACAAGTGCCACGCACAGGTGTAAAAAAACCTGATACCGAACAACTTAACTTGCTTAAAAAATCACAGCGAGCCTGGCTGGATTTTAGGGA‑CAAAGAATGTGAATTAATCCTTTCAAATGAGGACGTTCAGGATTTAAGTGACCCTTATTCTGAATCAGAATGGCTctcatg < 1:72154/263‑6 (MQ=255)
aaCGTGATCAAATCATGCCTGCGACAAGAATACAATCTCGTCGATGCGCAATTAAATAAAGCCTATGGTGAAGCTTATCGTTATATAGAACAAGTGCCACGCACAGGTGTAAAAAAACCTGATACCGAACAACTTAACTTGCTTAAAAAATCACAGCGAGCCTGGCTGGATTTTAGGGA‑CAAAGAATGTGAATTAATCCTTTCAAATGAGGACGTTCAGGATTTAAGTGACCCTTATTCTGAATCAGAATgg > 2:1681445/1‑252 (MQ=255)
aaCGTGATCAAATCATGCCTGCGACAAGAATACAATCTCGTCGATGCGCAATTAAATAAAGCCTATGGTGAAGCTTATCGTTATATAGAACAAGTGCCACGCACAGGTGTAAAAAAACCTGATACCGAACAACTTAACTTGCTTAAAAAATCACAGCGAGCCTGGCTGGATTTTAGGGA‑CAAAGAATGTGAATTAATCCTTTCAAATGAGGACGTTCAGGATTTAAGTGACCCTTATTCTGAATCAGAATgg < 1:1681445/252‑1 (MQ=255)
aaCGTGATCAAATCATGCCTGCGACAAGAATACAATCTCGTCGATGCGCAATTAAATAAAGCCTATGGTGAAGCTTATCGTTATATAGAACAAGTGCCACGCACAGGTGTAAAAAAACCTGATACCGAACAACTTAACTTGCTTAAAAAATCACAGCGAGCCTGGCTGGATTTTAGGGA‑CAAAGAATGTGAATTAATCCTTTCAAATGAGGACGTTCAGGATTTAAGTGACCCTTATTCTGAATCAGAATGGCTctcatg > 2:1613017/1‑255 (MQ=255)
gATCAAATCATGCCTGCGACAAGAATACAATCTCGTCGATGCGCAATTAAATAAAGCCTATGGTGAAGCTTATCGTTATATAGAACAAGTGCCACGCACAGGTGTAAAAAAACCTGATACCGAACAACTTAACTTGCTTAAAAAATCACAGCGAGCCTGGCTGGATTTTAGGGA‑CAAAGAATGTGAATTAATCCTTTCAAATGAGGACGTTCAGGATTTACGTGACCCTTATTCTGAATCAGAATGGCTCTCAAGTATGATCATAAAGACAAATACGCAAACTCGCCAg > 1:959472/1‑289 (MQ=255)
atcaaatcatGCCTGCGACAAGAATACAATCTCGTCGATGCGCAATTAAATAAAGCCTATGGTGAAGCTTATCGTTATATAGAACAAGTGCCACGCACAGGTGTAAAAAAACCTGATACCGAACAACTTAACTTGCTTAAAAAATCACAGCGAGCCTGGCTGGATTTTAGGGA‑CAAAGAATGTGAATTAATCCTTTCAAATGAGGACGTTCAGGATTTAAGTGACCCTTATTCTGAATCAGAATGGCTCTCATGTATGATCATACAGACCAATACGCGAACTCGCCAGt > 1:481993/10‑289 (MQ=255)
atcaaatcatGCCTGCGACAAGAATACAATCTCGTCGATGCGAAATTAAATAAAGCCTATGGTGAAGCTTATCGTTATATAGAACAAGTGCCACGCACAGGTGTAAAAAAACCTGATACCGAACAACTTAACTTGCTTAAAAAATCACAGCGAGCCTGGCTGGATTTTAGGGA‑CAAAGAATGTGAATTAATCCTTTCAAATGAGGACGTTCAGGATTTAAGTGACCCTTATTCTGAATCAGAATGGCTCTCATGTATGATCATACAGACCAATACGCGAACTCGCCAGt < 2:1454134/280‑1 (MQ=255)
tcaaatcatGCCTGCGACAAGAATACAATCTCGTCGATGCGCAATTAAATAAAGCCTATGGTGAAGCTTATCGTTATATAGAACAAGTGCCACGCACAGGTGTAAAAAAACCTGATACCGAACAACTTAACTTGCTTAAAAAATCACAGCGAGCCTGGCTGGATTTTAGGGA‑CAAAGAATGTGAATTAATCCTTTCAAATGAGGACGTTCAGGATTTAAGTGACCCTTATTCTGaat > 1:2508486/9‑236 (MQ=255)
tcaaatcatGCCTGCGACAAGAATACAATCTCGTCGATGCGCAATTAAATAAAGCCTATGGTGAAGCTTATCGTTATATAGAACAAGTGCCACGCACAGGTGTAAAAAAACCTGATACCGAACAACTTAACTTGCTTAAAAAATCACAGCGAGCCTGGCTGGATTTTAGGGA‑CAAAGAATGTGAATTAATCCTTTCAAATGAGGACGTTCAGGATTTAAGTGACCCTTATTCTGAATCAGAATGGCTCTCATGTATGATCATACAGACCAATACGCGAACTCg < 2:1361046/275‑1 (MQ=255)
tcaaatcatGCCTGCGACAAGAATACAATCTCGTCGATGCGCAATTAAATAAAGCCTATGGTGAAGCTTATCGTTATATAGAACAAGTGCCACGCACAGGTGTAAAAAAACCTGATACCGAACAACTTAACTTGCTTAAAAAATCACAGCGAGCCTGGCTGGATTTTAGGGA‑CAAAGAATGTGAATTAATCCTTTCAAATGAGGACGTTCAGGATTTAAGTGACCCTTATTCTGAATCAGAATGGCTCTCATGTATGATCATACAGACCAATACGCGAACTCGCCAGt < 1:2682449/280‑1 (MQ=255)
tcaaatcatGCCTGCGACAAGAATACAATCTCGTCGATGCGCAATTAAATAAAGCCTATGGTGAAGCTTATCGTTATATAGAACAAGTGCCACGCACAGGTGTAAAAAAACCTGATACCGAACAACTTAACTTGCTTAAAAAATCACAGCGAGCCTGGCTGGATTTTAGGGA‑CAAAGAATGTGAATTAATCCTTTCAAATGAGGACGTTCAGGATTTAAGTGACCCTTATTCTGAATCAGAATGGCTCTCATGTATGATCATACAGACCAATACGCGAACTCGCCAGt < 1:1503537/280‑1 (MQ=255)
tcaaatcatGCCTGCGACAAGAATACAATCTCGTCGATGCGCAATTAAATAAAGCCTATGGTGAAGCTTATCGTTATATAGAACAAGTGCCACGCACAGGTGTAAAAAAACCTGATACCGAACAACTTAACTTGCTTAAAAAATCACAGCGAGCCTGGCTGGATTTTAGGGA‑CAAAGAATGTGAATTAATCCTTTCAAATGAGGAAGTTCAGGATTTAAGTGACCCTTATTCTGAATCAGAATGGCTCTCATGTATGATCATACAGACCAATACGCGAACTCGACAGtt > 1:2256211/9‑289 (MQ=255)
caaatcatGCCTGCGACAAGAATACAATCTCGTCGATGCGCAATTAAATAAAGCCTATGGTGAAGCTTATCGTTATATAGAACAAGTGCCACGCACAGGTGTAAAAAAACCTGATACCGAACAACTTAACTTGCTTAAAAAATCACAGCGAGCCTGGCTGGATTTTAGGGA‑CAAAGAATGTGAATTAATCCTTTCAAATGAGGACGTTCAGGATTTAAGTGACCCTTATTCTGAATCAGAATGGCTCTCATGTATGATCATACAGACCAATACGCGAACTCGCCAGTTg < 2:2042718/282‑1 (MQ=255)
tcatGCCTGCGACAAGAATACAATCTCGTCGATGCGCAATTAAATAAAGCCTATGGTGAAGCTTATCGTTATATAGAACAAGTGCCACGCACAGGTGTAAAAAAACCTGATACCGAACAACTTAACTTGCTTAAAAAATCACAGCGAGCCTGGCTGGATTTTAGGGA‑CAAAGAATGTGAATTAATCCTTTCAAATGAGGACGTTCAGGATTTAAGTGACCCTTATTCTGAATCAGAATGGCTCTCATGTATGATCATACAGACCAATACGCGAACTCGCCAGTTGCAGc < 1:203389/286‑1 (MQ=255)
gCCTGCGACAAGAATACAATCTCGTCGATGCGCAATTAAATAAAGCCTATGGTGAAGCTTATCGTTATATAGAACAAGTGCCACGCACAGGTGTAAAAAAACCTGATACCGAACAACTTAACTTGCTT‑AAAAATCACAGCGAGCCTGGCTGGATTTTAGGGA‑CAAAGAATGTGAATTAATCCTTTCAAATGAGGACGTTCAGGATTTAAGTGACCCTTATTCTGAATCAGAATGGCTCTCATGTATGATCATACAGACCAATACGCGAACTCGCCAGTTGCAGCtata > 2:618175/1‑288 (MQ=255)
cGACAAGAATACAATCTCGTCGATGCGCAATTAAATAAAGCCTATGGTGAAGCTTATCGTTATATAGAACAAGTGCCACGCACAGGTGTAAAAAAACCTGATACCGAACAACTTAACTTGCTTAAAAAATCACAGCGAGCCTGGCTGGATTTTAGGGA‑CAAAGAATGTGAATTAATCCTTTCAAATGAGGACGtt < 2:2555899/195‑1 (MQ=255)
cGACAAGAATACAATCTCGTCGATGCGCAATTAAATAAAGCCTATGGTGAAGCTTATCGTTATATAGAACAAGTGCCACGCACAGGTGTAAAAAAACCTGATACCGAACAACTTAACTTGCTTAAAAAATCACAGCGAGCCTGGCTGGATTTTAGGGA‑CAAAGAATGTGAATTAATCCTTTCAAATGAGGACGTTCAGGATTTAAGTGACCCTTATTCTGAATCAGAATGGCTCTCATGTATGATCATACAGACCAATACGCGAACTCGCCAGTTGCAGCTATACCGt < 2:1523512/288‑1 (MQ=255)
aaTACAATCTCGTCGATGCGCAATTAAATAAAGCCTATGGTGAAGCTTATCGTTATATAGAACAAGTGCCACGCACAGGTGTAAAAAAACCTGATACCGAACAACTTAACTTGCTTAAAAAATCACAGCGAGCCTGGCTGGATTTTAGGGA‑CAAAGAATGTGAATTAATCCTTTCAAATGAGGACGTTCAGGATTTAAGTGACCCTTATTCTGAATCAGAATGGCTCTCATGTATGATCATACAGACCAATACGCGAACTCGCCAGTTGCAGCTATACCGT‑AACTCTGa > 2:1085633/1‑289 (MQ=255)
tctcGTCGATGCGCAATTAAATAAAGCCTATGGTGAAGCTTATCGTTATATAGAACAAGTGCCACGCACAGGTGTAAAAAAACCTGATACCGAACAACTTAACTTGCTTAAAAAATCACAGCGAGCCTGGCTGGATTTTAGGGA‑CAAAGAATGTGAATTAATCCTTTCAAATGAGGACGTTCAGGATTTAAGTGACCCTTATTCTGAATCAGAATGGCTCTCATGTATGATCATACAGACCAATACGCGAACTCGCCAGTTGCAGCTATACCGT‑AACTCTGAAGAtttt > 2:2407799/1‑289 (MQ=255)
tctcGTCGATGCGCAATTAAATAAAGCCTATGGTGAAGCTTATCGTTATATAGAACAAGTGCCACGCACAGGTGTAAAAAAACCTGATACCGAACAACTTAACTTGCTTAAAAAATCACAGCGAGCCTGGCTGGATTTTAGGGA‑CAAAGAATGTGAATTAATCCTTTCAAATGAGGACGTTCAGGAGTTAAGTGACCCTTATTCTGAATCAGAATGGCTCTCATGTATGATCATACAGACCAATACGCGAACTCGCCAGTTGCAGCTATACCGT‑AACTCTGAAGAtttt < 2:1941853/289‑1 (MQ=255)
cgtcgATGCGCAATTAAATAAAGCCTATGGTGAAGCTTATCGTTATATAGAACAAGTGCCACGCACAGGTGTAAAAAAACCTGATACCGAACAACTTAACTTGCTTAAAAAATCACAGCGAGCCTGGCTGGATTTTAGGGA‑CAAAGAATGTGAATTAATCCTTTCAAATGAGGACGTTCAGGATTTAAGTGACCCTTATTCTGAATCAGAATGGCTCTCATGTATGATCATACAGACCAATACGCGaa > 2:2276613/1‑248 (MQ=255)
tcgATGCGCAATTAAATAAAGCCTATGGTGAAGCTTATCGTTATATAGAACAAGTGCCACGCACAGGTGTAAAAAAACCTGATACCGAACAACTTAACTTGCTTAAAAAATCACAGCGAGCCTGGCTGGATTTTAGGGA‑CAAAGAATGTGAATTAATCCTTTCAAATGAGGACGTTCAGGATTTAAGTGACCCTTATTCTGAATCAGAATGGCTCTCATGTATGATCATACAGACCAATACGCGAACTCGCCAGTTTCAGCTATACCGT‑AACTCTGAAGATTTTTATcc > 2:2694149/1‑289 (MQ=255)
taaataaaGCCTATGGTGAAGCTTATCGTTATATAGAACAAGTGCCACGCACAGGTGTAAAAAAACCTGATACCGAACAACTTAACTTGCTTAAAAAATCACAGCGAGCCTGGCTGGATTTTAGGGA‑CAAAGAATGTGAATTAATCCTTTCAAATGAGGACGTTCAGGATTTAAGTGACCCTTATTCTGAATCAGAATGGCTCTCATGTATGATCATACAGACCAATACGCGAACTCGCCAGTTGCAGCTATACCGT‑AACTCTGAAGATTTTTATCCAAGCCCTTTGAc < 1:992842/289‑1 (MQ=255)
aGCCTATGGTGAAGCTTATCGTTATATAGAACAAGTGCCACGCACAGGTGTAAAAAAACCTGATACCGAACAACTTAACTTGCTTAAAAAATCACAGCGAGCCTGGCTGGATTTTAGGGA‑CAAAGAATGTGAATTAATCCTTTCAAATGAGGACGTTCAGGATTTAAGTGACCCTTATTCTGAATCAGAATGGCt < 2:558746/195‑1 (MQ=255)
aGCCTATGGTGAAGCTTATCGTTATATAGAACAAGTGCCACGCACAGGTGTAAAAAAACCTGATACCGAACAACTTAACTTGCTTAAAAAATCACAGCGAGCCTGGCTGGATTTTAGGGA‑CAAAGAATGTGAATTAATCCTTTCAAATGAGGACGTTCAGGATTTAAGTGACCCTTATTCTGAATCAGAATGGCTCTCATGTATGATCATACAGACCAATACGCGAACTCGCCAGTTGCAGCTATACCGT‑AACTCTGAAGATTTTTATCCAAGCCCTTTGACAAGAGGa > 1:2616742/1‑289 (MQ=255)
aGCCTATGGTGAAGCTTATCGTTATATAGAACAAGTGCCACGCACAGGTGTAAAAAAACCTGATACCGAACAACTTAACTTGCTTAAAAAATCACAGCGAGCCTGGCTGGATTTTAGGGA‑CAAAGAATGTGAATTAATCCTTTCAAATGAGGACGTTCAGGATTTAAGTGACCCTTATTCTGAATCAGAATGGCTCTCATGTATGATCATACAGACCAATACGCGAACTCGCCAGTTGCAGCTATACCGT‑AACTCTGAAGATTTTTATCCAAGCCCTTTGACAAGAGGa > 2:2299983/1‑289 (MQ=255)
ccTATGGTGAAGCTTATCGTTATATAGAACAAGTGCCACGCACAGGTGTAAAAAAACCTGATACCGAACAACTTAACTTGCTTAAAAAATCACAGCGAGCCTGGCTGGATTTTAGGGA‑CAAAGAATGTGAATTAATCCTTTCAAATGAGGACGTTCAGGATTTAAGTGACCCTTATTCTGAATCAGAATGGCTCTCATGTATGATCATACAGACCAATACGCGAACTCGCCAGTTGCAGCTATACCGT‑AACTCTGAAGATTTTTATCCAAGCCCTTTGACAAGAGGATa > 2:454825/1‑289 (MQ=255)
ccTATGGTGAAGCTTATCGTTATATAGAACAAGTGCCACGCACAGGTGTAAAAAAACCTGATACCGAACAACTTAACTTGCTTAAAAAATCACAGCGAGCCTGGCTGGATTTTAGGGA‑CAAAGAATGTGAATTAATCCTTTCAAATGAGGACGTTCAGGATTTAAGTGACCCTTATTCTGAATCAGAATGGCTCTCATGTATGATCATACAGACCAATACGCGAACTCGCCAGTTGCAGCTATACCGT‑AACTCTGAAGATTTTTATCCAAGCCCTTTGACAAGAGGATa > 1:1359610/1‑289 (MQ=255)
aTGGTGAAGCTTATCGTTATATAGAACAAGTGCCACGCACAGGTGTAAAAAAACCTGATACCGAACAACTTAACTTGCTTAAAAAATCACAGCGAGCCTGGCTGGATTTTAGGGA‑CAAAGAATGTGAATTAATCCTTTCAAATGAGGACGtt < 2:2196330/152‑1 (MQ=255)
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tATCGTTATATAGAACAAGTGCCACGCACAGGTGTAAAAAAACCTGATACCGAACAACTTAACTTGCTTAAAAAATCACAGCGAGCCTGGCTGGATTTTAGGGA‑CAAAGAATGTGAATTAATCCTTTCAAATGAGGACGTTCAGGATTTAAGTGACCCTTATTCTGAATCAGAATGGCTctcatgta < 1:1960571/187‑8 (MQ=255)
aTCGTTATATAGAACAAGTGCCACGCACAGGTGTAAAAAAACCTGATACCGAACAACTTAACTTGCTTAAAAAATCACAGCGAGCCTGGCTGGATTTTAGGGA‑CAAAGAATGTGAATTAATCCTTTCAAATGAGGACGTTCAGGATTTAAGTGACCCTTATTCTGAATCAGAATGGCTCTCATGTATGATCATACAGACCAATACGCGAACTCGCAAGTTGCAGCTATACCGTAAACTC‑GAAGATTTTTATCCAAGCCCTTTGACAAGCGGATAATTcaacaccttt > 2:1185648/1‑279 (MQ=255)
tCGTTATATAGAACAAGTGCCACGCACAGGTGTAAAAAAACCTGATACCGAACAACTTAACTTGCTTAAAAAATCACAGCGAGCCTGGCTGGATTTTAGGGA‑CAAAGAATGTGAATTAATCCTTTCAAATGAGGACGTTCAGGa > 1:2198429/1‑144 (MQ=255)
tCGTTATATAGAACAAGTGCCACGCACAGGTGTAAAAAAACCTGATACCGAACAACTTAACTTGCTTAAAAAATCACAGCGAGCCTGGCTGGATTTTAGGGA‑CAAAGAATGTGAATTAATCCTTTCAAATGAGGACGTTCAGGATTTAAGTGACCCTTATTCTGAATCAGAATGGCTctcatg < 1:2171906/183‑6 (MQ=255)
tCGTTATATAGAACAAGTGCCACGCACAGGTGTAAAAAAACCTGATACCGAACAACTTAACTTGCTTAAAAAATCACAGCGAGCCTGGCTGGATTTTAGGGA‑CAAAGAATGTGAATTAATCCTTTCAAATGAGGACGTTCAGGATTTAAGTGACCATTATTCTGAATCAGCATGGCTCTCATGTATGATCATACAGCCCAATACGCGAACTCGCCAGTTGCAGCTATACCGT‑AACTCTGAAGCTTTTTATCCAAGCCCTTTGACAAGAGGATCATTCCAATCTTTTTg > 2:727014/1‑288 (MQ=255)
atataGAACAAGTGCCACGCACAGGTGTAAAAAAACCTGATACCGAACAACTTAACTTGCTTAAAAAATCACAGCGAGCCTGGCTGGATTTTAGGGA‑CAAAGAATGTGAATTAATCCTTTCAAATGAGGACGTTCAGGATTTAAGTGACCCTTATTCTGAATCAGAATGGCTCTCATGTATGATCATACAGACCAATACGCGAACTCGCCAGTTGCAGCTATACCGT‑AACTCTGAAGATTTTTATCCAAGCCCTTTGACAAGAGGATAATTCACATCTTTTTGGCATGt > 1:2318370/1‑289 (MQ=255)
tataGAACAAGTGCCACGCACAGGTGTAAAAAAACCTGATACCGAACAACTTAACTTGCTTAAAAAATCACAGCGAGCCTGGCTGGATTTTAGGGA‑CAAAGAATGTGAATTAATCCTTTCAAATGAGGACGTTCAGGATTTAAGTGACCCTTATTCTGAATCAGAATGGCTCTCATGTATGATCATACAGACCAATACGCGAACTCGCCAGTTGCAGCTATACCGT‑AACTCTGAAGAttt > 2:1048066/1‑240 (MQ=255)
tataGAACAAGTGCCACGCACAGGTGTAAAAAAACCTGATACCGAACAACTTAACTTGCTTAAAAAATCACAGCGAGCCTGGCTGGATTTTAGGGA‑CAAAGAATGTGAATTAATCCTTTCAAATGAGGACGTTCAGGATTTAAGTGACCCTTATTCTGAATCAGAATGGCTCTCATGTATGATCATACAGACCAATACGCGAACTCGCCAGTTGCAGCTATACCGT‑AACTCTGAAGATTTTTATCCAAGCCCTTTGACAAGAGGATAATTCACATCTTTTTGGCATGtt > 1:2093369/1‑289 (MQ=255)
tataGAACAAGTGCCACGCACAGGTGTAAAAAAACCTGATACCGAACAACTTAACTTGCTTAAAAAATCACAGCGAGCCTGGCTGGATTTTAGGGA‑CAAAGAATGTGAATTAATCCTTTCAAATGAGGACGTTCAGGATTTAAGTGACCCTTATTCTGAATCAGAATGGCTCTCATGTATGATCATACAGACCAATACGCGAACTCGCCAGTTGCAGCTATACCGT‑AACTCTGAAGATTTTTATCCAAGCCCTTTGACAAGAGGATAATTCACATCTTTTTGGCATGtt < 1:1028342/289‑1 (MQ=255)
tataGAACAAGTGCCACGCACAGGTGTAAAAAAACCTGATACCGAACAACTTAACTTGCTTAAAAAATCACAGCGAGCCTGGCTGGATTTTAGGGA‑CAAAGAATGTGAATTAATCCTTTCAAATGAGGACGTTCAGGATTTAAGTGACCCTTATTCTGAATCAGAATGGCTCTCATGTATGATCATACAGACCAATACGCGAACTCGCCAGTTGCAGCTATACCGT‑AACTCTGAAGATTTTTATCCAAGCCCTTTGACAAGAGGATAATTCACATCTTTTTGGCATGtt < 2:765964/289‑1 (MQ=255)
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aaCAAGTGCCACGCACAGGTGTAAAAAAACCTGATACCGAACAACTTAACTTGCTTAAAAAATCACAGCGAGCCTGGCTGGATTTTAGGGA‑CAAAGAATGTGAATTAATCCTTTCAAATGAGGACGTTCAGGATTTAAGTGACCCTTATTCTGAATCAGAATGGCTCTCATGTATGATCATACAGACCAATACGCGAACTCGCCAGTTGCAGCTATACCGT‑AACTCTGAAGATTTTTATCCAAGCCCTTTGACaa > 2:375294/1‑255 (MQ=255)
aaCAAGTGCCACGCACAGGTGTAAAAAAACCTGATACCGAACAACTTAACTTGCTTAAAAAATCACAGCGAGCCTGGCTGGATTTTAGGGA‑CAAAGAATGTGAATTAATCCTTTCAAATGAGGACGTTCAGGATTTAAGTGACCCTTATTCTGAATCAGAATGGCTCTCATGTATGATCATACAGACCAATACGCGAACTCGCCAGTTGCAGCTATACCGT‑AACTCTGAAGATTTTTATCCAAGCCCTTTGACAAGAGGATAATTCACATCTTTTTGGCATGTTttgtt > 1:2396300/1‑289 (MQ=255)
aaGTGCCACGCACAGGTGTAAAAAAACCTGATACCGAACAACTTAACTTGCTTAAAAAATCACAGCGAGCCTGGCTGGATTTTAGGGA‑CAAAGAATGTGAATTAATCCTTTCAAATGAGGACGTTCAGGATTTAAGTGACCCTTATTCTGAATCAGAATGGCTCTCATGTATGATCATACAGACCAATACGCGAACTCGCCAGTTGCAGCTATACCGT‑AACTCTGAAGATTTTTATCCAAGCCCTTTGACAAGAGGATAATTCACATCTTTTTGGCATGTTTTGTTGCa < 2:2158105/289‑1 (MQ=255)
gTGCCACGCACAGGTGTAAAAAAACCTGATACCGAACAACTTAACTTGCTTAAAAAATCACAGCGAGCCTGGCTGGATTTTAGGGA‑CAAAGAATGTGAATTAATCCTTTCAAATGAGGACGTTCAGGCTTTAAGTGACCCTTATTCTGAATCATAATGGCTCTCATGTATGATCATACAGACCAATACGCGCACTCGCCAGTTGCAGCTATACCGT‑CACTCTGAAGATTTTTATCCAATCCCTTTTACAAGAGGATAATTCACCTCTTTTTGGCATGTTTTTTTTCaa > 2:247763/1‑288 (MQ=255)
gTGCCACGCACAGGTGTAAAAAAACCTGATACCGAACAACTTAACTTGCTTAAAAAATCACAGCGAGCCTGGCTGGATTTTAGGGA‑CAAAGAATGTGAATTAATCCTTTCAAATGAGGACGTTCAGGATTTAAGTGACCCTTATTCTGAATCAGAATGGCTc < 2:1969815/162‑1 (MQ=255)
gTGCCACGCACAGGTGTAAAAAAACCTGATACCGAACAACTTAACTTGCTTAAAAAATCACAGCGAGCCTGGCTGGATTTTAGGGA‑CAAAGAATGTGAATTAATCCTTTCAAATGAGGACGTTCAGGATTTAAGTGACCCTTATTCTGAATCAGAATGGCTCTCATGTATGATCATACAGACCAATACGCGAACTCGCCAGTTGCAGCTATACCGT‑AACTCTGAAGATTTTTATCCAAGc < 1:1636979/240‑1 (MQ=255)
gTGCCACGCACAGGTGTAAAAAAACCTGATACCGAACAACTTAACTTGCTTAAAAAATCACAGCGAGCCTGGCTGGATTTTAGGGA‑CAAAGAATGTGAATTAATCCTTTCAAATGAGGACGTTCAGGATTTAAGTGACCCTTATTCTGAATCAGAATGGCTCTCATGTATGATCATACAGACCAATACGCGAACTCGCCAGTTGCAGCTATACCGT‑AACTCTGAAGATTTTTATCCAAGCCCTTTGACAAGAGGATAATTCACATCTTTTTGGCATGTTTTGTTGCaa > 1:2534549/1‑288 (MQ=255)
gTGCCACGCACAGGTGTAAAAAAACCTGATACCGAACAACTTAACTTGCTTAAAAAATCACAGCGAGCCTGGCTGGATTTTAGGGA‑CAAAGAATGTGAATTAATCCTTTCAAATGAGGACGTTCAGGATTTAAGTGACCCTTATTCTGAATCAGAATGGCTCTCATGTATGATCATACAGACCAATACGCGAACTCGCCAGTTGCAGCTATACCGT‑AACTCTGAAGATTCTTATCCAAGCCCTTTGACAAGAGGATAATTCACATCTTTTTGGCATGTTTTGTTGCaa > 2:340349/1‑288 (MQ=255)
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aaaaaaCCTGATACCGAACAACTTAACTTGCTTAAAAAATCACAGCGAGCCTGGCTGGATTTTAGGGA‑CAAAGAATGTGAATTAATCCTTTCAAATGAGGACGTTCAGGATTTAAGTGACCCTTATTCTGAATCAGAATGGCTCTCATGTATGATCATACAGACCAATACGCGAACTCGCCAGTTGCAGCTATACCGT‑AACTCTGAAGATTTTTATCCAAGCCCTTTGACAAGAGGATAATTCACATCTTTTTGGCATGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAaataat > 2:1327830/1‑289 (MQ=255)
aCCTGATACCGAACAACTTAACTTGCTTAAAAAATCACAGCGAGCCTGGCTGGATTTTAGGGA‑CAAAGAATGTGAATTAATCCTTTCAAATGAGGACGTTCAGGATTTAAGTGACCCTTATTCTGAATCAGAATGGCTctcatg > 2:428633/1‑139 (MQ=255)
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aCCTGATACCGAACAACTTAACTTGCTTAAAAAATCACAGCGAGCCTGGCTGGATTTTAGGGA‑CAAAGAATGTGAATTAATCCTTTCAAATGAGGACGTTCAGGATTTAAGTGACCCTTATTCTGAATCAGAATGGCTCTCATGTATGATCATACAGACCAATACGCGAACTCGCCAGTTGCAGCTATACCGT‑AACTCTGAAGATTTTTATCCaa > 2:930932/1‑215 (MQ=255)
aCCTGATACCGAACAACTTAACTTGCTTAAAAAATCACAGCGAGCCTGGCTGGATTTTAGGGA‑CAAAGAATGTGAATTAATCCTTTCAAATGAGGACGTTCAGGATTTAAGTGACCCTTATTCTGAATCAGAATGGCTCTCATGTATGATCATACAGACCAATACGCGAACTCGCCAGTTGCAGCTATACCGT‑AACTCTGAAGATTTTTATCCAAGCCCTTTGACAAGAGGATAATTCACATCTTTTTGGCATGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGcaa > 2:799384/1‑289 (MQ=255)
aCCTGATACCGAACAACTTAACTTGCTTAAAAAATCACAGCGAGCCTGGCTGGATTTTAGGGA‑CAAAGAATGTGAATTAATCCTTTCAAATGAGGACGTTCAGGATTTAAGTGACCCTTATTCTGAATCAGAATGGCTCTCATGTATGATCATACAGACCAATACGCGAACTCGCCAGTTGCAGCTATACCGT‑AACTCTGAAGATTTTTATCCAAGCCCTTTGACAAGAGGATAATTCACATCTTTTTGGCATGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGca > 1:739779/1‑288 (MQ=255)
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cTGATACCGAACAACTTAACTTGCTTAAAAAATCACAGCGAGCCTGGCTGGATTTTAGGGA‑CAAAGAATGTGAATTAATCCTTTCAAATGAGGACGTTCAGGATTTAAGTGACCCTTATTCTGAATCAGAATGGCTCTCATGTATGATCATACAGACCAATACGCGAACTCGCCAGTTGCAGCTATACCGT‑AACTCTGAAGATTTTTATCCAAGCCCTTTGACAAGAGGATAATTCACATCTTTTTGGCATGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGcaaca < 2:2376595/289‑1 (MQ=255)
acaacTTAACTTGCTTAAAAAATCACAGCGAGCCTGGCTGGATTTTAGGGA‑CAAAGAATGTGAATTAATCCTTTCAAATGAGGACGTTCAGGATTTAAGTGACCCTTATTCTGAATCAGAATGGCTCTCATGTATGATCATACAGACCAATACGCGAACTCGCCAGTTGCAGCTATACCGT‑AACTCTGAAGATTTTTATCCAAGCCCTTTGACAAGAGGATAATTCACATCTTTTTGGCATGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGa < 2:2637226/288‑1 (MQ=255)
cttGCTTAAAAAATCACAGCGAGCCTGGCTGGATTTTAGGGC‑CAAAGAATGTCAATTGATCCTTTCAAATGAGGACGTTCAGGATTTAAGTTACCCTTATTCTGAATCAGAATGGCTCTCATGTATGATCATACAGACCAATACGCGAACTCGCCAGTTGCAGCTATACCGT‑AACTCTGAAGATTTTTATCCAAGCCCTTTGACAAGAGGATAATTCACATCTTTTTGGCATGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCa < 2:2202838/289‑1 (MQ=255)
tcttacaaaatcacAGCGAGCCTGTCTGGATGTTAGGGACCAAAGAGT‑TGAACTGAACCTTTCAAATGAGTACGTTCAGGAGTTAAGTTACCCTTATTCTAAATCAGAAATGCTCTAAAGTCATATCATACAGAACAATACGCGAACTCGCCAGTTGCAGCTATACCGT‑AACTCTGAAGATTTTTATCCAAGCCCTTTGACAAGAGGATAATTCACATCTTTTTGGCATGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGAAATCTAGCCTTTTTCACTg < 2:2097969/276‑1 (MQ=255)
gCTTAAAAAATCACAGCGAGCCTGGCTGGATTTTAGGGA‑CAAAGAATGTGAATTAATCCTTTCAAATGAGGACGTTCAGGATTTAAGTGACCCTTATTCTGAATCAGAATGGCTCTCATGTATGATCATACAGACCAATACGCGAACTCGCCAGTTGCAGCTATACCGT‑AACTCTGAAGATTTTTATCCAAGCCCTTTGACAAGAGGATAATTCACATCTTTTTGGCATGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCACTg < 2:28318/289‑1 (MQ=255)
gCTTAAAAAATCACAGCGAGCCTGGCTGGATTTTAGGGA‑CAAAGAATGTGAATTAATCCTTTCAAATGAGGACGTTCAGGATTTAAGTGACCCTTATTCTGAATCAGAATGGCTCTCATGTATGATCATACAGACCAATACGCGAACTCGCCAGTTGCAGCTATACCGT‑AACTCTGAAGATTTTTATCCAAGCCCTTTGACAAGAGGATAATTCACATCTTTTTGGCATGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCACTg < 1:586844/289‑1 (MQ=255)
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atcacAGCGAGCCTGGCTGGATTTTAGGGA‑CAAAGAATGTGAATTAATCCTTTCAAATGAGGACGTTCAGGATTTAAGTGACCCTTATTCTGAATCAGAATGGCTCTCATGTATGATCATACAGACCAATACGCGAACTCGCCAGTTGCAGCTATACCGT‑AACTCTGAAGATTTTTATCCAAGCCCTTTGACAAGAGGATAATTCACATCTTTTTGGCATGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCACTGAGTTATTaa < 1:1085633/285‑1 (MQ=255)
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aTTTTAGGGA‑CAAAGAATGTGAATTAATCCTTTCAAATGAGGACGTTCAGGATTTAAGTGACCCTTATTCTGAATCAGAATGGCTCTCATGTATGATCATACAGACCAATACGCGAACTCGCCAGTTGCAGCTATACCGT‑AACTCTGAAGATTTTTATCCAAGCCCTTTGACAAGAGGATAATTCACATCTTTTTGGCATGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCACTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTc > 2:1265219/1‑288 (MQ=255)
ttttAGGGA‑CAAAGAATGTGAATTAATCCTTTCAAATGAGGACGTTCAGGATTTAAGTGACCCTTATTCTGAATCAGAATGGCTCTCATGTATGATCATACAGACCAATACGCGAACTCGCCAGTTGCAGCTATACCGT‑AACTCTGAAGATTTTTATCCAAGCCCTTTGACAAGAGGATAATTCACATCTTTTTGGCATGTTTTGTTGTAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCACTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTcg < 1:190758/288‑1 (MQ=255)
aGGGA‑CAAAGAATGTGAATTAATCCTTTCAAATGAGGACGTTCAGGATTTAAGTGACCCTTATTCTGAATCAGAATGGCTCTCATGTATGATCATACAGACCAATACGCGAACTCGCCAGTTGCAGCTATACCGT‑AACTCTGAAGATTTTTATCCAAGCCCTTTGACAAGAGGATAATTCACATCTTTTTGGCATGTTTTGTTGCAAGCTTTTCCTGATAaataat < 2:2517538/226‑1 (MQ=255)
a‑CAAAGAATGTGAATTAATCCTTTCAAATGAGGACGTTCAGGATTTAAGTGACCCTTATTCTGAATCAGAATGGCTCTCATGTATGATCATACAGACCAATACGCGAACTCGCCAGTTGCAGCTATACCGT‑AACTCTGAAGATTTTTATCCAAGCCCTTTGACAAGAGGATAATTCACATCTTTTTGGCATGttt > 1:2587251/1‑195 (MQ=255)
aTGTGAATTAATCCTTTCAAATGAGGACGTTCAGGATTTAAGTGACCCTTATTCTGAATCAGAATGGCTCTCATGTATGATCATACAGACCAATACGCGAACTCGCCAGTTGCAGCTATACCGT‑AACTCTGAAGATTTTTATCCAAGCCCTTTGACAAGAGGATAATTCACATCTTTTTGGCATGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCACTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTCGCTACGCTagcaagc < 1:2299983/287‑1 (MQ=255)
gtgAATTAATCCTTTCAAATGAGGACGTTCAGGATTTAAGTGACCCTTATTCTGAATCAGAATGGCTCTCATGTATGATCATACAGACCAATACGCGAACTCGCCAGTTGCAGCTATACCGT‑AACTCTGAAGATTTTTATCCAAGCCCTTTGACAAGAGGATAATTCACATCTTTTTGGCATGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGa > 1:1240697/1‑229 (MQ=255)
gtgAATTAATCCTTTCAAATGAGGACGTTCAGGATTTAAGTGACCCTTATTCTGAATCAGAATGGCTCTCATGTATGATCATACAGACCAATACGCGAACTCGCCAGTTGCAGCTATACCGT‑AACTCTGAAGATTTTTATCCAAGCCCTTTGACAAGAGGATAATTCACATCTTTTTGGCATGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGa < 2:1240697/229‑1 (MQ=255)
tgAATTAATCCTTTCAAATGAGGACGTTCAGGATTTAAGTGACCCTTATTCTGAATCAGAATGGCTCTCATGTATGATCATACAGACCAATACGCGAACTCGCCAGTTGCAGCTATACCGT‑AACTCTGAAGATTTTTATCCAAGCCCTTTGACAAGAGGATAATTcaca < 2:954750/169‑1 (MQ=255)
aaTCCTTTCAAATGAGGACGTTCAGGATTTAAGTGACCCTTATTCTGAATCAGAATGGCTCTCATGTATGATCATACAGACCAATACGCGAACTCGCCAGTTGCAGCTATACCGT‑AACTCTGAAGATTTTTATCCAAGCCCTTTGACAAGAGGATAATTCACATCTTTTTGGCATGTTTTGTTTCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCACTGAGTTATTAAAAATAATCGCGAGCCCGTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATgctgt > 2:1881463/1‑285 (MQ=255)
aaTCCTTTCAAATGAGGACGTTCAGGATTTAAGTGACCCTTATTCTGAATCAGAATGGCTCTCATGTATGATCATACAGACCAATACGCGAACTCGCCAGTTGCAGCTATACCGT‑AACTCTGAAGATTTTTATCCAAGCCCTTTGACAAGAGGATAATTCACATCTTTTTGGCATGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCACTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAAc > 2:260908/1‑289 (MQ=255)
|||
TACGGTTATAGTAAACGACCATGACATTAGTGCCATCAAAGATTGTTGGCAAAAAAATAGTGATGATGATACTGACGTTAACGTGATCAAAAGTTGCCTGCGACAAGAATACAATCTCGTCGATGCGCAATTAAATAAAGCCTATGGTGAAGCTTATCGTTATATAGAACAAGTGCCACGCACAGGTGTAAAAAAACCTGATACCGAACAACTTAACTTGCTTAAAAAAAGTCAGCGAGCCTGGCTGGATTTTAGGGA‑CAAAGAATGTGAATTAATCCTTAGTAATGAGGACGTTCAGGATTTAAGTGACCCTTATTCTGAAAGTGAATGGCTCAGTTGTATGATCATACAGACCAATACGCGAACTCGCCAGTTGCAGCTATACCGT‑AACTCTGAAGATTTTTATCCAAGCCCTTTGACAAGAGGATAATTCACATCTTTTTGGCATGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCACTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAAC > CP042583/1642779‑1643340
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
