Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A13 F1 I1 R1
|
778 |
68.7 |
3228504 |
93.4% |
3015422 |
109.7 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,984,873 |
A→G |
W379R (TGG→CGG) |
aslA ← |
putative Ser‑type periplasmic non‑aryl sulfatase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,984,873 | 0 | A | G | 100.0%
| 283.7
/ NA
| 78 | W379R (TGG→CGG) | aslA | putative Ser‑type periplasmic non‑aryl sulfatase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (40/38); total (40/38) |
TTTCGCTCCAGGATGCCCTGCCAGATCCAGCGCGGTAGGGAAGAGATCTGCCAGATCGACAATACCGTCAGATTTACGCGGTTGGATCATCCCTTTCCAGTAAACGAAAGTCGGTACGCGAACGCCGCCTTCCCAGGTCGAACCTTTCGCACCACGGAACGGGGTGCGTCCGTGCGGCGGTACTTCGGCTTCCGGTCCGTTATCGGAGGTAAAGACGATCAGCGTGTTATCAAGCTGACCGTTTTTCTCCAGTGTTTTATACAGATTAGC > NC_000913/3984739‑3985008
|
tttCGCTCCAGGATGCCCTGCCAGATCCAGCGCGGTAGGGAAGAGATCTGCCAGATCGACAATACCGTCAGATTTACGCGGTTGGATCATCCCTTTCCAGTAAACGAAAGTCGGTACGCGAACGCCGCCTTCCCGGGTc > 2:940701/1‑139 (MQ=255)
tttCGCTCCAGGATGCCCTGCCAGATCCAGCGCGGTAGGGAAGAGATCTGCCAGATCGACAATACCGTCAGATTTACGCGGTTGGATCATCCCTTTCCAGTAAACGAAAGTCGGTACGCGAACGCCGCCTTCCCGGGTc > 2:1387856/1‑139 (MQ=255)
cTCCAGGATGCCCTGCCAGATCCAGCGCGGTAGGGAAGAGATCTGCCAGATCGACAATACCGTCAGATTTACGCGGTTGGATCATCCCTTTCCAGTAAACGAAAGTCGGTACGCGAACGCCGCCTTCCCGGGTCGAAcc > 1:502710/1‑139 (MQ=255)
cccTGCCAGATCCAGCGCGGTAGGGAAGAGATCTGCCAGATCGACAATACCGTCAGATTTACGCGGTTGGATCATCCCTTTCCAGTAAACGAAAGTCGGTACGCGAACGCCGCCTTCCCGGGTCGAACCTTTCGcacca < 1:1387856/139‑1 (MQ=255)
cccTGCCAGATCCAGCGCGGTAGGGAAGAGATCTGCCAGATCGACAATACCGTCAGATTTACGCGGTTGGATCATCCCTTTCCAGTAAACGAAAGTCGGTACGCGAACGCCGCCTTCCCGGGTCGAACCTTTCGcacca > 2:1570449/1‑139 (MQ=255)
ccTGCCAGATCCAGCGCGGTAGGGAAGAGATCTGCCAGATCGACAATACCGTCAGATTTACGCGGTTGGATCATCCCTTTCCAGTAAACGAAAGTCGGTACGCGAACGCCGCCTTCCCGGGTCGAACCTTTCg < 1:1313447/133‑1 (MQ=255)
ccTGCCAGATCCAGCGCGGTAGGGAAGAGATCTGCCAGATCGACAATACCGTCAGATTTACGCGGTTGGATCATCCCTTTCCAGTAAACGAAAGTCGGTACGCGAACGCCGCCTTCCCGGGTCGAACCTTTCg > 2:1313447/1‑133 (MQ=255)
ccAGATCCAGCGCGGTAGGGAAGAGATCTGCCAGATCGACAATACCGTCAGATTTACGCGGTTGGATCATCCCTTTCCAGTAAACGAAAGTCGGTACGCGAACGCCGCCTTCCCGGGTCGAACCTTTCGCACCACGGaa < 1:1440718/139‑1 (MQ=255)
aGATCCAGCGCGGTAGGGAAGAGATCTGCCAGATCGACAATACCGTCAGATTTACGCGGTTGGATCATCCCTTTCCAGTAAACGAAAGTCGGTACGCGAACGCCGCCTTCCCGGGTCGAACCTTTCGCACCACGGAACg < 1:468846/139‑1 (MQ=255)
tCCAGCGCGGTAGGGAAGAGATCTGCCAGATCGACAATACCGTCAGATTTACGCGGTTGGATCATCCCTTTCCAGTAAACGAAAGTCGGTACGCGAACGCCGCCTTCCCGGGTCGAACCTTTCGCACCACGGAACgggg > 2:856607/1‑139 (MQ=255)
cgcgGTAGGGAAGAGATCTGCCAGATCGACAATACCGTCAGATTTACGCGGTTGGATCATCCCTTTCCAGTAAACGAAAGTCGGTACGCGAACGCCGCCTTCCCGGGTCGAACCTTTCGCACCACGGAACGGGGTGCGt > 2:678562/1‑139 (MQ=255)
cgcgGTAGGGAAGAGATCTGCCAGATCGACAATACCGTCAGATTTACGCGGTTGGATCATCCCTTTCCAGTAAACGAAAGTCGGTACGCGAACGCCGCCTTCCCGGGTCGAACCTTTCGCACCACGGAACGGGGTGCGt > 1:390397/1‑139 (MQ=255)
tAGGGAAGAGATCTGCCAGATCGACAATACCGTCAGATTTACGCGGTTGGATCATCCCTTTCCAGTAAACGAAAGTCGGTACGCGAACGCCGCCTTCCCGGGTCGAACCTTTCGCACCACGGAACGGGGTGCGTCCGTg > 1:322625/1‑139 (MQ=255)
ggAAGAGATCTGCCAGATCGACAATACCGTCAGATTTACGCGGTTGGATCATCCCTTTCCAGTAAACGAAAGTCAGTACGCGAACGCCGCCTTCCCGGGTCGAACCTTTCGCACCACGGAACGGGGTGCGTCCGTgcgg < 1:1178550/139‑1 (MQ=255)
aTCTGCCAGATCGACAATACCGTCAGATTTACGCGGTTGGATCATCCCTTTCCAGTAAACGAAAGTCGGTACGCGAACGCCGCCTTCCCGGGTCGAACCTTTCGCACCACGGAACGGGGTGCGTCCGTGCGGCGGTACt < 2:1064633/139‑1 (MQ=255)
aTCTGCCAGATCGACAATACCGTCAGATTTACGCGGTTGGATCATCCCTTTCCAGTAAACGAAAGTCGGTACGCGAACGCCGCCTTCCCGGGTCGAACCTTTCGCACCACGGAACGGGGTGCGTCCGTGCGGCGGTACt > 1:55541/1‑139 (MQ=255)
tGCCAGATCGACAATACCGTCAGATTTACGCGGTTGGATCATCCCTTTCCAGTAAACGAAAGTCGGTACGCGAACGCCGCCTTCCCGGGTCGAACCTTTCGCACCACGGaa < 1:938886/111‑1 (MQ=255)
tGCCAGATCGACAATACCGTCAGATTTACGCGGTTGGATCATCCCTTTCCAGTAAACGAAAGTCGGTACGCGAACGCCGCCTTCCCGGGTCGAACCTTTCGCACCACGGaa > 2:938886/1‑111 (MQ=255)
tGCCAGATCGACAATACCGTCAGATTTACGCGGTTGGATCATCCCTTTCCAGTAAACGAAAGTCGGTACGCGAACGCCGCCTTCCCGGGTCGAACCTTTCGCACCACGGAACGGGGTGCGTCCGTGCGGCGGTACTTCg > 2:688478/1‑139 (MQ=255)
gATCGACAATACCGTCAGATTTACGCGGTTGGATCATCCCTTTCCAGTAAACGAAAGTCGGTACGCGAACGCCGCCTTCCCGGGTCGAACCTTTCGCACCACGGAACGGGGTGCGTCCGTGCGGCGGTACTTCGGCTTc > 2:1206218/1‑139 (MQ=255)
aTCGACAATACCGTCAGATTTACGCGGTTGGATCATCCCTTTCCAGTAAACGAAAGTCGGTACGCGAACGCCGCCTTCCCGGGTCGAACCTTTCGCACCACGGAACGGGGTGCGTCCGTGCGGCGGTACTTCGGCTTcc > 2:1581321/1‑139 (MQ=255)
aTCGACAATACCGTCAGATTTACGCGGTTGGATCATCCCTTTCCAGTAAACGAAAGTCGGTACGCGAACGCCGCCTTCCCGGGTCGAACCTTTCGCACCACGGAACGGGGTGCGTCCGTGCGGCGGTACTTCGGCTTcc > 2:186228/1‑139 (MQ=255)
aCAATACCGTCAGATTTACGCGGTTGGATCATCCCTTTCCAGTAAACGAAAGTCGGTACGCGAACGCCGCCTTCCCGGGTCGAACCTTTCGCACCACGGAACGGGGTGCGTCCGTGCGGCGGTACTTCGGCTTCCGGTc > 1:1360284/1‑139 (MQ=255)
cGTCAGATTTACGCGGTTGGATCATCCCTTTCCAGTAAACGAAAGTCGGTACGCGAACGCCGCCTTCCCGGGTCGAACCTTTCGCACCACGGAACGGGGTGCGTCCGTGCGGCGGTACTTCGGCTTCCGGTCCGTTATc < 1:856607/139‑1 (MQ=255)
gTCAGATTTACGCGGTTGGATCATCCCTTTCCAGTAAACGAAAGTCGGTACGCGAACGCCGCCTTCCCGGGTCGAACCTTTCGCACCACGGAACGGGGTGCGTCCGTGCGGCGGTACTTCGGCTTCCGGTCCGTTATCg < 2:1360284/139‑1 (MQ=255)
gTCAGATTTACGCGGTTGGATCATCCCTTTCCAGTAAACGAAAGTCGGTACGCGAACGCCGCCTTCCCGGGTCGAACCTTTCGCACCACGGAACGGGGTGCGTCCGTGCGGCGGTACTTCGGCTTCCGGTCCGTTATCg < 1:1596488/139‑1 (MQ=255)
gTCAGATTTACGCGGTTGGATCATCCCTTTCCAGTAAACGAAAGTCGGTACGCGAACGCCGCCTTCCCGGGTCGAACCTTTCGCACCACGGAACGGGGTGCGTCCGTGCGGCGGTACTTCGGCTTCCGGTCCGTTATCg < 1:678562/139‑1 (MQ=255)
tCAGATTTACGCGGTTGGATCATCCCTTTCCAGTAAACGAAAGTCGGTACGCGAACGCCGCCTTCCCGGGTCGAACCTTTCGCACCACGGAACGGGGTGCGTCCGTGCGGCGGTACTTCGGCtt < 2:1480363/124‑1 (MQ=255)
tCAGATTTACGCGGTTGGATCATCCCTTTCCAGTAAACGAAAGTCGGTACGCGAACGCCGCCTTCCCGGGTCGAACCTTTCGCACCACGGAACGGGGTGCGTCCGTGCGGCGGTACTTCGGCtt > 1:1480363/1‑124 (MQ=255)
tCAGATTTACGCGGTTGGATCATCCCTTTCCAGTAAACGAAAGTCGGTACGCGAACGCCGCCTTCCCGGGTCGAACCTTTCGCACCACGGAACGGGGTGCGTCCGTGCGGCGGTACTTCGGCTTCCGGTCCGTTATCgg > 2:1199150/1‑139 (MQ=255)
tCAGATTTACGCGGTTGGATCATCCCTTTCCAGTAAACGAAAGTCGGTACGCGAACGCCGCCTTCCCGGGTCGAACCTTTCGCACCACGGAACGGGGTGCGTCCGTGCGGCGGTACTTCGGCTTCCGGTCCGTTATCgg > 1:1303528/1‑139 (MQ=255)
aGATTTACGCGGTTGGATCATCCCTTTCCAGTAAACGAAAGTCGGTACGCGAACGCCGCCTTCCCGGGTCGAACCTTTCGCACCACGGAACGGGGTGCGTCCGTGCGGCGGTACTTCGGCTTCCGGTCCGTTATCGGAg > 1:1397439/1‑139 (MQ=255)
aGATTTACGCGGTTGGATCATCCCTTTCCAGTAAACGAAAGTCGGTACGCGAACGCCGCCTTCCCGGGTCGAACCTTTCGCACCACGGAACGGGGTGCGTCCGTGCGGCGGTACTTCGGCTTCCGGTCCGTTATCGGAg > 2:91638/1‑139 (MQ=255)
gATTTACGCGGTTGGATCATCCCTTTCCAGTAAACGAAAGTCGGTACGCGAACGCCGCCTTCCCGGGTCGAACCTTTCGCACCACGGAACGGGGTGCGTCCGTGCGGCGGTACTTCGGCTTCCGGTCCGTTATCGGAgg < 2:838795/139‑1 (MQ=255)
gATTTACGCGGTTGGATCATCCCTTTCCAGTAAACGAAAGTCGGTACGCGAACGCCGCCTTCCCGGGTCGAACCTTTCGCACCACGGAACGGGGTGCGTCCGTGCGGCGGTACTTCGGCTTCCGGTCCGTTATCGGAgg < 1:1570449/139‑1 (MQ=255)
ttGGATCATCCCTTTCCAGTAAACGAAAGTCGGTACGCGAACGCCGCCTTCCCGGGTCGAACCTTTCGCACCACGGAACGGGGTGCGTCCGTGCGGCGGTACTTCGGCTTCCGGTCCGTTATCGGAGGTAAAGACGATc < 1:91638/139‑1 (MQ=255)
ttGGATCATCCCTTTCCAGTAAACGAAAGTCGGTACGCGAACGCCGCCTTCCCGGGTCGAACCTTTCGCACCACGGAACGGGGTGCGTCCGTGCGGCGGTACTTCGGCTTCCGGTCCGTTATCGGAGGTAAAGACGATc < 2:613563/139‑1 (MQ=255)
ttGGATCATCCCTTTCCAGTAAACGAAAGTCGGTACGCGAACGCCGCCTTCCCGGGTCGAACCTTTCGCACCACGGAACGGGGTGCGTCCGTGCGGCGGTACTTCGGCTTCCGGTCCGTTATCGGAGGTAAAGACGATc > 1:1253223/1‑139 (MQ=255)
atcatcCCTTTCCAGTAAACGAAAGTCGGTACGCGAACGCCGCCTTCCCGGGTCGAACCTTTCGCACCACGGAACGGGGTGCGTCCGTGCGGCGGTACTTCGGCTTCCGGTCCGTTATCGGAGGTAAAGACGATCAGCg < 2:264900/139‑1 (MQ=255)
tcCCTTTCCAGTAAACGAAAGTCGGTACGCGAACGCCGCCTTCCCGGGTCGAACCTTTCGCACCACGGAACGGGGTGCGTCCGTGCGGCGGTACTTCGGCTTCCGGTCCGTTATCGGAGGTAAAGACGATCAGCGTGtt < 2:390397/139‑1 (MQ=255)
tcCCTTTCCAGTAAACGAAAGTCGGTACGCGAACGCCGCCTTCCCGGGTCGAACCTTTCGCACCACGGAACGGGGTGCGTCCGTGCGGCGGTACTTCGGCTTCCGGTCCGTTATCGGAGGTAAAGACGATCAGCGTGtt > 1:1445180/1‑139 (MQ=255)
ccTTTCCAGTAAACGAAAGTCGGTACGCGAACGCCGCCTTCCCGGGTCGAACCTTTCGCACCACGGAACGGGGTGCGTCCGTGCGGCGGTACTTCGGCTTCCGGTCCGTTATCg < 2:1570787/114‑1 (MQ=255)
ccTTTCCAGTAAACGAAAGTCGGTACGCGAACGCCGCCTTCCCGGGTCGAACCTTTCGCACCACGGAACGGGGTGCGTCCGTGCGGCGGTACTTCGGCTTCCGGTCCGTTATCg > 1:1570787/1‑114 (MQ=255)
ttCCAGTAAACGAAAGTCGGTACGCGAACGCCGCCTTCCCGGGTCGAACCTTTCGCACCACGGAACGGGGTGCGTCCGTGCGGCGGTACTTc < 1:369833/92‑1 (MQ=255)
ttCCAGTAAACGAAAGTCGGTACGCGAACGCCGCCTTCCCGGGTCGAACCTTTCGCACCACGGAACGGGGTGCGTCCGTGCGGCGGTACTTc > 2:369833/1‑92 (MQ=255)
tCCAGTAAACGAAAGTCGGTACGCGAACGCCGCCTTCCCGGGTCGAACCTTTCGcaccac > 1:54434/1‑60 (MQ=255)
tCCAGTAAACGAAAGTCGGTACGCGAACGCCGCCTTCCCGGGTCGAACCTTTCGcaccac < 2:54434/60‑1 (MQ=255)
tCCAGTAAACGAAAGTCGGTACGCGAACGCCGCCTTCCCGGGTCGAACCTTTCGCACCACGGAACGGGGTGCGTCCGTGCGGCGGTACTTCGGCTTCCgg > 1:839421/1‑100 (MQ=255)
tCCAGTAAACGAAAGTCGGTACGCGAACGCCGCCTTCCCGGGTCGAACCTTTCGCACCACGGAACGGGGTGCGTCCGTGCGGCGGTACTTCGGCTTCCgg < 2:839421/100‑1 (MQ=255)
gTAAACGAAAGTCGGTACGCGAACGCCGCCTTCCCGGGTCGAACCTTTCGCACCACGGaa < 2:1051987/60‑1 (MQ=255)
gTAAACGAAAGTCGGTACGCGAACGCCGCCTTCCCGGGTCGAACCTTTCGCACCACGGaa > 1:1051987/1‑60 (MQ=255)
tAAACGAAAGTCGGTACGCGAACGCCGCCTTCCCGGGTCGAACCTTTCGCACCACGGAACGGGGTGCGTCCGTGCGGCGGTACTTCGGCTTc > 2:191605/1‑92 (MQ=255)
tAAACGAAAGTCGGTACGCGAACGCCGCCTTCCCGGGTCGAACCTTTCGCACCACGGAACGGGGTGCGTCCGTGCGGCGGTACTTCGGCTTc < 1:191605/92‑1 (MQ=255)
tAAACGAAAGTCGGTACGCGAACGCCGCCTTCCCGGGTCGAACCTTTCGCACCACGGAACGGGGTGCGTCCGTGCGGCGGTACTTCGGCTTCCGGTCCGTTATCGGAGGTAAAGACGATCAGCGTGTTATCAAGCTGAc > 1:1111935/1‑139 (MQ=255)
tAAACGAAAGTCGGTACGCGAACGCCGCCTTCCCGGGTCGAACCTTTCGCACCACGGAACGGGGTGCGTCCGTGCGGCGGTACTTCGGCTTCCGGTCCGTTATCGGAGGTAAAGACGATCAGCGTGTTATCAAGCTGAc < 1:186228/139‑1 (MQ=255)
tAAACGAAAGTCGGTACGCGAACGCCGCCTTCCCGGGTCGAACCTTTCGCACCACGGAACGGGGTGCGTCCGTGCGGCGGTACTTCGGCTTCCGGTCCGTTATCGGAGGTAAAGACGATCAGCGTGTTATCAAGCTGAc > 1:1458593/1‑139 (MQ=255)
tAAACGAAAGTCGGTACGCGAACGCCGCCTTCCCGGGTCGAACCTTTCGCACCACGGAACGGGGTGCGTCCGTGCGGCGGTACTTCGGCTTCCGGTCCGTTATCGGAGGTAAAGACGATCAGCGTGTTATCAAGCTGAc > 2:1214296/1‑139 (MQ=255)
aaGTCGGTACGCGAACGCCGCCTTCCCGGGTCGAACCTTTCGCACCACGGAACGGGGTGCGTCCGTGCGGCGGTACTTCGGCTTCCGGTCCGTTATCGGAGGTAAAGACGATCAGCGTGTTATCAAGCTGACCGttttt > 2:1274593/1‑139 (MQ=255)
tCGGTACGCGAACGCCGCCTTCCCGGGTCGAACCTTTCg < 1:723752/39‑1 (MQ=255)
tCGGTACGCGAACGCCGCCTTCCCGGGTCGAACCTTTCg > 2:723752/1‑39 (MQ=255)
tCGGTACGCGAACGCCGCCTTCCCGGGTCGAACCTTTCGCACCACGGAACGGGGTGCGTCCGTGCGGCGGTACTTCGGCTTCCGGTCCGTTATCGGAGGTAAAGACGATCAGCGTGTTATCAAGCTGACCGTTTTtctc < 2:1253223/139‑1 (MQ=255)
ggTACGCGAACGCGGCCTTCCCGGGTCGAACCTTTCGCACCACGGAACGGGGTGCGTCCGTGCGGCGGTACTTCGGCTTCCGGTCCGTTATCGGAGGTAAAGACGATCAGCGTGTTATCAAGCTGACCGTTTTTCTCCa < 1:1305805/139‑1 (MQ=255)
ggTACGCGAACGCCGCCTTCCCGGGTCGAACCTTTCGCACCACGGAACGGGGTGCGTCCGTGCGGCGGTACTTCGGCTTCCGGTCCGTTATCGGAGGTAAAGACGATCAGCGTGTTATCAAGCTGACCGTTTTTCTCCa < 1:1199150/139‑1 (MQ=255)
ggTACGCGAACGCCGCCTTCCCGGGTCGAACCTTTCGCACCACGGAACGGGGTGCGTCCGTGCGGCGGTACTTCGGCTTCCGGTCCGTTATCGGAGGTAAAGACGATCAGCGTGTTATCAAGCTGACCGTTTTTCTCCa < 2:1445180/139‑1 (MQ=255)
ggTACGCGAACGCCGCCTTCCCGGGTCGAACCTTTCGCACCACGGAACGGGGTGCGTCCGTGCGGCGGTACTTCGGCTTCCGGTCCGTTATCGGAGGTAAAGACGATCAGCGTGTTATCAAGCTGACCGTTTTTCTCCa > 1:700353/1‑139 (MQ=255)
gTACGCGAACGCCGCCTTCCCGGGTCGAACCTTTCGCACCACGGAACGGGGTGCGTCCGTGCGGCGGTACTTCGGCTTCCGGTCCGTTAt > 2:1364805/1‑90 (MQ=255)
gTACGCGAACGCCGCCTTCCCGGGTCGAACCTTTCGCACCACGGAACGGGGTGCGTCCGTGCGGCGGTACTTCGGCTTCCGGTCCGTTAt < 1:1364805/90‑1 (MQ=255)
cgcgAACGCCGCCTTCCCGGGTCGAACCTTTCGCACCACGGAACGGGGTGCGTCCGTGCGGCGGTACTTCGGCTTCCGGTCCGTTATCGGAGGTAAAGACGATCAGCGTGTTATCAAGCTGACCGTTTTTCTCCAgtgt < 2:1111935/139‑1 (MQ=255)
gcgAACGCCGCCTTCCCGGGTCGAACCTTTCGCACCACGGAACGGGGTGCGTCCGTGCGGCGGTACTTCGGCTTCCGGTCCGTTTTCAGAGGAAAAGACGATAAGTGTGTTATCAAGATGAACGTTTTTCTCCAGTGtt < 1:1206218/139‑1 (MQ=255)
aaCGCCGCCTTCCCGGGTCGAACCTTTCGCACCACGGAACg < 1:1468373/41‑1 (MQ=255)
aaCGCCGCCTTCCCGGGTCGAACCTTTCGCACCACGGAACg > 2:1468373/1‑41 (MQ=255)
aaCGCCGCCTTCCCGGGTCGAACCTTTCGCACCACGGAACGGGGTGCGTCCGTGCGGCGGTACTTCGGCTTCCGGTCCGTTATCGGAGGTAAAGACGATCAGCGTGTTATCAAGCTGACCGTTTTTCTCCAGTGTTTta > 1:938118/1‑139 (MQ=255)
cgccgcCTTCCCGGGTCGAACCTTTCGCACCACGGAACGGGGTGCGTCCGTGCGGCGGTACTTCGGCTTCCGGTCCGTTATCGGAGGTAAAGACGATCAGCGTGTTATCAAGCTGACCGTTTTTCTCCAGTGTTTtata < 1:1214296/139‑1 (MQ=255)
cgccgcCTTCCCGGGTCGAACCTTTCGCACCACGGAACGGGGTGCGTCCGTGCGGCGGTACTTCGGCTTCCGGTCCGTTATCGGAGGTAAAGACGATCAGCGTGTTATCAAGCTGACCGTTTTTCTCCAGTGTTTtata < 2:1430950/139‑1 (MQ=255)
ccgccTTCCCGGGTCGAACCTTTCGCACCACGGAACGGGGTGCGTCCGTGCGGCGGTACTTCGGCTTCCGGTCCGTTATCGGAGGTAAAGACGATCAGCGTGTTATCAAGCTGACCGTTTTTCTCCAGTGTTTTATACa > 1:561380/1‑139 (MQ=255)
ccTTCCCGGGTCGAACCTTTCGCACCACGGAACGGGGTGCGTCCGTGCGGCGGTACTTCGGCTTCCGGTCCGTTATCGGAGGTAAAGACGATCAGCGTGTTATCAAGCTGACCGTTTTTCTCCAGTGTTTTATACAGAt > 2:493718/1‑139 (MQ=255)
cTTCCCGGGTCGAACCTTTCGCACCACGGAACGGGGTGCGTCCGTGCGGCGGTACTTCGGCTTCCGGTCCGTTATCGGAGGTAAAGACGATCAGCGTGTTATCAAGCTGACCGTTTTTCTCCAGTGTTTTATACAGAtt < 2:1458593/139‑1 (MQ=255)
cccGGGTCGAACCTTTCGCACCACGGAACGGGGTGCGTCCGTGCGGCGGTACTTCGGCTTCCGGTCCGTTATCGGAGGTAAAGACGATCAGCGTGTTATCAAGCTGACCGTTTTTCTCCAGTGTTTTATACAGATTAGc < 2:502710/139‑1 (MQ=255)
|
TTTCGCTCCAGGATGCCCTGCCAGATCCAGCGCGGTAGGGAAGAGATCTGCCAGATCGACAATACCGTCAGATTTACGCGGTTGGATCATCCCTTTCCAGTAAACGAAAGTCGGTACGCGAACGCCGCCTTCCCAGGTCGAACCTTTCGCACCACGGAACGGGGTGCGTCCGTGCGGCGGTACTTCGGCTTCCGGTCCGTTATCGGAGGTAAAGACGATCAGCGTGTTATCAAGCTGACCGTTTTTCTCCAGTGTTTTATACAGATTAGC > NC_000913/3984739‑3985008
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
