Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A11 F28 I1 R1
|
228 |
65.7 |
2434974 |
91.7% |
2232871 |
138.5 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,417,748 |
T→C |
V223A (GTT→GCT) |
yfcC → |
putative transporter YfcC |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,417,748 | 0 | T | C | 100.0%
| 234.4
/ NA
| 67 | V223A (GTT→GCT) | yfcC | putative transporter YfcC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (32/35); total (32/35) |
CGCACCGCTAATGGTCCGGCTGGGCTATGACAGTATTACCACCGTCCTGGTGACCTATATTGCCACGCAAATCGGTTTTGCCAGTTCGTGGATGAACCCGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGTTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGTGTGGGTTATCGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCATGGTGTACGCCTCACGAGTGAAAAAGAATCCTCTTCTGTCACGCGTGCA > NC_000913/2417614‑2417871
|
cGCACCGCTAATGGTCCGGCTGGGCTATGACAGTATTACCACCGTCCTGGTGACCTATATTGCCACGCAAATCGGTTTTGCCAGTTCGTGGATGAACCCGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGCTCCgg > 2:15604/1‑140 (MQ=255)
cGCACCGCTAATGGTCCGGCTGGGCTATGACAGTATTACCACCGTCCTGGTGACCTATATTGCCACGCAAATCGGTTTTGCCAGTTCGTGGATGAACCCGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGCTCCgg > 2:559309/1‑140 (MQ=255)
cGCACCGCTAATGGTCCGGCTGGGCTATGACAGTATTACCACCGTCCTGGTGACCTATATTGCCACGCAAATCGGTTTTGCCAGTTCGTGGATGAACCCGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGCTCCgg > 1:1194902/1‑140 (MQ=255)
gCACCGCTAATGGTCCGGCTGGGCTATGACAGTATTACCACCGTCCTGGTGACCTATATTGCCACGCAAATCGGTTTTGCCAGTTCGTGGATGAACCCGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGCTCCGGt > 2:997926/1‑140 (MQ=255)
cACCGCTAATGGTCCGGCTGGGCTATGACAGTATTACCACCGTCCTGGTGACCTATATTGCCACGCAAATCGGTTTTGCCAGTTCGTGGATGAACCCGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGCTCCGGTg < 2:959058/140‑1 (MQ=255)
aCCGCTAATGGTCCGGCTGGGCTATGACAGTATTACCACCGTCCTGGTGACCTATATTGCCACGCAAATCGGTTTTGCCAGTTCGTGGATGAACCCGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGCTCCGGTGc > 2:685641/1‑140 (MQ=255)
cTAATGGTCCGGCTGGGCTATGACAGTATTACCACCGTCCTGGTGACCTATATTGCCACGCAAATCGGTTTTGCCAGTTCGTGGATGAACCCGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGCTCCGGTGCTTTc < 1:590674/140‑1 (MQ=255)
cTAATGGTCCGGCTGGGCTATGACAGTATTACCACCGTCCTGGTGACCTATATTGCCACGCAAATCGGTTTTGCCAGTTCGTGGATGAACCCGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGCTCCGGTGCTTTc < 1:559309/140‑1 (MQ=255)
ccGGCTGGGCTATGACAGTATTACCACCGTCCTGGTGACCTATATTGCCACGCAAATCGGTTTTGCCAGTTCGTGGATGAACCCGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGTCGGCGCTCCGGTGCTTTCTGGCTCCg > 1:302539/1‑140 (MQ=255)
ccGGCTGGGCTATGACAGTATTACCACCGTCCTGGTGACCTATATTGCCACGCAAATCGGTTTTGCCAGTTCGTGGATGAACCCGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGCTCCGGTGCTTTCTGGCTCCg > 2:1188470/1‑140 (MQ=255)
cGGCTGGGCTATGACAGTATTACCACCGTCCTGGTGACCTATATTGCCACGCAAATCGGTTTTGCCAGTTCGTGGATGAACCCGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGCTCCGGTGCTTTTTGGCTCCgg > 2:1071444/1‑140 (MQ=255)
ggCTGGGCTATGACAGTATTACCACCGTCCTGGTGACCTATATTGCCACGCAAATCGGTTTTGCCAGTTCGTGGATGAACCCGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGCTCCGGTGCTTTCTGGCTCCggg < 1:189361/140‑1 (MQ=255)
cTGGGCTATGACAGTATTACCACCGTCCTGGTGACCTATATTGCCACGCAAATCGGTTTTGCCAGTTCGTGGATGAACCCGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGCTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGtt < 2:1194902/140‑1 (MQ=255)
gCTATGACAGTATTACCACCGTCCTGGTGACCTATATTGCCACGCAAATCGGTTTTGCCAGTTCGTGGATGAACCCGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGCTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTgcgc > 1:628338/1‑140 (MQ=255)
cTATGACAGTATTACCACCGTCCTGGTGACCTATATTGCCACGCAAATCGGTTTTGCCAGTTCGTGGATGAACCCGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGCTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCa > 1:55924/1‑140 (MQ=255)
aTGACAGTATTACCACCGTCCTGGTGACCTATATTGCCACGCAAATCGGTTTTGCCAGTTCGTGGATGAACCCGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGCTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATc < 1:768496/140‑1 (MQ=255)
tGACAGTATTACCACCGTCCTGGTGACCTATATTGCCACGCAAATCGGTTTTGCCAGTTCGTGGATGAACCCGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGCTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCg < 1:108577/140‑1 (MQ=255)
cAGTATTACCACCGTCCTGGTGACCTATATTGCCACGCAAATCGGTTTTGCCAGTTCGTGGATGAACCCGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGCTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCgtgg < 1:997926/140‑1 (MQ=255)
tATTACCACCGTCCTGGTGACCTATATTGCCACGCAAATCGGTTTTGCCAGTTCGTGGATGAACCCGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGCTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCg < 2:13831/134‑1 (MQ=255)
tATTACCACCGTCCTGGTGACCTATATTGCCACGCAAATCGGTTTTGCCAGTTCGTGGATGAACCCGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGCTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCg > 1:13831/1‑134 (MQ=255)
tATTACCACCGTCCTGGTGACCTATATTGCCACGCAAATCGGTTTTGCCAGTTCGTGGATGAACCCGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGCTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGgtgt > 2:509742/1‑140 (MQ=255)
tATTACCACCGTCCTGGTGACCTATATTGCCACGCAAATCGGTTTTGCCAGTTCGTGGATGAACCCGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGCTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGgtgt < 1:685641/140‑1 (MQ=255)
accaccGTCCTGGTGACCTATATTGCCACGCAAATCGGTTTTGCCAGTTCGTGGATGAACCCGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGCTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGTGTGGGt < 1:1188470/140‑1 (MQ=255)
gccGTCCTGGTGACCTATATTGCCACGCAAATCGGTTTTGCCAGTTCGTGGATGAACCCGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGCTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGTGTGGGTTAt < 1:723126/139‑1 (MQ=255)
accGGCCTGGTGACCTATATTGCCACGCAAATCGGGTTTGCCAGTTCGTGGATGAACCCGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGCTCCGGTGCTTTCTGGCTGCGGGTTGCGCATCGTGGTGTGGGTTAt < 2:1147793/140‑1 (MQ=255)
ccGTCCTGGTGACCTATATTGCCACGCAAATCGGTTTTGCCAGTTCGTGGATGAACCCGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGCTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGTGTGGGTTATc > 1:971720/1‑140 (MQ=255)
gTCCTGGTGACCTATATTGCCACGCAAATCGGTTTTGCCAGTTCGTGGATGAACCCGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGCTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGTGTGGGTTATCGc > 1:945547/1‑140 (MQ=255)
gTCCTGGTGACCTATATTGCCACGCAAATCGGTTTTGCCAGTTCGTGGATGAACCCGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGCTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGTGTGGGTTATCGc > 1:528845/1‑140 (MQ=255)
gTCCTGGTGACCTATATTGCCACGCAAATCGGTTTTGCCAGTTCGTGGATGAACCCGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGCTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGTGTGGGTTATCGc < 1:47239/140‑1 (MQ=255)
gTCCTGGTGACCTATATTGCCACGCAAATCGGTTTTGCCAGTTCGTGGATGAACCCGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGCTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGTGTGGGTTATCGc > 2:812658/1‑140 (MQ=255)
ccTGGTGACCTATATTGCCACGCAAATCGGTTTTGCCAGTTCGTGGATGAACCCGTTTTGTGTGGCCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGCTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGTGTGGGTTATCGCCa > 2:245226/1‑140 (MQ=255)
gACCTATATTGCCACGCAAATCGGTTTTGCCAGTTCGTGGATGAACCCGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGCTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGTGTGGGTTATCGCCACTCTGa < 1:593818/140‑1 (MQ=255)
gACCTATATTGCCACGCAAATCGGTTTTGCCAGTTCGTGGATGAACCCGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGCTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGTGTGGGTTATCGCCACTCTGa < 2:55924/140‑1 (MQ=255)
aCCTATATTGCCACGCAAATCGGTTTTGCCAGTTCGTGGATGAACCCGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGCTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGTGTGGGTTATCGCCACTCTGAt < 2:8922/140‑1 (MQ=255)
cTATATTGCCACGCAAATCGGTTTTGCCAGTTCGTGGATGAACCCGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGCTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGTGTGGGTTATCGCCACTCTGATTg > 2:262407/1‑140 (MQ=255)
cTATATTGCCACGCAAATCGGTTTTGCCAGTTCGTGGATGAACCCGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGCTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGTGTGGGTTATCGCCACTCTGATTg > 1:378550/1‑140 (MQ=255)
cTATATTGCCACGCAAATAGGTTTTGCCAGTTCGTGGATGAACCCGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGCTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGTGTGGGTTATCGCCACTCTGATTg > 1:240767/1‑140 (MQ=255)
tataTTGCCACGCAAATCGGTTTTGCCAGTTCGTGGATGAACCCGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGCTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGTGTGGGTTATCGCCACTCTGa > 1:1082042/1‑136 (MQ=255)
tataTTGCCACGCAAATCGGTTTTGCCAGTTCGTGGATGAACCCGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGCTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGTGTGGGTTATCGCCACTCTGa < 2:1082042/136‑1 (MQ=255)
tataTTGCCACGCAAATCGGTTTTGCCAGTTCGTGGATGAACCCGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGCTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGTGTGGGTTATCGCCACTCTGATTgg > 2:844820/1‑140 (MQ=255)
atatTGCCACGCAAATCGGTTTTGCCAGTTCGTGGATGAACCCGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGCTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGTGTGGGTTATCGCCACTCTGATTGGc < 2:628338/140‑1 (MQ=255)
tatTGCCACGCAAATCGGTTTTGCCAGTTCGTGGATGAACCCGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGCTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGTGTGGGTTATCGCCACTCTGATTGGcc < 1:842616/140‑1 (MQ=255)
tatTGCCACGCAAATCGGTTTTGCCAGTTCGTGGATGAACCCGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGCTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGTGTGGGTTATCGCCACTCTGATTGGcc > 2:696742/1‑140 (MQ=255)
atTGCCACGCAAGTCGGTTTTGCCAGTTGGTGGATGAACCCGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATGGCCGGCGCTCCGATGCTTTCTGGCACCGGGTTGCGCATCGTGGTGTGGGTTATCGCCACTCTGATTGGcgt < 2:240767/140‑3 (MQ=255)
atTGCCACGCAAATCGGTTTTGCCAGTTCGTGGATGAACCCGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGCTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGTGTGGGTTATCGCCACTCTGATTGGCCt < 2:378550/140‑1 (MQ=255)
atTGCCACGCAAATCGGTTTTGCCAGTTCGTGGATGAACCCGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGCTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGTGTGGGTTATCGCCACTCTGATTGGCCt < 1:1071444/140‑1 (MQ=255)
gCCACGCAAATCGGTTTTGCCAGTTCGTGGATGAACCCGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGCTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGTGTGGGTTATCGCCACTCTGATTGGCCTGAt < 1:245226/140‑1 (MQ=255)
gCCACGCAAATCGGTTTTGCCAGTTCGTGGATGAACCCGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGCTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGTGTGGGTTATCGCCACTCTGATTGGCCTGAt < 2:1146201/140‑1 (MQ=255)
ccACGCAAATCGGTTTTGCCAGTTGGTGGATGAACCCGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGCTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGTGTGGGTTATCGCCACTCTGATTGGCCTGATc > 2:1052522/1‑140 (MQ=255)
cACGCAAATCGGTTTTGCCAGTTCGTGGATGAACCCGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGCTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGTGTGGGTTATCGCCACTCTGATTGGCCTGATCt < 1:812658/140‑1 (MQ=255)
gCAAATCGGTTTTGCCAGTTCGTGGATGAACCCGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGCTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGTGTGGGTTATCGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTa < 1:844820/140‑1 (MQ=255)
aaTCGGTTTTGCCAGTTCGTGGATGAACCCGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGCTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGTGTGGGTTATCGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCa < 2:945547/140‑1 (MQ=255)
aaTCGGTTTTGCCAGTTCGTGGATGAACCCGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGCTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGTGTGGGTTATCGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCa < 1:15604/140‑1 (MQ=255)
gTTTTGCCAGTTCGTGGATGAACCCGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGCTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGTGTGGGTTATCGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCATGgtg < 2:528845/140‑1 (MQ=255)
tttGCCAGTTCGTGGATGAACCCGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGCTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGTGTGGGTTATCGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCATGGTGTa < 2:567801/140‑1 (MQ=255)
tGCCAGTTCGTGGATGAACCCGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGCTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGTGTGGGTTATCGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCATGGTGTACg > 1:775032/1‑140 (MQ=255)
cAGTTCGTGGATGAACCCGTTTTGTGTGGCCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGCTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGTGTGGGTTATCGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCATGGTGTACGCCt < 2:532835/140‑1 (MQ=255)
ggATGAACCCGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGCTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGTGTGGGTTATCGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCATGGTGTACGCCTCACGAGTg < 2:971720/140‑1 (MQ=255)
aaCCCGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGCTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGTGTGGGTTATCGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCATGGTGTACGCCTCACGAGTGaaaaa > 1:544298/1‑140 (MQ=255)
aaCCCGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGCTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGTGTGGGTTATCGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCATGGTGTACGCCTCACGAGTGaaaaa > 1:396180/1‑140 (MQ=255)
ccGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGCTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGTGTGGGTTATCGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCATGGTGTACGCCTCACGAGTGAAAAAGaa < 2:999520/140‑1 (MQ=255)
ttttGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGCTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGTGTGGGTTATCGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCATGGTGTACGCCTCACGAGTGAAAAAGAATcc > 1:565542/1‑140 (MQ=255)
ttttGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGCTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGTGTGGGTTATCGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCATGGTGTACGCCTCACGAGTGAAAAAGAATcc > 1:397974/1‑140 (MQ=255)
tttGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGCTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGTGTGGGTTATCGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCATGGTGTACGCCTCACGAGTGAAAAAGAATCct < 2:397974/140‑1 (MQ=255)
tgtgGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGCTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGTGTGGGTTATCGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCATGGTGTACGCCTCACGAGTGAAAAAGAATCCtcttc > 1:43948/1‑140 (MQ=255)
tgtgGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGCTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGTGTGGGTTATCGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCATGGTGTACGCCTCACGAGTGAAAAAGAATCCtcttc > 2:506797/1‑140 (MQ=255)
ggTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGCTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGTGTGGGTTATCGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCATGGTGTACGCCTCACGAGTGAAAAAGAATCCTCTTCTGt < 1:506797/140‑1 (MQ=255)
ggTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGCTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGTGTGGGTTATCGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCATGGTGTACGCCTCACGAGTGAAAAAGAATCCTCTTCTGt < 1:1052522/140‑1 (MQ=255)
tCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGCTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGTGTGGGTTATCGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCATGGTGTACGCCTCACGAGTGAAAAAGAATCCTCTTCTGTCa > 1:143343/1‑140 (MQ=255)
cAGGGGATTGCCGGCGCTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGTGTGGGTTATCGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCATGGTGTACGCCTCACGAGTGAAAAAGAATCCTCTTCTGTCACGCGTGCa < 2:544298/140‑1 (MQ=255)
|
CGCACCGCTAATGGTCCGGCTGGGCTATGACAGTATTACCACCGTCCTGGTGACCTATATTGCCACGCAAATCGGTTTTGCCAGTTCGTGGATGAACCCGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGTTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGTGTGGGTTATCGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCATGGTGTACGCCTCACGAGTGAAAAAGAATCCTCTTCTGTCACGCGTGCA > NC_000913/2417614‑2417871
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
