Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A11 F28 I1 R1
|
228 |
65.7 |
2434974 |
91.7% |
2232871 |
138.5 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,121,491 |
T→G |
intergenic (‑212/+143) |
glcA ← / ← glcB |
glycolate/lactate:H(+) symporter GlcA/malate synthase G |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,121,491 | 0 | T | G | 98.7%
| 267.2
/ ‑4.3
| 75 | intergenic (‑212/+143) | glcA/glcB | glycolate/lactate:H(+) symporter GlcA/malate synthase G |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/0); new base G (33/41); total (34/41) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.53e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
TATAGGCGTTATACTTTACAGCAACAGTACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAAGGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTT‑AAGATGTCCATATTGTTGTTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACGGGTATTTAATATTGTTAAACCCTGATAATCGCTCCGGTTATTTCCGGGATAAATGTACTACCGCAGTTACTATCATAGCCCCGACAATAAAACTTGCCGGGGCTTTTT > NC_000913/3121358‑3121625
|
tataGGCGTTATACTTTACAGCAACAGTACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAAGGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTT‑AAGATGTCCATATTGTTGGTTTAgg < 2:679062/140‑1 (MQ=255)
tataGGCGTTATACTTTACAGCAACAGTACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAAGGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTT‑AAGATGTCCATATTGTTGGTTTAgg < 2:39851/140‑1 (MQ=255)
tataGGCGTTATACTTTACAGCAACAGTACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAAGGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTT‑AAGATGTCCATATTGTTGGTTTAgg < 1:947632/140‑1 (MQ=255)
tataGGCGTTATACTTTACAGCAACAGTACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAAGGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTT‑AAGATGTCCATATTGTTGGTTTAgg < 1:95209/140‑1 (MQ=255)
ataGGCGTTATACTTTACAGCAACAGTACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAAGGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCG‑T‑AAGATGTCCATATTGTTGGTTTAGGcc < 2:31654/140‑1 (MQ=255)
taGGCGTTATACTTTACAGCAACAGTACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAAGGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTT‑AAGATGTCCATATTGTTGGTTTAGGcc < 2:94078/140‑1 (MQ=255)
gCGTTATACTTTACAGCAACAGTACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAAGGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTT‑AAGATGTCCATATTGTTGGTTTAGGCCCGc > 2:1187374/1‑140 (MQ=255)
gCGTTATACTTTACAGCAACAGTACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAAGGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTT‑AAGATGTCCATATTGTTGGTTTAGGCCCGc > 1:73297/1‑140 (MQ=255)
gCGTTATACTTTACAGCAACAGTACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAAGGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTT‑AAGATGTCCATATTGTTGGTTTAGGCCCGc < 2:389619/140‑1 (MQ=255)
taCTTTACAGCAACAGTACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAAGGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTT‑AAGATGTCCATATTGTTGGTTTAGGCCCGCTAGTaa < 1:1187374/140‑1 (MQ=255)
taCTTTACAGCAACAGTACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAAGGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTT‑AAGATGTCCATATTGTTGGTTTAGGCCCGCTAGTaa < 1:935222/140‑1 (MQ=255)
ttACAGCAACAGTACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAAGGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTT‑AAGATGTCCATATTGTTGGTTTAgg < 1:988747/125‑1 (MQ=255)
ttACAGCAACAGTACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAAGGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTT‑AAGATGTCCATATTGTTGGTTTAgg > 2:988747/1‑125 (MQ=255)
tACAGCAACAGTACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAAGGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTT‑AAGATGTCCATATTGTTGGTTTAGGCCCGCTAGTAATgcgc > 1:99738/1‑140 (MQ=255)
tACAGCAACAGTACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAAGGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTT‑AAGATGTCCATATTGTTGGTTTAGGCCCGCTAGTAATgcgc < 2:302095/140‑1 (MQ=255)
tACAGCAACAGTACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAAGGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTT‑AAGATGTCCATATTGTTGGTTTAGGCCCGCTAGTAATgcg < 2:99088/139‑1 (MQ=255)
tACAGCAACAGTACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAAGGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTT‑AAGATGTCCATATTGTTGGTTTAGGCCCGCTAGTAATgcg > 1:99088/1‑139 (MQ=255)
aGCAACAGTACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAAGGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTT‑AAGATGTCCATATTGTTGGTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTAc > 2:327971/1‑140 (MQ=255)
aGCAACAGTACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAAGGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTT‑AAGATGTCCATATTGTTGGTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTAc > 2:1129109/1‑140 (MQ=255)
aGCAACAGTACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAAGGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTT‑AAGATGTCCATATTGTTGGTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTAc < 1:1139982/140‑1 (MQ=255)
aGCAACAGTACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAAGGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTT‑AAGATGTCCATATTGTTGGTTTAGGCCCGCTAGTAATGAGCTAc > 2:1075335/1‑140 (MQ=255)
gCAACAGTACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAAGGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTT‑AAGATGTCCATATTGTTGGTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACg < 1:1075335/140‑1 (MQ=255)
gCAACAGTACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAAGGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTT‑AAGATGTCCATATTGTTGGTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACg > 1:370428/1‑140 (MQ=255)
cAACAGTACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAAGGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTT‑AAGATGTCCATATTGTTGGTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACgg < 1:404035/140‑1 (MQ=255)
cAACAGTACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAAGGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTT‑AAGATGTCCATATTGTTGGTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACgg > 1:1131445/1‑140 (MQ=255)
cAACAGTACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAAGGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTT‑AAGATGTCCATATTGTTGGTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACgg < 2:15069/140‑1 (MQ=255)
cAACAGTACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAAGGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTT‑AAGATGTCCATATTGTTGGTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACgg > 2:1207133/1‑140 (MQ=255)
cAACAGTACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAAGGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTT‑AAGATGTCCATATTGTTGGTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACgg < 1:1207133/140‑1 (MQ=255)
cAACAGTACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAAGGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTT‑AAGATGTCCATATTGTTGGTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACgg > 1:983087/1‑140 (MQ=255)
cAACAGTACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAAGGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTT‑AAGATGTCCATATTGTTGGTTT‑GGCCCGCTAGTAATGCGCTACggg > 2:463046/1‑140 (MQ=255)
cAGTACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAAGGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTT‑AAGATGTCCATATTGTTGGTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACGGGTa > 1:453190/1‑140 (MQ=255)
aGTACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAAGGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTT‑AAGATGTCCATATTGTTGGTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACGGGTAt < 1:884207/140‑1 (MQ=255)
gTACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAAGGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTT‑AAGATGTCCATATTGTTGGTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACGGGTAtt < 2:73297/140‑1 (MQ=255)
tACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAAGGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTT‑AAGATGTCCATATTGTTGGTTTAGGCCCGCTAGTaa < 1:108930/124‑1 (MQ=255)
tACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAAGGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTT‑AAGATGTCCATATTGTTGGTTTAGGCCCGCTAGTaa > 2:108930/1‑124 (MQ=255)
ccgcTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAAGGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTT‑AAGATGTCCATATTGTTGGTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACGGGTATTTAata < 2:46887/140‑1 (MQ=255)
ccgcTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAAGGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTT‑AAGATGTCCATATTGTTGGTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACGGGTATTTAata < 2:948217/140‑1 (MQ=255)
cTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAAGGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTT‑AAGATGTCCATATTGTTGGTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACGGGTATTTAATATTg > 2:969691/1‑140 (MQ=255)
gCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAAGGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTT‑AAGATGTCCATATTGTTGGTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACGGGTATTTAATATTGTTaaa < 2:370428/140‑1 (MQ=255)
ccTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAAGGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTT‑AAGATGTCCATATTGTTGGTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACGGGTATTTAATATTGTTAAACCCTGATAAt > 1:1072156/1‑140 (MQ=255)
tGGCATAACAAGTATATCGGGTAAGGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTTAAAGATGTCCATATTGTTGGTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACGGGTATTTAATATTGTTaaa > 2:110589/1‑127 (MQ=255)
tGGCATAACAAGTATATCGGGTAAGGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTTAAAGATGTCCATATTGTTGGTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACGGGTATTTAATATTGTTaaa < 1:110589/127‑1 (MQ=255)
tGGCATAACAAGTATATCGGGTAAGGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTT‑AAGATGTCCATATTGTTGGTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACGGGTATTTAATATTGTTAAACCCTGATAATCGCt < 2:1131445/140‑1 (MQ=255)
cATAACAAGTATATCGGGTAAGGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTT‑AAGATGTCCATATTGTTGGTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACGGGTATTTAATATTGTTAAACCCTGATAATCGCTCCg > 2:376145/1‑140 (MQ=255)
cATAACAAGTATATCGGGTAAGGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTT‑AAGATGTCCATATTGTTGGTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACGGGTATTTAATATTGTTAAACCCTGATAATCGCTCCg > 2:184467/1‑140 (MQ=255)
aCAAGTATATCGGGTAAGGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTT‑AAGATGTCCATATTGTTGGTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACGGGTATTTAATATTGTTAAACCCTGATAATCGCTCCGGTTa > 1:401332/1‑140 (MQ=255)
gTATATCGGGTAAGGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTT‑AAGATGTCCATATTGTTGGTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACGGGTATTTAATATTGTTAAACCCTGATAATCGCTCCGGTTATTTc < 1:9830/140‑1 (MQ=255)
gTATATCGGGTAAGGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTT‑AAGATGTCCATATTGTTGGTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACGGGTATTTAATATTGTTAAACCCTGATAATCGCTCCGGTTATTTc < 1:1092447/140‑1 (MQ=255)
tataTCGGGTAAGGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTT‑AAGATGTCCATATTGTTGGTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACGGGTATTTAATATTGTTAAACCCTGATAATCGCTCCGGTTATTTcc < 1:565003/140‑1 (MQ=255)
cGGGTAAGGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTT‑AAGATGTCCATATTGTTGGTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACGGGTATTTAATATTGTTAAACCCTGATAATCGCTc > 2:479478/1‑124 (MQ=255)
cGGGTAAGGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTT‑AAGATGTCCATATTGTTGGTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACGGGTATTTAATATTGTTAAACCCTGATAATCGCTc < 1:479478/124‑1 (MQ=255)
cGGGTAAGGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTT‑AAGATGTCCATATTGTTGGTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACGGGTATTTAATATTGTTAAACCCTGATAATCGCTCCGGTTATTTCCGGGAt > 1:113482/1‑140 (MQ=255)
cGGGTAAGGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTT‑AAGATGTCCATATTGTTGGTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACGGGTATTTAATATTGTTAAACCCTGATAATCGCTCCGGTTATTTCCGGGAt < 1:1057603/140‑1 (MQ=255)
cGGGTAAGGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTT‑AAGATGTCCATATTGTTGGTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACGGGTATTTAATATTGTTAAACCCTGATAATCGCTCCGGTTATTTCCGGGAt < 2:453190/140‑1 (MQ=255)
cGGGTAAGGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTT‑AAGATGTCCATATTGTTGGTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACGGGTATTTAATATTGTTAAACCCTGATAATCGCTCCGGTTATTTCCGGGAt < 1:782854/140‑1 (MQ=255)
cGGGTAAGGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTT‑AAGATGTCCATATTGTTGGTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACGGGTATTTAATATTGTTAAACCCTGATAATCGCTCCGGTTATTTCCGGGAt < 2:401332/140‑1 (MQ=255)
ggTAAGGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTT‑AAGATGTCCATATTGTTGGTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACGGGTATTTAATATTGTTAAACCCTGATAATCGCTCCGGTTATTTCCGGGATaa > 1:1049019/1‑140 (MQ=255)
ggTAAGGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTT‑AAGATGTCCATATTGTTGGTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACGGGTATTTAATATTGTTAAACCCTGATAATCGCTCCGGTTATTTCCGGGATaa < 2:1072156/140‑1 (MQ=255)
tAAGGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTT‑AAGATGTCCATATTGTTGGTTT‑GGCCCGCTAGTAATGCGCTACGGGTATTTAATATTGTTAAACCCTGATAATCGCTCCGGTTATTTCCGGGATAAATg < 1:463046/140‑1 (MQ=255)
aaGGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTT‑AAGATGTCCATATTGTTGGTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACGGGTATTTAATATTGTTAAACCCTGATAATCGCTCCGGTTATTTCCGGGATAAATg < 2:647258/140‑1 (MQ=255)
ttCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTT‑AAGATGTCCATATTGTTGGTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACGGGTATTTAATATTGTTAAACCCTGATAATCGCTCCGGTTATTTCCGGGATAAATGtactac < 2:113482/140‑1 (MQ=255)
tCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTT‑AAGATGTCCATATTGTTGGTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACGGGTATTTAATATTGTTAAACCCTGATAATCGCTCCGGTTATTTCCGGGATAAATGTACTAcc > 1:788178/1‑140 (MQ=255)
gTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTT‑AAGATGTCCATATTGTTGGTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACGGGTATTTAATATTGTTAAACCCTGATAATCGCTCCGGTTATTTCCGGGATAAATGTACTACCGCa < 2:1049019/140‑1 (MQ=255)
gTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTT‑AAGATGTCCATATTGTTGGTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACGGGTATTTAATATTGTTAAACCCTGATAATCGCTCCGGTTATTTCCGGGATAAATGTACTACCGCa < 1:178397/140‑1 (MQ=255)
cGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTT‑AAGATGTCCATATTGTTGGTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACGGGTATTTAATATTGTTAAACCCTGATAATCGCTCCGGTTATTTCCGGGATAAATGTACTACCGCAGTTa < 1:453594/140‑1 (MQ=255)
cacaCGCAGACGCAGAGTATCGTT‑AAGATGTCCATATTGTTGGTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACGGGTATTTAATATTGTTAAACCCTGATAATCGCTCCGGTTATTTCCGGGATAAATGTACTACCGCAGTTACt > 1:270147/1‑140 (MQ=255)
agacgcagaGTATCGTT‑AAGATGTCCATATTGTTGGTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACGGGTATTTAATATTGTTAAACCCTGATAATCGCTCCGGTTATTTCCGGGATAAATGTACTACCGCAGTTACTATCATAg > 2:722023/1‑140 (MQ=255)
agTATCGTT‑AAGATGTCCATATTGTTGTTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACGGGTATTTAATATTGTTAAACCCTGATAATCGCTCCGGTTATTTCCGGGATAAATGTACTACCGCAGTTACTATCATAGCCCCGACa > 2:743679/1‑140 (MQ=255)
aGATGTCCATATTGTTGGTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACGGGTATTTAATATTGTTAAACCCTGATAATCGCTCCGGTTATTTCCGGGATAAATGTACTACCGCAGTTACTATCATAGCCCCGACAATAAAACTTg > 1:703662/1‑140 (MQ=255)
aTGTCCATATTGTTGGTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACGGGTATTTAATATTGTTAAACCCTGATAATCGCTCCGGTTATTTCCGGGATAAATGTACTACCGCAGTTACTATCATAGCCCCGACAATAAAACTTGcc > 1:351346/1‑140 (MQ=255)
gTCCATATTGTTGGTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACGGGTATTTAATATTGTTAAACCCTGATAATCGCTCCGGTTATTTCCGGGATAAATGTACTACCGCAGTTACTATCATAGCCCCGACAATAAAACTTGCCgg > 1:664385/1‑140 (MQ=255)
tCCATATTGTTGGTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACGGGTATTTAATATTGTTAAACCCTGATAATCGCTCCGGTTATTTCCGGGATAAATGTACTACCGCAGTTACTATCATAGCCCCGACAATaaaa > 2:953397/1‑131 (MQ=255)
tCCATATTGTTGGTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACGGGTATTTAATATTGTTAAACCCTGATAATCGCTCCGGTTATTTCCGGGATAAATGTACTACCGCAGTTACTATCATAGCCCCGACAATaaaa < 1:953397/131‑1 (MQ=255)
tCCATATTGTTGGTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACGGGTATTTAATATTGTTAAACCCTGATAATCGCTCCGGTTATTTCCGGGATAAATGTACTACCGCAGTTACTATCATAGCCCCGACAATAAAACTTGCCggg > 2:1177782/1‑140 (MQ=255)
ccATATTGTTGGTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACGGGTATTTAATATTGTTAAACCCTGATAATCGCTCCGGTTATTTCCGGGATAAATGTACTACCGCAGTTACTATCATAGCCCCGACAATAAAACTTGCCgggg > 2:162874/1‑140 (MQ=255)
tgttggTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACGGGTATTTAATATTGTTAAACCCTGATAATCGCTCCGGTTATTTCCGGGATAAATGTACTACCGCAGTTACTATCATAGCCCCGACAATAAAACTTGCCGGGGCttttt > 1:724016/1‑140 (MQ=255)
|
TATAGGCGTTATACTTTACAGCAACAGTACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAAGGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTT‑AAGATGTCCATATTGTTGTTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACGGGTATTTAATATTGTTAAACCCTGATAATCGCTCCGGTTATTTCCGGGATAAATGTACTACCGCAGTTACTATCATAGCCCCGACAATAAAACTTGCCGGGGCTTTTT > NC_000913/3121358‑3121625
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
