Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A2 F28 I1 R1
|
129 |
74.0 |
2524844 |
99.2% |
2504645 |
138.6 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,128,145 |
(T)8→7 |
intergenic (‑124/‑127) |
glcD ← / → glcC |
glycolate dehydrogenase, putative FAD‑linked subunit/DNA‑binding transcriptional dual regulator GlcC |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,128,138 | 0 | T | . | 100.0%
| 397.6
/ NA
| 94 | intergenic (‑117/‑134) | glcD/glcC | glycolate dehydrogenase, putative FAD‑linked subunit/DNA‑binding transcriptional dual regulator GlcC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base . (46/48); total (46/48) |
Only 100 of 101 total aligned reads displayed.
GTACAAGATGCTCATGAGTAGGCTTCGCTTTGTTGTGTTGTGTGGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCATTTTTTTTCCAGCTCTGTGACCTTGTCTTGGTTAACTCAATGTTAAATTGATGTAACATAATCACTTACGTGATGTGCGTGTTTTGCGAGTTAAGAACAGAAAAATTGGTCCTACCTGTGCACGAGGTCCGG > NC_000913/3128007‑3128269
|
gTACAAGATGCTCATGAGTAGGCTTCGCTTTGTTGTGTTGTGTGG‑‑GCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCAtttttttccag > 2:436712/1‑136 (MQ=255)
aCAAGATGCTCATGAGTAGGCTTCGCTTTGTTGTGTTGTGTGGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCAtttttttccag < 2:826598/140‑5 (MQ=255)
aTGCTCATGAGTAGGCTTCGCTTTGTTGTGTTGTGTGGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑TTTTTTTCCAGCTCtg < 1:504816/140‑1 (MQ=255)
aTGCTCATGAGTAGGCTTCGCTTTGTTGTGTTGTGTGGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑TTTTTTTCCAGCTCtg < 2:619304/140‑1 (MQ=255)
gCTCATGAGTAGGCTTCGCTTTGTTGTGTTGTGTGGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑TTTTTTTCCAGCTCtgtg > 2:239235/1‑140 (MQ=255)
gCTCATGAGTAGGCTTCGCTTTGTTGTGTTGTGTGGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑TTTTTTTCCAGCTCtgtg > 1:288459/1‑140 (MQ=255)
gCTCATGAGTAGGCTTCGCTTTGTTGTGTTGTGTGGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑TTTTTTTCCAGCTCtgtg > 2:202744/1‑140 (MQ=255)
gCTCATGAGTAGGCTTCGCTTTGTTGTGTTGTGTGGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑TTTTTTTCCAGCTCtgtg > 1:1123319/1‑140 (MQ=255)
gCTCATGAGTAGGCTTCGCTTTGTTGTGTTGTGTGGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑TTTTTTTCCAGCTCtgtg > 2:818124/1‑140 (MQ=255)
gCTCATGAGTAGGCTTCGCTTTGTTGTGTTGTGTGGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑TTTTTTTCCAGCTCtgtg > 2:248067/1‑140 (MQ=255)
gCTCATGAGTAGGCTTCGCTTTGTTGTGTTGTGTGGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑TTTTTTTCCAGCTCtg > 2:556646/1‑138 (MQ=255)
gCTCATGAGTAGGCTTCGCTTTGTTGTGTTGTGTGGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑TTTTTTTCCAGCTCtg < 1:556646/138‑1 (MQ=255)
tCATGAGTAGGCTTCGCTTTGTTGTGTTGTGTGGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑TTTTTTTCCAGctct < 2:638534/135‑1 (MQ=255)
tCATGAGTAGGCTTCGCTTTGTTGTGTTGTGTGGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑TTTTTTTCCAGctct > 1:638534/1‑135 (MQ=255)
tCATGAGTAGGCTTCGCTTTGTTGTGTTGTGTGGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑TTTTTTTCCAGCTCTGTGAc < 2:288459/140‑1 (MQ=255)
tCATGAGTAGGCTTCGCTTTGTTGTGTTGTGTGGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑TTTTTTTCCAGCTCTGTGAc < 1:1232297/140‑1 (MQ=255)
cATGAGTAGGCTTCGCTTTGTTGTGTTGTGTGGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑TTTTTTTCCAGCTCTGTGAcc < 1:248067/140‑1 (MQ=255)
cATGAGTAGGCTTCGCTTTGTTGTGTTGTGTGGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑TTTTTTTCCAGCTCTGTGAcc < 2:42395/140‑1 (MQ=255)
cATGAGTAGGCTTCGCTTTGTTGTGTTGTGTGGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑TTTTTTTCCAGCTCTGTGAcc < 1:55423/140‑1 (MQ=255)
tGAGTAGGCTTCGCTTTGTTGTGTTGTGTGGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑TTTTTTTCCAGCTCTGTGACCtt > 2:1103555/1‑140 (MQ=255)
aGTAGGCTTCGCTTTGTTGTGTTGTGTGGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCAtttttttcc < 1:150535/124‑3 (MQ=255)
aGTAGGCTTCGCTTTGTTGTGTTGTGTGGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCAtttttttcc > 2:150535/1‑122 (MQ=255)
aGTAGGCTTCGCTTTGTTGTGTTGTGTGGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCAtttttttcc < 1:919229/124‑3 (MQ=255)
aGTAGGCTTCGCTTTGTTGTGTTGTGTGGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCAtttttttcc > 2:919229/1‑122 (MQ=255)
gTAGGCTTTGCTTTGGTTGGTTGTGTGGCCGGTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑TTTTTTTCCAGCTCTGTGACCTTGTc < 2:917875/140‑1 (MQ=255)
gCTTCGCTTTGTTGTGTTGTGTGGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑‑TTTTTTCCAGCTCTGTGACCTTGTCTTGGt > 1:16233/1‑140 (MQ=255)
cTTCGCTTTGTTGTGTTGTGTGGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑TTTTTTTCCAGCTCTGTGACCTTGTCTTGGt < 1:616770/140‑1 (MQ=255)
ttCGCTTTGTTGTGTTGTGTGGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAGGCGGGCTTTTCGTTTTAGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑TTTTTTTCCAGCTCtgt > 2:831900/1‑125 (MQ=255)
ttCGCTTTGTTGTGTTGTGTGGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑TTTTTTTCCAGCTCtgt < 1:831900/125‑1 (MQ=255)
ttCGCTTTGTTGTGTTGTGTGG‑‑GCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑TTTTTTTCCAGCTCTGTGACCTTGTCTTGGTTaa < 1:436712/140‑1 (MQ=255)
cGCTTTGTTGTGTTGTGTGGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑TTTTTTTCCAGCTCTGTGACCTTGTCTTGGTTaa > 2:331206/1‑140 (MQ=255)
cTTTGTTGTGTTGTGTGGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑TTTTTTTCCAGCTCTGTGACCTTGTCTTGGTTAACt < 2:441558/140‑1 (MQ=255)
ttgttgTGTTGTGTGGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑TTTTTTTCCAGCTCTGTGACCTTGTCTTGGTTAACTCa < 1:93742/140‑1 (MQ=255)
tgtgtgGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑TTTTTTTCCAGCTCTGTGACCTTGTCTTGGTTAACTCAATGTTAAAt < 2:204376/140‑1 (MQ=255)
tgtgGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑TTTTTTTCCAGCTCTGTGACCTTGTCTTGGTTAACTCAATGTTAAATTg > 1:491898/1‑140 (MQ=255)
tgtgGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑TTTTTTTCCAGCTCTGTGACCTTGTCTTGGTTAACTCAATGTTAAATTg > 1:150073/1‑140 (MQ=255)
tgtgGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑TTTTTTTCCAGCTCTGTGACCTTGTCTTGGTTAACTCAATGTTAAATTg > 2:467158/1‑140 (MQ=255)
tgtgGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑TTTTTTTCCAGCTCTGTGACCTTGTCTTGGTTAACTCAATGTTAAATTg > 2:1020641/1‑140 (MQ=255)
tgtgGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑TTTTTTTCCAGCTCTGTGACCTTGTCTTGGTTAACTCAATGTTAAATTg > 1:1078239/1‑140 (MQ=255)
gtgGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑TTTTTTTCCAGCTCTGTGACCTTGTCTTGGTTAACTCAATGTTAAATTGa > 1:841463/1‑140 (MQ=255)
gtgGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑TTTTTTTCCAGCTCTGTGACCTTGTCTTGGTTAACTCAATGTTAAATTGa > 1:872400/1‑140 (MQ=255)
tgGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑TTTTTTTCCAGCTCTGTGACCTTGTCTTGGTTAAcattgag > 1:740343/1‑124 (MQ=255)
tgGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑TTTTTTTCCAGCTCTGTGACCTTGTCTTGGTTAAcattgag < 2:740343/130‑7 (MQ=255)
tgGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑TTTTTTTCCAGCTCTGTGACCTTGTCTTGGTTAACt > 1:192915/1‑125 (MQ=255)
tgGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑TTTTTTTCCAGCTCTGTGACCTTGTCTTGGTTAACt < 2:192915/125‑1 (MQ=255)
tgGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑TTTTTTTCCAGCTCTGTGACCTTGTCTTGGTTAACTCAATGTTAAATTGAt < 1:1020641/140‑1 (MQ=255)
tgGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑TTTTTTTCCAGCTCTGTGACCTTGTCTTGGTTAACTCAATGTTAAATTGAt < 1:467158/140‑1 (MQ=255)
gCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑‑TTTTTTCCAGCTCTGTGACCTTGTCTTGGTTAACTCAATGTTAAATTGATGTa < 2:16233/140‑1 (MQ=255)
cAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCATACCA‑TTTTTTTCCAGCTCTGTGACCTTGTCTTGGTTAACTCAATGTTAAATTGATGTa < 1:331206/140‑1 (MQ=255)
gCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑TTTTTTTCCAGCTCTGTGACCTTGTCTTGGTTAACTCAATGTTAAATTGATGTAAc > 2:1007479/1‑140 (MQ=255)
gCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑TTTTTTTCCAGCTCTGTGACCTTGTCTTGGTTAACTCAATGTTAAATTGATGTAAc > 2:609486/1‑140 (MQ=255)
gCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑TTTTTTTCCAGCTCTGTGACCTTGTCTTGGTTAACTCAATGTTAAATTGATGTAAc > 1:679635/1‑140 (MQ=255)
cTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑TTTTTTTCCAGCTCTGTGACCTTGTCTTGGTTAACTCAATGTTAAATTGATGTAACa > 1:748991/1‑140 (MQ=255)
tGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑TTTTTTTCCAGCTCTGTGACCTTGTCTTGGTTAACTCAATGTTAAATTGATGTAACAt < 2:1078239/140‑1 (MQ=255)
gATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑TTTTTTTCCAGCTCTGTGACCTTGTCTTGGTTAACTCAATGTTAAATTGATGTAACATa < 2:872400/140‑1 (MQ=255)
gATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑TTTTTTTCCAGCTCTGTGACCTTGTCTTGGTTAACTCAATGTTAAATTGATGTAACATa < 2:841463/140‑1 (MQ=255)
gATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑TTTTTTTCCAGCTCTGTGACCTTGTCTTGGTTAACTCAATGTTAAATTGATGTAACATa > 2:704875/1‑140 (MQ=255)
gATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑TTTTTTTCCAGCTCTGTGACCTTGTCTTGGTTAACTCAATGTTAAATTGATGTAACATa > 1:134813/1‑140 (MQ=255)
tttttGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑TTTTTTTCCAGCTCTGTGACCTTGTCTTGGTTAACTCAATGTTAAATTGATGTAACATAAt < 1:1007479/140‑1 (MQ=255)
tttttGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑TTTTTTTCCAGCTCTGTGACCTTGTCTTGGTTAACTCAATGTTAAATTGATGTAACATAAt < 1:1065845/140‑1 (MQ=255)
tttttGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑TTTTTTTCCAGCTCTGTGACCTTGTCTTGGTTAACTCAATGTTAAATTGATGTAACATAAt < 1:1103555/140‑1 (MQ=255)
tttttGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑TTTTTTTCCAGCTCTGTGACCTTGTCTTGGTTAACTCAATGTTAAATTGATGTAACATAAt < 1:202744/140‑1 (MQ=255)
gctgctTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑TTTTTTTCCAGCTCTGTGACCTTGTCTTGGTTAACTCAATGTTAAATTGATGTAACATAATCACTTACGt < 2:679635/140‑1 (MQ=255)
ctTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑TTTTTTTCCAGCTCTGTGACCTTGTCTTGGTTAACTCAATGTTAAATTGATGTAACATAATCACTTACGTGAtg < 1:237706/140‑1 (MQ=255)
aaCAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑TTTTTTTCCAGCTCTGTGACCTTGTCTTGGTTAACTCAATGTTAAATTGATGTAACATAATCACTTACGTGATGTGCGTGtt > 1:775363/1‑140 (MQ=255)
aaCAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑TTTTTTTCCAGCTCTGTGACCTTGTCTTGGTTAACTCAATGTTAAATTGATGTAACATAATCACTTACGTGATGTGCGTGtt > 2:112511/1‑140 (MQ=255)
cAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑TTTTTTTCCAGCTCTGTGACCTTGTCTTGGTTAACTCAATGTTAAATTGATGTAACATAATCACTTACGTGa > 1:546724/1‑128 (MQ=255)
cAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑TTTTTTTCCAGCTCTGTGACCTTGTCTTGGTTAACTCAATGTTAAATTGATGTAACATAATCACTTACGTGa < 2:546724/128‑1 (MQ=255)
cAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑TTTTTTTCCAGCTCTGTGACCTTGTCTTGGTTAACTCAATGTTAAATTGATGTAACATAATCACTTACGTGATGTGCGTGtttt < 1:546946/140‑1 (MQ=255)
cAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑TTTTTTTCCAGCTCTGTGACCTTGTCTTGGTTAACTCAATGTTAAATTGATGTAACATAATCACTTACGTGATGTGCGTGtttt > 2:1223169/1‑140 (MQ=255)
cAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑TTTTTTTCCAGCTCTGTGACCTTGTCTTGGTTAACTCAATGTTAAATTGATGTAACATAATCACTTACGTGATGTGCGTGtttt > 1:1149883/1‑140 (MQ=255)
cAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑TTTTTTTCCAGCTCTGTGACCTTGTCTTGGTTAACTCAATGTTAAATTGATGTAACATAATCACTTACGTGATGTGCGTGtttt < 2:491898/140‑1 (MQ=255)
gTTATTAAGCTGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑TTTTTTTCCAGCTCTGTGACCTTGTCTTGGTTAACTCAATGTTAAATTGATGTAACATAATCACTTACGTGATGTGCGTGTTTTGc < 2:775363/140‑1 (MQ=255)
gTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑TTTTTTTCCAGCTCTGTGACCTTGTCTTGGTTAACTCAATGTTAAATTGATGTAACATAATCACTTACGTGATGTGCGTGTTTTGc < 2:134813/140‑1 (MQ=255)
gTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑TTTTTTTCCAGCTCTGTGACCTTGTCTTGGTTAACTCAATGTTAAATTGATGTAACATAATCACTTACGTGATGTGCGTGTTTTGc < 2:764355/140‑1 (MQ=255)
tattaAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑TTTTTTTCCAGCTCTGTGACCTTGTCTTGGTTAACTCAATGTTAAATTGATGTAACATAATCACTTACGTGATGTGCGTGTTTTGc > 2:615918/1‑138 (MQ=255)
tattaAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑TTTTTTTCCAGCTCTGTGACCTTGTCTTGGTTAACTCAATGTTAAATTGATGTAACATAATCACTTACGTGATGTGCGTGTTTTGc < 1:615918/138‑1 (MQ=255)
aaGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑TTTTTTTCCAGCTCTGTGACCTTGTCTTGGTTAACTCAATGTTAAATTGATGTAACATAATCACTTACGTGATGTGCgtgt < 1:1025218/129‑1 (MQ=255)
aaGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑TTTTTTTCCAGCTCTGTGACCTTGTCTTGGTTAACTCAATGTTAAATTGATGTAACATAATCACTTACGTGATGTGCgtgt > 2:1025218/1‑129 (MQ=255)
cGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑TTTTTTTCCAGCTCTGTGACCTTGTCTTGGTTAACTCAATGTTAAATTGATGTAACATAATCACATACGTGATGTGCGTGTTTTGCGAGTTAAGa > 2:769802/1‑140 (MQ=255)
ggCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑TTTTTTTCCAGCTCTGTGACCTTGTCTTGGTTAACTCAATGTTAAATTGATGTAACATAATCACTTACGTGATGTGCGTGTTTTGCGAGTTAAGAAc > 1:139675/1‑140 (MQ=255)
ggCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑TTTTTTTCCAGCTCTGTGACCTTGTCTTGGTTAACTCAATGTTAAATTGATGTAACATAATCACTTACGTGATGTGCGTGTTTTGCGAGTTAAGAAc > 1:733900/1‑140 (MQ=255)
ggCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑TTTTTTTCCAGCTCTGTGACCTTGTCTTGGTTAACTCAATGTTAAATTGATGTAACATAATCACTTACGTGATGTGCGTGTTTTGCGAGTTAAGAAc > 1:1137196/1‑140 (MQ=255)
ggCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑TTTTTTTCCAGCTCTGTGACCTTGTCTTGGTTAACTCAATGTTAAATTGATGTAACATAATCACTTACGTGATGTGCGTGTTTTGCGAGTTAAGAAc > 2:649769/1‑140 (MQ=255)
cTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑TTTTTTTCCAGCTCTGTGACCTTGTCTTGGTTAACTCAATGTTAAATTGATGTAACATAATCACTTACGTGATGTGCGTGTTTTGCGAGTTAAGAACAg > 2:412155/1‑140 (MQ=255)
ttttcgttttcgTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑TTTTTTTCCAGCTCTGTGACCTTGTCTTGGTTAACTCAATGTTAAATTGATGTAACATAATCACTTACGTGATGTGCGTGTTTTGCGAGTTAAGAACAGa < 1:112511/140‑1 (MQ=255)
cgttttcgtCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑TTTTTTTCCAGCTCTGTGACCTTGTCTTGGTTAACTCAATGTTAAATTGATGTAACATAATCACTTACGTGATGTGCGTGTTTTGCGAGTTAAGAACAGaaaaa < 1:649769/140‑1 (MQ=255)
cgttttcgtCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑TTTTTTTCCAGCTCTGTGACCTTGTCTTGGTTAACTCAATGTTAAATTGATGTAACATAATCACTTACGTGATGTGCGTGTTTTGCGAGTTAAGAACAGaaaaa < 2:543759/140‑1 (MQ=255)
ttttcgtCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑TTTTTTTCCAGCTCTGTGACCTTGTCTTGGTTAACTCAATGTTAAATTGATGTAACATAATCACTTACGTGATGTGCGTGTTTTGCGAGTTAAGAACAGAAAAAtt < 2:1149883/140‑1 (MQ=255)
gtCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCA‑TTTTTTTCCAGCTCTGTGACCTTGTCTTGGTTAACTCAATGTTAAATTGATGTAACATAATCACTTACGTGATGTGCGTGTTTTGCGAGTTAAGAACAGAAAAATTGGTcc < 2:1114789/140‑1 (MQ=255)
tAGCTACCGGTCAGACCA‑TTTTTTTCCAGCTCTGTGACCTTGTCTTGGTTAACTCAATGTTAAATTGATGTAACATAATCACTTACGTGATGTGCGTGTTTTGCGAGTTAAGAACAGAAAAATTGGTCCTACCTGTGCAc > 2:731768/1‑140 (MQ=255)
aGCTACCGGTCAGACCA‑TTTTTTTCCAGCTCTGTGACCTTGTCTTGGTTAACTCAATGTTAAATTGATGTAACATAATCACTTACGTGATGTGCGTGTTTTGCGAGTTAAGAACAGAAAAATTGGTCCTACCTGTGCACg < 2:395483/140‑1 (MQ=255)
aGCTACCGGTCAGACCA‑TTTTTTTCCAGCTCTGTGACCTTGTCTTGGTTAACTCAATGTTAAATTGATGTAACATAATCACTTACGTGATGTGCGTGTTTTGCGAGTTAAGAACAGAAAAATTGGTCCTACCTGTGCACg < 1:456207/140‑1 (MQ=255)
tACCGGTCAGACCA‑TTTTTTTCCAGCTCTGTGACCTTGTCTTGGTTAACTCAATGTTAAATTGATGTAACATAATCACTTACGTGATGTGCGTGTTTTGCGAGTTAAGAACAGAAAAATTGGTCCTACCTGTGCACGAgg > 2:498093/1‑140 (MQ=255)
aCCGGTCAGACCA‑TTTTTTTCCAGCTCTGTGACCTTGTCTTGGTTAACTCAATGTTAAATTGATGTAACATAATCACTTACGTGATGTGCGTGTTTTGCGAGTTAAGAACAGAAAAATTGGTCCTACCTGTGCACGAGGt > 1:1121979/1‑140 (MQ=255)
ccGGTCAGACCA‑TTTTTTTCCAGCTCTGTGACCTTGTCTTGGTTAACTCAATGTTAAATTGATGTAACATAATCACTTACGTGATGTGCGTGTTTTGCGAGTTAAGAACAGAAAAATTGGTCCT‑CCTGTGCACGAGGTcc > 2:80305/1‑140 (MQ=255)
cGGTCAGACCA‑TTTTTTTCCAGCTCTGTGACCTTGTCTTGGTTAACTCAATGTTAAATTGATGTAACATAATCACTTACGTGATGTGCGTGTTTTGCGAGTTAAGAACAGAAAAATTGGTCCTACCTGTGCACGAGGTcc > 2:1188349/1‑140 (MQ=255)
ggTCAGACCA‑TTTTTTTCCAGCTCTGTGACCTTGTCTTGGTTAACTCAATGTTAAATTGATGTAACATAATCACTTACGTGATGTGCGTGTTTTGCGAGTTAAGAACAGAAAAATTGGTCCTACCTGTGCACGAGGTCCg < 2:1123319/140‑1 (MQ=255)
ggTCAGACCA‑TTTTTTTCCAGCTCTGTGACCTTGTCTTGGTTAACTCAATGTTAAATTGATGTAACATAATCACTTACGTGATGTGCGTGTTTTGCGAGTTAAGAACAGAAAAATTGGTCCTACCTGTGCACGAGGTCCg < 1:704875/140‑1 (MQ=255)
gTCAGACCA‑TTTTTTTCCAGCTCTGTGACCTTGTCTTGGTTAACTCAATGTTAAATTGATGTAACATAATCACTTACGTGATGTGCGTGTTTTGCGAGTTAAGAACAGAAAAATTGGTCCTACCTGTGCACGAGGTCCgg > 1:142226/1‑140 (MQ=255)
|
GTACAAGATGCTCATGAGTAGGCTTCGCTTTGTTGTGTTGTGTGGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCATTTTTTTTCCAGCTCTGTGACCTTGTCTTGGTTAACTCAATGTTAAATTGATGTAACATAATCACTTACGTGATGTGCGTGTTTTGCGAGTTAAGAACAGAAAAATTGGTCCTACCTGTGCACGAGGTCCGG > NC_000913/3128007‑3128269
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
