Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A10 F28 I1 R1
|
126 |
51.4 |
1736588 |
99.0% |
1719222 |
138.7 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,262,524 |
A→G |
G324G (GGT→GGC) |
fruB ← |
fructose‑specific PTS multiphosphoryl transfer protein FruB |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,262,524 | 0 | A | G | 100.0%
| 213.7
/ NA
| 61 | G324G (GGT→GGC) | fruB | fructose‑specific PTS multiphosphoryl transfer protein FruB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (30/31); total (30/31) |
GCAGCGATAGCGTCGCCGATTGCTTTCAGCGCCTGTTCAGCATCTGCACCCTGGGCGGTAAAGCGTAGGCGATGACCTTTCTTAACGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTACCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTAATGGTATTGACCAGCATGGTACCTGGACGAGCATGCAGGCCGTGTTCATTGCGCACCACAAACTCCGCGCTTAACACGTCGTCGGTCGG > NC_000913/2262387‑2262655
|
gcagcGATAGCGTCGCCGATTGCTTTCAGCGCCTGTTCAGCATCTGCACCCTGGGCGGTAAAGCGTAGGCGATGACCTTTCTTAACGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTGcc > 1:658659/1‑140 (MQ=255)
gcagcGATAGCGTCGCCGATTGCTTTCAGCGCCTGTTCAGCATCTGCACCCTGGGCGGTAAAGCGTAGGCGATGACCTTTCTTAACGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTGcc > 2:422671/1‑140 (MQ=255)
gcagcGATAGCGTCGCCGATTGCTTTCAGCGCCTGTTCAGCATCTGCACCCTGGGCGGTAAAGCGTAGGCGATGACCTTTCTTAACGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTGcc > 1:795317/1‑140 (MQ=255)
gcagcGATAGCGTCGCCGATTGCTTTCAGCGCCTGTTCAGCATCTGCACCCTGGGCGGTAAAGCGTAGGCGATGACCTTTCTTAACGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTGcc > 2:237309/1‑140 (MQ=255)
aTAGCGTCGCCGATTGCTTTCAGCGCCTGTTCAGCATCTGCACCCTGGGCGGTAAAGCGTAGGCGATGACCTTTCTTAACGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTGCCATCAAg > 2:459015/1‑140 (MQ=255)
aGCGTCGCCGATTGCTTTCAGCGCCTGTTCAGCATCTGCACCCTGGGCGGTAAAGCGTAGGCGATGACCTTTCTTAACGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTGCCATCAAGGt < 1:192041/140‑1 (MQ=255)
cGTCGCCGATTGCTTTCAGCGCCTGTTCAGCATCTGCACCCTGGGCGGTAAAGCGTAGGCGATGACCTTTCTTAACGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTGCCATCAAGGttt > 1:242262/1‑140 (MQ=255)
gTCGCCGATTGCTTTCAGCGCCTGTTCAGCATCTGCACCCTGGGCGGTAAAGCGTAGGCGATGACCTTTCTTAACGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTGCCATCAAGGTTTg > 1:737958/1‑140 (MQ=255)
tCGCCGATTGCTTTCAGCGCCTGTTCAGCATCTGCACCCTGGGCGGTAAAGCGTAGGCGATGACCTTTCTTAACGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTGCCATCAAGGTTTGt < 2:795317/140‑1 (MQ=255)
tCGCCGATTGCTTTCAGCGCCTGTTCAGCATCTGCACCCTGGGCGGTAAAGCGTAGGCGATGACCTTTCTTAACGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTGCCATCAAGGTTTGt < 2:701235/140‑1 (MQ=255)
tCGCCGATTGCTTTCAGCGCCTGTTCAGCATCTGCACCCTGGGCGGTAAAGCGTAGGCGATGACCTTTCTTAACGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTGCCATCAAGGTTTGt < 2:76063/140‑1 (MQ=255)
cGCCGATTGCTTTCAGCGCCTGTTCAGCATCTGCACCCTGGGCGGTAAAGCGTAGGCGATGACCTTTCTTAACGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTGCCATCAAGGTTTGTc < 1:313624/140‑1 (MQ=255)
cGCCGATTGCTTTCAGCGCCTGTTCAGCATCTGCACCCTGGGCGGTAAAGCGTAGGCGATGACCTTTCTTAACGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTGCCATCAAGGTTTGTc < 1:78419/140‑1 (MQ=255)
gCCGATTGCTTTCAGCGCCTGTTCAGCATCTGCACCCTGGGCGGTAAAGCGTAGGCGATGACCTTTCTTAACGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTGCCATCAAGGTTTGTCa > 2:227855/1‑140 (MQ=255)
gCCGATTGCTTTCAGCGCCTGTTCAGCATCTGCACCCTGGGCGGTAAAGCGTAGGCGATGACCTTTCTTAACGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTGCCATCAAGGTTTGTCa > 2:592820/1‑140 (MQ=255)
ccGATTGCTTTCAGCGCCTGTTCAGCATCTGCACCCTGGGCGGTAAAGCGTAGGCGATGACCTTTCTTAACGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTGCCATCAAGGTTTGTCAc < 1:286827/140‑1 (MQ=255)
tttCAGCGCCTGTTCAGCATCTGCACCCTGGGCGGTAAAGCGTAGGCGATGACCTTTCTTAACGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTGCCATCAAGGTTTGTCACGGTAatat < 1:237309/140‑1 (MQ=255)
tCAGCGCCTGTTCAGCATCTGCACCCTGGGCGGTAAAGCGTAGGCGATGACCTTTCTTAACGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTGCCATCAAGGTTTGTCa > 1:371088/1‑129 (MQ=255)
tCAGCGCCTGTTCAGCATCTGCACCCTGGGCGGTAAAGCGTAGGCGATGACCTTTCTTAACGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTGCCATCAAGGTTTGTCa < 2:371088/129‑1 (MQ=255)
tCAGCGCCTGTTCAGCATCTGCACCCTGGGCGGTAAAGCGTAGGCGATGACCTTTCTTAACGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTGCCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCa < 2:472793/140‑1 (MQ=255)
gcgcCTGTTCAGCATCTGCACCCTGGGCGGTAAAGCGTAGGCGATGACCTTTCTTAACGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTGCCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTg < 1:853777/140‑1 (MQ=255)
cTGTTCAGCATCTGCACCCTGGGCGGTAAAGCGTAGGCGATGACCTTTCTTAACGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTGCCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTaa > 2:474353/1‑140 (MQ=255)
cTGTTCAGCATCTGCACCCTGGGCGGTAAAGCGTAGGCGATGACCTTTCTTAACGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTGCCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTaa > 2:228742/1‑140 (MQ=255)
tGTTCAGCATCTGCACCCTGGGCGGTAAAGCGTAGGCGATGACCTTTCTTAACGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTGCCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTaaa > 1:579254/1‑140 (MQ=255)
tGTTCAGCATCTGCACCCTGGGCGGTAAAGCGTAGGCGATGACCTTTCTTAACGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTGCCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTaaa < 2:242262/140‑1 (MQ=255)
tGTTCAGCATCTGCACCCTGGGCGGTAAAGCGTAGGCGATGACCTTTCTTAACGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTGCCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTaaa < 1:227855/140‑1 (MQ=255)
ttCAGCATCTGCACCCTGGGCGGTAAAGCGTAGGCGATGACCTTTCTTAACGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTGCCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAAtt > 1:664231/1‑140 (MQ=255)
aGCATCTGCACCCTGGGCGGTAAAGCGTAGGCGATGACCTTTCTTAACGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTGCCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGtt < 1:817039/140‑1 (MQ=255)
cATCTGCACCCTGGGCGGTAAAGCGTAGGCGATGACCTTTCTTAACGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTGCCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTa > 1:481440/1‑140 (MQ=255)
aTCTGCACCCTGGGCGGTAAAGCGTAGGCGATGACCTTTCTTAACGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTGCCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTaa < 1:592820/140‑1 (MQ=255)
gCACCCTGGGCGGTAAAGCGTAGGCGATGACCTTTCTTAACGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTGCCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTAATGGt > 1:206859/1‑140 (MQ=255)
aCCCTGGGCGGTAAAGCGTAGGCGATGACCTTTCTTAACGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTGCCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTAATGGTAt < 2:579254/140‑1 (MQ=255)
cccTGGGCGGTAAAGCGTAGGCGATGACCTTTCTTAACGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTGCCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTAATGGTAtt > 1:802510/1‑140 (MQ=255)
cccTGGGCGGTAAAGCGTAGGCGATGACCTTTCTTAACGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTGCCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTAATGGTAtt < 1:705149/140‑1 (MQ=255)
tGGGCGGTAAAGCGTAGGCGATGACCTTTCTTAACGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTGCCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTAATGGTATTGAc < 2:206859/140‑1 (MQ=255)
tGGGCGGTAAAGCGTAGGCGATGACCTTTCTTAACGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTGCCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTAATGGTATTGAc > 1:475722/1‑140 (MQ=255)
tGGGCGGTAAAGCGTAGGCGATGACCTTTCTTAACGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTGCCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTAATGGTATTGAc < 2:475722/140‑1 (MQ=255)
ggCGGTAAAGCGTAGGCGATGACCTTTCTTAACGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTGCCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTAATGGTATTGACCa > 1:665186/1‑140 (MQ=255)
ggCGGTAAAGCGTAGGCGATGACCTTTCTTAACGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTGCCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTAATGGTATTGACCa > 1:210756/1‑140 (MQ=255)
ggTAAAGCGTAGGCGATGACCTTTCTTAACGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTGCCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTAATGGTATTGACCAGCa < 2:802510/140‑1 (MQ=255)
gTAAAGCGTAGGCGATGACCTTTCTTAACGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTGCCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTAATGGTATTGACCAGCAt < 1:422671/140‑1 (MQ=255)
aaaGCGTAGGCGATGACCTTTCTTAACGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTGCCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTAATGGTATTGAc > 1:195172/1‑132 (MQ=255)
aaaGCGTAGGCGATGACCTTTCTTAACGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTGCCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTAATGGTATTGAc < 2:195172/132‑1 (MQ=255)
cGTAGGCGATGACCTTTCTTAACGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTGCCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTAATGGTATTGACCAGCa < 2:646922/133‑1 (MQ=255)
cGTAGGCGATGACCTTTCTTAACGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTGCCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTAATGGTATTGACCAGCa > 1:646922/1‑133 (MQ=255)
gCGATGACCTTTCTTAACGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTGCCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTAATGGTATTGACCAGCATGGTACCTGGAc < 2:658659/140‑1 (MQ=255)
tGACCTTTCTTAACGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTGCCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTAATGGTATTGACCAGCATGGTACCTGGACGAGc > 2:205492/1‑140 (MQ=255)
gACCTTTCTTAACGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTGCCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTAATGGTATTGACCAGCATGGTACCTGGACGAGCa > 1:840848/1‑140 (MQ=255)
gACCTTTCTTAACGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTGCCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTAATGGTATTGACCAGCATGGTACCTGGACGAGCa > 2:561667/1‑140 (MQ=255)
cTTTCTTAACGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTGCCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTAATGGTATTGACCAGCATGGTACCTGGACGAGCATGc < 1:459015/140‑1 (MQ=255)
cTTAACGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTGCCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTAATGGTATTGACCAGCATGGTACCTGGACGAGCATGCAGGc < 2:481440/140‑1 (MQ=255)
cTTAACGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTGCCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTAATGGTATTGACCAGCATGGTACCTGGACGAGCATGCAGGc < 2:840848/140‑1 (MQ=255)
cGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTGCCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTAATGGTATTGACCAGCATGGTACCTGGACGAGCATGCAGGCCgtgt > 2:272205/1‑140 (MQ=255)
gCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTGCCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTAATGGTATTGACCAGCATGGTACCTGGACGAGCATGCAGGCCGTGtt > 1:694201/1‑140 (MQ=255)
aaGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTGCCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTAATGGTATTGACCAGCATGGTACCTGGACGAGCATGCAGGCCGTGTTCAt > 2:561090/1‑140 (MQ=255)
gTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTGCCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTAATGGTATTGACCAGCATGGTACCTGGACGAGCATGCAGGCCGTGTTCATTg > 1:271136/1‑140 (MQ=255)
ccACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTGCCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTAATGGTATTGACCAGCATGGTACCTGGACGAGCATGCAGGCCGTGTTCATTgcgc < 1:272205/140‑1 (MQ=255)
acaACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTGCCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTCTAATGGTATTGACCAGCATGGTACCTGGACGAGCATGCAGGCCGTGTTCATTGCGcac > 2:257279/1‑140 (MQ=255)
caGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTGCCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTAATGGTATTGACCAGCATGGTACCTGGACGAGCATGCAGGCCGTGTTCATTGCGCACCACAAACTCcg < 2:694201/140‑1 (MQ=255)
ttgccggtGCCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTAATGGTATTGACCAGCATGGTACCTGGACGAGCATGCAGGCCGTGTTCATTGCGCACCACAAACTCCGCGCTTAACACGTCGtcggtcgg < 2:271136/140‑1 (MQ=255)
ttgccggtGCCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTAATGGTATTGACCAGCATGGTACCTGGACGAGCATGCAGGCCGTGTTCATTGCGCACCACAAACTCCGCGCTTAACACGTCGtcggtcgg < 1:426738/140‑1 (MQ=255)
|
GCAGCGATAGCGTCGCCGATTGCTTTCAGCGCCTGTTCAGCATCTGCACCCTGGGCGGTAAAGCGTAGGCGATGACCTTTCTTAACGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTACCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTAATGGTATTGACCAGCATGGTACCTGGACGAGCATGCAGGCCGTGTTCATTGCGCACCACAAACTCCGCGCTTAACACGTCGTCGGTCGG > NC_000913/2262387‑2262655
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A