Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A17 F30 I1 R1
|
22 |
146.6 |
4936358 |
99.2% |
4896867 |
138.5 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,504,131 |
T→C |
V25A (GTA→GCA) |
yjhB → |
putative sialic acid transporter |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,504,131 | 0 | T | C | 100.0%
| 802.6
/ NA
| 207 | V25A (GTA→GCA) | yjhB | putative sialic acid transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (106/101); total (106/101) |
Only 100 of 208 total aligned reads displayed.
ATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAAT‑‑‑CCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGATATGTATTTGATGGCTTTGATTTTATGATGATATTTTACATTCTTCATATTATAAAAGCAGATCTTGGCATTACGGATATTCAGGCTACTTTAATAGGGACAGTGGCCTTCATAGCCAGACCTATTGGAGGTGG > NC_000913/4503997‑4504260
|
tgttgAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAAT‑‑‑CCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGATATGCATTTGAt > 2:126910/1‑140 (MQ=255)
tgttgAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAAT‑‑‑CCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGATATGCATTTGAt > 1:1285851/1‑140 (MQ=255)
aGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAAT‑‑‑CCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGATATGCATTTGATGGCtt > 1:1291285/1‑140 (MQ=255)
aGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAAT‑‑‑CCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGATATGCATTTGATGGCtt > 2:1121117/1‑140 (MQ=255)
cccTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAAT‑‑‑CCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGATATGCATTTGATGGCTTTGAtt > 2:398152/1‑140 (MQ=255)
cccTAATATTTACTTTAAGGGCTATACTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAAT‑‑‑CCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGATATGCATTTGATGGCTTTGAtt > 1:1748623/1‑140 (MQ=255)
cTAATATTTACTTTAATGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAAT‑‑‑CCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGATATGCATTTGa < 2:1924419/127‑1 (MQ=255)
cTAATATTTACTTTAATGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAAT‑‑‑CCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGATATGCATTTGa > 1:1924419/1‑127 (MQ=255)
tAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAAT‑‑‑CCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGATATGCATTTGATGGCTTTGATTTTa < 2:631276/140‑1 (MQ=255)
atatTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAAT‑‑‑CCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGATATGCATTTGATGGCTTTGATTTTatg > 1:980383/1‑140 (MQ=255)
tACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAAT‑‑‑CCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGATATGCATTTGATGGCTTTGATTTTATgatgat < 1:1493/140‑1 (MQ=255)
tACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAAT‑‑‑CCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGATATGCATTTGATGGCTTTGATTTTATgatgat < 1:266948/140‑1 (MQ=255)
aCTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAAT‑‑‑CCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGATATGCATTTGATGGCTTTGATTTTatgatg > 2:1661805/1‑137 (MQ=255)
aCTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAAT‑‑‑CCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGATATGCATTTGATGGCTTTGATTTTatgatg < 1:1661805/137‑1 (MQ=255)
aCTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAAT‑‑‑CCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGATATGCATTTGATGGCTTTGATTTTATGATGata > 1:2459914/1‑140 (MQ=255)
aCTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAAT‑‑‑CCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGATATGCATTTGATGGCTTTGATTTTATGATGata > 1:2334162/1‑140 (MQ=255)
aCTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAAT‑‑‑CCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGATATGCATTTGATGGCTTTGATTTTATGATGata > 1:2400531/1‑140 (MQ=255)
aCTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAAT‑‑‑CCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGATATGCATTTGATGGCTTTGATTTTATGATGata > 1:1404950/1‑140 (MQ=255)
tAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAAT‑‑‑CCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGATATGCATTTGATGGCTTTGATTTTATgatgat > 1:1595073/1‑135 (MQ=255)
tAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAAT‑‑‑CCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGATATGCATTTGATGGCTTTGATTTTATGATGATAtttt < 2:2242679/140‑1 (MQ=255)
tAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAAT‑‑‑CCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGATATGCATTTGATGGCTTTGATTTTATGATGATAtttt < 1:152669/140‑1 (MQ=255)
gggCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAAT‑‑‑CCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGATATGCATTTGATGGCTTTGATTTTatga < 2:2078254/128‑1 (MQ=255)
gggCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAAT‑‑‑CCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGATATGCATTTGATGGCTTTGATTTTatga > 1:2078254/1‑128 (MQ=255)
gggCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAAT‑‑‑CCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGATATGCATTTGATGGCTTTGATTTTATGATGATATTTTACa < 2:569164/140‑1 (MQ=255)
cTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAAT‑‑‑CCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGATATGCATTTGATGGCTTTGATTTTATGATGATATTTTACAttc < 2:2400531/140‑1 (MQ=255)
cTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAAT‑‑‑CCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGATATGCATTTGATGGCTTTGATTTTATGATGATATTTTACAttc > 1:1039711/1‑140 (MQ=255)
atatTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAAT‑‑‑CCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGATATGCATTTGATGGCTTTGATTTTatga > 2:1982734/1‑123 (MQ=255)
atatTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAAT‑‑‑CCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGATATGCATTTGATGGCTTTGATTTTatga < 1:1982734/123‑1 (MQ=255)
atatTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAAT‑‑‑CCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGATATGCATTTGATGGCTTTGATTTTATGATGATATTTTACAttctt > 1:157252/1‑140 (MQ=255)
atatTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAAT‑‑‑CCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGATATGCATTTGATGGCTTTGATTTTATGATGATATTTTACAttctt > 1:454261/1‑140 (MQ=255)
ttAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAAT‑‑‑CCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGATATGCATTTGATGGCTTTGATTTTATGATGATATTTTACATTCTTCat < 1:632223/140‑1 (MQ=255)
ttAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAAT‑‑‑CCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGATATGCATTTGATGGCTTTGATTTTATGATGATATTTTACATTCTTCat < 2:914331/140‑1 (MQ=255)
gAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAAT‑‑‑CCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGATATGCATTTGATGGCTTTGATTTTATGATGATATTTTACATTCTTCAtatt > 1:1119903/1‑140 (MQ=255)
aaTAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAAT‑‑‑CCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGATATGCATTTGATGGCTTTGATTTTATGATGATATTTTACATTCTTCat > 2:2438948/1‑136 (MQ=255)
aaTAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAAT‑‑‑CCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGATATGCATTTGATGGCTTTGATTTTATGATGATATTTTACATTCTTCat < 2:214157/136‑1 (MQ=255)
aaTAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAAT‑‑‑CCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGATATGCATTTGATGGCTTTGATTTTATGATGATATTTTACATTCTTCat > 1:214157/1‑136 (MQ=255)
aTAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAAT‑‑‑CCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGATATGCATTTGATGGCTTTGATTTTATGATGATATTTTACATTCTTCAtattat < 2:36373/140‑1 (MQ=255)
acacAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAAT‑‑‑CCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGATATGCATTTGATGGCTTTGATTTTATGATGATATTTTAc < 2:1360661/123‑1 (MQ=255)
acacAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAAT‑‑‑CCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGATATGCATTTGATGGCTTTGATTTTATGATGATATTTTACAttctt > 2:3147/1‑129 (MQ=255)
acacAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAAT‑‑‑CCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGATATGCATTTGATGGCTTTGATTTTATGATGATATTTTACAttctt < 1:3147/129‑1 (MQ=255)
acacAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAAT‑‑‑CCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGATATGCATTTGATGGCTTTGATTTTATGATGATATTTTACATTCTTCATATTATaaa > 2:1476681/1‑140 (MQ=255)
acacAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAAT‑‑‑CCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGATATGCATTTGATGGCTTTGATTTTATGATGATATTTTACATTCTTCATATTATaaa > 2:2186242/1‑140 (MQ=255)
acacAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAAT‑‑‑CCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGATATGCATTTGATGGCTTTGATTTTATGATGATATTTTACATTCTTCATATTATaaa > 1:2050059/1‑140 (MQ=255)
acacAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAAT‑‑‑CCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGATATGCATTTGATGGCTTTGATTTTATGATGATATTTTACATTCTTCATATTATaaa > 2:1055100/1‑140 (MQ=255)
acacAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAAT‑‑‑CCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCACATGGCTTGGATATGCATTTGATGGCTTTGATTTTATGATGATATTTTACAttct < 2:265411/128‑1 (MQ=255)
cacaGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAAT‑‑‑CCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGATATGCATTTGATGGCTTTGATTTTATGATGATATTTTACATTCTTCat > 1:2448022/1‑131 (MQ=255)
acaGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAAT‑‑‑CCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGATATGCATTTGATGGCTTTGATTTTATGATGATATTTTACATTCTTCATATTATAAAAg < 2:2022074/140‑1 (MQ=255)
acaGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAAT‑‑‑CCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGATATGCATTTGATGGCTTTGATTTTATGATGATATTTTACATTCTTCATATTATAAAAg < 2:1525874/140‑1 (MQ=255)
acaGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAAT‑‑‑CCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGATATGCATTTGATGGCTTTGATTTTATGATGATATTTTACATTCTTCATATTATAAAAg < 2:720983/140‑1 (MQ=255)
aGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAAT‑‑‑CCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGATATGCATTTGATGGCTTTGATTTTATGATGATATTTTACATTCTTCATATTATAAAAGCa < 2:2334162/140‑1 (MQ=255)
aGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAAT‑‑‑CCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGATATGCATTTGATGGCTTTGATTTTATGATGATATTTTACATTCTTCATATTATAAAAGCa > 1:1757644/1‑140 (MQ=255)
gAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAAT‑‑‑CCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGATATGCATTTGATGGCTTTGATTTTATGATGATATTTTACATTCTTCATATTATAAAAGCAGa > 2:2290791/1‑140 (MQ=255)
aaCAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAAT‑‑‑CCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGATATGCATTTGATGGCTTTGATTTTATGATGATATTTTACATTCTTCATATTATAAAAGCAGATc < 1:1476681/140‑1 (MQ=255)
aCAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAAT‑‑‑CCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGATATGCATTTGATGGCTTTGATTTTATGATGATATTTTACATTCTTCATATTATAAAAGCAGATCt < 2:2459914/140‑1 (MQ=255)
tatGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAATCCACCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGATATGCATTTGATGGCTTTGATTTTATGATGATATTTTACATTCTTCATATTATAAAAGCAGATCTTg < 1:55247/140‑1 (MQ=255)
tatGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAAT‑‑‑CCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGATATGCATTTGATGGCTTTGATTTTATGATGATATTTTACATTCTTCATATTATAAAAGCAGATCTTGGCa > 1:347325/1‑140 (MQ=255)
gCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAAT‑‑‑CCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGATATGCATTTGATGGCTTTGATTTTATGATGATATTTTACATTCTTCATATTATAAAAGCAGATCTTGGCATTAc > 1:1863563/1‑140 (MQ=255)
cAACAGCATGGTATAAACAAGTTAAT‑‑‑CCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGATATGCATTTGATGGCTTTGATTTTATGATGATATTTTACATTCTTCATATTATAAAAGCAGATCTTGGCATTACg < 1:1055247/140‑1 (MQ=255)
aCAGCATGGTATAAACAAGTTAAT‑‑‑CCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGATATGCATTTGATGGCTTTGATTTTATGATGATATTTTACATTCTTCATATTATAAAAGCAGATCTTGGCATTACGGa > 1:1351517/1‑140 (MQ=255)
aCAGCATGGTATAAACAAGTTAAT‑‑‑CCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGATATGCATTTGATGGCTTTGATTTTATGATGATATTTTACATTCTTCATATTATAAAAGCAGATCTTGGCATTACGGa > 2:1079097/1‑140 (MQ=255)
cATGGTATAAACAAGTTAAT‑‑‑CCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGATATGCATTTGATGGCTTTGATTTTATGATGATATTTTACATTCTTCATATTATAAAAGCAGATCTTGGCATTACGGATAtt < 1:817676/140‑1 (MQ=255)
ggTATAAACAAGTTAAT‑‑‑CCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGATATGCATTTGATGGCTTTGATTTTATGATGATATTTTACATTCTTCATATTATAAAAGCAGATCTTGGCATTACGGATATTCAg < 1:570253/140‑1 (MQ=255)
gTATAAACAAGTTAAT‑‑‑CCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGATATGCATTTGATGGCTTTGATTTTATGATGATATTTTACATTCTTCATATTATAAAAGCAGATCTTGGCATTACGGATATTCAgg < 2:132356/140‑1 (MQ=255)
gTATAAACAAGTTAAT‑‑‑CCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGATATGCATTTGATGGCTTTGATTTTATGATGATATTTTACATTCTTCATATTATAAAAGCAGATCTTGGCATTACGGATATTCAgg < 2:157252/140‑1 (MQ=255)
tataAACAAGTTAAT‑‑‑CCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGATATGCATTTGATGGCTTTGATTTTATGATGATATTTTACATTCTTCATATTATAAAAGCAGATCTTGGCATTACGGATATTCAGGc < 2:278859/140‑1 (MQ=255)
tataAACAAGTTAAT‑‑‑CCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGATATGCATTTGATGGCTTTGATTTTATGATGATATTTTACATTCTTCATATTATAAAAGCAGATCTTGGCATTACGGATATTCAGGc < 2:1748623/140‑1 (MQ=255)
taAACAAGTTAAT‑‑‑CCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGATATGCATTTGATGGCTTTGATTTTATGATGATATTTTACATTCTTCATATTATAAAAGCAGATCTTGGCATTACGGATATTCAGGCTa < 1:667796/140‑1 (MQ=255)
aaCAAGTTAAT‑‑‑CCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGATATGCATTTGATGGCTTTGATTTTATGATGATATTTTACATTCTTCATATTATAAAAGCAGATCTTGGCATTACGGATATTCAGGCTACt < 1:2302191/140‑1 (MQ=255)
aaCAAGTTAAT‑‑‑CCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGATATGCATTTGATGGCTTTGATTTTATGATGATATTTTACATTCTTCATATTATAAAAGCAGATCTTGGCATTACGGATATTCAGGCTACt < 1:1616808/140‑1 (MQ=255)
aCAAGTTAAT‑‑‑CCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGATATGCATTTGATGGCTTTGATTTTATGATGATATTTTACATTCTTCATATTATAAAAGCAGATCTTGGCATTACGGATATTCAGGCTACtt > 2:48095/1‑140 (MQ=255)
aGTTAAT‑‑‑CCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGATATGCATTTGATGGCTTTGATTTTATGATGATATTTTACATTCTTCATATTATAAAAGCAGATCTTGGCATTACGGATATTCAGGCTACTTTaa > 2:2023821/1‑140 (MQ=255)
gTTAAT‑‑‑CCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGATATGCATTTGATGGCTTTGATTTTATGATGATATTTTACATTCTTCATATTATAAAAGCAGATCTTGGCATTACGGATATTCAGGCTa > 2:596500/1‑133 (MQ=255)
gTTAAT‑‑‑CCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGATATGCATTTGATGGCTTTGATTTTATGATGATATTTTACATTCTTCATATTATAAAAGCAGATCTTGGCATTACGGATATTCAGGCTa < 1:596500/133‑1 (MQ=255)
gTTAAT‑‑‑CCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGATATGCATTTGATGGCTTTGATTTTATGATGATATTTTACATTCTTCATATTATAAAAGCAGATCTTGGCATTACGGATATTCAGGCTACTTTAAt > 2:2012577/1‑140 (MQ=255)
ttAAT‑‑‑CCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGATATGCATTTGATGGCTTTGATTTTATGATGATATTTTACATTCTTCATATTATAAAAGCAGATCTTGGCATTACGGATATTCAGGCTACt < 1:430184/134‑1 (MQ=255)
ttAAT‑‑‑CCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGATATGCATTTGATGGCTTTGATTTTATGATGATATTTTACATTCTTCATATTATAAAAGCAGATCTTGGCATTACGGATATTCAGGCTACTTTAATa > 1:562003/1‑140 (MQ=255)
ttAAT‑‑‑CCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGATATGCATTTGATGGCTTTGATTTTATGATGATATTTTACATTCTTCATATTATAAAAGCAGATCTTGGCATTACGGATATTCAGGCTACTTTAATa > 2:563537/1‑140 (MQ=255)
t‑‑‑CCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGATATGCATTTGATGGCTTTGATTTTATGATGATATTTTACATTCTTCATATTATAAAAGCAGATCTTGGCATTACGGATATTCAgg < 1:1167193/125‑1 (MQ=255)
t‑‑‑CCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGATATGCATTTGATGGCTTTGATTTTATGATGATATTTTACATTCTTCATATTATAAAAGCAGATCTTGGCATTACGGATATTCAGGCTACTTTAATAGGGa > 2:128610/1‑140 (MQ=255)
t‑‑‑CCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGATATGCATTTGATGGCTTTGATTTTATGATGATATTTTACATTCTTCATATTATAAAAGCAGATCTTGGCATTACGGATATTCAGGCTACTTTAATAGGGa > 2:2300575/1‑140 (MQ=255)
caccacAACGGAAATCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGATATGCATTTGATGGCTTTGATTTTATGATGATATTTTACATTCTTCATATTATAAAAGCAGATCTTGGCATTACGGATATTCAGGCTACTTTAATAGGGACa < 1:2270122/140‑1 (MQ=255)
caccacAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGATATGCATTTGATGGCTTTGATTTTATGATGATATTTTACATTCTTCATATTATAAAAGCAGATCTTGGCATTACGGATATTCAGGCTACTTTAATAGGGACa > 2:83545/1‑140 (MQ=255)
cacaACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGATATGCATTTGATGGCTTTGATTTTATGATGATATTTTACATTCTTCATATTATAAAAGCAGATCTTGGCATTACGGATATTCAGGCTACTTTAATAGGGACAGTg < 2:445356/140‑1 (MQ=255)
cacaACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGATATGCATTTGATGGCTTTGATTTTATGATGATATTTTACATTCTTCATATTATAAAAGCAGATCTTGGCATTACGGATATTCAGGCTACTTTAATAGGGACAGTg > 2:1591348/1‑140 (MQ=255)
acaACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGATATGCATTTGATGGCTTTGATTTTATGATGATATTTTACATTCTTCATATTATAAAAGCAGATCTTGGCATTACGGATATTCAGGCTACTTTAATAGGGACAGTgg < 1:2012577/140‑1 (MQ=255)
cGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGATATGCATTTGATGGCTTTGATTTTATGATGATATTTTACATTCTTCATATTATAAAAGCAGATCTTGGCATTACGGATATTCAGGCTACTTTAATAGGGACAGTgg > 1:1246906/1‑136 (MQ=255)
cGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGATATGCATTTGATGGCTTTGATTTTATGATGATATTTTACATTCTTCATATTATAAAAGCAGATCTTGGCATTACGGATATTCAGGCTACTTTAATAGGGACAGTgg < 2:1246906/136‑1 (MQ=255)
cGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGATATGCATTTGATGGCTTTGATTTTATGATGATATTTTACATTCTTCATATTATAAAAGCAGATCTTGGCATTACGGATATTCAGGCTACTTTAATAGGGACAGTGGCCtt > 1:231297/1‑140 (MQ=255)
gAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGATATGCATTTGATGGCTTTGATTTTATGATGATATTTTACATTCTTCATATTATAAAAGCAGATCTTGGCATTACGGATATTCAGGCTACTTTAATAGGGACAGTGGCCTTCa > 2:808950/1‑140 (MQ=255)
aaaGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGATATGCATTTGATGGCTTTGATTTTATGATGATATTTTACATTCTTCATATTATAAAAGCAGATCTTGGCATTACGGATATTCAGGCTACTTTAATAGGGACAGTGGCCTTCAt > 1:2200623/1‑140 (MQ=255)
aGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGATATGCATTTGATGGCTTTGATTTTATGATGATATTTTACATTCTTCATATTATAAAAGCAGATCTTGGCATTACGGATATTCAGGCTACTTTAATAGGGACAGTGGCCTTCATAg > 2:206175/1‑140 (MQ=255)
aGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGATATGCATTTGATGGCTTTGATTTTATGATGATATTTTACATTCTTCATATTATAAAAGCAGATCTTGGCATTACGGATATTCAGGCTACTTTAATAGGGACAGTGGCCTTCATAg > 2:626043/1‑140 (MQ=255)
aGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGATATGCATTTGATGGCTTTGATTTTATGATGATATTTTACATTCTTCATATTATAAAAGCAGATCTTGGCATTACGGATATTCAGGCTACTTTAATAGGGACAGTGGCCTTCATAg < 2:123720/140‑1 (MQ=255)
gCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGATATGCATTTGATGGCTTTGATTTTATGATGATATTTTACATTCTTCATATTATAAAAGCAGATCTTGGCATTACGGATATTCAGGCTACTTTAATAGGGACAGTGGCCTTCATAGc < 2:636724/140‑1 (MQ=255)
ttttttCCGCATGGCTTGGATATGCATTTGATGGCTTTGATTTTATGATGATATTTTACATTCTTCATATTATAAAAGCAGATCTTGGCATTACGGATATTCAGGCTACTTTAATAGGGACAGTGGCCTTCATAGCCAGa < 2:231297/140‑1 (MQ=255)
aTGGCTTGGATATGCATTTGATGGCTTTGATTTTATGATGATATTTTACATTCTTCATATTATAAAAGCAGATCTTGGCATTACGGATATTCAGGCTACTTTAATAGGGACAGTGGCCTTCATAGCCAGa < 2:1698461/130‑1 (MQ=255)
aTGGCTTGGATATGCATTTGATGGCTTTGATTTTATGATGATATTTTACATTCTTCATATTATAAAAGCAGATCTTGGCATTACGGATATTCAGGCTACTTTAATAGGGACAGTGGCCTTCATAGCCAGa > 1:1698461/1‑130 (MQ=255)
aTGGCTTGGATATGCATTTGATGGCTTTGATTTTATGATGATATTTTACATTCTTCATATTATAAAAGCAGATCTTGGCATTACGGATATTCAGGCTACTTTAATAGGGACAGTGGCCTTCATAGCCAGACCTATTGGAg < 2:1404950/140‑1 (MQ=255)
ggCTTGGATATGCATTTGATGGCTTTGATTTTATGATGATATTTTACATTCTTCATATTATAAAAGCAGATCTTGGCATTACGGATATTCAGGCTACTTTAATAGGGACAGTGGCCTTCATAGCCAGACCTATTGGAggt < 2:1018777/140‑1 (MQ=255)
cTTGGATATGCATTTGATGGCTTTGATTTTATGATGATATTTTACATTCTTCATATTATAAAAGCAGATCTTGGCATTACGGATATTCAGGCTACTTTAATAGGGACAGTGGCCTTCATAGCCAg > 1:2163654/1‑125 (MQ=255)
|
ATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAAT‑‑‑CCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGATATGTATTTGATGGCTTTGATTTTATGATGATATTTTACATTCTTCATATTATAAAAGCAGATCTTGGCATTACGGATATTCAGGCTACTTTAATAGGGACAGTGGCCTTCATAGCCAGACCTATTGGAGGTGG > NC_000913/4503997‑4504260
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
