Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A38 F60 I1 R1
|
17 |
92.6 |
3121444 |
99.1% |
3093351 |
138.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,368,692 |
T→C |
F10S (TTC→TCC) |
fxsA → |
protein FxsA |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,368,692 | 0 | T | C | 100.0%
| 353.2
/ NA
| 88 | F10S (TTC→TCC) | fxsA | protein FxsA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (38/50); total (38/50) |
TTGCGCAAACATCTTGAAATTTTGCTAATGACCACAATATAAGCTAAACGCGATTCGCAACCCATTCAGGTAGCCGGGGTTAACCGGCTGCTATTACAGGAGAAACCTTTGCGCTGGTTACCTTTTATTGCCATTTTCCTTTATGTCTATATTGAGATTTCAATCTTTATTCAGGTTGCCCATGTATTGGGGGTATTGCTGACCCTCGTGCTGGTTATATTCACGTCAGTTATCGGTATGTCACTGGTACGTAACCAGGGCTTTAAGAATTT > NC_000913/4368556‑4368827
|
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tGCGCAAACATCTTGAAATTTTGCTAATGACCACAATATAAGCTAAACGCGATTCGCAACCCATTCAGGTAGCCGGGGTTAACCGGCTGCTATTACAGGAGAAACCTTTGCGCTGGTTACCTTTTATTGCCATTTCCCtt < 1:1016031/140‑1 (MQ=255)
tGCGCAAACATCTTGAAATTTTGCTAATGACCACAATATAAGCTAAACGCGATTCGCAACCCATTCAGGTAGCCGGGGTTAACCGGCTGCTATTACAGGAGAAACCTTTGCGCTGGTTACCTTTTATTGCCATTTCCCtt < 2:207283/140‑1 (MQ=255)
tGCGCAAACATCTTGAAATTTTGCTAATGACCACAATATAAGCTAAACGCGATTCGCAACCCATTCAGGTAGCCGGGGTTAACCGGCTGCTATTACAGGAGAAACCTTTGCGCTGGTTACCTTTTATTGCCATTTCCCtt < 2:25451/140‑1 (MQ=255)
tGCGCAAACATCTTGAAATTTTGCTAATGACCACAATATAAGCTAAACGCGATTCGCAACCCATTCAGGTAGCCGGGGTTAACCGGCTGCTATTACAGGAGAAACCTTTGCGCTGGTTACCTTTTATTGCCATTTCCCtt < 2:495995/140‑1 (MQ=255)
tGCGCAAACATCTTGAAATTTTGCTAATGACCACAATATAAGCTAAACGCGATTCGCAACCCATTCAGGTAGCCGGGGTTAACCGGCTGCTATTACAGGAGAAACCTTTGCGCTGGTTACCTTTTATTGCCATTTCCCtt < 1:1474094/140‑1 (MQ=255)
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gcgcAAACATCTTGAAATTTTGCTAATGACCACAATATAAGCTAAACGCGATTCGCAACCCATTCAGGTAGCCGGGATTAACCGGCTGCTATTACAGGAGAAACCTTTGCGCTGGTTACCTTTTATTGCCATTTCCCttt < 2:1085720/140‑1 (MQ=255)
cgcAAACATCTTGAAATTTTGCTAATGACCACAATATAAGCTAAACGCGATTCGCAACCCATTCAGGTAGCCGGGGTTAACCGGCTGCTATTACAGGAGAAACCTTTGCGCTGGTTACCTTTTATTGCCATTTCCCTTTa > 1:1401902/1‑140 (MQ=255)
cgcAAACATCTTGAAATTTTGCTAATGACCACAATATAAGCTAAACGCGATTCGCAACCCATTCAGGTAGCCGGGGTTAACCGGCTGCTATTACAGGAGAAACCTTTGCGCTGGTTACCTTTTATTGCCATTTCCCTTTa < 1:161214/140‑1 (MQ=255)
cgcAAACATCTTGAAATTTTGCTAATGACCACAATATAAGCTAAACGCGATTCGCAACCCATTCAGGTAGCCGGGGTTAACCGGCTGCTATTACAGGAGAAACCTTTGCGCTGGTTACCTTTTATTGCCATTTCCCTTTa < 1:1535900/140‑1 (MQ=255)
gcAAACATCTTGAAATTTTGCTAATGACCACAATATAAGCTAAACGCGATTCGCAACCCATTCAGGTAGCCGGGGTTAACCGGCTGCTATTACAGGAGAAACCTTTGCGCTGGTTACCTTTTATTGCCATTTCCCTTTAt < 2:1401902/140‑1 (MQ=255)
cAAACATCTTGAAATTTTGCTAATGACCACAATATAAGCTAAACGCGATTCGCAACCCATTCAGGTAGCCGGGGTTAACCGGCTGCTATTACAGGAGAAACCTTTGCGCTGGTTACCTTTTATTGCCATTTCCCTTTATg < 2:1334339/140‑1 (MQ=255)
aaaCATCTTGAAATTTTGCTAATGACCACAATATAAGCTAAACGCGATTCGCAACCCATTCAGGTAGCCGGGGTTAACCGGCTGCTATTACAGGAGAAACCTTTGCGCTGGTTACCTTTTATTGCCATTTCCCTTTATGt < 2:1295039/140‑1 (MQ=255)
aaCATCTTGAAATTTTGCTAATGACCACAATATAAGCTAAACGCGATTCGCAACCCATTCAGGTAGCCGGGGTTAACCGGCTGCTATTACAGGAGAAACCTTTGCGCTGGTTACCTTTTATTGCCATTTCCCTTTATGTc < 2:499648/140‑1 (MQ=255)
aCATCTTGAAATTTTGCTAATGACCACAATATAAGCTAAACGCGATTCGCAACCCATTCAGGTAGCCGGGGTTAACCGGCTGCTATTACAGGAGAAACCTTTGCGCTGGTTACCTTTTATTGCCATTTCCCTTTATGTCt > 1:1194677/1‑140 (MQ=255)
aCATCTTGAAATTTTGCTAATGACCACAATATAAGCTAAACGCGATTCGCAACCCATTCAGGTAGCCGGGGTTAACCGGCTGCTATTACAGGAGAAACCTTTGCGCTGGTTACCTTTTATTGCCATTTCCCTTTATGTCt > 1:176488/1‑140 (MQ=255)
ttGAAATTTTGCTAATGACCACAATATAAGCTAAACGCGATTCGCAACCCATTCAGGTAGCCGGGGTTAACCGGCTGCTATTACAGGAGAAACCTTTGCGCTGGTTACCTTTTATTGCCATTTCCCTTTATGTCTATAtt > 1:1113953/1‑140 (MQ=255)
tGAAATTTTGCTAATGACCACAATATAAGCTAAACGCGATTCGCAACCCATTCAGGTAGCCGGGGTTAACCGGCTGCTATTACAGGAGAAACCTTTGCGCTGGTTACCTTTTATTGCCATTTCCCTTTATGTCTATATTg < 1:201385/140‑1 (MQ=255)
gAAATTTTGCTAATGACCACAATATAAGCTAAACGCGATTCGCAACCCATTCAGGTAGCCGGGGTTAACCGGCTGCTATTACAGTAGAAACCTTTGCGCTGGTTACCTTTTATTGCCATTTCCCTTTATGTCTATATTga < 2:168446/140‑1 (MQ=255)
tttGCTAATGACCACAATATAAGCTAAACGCGATTCGCAACCCATTCAGGTAGCCGGGGTTAACCGGCTGCTATTACAGGAGAAACCTTTGCGCTGGTTACCTTTTATTGCCATTTCCCTTTATGTCTATATTGAGAttt > 1:1088454/1‑140 (MQ=255)
tGCTAATGACCACAATATAAGCTAAACGCGATTCGCAACCCATTCAGGTAGCCGGGGTTAACCGGCTGCTATTACAGGAGAAACCTTTGCGCTGGTTACCTTTTATTGCCATTTCCCTTTATGTCTATATTGAGATTTCa > 1:886941/1‑140 (MQ=255)
aaTATAAGCTAAACGCGATTCGCAACCCATTCAGGTAGCCGGGGTTAACCGGCTGCTATTACAGGAGAAACCTTTGCGCTGGTTACCTTTTATTGCCATTTCCCTTTATGTCTATATTGAGATTTCAATCTTTATTCAgg < 1:1444854/140‑1 (MQ=255)
atatAAGCTAAACGCGATTCGCAACCCATTCAGGTAGCCGGGGTTAACCGGCTGCTATTACAGGAGAAACCTTTGCGCTGGTTACCTTTTATTGCCATTTCCCTTTATGTCTATATTGAGATTTCAATCTTTATTCAGGt < 2:886941/140‑1 (MQ=255)
taAGCTAAACGCGATTCGCAACCCATTCAGGTAGCCGGGGTTAACCGGCTGCTATTACAGGAGAAACCTTTGCGCTGGTTACCTTTTATTGCCATTTCCCTTTATGTCTATATTGAGATTTCAATCTTTATTCAGGTTGc < 2:876880/140‑1 (MQ=255)
aaGCTAAACGCGATTCGCAACCCATTCAGGTAGCCGGGGTTAACCGGCTGCTATTACAGGAGAAACCTTTGCGCTGGTTACCTTTTATTGCCATTTCCCTTTATGTCTATATTGAGATTTCAATCTTTATTCAGGTTGcc > 1:1061451/1‑140 (MQ=255)
gCTAAACGCGATTCGCAACCCATTCAGGTAGCCGGGGTTAACCGGCTGCTATTACAGGAGAAACCTTTGCGCTGGTTACCTTTTATTGCCATTTCCCTTTATGTCTATATTGAGATTTCAATCTTTATTCAGGTTGCCCa < 2:176488/140‑1 (MQ=255)
aaaCGCGATTCGCAACCCATTCAGGTAGCCGGGGTTAACCGGCTGCTATTACAGGAGAAACCTTTGCGCTGGTTACCTTTTATTGCCATTTCCCTTTATGTCTATATTGAGATTTCAATCTTTATTCAGGTTGcc > 2:1384085/1‑135 (MQ=255)
aaaCGCGATTCGCAACCCATTCAGGTAGCCGGGGTTAACCGGCTGCTATTACAGGAGAAACCTTTGCGCTGGTTACCTTTTATTGCCATTTCCCTTTATGTCTATATTGAGATTTCAATCTTTATTCAGGTTGcc < 1:1384085/135‑1 (MQ=255)
aaaCGCGATTCGCAACCCATTCAGGTAGCCGGGGTTAACCGGCTGCTATTACAGGAGAAACCTTTGCGCTGGTTACCTTTTATTGCCATTTCCCTTTATGTCTATATTGAGATTTCAATCTTTATTCAGGTTGCCCATGt > 1:384765/1‑140 (MQ=255)
aaaCGCGATTCGCAACCCATTCAGGTAGCCGGGGTTAACCGGCTGCTATTACAGGAGAAACCTTTGCGCTGGTTACCTTTTATTGCCATTTCCCTTTATGTCTATATTGAGATTTCAATCTTTATTCAGGTTGCCCATGt > 2:1297494/1‑140 (MQ=255)
aaaCGCGATTCGCAACCCATTCAGGTAGCCGGGGTTAACCGGCTGCTATTACAGGAGAAACCTTTGCGCTGGTTACCTTTTATTGCCATTTCCCTTTATGTCTATATTGAGATTTCAATCTTTATTCAGGTTGCCCATGt > 1:1410784/1‑140 (MQ=255)
aaaCGCGATTCGCAACCCATTCAGGTAGCCGGGGTTAACCGGCTGCTATTACAGGAGAAACCTTTGCGCTGGTTACCTTTTATTGCCATTTCCCTTTATGTCTATATTGAGATTTCAATCTTTATTCAGGTTGCCCATGt > 2:444052/1‑140 (MQ=255)
aaaCGCGATTCGCAACCCATTCAGGTAGCCGGGGTTAACCGGCTGCTATTACAGGAGAAACCTTTGCGCTGGTTACCTTTTATTGCCATTTCCCTTTATGTCTATATTGAGATTTCAATCTTTATTCAGGTTGCCCATGt > 1:795210/1‑140 (MQ=255)
aaaCGCGATTCGCAACCCATTCAGGTAGCCGGGGTTAACCGGCTGCTATTACAGGAGAAACCTTTGCGCTGGTTACCTTTTATTGCCATTTCCCTTTATGTCTATATTGAGATTTCAATCTTTATTCAGGTTGCCCATGt > 1:85084/1‑140 (MQ=255)
aaaCGCGATTCGCAACCCATTCAGGTAGCCGGGGTTAACCGGCTGCTATTACAGGAGAAACCTTTGCGCTGGTTACCTTTTATTGCCATTTCCCTTTATGTCTATATTGAGATTTCAATCTTTATTCAGGTTGCCCATGt > 2:266454/1‑140 (MQ=255)
aaaCGCGATTCGCAACCCATTCAGGTAGCCGGGGTTAACCGGCTGCTATTACAGGAGAAACCTTTGCGCTGGTTACCTTTTATTGCCATTTCCCTTTATGTCTATATTGAGATTTCAATCTTTATTCAGGTTGCCCATGt > 2:1032337/1‑140 (MQ=255)
aaCGCGATTCGCAACCCATTCAGGTAGCCGGGGTTAACCGGCTGCTATTACAGTAGAAACCTTTGCGCTGGTTACCTTTTATTGCCATTTCCCTTTATGTCTATATTGAGATTTCAATCTTTATTCAGGTTGCCCATGTa > 2:1096266/1‑140 (MQ=255)
aCGCGATTCGCAACCCATTCAGGTAGCCGGGGTTAACCGGCTGCTATTACAGGAGAAACCTTTGCGCTGGTTACCTTTTATTGCCATTTCCCTTTATGTCTATATTGAGATTTCAATCTTTATTCAGGTTGCCCATGTAt > 1:39715/1‑140 (MQ=255)
aCGCGATTCGCAACCCATTCAGGTAGCCGGGGTTAACCGGCTGCTATTACAGGAGAAACCTTTGCGCTGGTTACCTTTTATTGCCATTTCCCTTTATGTCTATATTGAGATTTCAATCTTTATTCAGGTTGCCCATGTAt > 2:1100869/1‑140 (MQ=255)
aCGCGATTCGCAACCCATTCAGGTAGCCGGGGTTAACCGGCTGCTATTACAGGAGAAACCTTTGCGCTGGTTACCTTTTATTGCCATTTCCCTTTATGTCTATATTGAGATTTCAATCTTTATTCAGGTTGCCCATGTAt > 2:630577/1‑140 (MQ=255)
aCGCGATTCGCAACCCATTCAGGTAGCCGGGGTTAACCGGCTGCTATTACAGGAGAAACCTTTGCGCTGGTTACCTTTTATTGCCATTTCCCTTTATGTCTATATTGAGATTTCAATCTTTATTCAGGTTGCCCATGTAt > 1:215702/1‑140 (MQ=255)
cgcgATTCGCAACCCATTCAGGTAGCCGGGGTTAACCGGCTGCTATTACAGGAGAAACCTTTGCGCTGGTTACCTTTTATTGCCATTTCCCTTTATGTCTATATTGAGATTTCAATCTTTATTCAGGTTGCCCATGTAtt < 1:1100869/140‑1 (MQ=255)
cgATTCGCAACCCATTCAGGTAGCCGGGGTTAACCGGCTGCTATTACAGGAGAAACCTTTGCGCTGGTTACCTTTTATTGCCATTTCCCTTTATGTCTATATTGAGATTTCAATCTTTATTCAGGTTGCCCATGTATTgg < 2:384765/140‑1 (MQ=255)
gATTCGCAACCCATTCAGGTAGCCGGGGTTAACCGGCTGCTATTACAGGAGAAACCTTTGCGCTGGTTACCTTTTATTGCCATTTCCCTTTATGTCTATATTGAGATTTCAATCTTTATTCAGGTTGCCCATGTATTggg > 2:1440919/1‑140 (MQ=255)
aTTCGCAACCCTTTCAGGTAGCCGGGGTTAACCGGCTGCTATTACAGGAGAAACCTTTGCGCTGGTTACCTTTTATTGCCATTTCCCTTTATGTCTATATTGAGATTTCAATCTTTATTCAGGTTGCCCATGTATTgggg > 1:849977/1‑140 (MQ=255)
aTTCGCAACCCATTCAGGTAGCCGGGGTTAACCGGCTGCTATTACAGGAGAAACCTTTGCGCTGGTTACCTTTTATTGCCATTTCCCTTTATGTCTATATTGAGATTTCAATCTTTATTCAGGTTGCCCATGTATTgggg > 2:59681/1‑140 (MQ=255)
aTTCGCAACCCATTCAGGTAGCCGGGGTTAACCGGCTGCTATTACAGGAGAAACCTTTGCGCTGGTTACCTTTTATTGCCATTTCCCTTTATGTCTATATTGAGATTTCAATCTTTATTCAGGTTGCCCATGTATTgggg > 1:1076960/1‑140 (MQ=255)
ttCGCAACCCATTCAGGTAGCCGGGGTTAACCGGCTGCTATTACAGGAGAAACCTTTGCGCTGGATACCTTTTATTGCCATTTCCCTTTATGTCTATATTGAGATTTCAATCTTTATTCAGGTTGCCCATGTATTgggg > 1:1327940/1‑139 (MQ=255)
ttCGCAACCCATTCAGGTAGCCGGGGTTAACCGGCTGCTATTACAGGAGAAACCTTTGCGCTGGATACCTTTTATTGCCATTTCCCTTTATGTCTATATTGAGATTTCAATCTTTATTCAGGTTGCCCATGTATTgggg < 2:1327940/139‑1 (MQ=255)
cccATTCAGGTAGCCGGGGTTAACCGGCTGCTATTACAGGAGAAACCTTTGCGCTGGTTACCTTTTATTGCCATTTCCCTTTATGTCTATATTGAGATTTCAATCTTTATTCAGGTTGCCCATGTATTGGGGGTATTGCt < 2:1076960/140‑1 (MQ=255)
tCAGGTAGCCGGGGTTAACCGGCTGCTATTACAGGAGAAACCTTTGCGCTGGTTACCTTTTATTGCCATTTCCCTTTATGTCTATATTGAGATTTCAATCTTTATTCAGGTTGCCCATGTATTGGGGGTATTGCTGAccc < 2:1088454/140‑1 (MQ=255)
tCAGGTAGCCGGGGTTAACCGGCTGCTATTACAGGAGAAACCTTTGCGCTGGTTACCTTTTATTGCCATTTCCCTTTATGTCTATATTGAGATTTCAATCTTTATTCAGGTTGCCCATGTATTGGGGGTATTGCTGAccc > 1:293950/1‑140 (MQ=255)
cAGGTAGCCGGGGTTAACCGGCTGCTATTACAGGAGAAACCTTTGCGCTGGTTACCTTTTATTGCCATTTCCCTTTATGTCTATATTGAGATTTCAATCTTTATTCAGGTTGCCCATGTATTGGGGGTATTGCTGACCCt < 2:1061451/140‑1 (MQ=255)
tAGCCGGGGTTAACCGGCTGCTATTACAGGAGAAACCTTTGCGCTGGTTACCTTTTATTGCCATTTCCCTTTATGTCTATATTGAGATTTCAATCTTTATTCAGGTTGCCCATGTATTGGGGGTATTGCTGACCCTCGTg < 2:85084/140‑1 (MQ=255)
tAGCCGGGGTTAACCGGCTGCTATTACAGGAGAAACCTTTGCGCTGGTTACCTTTTATTGCCATTTCCCTTTATGTCTATATTGAGATTTCAATCTTTATTCAGGTTGCCCATGTATTGGGGGTATTGCTGACCCTCGTg > 1:1536572/1‑140 (MQ=255)
tAGCCGGGGTTAACCGGCTGCTATTACAGGAGAAACCTTTGCGCTGGTTACCTTTTATTGCCATTTCCCTTTATGTCTATATTGAGATTTCAATCTTTATTCAGGTTGCCCATGTATTGGGGGTATTGCTGACCCTCGTg < 1:1260037/140‑1 (MQ=255)
aGCCGGGGTTAACCGGCTGCTATTACAGGAGAAACCTTTGCGCTGGTTACCTTTTATTGCCATTTCCCTTTATGTCTATATTGAGATTTCAATCTTTATTCAGGTTGCCCATGTATTGGGGGTATTGCTGACCCTCGTGc > 2:1117290/1‑140 (MQ=255)
aGCCGGGGTTAACCGGCTGCTATTACAGGAGAAACCTTTGCGCTGGTTACCTTTTATTGCCATTTCCCTTTATGTCTATATTGAGATTTCAATCTTTATTCAGGTTGCCCATGTATTGGGGGTATTGCTGACCCTCGTGc < 2:1410784/140‑1 (MQ=255)
ccGGGGTTAACCGGCTGCTATTACAGGAGAAACCTTTGCGCTGGTTACCTTTTATTGCCATTTCCCTTTATGTCTATATTGAGATTTCAATCTTTATTCAGGTTGCCCATGTATTGGGGGTATTGCTGACCCTCGTg < 1:482560/137‑1 (MQ=255)
ccGGGGTTAACCGGCTGCTATTACAGGAGAAACCTTTGCGCTGGTTACCTTTTATTGCCATTTCCCTTTATGTCTATATTGAGATTTCAATCTTTATTCAGGTTGCCCATGTATTGGGGGTATTGCTGACCCTCGTg > 2:482560/1‑137 (MQ=255)
gctgctATTACAGGAGAAACCTTTGCGCTGGTTACCTTTTATTGCCATTTCCCTTTATGTCTATATTGAGATTTCAATCTTTATTCAGGTTGCCCATGTATTGGGGGTATTGCTGACCCTCGTGCTGGTTATATTCACGt < 2:174277/140‑1 (MQ=255)
gctATTACAGGAGAAACCTTTGCGCTGGTTACCTTTTATTGCCATTTCCCTTTATGTCTATATTGAGATTTCAATCTTTATTCAGGTTGCCCATGTATTGGGGGTATTGCTGACCCTCGTGCTGGTTATATTCACGTCAg < 2:1113953/140‑1 (MQ=255)
ttACAGGAGAAACCTTTGCGCTGGTTACCTTTTATTGCCATTTCCCTTTATGTCTATATTGAGATTTCAATCTTTATTCAGGTTGCCCATGTATTGGGGGTATTGCTGACCCTCGTGCTGGTTATATTCACGTCAGTTAt < 1:1032337/140‑1 (MQ=255)
ttACAGGAGAAACCTTTGCGCTGGTTACCTTTTATTGCCATTTCCCTTTATGTCTATATTGAGATTTCAATCTTTATTCAGGTTGCCCATGTATTGGGGGTATTGCTGACCCTCGTGCTGGTTATATTCACGTCAGTTAt < 1:266454/140‑1 (MQ=255)
ttACAGGAGAAACCTTTGCGCTGGTTACCTTTTATTGCCATTTCCCTTTATGTCTATATTGAGATTTCAATCTTTATTCAGGTTGCCCATGTATTGGGGGTATTGCTGACCCTCGTGCTGGTTATATTCACGTCAGTTAt < 1:59681/140‑1 (MQ=255)
aGGAGAAACCTTTGCGCTGGTTACCTTTTATTGCCATTTCCCTTTATGTCTATATTGAGATTTCAATCTTTATTCAGGTTGCCCATGTATTGGGGGTATTGCTGACCCTCGTGCTGGTTATATTCACGTCAGTTATCGGt < 1:444052/140‑1 (MQ=255)
gagaAACCTTTGCGCTGGTTACCTTTTATTGCCATTTCCCTTTATGTCTATATTGAGATTTCAATCTTTATTCAGGTTGCCCATGTATTGGGGGTATTGCTGACCCTCGTGCTGGTTATATTCACGTCAGTTATCGGTAt < 2:39715/140‑1 (MQ=255)
agaAACCTTTGCGCTGGTTACCTTTTATTGCCATTTCCCTTTATGTCTATATTGAGATTTCAATCTTTATTCAGGTTGCCCATGTATTGGGGGTATTGCTGACCCTCGTGCTGGTTATATTCa < 2:611011/123‑1 (MQ=255)
agaAACCTTTGCGCTGGTTACCTTTTATTGCCATTTCCCTTTATGTCTATATTGAGATTTCAATCTTTATTCAGGTTGCCCATGTATTGGGGGTATTGCTGACCCTCGTGCTGGTTATATTCa > 1:611011/1‑123 (MQ=255)
agaAACCTTTGCGCTGGTTACCTTTTATTGCCATTTCCCTTTATGTCTATATTGAGATTTCAATCTTTATTCAGGTTGCCCATGTATTGGGGGTATTGCTGACCCTCGTGCTGGTTATATTCACGt < 2:22755/126‑1 (MQ=255)
agaAACCTTTGCGCTGGTTACCTTTTATTGCCATTTCCCTTTATGTCTATATTGAGATTTCAATCTTTATTCAGGTTGCCCATGTATTGGGGGTATTGCTGACCCTCGTGCTGGTTATATTCACGt > 1:22755/1‑126 (MQ=255)
gaAACCTTTGCGCTGGTTACCTTTTATTGCCATTTCCCTTTATGTCTATATTGAGATTTCAATCTTTATTCAGGTTGCCCATGTATTGGGGGTATTGCTGACCCTCGTGCTGGTTATATTCACg < 1:1533969/124‑1 (MQ=255)
gaAACCTTTGCGCTGGTTACCTTTTATTGCCATTTCCCTTTATGTCTATATTGAGATTTCAATCTTTATTCAGGTTGCCCATGTATTGGGGGTATTGCTGACCCTCGTGCTGGTTATATTCACg > 2:1533969/1‑124 (MQ=255)
gaAACCTTTGCGCTGGTTACCTTTTATTGCCATTTCCCTTTATGTCTATATTGAGATTTCAATCTTTATTCAGGTTGCCCATGTATTGGGGGTATTGCTGACCCTCGTGCTGGTTATATTCACGTCAGTTATCGGTATGt < 2:1194677/140‑1 (MQ=255)
aCCTTTGCGCTGGTTACCTTTTATTGCCATTTCCCTTTATGTCTATATTGAGATTTCAATCTTTATTCAGGTTGCCCATGTATTGGGGGTATTGCTGACCCTCGTGCTGGTTATATTCACGTCAGTTATCGGTATGTCAc < 1:1096266/140‑1 (MQ=255)
aCCTTTGCGCTGGTTACCTTTTATTGCCATTTCCCTTTATGTCTATATTGAGATTTCAATCTTTATTCAGGTTGCCCATGTATTGGGGGTATTGCTGACCCTCGTGCTGGTTATATTCACGTCAGTTATCGGTATGTCAc > 1:887099/1‑140 (MQ=255)
ccTTTGCGCTGGTTACCTTTTATTGCCATTTCCCTTTATGTCTATATTGAGATTTCAATCTTTATTCAGGTTGCCCATGTATTGGGGGTATTGCTGACCCTCGTGCTGGTTATATTCACGTCAGTTATCGGTATGTCACt < 2:887099/140‑1 (MQ=255)
tttGCGCTGGTTACCTTTTATTGCCATTTCCCTTTATGTCTATATTGAGATTTCAATCTTTATTCAGGTTGCCCATGTATTGGGGGTATTGCTGACCCTCGTGCTGGTTATATTCACGTCAGTTATCGGTATGt < 1:968927/134‑1 (MQ=255)
tttGCGCTGGTTACCTTTTATTGCCATTTCCCTTTATGTCTATATTGAGATTTCAATCTTTATTCAGGTTGCCCATGTATTGGGGGTATTGCTGACCCTCGTGCTGGTTATATTCACGTCAGTTATCGGTATGt > 2:968927/1‑134 (MQ=255)
tGCGCTGGTTACCTTTTATTGCCATTTCCCTTTATGTCTATATTGAGATTTCAATCTTTATTCAGGTTGCCCATGTATTGGGGGTATTGCTGACCCTCGTGCTGGTTATATTCACGTCAGTTATCGGTATGTCa < 1:495560/134‑1 (MQ=255)
tGCGCTGGTTACCTTTTATTGCCATTTCCCTTTATGTCTATATTGAGATTTCAATCTTTATTCAGGTTGCCCATGTATTGGGGGTATTGCTGACCCTCGTGCTGGTTATATTCACGTCAGTTATCGGTATGTCa > 2:495560/1‑134 (MQ=255)
tGCGCTGGTTACCTTTTATTGCCATTTCCCTTTATGTCTATATTGAGATTTCAATCTTTATTCAGGTTGCCCATGTATTGGGGGTATTGCTGACCCTCGTGCTGGTTATATTCACGTCAGTTATCGGTATGTCACTGGTa < 1:161170/140‑1 (MQ=255)
tGCGCTGGTTACCTTTTATTGCCATTTCCCTTTATGTCTATATTGAGATTTCAATCTTTATTCAGGTTGCCCATGTATTGGGGGTATTGCTGACCCTCGTGCTGGTTATATTCACGTCAGTTATCGGTATGTCACTGGTa < 2:215702/140‑1 (MQ=255)
gTTACCTTTTATTGCCATTTCCCTTTATGTCTATATTGAGATTTCAATCTTTATTCAGGTTGCCCATGTATTGGGGGTATTGCTGACCCTCGTGCTGGTTATATTCACGTCAGTTATCGGTATGTCACTGGTACGTAAcc < 2:293950/140‑1 (MQ=255)
ttACCTTTTATTGCCATTTCCCTTTATGTCTATATTGAGATTTCAATCTTTATTCAGGTTGCCCATGTATTGGGGGTATTGCTGACCCTCGTGCTGGTTATATTCACGTCAGTTATCGGTATGTCACTGGTACGTAACCa < 2:237641/140‑1 (MQ=255)
aTTGCCATTTCCCTTTATGTCTATATAGAGATTTCAATCTTTATTCAGGTTGCCCATGTATTGGGGGTATTGCTGACCCTCGTGCTGGTTATATTCACGTCAGTTATCGGTATGTCACTGGTACGTAACCAGGGCTTTaa > 1:59285/1‑140 (MQ=255)
aTTTCCCTTTATGTCTATATTGAGATTTCAATCTTTATTCAGGTTGCCCATGTATTGGGGGTATTGCTGACCCTCGTGCTGGTTATATTCACGTCAGTTATCGGTATGTCACTGGTACGTAACCAGGGCTTTAAGAAttt < 2:1440977/140‑1 (MQ=255)
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TTGCGCAAACATCTTGAAATTTTGCTAATGACCACAATATAAGCTAAACGCGATTCGCAACCCATTCAGGTAGCCGGGGTTAACCGGCTGCTATTACAGGAGAAACCTTTGCGCTGGTTACCTTTTATTGCCATTTTCCTTTATGTCTATATTGAGATTTCAATCTTTATTCAGGTTGCCCATGTATTGGGGGTATTGCTGACCCTCGTGCTGGTTATATTCACGTCAGTTATCGGTATGTCACTGGTACGTAACCAGGGCTTTAAGAATTT > NC_000913/4368556‑4368827
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
