Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A24 F60 I1 R1
|
49 |
40.6 |
4663232 |
29.3% |
1366326 |
138.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,037,198 |
A→G |
noncoding (58/77 nt) |
ileT → |
tRNA‑Ile |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,037,198 | 0 | A | G | 82.9%
| 208.3
/ 29.2
| 83 | noncoding (58/77 nt) | ileT | tRNA‑Ile |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (8/6); new base G (33/35); total (42/41) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.70e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.27e-01 |
GATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTTCTTTGAAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCACGGCAAATTTGAAGAGGTTTTAACTACATGTTATGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAGGTCTGCGGTTCGATCCCGCATAG > NC_000913/4037060‑4037327
|
gATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTTCTTTGAAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCaa > 1:1940027/1‑140 (MQ=37)
tCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTTCTTTGAAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGt < 2:1995663/140‑1 (MQ=34)
tCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTTCTTTGAAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGt < 2:2267518/140‑1 (MQ=34)
cctcctTACCTTAAAGAAGCGTTCTTTGAAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCa > 1:1674704/1‑140 (MQ=35)
cctcctTACCTTAAAGAAGCGTTCTTTGAAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGCGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCa > 2:2024578/1‑140 (MQ=21)
ctcctTACCTTAAAGAAGCGTTCTTTGAAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCAc < 2:2078586/140‑1 (MQ=34)
ctcctTACCTTAAAGAAGCGTTCTTTGAAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCAc < 2:1610926/140‑1 (MQ=34)
ttaccttaAAGAAGCGTTCTTTGAAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAg > 2:1708064/1‑140 (MQ=37)
taccttaAAGAAGCGTTCTTTGAAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAgg > 2:2331610/1‑140 (MQ=34)
accttaAAGAAGCGTTCTTTGAAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGc < 2:1588870/140‑1 (MQ=34)
accttaAAGAAGCGTTCTTTGAAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTCGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGc < 1:1595578/140‑1 (MQ=21)
taAAGAAGCGTTCTTTGAAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTAc > 2:2042390/1‑140 (MQ=34)
taAAGAAGCGTTCTTTGAAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTAc > 1:2165896/1‑140 (MQ=37)
aagaagCGTTCTTTGAAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCa > 2:2199478/1‑140 (MQ=35)
cGTTCTTTGAAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTg > 2:1886616/1‑140 (MQ=34)
cGTTCTTTGAAGAGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCACCCCAGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGACCACAAAGGCCTACCAAATTTg > 2:1668238/1‑140 (MQ=11)
ttCTTTGAAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCa > 1:1750365/1‑140 (MQ=34)
cctttagctCAGCTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccattaaggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgc < 1:1900064‑M2/136‑67 (MQ=255)
ctttagcTCAGCTGGTTAGAGAGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccattaaggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgca > 2:373424‑M2/4‑73 (MQ=255)
tttagCTCAGCTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccattaaggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaa < 2:1346434‑M2/138‑69 (MQ=255)
ttaGCTCAGCTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTTGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaag > 2:1436364‑M2/2‑71 (MQ=255)
ttaGCTCAGCTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCGCCAttatcaacacatgagtgttgatcccattaaggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaag < 2:2169636‑M2/139‑70 (MQ=255)
ttaGCTCAGCTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccattaaggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaag > 2:1121051‑M2/2‑71 (MQ=255)
gCTCAGCTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcag > 2:249496‑M2/1‑68 (MQ=255)
tCAGCTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCTAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccaatacggggccatagctcagctgcgagagcgcctgccttgcaagcagga > 1:1411760‑M2/1‑66 (MQ=255)
tCAGCTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcagga > 2:19965‑M2/1‑66 (MQ=255)
cAGCTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggag < 1:1294063‑M2/140‑76 (MQ=255)
agctggttagAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccattaaggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggagg < 2:1384288‑M2/137‑77 (MQ=255)
ctggttAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggaggtc > 1:1451511‑M2/2‑62 (MQ=255)
tggtTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggaggtca > 2:2098445‑M2/1‑61 (MQ=255)
ggtTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccattaaggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggaggtcag > 1:1372127‑M2/1‑60 (MQ=255)
ggtTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggaggtcag > 2:55879‑M2/1‑60 (MQ=255)
ggtTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggaggtcag > 1:815255‑M2/1‑60 (MQ=255)
ggtTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggaggtcag > 1:726719‑M2/1‑60 (MQ=255)
ggtTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggaggtcag > 1:255996‑M2/1‑60 (MQ=255)
agCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccattaaggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggaggtcagcggttc < 1:1376237‑M2/140‑87 (MQ=255)
cgcACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgtttatcccaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggaggtcagcggttcga < 2:191391‑M2/140‑89 (MQ=255)
cgcACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccaatacggggccatagctcagctgggatagcgcctgccttgcaagcaggaggtcagcggttaga < 2:1186710‑M2/140‑89 (MQ=255)
cgcACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggaggtcagcggttcga < 1:213827‑M2/140‑89 (MQ=255)
cgcACCCATGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccattaaggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggaggtcagcggttcga < 1:881194‑M2/140‑89 (MQ=255)
gcACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccattaaggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggaggtcagcggttcgat > 2:435597‑M2/1‑51 (MQ=255)
cACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggaggtcagcggttcgatc > 1:384781‑M2/1‑50 (MQ=255)
cACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggaggtcagcggttcgatc > 2:1294063‑M2/1‑50 (MQ=255)
aCCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggaggtcag < 2:1171190‑M2/129‑81 (MQ=255)
aCCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggaggtcag > 1:1171190‑M2/1‑49 (MQ=255)
cccTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccaatacggggccatagctcagctgggatagcgcctgccttgcaagcaggaggtcagcggttagatcccg > 1:1186710‑M2/1‑47 (MQ=255)
cccTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggaggtcagcggttcgatcccg < 1:983467‑M2/140‑94 (MQ=255)
cccTGATAAGGGTGAGGTAGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggaggtcagcggttcgatcccg < 1:531534‑M2/140‑94 (MQ=255)
ccTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccattaaggggccatagctcagctgggagagcgcctgcattgcaagcaggaggtcagcggttcgatcccgc > 1:673176‑M2/1‑46 (MQ=255)
ccTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggaggtcagcggttcgatcccgc > 2:983467‑M2/1‑46 (MQ=255)
tGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggaggtcagtggttcgatcccgctt > 1:888155‑M2/1‑44 (MQ=255)
tGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggaggtcagcggttcgatcccgctt > 2:104934‑M2/1‑44 (MQ=255)
tGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggaggtcagcggttcgatcccgctt > 1:235358‑M2/1‑44 (MQ=255)
tGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggaggtaagcggttcgatcccgctt > 2:704249‑M2/1‑44 (MQ=255)
aTAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccattaaggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggaggtcagcggttcgatcccgcttgg < 1:540404‑M2/140‑99 (MQ=255)
aTAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggaggtcagcggttcgatcccgcttgg < 2:77029‑M2/140‑99 (MQ=255)
tAATGGTGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccattaaggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggatgtcagcggttcgatcccgcttggc > 2:396223‑M2/1‑41 (MQ=255)
tAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccattaaggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggaggtcagcggttcgatcccgcttggc > 2:110482‑M2/1‑41 (MQ=255)
ggTTAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggatgtcagcggttcgatcccgcttggctcca < 2:1056233‑M2/140‑104 (MQ=255)
ggTGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccattaaggggccatagctcagctgggatagcgcctgccttgcaagcaggaggtcagcggttcgatcccgcttggctcca < 2:922173‑M2/140‑104 (MQ=255)
ggTGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccattaaggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggaggtcagcggttcgatcccgcttggctcca < 1:524313‑M2/140‑104 (MQ=255)
ggTGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccattaaggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggaggtcagcggttcgatcc > 2:533366‑M2/1‑37 (MQ=255)
ggTGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccattaaggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggaggtcagcggttcgatcc < 1:533366‑M2/128‑92 (MQ=255)
ggTGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggaggtcagcggttcgatcccgcttggctcca < 2:1209749‑M2/140‑104 (MQ=255)
ggTGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggaggtcagcggttcgatcccgcttggctcca < 2:529010‑M2/140‑104 (MQ=255)
ggTGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggaggtcagcggttcgatcccgcttggctcca < 1:1235344‑M2/140‑104 (MQ=255)
ggTGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggaggtcagcggttcgatcccgcttggctcca < 2:725310‑M2/140‑104 (MQ=255)
ggTGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggaggtcagcggttcgatcccgcttggctcca < 1:101290‑M2/140‑104 (MQ=255)
ggTGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggaggtcagcggttcgatcccgcttggc < 2:202062‑M2/136‑100 (MQ=255)
ggTGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggaggtcagcggttcgatcccgcttggc > 1:202062‑M2/1‑37 (MQ=255)
tGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccattaaggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggaggtcagcggttcgatcccgcttggctccatt < 2:283561‑M2/140‑106 (MQ=255)
tGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccattaaggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggaggtcagcggttcgatcccgcttggctccatt < 1:1444867‑M2/140‑106 (MQ=255)
tGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccattaaggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggaggtcagcggttcgatcccgcttggctccatt < 2:508768‑M2/140‑106 (MQ=255)
tGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccattaaggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggaggtcagcggttagatcccgcttggctccatt < 2:36239‑M2/140‑106 (MQ=255)
tGAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggaggtcagcggttcgatcccgcttggctccatt < 1:243179‑M2/140‑106 (MQ=255)
gAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggaggtcagcggttcgatc > 1:50965‑M2/1‑34 (MQ=255)
gAGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggaggtcagcggttcgatc < 2:50965‑M2/124‑91 (MQ=255)
aGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccattaaggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggaggtcagcggttcgatcccgcttggctccatttg < 2:1549939‑M2/140‑108 (MQ=255)
aGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccaataagggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggaggtcagcggttcgatcccgcttggctccatttgt < 2:1147873‑M2/140‑108 (MQ=255)
ggTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccattaaggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggaggtcagcggttcgatcccgcttggctccatttgt < 2:1114860‑M2/140‑109 (MQ=255)
ggTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggaggtcagcggttcgatcccgcttggctccatttgt > 2:436110‑M2/1‑32 (MQ=255)
ggTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggaggtcagcggttcgatcccgcttggctccatttgt > 2:243179‑M2/1‑32 (MQ=255)
ggTCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggaggtcagcggttcgatcccgcttggctccatttgt > 2:101290‑M2/1‑32 (MQ=255)
tCGGTGGTTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccattaaggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggaggtcagcggttcgatcccgcttggctccatttgttc > 1:1159044‑M2/1‑30 (MQ=255)
gtggtTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggaggtcagcggttcgatcccgctt > 1:948940‑M2/1‑27 (MQ=255)
gtggtTCGAGTCCACTAAGGCCCACCAttatcaacacatgagtgttgatcccaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcaagcaggaggtcagcggttcgatcccgctt < 2:948940‑M2/123‑97 (MQ=255)
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GATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTTCTTTGAAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCACGGCAAATTTGAAGAGGTTTTAACTACATGTTATGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAGGTCTGCGGTTCGATCCCGCATAG > NC_000913/4037060‑4037327
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
