Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A39 F60 I1 R1
|
12 |
43.9 |
1501804 |
99.4% |
1492793 |
139.5 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| JC JC |
NC_000913 |
4,538,410 |
IS5 (–) +4 bp |
coding (353‑356/1107 nt) |
nanM ← |
N‑acetylneuraminate mutarotase |
|
| |
seq id |
position |
reads (cov) |
reads (cov) |
score |
skew |
freq |
annotation |
gene |
product |
| * |
? |
NC_000913 |
= 2290113 | NA (NA) | 65 (1.460) |
46/278 |
0.0 |
100% |
noncoding (1/1195 nt) |
IS5 |
repeat region |
| ? | NC_000913 |
4538410 = |
0 (0.000) | coding (356/1107 nt) |
nanM |
N‑acetylneuraminate mutarotase |
| * |
? |
NC_000913 |
3652036 = | NA (NA) | 50 (1.130) |
32/278 |
0.3 |
100% |
noncoding (1195/1195 nt) |
IS5 |
repeat region |
| ? | NC_000913 |
= 4538413 |
0 (0.000) | coding (353/1107 nt) |
nanM |
N‑acetylneuraminate mutarotase |
AAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/2289976‑2290113
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCAATGCCGCCAAACACATACAGATTGCCATCAATAAATGCAGAGGTTGCTTGATCTCTTGG > NC_000913/4538410‑4538546
AAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTT > 2:510609/1‑140
TCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAACCC < 2:244872/140‑1
TCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAACCCAACTA < 1:644380/140‑1
GACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAACCCAACTATTGGTTTT < 2:413921/140‑1
GACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAACCCAACTATTGGTTTT < 1:535966/140‑1
ACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGGTGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAACCCAACTATTGGTTTTG > 1:45312/1‑140
ACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAACCCAACTATTGGTTTTG > 2:509710/1‑140
GCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCCCAACTATTGGTTTTGGGG < 2:94210/140‑1
GCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGG < 1:716201/140‑1
CTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTG < 1:21515/140‑1
CTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATT > 2:526416/1‑140
CTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATT > 2:220271/1‑140
CTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATT > 2:509546/1‑140
TGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTG < 2:726011/140‑1
GAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGATCCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCTTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGT < 2:532965/140‑1
AATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTA < 1:526416/140‑1
TCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGT < 1:695127/140‑1
ACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCA > 2:408463/1‑140
ACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCA < 2:478086/140‑1
TGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATT > 1:242917/1‑140
TGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATT > 2:639261/1‑140
TGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATT < 1:408463/140‑1
GAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACC < 2:277988/140‑1
GAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACC < 1:107015/140‑1
GGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGA > 1:109050/1‑140
GATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCC < 1:672298/140‑1
TGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCT > 1:170725/1‑140
ACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCG < 1:382329/140‑1
ATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGT > 1:496706/1‑140
ATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGT > 2:165792/1‑140
CCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCA > 2:98013/1‑140
CCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCA > 1:640490/1‑140
CCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCAA < 2:109050/140‑1
CCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCAA < 2:635158/140‑1
CTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCAAT > 1:174147/1‑140
CTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCAAT > 1:240920/1‑140
TGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCAATG > 2:270647/1‑140
GTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCAATGC > 1:487803/1‑140
GTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCAATGC > 2:37501/1‑140
GTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCAATGC > 1:591301/1‑140
TTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCAATGCC > 1:729188/1‑140
ATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCAATGCCGCCA < 1:334549/140‑1
TGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCAATGCCGCCAA > 1:125997/1‑140
TGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCAATGCCGCCAA > 2:68643/1‑140
GGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCAATGCCGCCAAA > 2:479083/1‑140
CTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCAATGCCGCCAAACA > 1:591239/1‑140
CCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCAATGCCGCCAAACACA > 1:666054/1‑140
CCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCAATGCCGCCAAACACA > 2:202806/1‑140
GATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTCGTTCGCACCTTCCTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCAT‑‑AATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCAATGCCGCCAAA < 1:139371/131‑1
GATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTCGTTCGCACCTTCCTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCAT‑‑AATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCAATGCCGCCAAA > 2:139371/1‑131
GACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCAATGCCGCCAAACACATACAGA < 1:509546/140‑1
GACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCAATGCCGCCAAACACATACAGA < 1:220271/140‑1
TCTCATATCAGGGACTTGTTCGTACCTTCCTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCAATGCCGCCAAACACATACAGATTGCCATCAAT < 2:386482/140‑1
TCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCAATGCCGCCAAACACATACAGATTGCCATCAAT > 1:656457/1‑140
TCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCAATGCCGCCAAACACATACAGATTGCCATCAAT < 2:125997/140‑1
GGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCAATGCCGCCAAACACATACAGATTGCCATCAATAAATGCAGAG > 2:511589/1‑140
GGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCAATGCCGCCAAACACATACAGATTGCCATCAATAAATGCAGAG < 2:170725/140‑1
GGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCAATGCCGCCAAACACATACAGATTGCCATCAATAAATGCAGAG > 2:748976/1‑140
GGACTTGTTCGCACCTTCCTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCAATGCCGCCAAACACATACAGATTGCCATCAATAAATGCAGAGG > 1:218278/1‑140
CTTGTTCGCACCTTCCTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCAATGCCGCCAAACACATACAGATTGCCATCAATAAATGCAGAGGTTG > 1:675561/1‑140
GTTCGCACCTTCCTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCAATGCCGCCAAACACATACAGATTGCCATCAATAAATGCAGAGGTTGCTT > 1:743238/1‑140
TTCGCACCTTCCTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCAATGCCGCCAAACACATACAGATTGCCATCAATAAATGCAGAGGTTGCTTG < 2:675561/140‑1
GCACCTTCCTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCAATGCCGCCAAACACATACAGATTGCCATCAATAAATGCAGAGGTTGCTTGATC > 2:78856/1‑140
CTTCCTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCAATGCCGCCAAACACATACAGATTGCCATCAATAAATGCAGAGGTTGCTTGATCTCTT > 2:745167/1‑140
TCCTTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCAATGCCGCCAAACACATACAGATTGCCATCAATAAATGCAGAGGTTGCTTGATCTCTTGG > 1:569174/1‑140
AAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/2289976‑2290113
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTAACCCAACTATTGGTTTTGGGGTTGTATTTGTGTACGTCATTAAATACCTGAGTCAAGCCCTCGCTGTTTTTGCCAATGCCGCCAAACACATACAGATTGCCATCAATAAATGCAGAGGTTGCTTGATCTCTTGG > NC_000913/4538410‑4538546
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
|---|
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |
GATK/CNVnator alignment
N/A
