Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A31 F60 I1 R1
|
12 |
96.5 |
3303246 |
98.4% |
3250394 |
139.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,330,783 |
T→G |
G94G (GGT→GGG) |
proP → |
osmolyte:H(+) symporter ProP |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,330,783 | 0 | T | G | 98.2%
| 425.5
/ NA
| 112 | G94G (GGT→GGG) | proP | osmolyte:H(+) symporter ProP |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/2); new base G (48/62); total (48/64) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.06e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 113 total aligned reads displayed.
TACGCATTAGGTAAAGTTTTTTTCCCGGGGGCTGACCCCAGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGTCGCCAGAAGATCCTCGCTATCACTATTGTGATTATGTCGATCAGTACGTTCTGTATTGGCTTAATACCGTCCTACGACACGATTGGTATTTGGGCACCGATTCTGCTGTTGATCTGTAAGATGGCACAAGGTTTC > NC_000913/4330646‑4330918
|
tACGCATTAGGTAAAGTTTTTTTCCCGGGGGCTGACCCCAGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGGCg > 1:881130/1‑140 (MQ=255)
tACGCATTAGGTAAAGTTTTTTTCCCGGGGGCTGACCCCAGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGGCg > 2:863833/1‑140 (MQ=255)
aTTAGGTAAAGTTTTTTTCCCGGGGGCTGACCCCAGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGGCGCCaga > 2:827115/1‑140 (MQ=255)
aGGTAAAGTTTTTTTCCCGGGGGCTGACCCCAGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGGCGCCagaaga > 1:216153/1‑140 (MQ=255)
aGGTAAAGTTTTTTTCCCGGGGGCTGACCCCAGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGGCGCCagaaga > 1:1313146/1‑140 (MQ=255)
aGGTAAAGTTTTTTTCCCGGGGGCTGACCCCAGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGCGGACTCTTCTTTGGTAGGTTGGGAGATAAAAATGGGCGCCagaaga > 1:475946/1‑140 (MQ=255)
ggTAAAGTTTTTTTCCCGGGGGCTGACCCCAGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGCGGACTCTTCTTAGGTGTGTTGGGCGATAAGTATGGGCGCCAGAAGAt > 2:464356/1‑140 (MQ=255)
tAAAGTTTTTTTCCCGGGGGCTGACCCCAGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGGCGCCAGAAGATcc < 2:174178/140‑1 (MQ=255)
aaaGTTTTTTTCCCGGGGGCTGACCCCAGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGGCGCCagaa > 1:881183/1‑134 (MQ=255)
aaaGTTTTTTTCCCGGGGGCTGACCCCAGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGGCGCCagaa < 2:881183/134‑1 (MQ=255)
aaaGTTTTTTTCCCGGGGGCTGACCCCAGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGGCGCCAGAAGATCCt < 2:252789/140‑1 (MQ=255)
aaaGTTTTTTTCCCGGGGGCTGACCCCAGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGGCGCCAGAAGATCCt < 2:1421035/140‑1 (MQ=255)
aaGTTTTTTTCCCGGGGGCTGACCCCAGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGGCGCCAGAAGATCCTc < 1:2309/140‑1 (MQ=255)
aGTTTTTTTCCCGGGGGCTGACCCCAGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGGCGCCAGAAGATCCTCg > 1:915486/1‑140 (MQ=255)
gTTTTTTTCCCGGGGGCTGACCCCAGCGTGCGGATGGTTCCTGCACTTTCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGGCGCCAGAAGATCCTCGc < 2:475946/140‑1 (MQ=255)
gTTTTTTTCCCGGGGGCTGACCCCAGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGGCGCCAGAAGATCCTCGc < 2:375112/140‑1 (MQ=255)
gTTTTTTTCCCGGGGGCTGACCCCAGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGGCGCCAGAAGATCCTCGc < 2:915486/140‑1 (MQ=255)
gTTTTTTTCCCGGGGGCTGACCCCAGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGGCGCCAGAAGATCCTCGc < 2:1416091/140‑1 (MQ=255)
gTTTTTTTCCCGGGGGCTGACCCCAGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGGCGCCAGAAGATCCTCGc < 1:1471783/140‑1 (MQ=255)
gTTTTTTTCCCGGGGGCTGACCCCAGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGGCGCCAGAAGATCCTCGc < 2:1225231/140‑1 (MQ=255)
gTTTTTTTCCCGGGGGCTGACCCCAGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGGCGCCAGAAGATCCTCGc > 2:1180847/1‑140 (MQ=255)
gTTTTTTTCCCGGGGCCTGACCCCACCGTTCAGATGGCTGCTGCACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGGCGCCAGAAGATCCTCGc < 1:464356/140‑1 (MQ=255)
tttttttCCCGGGGGCTGACCCCAGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGGCGCCAGAAGATCCTCGCt < 2:1313146/140‑1 (MQ=255)
tttttCCCGGGGGCTGACCCCAGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGGCGCCAGAAGATCCTCGCTAt < 2:881130/140‑1 (MQ=255)
tttttCCCGGGGGCTGAACCCAGCGTGCAGAAGGTCGCTCCACTTGCCGCTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGGCGCCAGAAGATCCTCGCTAt < 2:526824/140‑1 (MQ=255)
ttttCCCGGGGGCTGACCCCAGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGGCGCCAGAAGATCCTCGCTATc < 2:216153/140‑1 (MQ=255)
tttCCCGGGGGCTGACCCCAGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGGCGCCAGAAGATCCTCGCTATCa < 1:1180847/140‑1 (MQ=255)
tttCCCGGGGGCTGACCCCAGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGGCGCCAGAAGATCCTCGCTATCa < 2:50150/140‑1 (MQ=255)
ccGGGGGCTGACCCCAGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGGCGCCAGAAGATCCTCGCTATCACTAt < 1:107457/140‑1 (MQ=255)
ccGGGGGCTGACCCCAGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGGCGCCAGAAGATCCTCGCTATCACTAt < 1:1228598/140‑1 (MQ=255)
ccGGGGGCTGACCCCAGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGGCGCCAGAAGATCCTCGCTATCACTAt < 1:1632763/140‑1 (MQ=255)
gggggCTGACCCCAGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGGCGCCAGAAGATCCTCGCTATCACTATtg > 2:849913/1‑140 (MQ=255)
ggCTGACCCCAGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCGCTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGGCGCCAGAAGATCCTCGCTATCACTATTGTGa < 2:1161092/140‑1 (MQ=255)
aCCCCAGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGGCGCCAGAAGATCCTCGCTATCACTATTGTGATTATg < 1:272805/140‑1 (MQ=255)
aGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAGATATGGGCCCCATAAGATCCTCGCTTTCACCATTGTGATTATGTCGAt > 2:727649/1‑140 (MQ=255)
aGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGGCGCCAGAAGATCCTCGCTATCACTAt < 1:367901/125‑1 (MQ=255)
aGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGGCGCCAGAAGATCCTCGCTATCACTAt > 2:367901/1‑125 (MQ=255)
aGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGGCGCCAGAAGATCCTCGCTATCACTATTGTGATTATGTCGAt > 1:1290115/1‑140 (MQ=255)
aGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGGCGCCAGAAGATCCTCGCTATCACTATTGTGATTATGTCGAt > 1:1400386/1‑140 (MQ=255)
tGCAGATGGTTGCTGTACTTGCAACGTTCACCGTTCCATTTCTGATTCGACCGCTTGGCGGGCTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGTCGCCAGAAGATCCTCGCTATCGCTATTGTGATTATGTCGATCAGt < 1:696623/140‑1 (MQ=255)
tGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGGCGCCAGAAGATCCTCGCTATCACTATTGTGa > 1:107773/1‑126 (MQ=255)
tGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGGCGCCAGAAGATCCTCGCTATCACTATTGTGa < 2:107773/126‑1 (MQ=255)
tGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGGCGCCAGAAGATCCTCGCTATCACTATTGTGATTATGTCGATCAGt < 1:827115/140‑1 (MQ=255)
tGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGGCGCCAGAAGATCCTCGCTATCACTATTGTGATTATGTCGATCAGt < 2:1290115/140‑1 (MQ=255)
gCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGGCGCCAGAAGATCCTCGCTATCACTATTGTGATTATGTCGATCAGTa > 2:344819/1‑140 (MQ=255)
aGATGGTTGCTGCACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGGCGCCAGAAGATCCTCGCTCTCACTATTGTGATTATGTCGATCAGTACg > 1:643412/1‑140 (MQ=255)
gATGGTTGCTGCACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGGCGCCAGAAGATCCTCGCTATCACTATTGTGATTATGTCGATCAGTACGt < 1:1003668/140‑1 (MQ=255)
gATGGTTGCTGCACTTAACACTTTCTCCGTTACCTTTCTGATTCGACCGCTTGGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGGCGCCAGAAGATCCTCGCTATCACTATTGTGATTATGTCGATCAGTACGt < 2:761490/140‑1 (MQ=255)
aTGGTTGCTGCACTTTCCACTTTCTCCGTGCCCTTTCCGATTCGACCGCTTGGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGGCGCCAGAAGATCCTCGCTATCACTATTGTGATTATGTCGATCAGTACGtt < 1:727649/140‑1 (MQ=255)
tgctgcACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGGCGCCAGAAGATCCTCGCTATCACTATTGTGATTATGTCGATCAGTACGTTCTGTa < 1:1356222/140‑1 (MQ=255)
tgctgcACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGGCGCCAGAAGATCCTCGCTATCACTAATGTCATGATGTCGATCAGTACGTTCTGTa > 1:775233/1‑140 (MQ=255)
gctgcACTTGCCACTTTTTCCGTTCCCTTTCCGATTCGACCGCTTGGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGGCGCCAGAAGATCCTCGCTATCACTATTGTGATTATGTCGATCAGTACGTTCTGTAt < 2:717368/140‑1 (MQ=255)
gctgcACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGGCGCCAGAAGATCCTCGCTATCACTATTGTGATTATGTCGATCAGTACGTTCTGTAt < 2:218810/140‑1 (MQ=255)
gctgcACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGGCGCCAGAAGATCCTCGCTATCACTATTGTGATTATGTCGATCAGTACGTTCTGTAt < 2:1522805/140‑1 (MQ=255)
gctgcACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGGCGCCAGAAGATCCTCGCTATCACTATTGTGATTATGTCGATCAGTACGTTCTGTAt < 2:1220035/140‑1 (MQ=255)
gctgcACTTGCCACTCTCTCCGCTCCCTTGCTGATTCTACCGCTTGGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGGCGCCAGAAGATCCTCGCTATCACTATTGTGATTATGTCGATCAGTACGTTCTGTAt < 1:426770/140‑1 (MQ=255)
gcACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGGCGCCAGAAGATCCTCGCTATCACTATTGTGATTATGTCGATCAGTACGTTCTGTATTgg < 1:71087/140‑1 (MQ=255)
aCTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGGCGCCAGAAGATCCTCGCTATCACTATTGTGATTATGTCGATCAGTACGTTCTGTATTGGCt < 1:344819/140‑1 (MQ=255)
tGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGGCGCCAGAAGATCCTCGCTATCACTATCGTGATTAAGTCGATTAGTACGATCTGTATTGGCTTaa > 1:713157/1‑140 (MQ=255)
tctcCGTTCCCTTTCTGATTCGTCCGCTTGGGGGATTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGGCGCCAGAAGATCCTCGCTATCACTATTGTGATTATGTCGATCAGTACGTTCTGTATTGGCTTAATACCGTcc < 2:713157/140‑1 (MQ=255)
ctcCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGGCGCCAGAAGATCCTCGCTATCACTATTGTGATTATGTCGATCAGTACGTTCTGTATTGGCTTAATACCGTCCt > 2:1441106/1‑140 (MQ=255)
ccGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGGCGCCAGAAGATCCTCGCTATCACTATTGTGATTATGTCGATCAGTACGTTCTGTATTGGCTTAATACCGTCCTAc < 1:1441106/140‑1 (MQ=255)
ccGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGGCGCCAGAAGATCCTCGCTATCACTATTGTGATTATGTCGATCAGTACGTTCTGTATTGGCTTAATACCGTCCTAc > 2:299532/1‑140 (MQ=255)
cTTTCTGATTCGACCGCTTGGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGGCGCCAGAAGATCCTCGCTATCACTATTGTGATTATGTCGATCAGTACGTTCTGTATTGGCTTAATACCGTCCTACGACACGa > 2:1412101/1‑140 (MQ=255)
tttCTGATTCGACCGCTTTGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGGCGCCAGAAGATCCTCGCTATCACTATTGTGATTATGTCGATCAGTACGTTCTGTATTGGCTTAATACCGTCCTACGACACGAt > 2:212569/1‑140 (MQ=255)
tttCTGATTCGACCGCTTGGCGTACCCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGGCGCCAGAAGATCCTCGCTATCACTATTGTGATTATGTCGATCAGTACGTTCTGTATTGGCTTAATACCGTCCTACGACACGAt < 1:688164/140‑1 (MQ=255)
tttCTGATTCGACCGCTTGGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGGCGCCAGAAGATCCTCGCTATCACTATTGTGATTATGTCGATCAGTACGTTCTGTATTGGCTTAATACCGTCCTACGACACGAt < 1:849913/140‑1 (MQ=255)
tttCTGATTCGACCGCTTGGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGGCGCCAGAAGATCCTCGCTATCACTATTGTGATTATGTCGATCAGTACGTTCTGTATTGGCTTAATACCGTCCTACGACACGAt < 1:858348/140‑1 (MQ=255)
tttCTGATTCGACCGCTTGGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGGCGCCAGAAGATCCTCGCTATCACTATTGTGATTATGTCGATCAGTACGTTCTGTATTGGCTTAATACCGTCCTACGACACGAt > 1:1194833/1‑140 (MQ=255)
ttCTGATTCGACCGCTTGGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGGCGCCAGAAGATCCTCGCTATCACTATTGTGATTATGTCGATCAGTACGTTCTGTATTGGCTTAATACCGTCCTACGACACGAtt < 1:299532/140‑1 (MQ=255)
ttCTGATTCGACCGCTTGGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGGCGCCAGAAGATCCTCGCTATCACTATTGTGATTATGTCGATCAGTACGTTCTGTATTGGCTTAATACCGTCCTACGACACGAtt < 2:1297195/140‑1 (MQ=255)
gACCGCTTGGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGGCGCCAGAAGATCCTCGCTATCACTATTGTGATTATGTCGATCAGTACGTTCTGTATTGGCTTAATACCGTCCTACGACACGATTGGTATTTgg > 1:1203974/1‑140 (MQ=255)
aCCGCTTGGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGGCGCCAGAAGATCCTCGCTATCACTATTGTGATTATGTCGATCAGTACGTTCTGTATTGGCTTAATACCGTCCTACGACACGAt > 2:1213918/1‑129 (MQ=255)
ccGCTTGGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGTCGCCAGAAGATCCTCGCTATCACTATTGTGATTATGTCGATCAGTACGTTCTGTATTGGCTTAATACCGTCCTACGACACGATTGGTATTTGGGc < 1:1279202/140‑1 (MQ=255)
cGCTTGGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGGCGCCAGAAGATCCTCGCTATCACTATTGTGATTATGTCGATCAGTACGTTCTGTATTGGCTTAATACCGTCCTACGACACGATTGGTATTTGGGCa > 2:1538414/1‑140 (MQ=255)
gCTTGGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGGCGCCAGAAGATCCTCGCTATCACTATTGTGATTATGTCGATCAGTACGTTCTGTATTGGCTTAATACCGTCCTACGACACGATTGGTATTTGGGCAc < 2:1203974/140‑1 (MQ=255)
gCTTGGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGGCGCCAGAAGATCCTCGCTATCACTATTGTGATTATGTCGATCAGTACGTTCTGTATTGGCTTAATACCGTCCTACGACACGATTGGTATTTGGGCAc < 1:15819/140‑1 (MQ=255)
cTTGGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGGCGCCAGAAGATCCTCGCTATCACTATTGTGATTATGTCGATCAGTACGTTCTGTATTGGCTTAATACCGTCCTACGACACGATTGGTATTTGGGCAcc > 1:322685/1‑140 (MQ=255)
ttGGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGGCGCCAGAAGATCCTCGCTATCACTATTGTGATTATGTCGATCAGTACGTTCTGTATTGGCTTAATACCGTCCTACGACACGAtt > 1:131541/1‑125 (MQ=255)
ttGGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGGCGCCAGAAGATCCTCGCTATCACTATTGTGATTATGTCGATCAGTACGTTCTGTATTGGCTTAATACCGTCCTACGACACGAtt < 2:131541/125‑1 (MQ=255)
ttGGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGGCGCCAGAAGATCCTCGCTATCACTATTGTGATTATGTCGATCAGTACGTTCTGTATTGGCTTAATACCGTCCTACGACACGATTGGTATTTGGGCACCg > 2:1460069/1‑140 (MQ=255)
tGGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGGCGCCAGAAGATCCTCGCTATCACTATTGTGATTATGTCGATCAGTACGTTCTGTATTGGCTTAATACCGTCCTACGACACGATTGGTATTTGGGCACCGa > 1:110394/1‑140 (MQ=255)
gCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGGCGCCAGAAGATCCTCGCTATCACTATTGTGATTATGTCGATCAGTACGTTCTGTATTGGCTTAATACCGTCCTACGACACGATTGGTATTTGGGCACCGAtt < 1:1266776/140‑1 (MQ=255)
tcttctTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGGCGCCAGAAGATCCTCGCTATCACTATTGTGATTATGTCGATCAGTACGTTCTGTATTGGCTTAATACCGTCCTACGACACGATTGGTATTTGGGCACCGATTctgctg < 2:300437/140‑1 (MQ=255)
tcttctTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGGCGCCAGAAGATCCTCGCTATCACTATTGTGATTATGTCGATCAGTACGTTCTGTATTGGCTTAATACCGTCCTACGACACGATTGGTATTTGGGCACCGATTctgctg > 2:16812/1‑140 (MQ=255)
cttcttTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGGCGCCAGAAGATCCTCGCTATCACTATTGTGATTATGTCGATCAGTACGTTCTGTATTGGCTTAATACCGTCCTACGACACGATTGGTATTTGGGCACCGATTCTGCTGt < 1:1538414/140‑1 (MQ=255)
cttcttTGGTATGTTGGCCGATCAATATGGACGGCAGAATATCCTCGCTATCACTATTGTGATTATGTCGATCAGTACGTTCTGTATTGGCTTAATACCGTCCTACGACACGATTGGTATTTGGGCACCGATTCTGCTGt < 2:775233/140‑1 (MQ=255)
tcttTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGGCGCCAGAAGATCCTCGCTATCACTATTGTGATTATGTCGATCAGTACGTTCTGTATTGGCTTAATACCGTCCTACGACACGATTGGTATTTGGGCACCGATTCTGCTGTTg < 1:16812/140‑1 (MQ=255)
tGTTGGGCGATAAATATGGGCGCCAGAAGATCCTCGCTATCACTATTGTGATTATGTCGATCAGTACGTTCTGTATTGGCTTAATACCGTCCTACGACACGATTGGTATTTGGGCACCGATTCTGCTGTTGATCTGTAAg > 2:1545177/1‑140 (MQ=255)
tGTTGGGCGATAAATATGGGCGCCAGAAGATCCTCGCTATCACTATTGTGATTATGTCGATCAGTACGTTCTGTATTGGCTTAATACCGTCCTACGACACGATTGGTATTTGGGCACCGATTCTGCTGTTGATCTGTAAg > 2:215504/1‑140 (MQ=255)
ttGGGCGATAAATATGGGCGCCAGAAGATCCTCGCTATCACTATTGTGATTATGTCGATCAGTACGTTCTGTATTGGCTTAATACCGTCCTACGACACGATTAGTATTTGAGCAACGTTTCTGCGGTTGATCTGTAAGAt > 1:466408/1‑140 (MQ=255)
ggCGATAAATATGGGCGCCAGAAGATCCTCGCTATCACTATTGTGATTATGTCGATCAGTACGTTCTGTATTGGCTTAATACCGTCCTACGACACGATTGGTGTTTGGGCGCCGTTTCTGCTGTTGATCTGTAAGATGGc > 1:726305/1‑140 (MQ=255)
ggCGATAAATATGGGCGCCAGAAGATCCTCGCTATCACTATTGTGATTATGTCGATCAGTACGTTCTGTATTGGCTTAATACCGTCCTACGACACGATTGGTGTTTGGGCGCCGGTTATGCTGTGGATCTGTAAGATGGc > 1:453988/1‑140 (MQ=255)
gCGATAAATATGGGCGCTAGAACATCCTCGCTATCCCTACTGTGATTACGTCGATCAGTACGTTCTGTATTGGCTTAATACCGTCCTACGACACGATTGGTATTTGGGCACCGATTCTGCTGTTGATCTGTAAGATGGca < 2:453988/140‑1 (MQ=255)
gCGATAAATATGGGCGCCAGAAGATCCTCGCTATCACTATTGTGATTATGTCGATCAGTACGTTCTGTATTGGCTTAATACCGTCCTACGACACGATTGGTATTTGGGCACCGATTCTGCTGTTGATCTGTAAg > 1:945536/1‑134 (MQ=255)
cGATAAATATGGGCGCCAGAAGATCCTCGCTATCACTATTGTGATTATGTCGATCAGTACGTTCTGTATTGGCTTAATACCGTCCTACGACACGATTGGTATTTGGGCACCGATTCTGCTGTTg > 1:1321756/1‑124 (MQ=255)
cGATAAATATGGGCGCCAGAAGATCCTCGCTATCACTATTGTGATTATGTCGATCAGTACGTTCTGTATTGGCTTAATACCGTCCTACGACACGATTGGTATTTGGGCACCGATTCTGCTGTTGATCTGTAAGATGGcac > 1:1452548/1‑140 (MQ=255)
aaTATGGGCGCCAGAAGATCCTCGCTATCACTATTGTGATTATGTCGATCAGTACGTTCTGTATTGGCTTAATACCGTCCTACGACACGATTGGTATTTGGGCACCGATTCTGCTGTTGATCTGTAAGATGGCACAAGGt > 2:875119/1‑140 (MQ=255)
aaTATGGGCGCCAGAAGATCCTCGCTATCACTATTGTGAATATGTCGATCAGTACGTTCTGTATTGGCTTAATACCGTCCTACGACACGATTGGTATTTGGGCACCGATTCTGCTGTTGATCTGTAAGATGGCACAAGGt > 2:943691/1‑140 (MQ=255)
atGGGCGCCAGAAGATCCTCGCTATCACTATTGTGATTATGTCGATCAGTACGTTCTGTATTGGCTTAATACCGTCCTACGACACGATTGGTATTTGGGCACCGATTCTGCTGTTGATCTGTAAGATGGCACAAGGTTtc > 1:1138511/1‑140 (MQ=255)
|
TACGCATTAGGTAAAGTTTTTTTCCCGGGGGCTGACCCCAGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGTCGCCAGAAGATCCTCGCTATCACTATTGTGATTATGTCGATCAGTACGTTCTGTATTGGCTTAATACCGTCCTACGACACGATTGGTATTTGGGCACCGATTCTGCTGTTGATCTGTAAGATGGCACAAGGTTTC > NC_000913/4330646‑4330918
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
