Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A6 F60 I1 R1
|
15 |
82.6 |
2828648 |
98.9% |
2797532 |
138.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,280,612 |
C→T |
S211S (AGC→AGT) |
yjcE → |
putative transporter YjcE |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,280,612 | 0 | C | T | 98.7%
| 239.1
/ NA
| 74 | S211S (AGC→AGT) | yjcE | putative transporter YjcE |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); new base T (38/35); total (38/36) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.86e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
CCGTAGCAGTGGCGATGGGGACGATGATCTTCACCGTCGGCGGTGCGACGGTCGAATTTATGAAAGTAGCCATTGGCGGTATTCTCGCCGGTTTTGTGGTGAGCTGGCTGTACGGTCGCTCGCTGCGATTCCTCAGCCGCTGGGGCGGTGATGAACCCGCGACGCAGATCGTCCTGCTGTTCCTGCTGCCATTCGCTTCTTATCTGATTGCCGAACATATTGGCGTTTCCGGCATCCTCGCTGCGGTTGCCGCCGGGATGACCATCACCC > NC_000913/4280476‑4280745
|
ccGTAGCAGTGGCGATGGGGACGATGATCTTCACCGTCGGCGGTGCGACGGTCGAATTTATGAAAGTAGCCATTGGCGGTATTCTCGCCGGTTTTGTGGTGAGCTGGCTGTACGGTCGCTCGCTGCGATTCCTCAGTCGc < 2:1162105/140‑1 (MQ=255)
aGTGGCGATGGGGACGATGATCTTCACCGTCGGCGGTGCGACGGTCGAATTTATGAAAGTAGCCATTGGCGGTATTCTCGCCGGTTTTGTGGTGAGCTGGCTGTACGGTCGCTCGCTGCGATTCCTCAGTCGCTGGGGCg < 1:1245745/140‑1 (MQ=255)
ggggACGATGATCTTCACCGTCGGCGGTGCGACGGTCGAATTTATGAAAGTAGCCATTGGCGGTATTCTCGCCGGTTTTGTGGTGAGCTGGCTGTACGGTCGCTCGCTGCGATTCCTCAGTCGCTGGGGCGGTGATGAAc > 1:740226/1‑140 (MQ=255)
gACGATGATCTTCACCGTCGGCGGTGCGACGGTCGAATTTATGAAAGTAGCCATTGGCGGTATTCTCGCCGGTTTTGTGGTGAGCTGGCTGTACGGTCGCTCGCTGCGATTCCTCAGTCGCTGGGGCGGTGATGAACCcg < 1:863468/140‑1 (MQ=255)
gACGATGATCTTCACCGTCGGCGGTGCGACGGTCGAATTTATGAAAGTAGCCATTGGCGGTATTCTCGCCGGTTTTGTGGTGAGCTGGCTGTACGGTCGCTCGCTGCGATTCCTCAGTCGCTGGGGCGGTGATGAACCcg < 1:912685/140‑1 (MQ=255)
gACGATGATCTTCACCGTCGGCGGTGCGACGGTCGAATTTATGAAAGTAGCCATTGGCGGTATTCTCGCCGGTTTTGTGGGGAGCTGGCTGTACGGTCGCTCGCTGCGATTCCTCAGTCGGTGGGGCGGGGGTGAAcccc > 2:1041388/1‑139 (MQ=255)
gatgatCTTCACCGTCGGCGGTGCGACGGTCGAATTTATGAAAGTAGCCATTGGCGGTATTCTCGCCGGTTTTGTGGTGAGCTGGCTGTACGGTCGCTCGCTGCGATTCCTCAGTCGCTGGGGCGGTGATGAACCCGCGa < 1:1041388/140‑1 (MQ=255)
atCTTCACCGTCGGCGGTGCGACGGTCGAATTTATGAAAGTAGCCATTGGCGGTATTCTCGCCGGGTTTGTGGTGAGCTGGCTGTACGGTCGCTCGCTGCGATTCCTCAGTCGCTGGGGCGGTGATGAACCCGCGACGCa > 2:1202388/1‑140 (MQ=255)
tCTTCACCGTCGGCGGTGCGACGGTCGAATTTATGAAAGTAGCCATTGGCGGTATTCTCGCCGGTTTTGTGGTGAGCTGGCTGTACGGTCGCTCGCTGCGATTCCTCAGTCGCTGGGGCGGTGATGAACCCGCGACGCAg > 1:900134/1‑140 (MQ=255)
tCTTCACCGTCGGCGGTGCGACGGTCGAATTTATGAAAGTAGCCATTGGCGGTATTCTCGCCGGTTTTGTGGTGAGCTGGCTGTACGGTCGCTCGCTGCGATTCCTCAGTCGCTGGGGCGGTGATGAACCCGCGACGCAg > 2:919785/1‑140 (MQ=255)
ttCACCGTCGGCGGTGCGACGGTCGAATTTATGAAAGTAGCCATTGGCGGTATTCTCGCCGGTTTTGTGGTGAGCTGGCTGTACGGTCGCTCGCTGCGATTCTTCAGTCGGTGGGGCTGTGATGCACCCGCGACGCAGAt > 1:571049/1‑140 (MQ=255)
ttCACCGTCGGCGGTGCGACGGTCGAATTTATGAAAGTAGCCATTGGCGGTATTCTCGCCGGTTTTGTGGTGAGCTGGCTGTACGGTCGCTCGCTGCGATTCCTCAGTCGCTGGGGCGGTGATGAACCcg < 2:1055098/130‑1 (MQ=255)
ttCACCGTCGGCGGTGCGACGGTCGAATTTATGAAAGTAGCCATTGGCGGTATTCTCGCCGGTTTTGTGGTGAGCTGGCTGTACGGTCGCTCGCTGCGATTCCTCAGTCGCTGGGGCGGTGATGAACCcg > 1:1055098/1‑130 (MQ=255)
ttCACCGTCGGCGGTGCGACGGTCGAATTTATGAAAGTAGCCATTGGCGGTATTCTCGCCGGTTTTGTGGTGAGCTGGCTGTACGGTCGCTCGCTGCGATTCCTCAGTCGCTGGGGCGGTGATGAACCCGCGACGCAGAt > 1:900803/1‑140 (MQ=255)
tCACCGTCGGCGGTGCGACGGTCGAATTTATGAAAGTAGCCATTGGCGGTATTCTCGCCGGTTTTGTGGTGAGCTGGCTGTACGGTCGCTCGCTGCGATTCCTCAGTCGCTGGGGCGGTGATGAACCCGCGACGCAGATc > 2:1218500/1‑140 (MQ=255)
cGTCGGCGGTGCGACGGTCGAATTTATGAAAGTAGCCATTGGCGGTATTCTCGCCGGTTTTGTGGTGAGCTGGCTGTACGGTCGCTCGCTGCGATTCCTCAGGCGCTGGGGCGGGGAAGAACCCGCGACGCAGATCGTcc > 1:546974/1‑140 (MQ=255)
cGTCGGCGGTGCGACGGTCGAATTTATGAAAGTAGCCATTGGCGGTATTCTCGCCGGGTTTGTGGGGAGCTGGCTGTACGGTCGCTCGCTGCGATTCCTCAGTCGCTGGGGCGGTGATGAACCCGCGACGCAGATCGTcc > 2:139851/1‑140 (MQ=255)
gTCGGCGGTGCGACGGTTGAATGTATGAAAGCAGCTATTGGCGGTATTTTCGCCGGTTTTGTGGTGAGCTGGCTGTACGGTCGCTCGCTGCGATTCCTCAGTCGCTGGGGCGGTGATGAACCCGCGACGCAGATCGTCct < 2:594230/140‑1 (MQ=255)
tCGGCGGTGCGACGGTCGAATTTATGAAAGTAGCCATTGGCGGTATTCTCGCCGGTTTTGTGGTGAGCTGGCTGTACGGTCGCTCGCTGCGATTCCTCAGTCGCTGGGGCGGTGATGAACCCGCGACGCAGATCGTCctg > 2:1181043/1‑140 (MQ=255)
tCGGCGGTGCGACGGTCGAATTTATGAAAGTAGCCATTGGCGGTATTCTCGCCGGTTTTGTGGTGAGCTGGCTGTACGGGCGCTCGCTGCGATTCCTCAGTCGCTGGGGCGGGGGTGAACCCGCGGCGCAGATCGTCctg > 2:130360/1‑140 (MQ=255)
cggcggTGCGACGGTCGAATTTATGAAAGTAGCCATTGGCGGTATTCTCGCCGGTTTTGTGGTGAGCTGGCTGTACGGTCGCTCGCTGCGATTCCTCAGTCGCTGGGGCGGTGATGAACCCGCGACGCAGATCGTCctgc < 1:1181043/140‑1 (MQ=255)
cggcggTGCGACGGTCGAATTTATGAAAGTAGCCATTGGCGGTATTCTCGCCGGTTTTGTGGTGAGCTGGCTGTACGGTCGCTCGCTGCGATTCCTCAGTCGATGGGGCGCTGAGGAACCCGCGACGCAGATCGTCctgc > 1:478717/1‑140 (MQ=255)
ggcggTGCGACGGTCGAATTTATGAAAGTAGCCATTGGCGGTATTCTCGCCGGTTTTGTGGTGAGCTGGCTGTACGGTCGCTCGCTGCGATTCCTCAGTCGCTGGGGCGGTGATGAACCCGCGACGCAGATCGTCctgct > 1:1202520/1‑140 (MQ=255)
ggcggTGCGACGGTCGAATTTATGAAAGTAGCCATTGGCGGTATTCTCGCCGGTTTTGTGGTGAGCTGGCTGTACGGGCGCTCGCTGCGATTCCTCAGTCGCTGGGGCGGTGATGAACCCGCGACGCAGATCGTCctgct > 1:228751/1‑140 (MQ=255)
ggcggTGCGACGGTCGAATTTATGAAAGTAGCCATTGGCGGTATTCTCGCCGGTTTTGTGGTGAGATGGCTGTACCGTCGCTCCCTGCGATATCTCAGTCACTGAGGCTGGGATGAAGCCGCGACGGAGATAGTCctgcg > 2:414855/1‑139 (MQ=255)
ggcggTGCGACGGTCGAATTTATGAAAGTAGCCATTGGCGGTATTCTCGCCGATTTTGTGGTGAGCTGGCTGTACGGTCGCTCGCTGCGATTCCTCAGTCGCTGGGGCGGTGATGAACCCGCGACGCAGATCGTCctgct > 2:1312705/1‑140 (MQ=255)
cGACGGTCGAATTTATGAAAGTTGCCATTTGCGGTATCCTCGCCGGTTTTGTGGTGAGCTGGCTGTACGGTCGCTCGCTGCGATTCCTCAGTCGCTGGGGCGGTGATGAACCCGCGACGCAGATCGTCCTGCTGTTCctg < 1:476931/140‑1 (MQ=255)
cGGTCGAATTTATGAAAGTAGCCATTGGCGGTATTCTCGCCGGTTTTGTGGTGAGCTGGCTGTACGGTCGCTCGCTGCGATTCCTCAGTCGCTGGGGCGGTGATGAACCCGCGACGCAGATCGTCCTGCTGTTCctgctg > 1:739554/1‑140 (MQ=255)
gAATTTATGAAAGTAGCCATTGGCGGTATTCTCGCCGGTTTTGTGGTGAGCTGGCTGTACGGTCGCTCGCTGCGATTCCTCAGTCGCTGGGGCGGTGATGAACCCGCGACGCAGATCGTCCTGCTGTTCCTGCTGCCAtt < 2:49524/140‑1 (MQ=255)
gAATTTATGAAAGTAGCCATTGGCGGTATTCTCGCCGGTTTTGTGGTGAGCTGGCTGTACGGTCGCTCGCTGCGATTCCTCAGTCGCTGGGGCGGTGATGAACCCGCGACGCAGATCGTCCTGCTGTTCCTGCTGCCAtt < 1:1218500/140‑1 (MQ=255)
gAATTTATGAAAGTAGCCATTGGCGGTATTCTCGCCGGTTTTGTGGTGAGCTGGCTGTACGGTCGCTCGCTGCGATTCCTCAGTCGCTGGGGCGGTGATGAACCCGCGACGCAGATCGTCCTGCTGTTCCTGCTGCCAtt < 1:1202388/140‑1 (MQ=255)
gAATTTATGAAAGTACCCATTGCCGTTATTCTCGCCGCTTTTGTGGTGAGCTGACTGTACGGTCGCTCGCTGCGATTCCTCAGTCGCTGGGGCGGTGATGAACCCGCGACGCAGATCGTCCTGCTGTTCCTGCTGCCAtt < 1:409499/140‑1 (MQ=255)
aTTTATGAAAGTAGCCATTGGCGGTATTCTCGCCGGTTTTGTGGTGAGCTGGCTGTACGGTCGCTCGCTGCGATTCCTCAGTCGCTGGGGCGGTGATGAACCCGCGACGCAGATCGTCCTGCTGTTCCTGCTGCCATTCg < 1:763543/140‑1 (MQ=255)
aTTTATGAAAGTAGCCATTGGCGGTATTCTCGCCGGTTTTGTGGTGAGCTGGCTGTACGGTCGCTCGCTGCGATTCCTCAGTCGCTGGGGCGGTGATGAACCCGCGACGCAGATCGTCCTGCTGTTCCTGCTGCCATTCg < 2:727500/140‑1 (MQ=255)
gTAGCCATTGGCGGTATTCTCGCCGGTTTTGTGGTGAGCTGGCTGTACGGTCGCTCGCTGCGATTCCTCAGTCGCTGGGGCGGTGATGAACCCGCGACGCAGATCGTCCTGCTGTTCCTGCTGCCATTCGCTTCTTATCt < 1:130360/140‑1 (MQ=255)
gTAGCCATTGGCGGTATTCTCGCCGGTTTTGTGGTGAGCTGACTGTACGGTCGCTCGCTGCGATTCCTCAGTCGCTGGGGCGGTGATGAACGCGCGACGCCGATGGTCGTGCTGTTCCTGCTCCCATTCGCTTCTTATcc > 2:409499/1‑139 (MQ=255)
cgCCATTGGCGGTATTCTCGCCGGTTTTGTGGTGAGCTGGCTGTACGGTCGCTCGCTGCGATTCCTCAGCCGCTGGGGCGGTGATGAACCCGCGACGCAGATCGTCCTGCTGTTCCTGCTGCCATTCGCTTCTTATCTGa < 1:1242804/139‑1 (MQ=255)
aGCCATTGGCGGTATTCTCGCCGATTTTGTGGTGAGCTGGCTGTACGGTCGCTCGCTGCGATTCCTCAGTCGCTGGGGCGGTGATGAACCCGCGACGCAGATCGTCCTGCTGTTCCTGCTGCCATTCGCTTCTTATCTGa < 1:1312705/140‑1 (MQ=255)
gCCATTGGCGGTATTCTCGCCGGTTTTGTGGTGAGCTGGCTGTACGGTCGCTCGCTGCGATTCCTCAGTCGCTGGGGCGGTGATGAACCCGCGACGCAGATCGTCCTGCTGTTCCTGCTGCCATTCGCTTCTTATCTGAt < 1:919785/140‑1 (MQ=255)
gCCATTGGCGGTATTCTCGCCGGTTTTGTGGTGAGCTGGCTGTACGGTCGCTCGCTGCGATTCCTCAGTCGCTGGGGCGGTGATGAACCCGCGACGCAGATCGTCCTGCTGTTCCTGCTGCCATTCGCTTCTTATCTGAt > 1:327306/1‑140 (MQ=255)
ccATTGGCGGTATTCTCGCCGGTTTTGTGGTGAGCTGGCTGTACGGTCGCTCGCTGCGATTCCTCAGTCGCTGGGGCGGTGGTGAACCCGCGACGCAGATCGTCCTGCCGTTCCCGCTGCCATTCGCCTCTTATCTGAtt > 2:1254616/1‑140 (MQ=255)
ccATTGGCGGTATTCTCGCCGGTTTTGTGGTGAGCTGGCTGTACGGTCGCTCGCTGCGATTCCTCAGTCGCTGGGGCGGTGATGAACCCGCGACGCAGATCGTCCTGCTGTTCCTGCTGCCATTCGCTTCTTATCTGAtt > 2:1367318/1‑140 (MQ=255)
cATTGGCGGTATTCTCGCCGGTTTTGTGGTGAGCTGGCTGTACGGTCGCTCGCTGCGATTCCTCAGTCGCTGGGGCGGTGATGAACCCGCGACGCAGATCGTCCTGCTGTTCCTGCTGCCATTCGCTTCTTATCTGATTg < 1:1301306/140‑1 (MQ=255)
ttGGCGGTATTCTCGCCGGTTTTGTGGTGAGCTGGCTGTACGGTCGCTCGCTGCGATTCCTCAGTCGCTGGGGCGGTGATGAACCCGCGACGCAGATCGTCCTGCTGTTCCTGCTGCCATTCGCTTCTTATCTGATTGcc > 1:1379817/1‑140 (MQ=255)
tGGCGGTATTCTCGCCGGTTTTGTGGTGAGCTGGCTGTACGGTCGCTCGCTGCGATTCCTCAGTCGCTGGGGCGGTGATGAACCCGCGACGCAGATCGTCCTGCTGTTCCTGCTGCCATTCGCTTCTTATCTGATTGCCg > 1:37883/1‑140 (MQ=255)
ggCGGTATTCTCGCCGGTTTTGTGGTGAGCTGGCTGTACGGTCGCTCGCTGCGATTCCTCAGTCGCTGGGGCGGTGATGAACCCGCGACGCAGATCGTCCTGCTGTTCCTGCTGCCATTCGCTTCTTATCTGATTGCCGa < 2:327306/140‑1 (MQ=255)
cGGTATTCTCGCCGGTTTTGTGGTGAGCTGGCTGTACGGTCGCTCGCTGCGATTCCTCAGTCGCTGGGGCGGGGATGAAACCGCGACGCAGATCGTCCTGCTGTTCCTGCTGCCATTCGCTTCTTATCTGATTGCCGAAc > 2:904033/1‑140 (MQ=255)
ctcGCCGGTTTTGTGGTGAGCTGGCTGTACGGTCGCTCGCTGCGATTCCTCAGTCGCTGGGGCGGTGATGAACCCGCGACGCAGATCGTCCTGCTGTTCCTGCTGCCATTCACTTCTTATCTGATTGCCGAACATATTgg < 2:754871/140‑1 (MQ=255)
tcGCCGGTTTTGTGGTGAGCTGGCTGTACGGTCGCTCGCTGCGATTCCTCAGTCGCTGGGGCGGTGATGAACCCGCGACGCAGATCGTCCTGCTGTTCCTGCCGCCATTCACTTGTTATCTGATGTCCGAACATATTGGc > 1:411549/1‑140 (MQ=255)
cGCCGGTTTTGTGGTGAGCTGGCTGTACGGTCGCTCGCTGCGATTCCTCAGTCGCTGGGGCGGTGATGAACCCGCGACGCAGATCGTCCTGCTGTTCCTGCTGCCATTCGCTTCTTATCTGATTGCCGAACATATTGGCg > 1:815701/1‑140 (MQ=255)
gCCGGTTTTGTGGTGAGTTGGCCGTACGGTCCCTCGCTGCGATTCCTCGGTCGCTGGGGCGGTGATGAACCCGCGACGCAGATCGTCCTGCTGTTCCTGCTGCCATTCGCTTCTTATCTGATTGCCGAACATATTGGCGt < 2:428595/140‑1 (MQ=255)
gCCGGTTTTGTGGTGAGCTGGCTGTACGGTCGCTCGCTGCGATTCCTCAGTCGCTGGGGCGGTGATGAACCCGCGACGCAGATCGTCCTGCTGTTCCTGCTGCCATTCGCTTCTTATCTGATTGCCGa < 1:18054/128‑1 (MQ=255)
gCCGGTTTTGTGGTGAGCTGGCTGTACGGTCGCTCGCTGCGATTCCTCAGTCGCTGGGGCGGTGATGAACCCGCGACGCAGATCGTCCTGCTGTTCCTGCTGCCATTCGCTTCTTATCTGATTGCCGa > 2:18054/1‑128 (MQ=255)
gCCGGTTTTGTGGTGAGCTGGCTGTACGGTCGCTCGCTGCGATTCCTCAGTCGCTGGGGCGGTGATGAACCCGCGACGCAGATCGTCCTGCTGTTCCTGCTGCCATTCGCTTCTTATCTGATTGCCGAACATATTGGCGt < 2:37883/140‑1 (MQ=255)
gCCGGTTTTGTGGTGAGCTGGCTGTACGGTCGCTCGCTGCGATTCCTCAGTCGCTGGGGCGGTGATGAACCCGCGACGCAGATCGTCCTGCTGTTCCTGCTGCCATTCGCTTCTTATCTGATTGCCGAACATATTGGCGt > 1:221495/1‑140 (MQ=255)
tggtgAGCTGGCTGTACGGTCGATCGCTGCGCTTCTTCATTCGCTGGGGCGGTGATGAACCCGCGACGCAGATCGTCCTGCTGTTCCTGCTGCCATTCGCTTCTTATCTGATTGCCGAACATATTGGCGTTTCCGGCATc < 2:523425/140‑1 (MQ=255)
gtgAGCTGGCTGTACGGTCGCTCGCTGCGATTCCTCAGTCGCTGGGGCGGTGATGAACCCGCGACGCAGATCGTCCTGCTGTTCCTGCTGCCATTCGCTTCTTATCTGATTGCCGAACATATTGGCGTTTCCGGCATCCt < 1:1367318/140‑1 (MQ=255)
gtgAGCTGGCTGTACGGTCGCTCGCTGCGATTCCTCAGTCGCTGGGGCGGTGATGAACCCGCGACGCAGATCGTCCTGCTGTTCCTGCTGCCATTCGCTTCTTATCTGATTGCCGAACATATTGGCGTTTCCGGCATCCt < 1:1254616/140‑1 (MQ=255)
gAGCTGGCTGTACGGTCTCTCGCTGCGATTCCTCAGTCGCTGGGGCGGGGATGAACCCGCGACGCAGATCGTCCTGCTGTTCCTGCTGCCATTCGCTTCTTATCTGATTGCCGAACATATTGGCGTTTCCGGCATCCTCg < 2:571049/140‑1 (MQ=255)
gAGCTGGCTGTACGGTCGCTCGCTGCGATTCCTCAGTCGCTGGGGCGGTGATGAACCCGCGACGCAGATCGTCCTGCTGTTCCTGCTGCCATTCGCTTCTTATCTGATTGCCGAACATATTGGCGTTTCCGGCATCCTCg > 1:997751/1‑140 (MQ=255)
gAGCTGGCTGTACGGTCGCTCGCTGCGATTCCTCAGTCGCTGGGGCGGTGATGAACCCGCGACGCAGATCGTCCTGCTGTTCCTGCTGCCATTCGCTTCTTATCTGATTGCCGAACATATTGGCGTTTCCGGCATCCTCg > 2:1165861/1‑140 (MQ=255)
aGCTGGCTGTACGGTCGCTCGCTGCGATTCCTCAGTCGCTGGGGCGGTGATGAACCCGCGACGCAGATCGTCCTGCTGTTCCTGCTGCCATACGCTTCTTCTCTGATTGCCGAACATATTGGTGTTTCCGGCATCCTCGc > 2:556106/1‑140 (MQ=255)
ctggctgTACGGTCGCTCGCTGCGATTCCTCAGTCGCTGGGGCGGTGATGAACCCGCGACGCAGATCGTCCTGCTGTTCCTGCTGCCATTCGCTTCTTATCTGATTGCCGAACATATTGGCGTTTCCGGCATCCTCGCTg > 2:108082/1‑140 (MQ=255)
ctggctgTACGGTCGCTCGCTGCGATTCCTCAGTCGCTGGGGCGGTGATGAACCCGCGACGCAGATCGTCCTGCTGTTCCTGCTGCCATTCGCTTCTTATCTGATTGCCGAACATATTGGCGTTTCCGGCATCCTCGCTg > 1:846779/1‑140 (MQ=255)
ctggctgTACGGTCGCTCGCTGCGATTCCTCAGTCGCTGGGGCGGTGATGAACCCGCGACGCAGATCGTCCTGCTGTTCCTGCTGCCATTCGCTTCTTATCTGATTGCCGAACATATTGGCGTTTCCGGCATCCTCGCTg > 2:992989/1‑140 (MQ=255)
gTACGGTCGCTCGCTGCGATTCCTCAGTCGCTGGGGCGGTGATGAATCCGCGACGCAGATCGTCCTGCTGTTCCTGCTGCCATTCGCTTCTTATCTGATTGCCGAACATATTGGCGTTTCCGGCATCCTCGCTGCGGTTg > 1:988663/1‑140 (MQ=255)
aCGGTCGCTCGCTGCGATTCCTCAGTCGCTGGGGCGGTGATGAACCCGCGACGCAGATCGTCCTGCTGTTCCTGCTGCCATTCGCTTCTTATCTGATTGCCGAACATATTGGCGTTTCCGGCATCCTCGCTGCGGTTgcc > 1:194621/1‑140 (MQ=255)
cGGTCGCTCGCTGCGATTCCTCAGTCGCTGGGGCGGTGATGAACCCGCGACGCAGATCGTCCTGCTGTTCCTGCTGCCATTCGCTTCTTATCTGATTGCCGAACATATTGGCGTTTCCGGCATCCTCGCTGCGGTTgccg < 2:194621/140‑1 (MQ=255)
cgctcgctGCGATTCCTCAGTCGCTGGGGCGGTGATGAACCCGCGACGCAGATCGTCCTGCTGTTCCTGCTGCCATTCGCTTCTTATCTGATTGCCG‑ACATATTGGCGTTTCCGGCATCCTCGCTGCGGTTGCCGCCggg > 2:1119964/1‑140 (MQ=255)
gctcgctGCGATTCCTCAGTCGCTGGGGCGGTGATGAACCCGCGACGCAGATCGTCCTGCTGTTCCTGCTGCCATTCGCTTCTTATCTGATTGCCGAACATATTGGCGTTTCCGGCATCCTCGCTGCGGTTGCCGCCggg > 2:1262245/1‑140 (MQ=255)
gctcgctGCGATTCCTCAGTCGCTGGGGCGGTGATGAACCCGCGACGCAGATCGTCCTGCTGTTCCTGCTGCCATTCGCTTCTTATCTGATTGCCG‑ACATATTGGCGTTTCCGGCATCCTCGCTGCGGTTGCCGCCGGGa < 1:1119964/140‑1 (MQ=255)
ctcgctGCGATTCCTCAGTCGCTGGGGCGGTGATGAACCCGCGACGCAGATCGTCCTGCTGTTCCTGCTGCCATTCGCTTCTTATCTGATTGCCGAACATATTGGCGTTTCCGGCATCCTCGCTGCGGTTGCCGCCGGGa < 2:1271656/140‑1 (MQ=255)
ctcgctGCGATTCCTCAGTCGCTGGGGCGGTGATGAACCCGCGACGCAGATCGTCCTGCTGTTCCTGCTGCCATTCGCTTCTTATCTGATTGCCGAACATATTGGCGTTTCCGGCATCCTCGCTGCGGTTGCCGCCGGGa < 2:988663/140‑1 (MQ=255)
ctcgctGCGATTCCTCAGTCGCTGGGGCGGTGATGAACCCGCGACGCAGATCGTCCTGCTGTTCCTGCTGCCATTCGCTTCTTATCTGATTGCCGAACATATGGGCGTTTACGGAATACTCGCTTCGGTTGCCGCCGGGa > 1:462123/1‑140 (MQ=255)
cGATTCCTCAGTCGCTGGGGCGGTGATGAACCCGCGACGCAGATCGTCCTGCTGTTCCTGCTGCCATTCGCTTCTTATCTGATTGCCGAACATATTGGCGTTTCCGGCATCCTCGCTGCGGTTGCCGCCGGGa > 2:211816/1‑133 (MQ=255)
cGATTCCTCAGTCGCTGGGGCGGTGATGAACCCGCGACGCAGATCGTCCTGCTGTTCCTGCTGCCATTCGCTTCTTATCTGATTGCCGAACATATTGGCGTTTCCGGCATCCTCGCTGCGGTTGCCGCCGGGa < 1:211816/133‑1 (MQ=255)
gATTCCTCAGTCGCTGGGGCGGTGATGAACCCGCGACGCAGATCGTCCTGCTGTTCCTGCTGCCATTCGCTTCTTATCTGATTGCCGAACATATTGGCGTTTCCGGCATCCTCGCTGCGGTTGCCGCCGGGATGACCATc < 2:739554/140‑1 (MQ=255)
tCCTCAGTCGCTGGGGCGGTGATGAACCCGCGACGCAGATCGTCCTGCTGTTCCTGCTGCCATTCGCTTCTTATCTGATTGCCGAACATATTGGCGTTTCAGGCGTCCGCGCTGCGGATGCCTCCGGGATGACCATCAcc > 2:542766/1‑140 (MQ=255)
ccTCAGTCGCTGGGGCGGTGATGAACCCGCGACGCAGATCGTCCTGCTGTTCCTGCTGCCATTCGCTTCTTATCTGATTGCCGAACATATTGGCGTTTCCGGCATCCTCGCTGCGGTTGCCGCCGGGATGACCATCAccc < 2:997751/140‑1 (MQ=255)
|
CCGTAGCAGTGGCGATGGGGACGATGATCTTCACCGTCGGCGGTGCGACGGTCGAATTTATGAAAGTAGCCATTGGCGGTATTCTCGCCGGTTTTGTGGTGAGCTGGCTGTACGGTCGCTCGCTGCGATTCCTCAGCCGCTGGGGCGGTGATGAACCCGCGACGCAGATCGTCCTGCTGTTCCTGCTGCCATTCGCTTCTTATCTGATTGCCGAACATATTGGCGTTTCCGGCATCCTCGCTGCGGTTGCCGCCGGGATGACCATCACCC > NC_000913/4280476‑4280745
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
