Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A14 F48 I1 R1
|
75 |
141.5 |
4784044 |
99.1% |
4740987 |
139.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
637,080 |
C→A |
R180M (AGG→ATG) |
ybdO ← |
putative LysR family DNA‑binding transcriptional regulator YbdO |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 637,080 | 0 | C | A | 99.1%
| 796.9
/ ‑1.5
| 219 | R180M (AGG→ATG) | ybdO | putative LysR family DNA‑binding transcriptional regulator YbdO |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/1); new base A (114/102); total (116/103) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.76e-01 |
Only 100 of 223 total aligned reads displayed.
TGAGATTTTGCGATTCATAAATCTCTCGTCTATTTCCATTTGAATATCATCAACCCCTGCTGATTTAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAAGTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCCTATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGAACGGCTGATCACTGGCATTTGGGTGATCACCAGATCGGCTTTGCGGTGAACCAACAGTTCTTCAGCATTCTCTGCTGACAT > NC_000913/636944‑637216
|
tGAGATTTTGCGATTCATAAATCTCTCGTCTATTTCCATTTGAATATCATCAACCCCTGCTGATTTAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAAGTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCatat < 1:329483/140‑1 (MQ=255)
agaTTTTGCGATTCATAAATCTCTCGTCTATTTCCATTTGAATATCATCAACCCCTGCTGATTTAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAAGTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCATATta < 2:285260/140‑1 (MQ=255)
aTTTTGCGATTCATAAATCTCTCGTCTATTTCCATTTGAATATCATCAACCCCTGCTGATTTAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAAGTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCATATtact < 2:2036362/140‑1 (MQ=255)
aTTTTGCGATTCATAAATCTCTCGTCTATTTCCATTTGAATATCATCAACCCCTGCTGATTTAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAAGTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCATATtact < 2:2315361/140‑1 (MQ=255)
tGCGATTCATAAATCTCTCGTCTATTTCCATTTGAATATCATCAACCCCTGCTGATTTAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAAGTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCATATTACTACaa > 1:843751/1‑140 (MQ=255)
tGCGATTCATAAATCTCTCGTCTATTTCCATTTGAATATCATCAACCCCTGCTGATTTAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAAGTGCTATTGTCAGTAATTAGTGGATGCATATTACTACaa > 2:1617518/1‑140 (MQ=255)
aTTCATAAATCTCTCGTCTATTTCCATTTGAATATCATCAACCCCTGCTGATTTAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAAGTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCATATTACTACAAATTa < 1:1998024/140‑1 (MQ=255)
tCATAAATCTCTCGTCTATTTCCATTTGAATATCATCAACCCCTGCTGATTTAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAAGTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCATATTACTACAAATTaga > 2:2066296/1‑140 (MQ=255)
tCATAAATCTCTCGTCTATTTCCATTTGAATATCATCAACCCCTGCTGATTTAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAAGTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCATATTACTACAAATTaga < 2:1153773/140‑1 (MQ=255)
tctctcGTCTATTTCCATTTGAATATCATCAACCCCTGCTGATTTAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAAGTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCATATTACTACAAATTAGAGTATTGc < 2:555553/140‑1 (MQ=255)
tctctcGTCTATTTCCATTTGAATATCATCAACCCCTGCTGATTTAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAAGTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCATATTACTACAAATTAGAGTATTGc < 1:1199659/140‑1 (MQ=255)
tctctcGTCTATTTCCATTTGAATATCATCAACCCCTGCTGATTTAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAAGTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCATATTACTACAAATTAGAGTATTGc < 2:948909/140‑1 (MQ=255)
tctcGTCTATTTCCATTTGAATATCATCAACCCCTGCTGATTTAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAAGTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCATATTACTACAAATTAGAGTATTGCGa > 1:967324/1‑140 (MQ=255)
tctcGTCTATTTCCATTTGAATATCATCAACCCCTGCTGATTTAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAAGTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCATATTACTACAAATTAGAGTATTGCGa > 2:1144040/1‑140 (MQ=255)
tctcGTCGATTTCCATTTGAATATCATCAACCCCTGCTGATTTAGATATTAATTGGGTGAACTCTTATGCCATAATTTGTTCATAAGTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCATATTACTACAAATTAGAGTATTGCGa < 1:2138574/140‑1 (MQ=255)
tcGTCTATTTCCATTTGAATATCATCAACCCCTGCTGATTTAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAAGTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCATATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAAt > 1:402936/1‑140 (MQ=255)
cGTCTATTTCCATTTGAATATCATCAACCCCTGCTGATTTAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAAGTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCATATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATc < 1:2066296/140‑1 (MQ=255)
cGTCTATTTCCATTTGAATATCATCAACCCCTGCTGATTTAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAAGTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCATATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATc < 1:1238040/140‑1 (MQ=255)
tATTTCCATTTGAATATCATCAACCCCTGCTGATTTAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAAGTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCATATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTAt > 1:1395533/1‑140 (MQ=255)
ttCCATTTGAATATCATCAACCCCTGCTGATTTAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAAGTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCATATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCa < 1:71924/140‑1 (MQ=255)
ttCCATTTGAATATCATCAACCCCTGCTGATTTAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAAGTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCATATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCa > 1:1325021/1‑140 (MQ=255)
tCCATTTGAATATCATCAACCCCTGCTGATTTAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAAGTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCATATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCaa < 1:100292/140‑1 (MQ=255)
tCCATTTGAATATCATCAACCCCTGCTGATTTAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAAGTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCATATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCaa < 2:1509481/140‑1 (MQ=255)
tCCATTTGAATATCATCAACCCCTGCTGATTTAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAAGTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCATATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCaa < 1:2131974/140‑1 (MQ=255)
ccATTTGAATATCATCAACCCCTGCTGATTTAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAAGTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCATATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAAt > 2:365880/1‑140 (MQ=255)
ccATTTGAATATCATCAACCCCTGCTGATTTAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAAGTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCATATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAAt < 1:1531475/140‑1 (MQ=255)
tttGAATATCATCAACCCCTGCTGATTTAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAAGTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCATATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGc > 2:1430836/1‑140 (MQ=255)
aaTATCATCAACCCCTGCTGATTTAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAAGTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCATATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGc > 2:1913087/1‑140 (MQ=255)
tcatcaACCCCTGCTGATTTAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAAGTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCATATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAAt < 1:1642374/140‑1 (MQ=255)
tcatcaACCCCTGCTGATTTAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAAGTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCATATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAAt < 1:2290549/140‑1 (MQ=255)
aaCCCCTGCTGATTTAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAAGTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCATATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACgg < 2:774827/140‑1 (MQ=255)
aCCCCTGCTGATTTAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAAGTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCATATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGa > 1:985668/1‑140 (MQ=255)
ccccTGCTGATTTAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAAGTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCATATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGaa > 2:798473/1‑140 (MQ=255)
ccccTGCTGATTTAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAAGTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCATATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGaa < 1:798473/140‑1 (MQ=255)
ccccTGCTGATTTAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAAGTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCATATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGaa < 2:1524957/140‑1 (MQ=255)
ctgctgATTTAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAAGTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCATATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGAACgg > 1:1046664/1‑140 (MQ=255)
ctgctgATTTAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAAGTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCATATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGAACgg > 1:1143148/1‑140 (MQ=255)
tgctgATTTAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAAGTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCATATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGAACGGc > 1:260001/1‑140 (MQ=255)
tgctgATTTAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAAGTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCATATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGAACGGc > 1:1146289/1‑140 (MQ=255)
gctgATTTAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAAGTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCATATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGAACGGCt < 2:1325582/140‑1 (MQ=255)
aTTTAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAAGTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCATATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGAACGGCTGATc > 2:1380859/1‑140 (MQ=255)
ttAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAAGTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCATATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGAACGGCTGATCAc < 1:1433512/140‑1 (MQ=255)
gATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAAGTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCATATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGAACGGCTGATCACTgg > 2:1921918/1‑140 (MQ=255)
tAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAAGTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCATATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGAACGGCTGATCACTGGCAttt > 2:731413/1‑140 (MQ=255)
tAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAAGTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCATATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGAACGGCTGATCACTGGCAttt < 2:1403/140‑1 (MQ=255)
tAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAAGTTGTTCATAAGTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCATATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGAACGGCTGATCACTGGCAttt > 2:1674817/1‑140 (MQ=255)
tGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAAGTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCATATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGAACGGCTGATCACTGGCATTTGGGt < 2:1467514/140‑1 (MQ=255)
tGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAAGTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCATATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGAACGGCTGATCACTGGCATTTGGGt < 2:627245/140‑1 (MQ=255)
tGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAAGTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCATATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGAACGGCTGATCACTGGCATTTGGGt < 2:1122208/140‑1 (MQ=255)
gggTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAAGTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCATATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGAACGGCTGATCACTGGCATTTGGGTg > 1:2026978/1‑140 (MQ=255)
ggTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAAGTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCTTATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGAACGGCTGATCACTGGCATTTGGGTGa > 1:561413/1‑140 (MQ=255)
ggTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAAGTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCATATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGAACGGCTGATCACTGGCATTTGGGTGa > 1:1581580/1‑140 (MQ=255)
ggTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAAGTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCATATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGAACGGCTGATCACTGGCATTTGGGTGa > 1:1753934/1‑140 (MQ=255)
gTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAAGTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCATATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGAACGGCTGATCACTGGCATTTGGGTGAt > 2:1994579/1‑140 (MQ=255)
gTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAAGTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCATATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGAACGGCTGATCACTGGCATTTGGGTGAt > 2:1294955/1‑140 (MQ=255)
gTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAAGTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCATATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGAACGGCTGATCACTGGCATTTGGGTGAt > 2:125579/1‑140 (MQ=255)
aaCTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAAGTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCATATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGAACGGCTGATCACTGGCATTTGGGTGATCAc > 1:1434077/1‑140 (MQ=255)
aaCTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAAGTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCATATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGAACGGCTGATCACTGGCATTTGGGTGATCAc > 1:2175424/1‑140 (MQ=255)
ctGCCATAATTTGTTCATAAGTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCATATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGAACGGCTGATCACTGGCATTTGGGTGATCACCAGATct > 2:1116318/1‑139 (MQ=255)
ccATAATTTGTTCATAAGTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCCTATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCTTATGCAATGGCATGCAAATGACGGAACGGCTGATCACTGGCATTTGGGTGATCACCAGATCGGCt > 1:936501/1‑140 (MQ=255)
ccATAATTTGTTCATAAGTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCATATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGAACGGCTGATCACTGGCATTTGGGTGATCACCAGATCGGCt > 2:2363892/1‑140 (MQ=255)
tAATTTGTTCATAAGTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCATATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGAACGGCTGATCACTGGCATTTGGGTGATCACCAGATCGGCTTTg > 1:183221/1‑140 (MQ=255)
aTTTGTTCATAAGTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCATATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGAACGGCTGATCACTGGCATTTGGGTGATCACCAGATCGGCTTTGCg > 1:2214892/1‑140 (MQ=255)
aTTTGTTCATAAGTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCATATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGAACGGCTGATCACTGGCATTTGGGTGATCACCAGATCGGCTTTGCg > 1:1122933/1‑140 (MQ=255)
aTTTGTTCATAAGTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCATATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGAACGGCTGATCACTGGCATTTGGGTGATCACCAGATCGGCTTTGCg > 2:865823/1‑140 (MQ=255)
aTTTGTTCATAAGTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCATATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGAACGGCTGATCACTGGCATTTGGGTGATCACCAGATCGGCTTTGCg < 1:1921918/140‑1 (MQ=255)
tttGTTCATAAGTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCATATTACTTCAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGAACGGCTGATCACTGGCATTTGGGTGATCACCAGATCGGCTTTGCgg < 1:2332532/140‑1 (MQ=255)
tttGTTCATAAGTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCATATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGAACGGCTGATCACTGGCATTTGGGTGATCACCAGATCGGCTTTGCgg < 2:1581580/140‑1 (MQ=255)
tttGTTCATAAGTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCATATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGAACGGCTGATCACTGGCATTTGGGTGATCACCAGATCGGCTTTGCgg < 1:731413/140‑1 (MQ=255)
tGTTCATAAGTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCATATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGAACGGCTGATCACTGGCATTTGGGTGATCACCAGATCGGCTTTGCGGTg > 2:1974034/1‑140 (MQ=255)
tGTTCATAAGTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCATATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGAACGGCTGATCACTGGCATTTGGGTGATCACCAGATCGGCTTTGCGGTg < 1:1674817/140‑1 (MQ=255)
ttCATAAGTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCATATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGAACGGCTGATCACTGGCATTTGGGTGATCACCAGATCGGCTTTGCGGTGaa > 1:822385/1‑140 (MQ=255)
ttCATAAGTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCATATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGAACGGCTGATCACTGGCATTTGGGTGATCACCAGATCGGCTTTGCGGTGaa > 1:1890618/1‑140 (MQ=255)
ttCATAAGTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCATATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGAACGGCTGATCACTGGCATTTGGGTGATCACCAGATCGGCTTTGCGGTGaa > 2:2156560/1‑140 (MQ=255)
gCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCATATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGAACGGCTGATCACTGGCATTTGGGTGATCACCAGATCGGCTTTGCGGTGAACCAACAGtt < 1:1974034/140‑1 (MQ=255)
gCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCATATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGAACGGCTGATCACTGGCATTTGGGTGATCACCAGATCGGCTTTGCGGTGAACCAACAGtt < 2:748553/140‑1 (MQ=255)
cTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCATATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGAACGGCTGATCACTGGCATTTGGGTGATCACCAGATCGGCTTTGCGGTGAACCAACAGttc > 2:1829304/1‑140 (MQ=255)
cTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCATATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGAACGGCTGATCACTGGCATTTGGGTGATCACCAGATCGGCTTTGCGGTGAACCAACAGttc > 1:1266418/1‑140 (MQ=255)
cTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCATATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGAACGGCTGATCACTGGCATTTGGGTGATCACCAGATCGGCTTTGCGGTGAACCAACAGttc > 2:2204781/1‑140 (MQ=255)
tATTGTCAGTAATTCGTGGATGCATATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGAACGGCTGATCACTGGCATTTGGGTGATCACCAGATCGGCTTTGCGGTGAACCAACAGttct < 1:2363892/140‑1 (MQ=255)
tATTGTCAGTAATTCGTGGATGCATATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGAACGGCTGATCACTGGCATTTGGGTGATCACCAGATCGGCTTTGCGGTGAACCAACAGttct < 2:350867/140‑1 (MQ=255)
tGTCAGTAATTCGTGGATGCATATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGAACGGCTGATCACTGGCATTTGGGTGATCACCAGATCGGCTTTGCGGTGAACCAACAGTTCTTCa < 2:967324/140‑1 (MQ=255)
tCAGTAATTCGTGGATGCATATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGAACGGCTGATCACTGGCATTTGGGTGATCACCAGATCGGCTTTGCGGTGAACCAACAGTTCTTCAGc < 1:681344/140‑1 (MQ=255)
aGTAATTCGTGGATGCATATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGAACGGCTGATCACTGGCATTTGGGTGATCACCAGATCGGCTTTGCGGTGAACCAACAGTTCTTCAGCAt > 1:669221/1‑140 (MQ=255)
aGTAATTCGTGGATGCATATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGAACGGCTGATCACTGGCATTTGGGTGATCACCAGATCGGCTTTGCGGTGAACCAACAGTTCTTCAGCAt > 1:610806/1‑140 (MQ=255)
aGTAATTCGTGGATGCATATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGAACGGCTGATCACTGGCATTTGGGTGATCACCAGATCGGCTTTGCGGTGAACCAACAGTTCTTCAGCAt > 1:295998/1‑140 (MQ=255)
gTAATTCGTGGATGCATATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGAACGGCTGATCACTGGCATTTGGGTGATCACCAGATCGGCTTTGCGGTGAACCAACAGTTCTTCAGCAtt < 1:1351778/140‑1 (MQ=255)
gTAATTCGTGGATGCATATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGAACGGCTGATCACTGGCATTTGGGTGATCACCAGATCGGCTTTGCGGTGAACCAACAGTTCTTCAGCAtt < 2:581983/140‑1 (MQ=255)
tCGTGGATGCATATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGAACGGCTGATCACTGGCATTTGGGTGATCACCAGATCGGCTTTGCGGTGAACCAACAGTTCTTCAGCATTCTctg < 1:74880/140‑1 (MQ=255)
cGTGGATGCATATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGAACGGCTGATCACTGGCATTTGGGTGATCACCAGATCGGCTTTGCGGTGAACCAACAGTTCTTCAGCATTCTctgc > 2:1003738/1‑140 (MQ=255)
cGTGGATGCATATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGAACGGCTGATCACTGGCATTTGGGTGATCACCAGATCGGCTTTGCGGTGAACCAACAGTTCTTCAGCATTCTctgc < 1:624752/140‑1 (MQ=255)
cGTGGATGCATATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGAACGGCTGATCACTGGCATTTGGGTGATCACCAGATCGGCTTTGCGGTGAACCAACAGTTCTTCAGCACTCTctgc > 1:515055/1‑140 (MQ=255)
gTGGATGCCTATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCTTATGCAATGGCATGCAAATGACGGAACGGCTGATCACTGGCATTTGGGTGATCACCAGATCGGCTTTGCGGTGAACCAACAGTTCTTCAGCATTCTctgct < 2:936501/140‑1 (MQ=255)
gTGGATGCATATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGAACGGCTGATCACTGGCATTTGGGTGATCACCAGATCGGCTTTGCGGTGAACCAACAGTTCTTCAGCATTCTctgct > 1:435690/1‑140 (MQ=255)
ggATGCATATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGAACGGCTGATCACTGGCATTTGGGTGATCACCAGATCGGCTTTGCGGTGAACCAACAGTTCTTCAGCATTCTCTGCTGa < 1:1020693/140‑1 (MQ=255)
gATGCATATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGAACGGCTGATCACTGGCATTTGGGTGATCACCAGATCGGCTTTGCGGTGAACCAACAGTTCTTCAGCATTCTCTGCTGAc < 1:365880/140‑1 (MQ=255)
gATGCATATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGAACGGCTGATCACTGGCATTTGGGTGATCACCAGATCGGCTTTGCGGTGAACCAACAGTTCTTCAGCATTCTCTGCTGAc < 1:2156560/140‑1 (MQ=255)
gATGCATATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGAACGGCTGATCACTGGCATTTGGGTGATCACCAGATCGGCTTTGCGGTGAACCAACAGTTCTTCAGCATTCTCTGCTGAc < 2:260001/140‑1 (MQ=255)
aTGCATATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGAACGGCTGATCACTGGCATTTGGGTGATCACCAGATCGGCTTTGCGGTGAACCAACAGTTCTTCAGCATTCTCTGCTGACa > 2:541655/1‑140 (MQ=255)
tGCATATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGAACGGCTGATCACTGGCATTTGGGTGATCACCAGATCGGCTTTGCGGTGAACCAACAGTTCTTCAGCATTCTCTGCTGACAt < 1:865823/140‑1 (MQ=255)
|
TGAGATTTTGCGATTCATAAATCTCTCGTCTATTTCCATTTGAATATCATCAACCCCTGCTGATTTAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAAGTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCCTATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGAACGGCTGATCACTGGCATTTGGGTGATCACCAGATCGGCTTTGCGGTGAACCAACAGTTCTTCAGCATTCTCTGCTGACAT > NC_000913/636944‑637216
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
