Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
1357 |
179.3 |
9500450 |
96.1% |
9129932 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,841,661 |
A→G |
T423A (ACC→GCC) |
gdhA → |
NADP‑specific glutamate dehydrogenase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,841,661 | 0 | A | G | 100.0%
| 553.4
/ NA
| 167 | T423A (ACC→GCC) | gdhA | NADP‑specific glutamate dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (82/85); total (82/85) |
Only 100 of 173 total aligned reads displayed.
TGGAAAGCCGAGAAAGTTGACGCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAACCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTAAATGCC > NC_000913/1841571‑1841750
|
tGGAAAGCCGAGAAAGTTGACGCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGcc > 1:238482/1‑93 (MQ=255)
aaaGCCGAGAAAGTTGACGCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAAc < 1:279307/93‑1 (MQ=255)
aaaGCCGAGAAAGTTGACGCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAAc < 2:4696082/93‑1 (MQ=255)
aaGCCGAGAAAGTTGACGCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACt < 1:2647664/93‑1 (MQ=255)
aGCCGAGAAAGTTGACGCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTa < 2:2620797/93‑1 (MQ=255)
ccGAGAAAGTTGACGCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACg < 2:60719/93‑1 (MQ=255)
gagaAAGTTGACGCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTg > 2:867958/1‑93 (MQ=255)
gagaAAGTTGACGCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTg > 1:3768325/1‑93 (MQ=255)
agaAAGTTGACGCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGc > 2:427600/1‑93 (MQ=255)
agaAAGTTGACGCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGc > 1:3716335/1‑93 (MQ=255)
agaAAGTTGACGCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGc > 1:2054008/1‑93 (MQ=255)
agaAAGTTGACGCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGAATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGc < 1:1526557/93‑1 (MQ=255)
gaAAGTTGACGCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCa < 2:100603/93‑1 (MQ=255)
aaaGTTGACGCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAg < 2:2670625/93‑1 (MQ=255)
aaGTTGACGCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAgg < 2:1854366/93‑1 (MQ=255)
aaGTTGACGCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAgg < 2:3188673/93‑1 (MQ=255)
aGTTGACGCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAggg > 2:796984/1‑93 (MQ=255)
gTTGACGCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGgc > 2:697824/1‑93 (MQ=255)
gTTGACGCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGgc < 2:1416352/93‑1 (MQ=255)
gACGCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGcgcg > 2:726151/1‑93 (MQ=255)
gCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGaaa > 1:3332316/1‑92 (MQ=255)
gCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAAc > 1:3207522/1‑93 (MQ=255)
gCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTCGGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAAc > 1:1126205/1‑93 (MQ=255)
aCGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACAt > 2:4419548/1‑93 (MQ=255)
aCGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACAt > 2:2363530/1‑93 (MQ=255)
gTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTg > 1:3535457/1‑93 (MQ=255)
tttGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGc < 1:3812627/93‑1 (MQ=255)
ttGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGcc < 1:2230998/93‑1 (MQ=255)
cacatcaTGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGtttt > 1:1589743/1‑93 (MQ=255)
cacatcaTGCTGGATATACACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGGCGGtttt > 2:495654/1‑93 (MQ=255)
acatcaTGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTtg > 1:725071/1‑93 (MQ=255)
acatcaTGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTtg > 1:4256152/1‑93 (MQ=255)
atcatGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTtgtg > 2:2856207/1‑93 (MQ=255)
tcatGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGa > 1:3413976/1‑93 (MQ=255)
catGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGaa < 2:2971169/93‑1 (MQ=255)
atGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAg > 1:4295364/1‑93 (MQ=255)
tGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAgg < 2:426669/93‑1 (MQ=255)
tGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAgg > 1:4107631/1‑93 (MQ=255)
cTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGtt < 1:1112726/93‑1 (MQ=255)
cTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGtt < 2:2078178/93‑1 (MQ=255)
cTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGtt > 1:1627308/1‑93 (MQ=255)
tGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTg > 2:1554423/1‑93 (MQ=255)
ggATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGc < 2:2143862/93‑1 (MQ=255)
ggATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGc < 1:1075762/93‑1 (MQ=255)
atCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCcgat > 1:4706632/1‑93 (MQ=255)
atCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCcgat > 2:328601/1‑93 (MQ=255)
tCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCcgatg > 1:2431205/1‑93 (MQ=255)
tCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCcgatg > 1:2334850/1‑93 (MQ=255)
ccaccaTGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCcgatgc < 2:4184132/93‑1 (MQ=255)
ccaccaTGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCcgatgc > 2:3758380/1‑93 (MQ=255)
ccaccaTGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCcgatgc < 2:4739215/93‑1 (MQ=255)
ccaccaTGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCcgatgc < 1:2097994/93‑1 (MQ=255)
ccaccaTGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCcgatgc > 1:2477418/1‑93 (MQ=255)
ccaccaTGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCcgatgc > 2:595937/1‑93 (MQ=255)
caccaTGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCcgatgcg > 2:161200/1‑93 (MQ=255)
cccaTGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCcgatgcga < 1:1669081/92‑1 (MQ=255)
accaTGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCcgatgcga > 1:4357375/1‑93 (MQ=255)
accaTGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCcgatgcga > 2:3932033/1‑93 (MQ=255)
caTGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCcgctgcgatg > 1:433820/1‑93 (MQ=255)
aTGCCTGTGTTGAGCATTGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCgatgcgatgc < 2:1852635/93‑1 (MQ=255)
aTGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCgatgcgatgc > 1:2002144/1‑93 (MQ=255)
aTGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCgatgcgatgc < 1:3145267/93‑1 (MQ=255)
tGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCt < 2:4540526/93‑1 (MQ=255)
tGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCt < 1:992028/93‑1 (MQ=255)
ccTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTgg < 2:2267266/93‑1 (MQ=255)
ccTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTgg < 1:1367510/93‑1 (MQ=255)
cTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGGGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGGTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGgc > 2:3028519/1‑93 (MQ=255)
cTGAGTTGAGCATGGTGGGGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGgc > 2:1714371/1‑93 (MQ=255)
tgtgTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGgcg > 1:3015109/1‑93 (MQ=255)
tgtgTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGAGGCTGgcg > 1:1178523/1‑93 (MQ=255)
tgtgTTGAGCATGGGGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGgcg < 1:3525615/93‑1 (MQ=255)
gtgtTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGgcgc > 2:4176398/1‑93 (MQ=255)
gtgtTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGgcgc < 1:4105292/93‑1 (MQ=255)
tgtTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGACAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGgcgcg > 1:2946473/1‑92 (MQ=255)
gcgtGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGCTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCa < 2:963213/90‑1 (MQ=255)
gtTGTGCATGGTGTGGAAGGTGAGCAAACCAACTACGTGCAGGTCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAg < 2:2696937/93‑1 (MQ=255)
tGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAggg < 2:4023465/93‑1 (MQ=255)
gAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGgt < 2:3378328/93‑1 (MQ=255)
gAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGgt < 1:4010702/93‑1 (MQ=255)
gCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGgtgt > 2:202966/1‑93 (MQ=255)
cATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGtgtg < 2:1974547/93‑1 (MQ=255)
tggtgAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTa < 1:3133513/93‑1 (MQ=255)
tggtgAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTa < 2:4432704/93‑1 (MQ=255)
ggtgAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTaa < 2:3072359/93‑1 (MQ=255)
tgAAGGCGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGTAGGGTGTGATTTAAGt > 2:4197631/1‑93 (MQ=255)
gAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGtt > 1:4744238/1‑93 (MQ=255)
aaGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTg > 1:1136576/1‑93 (MQ=255)
aaGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTg > 1:1847661/1‑93 (MQ=255)
aaGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTg < 1:671001/93‑1 (MQ=255)
aGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGt > 1:2694429/1‑93 (MQ=255)
aGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGt < 2:34322/93‑1 (MQ=255)
ggTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTa > 2:3581759/1‑93 (MQ=255)
gTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTaa < 2:46649/93‑1 (MQ=255)
tGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTaaa < 2:4630180/93‑1 (MQ=255)
tGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTaaa < 1:4465678/93‑1 (MQ=255)
tGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTaaa < 1:1930412/93‑1 (MQ=255)
gAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTAAAt < 1:4497215/93‑1 (MQ=255)
gAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTAAAt < 1:77/93‑1 (MQ=255)
aGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTAAATg < 1:4396364/93‑1 (MQ=255)
cAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTAAATGcc < 1:2556016/93‑1 (MQ=255)
|
TGGAAAGCCGAGAAAGTTGACGCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAACCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTAAATGCC > NC_000913/1841571‑1841750
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GGCTGGAAAGCCGAGAAAGTTGACGCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAACCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTAAATGCCTG > NC_000913/1841568‑1841752
|
GGCTGGAAAGCCGAGAAAGTTGACGCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAG < SRR4302544.808789/94‑1 (MQ=60)
GGCTGGAAAGCCGAGAAAGTTGACGCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAG < SRR4302544.2952719/94‑1 (MQ=60)
GGCTGGAAAGCCGAGAAAGTTGACGCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAG < SRR4302544.180807/94‑1 (MQ=60)
CTGGAAAGCCGAGAAAGTTGACGCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCC < SRR4302544.3125863/94‑1 (MQ=60)
CTGGAAAGCCGAGAAAGTTGACGCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCC > SRR4302544.240960/1‑94 (MQ=60)
TGGAAAGCCGAGAAAGTTGACGCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCA > SRR4302544.4711399/1‑94 (MQ=60)
TGGAAAGCCGAGAAAGTTGACGCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCA < SRR4302544.433645/94‑1 (MQ=60)
TGGAAAGCCGAGAAAGTTGACGCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCA > SRR4302544.2583024/1‑94 (MQ=60)
AAAGCCGAGAAAGTTGACGCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACT < SRR4302544.4771342/94‑1 (MQ=60)
AAAGCCGAGAAAGTTGACGCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACT > SRR4302544.4294241/1‑94 (MQ=60)
AAAGCCGAGAAAGTTGACGCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACT < SRR4302544.282225/94‑1 (MQ=60)
AAAGCCGAGAAAGTTGACGCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACT > SRR4302544.2687424/1‑94 (MQ=60)
AAGCCGAGAAAGTTGACGCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTA < SRR4302544.2673055/94‑1 (MQ=60)
AGCCGAGAAAGTTGACGCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTAC > SRR4302544.993852/1‑94 (MQ=60)
CGAGAAAGTTGACGCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGATCAAGCCAACTACGTG > SRR4302544.1938386/1‑94 (MQ=60)
CGAGAAAGTTGACGCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTG < SRR4302544.3173927/94‑1 (MQ=60)
CGAGAAAGTTGACGCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTG > SRR4302544.3805691/1‑94 (MQ=60)
CGAGAAAGTTGACGCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTG > SRR4302544.1646062/1‑94 (MQ=60)
GAGAAAGTTGACGCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGC < SRR4302544.4462098/94‑1 (MQ=60)
GAGAAAGTTGACGCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGC > SRR4302544.2073778/1‑94 (MQ=60)
GAGAAAGTTGACGCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGC > SRR4302544.3753302/1‑94 (MQ=60)
AGAAAGTTGACGCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGAATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCA < SRR4302544.1541713/94‑1 (MQ=60)
GAAAGTTGACGCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAG < SRR4302544.636470/94‑1 (MQ=60)
GTGACGCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCGCCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGC < SRR4302544.237253/94‑1 (MQ=60)
TGACGCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCG > SRR4302544.4388477/1‑94 (MQ=60)
CGCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAAC > SRR4302544.3238115/1‑94 (MQ=60)
CGCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAAA > SRR4302544.3364049/1‑94 (MQ=60)
CGCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTCGGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAAC > SRR4302544.1137426/1‑94 (MQ=60)
CGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCATCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTG < SRR4302544.1124170/94‑1 (MQ=60)
CGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTG > SRR4302544.3569277/1‑94 (MQ=60)
TTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCC < SRR4302544.3850416/94‑1 (MQ=60)
TTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCC < SRR4302544.3850415/94‑1 (MQ=60)
TTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCG < SRR4302544.2251979/94‑1 (MQ=60)
ATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTT > SRR4302544.1144130/1‑94 (MQ=60)
TCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTT > SRR4302544.1605424/1‑94 (MQ=60)
CACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTG > SRR4302544.4299541/1‑94 (MQ=60)
CACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTG > SRR4302544.732193/1‑94 (MQ=60)
ATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGA > SRR4302544.3446606/1‑94 (MQ=60)
CATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAG > SRR4302544.4339209/1‑94 (MQ=60)
CATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGCGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAG < SRR4302544.1218974/94‑1 (MQ=60)
ATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGG > SRR4302544.4148470/1‑94 (MQ=60)
GCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTT > SRR4302544.1643334/1‑94 (MQ=60)
GCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTT < SRR4302544.254120/94‑1 (MQ=60)
CTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTG > SRR4302544.3448605/1‑94 (MQ=60)
CTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTG < SRR4302544.1123825/94‑1 (MQ=60)
TGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGC > SRR4302544.3239288/1‑94 (MQ=60)
GGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCC < SRR4302544.1086459/94‑1 (MQ=60)
GGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCC < SRR4302544.741556/94‑1 (MQ=60)
TATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGAT > SRR4302544.4753139/1‑94 (MQ=60)
ATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATG > SRR4302544.2356983/1‑94 (MQ=60)
ATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATG > SRR4302544.2454365/1‑94 (MQ=60)
TCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGC > SRR4302544.2501109/1‑94 (MQ=60)
CCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCG < SRR4302544.2118179/94‑1 (MQ=60)
CACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGA > SRR4302544.2082381/1‑94 (MQ=60)
CACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGA > SRR4302544.4401608/1‑94 (MQ=60)
CCCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGAT < SRR4302544.1381532/94‑1 (MQ=60)
CCCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGAT < SRR4302544.1685523/94‑1 (MQ=60)
ACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGACGCGAT < SRR4302544.3039577/94‑1 (MQ=60)
CCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGCTGCGATG > SRR4302544.438197/1‑94 (MQ=60)
CATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGC > SRR4302544.2021590/1‑94 (MQ=60)
ATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCT < SRR4302544.3175167/94‑1 (MQ=60)
TGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTG < SRR4302544.1001825/94‑1 (MQ=60)
CCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGC < SRR4302544.1381106/94‑1 (MQ=60)
CTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCG > SRR4302544.322778/1‑94 (MQ=60)
CTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCG > SRR4302544.3044009/1‑94 (MQ=60)
CTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCG > SRR4302544.2944275/1‑94 (MQ=60)
CTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGAGGCTGGCG > SRR4302544.1190266/1‑94 (MQ=60)
TGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGC > SRR4302544.4129908/1‑94 (MQ=60)
TGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGGGAGCAGGCCAGCTACGTGCCGGGGGCGAATGTTGCCGGTTTTGTGAgggtggctgacgtgcggcgggggc > SRR4302544.4129909/1‑70 (MQ=20)
TGTGTTGAGCATGGGGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGC < SRR4302544.3559304/94‑1 (MQ=60)
GTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCA < SRR4302544.4146117/94‑1 (MQ=60)
GTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGACAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCG > SRR4302544.2974774/1‑94 (MQ=60)
GTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGG > SRR4302544.3731271/1‑94 (MQ=60)
GTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGG < SRR4302544.2352282/94‑1 (MQ=60)
TGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGG > SRR4302544.3561499/1‑94 (MQ=60)
GAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTG < SRR4302544.1810045/94‑1 (MQ=60)
GAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTG < SRR4302544.4050600/94‑1 (MQ=60)
ACATGGTGGTGAATGTGAGGAAGCCAACTACGTGCACGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTG < SRR4302544.2410723/94‑1 (MQ=60)
CATGGTGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGA < SRR4302544.3873804/94‑1 (MQ=60)
TGGTGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAA < SRR4302544.3163279/94‑1 (MQ=60)
TGAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTT > SRR4302544.4790989/1‑94 (MQ=60)
GAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTG > SRR4302544.1865549/1‑94 (MQ=60)
GAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTG > SRR4302544.1147883/1‑94 (MQ=60)
GAAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTG < SRR4302544.1559633/94‑1 (MQ=60)
AAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGT < SRR4302544.677633/94‑1 (MQ=60)
AAGGTGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGT > SRR4302544.2720295/1‑94 (MQ=60)
TGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTAAAT < SRR4302544.1949089/94‑1 (MQ=60)
TGAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTAAAT < SRR4302544.4510608/94‑1 (MQ=60)
GAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTAAATG < SRR4302544.4427346/94‑1 (MQ=60)
GAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTAAATG < SRR4302544.79/94‑1 (MQ=60)
GAGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTAAATG < SRR4302544.4542351/94‑1 (MQ=60)
AGCAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTAAATGC < SRR4302544.4440817/94‑1 (MQ=60)
CAAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTAAATGCCT < SRR4302544.2580557/94‑1 (MQ=60)
AAGCCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTAAATGCCTG > SRR4302544.1447387/1‑94 (MQ=60)
|
GGCTGGAAAGCCGAGAAAGTTGACGCACGTTTGCATCACATCATGCTGGATATCCACCATGCCTGTGTTGAGCATGGTGGTGAAGGTGAGCAAACCAACTACGTGCAGGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTAAATGCCTG > NC_000913/1841568‑1841752
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
