Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
1357 |
179.3 |
9500450 |
96.1% |
9129932 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,137,219 |
C→T |
G24R (GGG→AGG) |
talC ← |
putative transaldolase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,137,219 | 0 | C | T | 97.5%
| 559.0
/ ‑0.3
| 161 | G24R (GGG→AGG) | talC | putative transaldolase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (2/2); new base T (81/76); total (83/78) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.25e-01 |
Only 100 of 164 total aligned reads displayed.
CCTCATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTAGTTGTCACCCCGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCATGATGTTTCCTTTTACAGTT > NC_000913/4137129‑4137307
|
ccTCATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTgg > 2:1233532/1‑93 (MQ=255)
cTCATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGc > 2:529808/1‑93 (MQ=255)
cTCATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGc > 2:1641545/1‑93 (MQ=255)
cTCATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGc > 1:3783907/1‑93 (MQ=255)
catcaCCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCaa > 1:2729687/1‑93 (MQ=255)
catcaCCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCaa > 2:1474235/1‑93 (MQ=255)
catcaCCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCaa < 2:436630/93‑1 (MQ=255)
atcaCCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAAt > 2:1119793/1‑93 (MQ=255)
atcaCCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAAt < 1:3123978/93‑1 (MQ=255)
atcaCCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAAt < 2:1233288/93‑1 (MQ=255)
atcaCCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTAGTTGTCACCCCGGCAAt > 1:3819643/1‑93 (MQ=255)
aCCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATggg < 1:2169731/93‑1 (MQ=255)
ccAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATgggg < 1:4361656/93‑1 (MQ=255)
cAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGa > 1:4138014/1‑93 (MQ=255)
cAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGa > 2:2422914/1‑93 (MQ=255)
aaTCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGaa > 2:3424084/1‑93 (MQ=255)
aaTCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGaa > 1:3362178/1‑93 (MQ=255)
aaTCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGaa < 2:708393/93‑1 (MQ=255)
aTCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAat < 2:209311/93‑1 (MQ=255)
tCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAata < 1:11285/93‑1 (MQ=255)
tCGCTGTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAata < 2:2176266/93‑1 (MQ=255)
cGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAatat < 2:899915/93‑1 (MQ=255)
cGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAatat > 1:2726336/1‑93 (MQ=255)
cGCTTTTTGCAGAAGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAatat < 1:1583106/93‑1 (MQ=255)
gCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATg > 2:2536178/1‑93 (MQ=255)
tttttGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCg > 2:1280992/1‑93 (MQ=255)
tttttGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCg > 2:3811493/1‑93 (MQ=255)
ttttGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGt < 2:1444689/93‑1 (MQ=255)
gCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGccg > 1:1408929/1‑92 (MQ=255)
aGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGa > 1:789989/1‑93 (MQ=255)
aGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGa < 1:916039/93‑1 (MQ=255)
aGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGa < 1:2475258/93‑1 (MQ=255)
gACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGAc < 1:1763628/93‑1 (MQ=255)
gACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGAc < 1:1520681/93‑1 (MQ=255)
gACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGAc < 1:697536/93‑1 (MQ=255)
aCGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACg < 2:1130995/93‑1 (MQ=255)
cgcgGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGt > 2:4630092/1‑93 (MQ=255)
cgcgGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGt < 1:228448/93‑1 (MQ=255)
gcgGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGtt < 1:1987028/93‑1 (MQ=255)
cgtcagcaCTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTc < 2:1265575/90‑1 (MQ=255)
cgGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTc < 2:24154/93‑1 (MQ=255)
ggCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCg < 2:212258/93‑1 (MQ=255)
cagcaCTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGAc < 2:2104825/93‑1 (MQ=255)
agcaCTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACt > 1:1894916/1‑93 (MQ=255)
gcaCTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACtt < 1:1022526/93‑1 (MQ=255)
caCTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTc < 2:4095415/93‑1 (MQ=255)
aCTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCt < 2:18283/93‑1 (MQ=255)
ttCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGc < 2:919727/93‑1 (MQ=255)
ttCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGc > 1:575280/1‑93 (MQ=255)
ccATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGAc < 2:1309245/93‑1 (MQ=255)
cATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACg > 1:1040031/1‑93 (MQ=255)
atatGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTTTGCGACGt < 2:3839589/93‑1 (MQ=255)
tatGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGtt > 2:2712614/1‑93 (MQ=255)
tatGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGtt < 2:4661547/93‑1 (MQ=255)
tatGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGtt > 1:2016213/1‑93 (MQ=255)
atGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGGCGTTa > 2:1709696/1‑93 (MQ=255)
atGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTa > 2:1979422/1‑93 (MQ=255)
atGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTa < 2:2932738/93‑1 (MQ=255)
atGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTa < 1:2200255/93‑1 (MQ=255)
tGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAg < 2:3365971/93‑1 (MQ=255)
tGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAg > 1:3324840/1‑93 (MQ=255)
ggACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGc < 1:1984158/93‑1 (MQ=255)
ggACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGc < 2:2743588/93‑1 (MQ=255)
tCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGgtg < 2:3115967/93‑1 (MQ=255)
tCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGgtg > 1:4607022/1‑93 (MQ=255)
ttGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTcc < 2:4542038/93‑1 (MQ=255)
ttGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTcc > 2:321783/1‑93 (MQ=255)
ttGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTcc > 2:3132904/1‑93 (MQ=255)
tGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCa < 2:3484929/93‑1 (MQ=255)
cTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGa > 1:3868998/1‑93 (MQ=255)
tGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGAt > 1:59875/1‑93 (MQ=255)
gCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATAc > 2:4406430/1‑93 (MQ=255)
cAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACa < 1:3539446/93‑1 (MQ=255)
cAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACa < 1:2553566/93‑1 (MQ=255)
aGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAg < 2:3710117/93‑1 (MQ=255)
gCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGt < 2:3946946/93‑1 (MQ=255)
gCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGt > 1:1800684/1‑93 (MQ=255)
gCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGt > 1:4675514/1‑93 (MQ=255)
gATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTc < 1:502806/93‑1 (MQ=255)
aTAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTcc < 1:1845668/93‑1 (MQ=255)
tAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGACTATGCGTGGCAGACGGTCGACTTCTGCGACGTGAGCGGTGTCCAGGTACAGTTGCa > 2:2178878/1‑93 (MQ=255)
tAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGATCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTTCa > 2:2812083/1‑93 (MQ=255)
aaTGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCat < 1:31751/93‑1 (MQ=255)
aaTGCTCGGGTTAGTTGTCACCCCGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCat > 2:2137492/1‑93 (MQ=255)
aTGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCatg > 1:1002453/1‑93 (MQ=255)
aTGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCatg < 1:2583035/93‑1 (MQ=255)
tCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCATGATGt < 2:1703220/93‑1 (MQ=255)
tCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCATGATGt > 2:1187752/1‑93 (MQ=255)
cGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCATGATGtt > 2:855424/1‑93 (MQ=255)
gttggttgTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCATGATGTTTcc < 2:2231449/93‑1 (MQ=255)
ttAGTTGTCACCCCGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCATGATGTTTCCt < 2:4021495/93‑1 (MQ=255)
tggTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCATGATGTTTCCtt > 1:1926890/3‑93 (MQ=255)
gTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCATGATGTTTCCtttt > 1:862267/1‑93 (MQ=255)
ttGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGCCGTTCGACTTATGCTACGTTCGCGGGGTCCAGATACAGTTCCATGATGTTTCCTTTTa > 1:4528266/1‑93 (MQ=255)
gTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGCGTCCAGATACAGTTCCATGATGTTTCCTTTTAca > 1:1356995/1‑93 (MQ=255)
tCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCATGATGTTTCCTTTTAcag > 1:2824913/1‑93 (MQ=255)
tCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCATGATGTTTCCTTTTAcag > 2:3008112/1‑93 (MQ=255)
cACCCTGGCAATGGGGAATAGGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGCTACAGTTCCATGATGTTTCCTTTTAcagt > 2:3548125/1‑93 (MQ=255)
cccctGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCATGATGTTTCCTTTTAcagtt < 1:392786/92‑1 (MQ=255)
aCCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCATGATGTTTCCTTATAcagtt > 1:682180/1‑93 (MQ=255)
|
CCTCATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTAGTTGTCACCCCGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCATGATGTTTCCTTTTACAGTT > NC_000913/4137129‑4137307
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GCCCTCATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTAGTTGTCACCCC‑GGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCATGATGTTTCCTTTTACAGTTCCAG > NC_000913/4137127‑4137311
|
GCNCTCANCACCAATCGCTTTNTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCT‑G < SRR4302544.2900627/94‑1 (MQ=60)
GCCCTCATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCT‑G < SRR4302544.528648/94‑1 (MQ=60)
CCCTCATCCCCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCT‑GG < SRR4302544.3929748/94‑1 (MQ=60)
CCCTCATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCT‑GG < SRR4302544.888187/94‑1 (MQ=60)
CCTCATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCT‑GGC > SRR4302544.3821375/1‑94 (MQ=60)
CTCATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCT‑GGCA < SRR4302544.1759636/94‑1 (MQ=60)
TCATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCT‑GGCAA > SRR4302544.1034527/1‑94 (MQ=60)
TCATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCT‑GGCAA > SRR4302544.2755994/1‑94 (MQ=60)
CATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTAGTTGTCACCCC‑GGCAAT > SRR4302544.3857506/1‑94 (MQ=60)
ATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCT‑GGCAATG < SRR4302544.3153672/94‑1 (MQ=60)
CACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCT‑GGCAATGGG > SRR4302544.3804021/1‑94 (MQ=60)
CACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCT‑GGCAATGGG < SRR4302544.693164/94‑1 (MQ=60)
ACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCT‑GGCAATGGGG > SRR4302544.2845470/1‑94 (MQ=60)
ACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCT‑GGCAATGGGG < SRR4302544.2190308/94‑1 (MQ=60)
CCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCT‑GGCAATGGGGA > SRR4302544.4178996/1‑94 (MQ=60)
CCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCT‑GGCAATGGGGA < SRR4302544.4405915/94‑1 (MQ=60)
CAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCT‑GGCAATGGGGAA > SRR4302544.3394264/1‑94 (MQ=60)
CAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCT‑GGCAATGGGGAA < SRR4302544.3258171/94‑1 (MQ=60)
ATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCT‑GGCAATGGGGAATA > SRR4302544.4484038/1‑94 (MQ=60)
TCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCT‑GGCAATGGGGAATAT < SRR4302544.11386/94‑1 (MQ=60)
TCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCT‑GGCAATGGGGAATAT > SRR4302544.2752596/1‑94 (MQ=60)
CGCTTTTTGCAGAAGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCT‑GGCAATGGGGAATATG < SRR4302544.1598746/94‑1 (MQ=60)
CTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCCCCCT‑GGCAATGGGGAATATGCG < SRR4302544.1300424/94‑1 (MQ=60)
CTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCT‑GGCAATGGGGAATATGCG > SRR4302544.241308/1‑94 (MQ=60)
CTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCT‑GGCAATGGGGAATATGCG > SRR4302544.2011413/1‑94 (MQ=60)
TTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTAGTTGTCACCCC‑GGCAATGGGGAATATGCGT < SRR4302544.1584829/94‑1 (MQ=60)
TTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCT‑GGCAATGGGGAATATGCGTG < SRR4302544.739573/94‑1 (MQ=60)
TTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCT‑GGCAATGGGGAATATGCGTG < SRR4302544.54198/94‑1 (MQ=60)
TGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCT‑GGCAATGGGGAATATGCGTGCCG > SRR4302544.1422955/1‑94 (MQ=60)
GCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCT‑GGCAATGGGGAATATGCGTGCCAG > SRR4302544.2626600/1‑94 (MQ=60)
CAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCT‑GGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGA > SRR4302544.797630/1‑94 (MQ=60)
AGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCT‑GGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGAC < SRR4302544.2498927/94‑1 (MQ=60)
AGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCT‑GGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGAC < SRR4302544.925089/94‑1 (MQ=60)
GACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCT‑GGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACG < SRR4302544.704483/94‑1 (MQ=60)
GACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCT‑GGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACG < SRR4302544.1535775/94‑1 (MQ=60)
GACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCT‑GGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACG < SRR4302544.1780880/94‑1 (MQ=60)
CGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCT‑GGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTT < SRR4302544.230818/94‑1 (MQ=60)
CGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCT‑GGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTT < SRR4302544.1854344/94‑1 (MQ=60)
GCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCT‑GGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTC < SRR4302544.2006321/94‑1 (MQ=60)
GCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCT‑GGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTC < SRR4302544.2855629/94‑1 (MQ=60)
CAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCT‑GGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACT > SRR4302544.1913231/1‑94 (MQ=60)
CAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCT‑GGCAATGGGGAATATGCGTGCCACACGTTCGACT > SRR4302544.2036001/1‑94 (MQ=60)
GCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCT‑GGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTC < SRR4302544.1032742/94‑1 (MQ=60)
CTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCT‑GGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGC > SRR4302544.580903/1‑94 (MQ=60)
CCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCT‑GGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACG > SRR4302544.1050356/1‑94 (MQ=60)
ATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCT‑GGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTT > SRR4302544.2035798/1‑94 (MQ=60)
ATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCT‑GGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTT > SRR4302544.2589781/1‑94 (MQ=60)
TATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCT‑GGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTA > SRR4302544.1380853/1‑94 (MQ=60)
ATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCT‑GGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAG < SRR4302544.2220994/94‑1 (MQ=60)
ATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCT‑GGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAG > SRR4302544.3356510/1‑94 (MQ=60)
TGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCT‑GGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGC > SRR4302544.890281/1‑94 (MQ=60)
GGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCT‑GGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCG < SRR4302544.2003424/94‑1 (MQ=60)
CTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCT‑GGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTG > SRR4302544.4652788/1‑94 (MQ=60)
CTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCT‑GGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCC > SRR4302544.4356894/1‑94 (MQ=60)
TGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCT‑GGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAG < SRR4302544.581315/94‑1 (MQ=60)
GCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCT‑GGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGA > SRR4302544.3907418/1‑94 (MQ=60)
GCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCT‑GGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGA > SRR4302544.3907419/1‑94 (MQ=60)
CTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCT‑GGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGAT > SRR4302544.60484/1‑94 (MQ=60)
CTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCT‑GGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGAT > SRR4302544.3522582/1‑94 (MQ=60)
TGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCT‑GGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATA < SRR4302544.1991313/94‑1 (MQ=60)
CAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCT‑GGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAG > SRR4302544.1894693/1‑94 (MQ=60)
CAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCT‑GGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAG < SRR4302544.3573313/94‑1 (MQ=60)
CAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCT‑GGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAG < SRR4302544.2578082/94‑1 (MQ=60)
AGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCT‑GGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGT > SRR4302544.1818281/1‑94 (MQ=60)
AGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCT‑GGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGT > SRR4302544.4721724/1‑94 (MQ=60)
GATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCT‑GGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCC < SRR4302544.507753/94‑1 (MQ=60)
ATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCT‑GGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCA < SRR4302544.1863548/94‑1 (MQ=60)
AATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCT‑GGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCATG > SRR4302544.990342/1‑94 (MQ=60)
AATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCT‑GGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCATG > SRR4302544.1012404/1‑94 (MQ=60)
AATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCT‑GGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCATG < SRR4302544.32061/94‑1 (MQ=60)
ATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCT‑GGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCATGA < SRR4302544.2607862/94‑1 (MQ=60)
TTGGTTGTCACCCT‑GGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCATGATGTTTCCTT > SRR4302544.1945533/1‑94 (MQ=60)
GGTTGTCACCCT‑GGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCATGATGTTTCCTTTT > SRR4302544.870798/1‑94 (MQ=60)
GTTGTCACCCT‑GGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGCCGTTCGACTTATGCTACGTTCGCGGGGTCCAGATACAGTTCCATGATGTTTCCTTTTA > SRR4302544.4573578/1‑94 (MQ=60)
TTGTCACCCT‑GGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCATGATGTTTCCTTTTAC > SRR4302544.2246018/1‑94 (MQ=60)
TGTCACCCT‑GGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCATGATGTTTCCTTTTACA > SRR4302544.4661122/1‑94 (MQ=60)
TGTCACCCT‑GGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGCGTCCAGATACAGTTCCATGATGTTTCCTTTTACA > SRR4302544.1370457/1‑94 (MQ=60)
GTCACCCT‑GGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCATGATGTTTCCTTTTACAG > SRR4302544.2852207/1‑94 (MQ=60)
CACCCT‑GGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCATGATGTTTCCTTATACAGTT > SRR4302544.688962/1‑94 (MQ=60)
CCCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCATGATGTTTCCTTTTACAGTTC < SRR4302544.396767/94‑1 (MQ=60)
CCCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCATGATGTTTCCTTTTACAGTTC < SRR4302544.396766/94‑1 (MQ=60)
CCT‑GGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCATGATGTTTCCTTTTACAGTTCCA > SRR4302544.4142170/1‑94 (MQ=60)
CCT‑GGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCATGATGTTTCCTTTTACAGTTCCA < SRR4302544.293323/94‑1 (MQ=60)
CT‑GGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCATGATGTTTCCTTTTACAGTTCCAG < SRR4302544.2929376/94‑1 (MQ=60)
|
GCCCTCATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTAGTTGTCACCCC‑GGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCATGATGTTTCCTTTTACAGTTCCAG > NC_000913/4137127‑4137311
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
