Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1475 |
266.7 |
13469680 |
98.2% |
13227225 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,143,530 |
T→C |
L748P (CTG→CCG) |
yegE → |
putative sensor‑type protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,143,530 | 0 | T | C | 100.0%
| 715.4
/ NA
| 218 | L748P (CTG→CCG) | yegE | putative sensor‑type protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (106/112); total (106/112) |
Only 100 of 225 total aligned reads displayed.
TTATCGATCTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCTGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAGCGCGC > NC_000913/2143440‑2143619
|
tATCGATCTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAg < 2:855664/93‑1 (MQ=255)
tATCGATCTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAg > 1:6647947/1‑93 (MQ=255)
tCGATCTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTa < 1:4034162/93‑1 (MQ=255)
cGATCTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTAt < 2:354298/93‑1 (MQ=255)
cGATCTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTAt < 2:2601696/93‑1 (MQ=255)
cGATCTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTAt > 2:1874592/1‑93 (MQ=255)
gATCTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTAtg > 2:4500769/1‑93 (MQ=255)
aTCTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTAtgc > 1:6488835/1‑93 (MQ=255)
aTCTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTAtgc < 1:3963651/93‑1 (MQ=255)
tCTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTAtgct > 2:904386/1‑93 (MQ=255)
tCTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTAtgct > 2:1179601/1‑93 (MQ=255)
tCTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGGGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTAtgct > 1:2693252/1‑93 (MQ=255)
ttGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTAtgctgc < 1:1856201/93‑1 (MQ=255)
ttGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTAtgctgc < 1:2005223/93‑1 (MQ=255)
gATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGt < 2:603768/93‑1 (MQ=255)
aTCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGtt > 2:6484241/1‑93 (MQ=255)
aTCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGtt > 1:4473658/1‑93 (MQ=255)
aTCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGtt > 1:380674/1‑93 (MQ=255)
cGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTcc > 1:2425387/1‑93 (MQ=255)
cGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTcc < 1:6531314/93‑1 (MQ=255)
cGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTcc < 2:5005259/93‑1 (MQ=255)
cGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTcc < 2:5836951/93‑1 (MQ=255)
gCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCa > 1:6129549/1‑93 (MQ=255)
gCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCa < 1:2840118/93‑1 (MQ=255)
cTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAg < 1:451173/93‑1 (MQ=255)
tttAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTGTGCTGCGTTCCAGc > 2:1394498/1‑93 (MQ=255)
tAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGa > 1:331693/1‑93 (MQ=255)
aaaGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGag > 2:1751142/1‑92 (MQ=255)
aaaGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGAc > 2:3129478/1‑93 (MQ=255)
aaGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACg > 1:5330814/1‑93 (MQ=255)
aaGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACg > 2:5164968/1‑93 (MQ=255)
aGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACgg > 1:5041852/1‑92 (MQ=255)
aGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGt < 1:4820878/93‑1 (MQ=255)
aGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGt > 2:6090493/1‑93 (MQ=255)
gCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTg > 1:4192801/1‑93 (MQ=255)
cGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGc < 2:214940/93‑1 (MQ=255)
cGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGc < 2:6704329/93‑1 (MQ=255)
ggTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCt < 2:2102059/93‑1 (MQ=255)
ggTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCt < 1:1624257/93‑1 (MQ=255)
gTGAATGACAGCGCCTGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTg < 1:5218247/93‑1 (MQ=255)
gTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGACCTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTg < 1:1503313/93‑1 (MQ=255)
tGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGGGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTgg > 2:1768875/1‑93 (MQ=255)
aTGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGgcgc > 1:1028362/1‑93 (MQ=255)
gACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGa > 2:3400430/1‑93 (MQ=255)
gACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTCGCGCGa > 2:2671513/1‑93 (MQ=255)
aCAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGAc < 1:4326270/93‑1 (MQ=255)
gcgcCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCg > 1:1103799/1‑93 (MQ=255)
gcgcCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCg > 2:738420/1‑93 (MQ=255)
gcgcCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCg > 2:4576713/1‑93 (MQ=255)
cgcCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCgg < 2:3847761/93‑1 (MQ=255)
ccGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTg > 2:1072822/1‑93 (MQ=255)
cGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTgg < 1:1274165/93‑1 (MQ=255)
ggCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTgggg > 2:4710110/1‑93 (MQ=255)
gCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGa < 1:2117366/93‑1 (MQ=255)
aTGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATg > 2:4187691/1‑93 (MQ=255)
aTGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATg < 2:4913032/93‑1 (MQ=255)
tGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGCTGa > 1:4239275/1‑93 (MQ=255)
gcggcgGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGGGGGGGTGaa > 1:2817540/1‑93 (MQ=255)
gcggcgGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGGCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGGTGaa > 2:181005/1‑93 (MQ=255)
cggcggGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAAt < 2:2494020/93‑1 (MQ=255)
ggcggGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAAtt > 2:5502266/1‑93 (MQ=255)
ggcggGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAAtt < 1:4085681/93‑1 (MQ=255)
ggcggGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAAtt < 1:6272635/93‑1 (MQ=255)
gggTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTgg > 2:5090257/1‑93 (MQ=255)
ggTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGt < 1:4873793/93‑1 (MQ=255)
ggTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGAGACTCGGTGGGGATGAATTTGGt < 1:5378357/93‑1 (MQ=255)
gctGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGt < 2:3891929/91‑1 (MQ=255)
gTGACGCTTTGCTGCGCGAAGTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTc < 1:29636/93‑1 (MQ=255)
gTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTc < 1:4423554/93‑1 (MQ=255)
gTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTc < 1:5798590/93‑1 (MQ=255)
gTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTGAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTc < 1:3562417/93‑1 (MQ=255)
tGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTct > 2:2302122/1‑93 (MQ=255)
tGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTct < 2:1012272/93‑1 (MQ=255)
gACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTctg > 2:3060245/1‑93 (MQ=255)
gACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTctg > 2:5357625/1‑93 (MQ=255)
gACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTctg < 2:4669402/93‑1 (MQ=255)
aCGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTctgc > 2:1261853/1‑93 (MQ=255)
aCGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTctgc < 1:3129446/93‑1 (MQ=255)
cTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCtgctgc < 1:4669526/93‑1 (MQ=255)
cTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCtgctgc > 1:6232043/1‑93 (MQ=255)
tttGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGCATTTGGTCTgctgct > 1:1905934/1‑93 (MQ=255)
tttGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTgctgct < 2:4137705/93‑1 (MQ=255)
ttGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTa > 1:684408/1‑93 (MQ=255)
gctgcGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTAcc > 2:2775911/1‑93 (MQ=255)
ctgcGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCa < 1:1674800/93‑1 (MQ=255)
gcgcGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGa < 2:2577458/93‑1 (MQ=255)
cgAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTg > 1:5518113/1‑93 (MQ=255)
cgAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTg < 2:3443982/93‑1 (MQ=255)
gAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGGTGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGt > 1:5708529/1‑93 (MQ=255)
gAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGt > 1:5845839/1‑93 (MQ=255)
aaCTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTa > 2:6407556/1‑93 (MQ=255)
cTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAAt < 2:2963862/93‑1 (MQ=255)
cTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAAt < 2:4214838/93‑1 (MQ=255)
ggCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGt > 1:5994581/1‑93 (MQ=255)
gccgtcgtGAAGGCCGAGTATGCTGCGTACCAGCGACGTGCGGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGt < 1:1134130/91‑1 (MQ=255)
gtcgtTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGa < 1:6332372/93‑1 (MQ=255)
tcgtTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGaa < 2:5723241/93‑1 (MQ=255)
tcgtTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGaa < 1:3690433/93‑1 (MQ=255)
gtTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAg > 1:3887882/1‑93 (MQ=255)
tAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAgcg > 1:1615466/1‑93 (MQ=255)
|
TTATCGATCTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCTGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAGCGCGC > NC_000913/2143440‑2143619
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TGTTTATCGATCTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCTGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAGCGCGCGTT > NC_000913/2143437‑2143622
|
TGTTTATCGATCTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGCACTGGCGTCGTTAATGCC > SRR4302536.71625/1‑94 (MQ=60)
TGTTTATCGATCTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCC < SRR4302536.3289079/94‑1 (MQ=60)
TTATCGATCTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAG > SRR4302536.6845597/1‑94 (MQ=60)
TTATCGATCTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAG < SRR4302536.6669265/94‑1 (MQ=60)
ATCGATCTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTG > SRR4302536.4198071/1‑94 (MQ=60)
TCGATCTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTAT < SRR4302536.4153801/94‑1 (MQ=60)
TCGATCTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTAT < SRR4302536.65587/94‑1 (MQ=60)
CGATCTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATG < SRR4302536.6723981/94‑1 (MQ=60)
GATCTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGC < SRR4302536.1597782/94‑1 (MQ=60)
GATCTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGC > SRR4302536.6682336/1‑94 (MQ=60)
ATCTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCT < SRR4302536.4081317/94‑1 (MQ=60)
ATCTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCT < SRR4302536.3643455/94‑1 (MQ=60)
ATCTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCT > SRR4302536.6274967/1‑94 (MQ=60)
ATCTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACCGGCGTCGTTAATGCCGACTATGCT > SRR4302536.3407729/1‑94 (MQ=60)
ATCTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGGGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCT > SRR4302536.2773648/1‑94 (MQ=60)
TTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCG < SRR4302536.1912123/94‑1 (MQ=60)
TTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCG < SRR4302536.2065562/94‑1 (MQ=60)
TGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGT > SRR4302536.453289/1‑94 (MQ=60)
GATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTT > SRR4302536.3686614/1‑94 (MQ=60)
GATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTT > SRR4302536.4608046/1‑94 (MQ=60)
GATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTT > SRR4302536.390697/1‑94 (MQ=60)
GATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTT > SRR4302536.43099/1‑94 (MQ=60)
GATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTT < SRR4302536.2781259/94‑1 (MQ=60)
TCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCC > SRR4302536.2498700/1‑94 (MQ=60)
CGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGGGCCGTGCATGCGGCGCGTGACGCTTTGCTGCGCGGATTGGCGTCGTTAAAGCCTAGTATGCTGCATTCCA > SRR4302536.1021074/1‑94 (MQ=53)
CGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCA > SRR4302536.6312230/1‑94 (MQ=60)
CGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCA < SRR4302536.6725850/94‑1 (MQ=60)
GCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAG < SRR4302536.2924157/94‑1 (MQ=60)
CTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGC < SRR4302536.463023/94‑1 (MQ=60)
CTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGC > SRR4302536.6053732/1‑94 (MQ=60)
CTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAACGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGC > SRR4302536.6326113/1‑94 (MQ=60)
TTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCG < SRR4302536.6426880/94‑1 (MQ=60)
GTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCG < SRR4302536.2318621/94‑1 (MQ=60)
TTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGA > SRR4302536.340500/1‑94 (MQ=60)
AAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACG > SRR4302536.5490081/1‑94 (MQ=60)
AAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGT < SRR4302536.3777184/94‑1 (MQ=60)
AAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGT < SRR4302536.4574599/94‑1 (MQ=60)
AAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGT < SRR4302536.5803107/94‑1 (MQ=60)
AAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGG > SRR4302536.5192960/1‑94 (MQ=60)
AGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTG < SRR4302536.4965955/94‑1 (MQ=60)
AGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTG > SRR4302536.4317402/1‑94 (MQ=60)
AGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATCCTCCGTTCCAGCGACGTG > SRR4302536.2150083/1‑94 (MQ=60)
CGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCT < SRR4302536.4455608/94‑1 (MQ=60)
GGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTG < SRR4302536.1279425/94‑1 (MQ=60)
GGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTG < SRR4302536.1671556/94‑1 (MQ=60)
GGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTG > SRR4302536.5727899/1‑94 (MQ=60)
GTGAATGACAGCGCCTGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGG < SRR4302536.5373734/94‑1 (MQ=60)
GTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGACCTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGG < SRR4302536.1547635/94‑1 (MQ=60)
GTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTAG > SRR4302536.5642958/1‑94 (MQ=60)
AATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGC > SRR4302536.1058821/1‑94 (MQ=60)
GACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGAC > SRR4302536.4151767/1‑94 (MQ=60)
GACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGGGACGCTTTGCGGCGCGAACTGGCGTCGTTAAAGCAGAGTGTTCTTCGGTCCAGCGACGTGCCGGGGCGAC > SRR4302536.1265547/1‑94 (MQ=44)
ACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACT < SRR4302536.4455816/94‑1 (MQ=60)
AGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCG < SRR4302536.4972110/94‑1 (MQ=60)
AGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCG > SRR4302536.1136931/1‑94 (MQ=60)
AGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCG > SRR4302536.1947797/1‑94 (MQ=60)
CGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGG > SRR4302536.1882109/1‑94 (MQ=60)
GCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTG < SRR4302536.6246161/94‑1 (MQ=60)
CCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGG > SRR4302536.1506311/1‑94 (MQ=60)
CGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGG < SRR4302536.1312314/94‑1 (MQ=60)
CGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGG < SRR4302536.2722061/94‑1 (MQ=60)
GGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGG < SRR4302536.5532945/94‑1 (MQ=60)
GGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGG < SRR4302536.98549/94‑1 (MQ=60)
GGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGA > SRR4302536.4412341/1‑94 (MQ=60)
GCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGAT < SRR4302536.2180986/94‑1 (MQ=60)
CATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTTGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATG > SRR4302536.3989231/1‑94 (MQ=60)
CATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATG < SRR4302536.1789218/94‑1 (MQ=60)
ATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGCTGA > SRR4302536.4365485/1‑94 (MQ=60)
TGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGGGGGGGTGAA > SRR4302536.2901000/1‑94 (MQ=60)
GGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTT < SRR4302536.4206815/94‑1 (MQ=60)
GGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTT > SRR4302536.1160838/1‑94 (MQ=60)
GGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTT < SRR4302536.6459518/94‑1 (MQ=60)
GCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTG < SRR4302536.5941686/94‑1 (MQ=60)
CGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGG > SRR4302536.4637510/1‑94 (MQ=60)
GGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTC < SRR4302536.5020413/94‑1 (MQ=60)
GGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGAGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTC < SRR4302536.5538826/94‑1 (MQ=60)
GCTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTC < SRR4302536.4669001/94‑1 (MQ=60)
GTGACGCTTTGCTGCGCGAAGTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCT < SRR4302536.30453/94‑1 (MQ=60)
GTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCT > SRR4302536.1668485/1‑94 (MQ=60)
GTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCT < SRR4302536.5971248/94‑1 (MQ=60)
GTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCT < SRR4302536.4556042/94‑1 (MQ=60)
GTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTGAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCT < SRR4302536.3668935/94‑1 (MQ=60)
ACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCT < SRR4302536.3220928/94‑1 (MQ=60)
CGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTG > SRR4302536.3041801/1‑94 (MQ=60)
GCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGC > SRR4302536.428309/1‑94 (MQ=60)
GCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGC > SRR4302536.6417722/1‑94 (MQ=60)
CTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGCATTTGGTCTGCTGCT > SRR4302536.1963315/1‑94 (MQ=60)
CTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCT < SRR4302536.6880089/94‑1 (MQ=60)
CTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCT > SRR4302536.5436200/1‑94 (MQ=60)
CTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCT < SRR4302536.4809926/94‑1 (MQ=60)
TTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTA > SRR4302536.704458/1‑94 (MQ=60)
GCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCA < SRR4302536.2037399/94‑1 (MQ=60)
CTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAG < SRR4302536.1723370/94‑1 (MQ=60)
TGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGA < SRR4302536.3865181/94‑1 (MQ=60)
TGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGA > SRR4302536.4046951/1‑94 (MQ=60)
CGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACT < SRR4302536.534370/94‑1 (MQ=60)
CGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACT > SRR4302536.1689990/1‑94 (MQ=60)
GCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTG > SRR4302536.5682679/1‑94 (MQ=60)
GCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTG < SRR4302536.2982766/94‑1 (MQ=60)
CGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGGTGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGT > SRR4302536.5878293/1‑94 (MQ=60)
CGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGT > SRR4302536.6020005/1‑94 (MQ=60)
CGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTATGCTGCTACCAGACTGT > SRR4302536.4139198/1‑94 (MQ=60)
GAACTGGCGTCGTTAATGCCGGGTATGCTACGTTCCAGCGACGAGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGATCTTGGTCTGGTGCTACCAGACTGCA > SRR4302536.4826244/1‑94 (MQ=60)
AGCTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAA < SRR4302536.3212443/94‑1 (MQ=60)
AACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATTAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAA < SRR4302536.646878/94‑1 (MQ=60)
AACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAA > SRR4302536.5367236/1‑94 (MQ=60)
AACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAA > SRR4302536.5183764/1‑94 (MQ=60)
AACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAA > SRR4302536.3366843/1‑94 (MQ=60)
ACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAAT < SRR4302536.1418885/94‑1 (MQ=60)
CTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATG < SRR4302536.4872869/94‑1 (MQ=60)
TGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGT > SRR4302536.6173280/1‑94 (MQ=60)
TGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGT > SRR4302536.218904/1‑94 (MQ=60)
GTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAA < SRR4302536.6016478/94‑1 (MQ=60)
GTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAA < SRR4302536.6520959/94‑1 (MQ=60)
GTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGGTCCAGCGACGGGCTGGCGCGAATCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGGTGAA > SRR4302536.336578/1‑94 (MQ=60)
TCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAA < SRR4302536.3800804/94‑1 (MQ=60)
CGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAG > SRR4302536.4003499/1‑94 (MQ=60)
CGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAG > SRR4302536.727376/1‑94 (MQ=60)
GTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTGATGTTGcaagg > SRR4302536.2902073/1‑89 (MQ=60)
GTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAGC < SRR4302536.4730275/94‑1 (MQ=60)
TTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAGCG > SRR4302536.1662549/1‑94 (MQ=60)
TAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAGCGC > SRR4302536.6845112/1‑94 (MQ=60)
AATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAGCGCG > SRR4302536.1075962/1‑94 (MQ=60)
CCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAGCGCGCGTT < SRR4302536.2996612/94‑1 (MQ=60)
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TGTTTATCGATCTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCTGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAGCGCGCGTT > NC_000913/2143437‑2143622
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
