Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1475 |
266.7 |
13469680 |
98.2% |
13227225 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,496,430 |
T→C |
I322I (ATT→ATC) |
cysG → |
uroporphyrinogen III methylase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,496,430 | 0 | T | C | 100.0%
| 783.9
/ NA
| 239 | I322I (ATT→ATC) | cysG | uroporphyrinogen III methylase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (113/126); total (113/126) |
Only 100 of 250 total aligned reads displayed.
AGGCAAACGCGTGGTGCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATTCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGA > NC_000913/3496340‑3496518
|
aGGCAAACGCGTGGTGCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATccc > 1:1925400/1‑93 (MQ=255)
aGGCAAACGCGTGGTGCGGCGGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATccc < 1:4346278/93‑1 (MQ=255)
ggCAAACGCGTGGTGCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCg > 1:4242987/1‑93 (MQ=255)
ggCAAACGCGTGGTGCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCg > 2:5677085/1‑93 (MQ=255)
gCAAACGCGTGGTGCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGt > 2:851155/1‑93 (MQ=255)
aaaCGCGTGGTGCGGCTTAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTtc < 1:4417564/93‑1 (MQ=255)
aaaCGCGTGGTGCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTtc > 1:3330247/1‑93 (MQ=255)
aaaCGCGTGGTGCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTtc < 2:759447/93‑1 (MQ=255)
aaaCGCGTGGTGCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTtc < 2:5707586/93‑1 (MQ=255)
aaCGCGTGGTGCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTtct > 2:90472/1‑93 (MQ=255)
aCGCGTGGTGCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTtctc < 1:3291835/93‑1 (MQ=255)
aCGCGTGGTGCCGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTtctc < 1:2056506/93‑1 (MQ=255)
cgTGGTGCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCggt < 1:6680962/93‑1 (MQ=255)
tggtgCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCggtgg > 1:6341332/1‑93 (MQ=255)
tggtgCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCggtgg > 2:5574414/1‑93 (MQ=255)
ggtgCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCggtggt > 2:3766627/1‑93 (MQ=255)
ggtgCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCggtggt > 1:5918715/1‑93 (MQ=255)
gtgCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGtt > 1:1656201/1‑93 (MQ=255)
cGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCg < 1:5315802/93‑1 (MQ=255)
ggCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCgg > 1:3149346/1‑93 (MQ=255)
tGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGGGCAACGCGGGCATCCCGTTCTCGGTGGTTCCggggt > 1:6146350/1‑91 (MQ=255)
gAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTAt < 2:4353005/93‑1 (MQ=255)
aaGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTa > 1:5216656/1‑93 (MQ=255)
aGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTAc < 2:4207657/93‑1 (MQ=255)
ggCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCa > 2:5389419/1‑93 (MQ=255)
ggCGATCCGGTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCa < 2:259806/93‑1 (MQ=255)
cGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGc < 1:5786875/93‑1 (MQ=255)
tCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTc > 2:3388713/1‑93 (MQ=255)
tCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTc < 1:4973611/93‑1 (MQ=255)
tCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTc < 1:2475201/93‑1 (MQ=255)
tCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTc > 1:2361219/1‑93 (MQ=255)
ccGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCt < 2:5820797/93‑1 (MQ=255)
cGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTg > 1:3773682/1‑93 (MQ=255)
cGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTg < 2:1838164/93‑1 (MQ=255)
gTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTgg > 2:2974199/1‑93 (MQ=255)
gTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTgg > 2:2842811/1‑93 (MQ=255)
tttATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGt > 1:6103851/1‑93 (MQ=255)
tttATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGt < 2:1090302/93‑1 (MQ=255)
tttATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGt < 2:2756276/93‑1 (MQ=255)
aTTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGc < 1:2235161/93‑1 (MQ=255)
aTTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGc < 2:3879302/93‑1 (MQ=255)
aTTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGc < 2:682281/93‑1 (MQ=255)
tttttGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGct > 2:2922661/1‑93 (MQ=255)
ttGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTg < 1:1444986/93‑1 (MQ=255)
ttGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTg < 2:6290662/93‑1 (MQ=255)
ggCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGcc < 2:3176117/93‑1 (MQ=255)
cGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACTCTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTAt < 1:227525/93‑1 (MQ=255)
cGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTAt < 1:6347789/93‑1 (MQ=255)
gtggtgGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTAtt < 2:2005120/93‑1 (MQ=255)
tggtggCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTc > 2:3260625/1‑93 (MQ=255)
tggtggCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTc < 2:4479287/93‑1 (MQ=255)
tggtggCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTc > 1:1021895/1‑93 (MQ=255)
tggtggCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTc > 2:4724921/1‑93 (MQ=255)
tggCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCggg < 1:4711420/93‑1 (MQ=255)
ggCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGt < 1:6495055/93‑1 (MQ=255)
gCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTa < 2:4996728/93‑1 (MQ=255)
cGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTAt < 2:2055539/93‑1 (MQ=255)
gAAGAGCTGTAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTAtt < 1:4816460/93‑1 (MQ=255)
gAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTAtt > 2:4607026/1‑93 (MQ=255)
gAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTAtt > 1:5585378/1‑93 (MQ=255)
aaGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTc > 1:5111011/1‑93 (MQ=255)
aaGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTc < 2:6261358/93‑1 (MQ=255)
agagCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTcc < 2:47990/93‑1 (MQ=255)
agagCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTcc < 2:2494451/93‑1 (MQ=255)
agagCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTcc > 1:2708851/1‑93 (MQ=255)
agCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCAc < 2:3005108/93‑1 (MQ=255)
cTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTc < 2:1266545/93‑1 (MQ=255)
cTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTc < 1:2184541/93‑1 (MQ=255)
cTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTc > 2:3429552/1‑93 (MQ=255)
tGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCa < 2:4037702/93‑1 (MQ=255)
ggAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCAc < 1:252211/93‑1 (MQ=255)
ggAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCAc < 1:2022496/93‑1 (MQ=255)
aaaCACTGTGCAACCCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGc < 1:1702006/93‑1 (MQ=255)
acacTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCAt < 1:2833567/93‑1 (MQ=255)
acacTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCAt > 1:5061578/1‑93 (MQ=255)
cacTGTGCAACGCTGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATc < 2:270910/93‑1 (MQ=255)
cacTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATc < 2:4779094/93‑1 (MQ=255)
cacTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATc < 1:3390368/93‑1 (MQ=255)
acTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATcg > 1:973817/1‑93 (MQ=255)
acTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATcg > 1:748523/1‑93 (MQ=255)
tgtgCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCCCGCATcgcg > 2:4931675/1‑93 (MQ=255)
tgtgCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATcgcg > 2:3509931/1‑93 (MQ=255)
gtgCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGa < 1:1783318/93‑1 (MQ=255)
tgCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGAt > 2:5193434/1‑93 (MQ=255)
ggCAACGCGCGTATCCGGTTCTCGGTGGTGCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCCCTCACGCATCGCGAt < 1:796187/92‑1 (MQ=255)
gCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGAtt < 1:5397408/93‑1 (MQ=255)
cAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTa < 1:6440583/93‑1 (MQ=255)
cAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTa < 2:5554804/93‑1 (MQ=255)
aaCGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTAt < 2:2541162/93‑1 (MQ=255)
aCGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATg > 2:219557/1‑93 (MQ=255)
gcgGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGcc < 1:1325982/93‑1 (MQ=255)
cgGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGccc > 1:5642797/1‑93 (MQ=255)
cgGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGccc < 2:6191271/93‑1 (MQ=255)
gggTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCa > 1:1212894/1‑93 (MQ=255)
gggTATCCCGTGCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCa < 2:3539785/93‑1 (MQ=255)
ggTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCag > 1:4548936/1‑93 (MQ=255)
gTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCaga < 1:687230/93‑1 (MQ=255)
gTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCaga > 2:5911227/1‑93 (MQ=255)
gTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCaga > 1:5480872/1‑93 (MQ=255)
gTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCaga < 2:6623528/93‑1 (MQ=255)
|
AGGCAAACGCGTGGTGCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATTCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGA > NC_000913/3496340‑3496518
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
AAAGGCAAACGCGTGGTGCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATTCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTA > NC_000913/3496338‑3496523
|
AAAGGCAAACGCGTGGTGCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCC > SRR4302536.6214736/1‑94 (MQ=60)
AAGGCAAACGCGTGGTGCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCC > SRR4302536.1983329/1‑94 (MQ=60)
AGGCAAACGCGTGGTGCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCG < SRR4302536.6914178/94‑1 (MQ=60)
AGGCAAACGCGTGGTGCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCG > SRR4302536.4369337/1‑94 (MQ=60)
AGGCAAACGCGTGGTGCGGCGGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCG < SRR4302536.4476377/94‑1 (MQ=60)
gagACGCGTGGGGCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTC < SRR4302536.2639106/91‑1 (MQ=60)
CAAACGCGTGGTGCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTC > SRR4302536.3428806/1‑94 (MQ=60)
AAACGCGTGGTGCGGCTTAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCT < SRR4302536.4549809/94‑1 (MQ=60)
AAACGCGTGGTGCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCT > SRR4302536.2098972/1‑94 (MQ=60)
ACGCGTGGTGCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCG < SRR4302536.840605/94‑1 (MQ=60)
ACGCGTGGTGCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCG < SRR4302536.3388744/94‑1 (MQ=60)
ACGCGTGGTGCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCG < SRR4302536.6168351/94‑1 (MQ=60)
ACGCGTGGTGCCGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCG < SRR4302536.2118441/94‑1 (MQ=60)
CGCGTGGTGCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGG > SRR4302536.2869172/1‑94 (MQ=60)
CGTGGTGCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTG < SRR4302536.6879419/94‑1 (MQ=60)
GTGGTGCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGG > SRR4302536.6530243/1‑94 (MQ=60)
TGGTGCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGT > SRR4302536.6095012/1‑94 (MQ=60)
GGTGCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTT > SRR4302536.1704309/1‑94 (MQ=60)
GGTGCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTT < SRR4302536.2772843/94‑1 (MQ=60)
GGTGCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTT > SRR4302536.2541037/1‑94 (MQ=60)
GCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCG < SRR4302536.5476274/94‑1 (MQ=60)
CGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGG > SRR4302536.3241571/1‑94 (MQ=60)
CGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGG < SRR4302536.5474565/94‑1 (MQ=60)
GCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGT < SRR4302536.4679539/94‑1 (MQ=60)
CTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTA > SRR4302536.5701896/1‑94 (MQ=60)
CTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGGGCAACGCGGGCATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGgt > SRR4302536.6329470/1‑92 (MQ=60)
TGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTAT > SRR4302536.6532896/1‑94 (MQ=60)
TGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTAT > SRR4302536.1496252/1‑94 (MQ=60)
GAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATT < SRR4302536.5438668/94‑1 (MQ=60)
GAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATT < SRR4302536.2001378/94‑1 (MQ=60)
AAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTA > SRR4302536.5372115/1‑94 (MQ=60)
AGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACC > SRR4302536.3412211/1‑94 (MQ=60)
AGCTGGCGATGCGTTTATTTTGGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAGCTCTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTggccggtattgcc < SRR4302536.6002739/94‑14 (MQ=60)
GGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCG < SRR4302536.4849351/94‑1 (MQ=60)
GGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCG < SRR4302536.1000136/94‑1 (MQ=60)
GGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCG < SRR4302536.1746937/94‑1 (MQ=60)
CGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCT < SRR4302536.5959138/94‑1 (MQ=60)
CGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCT < SRR4302536.2479455/94‑1 (MQ=60)
CGATCCGTTTATTTGTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGAATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGGATTACCGCAGCT > SRR4302536.3486257/1‑94 (MQ=60)
GATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTT > SRR4302536.231165/1‑94 (MQ=60)
GATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTT < SRR4302536.2164951/94‑1 (MQ=60)
GATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTT < SRR4302536.4501103/94‑1 (MQ=60)
GATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTT < SRR4302536.1786130/94‑1 (MQ=60)
GATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTT > SRR4302536.2025081/1‑94 (MQ=60)
GATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTT > SRR4302536.6616323/1‑94 (MQ=60)
ATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTC > SRR4302536.2432808/1‑94 (MQ=60)
TCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCT < SRR4302536.5762740/94‑1 (MQ=60)
TCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCT < SRR4302536.5873038/94‑1 (MQ=60)
TCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCT < SRR4302536.2549919/94‑1 (MQ=60)
TCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCT < SRR4302536.5122997/94‑1 (MQ=60)
TCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCT < SRR4302536.6701250/94‑1 (MQ=60)
CCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTG > SRR4302536.74569/1‑94 (MQ=60)
CCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTG > SRR4302536.3886320/1‑94 (MQ=60)
CGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGG > SRR4302536.75481/1‑94 (MQ=60)
GTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGT > SRR4302536.6285834/1‑94 (MQ=60)
GTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGGTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGT > SRR4302536.6433299/1‑94 (MQ=60)
TTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTT < SRR4302536.5259375/94‑1 (MQ=60)
TATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGC < SRR4302536.3973762/94‑1 (MQ=60)
TATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGC > SRR4302536.6461044/1‑94 (MQ=60)
ATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCT < SRR4302536.2302762/94‑1 (MQ=60)
ATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCT < SRR4302536.226937/94‑1 (MQ=60)
TTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTG > SRR4302536.2561734/1‑94 (MQ=60)
TTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGC < SRR4302536.1487814/94‑1 (MQ=60)
TGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGATCCGGGTGCTACAGCAGATTGTGTTTGCTCTGCC > SRR4302536.1648398/1‑94 (MQ=60)
GCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTA > SRR4302536.3727612/1‑94 (MQ=60)
CCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTAT > SRR4302536.2303447/1‑94 (MQ=60)
CCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTAT < SRR4302536.1553927/94‑1 (MQ=60)
CGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACTCTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATT < SRR4302536.233570/94‑1 (MQ=60)
CGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATT > SRR4302536.1260981/1‑94 (MQ=60)
CGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATT < SRR4302536.6536876/94‑1 (MQ=60)
CGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATT > SRR4302536.4908522/1‑94 (MQ=60)
GTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTC > SRR4302536.1052151/1‑94 (MQ=60)
GTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTC > SRR4302536.1317576/1‑94 (MQ=60)
TGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGCTGCTCTGCCTCTTCG > SRR4302536.5701269/1‑94 (MQ=60)
GTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGG > SRR4302536.5303834/1‑94 (MQ=60)
TGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGT < SRR4302536.4853136/94‑1 (MQ=60)
TGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGT < SRR4302536.5187255/94‑1 (MQ=60)
TGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGT > SRR4302536.3348259/1‑94 (MQ=60)
GGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTA < SRR4302536.6688701/94‑1 (MQ=60)
CGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATT > SRR4302536.5751541/1‑94 (MQ=60)
CGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATT > SRR4302536.6020044/1‑94 (MQ=60)
CGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATT > SRR4302536.3407157/1‑94 (MQ=60)
GAAGAGCTGTAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTC < SRR4302536.4961406/94‑1 (MQ=60)
GAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTC > SRR4302536.5263746/1‑94 (MQ=60)
GAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCCGGTATTC > SRR4302536.6280491/1‑94 (MQ=60)
AAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCC > SRR4302536.4619051/1‑94 (MQ=60)
AAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCC < SRR4302536.6673365/94‑1 (MQ=60)
AAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCC > SRR4302536.2789666/1‑94 (MQ=60)
AGCTTGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACT < SRR4302536.242239/94‑1 (MQ=60)
AGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACT > SRR4302536.4379570/1‑94 (MQ=60)
AGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACT > SRR4302536.4390121/1‑94 (MQ=60)
CTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCA < SRR4302536.2250391/94‑1 (MQ=60)
TGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCAC < SRR4302536.5527298/94‑1 (MQ=60)
TGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCAC > SRR4302536.3545793/1‑94 (MQ=60)
GGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACG < SRR4302536.2083386/94‑1 (MQ=60)
GGAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACG < SRR4302536.258942/94‑1 (MQ=60)
GAAACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGC > SRR4302536.1754094/1‑94 (MQ=60)
AAACACTGTGCAACCCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCA < SRR4302536.1751262/94‑1 (MQ=60)
AACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCAT > SRR4302536.5213182/1‑94 (MQ=60)
AACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCAT < SRR4302536.1956936/94‑1 (MQ=60)
AACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCAT > SRR4302536.6564653/1‑94 (MQ=60)
AACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCAT < SRR4302536.3129014/94‑1 (MQ=60)
AACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCAT > SRR4302536.5353168/1‑94 (MQ=60)
AACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCAT < SRR4302536.4927383/94‑1 (MQ=60)
ACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATC < SRR4302536.313378/94‑1 (MQ=60)
ACACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATC < SRR4302536.2917435/94‑1 (MQ=60)
CACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCG > SRR4302536.1002553/1‑94 (MQ=60)
CACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCG > SRR4302536.770510/1‑94 (MQ=60)
CACTGTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCG < SRR4302536.3491203/94‑1 (MQ=60)
GTGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGAT < SRR4302536.1837218/94‑1 (MQ=60)
TGCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATT < SRR4302536.5869799/94‑1 (MQ=60)
GGCAACGCGCGTATCCGGTTCTCGGTGGTGCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCCCTCACGCATCGCGATT < SRR4302536.819513/94‑1 (MQ=60)
GCAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTA < SRR4302536.5558592/94‑1 (MQ=60)
CAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGGTCTGCCTATTCTGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTAT > SRR4302536.2170850/1‑94 (MQ=60)
CAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTAT < SRR4302536.6633032/94‑1 (MQ=60)
CAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATAGCGATTAT < SRR4302536.5564085/94‑1 (MQ=60)
CAACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCGGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTAG > SRR4302536.6833593/1‑94 (MQ=60)
AACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATG < SRR4302536.6307621/94‑1 (MQ=60)
AACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATG > SRR4302536.5202714/1‑94 (MQ=60)
AACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATG < SRR4302536.1143538/94‑1 (MQ=60)
AACGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATG < SRR4302536.5015246/94‑1 (MQ=60)
GCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCC < SRR4302536.1365551/94‑1 (MQ=60)
GCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCC > SRR4302536.5810445/1‑94 (MQ=60)
GCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCC < SRR4302536.1460022/94‑1 (MQ=60)
CGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCTCTCACGCATCGCGATTATGCCCA < SRR4302536.6574210/94‑1 (MQ=60)
CGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCA > SRR4302536.1249328/1‑94 (MQ=60)
CGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCA < SRR4302536.784470/94‑1 (MQ=60)
GGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAG > SRR4302536.4685363/1‑94 (MQ=60)
GGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGA > SRR4302536.5644538/1‑94 (MQ=60)
GTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAG < SRR4302536.707347/94‑1 (MQ=60)
ATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCATCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCG > SRR4302536.5082862/1‑94 (MQ=60)
TCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGT > SRR4302536.4619346/1‑94 (MQ=60)
CCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTA < SRR4302536.5079271/94‑1 (MQ=60)
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AAAGGCAAACGCGTGGTGCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATTCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTA > NC_000913/3496338‑3496523
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
