Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1624 |
250.6 |
12620048 |
98.0% |
12367647 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,786,415 |
A→G |
T230A (ACG→GCG) |
b3614 → |
hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,786,415 | 0 | A | G | 99.6%
| 874.9
/ ‑5.2
| 270 | T230A (ACG→GCG) | b3614 | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); new base G (144/125); total (145/125) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.63e-01 |
Only 100 of 280 total aligned reads displayed.
CGCAACGGTTCGACCATTGCCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTACGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGCCTGATGCACCGCGTAAT > NC_000913/3786325‑3786504
|
cGCAACGGTTCGACCATTGCCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCg < 1:2149751/93‑1 (MQ=255)
gCAACGGTTCGACCATTGCCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACTCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTgcgc > 1:6041805/1‑93 (MQ=255)
gCAACGGTTCGACCATTGCCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTgcgc < 2:2717250/93‑1 (MQ=255)
aaCGGTTCGACCATTGCCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTg > 2:5681553/1‑93 (MQ=255)
aaCGGTTCGACCATTGCCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTg > 2:4446563/1‑93 (MQ=255)
aCGGTTCGACCATTGCCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGCCATTGCGCTgg > 2:3548438/1‑93 (MQ=255)
aCGGTTCGACCATTGCCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTgg > 2:745727/1‑93 (MQ=255)
aCGGTTCGACCATTGCCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTgg > 1:1243702/1‑93 (MQ=255)
aCGGTTCGACCATTGCCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTgg < 2:5992689/93‑1 (MQ=255)
cGGTTCGACCATTGCCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGt < 2:1752577/93‑1 (MQ=255)
cGGTTCGACCATTGCCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGt < 1:3437627/93‑1 (MQ=255)
ggTTCGACCATTGCCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTg > 1:4322441/1‑93 (MQ=255)
ggTTCGACCATTGCCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTg < 1:3972528/93‑1 (MQ=255)
ggTTCGACCATTGCCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTg > 2:5061478/1‑93 (MQ=255)
tggacattgccattgGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAg < 1:3390967/89‑1 (MQ=255)
gACCATTGCCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGc > 2:1023567/1‑93 (MQ=255)
gACCATTGCCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGc > 2:1058670/1‑93 (MQ=255)
aCCATTGCCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGcc < 2:48337/93‑1 (MQ=255)
aCCATTGCCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGcc > 2:5047176/1‑93 (MQ=255)
ccattgccattgGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCca < 1:3919683/93‑1 (MQ=255)
cattgccattgGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCcag < 1:879831/93‑1 (MQ=255)
attgccattgGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCcagc > 1:5505437/1‑93 (MQ=255)
attgccattgGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCcagc < 2:4199038/93‑1 (MQ=255)
attgccattgGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCcagc > 2:5323102/1‑93 (MQ=255)
ttgccattgGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCcagca > 1:2371438/1‑93 (MQ=255)
gccattgGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCagcagc < 2:2933218/93‑1 (MQ=255)
ccattgGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCt < 1:2744583/93‑1 (MQ=255)
cattgGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCtt > 2:1394960/1‑93 (MQ=255)
cattgGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCtt > 2:5942630/1‑93 (MQ=255)
attgGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTg > 2:3148400/1‑93 (MQ=255)
ttgGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGc < 1:5147125/93‑1 (MQ=255)
gCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCtgaa < 1:4180363/93‑1 (MQ=255)
cATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCtgaat < 2:3667539/93‑1 (MQ=255)
aTCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCtgaatg < 2:2426164/93‑1 (MQ=255)
tCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCtgaatga < 1:2015797/93‑1 (MQ=255)
tCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCtgaatga > 1:6146455/1‑93 (MQ=255)
cTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAAc < 2:874318/93‑1 (MQ=255)
tCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAAcc > 1:1107768/1‑93 (MQ=255)
tCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAAcc > 2:1489429/1‑93 (MQ=255)
cACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCg > 1:5211545/1‑93 (MQ=255)
aCCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGc < 2:3484975/93‑1 (MQ=255)
cccTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCa < 1:4275389/93‑1 (MQ=255)
ccTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAg > 1:4708577/1‑93 (MQ=255)
ccTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAg < 2:3235862/93‑1 (MQ=255)
tGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGt > 1:3597000/1‑93 (MQ=255)
gCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGtt < 1:4862465/93‑1 (MQ=255)
aaCGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGa > 2:5432263/1‑93 (MQ=255)
cGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATa > 1:978918/1‑93 (MQ=255)
gTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACt < 1:3477728/93‑1 (MQ=255)
tACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACtt > 2:2166805/1‑93 (MQ=255)
tACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACtt < 1:5858628/93‑1 (MQ=255)
aCGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTc > 1:3253016/1‑93 (MQ=255)
gcgTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTa > 1:3025477/1‑93 (MQ=255)
gcgTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTa < 1:5232786/93‑1 (MQ=255)
cgTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTac < 1:1310094/93‑1 (MQ=255)
gtgtTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTaca > 1:3872730/1‑93 (MQ=255)
gtgtTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTaca > 1:3227517/1‑93 (MQ=255)
tgtTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTacac < 2:5593550/93‑1 (MQ=255)
tgtTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTacac > 2:3042103/1‑93 (MQ=255)
tgtTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTacac < 1:761689/93‑1 (MQ=255)
gtTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACAcc < 1:3172479/93‑1 (MQ=255)
ttGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACAccg > 2:6039580/1‑93 (MQ=255)
tGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACAccgc < 2:3346310/93‑1 (MQ=255)
gCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACAccgcc < 2:456482/93‑1 (MQ=255)
cAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACAccgccg > 1:3817182/1‑93 (MQ=255)
aaCAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACTTTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGa > 2:3806550/1‑93 (MQ=255)
cAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGaaa > 1:1762686/1‑93 (MQ=255)
aGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGaaaa > 2:2315058/1‑93 (MQ=255)
aGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGaaaa > 1:1977499/1‑93 (MQ=255)
gATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGaaaaa < 1:2890984/93‑1 (MQ=255)
gATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGaaaaa > 1:5942983/1‑93 (MQ=255)
gATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGaaaaa > 2:5535357/1‑93 (MQ=255)
gATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGaaaaa < 2:1659189/93‑1 (MQ=255)
aTGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAAc < 2:2052908/93‑1 (MQ=255)
ggTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGc < 2:1279345/93‑1 (MQ=255)
ggTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGc < 1:2580328/93‑1 (MQ=255)
ttATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCtgt > 1:439278/1‑93 (MQ=255)
ttATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCtgt < 2:2661850/93‑1 (MQ=255)
ttATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCtgt < 2:4645995/93‑1 (MQ=255)
taACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGcc < 1:5683206/93‑1 (MQ=255)
aaCCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGCCt < 2:2987279/93‑1 (MQ=255)
aCCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGCCTg < 1:589482/93‑1 (MQ=255)
ccTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGCCTGa > 1:5760576/1‑93 (MQ=255)
ccTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGCCTGa < 1:1069156/93‑1 (MQ=255)
ccTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGCCTGa < 1:3519215/93‑1 (MQ=255)
cTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAACAACGCTGTGCCTGAt > 2:4930185/1‑93 (MQ=255)
cTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGCCTGAt > 1:1812573/1‑93 (MQ=255)
ccgccAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGCCTGATGCa < 2:4143964/93‑1 (MQ=255)
cgccAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGCCTGATGCAc < 2:3932930/93‑1 (MQ=255)
cgccAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGCCTGATGCAc > 2:211925/1‑93 (MQ=255)
gccAGTCATTGCGCTGGGGAAAGCCAGTAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGCTGATACGTCTACACTGCCGAAAAACGCTGTGCCTGACGCAcc > 2:6304284/1‑93 (MQ=255)
gccAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGCCTGATGCAcc > 1:2311857/1‑93 (MQ=255)
ccAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATCAACCGCAGGTTGAGACTTCTACACCGCCGAAAAAAGCTGTGCCTGATGCACcg > 1:374841/1‑93 (MQ=255)
cAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGCCTGATGCACcgc < 1:3671925/93‑1 (MQ=255)
aGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGCCTGATGCACcgcg > 2:1925536/1‑93 (MQ=255)
gACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGCCTGATGCACCGCGt > 2:5079645/1‑93 (MQ=255)
gACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGCCTGATGCACCGCGt > 2:5179323/1‑93 (MQ=255)
gACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGCCTGATGCACCGCGt > 1:6235284/1‑93 (MQ=255)
aCATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGCCTGATGCACCGCGTa > 2:5835969/1‑93 (MQ=255)
aCATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGCCTGATGCACCGCGTa > 2:2872625/1‑93 (MQ=255)
|
CGCAACGGTTCGACCATTGCCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTACGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGCCTGATGCACCGCGTAAT > NC_000913/3786325‑3786504
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CGTCGCAACGGTTCGACCATTGCCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTACGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGCCTGATGCACCGCGTAATCC > NC_000913/3786322‑3786506
|
CGTCGCAACGGTTCGACCATTGCCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTG > SRR4302533.2476449/1‑94 (MQ=60)
CGTCGCAACGGTTCGACCATTGCCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTG < SRR4302533.1230924/94‑1 (MQ=60)
CGTCGCAACGGTTCGACCATTGCCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTG > SRR4302533.3030144/1‑94 (MQ=60)
CGTCGCAACGGTTCGACCATTGCCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTG < SRR4302533.3106560/94‑1 (MQ=60)
GTCGCAACGGTTCGACCATTGCCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGC > SRR4302533.215041/1‑94 (MQ=60)
GTCGCAACGGTTCGACCATTGCCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGC > SRR4302533.1203952/1‑94 (MQ=60)
CGCAACGGTTCGACCATTGCCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACTCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGC > SRR4302533.6078415/1‑94 (MQ=60)
CGCAACGGTTCGACCATTGCCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGC < SRR4302533.2162989/94‑1 (MQ=60)
CGCAACGGTTCGACCATTGCCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGC > SRR4302533.2193123/1‑94 (MQ=60)
CGCAACGGTTCGACCATTGCCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGC > SRR4302533.1267682/1‑94 (MQ=60)
TAACGGTTCGACCATTGCCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTG < SRR4302533.528550/94‑1 (MQ=60)
CAACGGTTCGACCATTGCCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTG > SRR4302533.2331833/1‑94 (MQ=60)
AACGGTTCGACCATTGCCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGG < SRR4302533.841633/94‑1 (MQ=60)
AACGGTTCGACCATTGCCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGG > SRR4302533.1251130/1‑94 (MQ=60)
AACGGTTCGACCATTGCCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTACAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGG > SRR4302533.6210020/1‑94 (MQ=60)
ACGGTTCGACCATTGCCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGT < SRR4302533.4099882/94‑1 (MQ=60)
CGGTTCGACCATTGCCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTG > SRR4302533.4348471/1‑94 (MQ=60)
CGGTTCGACCATTGCCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTG < SRR4302533.3458859/94‑1 (MQ=60)
GGTTCGACCATTGCCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGA < SRR4302533.3996719/94‑1 (MQ=60)
GTTCGACCATTGCCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAA < SRR4302533.1415861/94‑1 (MQ=60)
TTCGACCATTGCCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAA > SRR4302533.6027621/1‑94 (MQ=60)
TCGACCATTGCCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAG < SRR4302533.65209/94‑1 (MQ=60)
tggaCATTGCCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGC < SRR4302533.3411908/90‑1 (MQ=60)
GACCATTGCCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCC > SRR4302533.386339/1‑94 (MQ=60)
GACCATTGCCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCC > SRR4302533.4565795/1‑94 (MQ=60)
GACCATTGCCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCC > SRR4302533.2132468/1‑94 (MQ=60)
ACCATTGCCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCA < SRR4302533.3332634/94‑1 (MQ=60)
ACCATTGCCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCA > SRR4302533.4109138/1‑94 (MQ=60)
ACCATTGCCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCA > SRR4302533.380676/1‑94 (MQ=60)
CCATTGCCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAG > SRR4302533.363400/1‑94 (MQ=60)
CCATTGCCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAG < SRR4302533.3943620/94‑1 (MQ=60)
CATTGCCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGC < SRR4302533.884995/94‑1 (MQ=60)
CATTGCCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGC > SRR4302533.5538657/1‑94 (MQ=60)
CATTGCCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGC > SRR4302533.179812/1‑94 (MQ=60)
CATTGCCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGC > SRR4302533.2013880/1‑94 (MQ=60)
ATTGCCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCA > SRR4302533.3604696/1‑94 (MQ=60)
ATTGCCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCA > SRR4302533.2386111/1‑94 (MQ=60)
TTGCCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAG < SRR4302533.2825175/94‑1 (MQ=60)
GCCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCT > SRR4302533.3258293/1‑94 (MQ=60)
CCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTT < SRR4302533.2761407/94‑1 (MQ=60)
CCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTT < SRR4302533.5636339/94‑1 (MQ=60)
TTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCT < SRR4302533.5178228/94‑1 (MQ=60)
TGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTG < SRR4302533.3118882/94‑1 (MQ=60)
GCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAAT < SRR4302533.4205681/94‑1 (MQ=60)
CATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATG < SRR4302533.1774960/94‑1 (MQ=60)
ATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGA > SRR4302533.5692464/1‑94 (MQ=60)
ATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGA > SRR4302533.6183460/1‑94 (MQ=60)
TCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAA < SRR4302533.2028215/94‑1 (MQ=60)
CCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAAC < SRR4302533.150975/94‑1 (MQ=60)
CTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACC > SRR4302533.1114337/1‑94 (MQ=60)
CTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACC < SRR4302533.932430/94‑1 (MQ=60)
CTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACC > SRR4302533.4222380/1‑94 (MQ=60)
TCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCG < SRR4302533.2646580/94‑1 (MQ=60)
TCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCG < SRR4302533.528650/94‑1 (MQ=60)
TCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCG > SRR4302533.5242931/1‑94 (MQ=60)
TCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCG < SRR4302533.4335945/94‑1 (MQ=60)
CACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGC > SRR4302533.2198132/1‑94 (MQ=60)
CCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAG > SRR4302533.4737115/1‑94 (MQ=60)
CCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAG < SRR4302533.4301107/94‑1 (MQ=60)
CCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAG < SRR4302533.2550064/94‑1 (MQ=60)
CTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGT > SRR4302533.3619133/1‑94 (MQ=60)
CTGCAACGGTACGCGTG‑TGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTT < SRR4302533.5911655/94‑1 (MQ=60)
GCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTG < SRR4302533.4891936/94‑1 (MQ=60)
GCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTG > SRR4302533.5863449/1‑94 (MQ=60)
AACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGAT > SRR4302533.3560564/1‑94 (MQ=60)
ACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATA > SRR4302533.984659/1‑94 (MQ=60)
ACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATA > SRR4302533.5078344/1‑94 (MQ=60)
CGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATAC > SRR4302533.3722287/1‑94 (MQ=60)
GGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACT < SRR4302533.3290200/94‑1 (MQ=60)
GTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTT < SRR4302533.3499186/94‑1 (MQ=60)
GTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTT < SRR4302533.6162751/94‑1 (MQ=60)
TACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTC < SRR4302533.5181918/94‑1 (MQ=60)
TACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTC < SRR4302533.2351965/94‑1 (MQ=60)
TACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTC > SRR4302533.3273076/1‑94 (MQ=60)
TACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTC < SRR4302533.5894044/94‑1 (MQ=60)
TACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTC > SRR4302533.3271629/1‑94 (MQ=60)
ACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCT < SRR4302533.3774937/94‑1 (MQ=60)
CGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTA > SRR4302533.3043988/1‑94 (MQ=60)
GCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTAC < SRR4302533.5264256/94‑1 (MQ=60)
GCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTAC < SRR4302533.5251282/94‑1 (MQ=60)
CGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACA > SRR4302533.3247414/1‑94 (MQ=60)
CGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACA < SRR4302533.1317959/94‑1 (MQ=60)
CGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACA > SRR4302533.3896367/1‑94 (MQ=60)
TGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACC < SRR4302533.766171/94‑1 (MQ=60)
TGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACC > SRR4302533.1260592/1‑94 (MQ=60)
TGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACC < SRR4302533.4414400/94‑1 (MQ=60)
GTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCG < SRR4302533.3192009/94‑1 (MQ=60)
GTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCG < SRR4302533.4286226/94‑1 (MQ=60)
TTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGC > SRR4302533.3066201/1‑94 (MQ=60)
GCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCG > SRR4302533.3840522/1‑94 (MQ=60)
GCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCG < SRR4302533.6134294/94‑1 (MQ=60)
GCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCG > SRR4302533.3684976/1‑94 (MQ=60)
GCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCG < SRR4302533.957853/94‑1 (MQ=60)
AACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAA > SRR4302533.5260198/1‑94 (MQ=60)
AACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAA > SRR4302533.3934429/1‑94 (MQ=60)
AACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGGTGATACTTCTACACCGCCGAA > SRR4302533.3454041/1‑94 (MQ=60)
ACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAA > SRR4302533.991699/1‑94 (MQ=60)
ACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAA > SRR4302533.1773424/1‑94 (MQ=60)
CAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAA > SRR4302533.1989610/1‑94 (MQ=60)
AGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAA > SRR4302533.2787866/1‑94 (MQ=60)
AGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAA > SRR4302533.5978923/1‑94 (MQ=60)
GATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAAC > SRR4302533.1171443/1‑94 (MQ=60)
GATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAAC < SRR4302533.2908753/94‑1 (MQ=60)
ATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACG < SRR4302533.5764526/94‑1 (MQ=60)
GGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCT < SRR4302533.2596205/94‑1 (MQ=60)
GTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTG < SRR4302533.5023440/94‑1 (MQ=60)
GTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTG < SRR4302533.2912914/94‑1 (MQ=60)
GTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTG > SRR4302533.3954384/1‑94 (MQ=60)
TTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGT < SRR4302533.3974194/94‑1 (MQ=60)
TTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGT > SRR4302533.441897/1‑94 (MQ=60)
TTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTG > SRR4302533.5950428/1‑94 (MQ=60)
TTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTG < SRR4302533.1214365/94‑1 (MQ=60)
TTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTG > SRR4302533.990754/1‑94 (MQ=60)
ATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGCC > SRR4302533.4358419/1‑94 (MQ=60)
ATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGCC > SRR4302533.3462304/1‑94 (MQ=60)
ATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGCC > SRR4302533.3924290/1‑94 (MQ=60)
TAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGCCT < SRR4302533.5717536/94‑1 (MQ=60)
AACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGCCTG > SRR4302533.5724720/1‑94 (MQ=60)
AACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTATGCCTG > SRR4302533.3703387/1‑94 (MQ=60)
ACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGCCTGA > SRR4302533.5795336/1‑94 (MQ=60)
ACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGCCTGA < SRR4302533.592965/94‑1 (MQ=60)
CCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGCCTGAT < SRR4302533.1075451/94‑1 (MQ=60)
CCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGCCTGAT > SRR4302533.1110941/1‑94 (MQ=60)
CCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGCCTGAT > SRR4302533.1823643/1‑94 (MQ=60)
CCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGCCTGAT > SRR4302533.1999444/1‑94 (MQ=60)
CCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGCCTGAT < SRR4302533.270211/94‑1 (MQ=60)
CCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGCCTGAT < SRR4302533.3540911/94‑1 (MQ=60)
CCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGCCTGAT < SRR4302533.3462753/94‑1 (MQ=60)
CCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGCCTGAT > SRR4302533.2980950/1‑94 (MQ=60)
CTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGCCTGATG < SRR4302533.5990393/94‑1 (MQ=60)
TGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGCCTGATGC < SRR4302533.3247011/94‑1 (MQ=60)
GCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGCCTGATGCA > SRR4302533.5929752/1‑94 (MQ=60)
GCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGCCTGATGCA < SRR4302533.4578140/94‑1 (MQ=60)
CCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGCCTGATGCAC < SRR4302533.5956735/94‑1 (MQ=60)
CCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGCCTGATGCAC > SRR4302533.3420260/1‑94 (MQ=60)
CCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGCCTGATGCAC > SRR4302533.4783156/1‑94 (MQ=60)
CGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGCCTGATGCACC > SRR4302533.2326179/1‑94 (MQ=60)
GCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGCCTGATGCACCG > SRR4302533.840960/1‑94 (MQ=60)
GCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATCAACCGCAGGTTGAGACTTCTACACCGCCGAAAAAAGCTGTGCCTGATGCACCG > SRR4302533.377104/1‑94 (MQ=60)
CAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGCCTGATGCACCGCG < SRR4302533.3694493/94‑1 (MQ=60)
AGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGCCTGATGCACCGCGT > SRR4302533.6272618/1‑94 (MQ=60)
ACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGCCTGATGCACCGCGTAA > SRR4302533.3534852/1‑94 (MQ=60)
CATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGCCTGATGCACCGCGTAAT < SRR4302533.1853588/94‑1 (MQ=60)
CATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGCCTGATGCACCGCGCAAT > SRR4302533.662864/1‑94 (MQ=60)
ATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGCCTGATGCACCGCGTAATC > SRR4302533.6214021/1‑94 (MQ=60)
ATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGCCTGATGCACCGCGTAATC < SRR4302533.4751976/94‑1 (MQ=60)
ATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGCCTGATGCACCGCGTAATC < SRR4302533.2049642/94‑1 (MQ=60)
TTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGCCTGATGCACCGCGTAATCC < SRR4302533.1514536/94‑1 (MQ=60)
TTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGCCTGATGCACCGCGTAATCC < SRR4302533.4043072/94‑1 (MQ=60)
TTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGCCTGATGCACCGCGTAATCC < SRR4302533.4991577/94‑1 (MQ=60)
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CGTCGCAACGGTTCGACCATTGCCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTACGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGCCTGATGCACCGCGTAATCC > NC_000913/3786322‑3786506
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
