Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1624 |
250.6 |
12620048 |
98.0% |
12367647 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,929,460 |
T→C |
M173T (ATG→ACG) |
kup → |
low affinity potassium transport system |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,929,460 | 0 | T | C | 100.0%
| 844.8
/ NA
| 256 | M173T (ATG→ACG) | kup | low affinity potassium transport system |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (155/101); total (155/101) |
Only 100 of 260 total aligned reads displayed.
TAGTTCCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGGG > NC_000913/3929370‑3929549
|
tAGTTCCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGc > 2:413160/1‑93 (MQ=255)
tAGTTCCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGc < 2:5225722/93‑1 (MQ=255)
tAGTTCCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGc < 1:4175553/93‑1 (MQ=255)
aGTTCCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCt < 2:1459236/93‑1 (MQ=255)
gTTCCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTg > 2:3968330/1‑93 (MQ=255)
ttCCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGa < 1:5827284/93‑1 (MQ=255)
tCCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGAc > 1:3462985/1‑93 (MQ=255)
cccTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCt > 1:4100905/1‑93 (MQ=255)
ccTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTg > 2:6144435/1‑93 (MQ=255)
ccTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTg < 2:5573131/93‑1 (MQ=255)
ctctCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTgg > 1:2852726/1‑93 (MQ=255)
tctcAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGt > 1:712322/1‑93 (MQ=255)
tctcAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGt > 1:3187764/1‑93 (MQ=255)
cAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGtttt > 2:30765/1‑93 (MQ=255)
cAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGtttt > 1:1865624/1‑93 (MQ=255)
aaTTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGttttt > 2:3756879/1‑93 (MQ=255)
aaTTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGttttt > 2:1660884/1‑93 (MQ=255)
aaTTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGttttt > 2:6001791/1‑93 (MQ=255)
ttATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGa < 1:3680638/93‑1 (MQ=255)
ttATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGa > 1:1696267/1‑93 (MQ=255)
ttATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGa > 1:1188424/1‑93 (MQ=255)
ttATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGa > 2:3565956/1‑93 (MQ=255)
ttATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATCGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTgt > 1:1539827/1‑92 (MQ=255)
tATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGAt > 2:1177896/1‑93 (MQ=255)
tATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGGTTGCGCAGCTCACGCTGCCCTCGTTTTTGAt > 1:628670/1‑93 (MQ=255)
aTCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGAtt < 2:4779471/93‑1 (MQ=255)
cGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGGTTTTGATTCt > 2:5989927/1‑93 (MQ=255)
gTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTg < 2:1793965/93‑1 (MQ=255)
gTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTg > 1:2045647/1‑93 (MQ=255)
ttCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTgg > 1:3351533/1‑93 (MQ=255)
tctcACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGc < 1:5017397/93‑1 (MQ=255)
ctcACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCa < 2:2942535/93‑1 (MQ=255)
aCTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGa > 2:231031/1‑93 (MQ=255)
cTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGAc > 2:5322627/1‑93 (MQ=255)
tttATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACt > 1:3369012/1‑93 (MQ=255)
attattTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTggg < 2:5784109/93‑1 (MQ=255)
ttatttatGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTgggg > 2:4919368/1‑93 (MQ=255)
ttatttatGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTgggg > 2:700370/1‑93 (MQ=255)
ttatttatGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTgggg > 1:1150876/1‑93 (MQ=255)
ttatttatGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTgggg > 1:1058412/1‑93 (MQ=255)
ttatttatGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCACCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTgggg > 2:1629977/1‑93 (MQ=255)
atttatGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGtt > 1:5074825/1‑93 (MQ=255)
atttatGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGtt > 1:3138856/1‑93 (MQ=255)
tttatGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTa > 1:4618932/1‑93 (MQ=255)
tttatGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTa < 1:5464486/93‑1 (MQ=255)
ttatGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTAc > 1:3927623/1‑93 (MQ=255)
ttatGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGGTAc > 2:2400521/1‑93 (MQ=255)
gATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAg > 2:4677158/1‑93 (MQ=255)
aTTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGc < 2:4421740/93‑1 (MQ=255)
aTTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGc > 1:2661712/1‑93 (MQ=255)
ttCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCa > 2:1825333/1‑93 (MQ=255)
ttCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCa > 2:2209588/1‑93 (MQ=255)
tCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCat > 2:1319637/1‑93 (MQ=255)
tCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCat > 2:1425649/1‑93 (MQ=255)
tCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCat > 1:3718729/1‑93 (MQ=255)
cAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCatt > 2:4577110/1‑93 (MQ=255)
cAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCatt < 2:4602526/93‑1 (MQ=255)
aaaaaCATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCatta > 2:65036/1‑93 (MQ=255)
aaaaaCATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCatta > 2:2029404/1‑93 (MQ=255)
aaaaCATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCattat > 1:2191620/1‑93 (MQ=255)
aaaCATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCattatt < 2:2490320/93‑1 (MQ=255)
aaCATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTg < 2:808937/93‑1 (MQ=255)
cATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCt > 2:3222897/1‑93 (MQ=255)
tGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTaa > 1:5235324/1‑93 (MQ=255)
tGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTaa < 1:2380339/93‑1 (MQ=255)
tGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTaa > 1:4546593/1‑93 (MQ=255)
gCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAAcc < 2:3809669/93‑1 (MQ=255)
aCGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCg > 1:3629512/1‑93 (MQ=255)
aCGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGC‑GGGCTGGGGGTACGGAGCATTTTTTCTTAACCgg > 2:669590/1‑93 (MQ=255)
ggCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGa > 1:3104718/1‑93 (MQ=255)
cTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAg < 2:1252182/93‑1 (MQ=255)
cTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAg < 2:570628/93‑1 (MQ=255)
tATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGt < 2:790720/93‑1 (MQ=255)
tATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGt < 1:2468157/93‑1 (MQ=255)
tGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGtgc > 1:792175/1‑93 (MQ=255)
tGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGtgc > 1:1771900/1‑93 (MQ=255)
ggTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGtgct > 2:2005236/1‑93 (MQ=255)
gTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGtgctg > 2:2157316/1‑93 (MQ=255)
tCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGtgctgc > 2:540496/1‑93 (MQ=255)
ggTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCAt < 1:5544865/93‑1 (MQ=255)
ggTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCAt > 1:4357821/1‑93 (MQ=255)
aGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATgcgc < 1:1903201/93‑1 (MQ=255)
gCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCt > 2:2243759/1‑93 (MQ=255)
gCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCt < 1:751108/93‑1 (MQ=255)
gTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGaa < 2:2736796/93‑1 (MQ=255)
gcgcCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCa < 2:1109772/93‑1 (MQ=255)
cgcCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCaa < 1:2790612/93‑1 (MQ=255)
cgcCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCaa < 1:2686821/93‑1 (MQ=255)
gcCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAAt > 1:3410028/1‑93 (MQ=255)
ccGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAAtg < 1:5616247/93‑1 (MQ=255)
ccGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAAtg > 2:3308595/1‑93 (MQ=255)
cGATCACGCTGTCCTGGTTTTTGATGCTGGCAGGACTGAGATTACGTAGCATTATTGCTAGCCCGGAAGTGCTGCATGTGCTGAATCCAAtgt < 2:2355541/93‑1 (MQ=255)
cGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAAtgt > 1:2146407/1‑93 (MQ=255)
gATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAAtgtg > 1:108157/1‑93 (MQ=255)
gATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAAtgtg > 2:2658137/1‑93 (MQ=255)
aTCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTgg < 1:2444625/93‑1 (MQ=255)
aTCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTgg > 2:52861/1‑93 (MQ=255)
tCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTggg < 1:3495918/93‑1 (MQ=255)
tCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTggg < 1:3865764/93‑1 (MQ=255)
tCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTggg < 1:6091604/93‑1 (MQ=255)
|
TAGTTCCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGGG > NC_000913/3929370‑3929549
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GGATAGTTCCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGGGCGGT > NC_000913/3929367‑3929553
|
GGATAGTTCCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCAC < SRR4302533.746133/94‑1 (MQ=60)
GATAGTTCCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACG < SRR4302533.2084180/94‑1 (MQ=60)
TAGTTCCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCT < SRR4302533.4200854/94‑1 (MQ=60)
TAGTTCCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCT > SRR4302533.5335256/1‑94 (MQ=60)
AGTTCCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTG < SRR4302533.3475949/94‑1 (MQ=60)
AGTTCCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTG > SRR4302533.5547728/1‑94 (MQ=60)
TTCCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGAC > SRR4302533.3484362/1‑94 (MQ=60)
TTCCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGAC < SRR4302533.5862494/94‑1 (MQ=60)
TTCCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGAC < SRR4302533.733593/94‑1 (MQ=60)
CCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCT > SRR4302533.4125861/1‑94 (MQ=60)
CCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGG > SRR4302533.2870274/1‑94 (MQ=60)
CTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGT > SRR4302533.716528/1‑94 (MQ=60)
CTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGT > SRR4302533.1690319/1‑94 (MQ=60)
CTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGT > SRR4302533.3207375/1‑94 (MQ=60)
TCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTT > SRR4302533.1877002/1‑94 (MQ=60)
CAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTT > SRR4302533.430452/1‑94 (MQ=60)
CAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTT > SRR4302533.32549/1‑94 (MQ=60)
ATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGA > SRR4302533.22027/1‑94 (MQ=60)
ATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGA < SRR4302533.2629578/94‑1 (MQ=60)
ATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGA > SRR4302533.1195559/1‑94 (MQ=60)
ATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGA > SRR4302533.1706541/1‑94 (MQ=60)
ATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATCGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGT > SRR4302533.1549100/1‑94 (MQ=60)
TTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGAT < SRR4302533.3703256/94‑1 (MQ=60)
TTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGAT < SRR4302533.3126366/94‑1 (MQ=60)
TTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGGTTGCGCAGCTCACGCTGCCCTCGTTTTTGAT > SRR4302533.632367/1‑94 (MQ=60)
TATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATT > SRR4302533.1947425/1‑94 (MQ=60)
TATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATT < SRR4302533.5994067/94‑1 (MQ=60)
ATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTC < SRR4302533.6172370/94‑1 (MQ=60)
TCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTATTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCT < SRR4302533.1093296/94‑1 (MQ=60)
CGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTG > SRR4302533.2058258/1‑94 (MQ=60)
GTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGG > SRR4302533.3797719/1‑94 (MQ=60)
GTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGG > SRR4302533.3372236/1‑94 (MQ=60)
TTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGC < SRR4302533.6256361/94‑1 (MQ=60)
TCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCA < SRR4302533.5047791/94‑1 (MQ=60)
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CTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAG < SRR4302533.4484270/94‑1 (MQ=60)
CTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAG > SRR4302533.3195316/1‑94 (MQ=60)
CTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAG > SRR4302533.3834946/1‑94 (MQ=60)
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TCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGG > SRR4302533.355806/1‑94 (MQ=60)
ACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGAC > SRR4302533.4875177/1‑94 (MQ=60)
CTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACT < SRR4302533.3017656/94‑1 (MQ=60)
CTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACT > SRR4302533.3728511/1‑94 (MQ=60)
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CTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACT < SRR4302533.2480230/94‑1 (MQ=60)
CTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACT > SRR4302533.3389819/1‑94 (MQ=60)
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TTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTG < SRR4302533.2779163/94‑1 (MQ=60)
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TATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGG > SRR4302533.732796/1‑94 (MQ=60)
ATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGG < SRR4302533.3389508/94‑1 (MQ=60)
ATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGG > SRR4302533.1157771/1‑94 (MQ=60)
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TATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTT > SRR4302533.3158152/1‑94 (MQ=60)
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TTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCAT > SRR4302533.3741555/1‑94 (MQ=60)
TTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGCTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTATGTAGCAT > SRR4302533.5604175/1‑94 (MQ=60)
TCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATT > SRR4302533.3257663/1‑94 (MQ=60)
TCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGATACGTAGCATT > SRR4302533.5107820/1‑94 (MQ=60)
AAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTAT > SRR4302533.2205124/1‑94 (MQ=60)
AAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATT < SRR4302533.5204747/94‑1 (MQ=60)
AAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATT > SRR4302533.389909/1‑94 (MQ=60)
AAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTG > SRR4302533.2789641/1‑94 (MQ=60)
AAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTG > SRR4302533.3955654/1‑94 (MQ=60)
AACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGC > SRR4302533.3670895/1‑94 (MQ=60)
CATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTA > SRR4302533.4526743/1‑94 (MQ=60)
CATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTA > SRR4302533.1488610/1‑94 (MQ=60)
CATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTA > SRR4302533.313612/1‑94 (MQ=60)
ATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGTATTATTGCTAA > SRR4302533.3434205/1‑94 (MQ=60)
ATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAA > SRR4302533.4574127/1‑94 (MQ=60)
ATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAA > SRR4302533.5266803/1‑94 (MQ=60)
TGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAAC < SRR4302533.2395062/94‑1 (MQ=60)
CACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCG < SRR4302533.4107544/94‑1 (MQ=60)
CACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCG > SRR4302533.459633/1‑94 (MQ=60)
CACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCG > SRR4302533.3651845/1‑94 (MQ=60)
ACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGG < SRR4302533.1651287/94‑1 (MQ=60)
CGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGA > SRR4302533.3123804/1‑94 (MQ=60)
GCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAG < SRR4302533.5096774/94‑1 (MQ=60)
CTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGT > SRR4302533.886092/1‑94 (MQ=60)
TATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTG < SRR4302533.2483380/94‑1 (MQ=60)
ATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGC > SRR4302533.1782688/1‑94 (MQ=60)
ATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGC > SRR4302533.5296805/1‑94 (MQ=60)
ATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGC > SRR4302533.796836/1‑94 (MQ=60)
GGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTG > SRR4302533.236735/1‑94 (MQ=60)
GGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGAAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTG < SRR4302533.3403005/94‑1 (MQ=60)
GTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGC > SRR4302533.1906129/1‑94 (MQ=60)
GTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGC > SRR4302533.1136611/1‑94 (MQ=60)
TCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCA < SRR4302533.1865572/94‑1 (MQ=60)
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CGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCAT < SRR4302533.5632578/94‑1 (MQ=60)
GGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATG < SRR4302533.5578356/94‑1 (MQ=60)
GGTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATG > SRR4302533.1068009/1‑94 (MQ=60)
GTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGC > SRR4302533.2119637/1‑94 (MQ=60)
GTAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGC < SRR4302533.5684553/94‑1 (MQ=60)
TAAGCTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCG > SRR4302533.3716025/1‑94 (MQ=60)
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CTGTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGA > SRR4302533.4956085/1‑94 (MQ=60)
GTTTGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAAT > SRR4302533.2863033/1‑94 (MQ=60)
TGCGCCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCA < SRR4302533.3495888/94‑1 (MQ=60)
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CCGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGT < SRR4302533.5650197/94‑1 (MQ=60)
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CGATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTG > SRR4302533.108840/1‑94 (MQ=60)
GATCACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGG > SRR4302533.2124294/1‑94 (MQ=60)
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CACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGGGCG < SRR4302533.5488199/94‑1 (MQ=60)
CACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGGGCG < SRR4302533.5433793/94‑1 (MQ=60)
ACGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGGGCGG < SRR4302533.1956089/94‑1 (MQ=60)
CGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGGGCGGT < SRR4302533.5073359/94‑1 (MQ=60)
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GGATAGTTCCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGGGCGGT > NC_000913/3929367‑3929553
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
