Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1624 |
250.6 |
12620048 |
98.0% |
12367647 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,934,461 |
A→G |
P186P (CCA→CCG) |
rbsB → |
D‑ribose periplasmic binding protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,934,461 | 0 | A | G | 99.6%
| 767.9
/ ‑4.6
| 237 | P186P (CCA→CCG) | rbsB | D‑ribose periplasmic binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (121/115); minor base T (0/1); total (121/116) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.89e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.72e-01 |
Only 100 of 270 total aligned reads displayed.
CATTGCTGGTACATCCGCAGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCAGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGTTCAGGCTGTATTCGCGCAGAATGA > NC_000913/3934371‑3934550
|
cATTGCTGGTACATCCGCAGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCcagccagccggc < 1:2613394/93‑1 (MQ=255)
aTTGCTGGTACATCCGCAGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCcggca < 1:2567611/93‑1 (MQ=255)
aTTGCTGGTACATCCGCAGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCcggca < 1:275895/93‑1 (MQ=255)
aTTGCTGGTACATCCGCAGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCcggca < 2:1100749/93‑1 (MQ=255)
ttGCTGGTACATCCGCAGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCcggcag > 2:874370/1‑93 (MQ=255)
tGGTACATCCGCAGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGAttt > 1:4704072/1‑93 (MQ=255)
ggTACATCCGCAGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGAtttt > 2:4419695/1‑93 (MQ=255)
ggTACATCCGCAGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGAtttt < 2:5496384/93‑1 (MQ=255)
tACATCCGCAGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGa < 2:5396015/93‑1 (MQ=255)
tACATCCGCAGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGa < 1:5779198/93‑1 (MQ=255)
aCATCCGCAGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGAt > 2:1761000/1‑93 (MQ=255)
aCATCCGCAGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGAt < 1:1066009/93‑1 (MQ=255)
cATCCGCAGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATc > 2:6041711/1‑93 (MQ=255)
tCCGCAGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGc > 2:934514/1‑93 (MQ=255)
tCCGCAGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGc > 2:394809/1‑93 (MQ=255)
tCCGCAGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGc > 2:5984065/1‑93 (MQ=255)
gCAGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCAtt > 1:905329/1‑93 (MQ=255)
cAGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTCTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTa > 1:354408/1‑93 (MQ=255)
aGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTaa < 1:2197073/93‑1 (MQ=255)
aGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTaa > 1:4049223/1‑93 (MQ=255)
cccGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAg < 2:5718892/93‑1 (MQ=255)
cccGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAg > 1:4447769/1‑93 (MQ=255)
cGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGt < 1:768834/93‑1 (MQ=255)
cGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGt < 1:3047824/93‑1 (MQ=255)
gTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGtt > 1:298795/1‑93 (MQ=255)
gTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGtt < 1:5463884/93‑1 (MQ=255)
gTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGtt > 1:2899926/1‑93 (MQ=255)
tGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGttt < 2:2621301/93‑1 (MQ=255)
tGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGttt > 2:4884453/1‑93 (MQ=255)
aCGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGaa < 2:2743035/93‑1 (MQ=255)
aCGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGaa > 1:3853232/1‑93 (MQ=255)
gTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACg < 1:240532/93‑1 (MQ=255)
gTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACg > 1:4309016/1‑93 (MQ=255)
gTGGCGAAGGCTTCAAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACg > 2:3848630/1‑93 (MQ=255)
tGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGAATTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGt > 1:3070318/1‑93 (MQ=255)
ggCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTa > 1:2907197/1‑93 (MQ=255)
ggCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTa < 1:2030590/93‑1 (MQ=255)
gCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTaa < 2:2377543/93‑1 (MQ=255)
cGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAAt < 1:5133875/93‑1 (MQ=255)
gAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATg > 2:1447606/1‑93 (MQ=255)
aaGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGc > 1:5977171/1‑93 (MQ=255)
aaGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGc < 1:1294398/93‑1 (MQ=255)
aGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCa < 2:3715227/93‑1 (MQ=255)
ggCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAg > 2:479216/1‑93 (MQ=255)
ggCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAg < 1:5598689/93‑1 (MQ=255)
gCTTCCAGCAGGCCTTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGa < 2:2008397/93‑1 (MQ=255)
gCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGa < 1:5083137/93‑1 (MQ=255)
ttCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAAc < 2:860129/93‑1 (MQ=255)
tCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAAcc < 2:3656663/93‑1 (MQ=255)
tCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAAcc < 1:2789108/93‑1 (MQ=255)
ccAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGCTTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAAACt > 1:3606651/1‑93 (MQ=255)
ccAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGCACCt > 2:4620363/1‑93 (MQ=255)
ccAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCt > 1:3363279/1‑93 (MQ=255)
ccAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCt < 2:1253094/93‑1 (MQ=255)
cagcagGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTg > 1:5555603/1‑93 (MQ=255)
cagcagGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTg > 1:625470/1‑93 (MQ=255)
cagcagGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAACGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTg < 2:6187191/93‑1 (MQ=255)
agcagGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGt < 2:3182474/93‑1 (MQ=255)
agGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGa > 1:1928461/1‑93 (MQ=255)
agGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGa > 2:3004152/1‑93 (MQ=255)
agGCCGTTGCTGCTCACAAGTCTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGa < 2:354408/93‑1 (MQ=255)
ggCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGAc < 1:1549214/93‑1 (MQ=255)
ggCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGAc < 2:3133544/93‑1 (MQ=255)
gctgTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGATCCTGTTGAcc < 2:3244514/90‑1 (MQ=255)
cGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGATTGTACGTAATGCAGAACCAGTTGAACGc > 2:4308655/1‑93 (MQ=255)
ctgctCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATc < 2:1336919/93‑1 (MQ=255)
ctgctCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATc < 1:119206/93‑1 (MQ=255)
cggctCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATc < 2:21797/91‑1 (MQ=255)
tgctCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATcc < 2:6078593/93‑1 (MQ=255)
tgctCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATcc < 2:503188/93‑1 (MQ=255)
tgctCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATcc > 1:2934464/1‑93 (MQ=255)
tgctCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATcc < 2:1645032/93‑1 (MQ=255)
gctCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCg > 2:1638129/1‑93 (MQ=255)
ctCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCgg > 1:493810/1‑93 (MQ=255)
ctCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCgg > 1:5849675/1‑93 (MQ=255)
tCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGa < 2:5558233/93‑1 (MQ=255)
cacaAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGAt > 2:5269230/1‑93 (MQ=255)
acaAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCAGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATg < 2:4514717/93‑1 (MQ=255)
gTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCa < 1:3227318/93‑1 (MQ=255)
gTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCa < 1:1601242/93‑1 (MQ=255)
tttAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAg > 1:1483069/1‑93 (MQ=255)
ttAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAgg > 1:4113135/1‑93 (MQ=255)
ttAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAgg > 2:47537/1‑93 (MQ=255)
tAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCGTTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAGGc > 2:2543262/1‑93 (MQ=255)
aaTGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAGGCt < 2:1495007/93‑1 (MQ=255)
aaTGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAGGCt > 2:1586273/1‑93 (MQ=255)
aTGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAGGCTg < 2:5650831/93‑1 (MQ=255)
tGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAGGCTGt > 1:666824/1‑93 (MQ=255)
tGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAGGCTGt > 2:1862796/1‑93 (MQ=255)
ttGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAGGCTGTATTcg > 1:3451422/1‑93 (MQ=255)
tGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAGGCTGTATTcgc > 2:4185380/1‑93 (MQ=255)
gccagccagccgGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAGGCTGTATTcgcg > 2:4023686/1‑93 (MQ=255)
agccagccggcAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAGGCTGTATTCGCGCAg > 2:5781422/1‑93 (MQ=255)
agccagccggcAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAGGCTGTATTCGCGCAg > 2:2255074/1‑93 (MQ=255)
gccagccggcAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAGGCTGTATTCGCGCAGa > 2:2835893/1‑93 (MQ=255)
gccagccggcAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAGGCTGTATTCGCGCAGa > 1:6078646/1‑93 (MQ=255)
ccagccggcAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAGGCTGTATTCGCGCAGaa > 2:727058/1‑93 (MQ=255)
agccggcAGATTTTGATCGCATTAAAGGCTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAGGCTGTATTCGCGCAGAatg > 1:5936097/1‑93 (MQ=255)
gccggcAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAGGCTGTATTCGCGCAGAatga < 2:4116362/93‑1 (MQ=255)
gccggcAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAGGCTGTATTCGCGCAGAatga < 1:1354045/93‑1 (MQ=255)
|
CATTGCTGGTACATCCGCAGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCAGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGTTCAGGCTGTATTCGCGCAGAATGA > NC_000913/3934371‑3934550
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
AGGCATTGCTGGTACATCCGCAGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCAGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGTTCAGGCTGTATTCGCGCAGAATGATGAA > NC_000913/3934368‑3934554
|
AGGCATTGCTGGTACATCCGCAGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCG < SRR4302533.5179469/94‑1 (MQ=60)
GGCATTGCTGGTACATCCGCAGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGG < SRR4302533.6242151/94‑1 (MQ=60)
CATTGCTGGTACATCCGCAGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCA < SRR4302533.2629435/94‑1 (MQ=60)
ATTGCTGGTACATCCGCAGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAG < SRR4302533.2583413/94‑1 (MQ=60)
ATTGCTGGTACATCCGCAGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAG < SRR4302533.277574/94‑1 (MQ=60)
CTGGTACATCCGCAGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTT > SRR4302533.4732586/1‑94 (MQ=60)
CTGGTACATCCGCAGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTT > SRR4302533.2616685/1‑94 (MQ=60)
GGTACATCCGCAGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTG < SRR4302533.3615091/94‑1 (MQ=60)
TACATCCGCAGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGAT < SRR4302533.5814103/94‑1 (MQ=60)
TACATCCGCAGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGAT < SRR4302533.3509480/94‑1 (MQ=60)
TACATCCGCAGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGAT > SRR4302533.3105817/1‑94 (MQ=60)
TCATCCGCAGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATC < SRR4302533.2292368/94‑1 (MQ=60)
ACATCCGCAGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATC > SRR4302533.1975779/1‑94 (MQ=60)
ACATCCGCAGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATC < SRR4302533.1072271/94‑1 (MQ=60)
TCCGCAGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCA < SRR4302533.3427373/94‑1 (MQ=60)
CGCAGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATT > SRR4302533.910635/1‑94 (MQ=60)
GCAGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTCTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTA > SRR4302533.356568/1‑94 (MQ=60)
CAGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAA > SRR4302533.4073885/1‑94 (MQ=60)
AGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAA > SRR4302533.3089073/1‑94 (MQ=60)
AGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAA > SRR4302533.1597632/1‑94 (MQ=60)
AGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAA < SRR4302533.2210609/94‑1 (MQ=60)
GCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAG > SRR4302533.4474667/1‑94 (MQ=60)
GCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAG < SRR4302533.613494/94‑1 (MQ=60)
CCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGG < SRR4302533.154008/94‑1 (MQ=60)
CCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGT > SRR4302533.2155982/1‑94 (MQ=60)
CCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGT > SRR4302533.2922555/1‑94 (MQ=60)
CGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTT > SRR4302533.300622/1‑94 (MQ=60)
CGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTT > SRR4302533.2917745/1‑94 (MQ=60)
CGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTT < SRR4302533.3066483/94‑1 (MQ=60)
CGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTT < SRR4302533.773365/94‑1 (MQ=60)
GTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTT < SRR4302533.2138876/94‑1 (MQ=60)
GTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTT > SRR4302533.2449327/1‑94 (MQ=60)
GTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTT < SRR4302533.5496810/94‑1 (MQ=60)
TGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTG < SRR4302533.5840970/94‑1 (MQ=60)
AACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAA > SRR4302533.2986554/1‑94 (MQ=60)
AACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAA > SRR4302533.3876770/1‑94 (MQ=60)
AACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAA < SRR4302533.1316478/94‑1 (MQ=60)
CGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACG > SRR4302533.4334953/1‑94 (MQ=60)
GTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGT > SRR4302533.3089169/1‑94 (MQ=60)
GTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGT < SRR4302533.242025/94‑1 (MQ=60)
GTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGT > SRR4302533.5536685/1‑94 (MQ=60)
GTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGT < SRR4302533.197225/94‑1 (MQ=60)
GTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGAATTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGT > SRR4302533.3089170/1‑94 (MQ=60)
TGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTA > SRR4302533.2925046/1‑94 (MQ=60)
GGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAA < SRR4302533.2043123/94‑1 (MQ=60)
CGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATG < SRR4302533.5164889/94‑1 (MQ=60)
CGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATG < SRR4302533.6090861/94‑1 (MQ=60)
GAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGC < SRR4302533.4414592/94‑1 (MQ=60)
GAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGC > SRR4302533.6013375/1‑94 (MQ=60)
AAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCA > SRR4302533.744993/1‑94 (MQ=60)
AAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCA < SRR4302533.1302191/94‑1 (MQ=60)
GGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGA < SRR4302533.5632514/94‑1 (MQ=60)
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GCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAA < SRR4302533.5113858/94‑1 (MQ=60)
gttccaccagtccggTGCTGCTCACAAGTATAATGTTCTTGCCCGCGAGCCGGCAGATTTTGATCACATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAAC < SRR4302533.2007923/79‑1 (MQ=60)
CTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAAC < SRR4302533.3004019/94‑1 (MQ=60)
CTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAAC > SRR4302533.283268/1‑94 (MQ=60)
TCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGCTTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAAACT > SRR4302533.3628855/1‑94 (MQ=60)
TCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAGCCT > SRR4302533.5171090/1‑94 (MQ=60)
TCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCT < SRR4302533.2806254/94‑1 (MQ=60)
TCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCT > SRR4302533.3384060/1‑94 (MQ=60)
CCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTG > SRR4302533.5589167/1‑94 (MQ=60)
CCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTG < SRR4302533.4128143/94‑1 (MQ=60)
CCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTG > SRR4302533.629142/1‑94 (MQ=60)
CAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGT > SRR4302533.5967181/1‑94 (MQ=60)
AGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTT > SRR4302533.5684063/1‑94 (MQ=60)
CAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGA > SRR4302533.1940228/1‑94 (MQ=60)
CAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGA > SRR4302533.5991754/1‑94 (MQ=60)
AGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGAC < SRR4302533.3373633/94‑1 (MQ=60)
GGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACC > SRR4302533.3583474/1‑94 (MQ=60)
GGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACC > SRR4302533.1478734/1‑94 (MQ=60)
GGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACC < SRR4302533.1558552/94‑1 (MQ=60)
CGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCT > SRR4302533.5517101/1‑94 (MQ=60)
CGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCT > SRR4302533.5930607/1‑94 (MQ=60)
GTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTC > SRR4302533.1311428/1‑94 (MQ=60)
GTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTC > SRR4302533.230513/1‑94 (MQ=60)
TTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCA > SRR4302533.3805818/1‑94 (MQ=60)
TTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCA < SRR4302533.1579666/94‑1 (MQ=60)
TTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCA > SRR4302533.476347/1‑94 (MQ=60)
CTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCC < SRR4302533.2676078/94‑1 (MQ=60)
CTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCC > SRR4302533.2929614/1‑94 (MQ=60)
CTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCC > SRR4302533.2952406/1‑94 (MQ=60)
CTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCC > SRR4302533.3014502/1‑94 (MQ=60)
CTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCC < SRR4302533.119962/94‑1 (MQ=60)
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TGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCG > SRR4302533.1255430/1‑94 (MQ=60)
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GCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGG > SRR4302533.496756/1‑94 (MQ=60)
GCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGG > SRR4302533.5885042/1‑94 (MQ=60)
CTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGA > SRR4302533.63576/1‑94 (MQ=60)
TCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGAT < SRR4302533.3830470/94‑1 (MQ=60)
TCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGAT < SRR4302533.560218/94‑1 (MQ=60)
CACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATG < SRR4302533.3062107/94‑1 (MQ=60)
CACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATG < SRR4302533.2596462/94‑1 (MQ=60)
CAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCT > SRR4302533.2921827/1‑94 (MQ=60)
CAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCT < SRR4302533.743229/94‑1 (MQ=60)
CAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCT > SRR4302533.5377689/1‑94 (MQ=60)
AGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCA > SRR4302533.409594/1‑94 (MQ=60)
GTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAG < SRR4302533.3247215/94‑1 (MQ=60)
GTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAG > SRR4302533.1492023/1‑94 (MQ=60)
GTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAG < SRR4302533.1610934/94‑1 (MQ=60)
TTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAGG > SRR4302533.4138131/1‑94 (MQ=60)
TAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAGGCT < SRR4302533.782407/94‑1 (MQ=60)
TAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAGGCT > SRR4302533.2801312/1‑94 (MQ=60)
TAATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAGGCT < SRR4302533.1699361/94‑1 (MQ=60)
AATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAGGCTG < SRR4302533.1192472/94‑1 (MQ=60)
ATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAGGCTGT > SRR4302533.670763/1‑94 (MQ=60)
ATGTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAGGCTGT < SRR4302533.1243110/94‑1 (MQ=60)
GTTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAGGCTGTAT < SRR4302533.6031807/94‑1 (MQ=60)
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TTCTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAGGCTGTATT < SRR4302533.1499852/94‑1 (MQ=60)
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CTTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAGGCTGTATTCG < SRR4302533.3975469/94‑1 (MQ=60)
TTGCCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAGGCTGTATTCGC > SRR4302533.4231956/1‑94 (MQ=60)
CCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAGGCTGTATTCGCGCA > SRR4302533.5883605/1‑94 (MQ=60)
CCAGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAGGCTGTATTCGCGCA > SRR4302533.4270727/1‑94 (MQ=60)
AGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAGGCTGTATTCGCGCAGA > SRR4302533.4868169/1‑94 (MQ=60)
AGCCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAGGCTGTATTCGCGCAGA > SRR4302533.6115409/1‑94 (MQ=60)
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CCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAGGCTGTATTCGCGCAGAAT < SRR4302533.4996797/94‑1 (MQ=60)
CCAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAGGCTGTATTCGCGCAGAAT > SRR4302533.5072211/1‑94 (MQ=60)
CAGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGCTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAGGCTGTATTCGCGCAGAATG > SRR4302533.5971989/1‑94 (MQ=60)
AGCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAGGCTGTATTCGCGCAGAATGA > SRR4302533.4356247/1‑94 (MQ=60)
GCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAGGCTGTATTCGCGCAGACTGAT > SRR4302533.2084656/1‑94 (MQ=60)
GCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAGGCTGTATTCGCGCAGAATGAT < SRR4302533.1362184/94‑1 (MQ=60)
GCCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAGGCTGTATTCGCGCAGAATGAT > SRR4302533.3019763/1‑94 (MQ=60)
CCGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAGGCTGTATTCGCGCAGAATGATG > SRR4302533.3911488/1‑94 (MQ=60)
CGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAGGCTGTATTCGCGCAGAATGATGA < SRR4302533.6008160/94‑1 (MQ=60)
CGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAGGCTGTATTCGCGCAGAATGATGA > SRR4302533.5673801/1‑94 (MQ=60)
CGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAGGCTGTATTCGCGCAGAATGATGA > SRR4302533.755825/1‑94 (MQ=60)
CGGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAGGCTGTATTCGCGCAGAATGATGA > SRR4302533.5542887/1‑94 (MQ=60)
GGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAGGCTGTATTCGCGCAGAATGATGAA < SRR4302533.4258434/94‑1 (MQ=60)
GGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAGGCTGTATTCGCGCAGAATGATGAA > SRR4302533.1500799/1‑94 (MQ=60)
GGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGCTCAGGCTGTATTCGCGCAGAATGATGAA < SRR4302533.2164931/94‑1 (MQ=60)
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AGGCATTGCTGGTACATCCGCAGCCCGTGAACGTGGCGAAGGCTTCCAGCAGGCCGTTGCTGCTCACAAGTTTAATGTTCTTGCCAGCCAGCCAGCAGATTTTGATCGCATTAAAGGTTTGAACGTAATGCAGAACCTGTTGACCGCTCATCCGGATGTTCAGGCTGTATTCGCGCAGAATGATGAA > NC_000913/3934368‑3934554
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
