Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
A1 F1 I1 R1
|
647 |
270.1 |
21258240 |
98.4% |
20918108 |
94.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
RA |
NC_000913 |
3,544,357 |
+G |
coding (163/1314 nt) |
gntT → |
gluconate permease |
|
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
* | NC_000913 | 3,544,356 | 1 | . | G | 99.8%
| 1587.7
/ ‑4.8
| 457 | coding (162/1314 nt) | gntT | gluconate permease |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/1); new base G (202/254); total (202/255) |
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 526 total aligned reads displayed.
CGGCTTCATCGCTCTCGTCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑GTC‑GC‑G‑G‑ACG‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAAC > NC_000913/3544263‑3544438
|
cGGCTTCATCGCTCTCGTCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑GTc < 2:9531373/94‑1 (MQ=255)
ggCTTCATCGCTCTCGTCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAACGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑GTc‑g > 1:3830173/1‑94 (MQ=255)
ggCTTCATCGCTCTCGTCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑GTc‑g < 2:915751/94‑1 (MQ=255)
ggCTTCATCGCTCTCGTCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑GTc‑g > 2:703893/1‑94 (MQ=255)
ggCTTCATCGCTCTCGTCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑GTc‑g < 1:8490041/94‑1 (MQ=255)
gCTTCATCGCTCTCGTCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑GTc‑gg < 2:6922809/94‑2 (MQ=255)
gCTTCATCGCTCTCGTCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑GTc‑gg < 1:4438420/94‑2 (MQ=255)
gCTTCATCGCTCTCGTCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑GTc‑gg < 1:2570246/94‑2 (MQ=255)
cTTCATCGCTCTCGTCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑GTc‑ggc < 2:7441150/94‑3 (MQ=255)
cTTCATCGCTCTCGTCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑GTc‑ggc < 1:4785272/94‑3 (MQ=255)
cTTCATCGCTCTCGTCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑GTc‑ggc > 2:7159177/1‑92 (MQ=255)
cTTCATCGCTCTCGTCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑GTc‑ggc < 2:5169807/94‑3 (MQ=255)
cTTCATCGCTCTCGTCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑GTc‑ggc < 2:8897951/94‑3 (MQ=255)
ttCATCGCTCTCGTCCTCGTGGCTCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑GTc‑ggcg < 1:7547807/94‑4 (MQ=255)
ttCATCGCTCTCGTCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATCAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑GTctgcg > 1:7812598/1‑90 (MQ=255)
ttCATCGCTCTCGTCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑GTc‑ggcg > 1:1702204/1‑91 (MQ=255)
ttCATCGCTCTCGTCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑GTc‑ggcg > 2:6231092/1‑91 (MQ=255)
ttCATCGCTCTCGTCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑GTc‑ggcg > 2:4380695/1‑91 (MQ=255)
tCATCGCTCTCGTCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑GTc‑ggcgg < 1:3297245/94‑5 (MQ=255)
cGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑GTCGGCGG‑G‑ACGCTCGGTAGCCtt < 2:6153694/94‑1 (MQ=255)
cGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑GTCGGCGG‑G‑ACGCTCGGTAGCCtt < 1:7302352/94‑1 (MQ=255)
cGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑GTCGGCGG‑G‑ACGCTCGGTAGCCtt < 2:4709306/94‑1 (MQ=255)
cGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑GTCGGCGG‑G‑ACGCTCGGTAGCCtt > 2:4551710/1‑94 (MQ=255)
cGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑GTCGGCGG‑G‑ACGCTCGGTAGCCtt > 2:330839/1‑94 (MQ=255)
cGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑GTCGGCGG‑G‑ACGCTCGGTAGCCtt < 1:4532485/94‑1 (MQ=255)
gTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑GTCGGCGG‑G‑ACGCTCGGTAGCCTTg > 1:4082700/1‑94 (MQ=255)
tGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑GTCGGCGG‑G‑ACGCTCGGTAGCCTTGc > 1:575469/1‑94 (MQ=255)
ggCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑GTCGGCGG‑G‑ACGCTCGGTAGCCTTGcc > 1:3051618/1‑94 (MQ=255)
gcgcTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑GTCGGCGG‑G‑ACGCTCGGTAGCCTTGccc < 1:8687972/94‑1 (MQ=255)
cgcTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑GTCGGCGG‑G‑ACGCTCGGTAGGCTTGCCCt > 2:249529/1‑94 (MQ=255)
cgcTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑GTCGGCGG‑G‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCt < 1:9999527/94‑1 (MQ=255)
gcTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑GTCGGCGG‑G‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTg > 2:6399953/1‑94 (MQ=255)
tGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑GTCGGCGG‑G‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATc > 1:1055975/1‑94 (MQ=255)
gCTGTTGGCTTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATCAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑GTCGGCGG‑G‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCa < 2:9381546/94‑1 (MQ=255)
cTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑GTCGGCGG‑G‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCAt < 1:4894658/94‑1 (MQ=255)
cTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑GTCGGCGG‑G‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCAt < 1:6461307/94‑1 (MQ=255)
cTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑GTCGGCGG‑G‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCAt < 2:4346245/94‑1 (MQ=255)
cTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑GTCGGCGG‑G‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCAt < 2:5011411/94‑1 (MQ=255)
tGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑GTCGGCGG‑G‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATg < 1:1963628/94‑1 (MQ=255)
gTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑GTCGGCGG‑G‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATgg < 2:1726634/94‑1 (MQ=255)
gTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑GTCGGCGG‑G‑ACGCTCGGTAGCCTTACCCTGATCATgg > 2:28223/1‑94 (MQ=255)
ttGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑GTCGGCGG‑G‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATggg < 1:5219044/94‑1 (MQ=255)
tGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑GTCGGCGG‑G‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGt > 2:1115398/1‑94 (MQ=255)
gATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑GTCGGCGG‑G‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGttt > 1:3518158/1‑94 (MQ=255)
gATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑GTCGGCGG‑G‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGttt < 1:6835845/94‑1 (MQ=255)
aTTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑GTCGGCGG‑G‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGtttt < 1:5272949/94‑1 (MQ=255)
ttAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑GTCGGCGG‑G‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTg < 1:9271567/94‑1 (MQ=255)
ttAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑GTCGGCGG‑G‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTg < 1:9177824/94‑1 (MQ=255)
tcaaTGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑GTCGGCGG‑G‑ACGCTCAGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTg < 2:8229193/92‑1 (MQ=255)
tAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑GTCGGCGG‑G‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTgg < 1:974410/94‑1 (MQ=255)
tAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑GTCGGCGG‑G‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTgg > 2:10224329/1‑94 (MQ=255)
aaTGCAAGGAAGGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑GTCGGCGG‑G‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGgc < 1:7108474/94‑1 (MQ=255)
aTGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑GTCGGCGG‑G‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGgcg < 2:8920031/94‑1 (MQ=255)
aTGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑GTCGGCGG‑G‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGgcg > 2:2273561/1‑94 (MQ=255)
aTGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCACCAAAGCCGGT‑GTCGGCGG‑G‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGgcg > 1:8062354/1‑94 (MQ=255)
tGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑GTCGGCGG‑G‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGgcgc > 1:10065807/1‑94 (MQ=255)
tGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑GTCGGCGG‑G‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGGTTTGgcgc > 1:9512227/1‑94 (MQ=255)
cAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑GTCGGCGG‑G‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCaa < 1:5850132/94‑1 (MQ=255)
aaGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑GTCGGCGG‑G‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAAt > 2:201343/1‑94 (MQ=255)
aaGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑GTCGGCGG‑G‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAAt > 2:4022462/1‑94 (MQ=255)
aGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑GTCGGCGG‑G‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATg < 2:240036/94‑1 (MQ=255)
gAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑GTCGGCGG‑G‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCt > 2:5264083/1‑94 (MQ=255)
gAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑GTCGGCGG‑G‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGATTTGGCGCAATGCt < 1:1022944/94‑1 (MQ=255)
aaTGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑GTCGGCGG‑G‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTg < 1:8254098/94‑1 (MQ=255)
aaTGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑GTCGGCGG‑G‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTg < 2:7614044/94‑1 (MQ=255)
aaTGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑GTCGGCGG‑G‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTg < 2:7815747/94‑1 (MQ=255)
aaTGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑GTCGGCGG‑G‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTg < 1:6929720/94‑1 (MQ=255)
gCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑GTCGGCGG‑G‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGc < 2:9275573/94‑1 (MQ=255)
cGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑GTCGGCGG‑G‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCaa > 1:1376530/1‑94 (MQ=255)
gCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑GTCGGCGG‑G‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCaaa < 2:6013005/94‑1 (MQ=255)
tGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑GTCGGCGG‑G‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAAt > 1:2217746/1‑94 (MQ=255)
tGGATAAAGTTATTGGCTCCACCAAAGCCGGT‑GTCGGCGG‑G‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAAt < 2:8062354/94‑1 (MQ=255)
ggATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑GTCGGCGG‑G‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATg < 1:1554126/94‑1 (MQ=255)
gATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑GTCGGCGG‑G‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGc > 1:6056937/1‑94 (MQ=255)
aTAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑GTCGGCGG‑G‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCt < 2:3209429/94‑1 (MQ=255)
aTAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑GTCGGCGG‑G‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCt > 1:5514712/1‑94 (MQ=255)
aTAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑GTCGGCGG‑G‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCt < 2:3814432/94‑1 (MQ=255)
tAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑GTCGGCGG‑G‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTg < 1:114687/94‑1 (MQ=255)
aaGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑GTCGGCGG‑G‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGc < 2:448856/94‑1 (MQ=255)
aGTTATTGTCTCCATCAAAGCCGGTGGCC‑GCGG‑G‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGAGCGTGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCa < 2:3465015/94‑1 (MQ=255)
tATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑GTCGGCGG‑G‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGGTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGAc > 2:9746923/1‑94 (MQ=255)
aTTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑GTCGGCGG‑G‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACt < 2:10512175/94‑1 (MQ=255)
ttGGCTCCATCAAAGCCGGT‑GTCGGCGG‑G‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTg < 2:8782988/94‑1 (MQ=255)
tGGCTCCATCAAAGCCGGT‑GTCGGCGG‑G‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGc < 2:8534062/94‑1 (MQ=255)
ggCTCCATCAAAGCCGGT‑GTCGGCGG‑G‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCg < 2:6745938/94‑1 (MQ=255)
ggCTCCATCAAAGCCGGT‑GTCGGCGG‑G‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCg < 1:10388920/94‑1 (MQ=255)
cTCCATCAAAGCCGGT‑GTCGGC‑G‑GTACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGt < 1:3676050/94‑1 (MQ=255)
tCCATCAAAGCCGGT‑GTCGGCGG‑G‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTg < 1:6284039/94‑1 (MQ=255)
tCCATCAAAGCCGGT‑GTCGGCGG‑G‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTg < 1:2424070/94‑1 (MQ=255)
gccaccaAAGCCGGT‑GTCGGCGG‑G‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTg < 1:8393407/93‑1 (MQ=255)
cATCAAAGCCGGT‑GTCGGCGG‑G‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGgc > 2:2147515/1‑94 (MQ=255)
cATCAAAGCCGGT‑GTCGGCGG‑G‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGgc < 2:5613251/94‑1 (MQ=255)
cATCAAAGCCGGT‑GTCGGCGG‑G‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGgc < 1:5397795/94‑1 (MQ=255)
aTCAAAGCCGGT‑GTCGGCGG‑G‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGgcg < 2:6606845/94‑1 (MQ=255)
tCAAAGCCGGT‑GTCGGCGG‑G‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATTGGTGTTGGCGCAATGCTTGGCAAAATGCTGGCAGTCTGCGGTGgcgc > 1:9385380/1‑94 (MQ=255)
cAAAGCCGGT‑GTCGGCGG‑G‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGca > 1:4325624/1‑94 (MQ=255)
aaaGCCGGT‑GTCGGT‑GTG‑ACGCTCGGTAGGCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGcac < 2:5737062/94‑1 (MQ=255)
aaGCCGGT‑GTCGGCGG‑G‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGcaca > 2:8576484/1‑94 (MQ=255)
aGCCGGT‑GTCGGCGG‑G‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACaa < 1:2947077/94‑1 (MQ=255)
aGCCGGT‑GTCGGCGG‑G‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACaa > 2:1281811/1‑94 (MQ=255)
|
CGGCTTCATCGCTCTCGTCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGT‑GTC‑GC‑G‑G‑ACG‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAAC > NC_000913/3544263‑3544438
|
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 238 total aligned reads displayed.
TCATCGCTCTCGTCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑G‑‑CGG‑ACG‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACGTATCGCCACCACG > NC_000913/3544268‑3544452
|
TCATCGCTCTCGTCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTCGG‑‑CGG < SRR4302545.10151549/94‑1 (MQ=60)
CGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTT < SRR4302545.4648637/94‑1 (MQ=60)
CGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTT < SRR4302545.7507123/94‑1 (MQ=60)
CGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTT < SRR4302545.5627113/94‑1 (MQ=60)
CGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTT < SRR4302545.4517983/94‑1 (MQ=60)
CGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTT < SRR4302545.4517982/94‑1 (MQ=60)
CGTGGCGCTTCCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTT > SRR4302545.7242145/1‑94 (MQ=60)
GTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTG > SRR4302545.4184923/1‑94 (MQ=60)
GGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCC > SRR4302545.3126439/1‑94 (MQ=60)
GCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCC < SRR4302545.8939992/94‑1 (MQ=60)
CGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCT > SRR4302545.6014410/1‑94 (MQ=60)
CGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCT > SRR4302545.3486142/1‑94 (MQ=60)
CGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCT < SRR4302545.4512765/94‑1 (MQ=60)
CGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCT < SRR4302545.3881359/94‑1 (MQ=60)
CGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCT < SRR4302545.7177366/94‑1 (MQ=60)
GCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTG > SRR4302545.1890818/1‑94 (MQ=60)
CTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GC‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGA < SRR4302545.7719798/94‑1 (MQ=60)
TTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGAT > SRR4302545.7955433/1‑94 (MQ=60)
TTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGAT > SRR4302545.7479415/1‑94 (MQ=60)
TTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGAT < SRR4302545.4393336/94‑1 (MQ=60)
TTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGAT > SRR4302545.8663993/1‑94 (MQ=60)
TGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATC > SRR4302545.1078931/1‑94 (MQ=60)
TGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATC < SRR4302545.94695/94‑1 (MQ=60)
TGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATC < SRR4302545.8500823/94‑1 (MQ=60)
TGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATC > SRR4302545.6835672/1‑94 (MQ=60)
TGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTAATC < SRR4302545.5449267/94‑1 (MQ=60)
CTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCAT > SRR4302545.10800982/1‑94 (MQ=60)
CTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCAT < SRR4302545.5018964/94‑1 (MQ=60)
CTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCAT < SRR4302545.2164957/94‑1 (MQ=60)
CTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCAT > SRR4302545.7083577/1‑94 (MQ=60)
CTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCAT > SRR4302545.2320279/1‑94 (MQ=60)
CTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCAT < SRR4302545.7055193/94‑1 (MQ=60)
CTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCAT > SRR4302545.3231962/1‑94 (MQ=60)
CTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCAT > SRR4302545.10125562/1‑94 (MQ=60)
CTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCAT > SRR4302545.6527743/1‑94 (MQ=60)
TGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATG < SRR4302545.2012316/94‑1 (MQ=60)
GTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGG < SRR4302545.4766574/94‑1 (MQ=60)
GTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGG < SRR4302545.2212099/94‑1 (MQ=60)
GTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGG < SRR4302545.1534539/94‑1 (MQ=60)
GTTGGATTAATGCAAGGAATGCAGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGCTCATGG > SRR4302545.4560972/1‑94 (MQ=60)
TTGGATTAATGCAAGTAATGCCCCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GTTGCGGC‑G‑‑‑GG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCCGATCATGGG < SRR4302545.4585122/94‑1 (MQ=48)
TTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGG < SRR4302545.8430011/94‑1 (MQ=60)
TTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGG < SRR4302545.5353528/94‑1 (MQ=60)
TGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGT < SRR4302545.8058065/94‑1 (MQ=60)
TGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGT > SRR4302545.5355350/1‑94 (MQ=60)
GATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTT > SRR4302545.7080602/1‑94 (MQ=60)
GATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTT > SRR4302545.3604442/1‑94 (MQ=60)
GATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTT < SRR4302545.7023660/94‑1 (MQ=60)
GATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTT < SRR4302545.628426/94‑1 (MQ=60)
GATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTT < SRR4302545.5045295/94‑1 (MQ=60)
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ATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTT < SRR4302545.5845561/94‑1 (MQ=60)
ATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTT < SRR4302545.3459040/94‑1 (MQ=60)
ATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTT < SRR4302545.9857214/94‑1 (MQ=60)
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TTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTG < SRR4302545.9447016/94‑1 (MQ=60)
TAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGG < SRR4302545.2214726/94‑1 (MQ=60)
TAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGG > SRR4302545.6479889/1‑94 (MQ=60)
TAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGG < SRR4302545.4400396/94‑1 (MQ=60)
TAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCCGGAGCCTTGCCCTGATCATGGGGTTTGG > SRR4302545.8663664/1‑94 (MQ=60)
TAATGCAAGGAATGACGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGGAGCCTTGTCCTCATCATGGGTTTTGG > SRR4302545.5821656/1‑94 (MQ=57)
AATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGC < SRR4302545.1813940/94‑1 (MQ=60)
AATGCAAGGAATACCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGC > SRR4302545.3702548/1‑94 (MQ=60)
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ATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCG < SRR4302545.3700386/94‑1 (MQ=60)
ATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCACCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCG > SRR4302545.8293004/1‑94 (MQ=60)
TGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGC > SRR4302545.3982740/1‑94 (MQ=60)
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TGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGGTTTGGCGC > SRR4302545.9792299/1‑94 (MQ=60)
GCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCA > SRR4302545.2476428/1‑94 (MQ=60)
GCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCA < SRR4302545.10445987/94‑1 (MQ=60)
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CAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAA < SRR4302545.6007676/94‑1 (MQ=60)
AAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑GCGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGATTTGGCGCAAT > SRR4302545.5354587/1‑94 (MQ=60)
AAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTCGCCTTGCCCTGATCATGGGATTTGGgagcag > SRR4302545.5354588/1‑88 (MQ=60)
AAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAAT > SRR4302545.10920528/1‑94 (MQ=60)
AAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAAT < SRR4302545.1390689/94‑1 (MQ=60)
AAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAAT > SRR4302545.5354586/1‑94 (MQ=60)
AAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAAT < SRR4302545.1390687/94‑1 (MQ=60)
AAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAAT > SRR4302545.2561538/1‑94 (MQ=60)
AGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGGCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATG > SRR4302545.9947307/1‑94 (MQ=60)
AGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATG < SRR4302545.9612881/94‑1 (MQ=60)
AGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATG < SRR4302545.1087541/94‑1 (MQ=60)
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AATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTG < SRR4302545.7120710/94‑1 (MQ=60)
AATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTG < SRR4302545.7120711/94‑1 (MQ=60)
AATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTG < SRR4302545.8493032/94‑1 (MQ=60)
ATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGG > SRR4302545.1886969/1‑94 (MQ=60)
TGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGG < SRR4302545.8051287/94‑1 (MQ=60)
TGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGG < SRR4302545.940334/94‑1 (MQ=60)
TGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGG > SRR4302545.5097139/1‑94 (MQ=60)
GCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGC > SRR4302545.5534960/1‑94 (MQ=60)
CCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCA < SRR4302545.6894959/94‑1 (MQ=60)
CCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCA < SRR4302545.8881445/94‑1 (MQ=60)
CCGCTAGATAAAGTTATTGGTTCCATCAAAGCCGCTGTCGGCGT‑‑‑GTC‑G‑‑C‑‑‑‑‑‑‑TGGGTAGCCTTGCCCTGATTATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCA < SRR4302545.1647540/94‑1 (MQ=36)
CGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAA > SRR4302545.3481476/1‑94 (MQ=60)
CGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAA < SRR4302545.5454108/94‑1 (MQ=60)
CGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAA > SRR4302545.1407379/1‑94 (MQ=60)
GCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAA < SRR4302545.3125822/94‑1 (MQ=60)
GCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAA > SRR4302545.8485097/1‑94 (MQ=60)
CTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAA < SRR4302545.7301873/94‑1 (MQ=60)
CTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAA < SRR4302545.1441183/94‑1 (MQ=60)
TGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAGTGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAAT < SRR4302545.1119172/94‑1 (MQ=60)
TGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAAT < SRR4302545.8826222/94‑1 (MQ=60)
TGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAAT < SRR4302545.3039289/94‑1 (MQ=60)
TGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAAT < SRR4302545.10602431/94‑1 (MQ=60)
TGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAAT < SRR4302545.10602432/94‑1 (MQ=60)
TGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAAT < SRR4302545.6733500/94‑1 (MQ=60)
GGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATG < SRR4302545.3166674/94‑1 (MQ=60)
GGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATG > SRR4302545.10684867/1‑94 (MQ=60)
GGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATG < SRR4302545.4782268/94‑1 (MQ=60)
GGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATG < SRR4302545.1590673/94‑1 (MQ=60)
GGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATG < SRR4302545.2935781/94‑1 (MQ=60)
GGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATG > SRR4302545.3874843/1‑94 (MQ=60)
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GATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGC > SRR4302545.5665111/1‑94 (MQ=60)
GATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGC > SRR4302545.6221219/1‑94 (MQ=60)
ATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTTGCCTTGTCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCG > SRR4302545.3925200/1‑94 (MQ=60)
ATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCT > SRR4302545.7453865/1‑94 (MQ=60)
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ATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCT > SRR4302545.1181244/1‑94 (MQ=60)
ATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCT < SRR4302545.8680675/94‑1 (MQ=60)
ATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCT < SRR4302545.761536/94‑1 (MQ=60)
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TAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTG < SRR4302545.9354540/94‑1 (MQ=60)
TAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTG > SRR4302545.10089417/1‑94 (MQ=60)
TAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTG < SRR4302545.117313/94‑1 (MQ=60)
TAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTG < SRR4302545.1122200/94‑1 (MQ=60)
TAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTG < SRR4302545.10792573/94‑1 (MQ=60)
AAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGG < SRR4302545.5066082/94‑1 (MQ=60)
AAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGG > SRR4302545.8287619/1‑94 (MQ=60)
AAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATTCTGGGCAAAATGCTGGC < SRR4302545.8259526/94‑1 (MQ=60)
AAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGC < SRR4302545.5407890/94‑1 (MQ=60)
AAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGC < SRR4302545.2078606/94‑1 (MQ=60)
AGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCA > SRR4302545.4659702/1‑94 (MQ=60)
GTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAG < SRR4302545.578198/94‑1 (MQ=60)
GTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAG < SRR4302545.6245999/94‑1 (MQ=60)
TATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGAC < SRR4302545.5758515/94‑1 (MQ=60)
TATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGAC > SRR4302545.10010599/1‑94 (MQ=60)
TATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGAC < SRR4302545.8745799/94‑1 (MQ=60)
TATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGAC > SRR4302545.1708677/1‑94 (MQ=60)
TATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GAC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGAC < SRR4302545.5998219/94‑1 (MQ=60)
ATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTCGG‑‑CGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGGTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGGAGACTG > SRR4302545.2328380/1‑94 (MQ=60)
ATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACT < SRR4302545.3640901/94‑1 (MQ=60)
TGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGC < SRR4302545.7862257/94‑1 (MQ=60)
GGCTCCTTCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCG < SRR4302545.9667800/94‑1 (MQ=60)
GGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCG < SRR4302545.10695186/94‑1 (MQ=60)
GCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGG < SRR4302545.163388/94‑1 (MQ=60)
GCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGG < SRR4302545.6832471/94‑1 (MQ=60)
TTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGT < SRR4302545.6465085/94‑1 (MQ=60)
CTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTCGG‑‑CGGTACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGT < SRR4302545.3765975/94‑1 (MQ=60)
CTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGG > SRR4302545.9437855/1‑94 (MQ=60)
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CCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGG < SRR4302545.5942934/94‑1 (MQ=60)
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ATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCG < SRR4302545.10739742/94‑1 (MQ=60)
ATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCG > SRR4302545.9417091/1‑94 (MQ=60)
TCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATTGGTGTTGGCGCAATGCTTGGCAAAATGCTGGCAGTCTGCGGTGGCGC > SRR4302545.9660834/1‑94 (MQ=57)
TCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGC > SRR4302545.4767865/1‑94 (MQ=60)
CAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCCTGGGGTTTGGCGCAATGCTGGGAAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCC > SRR4302545.4434693/1‑94 (MQ=60)
CAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCA > SRR4302545.148994/1‑94 (MQ=60)
CAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCA > SRR4302545.4434694/1‑94 (MQ=60)
AAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCAC > SRR4302545.3325657/1‑94 (MQ=60)
AAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCAC > SRR4302545.3641752/1‑94 (MQ=60)
AAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACA < SRR4302545.1044646/94‑1 (MQ=60)
AAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACA < SRR4302545.853028/94‑1 (MQ=60)
AGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAA < SRR4302545.3018783/94‑1 (MQ=60)
AGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAA < SRR4302545.1046199/94‑1 (MQ=60)
GCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑GGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAAC < SRR4302545.163376/94‑1 (MQ=60)
GG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACGTATCGCCACCAC > SRR4302545.8265245/1‑94 (MQ=60)
GG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACGTATCGCCACCAC < SRR4302545.1741851/94‑1 (MQ=60)
GG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACGTATCGCCACCAC < SRR4302545.7541839/94‑1 (MQ=60)
GG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACGTATCGCCACCAC > SRR4302545.1083525/1‑94 (MQ=60)
GG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACGTATCGCCACCAC < SRR4302545.5283837/94‑1 (MQ=60)
G‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACGTATCGCCACCACG > SRR4302545.10680115/1‑94 (MQ=60)
G‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACGTATCGCCACCACG < SRR4302545.10278066/94‑1 (MQ=60)
G‑ACGCTCGCTAGCCTTGCGCTGATAATGGGTTTTGGCCCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCTCATCGTATCGCCCCCACG < SRR4302545.9526872/94‑1 (MQ=60)
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TCATCGCTCTCGTCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑‑‑GTC‑G‑‑CGG‑ACG‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACGTATCGCCACCACG > NC_000913/3544268‑3544452
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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |