Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
A0 F0 I1 R1
|
245 |
579.6 |
28867798 |
97.7% |
28203838 |
96.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
RA |
NC_000913 |
3,870,631 |
Δ1 bp |
coding (610/1764 nt) |
dgoA ← |
2‑oxo‑3‑deoxygalactonate 6‑phosphate aldolase |
|
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
* | NC_000913 | 3,870,630 | 0 | C | . | 99.4%
| 2412.7
/ 1.7
| 506 | coding (611/1764 nt) | dgoA | 2‑oxo‑3‑deoxygalactonate 6‑phosphate aldolase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/3); new base . (276/226); total (277/229) |
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 9.26e-02 |
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 529 total aligned reads displayed.
GCCCCAACCGACCACGCCTTCATCGGTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCACCTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCGGCGCGATAGAGATCGCTGCCTAAGCC > NC_000913/3870536‑3870721
|
gCCCCAACCGACCACGCCTTCATCGGTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGGGATTTTCATTGCAct > 1:5657660/1‑95 (MQ=255)
ccccAACCGACCACGCCTTCATCGGTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCActg > 2:6808329/1‑94 (MQ=255)
cAACCGACCACGCCTTCATCGGTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCct > 1:9098223/1‑96 (MQ=255)
aaCCGACCACGCCTTCATCGGTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCctc > 1:6893352/1‑96 (MQ=255)
aaCCGACCACGCCTTCATCGGTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGAAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCctc > 2:12786907/1‑96 (MQ=255)
ccGACCACGCCTTCATCGGTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCtctc > 2:12986133/1‑96 (MQ=255)
cGACCCCGCCTTCATCGGTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCg < 2:882728/96‑1 (MQ=255)
gACCACGCCTTCATCGGTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGa < 1:9479279/96‑1 (MQ=255)
gACCACGCCTTCATCGGTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGa < 2:3860484/96‑1 (MQ=255)
aCCACGCCTTCATCGGTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGAt < 1:13550294/96‑1 (MQ=255)
aCCACGCCTTCATCGGTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGGGGTAATTTTGGGGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGAt > 2:5555860/1‑96 (MQ=255)
aCGCCTTCATCGTTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGTTTTTCACTGCA‑CTGCCTCTCGATACg < 1:13223645/96‑1 (MQ=255)
aCGCCTTCATCGGTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACg < 1:7364595/96‑1 (MQ=255)
cGCCTTCATCGGTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGc < 2:1802950/96‑1 (MQ=255)
ccTTCATCGGTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCt > 2:11621098/1‑96 (MQ=255)
cctCATCGGTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCtt > 1:11874846/3‑96 (MQ=255)
cTTCATCGGTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCtt > 1:2918442/1‑96 (MQ=255)
cTTCATCGGTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCtt < 2:7360694/96‑1 (MQ=255)
cTTCATCGGTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCtt < 2:4752540/96‑1 (MQ=255)
ttCATCGGTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTa < 1:12024882/96‑1 (MQ=255)
ttCATCGGTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTa > 2:8621715/1‑96 (MQ=255)
cATCGGTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAAc > 2:10770505/1‑96 (MQ=255)
cGGTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGGTACGTGGGAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACaaa > 1:4599234/1‑96 (MQ=255)
ggTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAAt < 2:13529785/96‑1 (MQ=255)
ggTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAAt > 1:1711869/1‑96 (MQ=255)
gTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAAtg < 2:8269472/96‑1 (MQ=255)
gTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGAAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCATCTCGATACGCCTTAACAAAtg > 2:9382702/1‑96 (MQ=255)
ttCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAAtgct < 1:10369555/96‑1 (MQ=255)
atCAATCTTCAGGACCATCAAGCCGGGAGGTAACCGATACGTTGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAAtttt < 1:3524667/95‑4 (MQ=255)
cAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAAtgctgc > 1:4763132/1‑96 (MQ=255)
aaTTTTCAGGAACTTCCAGCGATGATGTAAACGATACGTTGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGTCTCTCGATACTCCTTAACAAAtgctgct < 2:13905784/96‑1 (MQ=255)
aaTTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAAtgctgct < 1:1956541/96‑1 (MQ=255)
aaTTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAAtgctgct > 1:2212263/1‑96 (MQ=255)
aTTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAAtgctgctg > 2:6109887/1‑96 (MQ=255)
aTTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAAtgctgctg > 1:9984541/1‑96 (MQ=255)
aTTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATAAGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAAtgctgctg < 1:3238239/96‑1 (MQ=255)
ttttCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAAtgctgctgc < 2:2456986/96‑1 (MQ=255)
ttttCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAAtgctgctgc > 1:5317374/1‑96 (MQ=255)
tttCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGctgctgcc < 1:8725548/96‑1 (MQ=255)
tttCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGctgctgcc > 1:13979096/1‑96 (MQ=255)
ttCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTCATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACTAATGctgctgcct < 1:11004103/96‑1 (MQ=255)
tCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGctgctgcctg < 1:9698316/96‑1 (MQ=255)
tCAGGAACATCCAGCGGGGAGGCAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGAt < 2:10285941/71‑1 (MQ=255)
aGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGctgctgcctgct < 1:8907855/96‑1 (MQ=255)
aGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGctgctgcctgct > 1:10016127/1‑96 (MQ=255)
ggAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGctgctgcctgctg < 1:4099501/96‑1 (MQ=255)
aaCATCCAGCTGTGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTgcg < 1:13385592/96‑1 (MQ=255)
aaCATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTgcg > 2:3580890/1‑96 (MQ=255)
aaCATCCAGCGGGGAGGCAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTgcg > 1:6176949/1‑96 (MQ=255)
aCATCCAGCGGGGAGGAAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTgcgc > 2:13233635/1‑96 (MQ=255)
tCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGt > 2:13741645/1‑96 (MQ=255)
tCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGt < 1:12567611/96‑1 (MQ=255)
cAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTgc < 1:8386083/96‑1 (MQ=255)
cAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTgc < 1:4982254/96‑1 (MQ=255)
cAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTgc < 2:3163049/96‑1 (MQ=255)
gtggggAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTgcgc > 1:10587055/3‑96 (MQ=255)
ggAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTa < 1:708547/96‑1 (MQ=255)
ggggTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTAc > 1:13016852/3‑96 (MQ=255)
gAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTAc > 2:1651327/1‑96 (MQ=255)
gggTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACg > 1:11392669/2‑96 (MQ=255)
aGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACg > 2:5075138/1‑96 (MQ=255)
ggTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACgg < 2:13191326/96‑1 (MQ=255)
tAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGAt > 2:12061665/1‑96 (MQ=255)
aaaCGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGAtt > 2:12559101/1‑96 (MQ=255)
aaaCGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGAtt > 2:8350317/1‑96 (MQ=255)
aaaCGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGAtt < 1:8633547/96‑1 (MQ=255)
aCGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGc < 2:11459710/96‑1 (MQ=255)
gATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTCAGCTCTACGGATTGccc > 1:12773851/1‑96 (MQ=255)
aTACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCg > 1:13665633/1‑96 (MQ=255)
aTACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCg < 1:6629059/96‑1 (MQ=255)
tACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCgg > 2:11019491/1‑96 (MQ=255)
tACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCgg > 1:2045823/1‑96 (MQ=255)
aCGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCgcc < 1:7543569/96‑3 (MQ=255)
cGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCGgcg < 2:1050690/96‑1 (MQ=255)
cGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCGgcg > 1:8196377/1‑96 (MQ=255)
gTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCGgcgc < 2:6195702/96‑1 (MQ=255)
gTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCAGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCGgcgc > 2:14125301/1‑96 (MQ=255)
tAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCGGCGCGATa > 2:4375893/1‑96 (MQ=255)
tAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCGGCGCGATa < 1:10770505/96‑1 (MQ=255)
aTTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCGGCGCGATaga > 1:256573/1‑96 (MQ=255)
aTTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCGGCGCGATaga > 2:14302655/1‑96 (MQ=255)
aTTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCGGCGCGATaga > 2:6477024/1‑96 (MQ=255)
ttttGGTGATTTTCATTGCA‑CTTCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCGGCGCGATagag < 2:11274507/96‑1 (MQ=255)
ttttGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCAGTGCGCTCTACGGATTGCCCGGCGCGATagag < 2:2210028/96‑1 (MQ=255)
tttGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCGGCGCGATAgaga > 1:14061122/1‑96 (MQ=255)
ttGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCGGCGCGATAGAGAt > 2:2674376/1‑96 (MQ=255)
tGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCGGGGCGATAGAGATc > 2:2930630/1‑96 (MQ=255)
tGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCGGCGCGATAGAGATc < 1:1012597/96‑1 (MQ=255)
gTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCGGCGCGATAGAGATCGc > 1:3875558/1‑96 (MQ=255)
tGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGTTGCGCTCTACGGATTGCCCGGCGCGATAGAGATCGCt > 2:12251626/1‑96 (MQ=255)
tGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCGGCGCGATAGAGATCGCt < 2:12694559/96‑1 (MQ=255)
tGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCGGCGCGATAGAGATCGCt < 2:9222295/96‑1 (MQ=255)
gATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGTCATAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCGGCGCGATAGAGATCGCTg < 1:10863522/96‑1 (MQ=255)
gATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCGGCGCGATAGAGATCGCTg < 2:11906834/96‑1 (MQ=255)
gATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCGGCGCGATAGAGATCGCTg > 2:9710984/1‑96 (MQ=255)
aTTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCGTCGCGATATAGATCGCTGc > 2:5320371/1‑96 (MQ=255)
tttCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCGGCGCGATAGAGATCGCTGCCt < 2:700340/96‑1 (MQ=255)
ttCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCGGCGCGATAGAGATCGCTGCCTa < 2:2044115/96‑1 (MQ=255)
cATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCGGCGCGCTAGAGATCGCTGCCTAAg > 1:1211535/1‑96 (MQ=255)
cATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCGGCGCGATAGAGATCGCTGCCTAAg > 2:4105768/1‑96 (MQ=255)
|
GCCCCAACCGACCACGCCTTCATCGGTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCACCTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCGGCGCGATAGAGATCGCTGCCTAAGCC > NC_000913/3870536‑3870721
|
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 282 total aligned reads displayed.
GGCTCGCCCCAACCGACCACGCCTTCATCGGTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCACCTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCGGCGCGATAGAGATCGCTGCCTAAGCCCGCCCCTGCA > NC_000913/3870531‑3870731
|
NNNTCGCCCCCACCGACCACGCCTTCATCGGTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTCCATTGCACT < SRR4302518.14571361/101‑1 (MQ=60)
NNNTCGCCCCAACCGACCACGCCTTCATCGGTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCACT < SRR4302518.9503768/101‑1 (MQ=60)
TCGCCCCAACCGACCACGCCTTCATCGGTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCC > SRR4302518.6946177/1‑101 (MQ=60)
GCCCCAACCGACCCCGCCTTCATCGGTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTC < SRR4302518.878584/101‑1 (MQ=60)
GCCCCAACCGACCACGCCTTCATCGGTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTC > SRR4302518.4122490/1‑101 (MQ=60)
GCCCCAACCGACCACGCCTTCATCGGTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTC < SRR4302518.3629748/101‑1 (MQ=60)
GCCCCAACCGACCACGCCTTCATCGGTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTC < SRR4302518.2824720/101‑1 (MQ=60)
GCCCCAACCGACCACGCCTTCATCGGTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTC > SRR4302518.2369202/1‑101 (MQ=60)
nnnatctGACCACGCCTTCGTCGGTTTCAATTTTCAGGATCATCCAGCGTGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGTTTTTCATTGCA‑CTGCCTCTC < SRR4302518.9279855/94‑1 (MQ=60)
NNNAACCGACCACGCCTTCATCGGTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCACTGCA‑CTGCCTCTC < SRR4302518.14491264/101‑1 (MQ=60)
CCCAACGGACCACTCCTTCATCGGTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTC < SRR4302518.3142844/101‑1 (MQ=60)
CCAACCGACCACGCCTTCATCGGTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCG < SRR4302518.3857956/101‑1 (MQ=60)
CCAACCGACCACGCCTTCATCGGTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCG > SRR4302518.2395277/1‑101 (MQ=60)
NNNCCGACCACGCCTTCATCGGTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGA < SRR4302518.9938786/101‑1 (MQ=60)
NNNCGACCACGCCTTCATCGGTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGAT < SRR4302518.14172259/101‑1 (MQ=60)
AACCGACCACGCCTTCATCGGTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGAT < SRR4302518.3053666/101‑1 (MQ=60)
AACCGACCACGCCTTCATCGGTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGAT > SRR4302518.7258992/1‑101 (MQ=60)
AACCGACCACGCCTTCATCGGTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGGAATGTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGAT > SRR4302518.6807709/1‑101 (MQ=60)
NNNACCACGCCTTCATCGGTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATAC < SRR4302518.10113712/101‑1 (MQ=60)
CCGACCACGCCTTCATCGGTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATAC > SRR4302518.1126518/1‑101 (MQ=60)
NNNCCACGCCTTCATCGGTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACG < SRR4302518.7746537/101‑1 (MQ=60)
CGACCACGCCTTCATCGGTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGCAAACGATACGTGGTAGTTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATNNN > SRR4302518.12563009/1‑101 (MQ=60)
CGACCACGACTTCGCCGGCTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATNNN > SRR4302518.7516736/1‑101 (MQ=60)
GACCACGCCTTCATCGGTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGC > SRR4302518.1864020/1‑101 (MQ=60)
ACCACGCC‑TCATCGGTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGGTAACGATACGTGGGAATTTTTGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATAtgnnn > SRR4302518.14924120/1‑96 (MQ=60)
CCACGCCTTCATCGGTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCT > SRR4302518.5330474/1‑101 (MQ=60)
NNNGCCTTCATCGGTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTT < SRR4302518.14699418/101‑1 (MQ=60)
NNNCCTTCATCGGTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTA < SRR4302518.13908412/101‑1 (MQ=60)
NNNCCTTCATCGGTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTA < SRR4302518.12597716/101‑1 (MQ=60)
ACGCCTTCATCGGTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGTA‑CTGCCTCTCGATACGCCNNN > SRR4302518.13370379/1‑101 (MQ=60)
ACGCCTTCATCGGTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCNNN > SRR4302518.7674653/1‑101 (MQ=60)
GCCTTCATCGGTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTNNN > SRR4302518.8705885/1‑101 (MQ=60)
GCCTTCATCGGTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAAC > SRR4302518.4054311/1‑101 (MQ=60)
GCCTTCATCGGTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAAC < SRR4302518.6088099/101‑1 (MQ=60)
CCTTCATCGGTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTANNN > SRR4302518.10611304/1‑101 (MQ=60)
NNNCATCGGTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAA < SRR4302518.9146066/101‑1 (MQ=60)
CTTCATCGGTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAA > SRR4302518.4080017/1‑101 (MQ=60)
TTCATCGGTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACNNN > SRR4302518.7403790/1‑101 (MQ=60)
TTCATCGGTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACNNN > SRR4302518.9046373/1‑101 (MQ=60)
TTCATCGGTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAA > SRR4302518.3133382/1‑101 (MQ=60)
TTCATCGGTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAA > SRR4302518.2138580/1‑101 (MQ=60)
TCATCGGTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGCTCCGCCTTAACAAAT < SRR4302518.6474675/101‑1 (MQ=60)
TCATCGGTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACANNN > SRR4302518.9732659/1‑101 (MQ=60)
TCATCGGTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAAT > SRR4302518.4883493/1‑101 (MQ=60)
NNNTCGGTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAAT < SRR4302518.14214368/101‑1 (MQ=60)
CATCGGTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGGGGGAAACGATACGTGGCAATTTTGGGGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAANNN > SRR4302518.12473805/1‑101 (MQ=60)
CATCGGTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATG < SRR4302518.226432/101‑1 (MQ=60)
ATCGGTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGC > SRR4302518.5124823/1‑101 (MQ=60)
ATCGGTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGC < SRR4302518.514118/101‑1 (MQ=60)
ATCGGTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAANNN > SRR4302518.11443505/1‑101 (MQ=60)
TCGGTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATNNN > SRR4302518.14115709/1‑101 (MQ=60)
NNNGTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCT < SRR4302518.10856859/101‑1 (MQ=60)
NNNGTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCT < SRR4302518.7384121/101‑1 (MQ=60)
ACGGTATCAATCTTCAGGACCATCAAGCCGGGAGGTAACCGATACGTTGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATttt < SRR4302518.3689091/101‑4 (MQ=60)
NNNTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTG < SRR4302518.13272512/101‑1 (MQ=60)
CGGTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGGTACGTGGGAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTG > SRR4302518.4841271/1‑101 (MQ=60)
NNNTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGC < SRR4302518.13883647/101‑1 (MQ=60)
GGTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGC > SRR4302518.1787747/1‑101 (MQ=60)
GGTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCNNN > SRR4302518.13823554/1‑101 (MQ=60)
NNNTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCT < SRR4302518.9336763/101‑1 (MQ=60)
GTTTCATTTTTCAGGAACAACCAGCGGGGAGGTAAATGATACGTGGTAATCTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATTCGCCTTAACAAATGCTGCT < SRR4302518.2040921/101‑1 (MQ=60)
GTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTNNN > SRR4302518.14559908/1‑101 (MQ=60)
GTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCT > SRR4302518.4719803/1‑101 (MQ=60)
GTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCT > SRR4302518.6950810/1‑101 (MQ=60)
TTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGNNN > SRR4302518.13800063/1‑101 (MQ=60)
TTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTG > SRR4302518.5628258/1‑101 (MQ=60)
TTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTG > SRR4302518.727658/1‑101 (MQ=60)
TTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTG < SRR4302518.1916206/101‑1 (MQ=60)
TTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATAAGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTG < SRR4302518.3388752/101‑1 (MQ=60)
NNNCAATTTTCAGGAACATCCAGCGTGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTG < SRR4302518.13870335/101‑1 (MQ=60)
TTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCNNN > SRR4302518.12743541/1‑101 (MQ=60)
NNNATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCC < SRR4302518.9149597/101‑1 (MQ=60)
NNNTTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCT < SRR4302518.12723698/101‑1 (MQ=60)
NNNTTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTCATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACTAATGCTGCTGCCT < SRR4302518.11519290/101‑1 (MQ=60)
CAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCT < SRR4302518.2098964/101‑1 (MQ=60)
CAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGGGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCT > SRR4302518.1208507/1‑101 (MQ=60)
NNNTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTG < SRR4302518.10164995/101‑1 (MQ=60)
NNNTTTCAGAAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCCG < SRR4302518.11329168/101‑1 (MQ=60)
ATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGC < SRR4302518.7298089/101‑1 (MQ=60)
ATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGC > SRR4302518.6151887/1‑101 (MQ=60)
ATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGC > SRR4302518.5803736/1‑101 (MQ=60)
TTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTNNN > SRR4302518.9596436/1‑101 (MQ=60)
TTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTNNN > SRR4302518.10497883/1‑101 (MQ=60)
TTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCG > SRR4302518.5590107/1‑101 (MQ=60)
NNNTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCT < SRR4302518.13757775/101‑1 (MQ=60)
NNNTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCT < SRR4302518.9339270/101‑1 (MQ=60)
TTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGNNN > SRR4302518.10830165/1‑101 (MQ=60)
TTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTG < SRR4302518.4298082/101‑1 (MQ=60)
TTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTG < SRR4302518.2452345/101‑1 (MQ=60)
NNNCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTG < SRR4302518.12477613/101‑1 (MQ=60)
TTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGC > SRR4302518.4604139/1‑101 (MQ=60)
NNNAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGC < SRR4302518.14620702/101‑1 (MQ=60)
TCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCG < SRR4302518.4209680/101‑1 (MQ=60)
TCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCG > SRR4302518.5012209/1‑101 (MQ=60)
TCAGGAACATCCAGAGGGGAGGAAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAAAAAATGCTGCTGCCTGCTNNN > SRR4302518.14305299/1‑101 (MQ=60)
NNNGGAACATCCAGCTGTGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCG < SRR4302518.14001242/101‑1 (MQ=60)
NNNGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCG < SRR4302518.7527642/101‑1 (MQ=60)
CAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGC < SRR4302518.7095708/101‑1 (MQ=60)
AGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCNNN > SRR4302518.10492024/1‑101 (MQ=60)
AGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCG > SRR4302518.6875359/1‑101 (MQ=60)
NNNACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGG < SRR4302518.8889110/101‑1 (MQ=60)
NNNCATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACATGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGT < SRR4302518.13157019/101‑1 (MQ=60)
GAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCNNN > SRR4302518.12439408/1‑101 (MQ=60)
NNNATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTG < SRR4302518.15043342/101‑1 (MQ=60)
NNNTCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGC < SRR4302518.14039610/101‑1 (MQ=60)
ACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGC < SRR4302518.5241121/101‑1 (MQ=60)
CATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTNNN > SRR4302518.14646261/1‑101 (MQ=60)
CATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCG < SRR4302518.2056794/101‑1 (MQ=60)
CATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCG > SRR4302518.6456112/1‑101 (MQ=60)
TCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCNNN > SRR4302518.10458834/1‑101 (MQ=60)
TCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCT > SRR4302518.3114184/1‑101 (MQ=60)
CCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTC > SRR4302518.2706437/1‑101 (MQ=60)
CCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTC < SRR4302518.5501316/101‑1 (MQ=60)
CAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCT < SRR4302518.1077708/101‑1 (MQ=60)
CAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCNNN > SRR4302518.10452804/1‑101 (MQ=60)
GCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTAC < SRR4302518.6588841/101‑1 (MQ=60)
ACGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCNNN > SRR4302518.11824460/1‑101 (MQ=60)
NNNGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACG < SRR4302518.14204903/101‑1 (MQ=60)
CGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGGGCGCTCTACG > SRR4302518.3954532/1‑101 (MQ=60)
NNNGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGG < SRR4302518.13382525/101‑1 (MQ=60)
GGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTANNN > SRR4302518.10432551/1‑101 (MQ=60)
NNNAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATAAGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGAA < SRR4302518.11053584/101‑1 (MQ=60)
GAGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGAGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACNNN > SRR4302518.12654979/1‑101 (MQ=60)
NNNGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATT < SRR4302518.9053858/101‑1 (MQ=60)
GGGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGNNN > SRR4302518.13619717/1‑101 (MQ=60)
GAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATT < SRR4302518.2069599/101‑1 (MQ=60)
GGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGANNN > SRR4302518.11926400/1‑101 (MQ=60)
AGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGANNN > SRR4302518.10034304/1‑101 (MQ=60)
GGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATNNN > SRR4302518.11140840/1‑101 (MQ=60)
GTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTNNN > SRR4302518.9126250/1‑101 (MQ=60)
TAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGNNN > SRR4302518.14145961/1‑101 (MQ=60)
NNNACGATACGTCATAATTTGGGTTATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCAATACGCCTTCACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGACTGCCC < SRR4302518.11067063/101‑1 (MQ=60)
NNNCGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCG < SRR4302518.10517253/101‑1 (MQ=60)
AACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCNNN > SRR4302518.12669862/1‑101 (MQ=60)
AACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCNNN > SRR4302518.13259270/1‑101 (MQ=60)
NNNATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCGCC < SRR4302518.7930429/101‑1 (MQ=60)
NNNTACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCGGCG < SRR4302518.10950802/101‑1 (MQ=60)
GATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCGGNNN > SRR4302518.11375437/1‑101 (MQ=60)
GATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCGGNNN > SRR4302518.8679177/1‑101 (MQ=60)
GATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCGGNNN > SRR4302518.7961850/1‑101 (MQ=60)
GATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCGGCGC < SRR4302518.1789948/101‑1 (MQ=60)
NNNCGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCGGCGCG < SRR4302518.9370037/101‑1 (MQ=60)
ATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCGGCNNN > SRR4302518.10465583/1‑101 (MQ=60)
ATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCGGCNNN > SRR4302518.14291801/1‑101 (MQ=60)
AGACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCGGCNNN > SRR4302518.11224864/1‑101 (MQ=60)
TACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCGGCGNNN > SRR4302518.8830554/1‑101 (MQ=60)
TACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCGGCGCGA > SRR4302518.2140390/1‑101 (MQ=60)
AGGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCGGCGCNNN > SRR4302518.13769410/1‑101 (MQ=60)
CGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCGGCGCGATA < SRR4302518.3763453/101‑1 (MQ=60)
CGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCGGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCGGCGCGNNN > SRR4302518.9209144/1‑101 (MQ=60)
CGTGGTAATTTTGGGGGTTTTCGTTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGGGCGCTCTACGGATTGCCCGGAGCGATA > SRR4302518.4435261/1‑101 (MQ=60)
NNNGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGTCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCGGCGCGATAG < SRR4302518.14810444/101‑1 (MQ=60)
GTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCGGCGCGATAG > SRR4302518.5013254/1‑101 (MQ=60)
GTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCGGCGCGANNN > SRR4302518.7898127/1‑101 (MQ=60)
TGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCGCGGCGCGATAGA > SRR4302518.5931143/1‑101 (MQ=60)
TGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCGGGGCGATAGA > SRR4302518.2265647/1‑101 (MQ=60)
TGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGCTCGCTCTACCGATTGCCCGGCGCGATNNN > SRR4302518.13048622/1‑101 (MQ=60)
GGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCGGCGCGATANNN > SRR4302518.11279551/1‑101 (MQ=60)
NNNTTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCGGCGCGATAGAGAA < SRR4302518.11791107/101‑1 (MQ=60)
ttTTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATCCGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCGGCGCGATAGAGATC < SRR4302518.1013513/99‑1 (MQ=60)
NNNTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCGGCGCGATAGAGATC < SRR4302518.8629114/101‑1 (MQ=60)
AATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCGGCGCGATAGAGATC < SRR4302518.1052389/101‑1 (MQ=60)
ATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCGGCGCGATAGAGATCG > SRR4302518.4965875/1‑101 (MQ=60)
ATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCGGCGCGATAGAGATCG > SRR4302518.266947/1‑101 (MQ=60)
TTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCGGCGCGATAGAGATNNN > SRR4302518.10278348/1‑101 (MQ=60)
TTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCGGCGCGATAGAGATCNNN > SRR4302518.14704815/1‑101 (MQ=60)
TTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCGGCGCGATAGAGATCNNN > SRR4302518.7885449/1‑101 (MQ=60)
TTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCGGCGCGATAGAGATCGNNN > SRR4302518.9424422/1‑101 (MQ=60)
TTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCGGCGCGATAGAGATCGCTG > SRR4302518.1149263/1‑101 (MQ=60)
TTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCGGCGCGATAGAGATCGCTG < SRR4302518.2665002/101‑1 (MQ=60)
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TAGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCGGCGCGATAGAGATCGCNNN > SRR4302518.12432256/1‑101 (MQ=60)
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GTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCGGCGCGATAGAGATCGCTGCCT < SRR4302518.70306/101‑1 (MQ=60)
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ATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGTGGTGTGCTCTACTGTTTTCCCGGCGCGATGGAGATCGCTGCCTAAC > SRR4302518.3027001/1‑101 (MQ=60)
ATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCGGCGCGATAGAGATCGCTGCCTAAG > SRR4302518.350737/1‑101 (MQ=60)
caTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGGGGGGGGCTCTACGGATTGCCCGGCGCGATtgaggttgttggcttnnn > SRR4302518.12225385/3‑83 (MQ=60)
TTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCGGCGCGATAGAGATCGCTGCCTAAGCCC < SRR4302518.6217166/101‑1 (MQ=60)
TCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCGGCGCGATAGAGATCGCTGCCTAAGCNNN > SRR4302518.9558422/1‑101 (MQ=60)
TCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCC > SRR4302518.9193148/1‑43 (MQ=60)
CATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCGGCGCGCTAGAGATCGCTGCCTAAGCCCGC > SRR4302518.1260607/1‑101 (MQ=60)
CATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCGGCGCGATAGAGATCGCTGCCTAAGCCCGC < SRR4302518.4126554/101‑1 (MQ=60)
nnntgcaCTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCGGCGCGATAGAGATCGCTGCCTAAGCCCGC < SRR4302518.12168349/94‑1 (MQ=60)
TTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCGGCGCGATAGAGATCGCTGCCTAAGCCCGCCC < SRR4302518.4989041/101‑1 (MQ=60)
TGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGGGCGCTCTACGGATTGCCCGGCGCGATAGAGATCGCTGCCTAAGCCCGCCCC > SRR4302518.3540203/1‑101 (MQ=60)
nnnaCTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCGGCGCGATAGAGATCGCTGCCTAAGCCCGCCCC < SRR4302518.12956048/97‑1 (MQ=60)
GCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCGGCGCGATAGAGATCGCTGCCTAAGCCCGCCCCT > SRR4302518.5426096/1‑101 (MQ=60)
GCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCGGCGCGATAGAGATCGCTGCCTAAGCCCGCCCCG > SRR4302518.3083481/1‑101 (MQ=60)
NNNGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCGGCGCGATAGAGATCGCTGCCTAAGCCTGCCCCTGC < SRR4302518.13587864/101‑1 (MQ=60)
ACTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCGGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCGGCGCGATAGAGATCGCTGCCTAAGCCCGCCCCNNN > SRR4302518.13535116/1‑101 (MQ=60)
NNNCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCGGCGCGATAGAGATCGCTGCCTAAGCCCGCCCCTGCA < SRR4302518.11366069/101‑1 (MQ=60)
CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAACTGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGCTTGCCCGGCGCGATAGAGATCGCTGCCTAAGCCCGCCCCTGCA < SRR4302518.2800141/101‑1 (MQ=60)
CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCGGCGCGATAGAGATCGCTGCCTAAGCCCGCCCCTGCC > SRR4302518.1201871/1‑101 (MQ=60)
|
GGCTCGCCCCAACCGACCACGCCTTCATCGGTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCACCTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCGGCGCGATAGAGATCGCTGCCTAAGCCCGCCCCTGCA > NC_000913/3870531‑3870731
|
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |