Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
882 |
254.4 |
12957588 |
98.0% |
12698436 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,743,603 |
Δ1 bp |
coding (1171/1275 nt) |
yiaN → |
putative membrane protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,743,603 | 0 | C | . | 100.0%
| 1255.1
/ NA
| 264 | coding (1171/1275 nt) | yiaN | putative membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base . (111/153); total (111/153) |
Only 100 of 266 total aligned reads displayed.
TATCATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGATCGATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTCCCGATCTCATCATCCTC > NC_000913/3743515‑3743690
|
tATCATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGc > 1:5242393/1‑93 (MQ=255)
tATCATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGc < 1:1789418/93‑1 (MQ=255)
tATCATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGc < 2:5099973/93‑1 (MQ=255)
aTCATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCa > 1:3534313/1‑93 (MQ=255)
tCATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAg > 2:1636886/1‑93 (MQ=255)
tCATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAg > 1:2655408/1‑93 (MQ=255)
cATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGt < 2:59042/93‑1 (MQ=255)
aTTAACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTc < 1:3638741/93‑1 (MQ=255)
aTTAACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTc < 2:26862/93‑1 (MQ=255)
ttAACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCa > 2:2450046/1‑93 (MQ=255)
aaCTGCTCCATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCaga > 2:6282231/1‑93 (MQ=255)
aaCTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCaga > 1:2062412/1‑93 (MQ=255)
aaCTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCaga < 2:5243039/93‑1 (MQ=255)
aCTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCagag > 1:3842890/1‑93 (MQ=255)
aCTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCagag > 2:3151412/1‑93 (MQ=255)
cTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTAAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAgg < 2:3011356/93‑1 (MQ=255)
cgCTCAATCGGCTTAATCACGCCGCCGATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACACAAATTCGAT‑GATGCAGGCAGAGGc < 2:4890273/92‑1 (MQ=255)
gCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCg > 2:1290446/1‑93 (MQ=255)
cAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGttt > 2:577641/1‑93 (MQ=255)
aaTCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGtttt < 1:1089094/93‑1 (MQ=255)
aaTCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGtttt < 1:3180055/93‑1 (MQ=255)
aTCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTc > 1:2767093/1‑93 (MQ=255)
tCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTcc > 2:4024376/1‑93 (MQ=255)
cGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTccc > 1:3129898/1‑93 (MQ=255)
cGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTccc < 2:2982289/93‑1 (MQ=255)
ggCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCt < 1:5420923/93‑1 (MQ=255)
gCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCtt < 2:4474896/93‑1 (MQ=255)
gCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCtt > 1:198943/1‑93 (MQ=255)
cTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTa < 1:4041023/93‑1 (MQ=255)
ttAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTAc > 2:6117934/1‑93 (MQ=255)
ttAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTAc > 2:893408/1‑93 (MQ=255)
ttACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTcc < 1:3091956/93‑1 (MQ=255)
ttACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTcc < 2:177443/93‑1 (MQ=255)
tACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCt < 2:3887386/93‑1 (MQ=255)
tACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCt < 2:5686211/93‑1 (MQ=255)
tACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCt < 2:925376/93‑1 (MQ=255)
tACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCt < 1:3712131/93‑1 (MQ=255)
cGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGttt > 2:4398515/1‑93 (MQ=255)
cGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGttt > 1:2127081/1‑93 (MQ=255)
gCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGtttt < 1:3919290/93‑1 (MQ=255)
cTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTtat > 2:1169038/1‑93 (MQ=255)
cTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTtat > 2:4507209/1‑93 (MQ=255)
tATGGGTAATGTACTTACCGTTATTTCAGGGGTGGCAAATCTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCGTTACGCCCCGGTTTtata < 2:2137098/93‑1 (MQ=255)
tATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAAGTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTtata < 1:2430694/93‑1 (MQ=255)
aTCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGTGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTatat < 1:5885161/93‑1 (MQ=255)
aTCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTatat > 1:909843/1‑93 (MQ=255)
aTCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTatat > 1:1213191/1‑93 (MQ=255)
tCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATAtt > 1:3351011/1‑93 (MQ=255)
gTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCat > 1:4698589/1‑93 (MQ=255)
tAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCatt < 2:149117/93‑1 (MQ=255)
aaTGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCatta < 2:501688/93‑1 (MQ=255)
aaTGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCatta < 1:1875766/93‑1 (MQ=255)
aaTGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCatta < 2:6433634/93‑1 (MQ=255)
aaTGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCatta > 2:2491808/1‑93 (MQ=255)
aaTGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCatta < 1:3909902/93‑1 (MQ=255)
aTGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCattat < 2:2012492/93‑1 (MQ=255)
tGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCattatt > 2:3947643/1‑93 (MQ=255)
tGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCattatt < 2:3324427/93‑1 (MQ=255)
tGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCattatt > 1:5824072/1‑93 (MQ=255)
gTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCAttatta < 2:712089/93‑1 (MQ=255)
aCTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGt < 1:1013952/93‑1 (MQ=255)
cTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTc < 1:4633467/93‑1 (MQ=255)
ttAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCg < 2:5476770/93‑1 (MQ=255)
aaCGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTa < 1:5066020/93‑1 (MQ=255)
cGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTAtt < 1:6021114/93‑1 (MQ=255)
gTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTAttt > 1:4976694/1‑93 (MQ=255)
gTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGGTTTATATTCATTATTAGTCGTAttt > 2:1342480/1‑93 (MQ=255)
ttATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTg > 2:1769621/1‑93 (MQ=255)
aTTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGtt < 1:748772/93‑1 (MQ=255)
tttCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGttt < 1:2567003/93‑1 (MQ=255)
tttCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGttt > 1:300843/1‑93 (MQ=255)
ttCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGtttt < 2:6017884/93‑1 (MQ=255)
aGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTAt > 2:5963731/1‑93 (MQ=255)
aGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTAt > 1:2636758/1‑93 (MQ=255)
gggTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTc < 1:2373409/93‑1 (MQ=255)
ggTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTcc < 2:3787750/93‑1 (MQ=255)
ggTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTcc < 1:1477947/93‑1 (MQ=255)
ggTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTcc < 2:4721273/93‑1 (MQ=255)
gTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTccc < 2:4910781/93‑1 (MQ=255)
gTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTccc < 2:3581152/93‑1 (MQ=255)
gTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTcac < 1:3252131/93‑3 (MQ=255)
tGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTCCCg > 1:4927754/1‑93 (MQ=255)
tGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTCCCg > 2:859549/1‑93 (MQ=255)
gCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTCCCGAt > 1:5585530/1‑93 (MQ=255)
gCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTCCCGAt > 1:681272/1‑93 (MQ=255)
gCAAAACGCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTCCCGAt < 2:3402861/93‑1 (MQ=255)
aaaCTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTCCCGAtctc > 1:338534/1‑93 (MQ=255)
aaaCTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTCCCGAtctc > 1:1668368/1‑93 (MQ=255)
aaCTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTCCCGATCtca > 1:125759/1‑93 (MQ=255)
aCTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTCCCGATCtcat > 1:4187760/1‑93 (MQ=255)
aCTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTCCCGATCtcat < 2:6355177/93‑1 (MQ=255)
aCTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTCCCGATCtcat < 2:2148573/93‑1 (MQ=255)
tCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTCCCGATCtcatca > 1:4316727/1‑93 (MQ=255)
cAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTCTTTCCGATCTcatcat > 2:631413/1‑93 (MQ=255)
aaaTTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTCCCGATCTCatcatc > 2:2916874/1‑93 (MQ=255)
aTTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTCCCGATCTCATCAtcct < 1:3032333/93‑1 (MQ=255)
aTTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTCCCGATCTCATCAtcct > 1:4457272/1‑93 (MQ=255)
ttCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTCCCGATCTCATCAtcctc > 2:2308748/1‑93 (MQ=255)
ttCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTCCCGATCTCATCAtcctc < 1:4582952/93‑1 (MQ=255)
ttCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTCCCGATCTCATCAtcctc > 2:5540204/1‑93 (MQ=255)
|
TATCATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGATCGATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTCCCGATCTCATCATCCTC > NC_000913/3743515‑3743690
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
ATGTTTATCATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGATCGATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTCCCGATCTCATCATCCTCCCTTTG > NC_000913/3743510‑3743696
|
ATGTTTATCATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGATG < SRR4302537.3702661/94‑1 (MQ=60)
GTTTATCATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GAT < SRR4302537.3187021/94‑1 (MQ=60)
GTTTATCATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GAT > SRR4302537.4047239/1‑94 (MQ=60)
GTTTATCATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GAT > SRR4302537.1483857/1‑94 (MQ=60)
TTTATCATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATG > SRR4302537.5223016/1‑94 (MQ=60)
TTTATCATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATG > SRR4302537.4822933/1‑94 (MQ=60)
TTATCATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGC > SRR4302537.5278471/1‑94 (MQ=60)
TTATCATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGC > SRR4302537.4607976/1‑94 (MQ=60)
TATCATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCA < SRR4302537.3576309/94‑1 (MQ=60)
TATCATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCA > SRR4302537.3559283/1‑94 (MQ=60)
TATCATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCA < SRR4302537.1801916/94‑1 (MQ=60)
ATCATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAG > SRR4302537.2673971/1‑94 (MQ=60)
ATCATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAG > SRR4302537.2578024/1‑94 (MQ=60)
ATCATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAG < SRR4302537.2671554/94‑1 (MQ=60)
ATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCA < SRR4302537.4163664/94‑1 (MQ=60)
ATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCA > SRR4302537.5484636/1‑94 (MQ=60)
ATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCA < SRR4302537.3219675/94‑1 (MQ=60)
ATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCA < SRR4302537.3664362/94‑1 (MQ=60)
TTAACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAG > SRR4302537.5440180/1‑94 (MQ=60)
TAACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGA > SRR4302537.2076896/1‑94 (MQ=60)
AACTGCTCAATCGGCTTAATTACCCCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAG < SRR4302537.2615755/94‑1 (MQ=60)
AACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAG < SRR4302537.3052844/94‑1 (MQ=60)
AACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAG < SRR4302537.4637132/94‑1 (MQ=60)
AACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAG > SRR4302537.767913/1‑94 (MQ=60)
AACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAG > SRR4302537.3869801/1‑94 (MQ=60)
CTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGG > SRR4302537.3837187/1‑94 (MQ=60)
CTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGC < SRR4302537.5264827/94‑1 (MQ=60)
TGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCG > SRR4302537.3608365/1‑94 (MQ=60)
TGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCG < SRR4302537.2226226/94‑1 (MQ=60)
GCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGT > SRR4302537.703987/1‑94 (MQ=60)
AATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTC < SRR4302537.1096618/94‑1 (MQ=60)
AATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTC > SRR4302537.3462501/1‑94 (MQ=60)
AATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTC < SRR4302537.3202404/94‑1 (MQ=60)
AATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTC > SRR4302537.2786436/1‑94 (MQ=60)
ATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCC < SRR4302537.3069937/94‑1 (MQ=60)
ATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCC > SRR4302537.2475054/1‑94 (MQ=60)
TCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCC > SRR4302537.3151838/1‑94 (MQ=60)
GGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTT > SRR4302537.200361/1‑94 (MQ=60)
GGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTT < SRR4302537.5457863/94‑1 (MQ=60)
GGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTT < SRR4302537.2293312/94‑1 (MQ=60)
CTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTAC < SRR4302537.3076929/94‑1 (MQ=60)
CTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTAC < SRR4302537.4069290/94‑1 (MQ=60)
TTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACG < SRR4302537.4303728/94‑1 (MQ=60)
TTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACG > SRR4302537.3942999/1‑94 (MQ=60)
AATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTC < SRR4302537.211136/94‑1 (MQ=60)
AATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTC > SRR4302537.1112452/1‑94 (MQ=60)
ATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCC > SRR4302537.2792163/1‑94 (MQ=60)
ATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCC < SRR4302537.4045477/94‑1 (MQ=60)
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TTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCT < SRR4302537.3336862/94‑1 (MQ=60)
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TACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTG < SRR4302537.1957774/94‑1 (MQ=60)
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TACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTG < SRR4302537.3738227/94‑1 (MQ=60)
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CCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTT < SRR4302537.3129481/94‑1 (MQ=60)
GCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTA < SRR4302537.3946685/94‑1 (MQ=60)
CCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTAT < SRR4302537.4029633/94‑1 (MQ=60)
CTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATA < SRR4302537.5021871/94‑1 (MQ=60)
TATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATAT > SRR4302537.1221631/1‑94 (MQ=60)
TATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATAT > SRR4302537.916123/1‑94 (MQ=60)
TATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAAGTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATAT < SRR4302537.2447819/94‑1 (MQ=60)
ATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGTGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATT < SRR4302537.5925543/94‑1 (MQ=60)
ATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATT < SRR4302537.2085976/94‑1 (MQ=60)
ATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATT > SRR4302537.3374740/1‑94 (MQ=60)
ATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATT < SRR4302537.1230932/94‑1 (MQ=60)
TGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCA < SRR4302537.5789932/94‑1 (MQ=60)
CGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCA < SRR4302537.4106482/94‑1 (MQ=60)
GGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCAT > SRR4302537.4731096/1‑94 (MQ=60)
TAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTA < SRR4302537.3766354/94‑1 (MQ=60)
TAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGAAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTA > SRR4302537.3878177/1‑94 (MQ=60)
AATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTAT < SRR4302537.1729626/94‑1 (MQ=60)
AATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTAT < SRR4302537.3937234/94‑1 (MQ=60)
AATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTAT < SRR4302537.1474073/94‑1 (MQ=60)
AATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTAT > SRR4302537.1491734/1‑94 (MQ=60)
AATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTAT < SRR4302537.1888815/94‑1 (MQ=60)
AATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTAT < SRR4302537.5586017/94‑1 (MQ=60)
ATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATT > SRR4302537.5863986/1‑94 (MQ=60)
ATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATT > SRR4302537.102244/1‑94 (MQ=60)
ATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATT < SRR4302537.1805440/94‑1 (MQ=60)
TGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTA > SRR4302537.491151/1‑94 (MQ=60)
GTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAG > SRR4302537.2745322/1‑94 (MQ=60)
ttacTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGT < SRR4302537.445019/90‑1 (MQ=60)
TACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGCTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTTGT > SRR4302537.2073228/1‑94 (MQ=60)
ACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTC < SRR4302537.1020937/94‑1 (MQ=60)
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CTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCG < SRR4302537.4665518/94‑1 (MQ=60)
TTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCTGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGT > SRR4302537.3517026/1‑94 (MQ=60)
TAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTT > SRR4302537.3383251/1‑94 (MQ=60)
TAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTA < SRR4302537.1497157/94‑1 (MQ=60)
TAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTA > SRR4302537.4685903/1‑94 (MQ=60)
AACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTAT > SRR4302537.2602500/1‑94 (MQ=60)
AACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTAT < SRR4302537.5100895/94‑1 (MQ=60)
AACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTAT < SRR4302537.5040234/94‑1 (MQ=60)
AACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTAT < SRR4302537.3014970/94‑1 (MQ=60)
CGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTT > SRR4302537.5010995/1‑94 (MQ=60)
CGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTT < SRR4302537.6062480/94‑1 (MQ=60)
GTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTG < SRR4302537.1939951/94‑1 (MQ=60)
TTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGT > SRR4302537.2745532/1‑94 (MQ=60)
TATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTT > SRR4302537.2405285/1‑94 (MQ=60)
ATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTT < SRR4302537.753878/94‑1 (MQ=60)
ATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTT > SRR4302537.302940/1‑94 (MQ=60)
TTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTT < SRR4302537.3167882/94‑1 (MQ=60)
TTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTT < SRR4302537.2584987/94‑1 (MQ=60)
CAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTAT > SRR4302537.2655205/1‑94 (MQ=60)
AGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATT > SRR4302537.511969/1‑94 (MQ=60)
AGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATT < SRR4302537.5675345/94‑1 (MQ=60)
GGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTC < SRR4302537.912887/94‑1 (MQ=60)
GGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTCC < SRR4302537.2390131/94‑1 (MQ=60)
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GGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTCCC < SRR4302537.371706/94‑1 (MQ=60)
GTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTCCCG > SRR4302537.4961725/1‑94 (MQ=60)
GTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTCACG < SRR4302537.3275062/94‑1 (MQ=60)
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AAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTCCCGATCTC > SRR4302537.1680056/1‑94 (MQ=60)
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AAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTCCCGATCTC < SRR4302537.5894552/94‑1 (MQ=60)
AAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTCCCGATCTCA > SRR4302537.126662/1‑94 (MQ=60)
AACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTCCCGATCTCAT < SRR4302537.111820/94‑1 (MQ=60)
AACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTCCCGATCTCAT > SRR4302537.4217005/1‑94 (MQ=60)
CTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTCCCGATCTCATCA > SRR4302537.4671594/1‑94 (MQ=60)
CTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTCCCGATCTCATCA < SRR4302537.184075/94‑1 (MQ=60)
CTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTCCCGATCTCATCA < SRR4302537.4534839/94‑1 (MQ=60)
CTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTCCCGATCTCATCA < SRR4302537.6407150/94‑1 (MQ=60)
CTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTCCCGATCTCATCA > SRR4302537.4346737/1‑94 (MQ=60)
TCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTCCCGATCTCATCAT < SRR4302537.500613/94‑1 (MQ=60)
CAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTCCCGATCTCATCATC > SRR4302537.929034/1‑94 (MQ=60)
AAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTCCCGATCTCATCATCC < SRR4302537.4817704/94‑1 (MQ=60)
AATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTCCCGATCTCATCATCCT < SRR4302537.3304115/94‑1 (MQ=60)
AATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTCCCGATCTCATCATCCT > SRR4302537.4488056/1‑94 (MQ=60)
ATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTCCCGATCTCATCATCCTC < SRR4302537.3053476/94‑1 (MQ=60)
ATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTCCCGATCTCATCATCCTC < SRR4302537.6014385/94‑1 (MQ=60)
ATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTCCCGATCTCATCATCCTC > SRR4302537.6211367/1‑94 (MQ=60)
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GAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTCCCGATCTCATCATCCTCCCTT > SRR4302537.1723581/1‑94 (MQ=60)
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TGATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTCCCGATCTCATCATCCTCCCTTTG < SRR4302537.4083537/94‑1 (MQ=60)
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TGATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTCCCGATCTCATCATCCTCCCTTTG > SRR4302537.1700600/1‑94 (MQ=60)
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ATGTTTATCATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGATCGATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTCCCGATCTCATCATCCTCCCTTTG > NC_000913/3743510‑3743696
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
