Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
884 |
257.2 |
12958910 |
96.9% |
12557183 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,544,357 |
+G |
coding (163/1314 nt) |
gntT → |
gluconate permease |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,544,356 | 1 | . | G | 100.0%
| 696.8
/ NA
| 199 | V54V (GTC→GTG) | gntT | gluconate permease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/0); new base G (92/107); total (92/107) |
Only 100 of 225 total aligned reads displayed.
GGCTTCATCGCTCTCGTCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GC‑GG‑ACG‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAA > NC_000913/3544264‑3544437
|
ggCTTCATCGCTCTCGTCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTc < 2:3741711/93‑1 (MQ=255)
ggCTTCATCGCTCTCGTCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTc > 2:5701111/1‑93 (MQ=255)
ggCTTCATCGCTCTCGTCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTc < 1:2854127/93‑1 (MQ=255)
ggCTTCATCGCTCTCGTCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTc < 1:2411514/93‑1 (MQ=255)
ggCTTCATCGCTCTCGGCCTTGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTc < 2:4284282/93‑1 (MQ=255)
gCTTCATCGCTCTCGTCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTc‑g < 2:1016340/93‑1 (MQ=255)
gCTTCATCGCTCTCGTCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTc‑g > 2:717309/1‑93 (MQ=255)
cTTCATCGCTCTCGTCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTc‑gg < 1:8253/93‑2 (MQ=255)
cTTCATCGCTCTCGTCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCGCCATCAAAGCCGGTGTc‑gg > 1:1118560/1‑92 (MQ=255)
tCATCGCTCTCGTCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTc‑ggcg > 1:3471965/1‑90 (MQ=255)
tCATCGCTCTCGTCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCAGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCACAGCCGGTGTc‑ggcg > 2:4033214/1‑90 (MQ=255)
cATCGCTCTCGTCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTc‑ggcgg < 1:2775205/93‑5 (MQ=255)
tCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGG‑ACGCTCGGTAGcc < 2:294064/93‑1 (MQ=255)
tCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGG‑ACGCTCGGTAGcc > 1:3601089/1‑93 (MQ=255)
cGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCt < 1:4649032/93‑1 (MQ=255)
gTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCtt < 1:1663260/93‑1 (MQ=255)
gTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCtt < 1:5667317/93‑1 (MQ=255)
gTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCtt > 1:3116712/1‑93 (MQ=255)
ggCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGc < 2:4766981/93‑1 (MQ=255)
ggCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGc > 2:3353738/1‑93 (MQ=255)
gcgcTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGcc < 1:2986960/93‑1 (MQ=255)
gcgcTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGcc < 2:1765815/93‑1 (MQ=255)
gcgcTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGcc > 2:4682218/1‑93 (MQ=255)
cgcTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGccc < 1:6026706/93‑1 (MQ=255)
cgcTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGccc < 2:2261455/93‑1 (MQ=255)
cTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTg > 1:5105290/1‑93 (MQ=255)
ttGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGa < 1:2870609/93‑1 (MQ=255)
tGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGAt < 2:1561723/93‑1 (MQ=255)
tGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGAt > 2:5109180/1‑93 (MQ=255)
tGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGAt < 2:841549/93‑1 (MQ=255)
cTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCa > 2:603140/1‑93 (MQ=255)
tGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCAt < 1:3953890/93‑1 (MQ=255)
tGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCAt < 1:1818083/93‑1 (MQ=255)
gTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATg > 2:434862/1‑93 (MQ=255)
gTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATg > 1:630737/1‑93 (MQ=255)
ttGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATgg < 2:2791612/93‑1 (MQ=255)
tGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATggg < 2:6221218/93‑1 (MQ=255)
tGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATggg > 1:4108350/1‑93 (MQ=255)
gATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATggggt > 2:1024910/1‑91 (MQ=255)
aTTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCAGCAAAGCCGGTGTCGGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGttt < 2:2618607/93‑1 (MQ=255)
ttAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGtttt > 2:1928401/1‑93 (MQ=255)
tAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTg < 2:4470351/93‑1 (MQ=255)
tAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTg < 1:3853823/93‑1 (MQ=255)
aaTGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTgg < 2:3808332/93‑1 (MQ=255)
aaTGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTgg > 1:1726750/1‑93 (MQ=255)
aTGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTggg > 1:148921/1‑92 (MQ=255)
aTGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGgc < 1:670855/93‑1 (MQ=255)
aTGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGgc > 1:1002946/1‑93 (MQ=255)
gCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGgcgc > 1:807979/1‑93 (MQ=255)
gCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGgcgc > 1:5415195/1‑93 (MQ=255)
gCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGgcgc > 2:2156817/1‑93 (MQ=255)
gCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGgcgc < 2:1116035/93‑1 (MQ=255)
aaGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCaa < 2:3919931/93‑1 (MQ=255)
aaGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCaa > 1:764118/1‑93 (MQ=255)
aaGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCaa > 2:5906254/1‑93 (MQ=255)
aaGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCaa > 1:3706515/1‑93 (MQ=255)
aGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAAt > 2:3691094/1‑93 (MQ=255)
aGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAAt > 1:5265748/1‑93 (MQ=255)
aGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGCTTTGGCGCAAt > 1:2907783/1‑93 (MQ=255)
ggAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATg > 2:6070675/1‑93 (MQ=255)
gAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGc < 2:5343366/93‑1 (MQ=255)
gAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGc < 2:300432/93‑1 (MQ=255)
aaTGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCt < 1:13336/93‑1 (MQ=255)
aaTGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCt < 1:908977/93‑1 (MQ=255)
aTGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTg < 2:2841632/93‑1 (MQ=255)
tGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTgg > 1:4337722/1‑93 (MQ=255)
ccGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGc < 2:671089/93‑1 (MQ=255)
gCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCaa < 1:2066576/93‑1 (MQ=255)
tGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCaaaa > 2:5207606/1‑93 (MQ=255)
tGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCaaaa < 1:61911/93‑1 (MQ=255)
tGGATAAAGTGATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCaaaa < 1:4198202/93‑1 (MQ=255)
gATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATg > 2:1870955/1‑93 (MQ=255)
gATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATg < 1:5025083/93‑1 (MQ=255)
tAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCt < 2:2018274/93‑1 (MQ=255)
tAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCt < 2:1406692/93‑1 (MQ=255)
aaaGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTg < 2:5451497/93‑1 (MQ=255)
aaGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTgg < 2:3176587/93‑1 (MQ=255)
aGTTATTGTCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGc < 2:913792/93‑1 (MQ=255)
aGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGc > 2:3530176/1‑93 (MQ=255)
tATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGGTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGa > 1:3800258/1‑93 (MQ=255)
ggCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGc < 2:5181546/93‑1 (MQ=255)
ggCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGc < 2:4864766/93‑1 (MQ=255)
cTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCgg > 1:5843805/1‑93 (MQ=255)
tCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGt < 2:2397429/93‑1 (MQ=255)
tCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGt < 2:5557625/93‑1 (MQ=255)
ccATCAAAGCCGGTGTCGGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTg < 1:1601169/93‑1 (MQ=255)
ccATCAAAGCCGGTGTCGGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTg < 1:4249307/93‑1 (MQ=255)
ccATCAAAGCCGGTGTCGGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTg > 1:4466493/1‑93 (MQ=255)
ccAGCAAAGCCGGTGTCGGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTg < 2:4147349/93‑1 (MQ=255)
cATCAAAGCCGGTGTCGGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTgg < 2:5097941/93‑1 (MQ=255)
cATCAAAGCCGGTGTCGGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTgg > 1:2033017/1‑93 (MQ=255)
cATCAAAGCCGGTGTCGGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTgg < 2:4836349/93‑1 (MQ=255)
aTCAAAGCCGGTGTCGGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGgc < 1:5151500/93‑1 (MQ=255)
aTCAAAGCCGGTGTCGGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGgc > 2:2452206/1‑93 (MQ=255)
aTCAAAGCCGGTGTCGGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGgc < 2:1550626/93‑1 (MQ=255)
aTCAAAGCCGGTGTCGGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACGGCGGTGgc < 1:6269455/93‑1 (MQ=255)
aaaGCCGGTGTCGGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGca > 1:4171115/1‑93 (MQ=255)
aGCCGGTGTCGGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGcaca > 1:4879098/1‑93 (MQ=255)
aGCCGGTGTCGGC‑GGAACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGcaca > 2:105770/1‑93 (MQ=255)
gCCGGTGTCGGCGGG‑ACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACaa < 1:1986708/93‑1 (MQ=255)
|
GGCTTCATCGCTCTCGTCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GC‑GG‑ACG‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAA > NC_000913/3544264‑3544437
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GGCTTCATCGCTCTCGTCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑G‑‑CGGACG‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAAC > NC_000913/3544264‑3544438
|
GGCTTCATCGCTCTCGTCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑G < SRR4302534.2929098/94‑1 (MQ=60)
GGCTTCATCGCTCTCGTCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑G < SRR4302534.2475641/94‑1 (MQ=60)
GGCTTCATCGCTCTCGTCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑G > SRR4302534.1781473/1‑94 (MQ=60)
GCTTCATCGCTCTCGTCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑G‑‑G < SRR4302534.2937769/94‑1 (MQ=60)
GCTTCATCGCTCTCGTCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCGCCATCAAAGCCGGTGTC‑G‑‑G > SRR4302534.1147778/1‑94 (MQ=60)
CTTCATCGCTCTCGTCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑Ggc < SRR4302534.8471/94‑3 (MQ=60)
TTCATCGCTCTCGTCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑Ggcg > SRR4302534.3565281/1‑91 (MQ=60)
TCATCGCTCTCGTCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGG < SRR4302534.4427932/94‑1 (MQ=60)
CATCGCTCTCGTCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑Ggcggg < SRR4302534.2848224/94‑6 (MQ=60)
CATCGCTCTCGTCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑Ggcggg < SRR4302534.5309454/94‑6 (MQ=60)
TCGCTCTCGTCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑Ggcgggac > SRR4302534.1241121/1‑87 (MQ=60)
TCGCTCTCGTCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑Ggcgggac < SRR4302534.4881529/94‑8 (MQ=60)
CGCTCTCGTCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑Ggcgggacg < SRR4302534.4840492/94‑9 (MQ=60)
CGCTCTCGTCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑Ggcgggacg > SRR4302534.5275063/1‑86 (MQ=60)
GCTCTCGTCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑Ggcgggacgc > SRR4302534.4490097/1‑85 (MQ=60)
TCTCGTCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑Ggcggggcgctc > SRR4302534.1580392/1‑83 (MQ=60)
TCTCGTCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑Ggcgggacgctc < SRR4302534.3173303/94‑12 (MQ=60)
TCTCGTCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑Ggcgggacgctc < SRR4302534.1080294/94‑12 (MQ=60)
CTCGTCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑Ggcgggacgctcg < SRR4302534.2524805/94‑13 (MQ=60)
CTCGTCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑Ggcgggacgctca < SRR4302534.1168876/94‑13 (MQ=60)
TCGTCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑Ggcgggacgctcgg < SRR4302534.3830544/94‑14 (MQ=60)
TCGTCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑Ggcgggacgctcgg < SRR4302534.2355768/94‑14 (MQ=60)
CGTCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑Ggcgggacgctcggt > SRR4302534.5226554/1‑80 (MQ=60)
CGTCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑Ggcgggacgctcggt > SRR4302534.2720910/1‑80 (MQ=60)
CGTCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑Ggcgggacgctcggt < SRR4302534.1620517/94‑15 (MQ=60)
CGTCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑Ggcgggacgctcggt > SRR4302534.2406245/1‑80 (MQ=60)
TCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑Ggcgggacgctcggtag < SRR4302534.137696/94‑17 (MQ=60)
TCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑Ggcgggacgctcggtag > SRR4302534.990629/1‑78 (MQ=60)
TCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑Ggcgggacgctcggtag < SRR4302534.6504221/94‑17 (MQ=60)
TCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑Ggcgggacgctcggtag < SRR4302534.5033665/94‑17 (MQ=60)
CCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑Ggcgggacgctcgggagc > SRR4302534.215228/1‑77 (MQ=60)
CTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑Ggcgggacgctcggtagcc > SRR4302534.6334687/1‑76 (MQ=60)
CTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑Ggcgggacgctcggtagcc > SRR4302534.3697931/1‑76 (MQ=60)
CTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑Ggcgggacgctcggtagcc > SRR4302534.1017596/1‑76 (MQ=60)
TCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCT > SRR4302534.5237427/1‑94 (MQ=60)
CGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTT < SRR4302534.4775238/94‑1 (MQ=60)
CGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTT > SRR4302534.3198666/1‑94 (MQ=60)
CGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTT < SRR4302534.527642/94‑1 (MQ=60)
CGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTT < SRR4302534.3136142/94‑1 (MQ=60)
GTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTG < SRR4302534.5820747/94‑1 (MQ=60)
GTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTG < SRR4302534.1706558/94‑1 (MQ=60)
TGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGC > SRR4302534.4309741/1‑94 (MQ=60)
GCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCC < SRR4302534.3065075/94‑1 (MQ=60)
GCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCC > SRR4302534.4793935/1‑94 (MQ=60)
CGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAGGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCT < SRR4302534.2671398/94‑1 (MQ=60)
CGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCT < SRR4302534.6190481/94‑1 (MQ=60)
GCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTG > SRR4302534.5243067/1‑94 (MQ=60)
CTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGA < SRR4302534.6320891/94‑1 (MQ=60)
TTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGAT < SRR4302534.2945987/94‑1 (MQ=60)
TTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGAT < SRR4302534.2087854/94‑1 (MQ=60)
TGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATG > SRR4302534.646038/1‑94 (MQ=60)
TGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATG < SRR4302534.4059730/94‑1 (MQ=60)
TGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATG > SRR4302534.3692272/1‑94 (MQ=60)
TGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATG < SRR4302534.1865320/94‑1 (MQ=60)
TGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATG < SRR4302534.2966511/94‑1 (MQ=60)
GTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCTTGATCATGG < SRR4302534.6455221/94‑1 (MQ=60)
GTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGG < SRR4302534.377154/94‑1 (MQ=60)
TTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGG < SRR4302534.97617/94‑1 (MQ=60)
TTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGG > SRR4302534.4218855/1‑94 (MQ=60)
GGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGGT > SRR4302534.4664181/1‑94 (MQ=60)
GATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTT < SRR4302534.4121920/94‑1 (MQ=60)
ATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTT < SRR4302534.4387399/94‑1 (MQ=60)
TTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTG < SRR4302534.821632/94‑1 (MQ=60)
TTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTG < SRR4302534.1129288/94‑1 (MQ=60)
TAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGG > SRR4302534.1771587/1‑94 (MQ=60)
TAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGG < SRR4302534.3957292/94‑1 (MQ=60)
AATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGG > SRR4302534.152798/1‑94 (MQ=60)
AATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGC > SRR4302534.3355084/1‑94 (MQ=60)
AATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGC > SRR4302534.1028671/1‑94 (MQ=60)
ATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCG < SRR4302534.3981479/94‑1 (MQ=60)
ATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCG > SRR4302534.3894621/1‑94 (MQ=60)
ATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCG < SRR4302534.687204/94‑1 (MQ=60)
TGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGC > SRR4302534.828284/1‑94 (MQ=60)
TGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGC > SRR4302534.5560858/1‑94 (MQ=60)
CAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAA > SRR4302534.783090/1‑94 (MQ=60)
CAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAA > SRR4302534.2742270/1‑94 (MQ=60)
CAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAA > SRR4302534.3806162/1‑94 (MQ=60)
AAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAAT > SRR4302534.5408001/1‑94 (MQ=60)
AAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAAT > SRR4302534.1658778/1‑94 (MQ=60)
AAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAAT > SRR4302534.4332823/1‑94 (MQ=60)
AAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAAT > SRR4302534.2056902/1‑94 (MQ=60)
AAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGCTTTGGCGCAAT > SRR4302534.2984108/1‑94 (MQ=60)
AGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATG > SRR4302534.686996/1‑94 (MQ=60)
GAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCT > SRR4302534.5898756/1‑94 (MQ=60)
GAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCT > SRR4302534.6039680/1‑94 (MQ=60)
AATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTG < SRR4302534.932074/94‑1 (MQ=60)
AATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTG < SRR4302534.13686/94‑1 (MQ=60)
ATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGG > SRR4302534.4454961/1‑94 (MQ=60)
GCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGC < SRR4302534.830053/94‑1 (MQ=60)
CCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCA < SRR4302534.557181/94‑1 (MQ=60)
CCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCA < SRR4302534.858743/94‑1 (MQ=60)
CGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAA < SRR4302534.5553180/94‑1 (MQ=60)
GCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAA < SRR4302534.2120619/94‑1 (MQ=60)
TGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAAT < SRR4302534.63599/94‑1 (MQ=60)
TGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAAT > SRR4302534.6420185/1‑94 (MQ=60)
TGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAAT > SRR4302534.1640059/1‑94 (MQ=60)
TGGATAAAGTGATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAAT < SRR4302534.4311588/94‑1 (MQ=60)
GATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGC < SRR4302534.5160815/94‑1 (MQ=60)
AAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGC < SRR4302534.3024733/94‑1 (MQ=60)
AGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCA > SRR4302534.3044502/1‑94 (MQ=60)
GTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAG > SRR4302534.1459739/1‑94 (MQ=60)
TTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGA < SRR4302534.4068102/94‑1 (MQ=60)
TTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGGTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGA > SRR4302534.3902298/1‑94 (MQ=60)
ATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACT < SRR4302534.3750719/94‑1 (MQ=60)
ATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACT < SRR4302534.780989/94‑1 (MQ=60)
ATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACT > SRR4302534.719014/1‑94 (MQ=60)
ATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACT < SRR4302534.1918898/94‑1 (MQ=60)
ATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACT < SRR4302534.1749843/94‑1 (MQ=60)
GGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCG < SRR4302534.3951437/94‑1 (MQ=60)
GCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGG < SRR4302534.1577721/94‑1 (MQ=60)
GCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGG > SRR4302534.6002454/1‑94 (MQ=60)
GCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGG < SRR4302534.427442/94‑1 (MQ=60)
CTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGT < SRR4302534.1990819/94‑1 (MQ=60)
TCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTG > SRR4302534.4587273/1‑94 (MQ=60)
CCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTG < SRR4302534.5141055/94‑1 (MQ=60)
ACCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTG < SRR4302534.5141054/94‑1 (MQ=60)
CCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGG < SRR4302534.4363927/94‑1 (MQ=60)
CCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGG > SRR4302534.4483774/1‑94 (MQ=60)
CCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGG < SRR4302534.1643001/94‑1 (MQ=60)
CCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGG > SRR4302534.2086176/1‑94 (MQ=60)
CCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGG < SRR4302534.553268/94‑1 (MQ=60)
CATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGC < SRR4302534.1269001/94‑1 (MQ=60)
ATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCG < SRR4302534.5290468/94‑1 (MQ=60)
ATCAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACGGCGGTGGCG < SRR4302534.6439218/94‑1 (MQ=60)
CAAAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCA > SRR4302534.4283790/1‑94 (MQ=60)
AAGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACA > SRR4302534.5011429/1‑94 (MQ=60)
AGCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAA > SRR4302534.2852347/1‑94 (MQ=60)
GCCGGTGTC‑GGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAAC < SRR4302534.2038729/94‑1 (MQ=60)
|
GGCTTCATCGCTCTCGTCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑G‑‑CGGACG‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAAC > NC_000913/3544264‑3544438
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
