Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
884 |
257.2 |
12958910 |
96.9% |
12557183 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,732,250 |
C→T |
A301V (GCC→GTC) |
xylH → |
XylH |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,732,250 | 0 | C | T | 99.6%
| 1002.9
/ ‑5.2
| 261 | A301V (GCC→GTC) | xylH | XylH |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base T (130/130); total (131/130) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.01e-01 |
Only 100 of 261 total aligned reads displayed.
GGCGGCAATCTGGAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGCCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATCGCCGAACTGGACGCAATTGCAGCATGC > NC_000913/3732162‑3732338
|
ggcgtcAATCTGGAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATc < 2:5203999/93‑1 (MQ=255)
ggcggcAATCTGGAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATc < 1:3826194/93‑1 (MQ=255)
ggcggcAATCTGGAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATc < 2:1851154/93‑1 (MQ=255)
ggcggcAATCTGGAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATc < 2:1708378/93‑1 (MQ=255)
ggcggcAATCTGGAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATc < 1:2459869/93‑1 (MQ=255)
gcAATCTGGAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCg > 1:4732484/1‑93 (MQ=255)
gcAATCTGGAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCg > 2:2598733/1‑93 (MQ=255)
gcAATCTGGAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCg > 2:2935443/1‑93 (MQ=255)
cAATCTGGAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCgg > 2:4293497/1‑93 (MQ=255)
aTCTGGAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGAt > 2:2091080/1‑93 (MQ=255)
aTCTGGAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGAt > 2:5627003/1‑93 (MQ=255)
aTCTGGAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGAt > 1:3564796/1‑93 (MQ=255)
cTGGAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTa > 2:3161178/1‑93 (MQ=255)
tGGAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTaa < 2:1576635/93‑1 (MQ=255)
tGGAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTaa > 2:6205828/1‑93 (MQ=255)
ggAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAAt > 1:1747967/1‑93 (MQ=255)
gAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATc > 2:1974628/1‑93 (MQ=255)
gcagcaCGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCtt < 1:436524/93‑1 (MQ=255)
gcagcaCGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCtt < 2:3952690/93‑1 (MQ=255)
gcagcaCGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCtt > 2:5062151/1‑93 (MQ=255)
cagcaCGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTa < 2:4829058/93‑1 (MQ=255)
agcaCGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCTCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAg < 1:5563151/93‑1 (MQ=255)
agcaCGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAg > 2:2797684/1‑93 (MQ=255)
agcaCGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAg < 2:4017201/93‑1 (MQ=255)
aCGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTtc < 2:852746/93‑1 (MQ=255)
aCGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTtc < 1:1121820/93‑1 (MQ=255)
aCGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTtc < 1:3521562/93‑1 (MQ=255)
tctctcCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCg < 1:466925/93‑1 (MQ=255)
tctctcCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCg < 1:5297702/93‑1 (MQ=255)
tctctcCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCg > 2:4401793/1‑93 (MQ=255)
ctctcCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGa > 1:2319484/1‑93 (MQ=255)
tctcCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGAc < 1:865814/93‑1 (MQ=255)
tctcCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGAc < 2:5362866/93‑1 (MQ=255)
tctcCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGAc > 2:4198752/1‑93 (MQ=255)
tcCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACtt < 2:3587844/93‑1 (MQ=255)
tcCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACtt < 1:5273860/93‑1 (MQ=255)
ccGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTg < 1:2943470/93‑1 (MQ=255)
ccGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTg < 1:6121769/93‑1 (MQ=255)
ccGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTg < 1:1965847/93‑1 (MQ=255)
cGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACttcg < 2:6245401/93‑3 (MQ=255)
cGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTgg < 2:2218683/93‑1 (MQ=255)
cGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTgg < 2:634873/93‑1 (MQ=255)
gggATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGgc > 2:3801257/1‑93 (MQ=255)
ggATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCTGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGgcg > 1:3725102/1‑93 (MQ=255)
ggATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGgcg > 1:1045445/1‑93 (MQ=255)
gATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGgcgc > 1:4508965/1‑93 (MQ=255)
aTTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCt < 2:4984404/93‑1 (MQ=255)
tAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTgg > 1:5925737/1‑93 (MQ=255)
tAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTgg > 1:3685730/1‑93 (MQ=255)
aaCGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGt < 1:647693/93‑1 (MQ=255)
aaCGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGt < 1:5876217/93‑1 (MQ=255)
aaCGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGt > 2:2864410/1‑93 (MQ=255)
aCGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGtt < 1:4280902/93‑1 (MQ=255)
aCGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGtt > 2:5288390/1‑93 (MQ=255)
aCGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGtt > 1:3133579/1‑93 (MQ=255)
tGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCAcc > 1:6317721/1‑93 (MQ=255)
tGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCAcc > 2:344154/1‑93 (MQ=255)
tGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCAcc < 2:5561118/93‑1 (MQ=255)
gAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCt > 2:2039048/1‑93 (MQ=255)
aaCGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCtt < 2:2482048/93‑1 (MQ=255)
aCGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTc > 2:3271441/1‑93 (MQ=255)
aCGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTc < 2:2889036/93‑1 (MQ=255)
cGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCt < 1:1330897/93‑1 (MQ=255)
cGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCt < 1:4493107/93‑1 (MQ=255)
gCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTg > 1:702382/1‑93 (MQ=255)
cACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGc < 1:3220189/93‑1 (MQ=255)
aCCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCg > 2:2780863/1‑93 (MQ=255)
ccAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCgg > 1:5535762/1‑93 (MQ=255)
ccAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCgg < 1:730088/93‑1 (MQ=255)
aaaCTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGa > 1:3312115/1‑93 (MQ=255)
aCTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGaaa > 2:560050/1‑93 (MQ=255)
cTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAat < 1:6043136/93‑1 (MQ=255)
ttGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAata > 1:2235016/1‑93 (MQ=255)
tGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAatat < 2:3030962/93‑1 (MQ=255)
tGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAatat < 1:1637913/93‑1 (MQ=255)
tGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAatat < 1:2099260/93‑1 (MQ=255)
tGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAatat < 1:2690365/93‑1 (MQ=255)
gCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATc > 1:1874516/1‑93 (MQ=255)
ccGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATCg > 1:4871558/1‑93 (MQ=255)
cGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATCGc < 2:1025406/93‑1 (MQ=255)
gtTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATCGCCGa < 2:365282/93‑1 (MQ=255)
cgcgATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATCGCCGAACt < 2:3754324/93‑1 (MQ=255)
cgATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATCGCCGAACTgg > 2:1284559/1‑93 (MQ=255)
aTTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATCGCCGAACTGGAc > 2:695555/1‑93 (MQ=255)
aTTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATCGCCGAACTGGAc < 1:1792115/93‑1 (MQ=255)
tAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATCGCCGAACTGGACGc < 1:1441402/93‑1 (MQ=255)
aCGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATCGCCGAACTGGACGCaa > 2:1347062/1‑93 (MQ=255)
cGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATCGCCGAACTGGACGCAAt < 1:3895551/93‑1 (MQ=255)
ggATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATCGCCGAACTGGACGCAAtt > 2:5811341/1‑93 (MQ=255)
ggATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATCGCCGAACTGGACGCAAtt > 2:1213970/1‑93 (MQ=255)
aTTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATCGCCGAACTGGACGCAATTgc > 2:542553/1‑93 (MQ=255)
aTTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATCGCCGAACTGGACGCAATTgc < 2:5986708/93‑1 (MQ=255)
aaTGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATCGCCGAACTGGACGCAATTgcagc > 2:4598363/1‑93 (MQ=255)
aaTGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATCGCCGAACTGGACGCAATTgcagc > 2:1325033/1‑93 (MQ=255)
tGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATCGCCGAACTGGACGCAATTGCAGGAt > 1:1564686/1‑93 (MQ=255)
tGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATCGCCGAACTGGACGCAATTGCAGCAt > 1:597709/1‑93 (MQ=255)
tGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATCGCCGAACTGGACGCAATTGCAGCAt < 1:2768720/93‑1 (MQ=255)
tGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATCGCCGAACTGGACGCAATTGCAGCAt < 1:6198019/93‑1 (MQ=255)
tGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATCGCCGAACTGGACGCAATTGCAGCAt < 1:58274/93‑1 (MQ=255)
ggTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATCGCCGAACTGGACGCAATTGCAGCATg > 2:729701/1‑93 (MQ=255)
|
GGCGGCAATCTGGAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGCCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATCGCCGAACTGGACGCAATTGCAGCATGC > NC_000913/3732162‑3732338
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CCATCGGCGGCAATCTGGAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGCCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATCGCCGAACTGGACGCAATTGCAGCATGCGTGAT > NC_000913/3732157‑3732343
|
CCATCGGCGGCAATCTGGAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGCTTAATGGTAGT > SRR4302534.5957423/1‑94 (MQ=60)
CCATCGGCGGCAATCTGGAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGT < SRR4302534.3098239/94‑1 (MQ=60)
CCATCGGCGGCAATCTGGAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGT > SRR4302534.4294631/1‑94 (MQ=60)
CATCGGCGGCAATCTGGAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGTTTAATGGTAGTC < SRR4302534.3652348/94‑1 (MQ=60)
CATCGGCGGCAATCTGGAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTC < SRR4302534.72441/94‑1 (MQ=60)
CATCGGCGGCAATCTGGAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTC > SRR4302534.5323508/1‑94 (MQ=60)
CATCGGCGGCAATCTGGAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTC < SRR4302534.4953549/94‑1 (MQ=60)
CATCGGCGGCAATCTGGAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTC > SRR4302534.4163542/1‑94 (MQ=60)
GGCGGCAATCTGGAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCG > SRR4302534.6116301/1‑94 (MQ=60)
GGCGGCAATCTGGAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCG < SRR4302534.2525219/94‑1 (MQ=60)
GGCGGCAATCTGGAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCG < SRR4302534.4894008/94‑1 (MQ=60)
GGCGGCAATCTGGAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCG > SRR4302534.3325834/1‑94 (MQ=60)
GGCGGCAATCTGGAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCG < SRR4302534.3928980/94‑1 (MQ=60)
CGGCAATCTGGAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCC > SRR4302534.1427204/1‑94 (MQ=60)
GGCAATCTGGAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCG < SRR4302534.2248773/94‑1 (MQ=60)
GGCAATCTGGAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCG > SRR4302534.4860991/1‑94 (MQ=60)
CAATCTGGAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAAAGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGA > SRR4302534.3896114/1‑94 (MQ=60)
AATCTGGAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGAT > SRR4302534.3660686/1‑94 (MQ=60)
AATCTGGAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGAT < SRR4302534.1957390/94‑1 (MQ=60)
ATCTGGAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATT > SRR4302534.4860621/1‑94 (MQ=60)
ATCTGGAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATT > SRR4302534.1541273/1‑94 (MQ=60)
TCTGGAAGGAGCCCGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAACCTTGCCGTGTGCGGAATTAACGGATTAATGGTAGCCATCGCGGGATTA < SRR4302534.4529767/94‑1 (MQ=60)
CTGGAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAA < SRR4302534.6006035/94‑1 (MQ=60)
TGGAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAAT > SRR4302534.1793327/1‑94 (MQ=60)
TGGAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAAT > SRR4302534.4401802/1‑94 (MQ=60)
TGGAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAAT > SRR4302534.4054627/1‑94 (MQ=60)
TGGAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAAT < SRR4302534.3194035/94‑1 (MQ=60)
TGGAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAAT > SRR4302534.2300898/1‑94 (MQ=60)
GGAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATC < SRR4302534.3785735/94‑1 (MQ=60)
GGAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATC > SRR4302534.1080104/1‑94 (MQ=60)
GAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCC > SRR4302534.205687/1‑94 (MQ=60)
AAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCT > SRR4302534.269487/1‑94 (MQ=60)
AGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTT < SRR4302534.3971241/94‑1 (MQ=60)
AGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTT < SRR4302534.456791/94‑1 (MQ=60)
GCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTA < SRR4302534.447644/94‑1 (MQ=60)
GCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCGTA < SRR4302534.3439343/94‑1 (MQ=60)
CGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGT < SRR4302534.6155836/94‑1 (MQ=60)
AGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCTCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGT < SRR4302534.5713353/94‑1 (MQ=60)
AGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGT > SRR4302534.618940/1‑94 (MQ=60)
CACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTC > SRR4302534.2789095/1‑94 (MQ=60)
ACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCT < SRR4302534.3616282/94‑1 (MQ=60)
ACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCT < SRR4302534.1151132/94‑1 (MQ=60)
CGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTC < SRR4302534.848586/94‑1 (MQ=60)
CGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTC > SRR4302534.461333/1‑94 (MQ=60)
CGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTC > SRR4302534.4531399/1‑94 (MQ=60)
GTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCG < SRR4302534.5478709/94‑1 (MQ=60)
GTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCG < SRR4302534.2346353/94‑1 (MQ=60)
TCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGA < SRR4302534.478704/94‑1 (MQ=60)
TCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGA > SRR4302534.2381039/1‑94 (MQ=60)
TCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGA < SRR4302534.5440682/94‑1 (MQ=60)
TCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCAGATTAATCCTTAGTTCTCGA < SRR4302534.4462077/94‑1 (MQ=60)
CTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGAC > SRR4302534.6569925/1‑94 (MQ=60)
CTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGAC > SRR4302534.5434137/1‑94 (MQ=60)
TCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACT < SRR4302534.887682/94‑1 (MQ=60)
TCCGTGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTG < SRR4302534.3485572/94‑1 (MQ=60)
TCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTG < SRR4302534.5416300/94‑1 (MQ=60)
TCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTG < SRR4302534.887498/94‑1 (MQ=60)
CCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGG < SRR4302534.2017307/94‑1 (MQ=60)
CCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGG < SRR4302534.6288284/94‑1 (MQ=60)
CCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGG < SRR4302534.3020703/94‑1 (MQ=60)
CGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGC > SRR4302534.24857/1‑94 (MQ=60)
GGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCTGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCG > SRR4302534.3825230/1‑94 (MQ=60)
GGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCG > SRR4302534.1072463/1‑94 (MQ=60)
GGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCG > SRR4302534.370777/1‑94 (MQ=60)
GGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGC > SRR4302534.4631068/1‑94 (MQ=60)
GGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGC > SRR4302534.5688074/1‑94 (MQ=60)
ATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTG > SRR4302534.6518562/1‑94 (MQ=60)
TTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGG < SRR4302534.6301837/94‑1 (MQ=60)
TTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGG > SRR4302534.6086646/1‑94 (MQ=60)
TTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGG > SRR4302534.3784823/1‑94 (MQ=60)
TAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGT > SRR4302534.548720/1‑94 (MQ=60)
AACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTT > SRR4302534.5118683/1‑94 (MQ=60)
AACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTT < SRR4302534.6035755/94‑1 (MQ=60)
AACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTT < SRR4302534.6002782/94‑1 (MQ=60)
AACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTT < SRR4302534.663397/94‑1 (MQ=60)
AACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTT > SRR4302534.3215945/1‑94 (MQ=60)
ACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTC < SRR4302534.4396775/94‑1 (MQ=60)
ACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTC < SRR4302534.1825662/94‑1 (MQ=60)
CGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCA > SRR4302534.3943212/1‑94 (MQ=60)
CGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCA < SRR4302534.1855424/94‑1 (MQ=60)
TTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACC > SRR4302534.6488468/1‑94 (MQ=60)
TGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCT < SRR4302534.666178/94‑1 (MQ=60)
TGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCT > SRR4302534.3798432/1‑94 (MQ=60)
GAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTT < SRR4302534.2987512/94‑1 (MQ=60)
GAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTT < SRR4302534.1268670/94‑1 (MQ=60)
AACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTC > SRR4302534.3031330/1‑94 (MQ=60)
CGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTG < SRR4302534.4614691/94‑1 (MQ=60)
CGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTG < SRR4302534.1365981/94‑1 (MQ=60)
CGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTG < SRR4302534.3331121/94‑1 (MQ=60)
CGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTG < SRR4302534.274901/94‑1 (MQ=60)
CGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTG > SRR4302534.719604/1‑94 (MQ=60)
CACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCG < SRR4302534.517821/94‑1 (MQ=60)
CACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCG < SRR4302534.3305684/94‑1 (MQ=60)
ACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGG < SRR4302534.3278410/94‑1 (MQ=60)
ACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGG < SRR4302534.671220/94‑1 (MQ=60)
ACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGG > SRR4302534.5685196/1‑94 (MQ=60)
CCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGG < SRR4302534.3691230/94‑1 (MQ=60)
CCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGG < SRR4302534.748123/94‑1 (MQ=60)
CAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGA > SRR4302534.3400586/1‑94 (MQ=60)
CAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGA > SRR4302534.1615952/1‑94 (MQ=60)
CAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGA > SRR4302534.1669440/1‑94 (MQ=60)
AAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGTGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAA > SRR4302534.2121323/1‑94 (MQ=60)
AAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAA > SRR4302534.6402092/1‑94 (MQ=60)
ACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAAT < SRR4302534.729174/94‑1 (MQ=60)
CTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATA < SRR4302534.6207414/94‑1 (MQ=60)
CTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATA < SRR4302534.158198/94‑1 (MQ=60)
CTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATA > SRR4302534.5950788/1‑94 (MQ=60)
CTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATA > SRR4302534.2294234/1‑94 (MQ=60)
TTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATAT < SRR4302534.2824507/94‑1 (MQ=60)
TGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATC < SRR4302534.2154351/94‑1 (MQ=60)
TGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATC < SRR4302534.1680632/94‑1 (MQ=60)
TGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATC < SRR4302534.2761463/94‑1 (MQ=60)
TGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATC > SRR4302534.1923293/1‑94 (MQ=60)
GCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATCG > SRR4302534.6086946/1‑94 (MQ=60)
GCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATCG > SRR4302534.5003684/1‑94 (MQ=60)
CCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATCGC > SRR4302534.1828049/1‑94 (MQ=60)
GTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATCGCCG < SRR4302534.4902037/94‑1 (MQ=60)
TTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATCGCCGAAC > SRR4302534.893349/1‑94 (MQ=60)
TCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGTATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCCCCTCCTGCGGGAAATATCGCCGAACT < SRR4302534.1949139/94‑1 (MQ=60)
TCGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATCGCCGAACT < SRR4302534.3647776/94‑1 (MQ=60)
CGCGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATCGCCGAACTG < SRR4302534.6249363/94‑1 (MQ=60)
CGATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATCGCCGAACTGGC > SRR4302534.1709530/1‑94 (MQ=60)
GATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATCGCCGAACTGGAC > SRR4302534.6057456/1‑94 (MQ=60)
ATTAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATCGCCGAACTGGACG < SRR4302534.1838659/94‑1 (MQ=60)
TAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATCGCCGAACTGGACGCA < SRR4302534.1479333/94‑1 (MQ=60)
TAACGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATCGCCGAACTGGACGCA < SRR4302534.4769137/94‑1 (MQ=60)
CGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATCGCCGAACTGGACGCAATT < SRR4302534.4000099/94‑1 (MQ=60)
CGGATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATCGCCGAACTGGACGCAATT > SRR4302534.1190692/1‑94 (MQ=60)
GATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATCGCCGAACTGGACGCAATTGC > SRR4302534.1924684/1‑94 (MQ=60)
GATTAATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATCGCCGAACTGGACGCAATTGA > SRR4302534.4645278/1‑94 (MQ=60)
ATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATCGCCGAACTGGACGCAATTGCAGGAT > SRR4302534.1605634/1‑94 (MQ=60)
ATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATCGCCGAACTGGACGCAATTGCAGCAT > SRR4302534.631276/1‑94 (MQ=60)
ATGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATCGCCGAACTGGACGCAATTGCAGCAT > SRR4302534.612285/1‑94 (MQ=60)
TGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATCGCCGAACTGGACGCAATTGCAGCATG < SRR4302534.6366622/94‑1 (MQ=60)
TGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATCGCCGAACTGGACGCAATTGCAGCATG < SRR4302534.2841598/94‑1 (MQ=60)
TGGTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATCGCCGAACTGGACGCAATTGCAGCATG < SRR4302534.59846/94‑1 (MQ=60)
GTAGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATCGCCGAACTGGACGCAATTGCAGCATGCG < SRR4302534.5862687/94‑1 (MQ=60)
AGTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATCGCCGAACTGGACGCAATTGCAGCATGCGTG > SRR4302534.796077/1‑94 (MQ=60)
GTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATCGCCGAACTGGACGCAATTGCAGCATGCGTGA > SRR4302534.5309300/1‑94 (MQ=60)
GTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATCGCCGAACTGGACGCAATTGCAGCATGCGTGA > SRR4302534.2109729/1‑94 (MQ=60)
GTCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATCGCCGAACTGGACGCAATTGCAGCATGCGTGA < SRR4302534.2778094/94‑1 (MQ=60)
TCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATCGCCGAACTGGACGCAATTGCAGCATGCGTGAT > SRR4302534.5817982/1‑94 (MQ=60)
|
CCATCGGCGGCAATCTGGAAGCAGCACGTCTCTCCGGGATTAACGTTGAACGCACCAAACTTGCCGTGTTCGCGATTAACGGATTAATGGTAGCCATCGCCGGATTAATCCTTAGTTCTCGACTTGGCGCTGGTTCACCTTCTGCGGGAAATATCGCCGAACTGGACGCAATTGCAGCATGCGTGAT > NC_000913/3732157‑3732343
|
| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
