Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
884 |
257.2 |
12958910 |
96.9% |
12557183 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,743,457 |
T→C |
V342A (GTA→GCA) |
yiaN → |
putative membrane protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,743,457 | 0 | T | C | 100.0%
| 801.4
/ NA
| 229 | V342A (GTA→GCA) | yiaN | putative membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (95/134); total (95/134) |
Only 100 of 232 total aligned reads displayed.
CGCGTCTGCTGTTTATCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGTATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTACAC > NC_000913/3743367‑3743546
|
gcgTCTGCTGTTTATCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCAtt > 2:3839639/1‑93 (MQ=255)
gcgTCTGCTGTTTATCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCAtt > 2:2753099/1‑93 (MQ=255)
cgTCTGCTGTTTATCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTGCCCCGGCATTa < 2:1784024/93‑1 (MQ=255)
cgTCTGCTGTTTATCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTa > 1:1082139/1‑93 (MQ=255)
cgTCTGCTGTTTATCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTa > 2:2984187/1‑93 (MQ=255)
gTCTGCTGTTTATCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTAGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTaa > 2:2559726/1‑93 (MQ=255)
tCTGCTGTTTATCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAAt > 1:4862246/1‑93 (MQ=255)
ctgctgTTTATCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATg < 1:210595/93‑1 (MQ=255)
gctgTTTATCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGcc < 1:1550803/93‑1 (MQ=255)
ctgTTTATCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCt > 1:1649467/1‑93 (MQ=255)
tgTTTATCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCtt > 1:5319956/1‑93 (MQ=255)
tgTTTATCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCtt < 2:6345618/93‑1 (MQ=255)
tgTTTATCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCtt < 2:3057539/93‑1 (MQ=255)
gTTTATCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCttt < 1:5861955/93‑1 (MQ=255)
gTTTATCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCttt > 1:6140948/1‑93 (MQ=255)
tttATCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTa < 2:1599192/93‑1 (MQ=255)
tttATCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTa > 1:377120/1‑93 (MQ=255)
tttATCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTa < 1:4745343/93‑1 (MQ=255)
tttATCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTa < 2:5531590/93‑1 (MQ=255)
ttATCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGAAGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAg > 1:904346/1‑93 (MQ=255)
aTCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGtt > 1:1226252/1‑93 (MQ=255)
aTCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGtt > 2:5979991/1‑93 (MQ=255)
aTCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGtt > 1:2327087/1‑93 (MQ=255)
aTCGTCATAATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCAACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGtt < 1:4118290/93‑1 (MQ=255)
tCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTa < 1:3874482/93‑1 (MQ=255)
tCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTa < 1:4174854/93‑1 (MQ=255)
gTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTaaa > 2:4555688/1‑93 (MQ=255)
gTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTaaa > 2:4835764/1‑93 (MQ=255)
aTTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAagag < 1:565701/93‑1 (MQ=255)
ttATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAgg < 2:1478921/93‑1 (MQ=255)
tATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGc < 2:3954109/93‑1 (MQ=255)
aTGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCa > 2:1657701/1‑93 (MQ=255)
aTGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCa < 2:6294697/93‑1 (MQ=255)
tggtggCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAg < 2:2649391/93‑1 (MQ=255)
ggCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGact > 2:4246057/1‑91 (MQ=255)
ggCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAAt < 2:3215873/93‑1 (MQ=255)
gCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATc > 1:733660/1‑93 (MQ=255)
cTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCg < 2:1911166/93‑1 (MQ=255)
tATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGa > 2:1526422/1‑93 (MQ=255)
aTCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGAt > 1:1109522/1‑93 (MQ=255)
aTCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGAt > 1:2792017/1‑93 (MQ=255)
tCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATc < 1:655554/93‑1 (MQ=255)
ccTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATcc < 2:5353900/93‑1 (MQ=255)
tGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGa < 1:1838555/93‑1 (MQ=255)
tGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGa > 1:3703153/1‑93 (MQ=255)
tGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGa > 2:3596635/1‑93 (MQ=255)
tGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGa > 1:1395463/1‑93 (MQ=255)
gATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGat < 2:1838047/93‑1 (MQ=255)
gATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGat < 2:2435452/93‑1 (MQ=255)
gATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGat < 2:6063110/93‑1 (MQ=255)
ttGTCGGCATGGTCATGGATTTAAAGCAGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATAGATCCgggtt > 1:4632733/1‑89 (MQ=255)
ttGTCGGCATGGTCATGCATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGattt < 2:2346790/93‑1 (MQ=255)
tGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGattta < 2:5205089/93‑1 (MQ=255)
gTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGatttat < 2:5100317/93‑1 (MQ=255)
tCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGatttatt > 2:4190812/1‑93 (MQ=255)
tCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGatttatt < 1:5926382/93‑1 (MQ=255)
ggCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTc > 2:4492251/1‑93 (MQ=255)
ggCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTc < 1:820286/93‑1 (MQ=255)
gCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCg > 2:4054372/1‑93 (MQ=255)
gCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCg < 2:5307173/93‑1 (MQ=255)
gCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCg < 2:4896533/93‑1 (MQ=255)
cATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCgg < 1:5554272/93‑1 (MQ=255)
gTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTc < 2:3798896/93‑1 (MQ=255)
cATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCAt < 2:930540/93‑1 (MQ=255)
cATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCAt > 1:4480630/1‑93 (MQ=255)
aTGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATg > 2:3144764/1‑93 (MQ=255)
tGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGt > 1:1765453/1‑93 (MQ=255)
tGGATATAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGt < 2:2940759/93‑1 (MQ=255)
ggATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGtt < 1:4306150/93‑1 (MQ=255)
gATTTAACGCCGGCGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGttt > 1:5152099/1‑93 (MQ=255)
gATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGttt > 2:1160582/1‑93 (MQ=255)
aTTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTa < 2:5612956/93‑1 (MQ=255)
aTTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTa < 2:2167467/93‑1 (MQ=255)
aaCGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCAt < 2:1239635/93‑1 (MQ=255)
aCGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCAtt > 1:1877184/1‑93 (MQ=255)
ccGACGTTATTAATACTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAAc < 1:5897255/93‑1 (MQ=255)
gACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTg > 2:4693940/1‑93 (MQ=255)
aCGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGc > 1:2535131/1‑93 (MQ=255)
aCGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGc < 1:3286834/93‑1 (MQ=255)
tATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTCaa < 2:971146/93‑1 (MQ=255)
tATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTCaa < 2:5253856/93‑1 (MQ=255)
aTTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTCAAt < 1:2073660/93‑1 (MQ=255)
aTTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTCAAt < 1:4085291/93‑1 (MQ=255)
ttAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTCAATc > 2:961054/1‑93 (MQ=255)
ttAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTCAATc < 2:6380920/93‑1 (MQ=255)
ttAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTCAATc < 1:3495575/93‑1 (MQ=255)
tAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTCAATCg < 2:2948892/93‑1 (MQ=255)
tAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACCGCTCAATCg < 2:4918655/93‑1 (MQ=255)
aTTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTCAATTGGc > 1:1156687/1‑93 (MQ=255)
aTTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTCAATCGGc < 1:2688611/93‑1 (MQ=255)
aTTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTCAATCGGc < 2:3638088/93‑1 (MQ=255)
ttCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTCAATCGGCt < 2:5673325/93‑1 (MQ=255)
ttACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTCAATCGGCTTaa > 2:5040079/1‑93 (MQ=255)
ttACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTCAATCGGCTTaa < 1:3225355/93‑1 (MQ=255)
tACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTCAATCGGCTTAAt < 2:4515368/93‑1 (MQ=255)
aCCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTCAATCGGCTTAAtt > 2:64082/1‑93 (MQ=255)
ccccGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTa > 1:5105471/1‑93 (MQ=255)
cccGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTac > 2:1126537/1‑93 (MQ=255)
cccGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTac > 1:6354861/1‑93 (MQ=255)
cGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTacac < 2:3479411/93‑1 (MQ=255)
|
CGCGTCTGCTGTTTATCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGTATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTACAC > NC_000913/3743367‑3743546
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CACCGCGTCTGCTGTTTATCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGTATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCC > NC_000913/3743364‑3743550
|
CACCGCGTCTGCTGTTTATCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGC > SRR4302534.208784/1‑94 (MQ=60)
ACCGCGTCTGCTGTTTATCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCA > SRR4302534.5889814/1‑94 (MQ=60)
CCGCGTCTGCTGTTTATCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCAT < SRR4302534.4962789/94‑1 (MQ=60)
CCGCGTCTGCTGTTTATCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCAT > SRR4302534.1226423/1‑94 (MQ=60)
GCGTCTGCTGTTTATCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTA > SRR4302534.1110275/1‑94 (MQ=60)
GCGTCTGCTGTTTATCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTA < SRR4302534.4240318/94‑1 (MQ=60)
GTCTGCTGTTTATCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAAT > SRR4302534.4994153/1‑94 (MQ=60)
GTCTGCTGTTTATCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAAT < SRR4302534.57636/94‑1 (MQ=60)
CTGCTGTTTATCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGC < SRR4302534.216118/94‑1 (MQ=60)
GCTGTTTATCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCT < SRR4302534.1591434/94‑1 (MQ=60)
GCTGTTTATCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCT > SRR4302534.1692461/1‑94 (MQ=60)
CTGTTTATCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTT > SRR4302534.5463438/1‑94 (MQ=60)
TGTTTATCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTT > SRR4302534.6307976/1‑94 (MQ=60)
GTTTATCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTA < SRR4302534.6021112/94‑1 (MQ=60)
GTTTATCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTA < SRR4302534.5974470/94‑1 (MQ=60)
GTTTATCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTA > SRR4302534.386756/1‑94 (MQ=60)
TTTATCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAG < SRR4302534.4874165/94‑1 (MQ=60)
TTTATCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAG < SRR4302534.1769641/94‑1 (MQ=60)
TTTATCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGAAGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAG > SRR4302534.927309/1‑94 (MQ=60)
TTATCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGT < SRR4302534.5927871/94‑1 (MQ=60)
TATCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTT > SRR4302534.6440071/1‑94 (MQ=60)
TATCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTT > SRR4302534.1258541/1‑94 (MQ=60)
TATCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTT < SRR4302534.6086047/94‑1 (MQ=60)
TATCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTT > SRR4302534.2388836/1‑94 (MQ=60)
ATCGTCATAATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCAACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTA < SRR4302534.4229100/94‑1 (MQ=60)
TCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAA < SRR4302534.3978506/94‑1 (MQ=60)
TCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAA < SRR4302534.4287623/94‑1 (MQ=60)
CGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAA > SRR4302534.2505644/1‑94 (MQ=60)
GTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAG < SRR4302534.5396804/94‑1 (MQ=60)
CATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAG < SRR4302534.6037327/94‑1 (MQ=60)
ATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGG < SRR4302534.579605/94‑1 (MQ=60)
TATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCA < SRR4302534.5087129/94‑1 (MQ=60)
TATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCA < SRR4302534.3602189/94‑1 (MQ=60)
TATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCA < SRR4302534.333341/94‑1 (MQ=60)
ATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAG < SRR4302534.395495/94‑1 (MQ=60)
ATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAG < SRR4302534.526877/94‑1 (MQ=60)
TGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAAT > SRR4302534.5324777/1‑94 (MQ=60)
GGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATC < SRR4302534.1900625/94‑1 (MQ=60)
GGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATC > SRR4302534.751800/1‑94 (MQ=60)
GCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCG < SRR4302534.3566016/94‑1 (MQ=60)
TATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGAT > SRR4302534.2865446/1‑94 (MQ=60)
TATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGAT > SRR4302534.1138457/1‑94 (MQ=60)
ATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATC < SRR4302534.1150253/94‑1 (MQ=60)
TCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCC < SRR4302534.671519/94‑1 (MQ=60)
TCCTCATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTTCCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCC < SRR4302534.317560/94‑1 (MQ=60)
CCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCG < SRR4302534.2113259/94‑1 (MQ=60)
CTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGA < SRR4302534.400526/94‑1 (MQ=60)
CTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGA > SRR4302534.1432184/1‑94 (MQ=60)
CTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGA > SRR4302534.3802706/1‑94 (MQ=60)
TGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGAT < SRR4302534.3247999/94‑1 (MQ=60)
TGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGAT < SRR4302534.1886355/94‑1 (MQ=60)
ATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTT > SRR4302534.1377575/1‑94 (MQ=60)
ATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTT > SRR4302534.1744761/1‑94 (MQ=60)
ATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAAAGCAGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATAGATCCGggtt > SRR4302534.4758445/1‑90 (MQ=60)
TCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTT < SRR4302534.6087304/94‑1 (MQ=60)
GGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCG > SRR4302534.6218714/1‑94 (MQ=60)
GGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCG < SRR4302534.840918/94‑1 (MQ=60)
gatgcTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGT < SRR4302534.623284/89‑1 (MQ=60)
CATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGT < SRR4302534.5704221/94‑1 (MQ=60)
ATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTG > SRR4302534.4427727/1‑94 (MQ=60)
ATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTG < SRR4302534.2579660/94‑1 (MQ=60)
ATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTG > SRR4302534.856992/1‑94 (MQ=60)
TGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGT < SRR4302534.141692/94‑1 (MQ=60)
TCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCAT > SRR4302534.4601841/1‑94 (MQ=60)
ATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGT > SRR4302534.1498520/1‑94 (MQ=60)
ATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGT > SRR4302534.1811288/1‑94 (MQ=60)
ATGCATTTAGCGCCGACGGTATTAATTCTTCCCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGT < SRR4302534.5615475/94‑1 (MQ=60)
TGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTT < SRR4302534.4373277/94‑1 (MQ=60)
GGATTTAACGCCGGCGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTT > SRR4302534.5291077/1‑94 (MQ=60)
GGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTT < SRR4302534.4422871/94‑1 (MQ=60)
GGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTT > SRR4302534.4981220/1‑94 (MQ=60)
TTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATC < SRR4302534.2186105/94‑1 (MQ=60)
TTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATC < SRR4302534.21582/94‑1 (MQ=60)
TAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCAT < SRR4302534.383226/94‑1 (MQ=60)
TAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCAT > SRR4302534.2651710/1‑94 (MQ=60)
TAACGCCGACGGTATTAATTCTAACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCAT > SRR4302534.4202252/1‑94 (MQ=60)
AACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATT > SRR4302534.4837030/1‑94 (MQ=60)
AACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATT > SRR4302534.1926060/1‑94 (MQ=60)
CCGACGTTATTAATACTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACT < SRR4302534.6057376/94‑1 (MQ=60)
CCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACT < SRR4302534.398698/94‑1 (MQ=60)
CCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACT < SRR4302534.165681/94‑1 (MQ=60)
CCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCAGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACT < SRR4302534.2823180/94‑1 (MQ=60)
CGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTG > SRR4302534.4955486/1‑94 (MQ=60)
CGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTG < SRR4302534.4707270/94‑1 (MQ=60)
CGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTG < SRR4302534.711023/94‑1 (MQ=60)
GACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGC > SRR4302534.712522/1‑94 (MQ=60)
GACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGC > SRR4302534.2602415/1‑94 (MQ=60)
ACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCT < SRR4302534.3374468/94‑1 (MQ=60)
TATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTCAAT > SRR4302534.6532429/1‑94 (MQ=60)
ATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTCAATC < SRR4302534.4306655/94‑1 (MQ=60)
ATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTCAATC < SRR4302534.4194990/94‑1 (MQ=60)
ATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTCAATC < SRR4302534.2127927/94‑1 (MQ=60)
TTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTCAATCG < SRR4302534.374296/94‑1 (MQ=60)
TTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTCAATCG < SRR4302534.3589573/94‑1 (MQ=60)
AATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTCAATTGGC > SRR4302534.1187016/1‑94 (MQ=60)
ATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTCAATCGGCT < SRR4302534.2759665/94‑1 (MQ=60)
CTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTCAATCGGCTTAA > SRR4302534.766982/1‑94 (MQ=60)
TTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTCAATCGGCTTAAT > SRR4302534.111720/1‑94 (MQ=60)
TTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTCAATCGGCTTAAT > SRR4302534.2103310/1‑94 (MQ=60)
TTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTCAATCGGCTTAAT < SRR4302534.3311031/94‑1 (MQ=60)
ACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTA > SRR4302534.5243252/1‑94 (MQ=60)
CCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTAC > SRR4302534.6526485/1‑94 (MQ=60)
CGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTACACC < SRR4302534.1868708/94‑1 (MQ=60)
CGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTACACC > SRR4302534.1445277/1‑94 (MQ=60)
GGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCG < SRR4302534.2610849/94‑1 (MQ=60)
GGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCG < SRR4302534.5372445/94‑1 (MQ=60)
GCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTCCATCGGCTTAATTACACCGC > SRR4302534.1992546/1‑94 (MQ=60)
CATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCC > SRR4302534.1576055/1‑94 (MQ=60)
|
CACCGCGTCTGCTGTTTATCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGTATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCC > NC_000913/3743364‑3743550
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
