Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
884 |
257.2 |
12958910 |
96.9% |
12557183 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,979,535 |
+G |
coding (1036/1386 nt) |
yifK → |
putative amino acid/amine transport protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,979,534 | 1 | . | G | 99.5%
| 750.2
/ ‑4.0
| 212 | coding (1035/1386 nt) | yifK | putative amino acid/amine transport protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/1); new base G (105/106); total (105/107) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.79e-01 |
Only 100 of 227 total aligned reads displayed.
AAAAACCGTCAGTTACCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATT‑GCTCATGCCTGGAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCAT > NC_000913/3979442‑3979622
|
aaaaaCCGTCAGTTACCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAAtt > 1:4542656/1‑93 (MQ=255)
aaaaaCCGTCAGTTACCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAAtt < 1:5280029/93‑1 (MQ=255)
aaaCCGTCAGTTACCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATT‑gg < 2:4091412/93‑2 (MQ=255)
aCCGTCAGTTACCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATT‑ggct < 1:3395341/93‑4 (MQ=255)
ccGTCAGTTACCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATT‑ggctc < 2:5104730/93‑5 (MQ=255)
ccGTCAGTTACCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATT‑ggctc > 1:2933208/1‑89 (MQ=255)
ccGTCAGTTACCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATT‑ggctc > 2:3980778/1‑89 (MQ=255)
gTCAGTTACCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCAt > 2:5931811/1‑93 (MQ=255)
gTCAGTTACCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCAt > 2:3690866/1‑93 (MQ=255)
cAGTTACCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGc > 2:2687953/1‑93 (MQ=255)
aGTTACCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGcc < 2:3408440/93‑1 (MQ=255)
gTTACCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCt > 1:5683980/1‑93 (MQ=255)
gTTACCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCt < 1:5481468/93‑1 (MQ=255)
gTTACCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCt < 2:4242432/93‑1 (MQ=255)
ccGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCTgaac < 2:3564672/93‑4 (MQ=255)
ggcggcAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTa > 2:3282833/1‑93 (MQ=255)
cggcAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTAca < 1:1033505/93‑1 (MQ=255)
ggcAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTAcat > 2:4875410/1‑93 (MQ=255)
ggcAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTAcat > 1:5108176/1‑93 (MQ=255)
ggcAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTAcat < 1:890269/93‑1 (MQ=255)
gcAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTAcatc > 1:688879/1‑93 (MQ=255)
aaTGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTAcatcat < 1:6285373/93‑1 (MQ=255)
aaTGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTAcatcat > 2:2753772/1‑93 (MQ=255)
aaTGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTAcatcat < 1:4769035/93‑1 (MQ=255)
aaTGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTAcatcat < 1:4588779/93‑1 (MQ=255)
aTGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCAtt < 2:222462/93‑1 (MQ=255)
aTGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCAtt > 2:5588191/1‑93 (MQ=255)
aTGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCAtt > 2:874304/1‑93 (MQ=255)
aTGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGCTGCGGGCGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCAtt > 2:2016606/1‑93 (MQ=255)
tGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTc > 1:436297/1‑93 (MQ=255)
tGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTc < 1:4073973/93‑1 (MQ=255)
tGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTc < 1:2681457/93‑1 (MQ=255)
ggCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTcc > 2:5217592/1‑93 (MQ=255)
ggCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTcc < 2:4716349/93‑1 (MQ=255)
ggCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTcc > 2:6028049/1‑93 (MQ=255)
cGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCa < 2:1177408/93‑1 (MQ=255)
gAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCaa > 1:1507748/1‑93 (MQ=255)
gAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCaa > 1:2312496/1‑93 (MQ=255)
aaaGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAAt < 1:3037603/93‑1 (MQ=255)
aaGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATc < 2:727435/93‑1 (MQ=255)
aaGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATc < 1:4213283/93‑1 (MQ=255)
aGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATcc < 2:3325565/93‑1 (MQ=255)
gTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCg > 1:6250707/1‑93 (MQ=255)
tCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAg > 1:3632997/1‑93 (MQ=255)
cccGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGc < 1:5019353/93‑1 (MQ=255)
cccGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGc > 1:3475910/1‑93 (MQ=255)
cGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCgt < 2:2963462/93‑1 (MQ=255)
gTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCgtg > 1:2379812/1‑93 (MQ=255)
gTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCgtg > 2:382350/1‑93 (MQ=255)
gTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCgtg > 1:2248437/1‑93 (MQ=255)
gTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCgtg < 2:2513305/93‑1 (MQ=255)
cACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCgtgtg > 1:5228852/1‑93 (MQ=255)
ccGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCgtgtgt < 1:3892323/92‑1 (MQ=255)
aCGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCgtgtgt > 2:2955182/1‑93 (MQ=255)
aCGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCgtgtgt > 2:1638945/1‑93 (MQ=255)
aCGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCgtgtgt < 1:4126819/93‑1 (MQ=255)
cGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGtt < 2:5800763/93‑1 (MQ=255)
cGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGtt < 1:1919374/93‑1 (MQ=255)
cGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTgt < 2:4298014/93‑1 (MQ=255)
gTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTgtc > 2:16773/1‑93 (MQ=255)
gTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTgtc < 1:793215/93‑1 (MQ=255)
tACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTgtct > 2:1716961/1‑93 (MQ=255)
tACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTgtct < 1:1656122/93‑1 (MQ=255)
tccGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTgtcta < 2:847283/92‑1 (MQ=255)
aCCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTgtcta > 1:1229037/1‑93 (MQ=255)
aCCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTgtcta > 2:621166/1‑93 (MQ=255)
gTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTgtctacgtc > 2:23867/1‑93 (MQ=255)
gTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTgtctacgtc > 2:6156759/1‑93 (MQ=255)
tGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTgtctccgtcta > 1:960009/1‑93 (MQ=255)
cGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACa < 1:2519617/93‑1 (MQ=255)
gggTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAg < 2:4596967/93‑1 (MQ=255)
gggTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAg > 1:4245812/1‑93 (MQ=255)
ggggtgGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGt < 1:2362338/90‑1 (MQ=255)
ggTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGt > 2:1427051/1‑93 (MQ=255)
ggTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGt > 2:2911258/1‑93 (MQ=255)
gtgGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGcc < 2:3011287/93‑1 (MQ=255)
gtgGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGcc < 2:2560626/93‑1 (MQ=255)
tgGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCa > 2:2194870/1‑93 (MQ=255)
ggCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAg > 1:2723106/1‑93 (MQ=255)
gCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGc < 1:5770205/93‑1 (MQ=255)
gCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGc > 1:219014/1‑93 (MQ=255)
aGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGt < 2:17216/93‑1 (MQ=255)
aGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGt > 1:3971735/1‑93 (MQ=255)
tATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGc < 2:2331437/93‑1 (MQ=255)
tCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCtt > 2:5464751/1‑93 (MQ=255)
tCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCtt < 2:1257685/93‑1 (MQ=255)
cTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTc < 1:1110947/93‑1 (MQ=255)
tATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTcc > 2:307105/1‑93 (MQ=255)
tATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTGTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTcc < 1:6023974/93‑1 (MQ=255)
tGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCggg < 2:2128766/93‑1 (MQ=255)
cTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGa < 1:2043895/93‑1 (MQ=255)
tATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGAt < 1:3361288/93‑1 (MQ=255)
tATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGAt > 1:1743280/1‑93 (MQ=255)
aTTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATg < 2:4637211/93‑1 (MQ=255)
aTTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATg > 1:4910233/1‑93 (MQ=255)
aTTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATg > 1:1142890/1‑93 (MQ=255)
tCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGt < 2:6259003/93‑1 (MQ=255)
cTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTg > 2:3532284/1‑93 (MQ=255)
cTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTg < 2:1312250/93‑1 (MQ=255)
tAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCAt < 2:6333462/93‑1 (MQ=255)
|
AAAAACCGTCAGTTACCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATT‑GCTCATGCCTGGAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCAT > NC_000913/3979442‑3979622
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
AAAAACCGTCAGTTACCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATT‑G‑CTCATGCCTGGAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTTG > NC_000913/3979442‑3979628
|
AAAAACCGTCAGTTACCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATT‑G < SRR4302534.5422598/94‑1 (MQ=60)
AAAACCGTCCGCTACCGGAGGCAATGGCGCAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGGTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGGTAATT‑G‑A > SRR4302534.1238679/1‑94 (MQ=60)
AAAACCGTCAGTTACCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATT‑G‑G < SRR4302534.1146505/94‑1 (MQ=60)
AAACCGTCAGTTACCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGGGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATT‑Ggc > SRR4302534.4209466/1‑92 (MQ=60)
ACCGTCAGTTACCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTC > SRR4302534.3010206/1‑94 (MQ=60)
ACCGTCAGTTACCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTC < SRR4302534.3486449/94‑1 (MQ=60)
GTCAGTTACCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATG < SRR4302534.5809353/94‑1 (MQ=60)
CAGTTACCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCC > SRR4302534.4822682/1‑94 (MQ=60)
CAGTTACCGGCGGCAATGGCGAAAGGTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGCATCTATTTCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCC > SRR4302534.2350402/1‑94 (MQ=60)
AGTTACCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT > SRR4302534.5837903/1‑94 (MQ=60)
AGTTACCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGCACCGGTTGCGGGAGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT > SRR4302534.3228083/1‑94 (MQ=60)
GTTACCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCTG < SRR4302534.5629288/94‑1 (MQ=60)
TTACCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCTGA > SRR4302534.3112019/1‑94 (MQ=60)
ACCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAAC < SRR4302534.2252503/94‑1 (MQ=60)
CCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACT > SRR4302534.641345/1‑94 (MQ=60)
GGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTAC > SRR4302534.4358210/1‑94 (MQ=60)
CGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACAT < SRR4302534.1060173/94‑1 (MQ=60)
CGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACAT > SRR4302534.5246026/1‑94 (MQ=60)
ggcgcTGGCGAAAATTTCCCGTCGCGGCGTATCGGTGGCGGGTGTGCCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATC < SRR4302534.4357671/89‑1 (MQ=55)
GGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATC < SRR4302534.912809/94‑1 (MQ=60)
GGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATC > SRR4302534.705719/1‑94 (MQ=60)
GGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATC < SRR4302534.5874248/94‑1 (MQ=60)
AATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATT > SRR4302534.235054/1‑94 (MQ=60)
AATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATT < SRR4302534.4898514/94‑1 (MQ=60)
AATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATT < SRR4302534.4713312/94‑1 (MQ=60)
AATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATT > SRR4302534.1603681/1‑94 (MQ=60)
AATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATT < SRR4302534.6455430/94‑1 (MQ=60)
ATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTC > SRR4302534.2926820/1‑94 (MQ=60)
ATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTC > SRR4302534.447415/1‑94 (MQ=60)
ATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTC > SRR4302534.4955315/1‑94 (MQ=60)
TGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCC < SRR4302534.4183309/94‑1 (MQ=60)
TGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCC < SRR4302534.3974814/94‑1 (MQ=60)
TGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCC < SRR4302534.2752341/94‑1 (MQ=60)
GCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCA > SRR4302534.4192885/1‑94 (MQ=60)
CGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAA > SRR4302534.2373861/1‑94 (MQ=60)
CGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAA < SRR4302534.1767531/94‑1 (MQ=60)
CGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAA > SRR4302534.1547407/1‑94 (MQ=60)
AAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATC > SRR4302534.3329289/1‑94 (MQ=60)
AAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATC < SRR4302534.3117255/94‑1 (MQ=60)
AAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCC < SRR4302534.4326924/94‑1 (MQ=60)
AAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCC < SRR4302534.878043/94‑1 (MQ=60)
AAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAAATACATCATTCCCAATCC > SRR4302534.2388117/1‑94 (MQ=60)
AGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCG < SRR4302534.3453367/94‑1 (MQ=60)
AGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCG > SRR4302534.6420191/1‑94 (MQ=60)
GTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGC > SRR4302534.2735813/1‑94 (MQ=60)
TTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAG > SRR4302534.3730650/1‑94 (MQ=60)
TTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAG < SRR4302534.1210732/94‑1 (MQ=60)
TCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGC > SRR4302534.3569342/1‑94 (MQ=60)
CCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCG < SRR4302534.5154971/94‑1 (MQ=60)
CGTCACGGCGTGCCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTG < SRR4302534.1073142/94‑1 (MQ=60)
CGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTG > SRR4302534.2443043/1‑94 (MQ=60)
CGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTG > SRR4302534.2308028/1‑94 (MQ=60)
TCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTG > SRR4302534.5370014/1‑94 (MQ=60)
TCACGGCGTACCGGGTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTG > SRR4302534.5552779/1‑94 (MQ=60)
CCGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTT < SRR4302534.3996807/94‑1 (MQ=60)
ACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTT < SRR4302534.5177123/94‑1 (MQ=60)
ACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTT > SRR4302534.505572/1‑94 (MQ=60)
ACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTT < SRR4302534.4237940/94‑1 (MQ=60)
CGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTT < SRR4302534.1969555/94‑1 (MQ=60)
CGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTC > SRR4302534.645256/1‑94 (MQ=60)
GTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCT > SRR4302534.1980272/1‑94 (MQ=60)
GTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCT < SRR4302534.813091/94‑1 (MQ=60)
GTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCT < SRR4302534.5095545/94‑1 (MQ=60)
TACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTA < SRR4302534.1699287/94‑1 (MQ=60)
TACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTA > SRR4302534.1261398/1‑94 (MQ=60)
TACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTA < SRR4302534.2468744/94‑1 (MQ=60)
ACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTAC < SRR4302534.5509109/94‑1 (MQ=60)
ACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTAC > SRR4302534.2163861/1‑94 (MQ=60)
CGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGT > SRR4302534.4366181/1‑94 (MQ=60)
TTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTCCGTCTA > SRR4302534.984463/1‑94 (MQ=60)
TTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTA < SRR4302534.1874954/94‑1 (MQ=60)
GCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACA > SRR4302534.3667838/1‑94 (MQ=60)
GCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACA < SRR4302534.4538647/94‑1 (MQ=60)
CGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAG > SRR4302534.4360321/1‑94 (MQ=60)
CGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAG < SRR4302534.4126494/94‑1 (MQ=60)
CGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAG > SRR4302534.6055773/1‑94 (MQ=60)
CGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAG < SRR4302534.2586508/94‑1 (MQ=60)
GGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGT < SRR4302534.1390161/94‑1 (MQ=60)
GGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGT < SRR4302534.4294731/94‑1 (MQ=60)
GGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGT < SRR4302534.794529/94‑1 (MQ=60)
GGGGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTG < SRR4302534.2425045/94‑1 (MQ=60)
TGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCC > SRR4302534.353963/1‑94 (MQ=60)
TGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAG > SRR4302534.2794957/1‑94 (MQ=60)
GGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGC > SRR4302534.224756/1‑94 (MQ=60)
GGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGC < SRR4302534.925190/94‑1 (MQ=60)
GCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCG < SRR4302534.5926737/94‑1 (MQ=60)
GCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCG < SRR4302534.78186/94‑1 (MQ=60)
CAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGT > SRR4302534.4078041/1‑94 (MQ=60)
GTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGC < SRR4302534.150020/94‑1 (MQ=60)
GTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGC < SRR4302534.3240905/94‑1 (MQ=60)
CTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCC < SRR4302534.1139929/94‑1 (MQ=60)
TATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTGTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCG < SRR4302534.6187687/94‑1 (MQ=60)
ATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGG > SRR4302534.5411990/1‑94 (MQ=60)
ATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGG > SRR4302534.4017706/1‑94 (MQ=60)
TGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGG < SRR4302534.2756116/94‑1 (MQ=60)
TCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGA < SRR4302534.6173158/94‑1 (MQ=60)
GCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGA < SRR4302534.5342933/94‑1 (MQ=60)
GCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGA > SRR4302534.2438412/1‑94 (MQ=60)
GCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGA > SRR4302534.1974337/1‑94 (MQ=60)
CTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGAT > SRR4302534.1788525/1‑94 (MQ=60)
CTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGAT < SRR4302534.2097319/94‑1 (MQ=60)
CTATTCTGCTAATT‑GCCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGAT < SRR4302534.4520742/94‑1 (MQ=60)
TATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATG < SRR4302534.3451321/94‑1 (MQ=60)
TATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATG > SRR4302534.5043316/1‑94 (MQ=60)
TATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATG > SRR4302534.1172815/1‑94 (MQ=60)
ATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGG > SRR4302534.629013/1‑94 (MQ=60)
TTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGT < SRR4302534.559292/94‑1 (MQ=60)
TTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGT < SRR4302534.376137/94‑1 (MQ=60)
GCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCA > SRR4302534.2746924/1‑94 (MQ=60)
CTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCAT > SRR4302534.2391154/1‑94 (MQ=60)
TAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATG > SRR4302534.4017550/1‑94 (MQ=60)
TAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATG > SRR4302534.313806/1‑94 (MQ=60)
AATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGGTGGTGCCATGG > SRR4302534.2028522/1‑94 (MQ=60)
AATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGG > SRR4302534.2076220/1‑94 (MQ=60)
AATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGG < SRR4302534.3298941/94‑1 (MQ=60)
ATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGT < SRR4302534.4729856/94‑1 (MQ=60)
ATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGT > SRR4302534.3823819/1‑94 (MQ=60)
ATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGT < SRR4302534.2231516/94‑1 (MQ=60)
ATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGT > SRR4302534.3242175/1‑94 (MQ=60)
ATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGT < SRR4302534.1835373/94‑1 (MQ=60)
ttgG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTT < SRR4302534.3944386/91‑1 (MQ=60)
TG‑G‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTT > SRR4302534.1011974/1‑94 (MQ=60)
TG‑G‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTT > SRR4302534.159286/1‑94 (MQ=60)
G‑G‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTGCGGGGATGGTGCCATGGTTTG > SRR4302534.5842239/1‑94 (MQ=60)
G‑G‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTTG > SRR4302534.2688796/1‑94 (MQ=60)
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AAAAACCGTCAGTTACCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATT‑G‑CTCATGCCTGGAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTTG > NC_000913/3979442‑3979628
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
