Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
884 |
257.2 |
12958910 |
96.9% |
12557183 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,027,599 |
T→C |
A321A (GCA→GCG) |
fadB ← |
4‑enzyme protein: 3‑hydroxyacyl‑CoA dehydrogenase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,027,599 | 0 | T | C | 99.6%
| 853.6
/ ‑5.6
| 246 | A321A (GCA→GCG) | fadB | 4‑enzyme protein: 3‑hydroxyacyl‑CoA dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/0); new base C (112/133); total (113/133) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.59e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.94e-01 |
Only 100 of 254 total aligned reads displayed.
GAGGGTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCTGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCTTTTACATATTGATCGTTAAGGAAAAT > NC_000913/4027509‑4027688
|
gAGGGTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGc > 2:362567/1‑93 (MQ=255)
gAGGGTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCAGc > 2:2013283/1‑93 (MQ=255)
aGGGTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCa > 2:4804007/1‑93 (MQ=255)
gggTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCAc > 1:6196598/1‑93 (MQ=255)
ggTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCAcc < 2:3044255/93‑1 (MQ=255)
gTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCAccc < 1:2473635/93‑1 (MQ=255)
ttAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCa > 1:615977/1‑93 (MQ=255)
tAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAg > 1:4421325/1‑93 (MQ=255)
aCGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCa > 1:1012522/1‑93 (MQ=255)
gACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCAcc < 2:3705305/93‑1 (MQ=255)
cTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACcgc > 1:5731624/1‑93 (MQ=255)
ttGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACcgcg < 1:2368827/93‑1 (MQ=255)
cGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCt < 1:1341976/93‑1 (MQ=255)
gTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTg < 2:1310109/93‑1 (MQ=255)
gTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTg > 1:949085/1‑93 (MQ=255)
ttGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGt > 1:3887061/1‑93 (MQ=255)
tGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGtt < 2:5794225/93‑1 (MQ=255)
tGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGtt > 1:4979682/1‑93 (MQ=255)
atatCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTc > 1:5222529/1‑93 (MQ=255)
atCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCgg < 2:3548574/93‑1 (MQ=255)
tCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCggg > 2:551315/1‑93 (MQ=255)
ttCATGACACCCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGtt < 1:1763832/93‑1 (MQ=255)
ttCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGtt < 1:5010056/93‑1 (MQ=255)
aTGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCa < 2:1109750/93‑1 (MQ=255)
tGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCaa < 2:2583706/93‑1 (MQ=255)
gACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAAc < 1:26153/93‑1 (MQ=255)
gACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAAc > 2:6462114/1‑93 (MQ=255)
gACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAAc > 1:1112472/1‑93 (MQ=255)
aCAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGCTTCAACg > 2:223904/1‑93 (MQ=255)
cAACCGGCCCGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCCATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGt < 2:156846/93‑1 (MQ=255)
aCCGGCACCCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCt > 1:4633386/1‑93 (MQ=255)
ccGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCtt < 1:2281836/93‑1 (MQ=255)
ccGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCtt < 2:1730495/93‑1 (MQ=255)
cGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCttt < 1:3247914/93‑1 (MQ=255)
ggCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCTGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTg > 2:5363828/1‑93 (MQ=255)
ggCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTg < 1:2734718/93‑1 (MQ=255)
gCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTgg > 2:241265/1‑93 (MQ=255)
cACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGt < 1:3375683/93‑1 (MQ=255)
cACGCCTTTCCACCCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGt < 1:1876180/93‑1 (MQ=255)
aCGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTg < 1:5084587/93‑1 (MQ=255)
aCGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTg > 2:3535234/1‑93 (MQ=255)
aCGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCCCCCATAATGCCCGCACTCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGAGTTCCAACGTCTTTGGTg > 1:3577947/1‑93 (MQ=255)
cGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGa < 2:5113719/93‑1 (MQ=255)
cGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGa < 2:5195248/93‑1 (MQ=255)
gCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAg < 2:1760745/93‑1 (MQ=255)
gCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAg < 2:4165690/93‑1 (MQ=255)
ccTTTCCCCGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGt < 2:4966444/93‑1 (MQ=255)
cTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGTCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTCTCGGGGTTTCTACGTCTTTGGTGAGtt > 1:6474991/1‑93 (MQ=255)
cTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGtt < 2:2937637/93‑1 (MQ=255)
tttCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGTGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGttt > 2:4293790/1‑93 (MQ=255)
tttCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGttt < 2:1362387/93‑1 (MQ=255)
ttCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTttc > 2:290085/1‑93 (MQ=255)
ttCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTttc < 2:5908907/93‑1 (MQ=255)
ttCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTttc < 2:6440411/93‑1 (MQ=255)
tCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTttct > 2:468320/1‑93 (MQ=255)
ccACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTttctt < 2:6193191/93‑1 (MQ=255)
cACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTttcttc < 1:1690935/93‑1 (MQ=255)
cGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGc < 2:2034601/93‑1 (MQ=255)
gCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCt < 1:2245098/93‑1 (MQ=255)
gCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCt < 1:3777522/93‑1 (MQ=255)
cAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCtt < 1:3040229/93‑1 (MQ=255)
cAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCtt < 1:3747475/93‑1 (MQ=255)
aGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCttt > 2:5505322/1‑93 (MQ=255)
aGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCttt < 1:73822/93‑1 (MQ=255)
aGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCttt > 2:2428744/1‑93 (MQ=255)
aGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCttt > 1:3495816/1‑93 (MQ=255)
gACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTg > 2:5219221/1‑93 (MQ=255)
aCTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGc < 2:6321379/93‑1 (MQ=255)
tGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCt > 1:2915053/1‑93 (MQ=255)
ggTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCtt > 2:4606286/1‑93 (MQ=255)
ggTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCtt > 2:3139535/1‑93 (MQ=255)
ggTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCtt < 1:6109879/93‑1 (MQ=255)
gTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCGGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCttt > 2:559589/1‑93 (MQ=255)
aGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCTTTTAc < 1:3662808/93‑1 (MQ=255)
aGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCTTTTAc > 2:4109103/1‑93 (MQ=255)
aGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTATCTTCGCTTTGCCTTTTAc < 1:6324901/93‑1 (MQ=255)
gCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCTTTTACa < 1:5337591/93‑1 (MQ=255)
aTGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCTTTTACatat > 1:2806064/1‑93 (MQ=255)
aTGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCTTTTACatat < 1:137638/93‑1 (MQ=255)
ccgccgccCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCTTTTACATATTGa < 1:1510645/93‑1 (MQ=255)
ccgccgccCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCTTTTACATATTGa > 2:1830281/1‑93 (MQ=255)
gccgccCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCTTTTACATATTGATc > 2:796863/1‑93 (MQ=255)
cgccCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCTTTTACATATTGATCGt < 1:5899005/93‑1 (MQ=255)
cgccCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCTTTTACATATTGATCGt < 1:15464/93‑1 (MQ=255)
gccCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCTTTTACATATTGATCGtt > 1:3999045/1‑93 (MQ=255)
cccATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCTTTTACATATTGATCGTTa < 1:3870091/93‑1 (MQ=255)
cccATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCTTTTACATATTGATCGTTa > 2:5161616/1‑93 (MQ=255)
cccATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCTTTTACATATTGATCGTTa > 1:1837198/1‑93 (MQ=255)
ccATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGTGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCTTTTACATATTGATCGTTaa < 1:2521961/93‑1 (MQ=255)
ccATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCTTTTACATATTGATCGTTaa < 1:5483055/93‑1 (MQ=255)
ccATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCTTTTACATATTGATCGTTaa > 1:4782636/1‑93 (MQ=255)
ccATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCTTTTACATATTGATCGTTaa < 2:4457339/93‑1 (MQ=255)
cATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCTTTTACATATTGATCGTTAAg < 1:4097583/93‑1 (MQ=255)
cATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCTTTTACATATTGATCGTTAAg < 2:277515/93‑1 (MQ=255)
tAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCTTTTACATATTGATCGTTAAGGa > 1:6328354/1‑93 (MQ=255)
aaTGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCTTTTACATATTGATCGTTAAGGaa > 1:4190131/1‑93 (MQ=255)
aTGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCTTTTACATATTGATCGTTAAGGaaa > 1:782016/1‑93 (MQ=255)
tGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCTTTTACATATTGATCGTTAAGGaaaa < 2:3847177/93‑1 (MQ=255)
tGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCTTTTACATATTGATCGTTAAGGaaaa < 2:57228/93‑1 (MQ=255)
tGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCTTTTACATATTGATCGTTAAGGaaaa < 1:4319236/93‑1 (MQ=255)
|
GAGGGTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCTGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCTTTTACATATTGATCGTTAAGGAAAAT > NC_000913/4027509‑4027688
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GCCGAGGGTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCTGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCTTTTACATATTGATCGTTAAGGAAAATGCC > NC_000913/4027506‑4027691
|
GCCGAGGGTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCC < SRR4302534.4179475/94‑1 (MQ=60)
CCGAGGGTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCG > SRR4302534.4251311/1‑94 (MQ=60)
CCGAGGGTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCG < SRR4302534.1624260/94‑1 (MQ=60)
CGAGGGTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGC > SRR4302534.3462416/1‑94 (MQ=60)
CGAGGGTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGC > SRR4302534.5214117/1‑94 (MQ=60)
GAGGGTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCA > SRR4302534.1405396/1‑94 (MQ=60)
GAGGGTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCA > SRR4302534.2512647/1‑94 (MQ=60)
AGGGTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCAC > SRR4302534.6365179/1‑94 (MQ=60)
GGTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCC > SRR4302534.1838632/1‑94 (MQ=60)
GTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCA > SRR4302534.630932/1‑94 (MQ=60)
GTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCA < SRR4302534.2539366/94‑1 (MQ=60)
TTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATTATGCCCGCACCCAG > SRR4302534.1877550/1‑94 (MQ=60)
TTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAG < SRR4302534.5175469/94‑1 (MQ=60)
TTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAG > SRR4302534.4540688/1‑94 (MQ=60)
TAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGC < SRR4302534.963972/94‑1 (MQ=60)
TAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGC > SRR4302534.2440606/1‑94 (MQ=60)
AACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCA > SRR4302534.1038575/1‑94 (MQ=60)
CGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACC < SRR4302534.4516598/94‑1 (MQ=60)
CGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACC > SRR4302534.3859026/1‑94 (MQ=60)
CGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACC > SRR4302534.4245398/1‑94 (MQ=60)
ACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGC > SRR4302534.5331186/1‑94 (MQ=60)
ACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGC < SRR4302534.3749279/94‑1 (MQ=60)
ACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGC > SRR4302534.5886938/1‑94 (MQ=60)
CTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCG > SRR4302534.6431197/1‑94 (MQ=60)
CTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCG > SRR4302534.1025470/1‑94 (MQ=60)
TTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGG < SRR4302534.2431718/94‑1 (MQ=60)
TGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGC > SRR4302534.4127856/1‑94 (MQ=60)
GTCGTTGATATCTTTCATGACAGCCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCC < SRR4302534.6243229/94‑1 (MQ=60)
CGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTG > SRR4302534.973240/1‑94 (MQ=60)
CGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTG < SRR4302534.1377352/94‑1 (MQ=60)
GTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCTACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGT > SRR4302534.6343921/1‑94 (MQ=60)
GTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGT > SRR4302534.3991406/1‑94 (MQ=60)
TTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTT > SRR4302534.5114464/1‑94 (MQ=60)
TTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTT < SRR4302534.4588474/94‑1 (MQ=60)
TGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGGCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGCTT > SRR4302534.3061668/1‑94 (MQ=60)
GATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTC > SRR4302534.3258571/1‑94 (MQ=60)
GATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTC > SRR4302534.5363499/1‑94 (MQ=60)
GATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTC > SRR4302534.735202/1‑94 (MQ=60)
ATATCTTTCATGACACCCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCG < SRR4302534.4427926/94‑1 (MQ=60)
ATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCG > SRR4302534.1242702/1‑94 (MQ=60)
TATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGG > SRR4302534.2559683/1‑94 (MQ=60)
TCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGG < SRR4302534.944439/94‑1 (MQ=60)
CTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGT < SRR4302534.774053/94‑1 (MQ=60)
TTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTT < SRR4302534.2774327/94‑1 (MQ=60)
TTCATGACACCCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTT < SRR4302534.1809605/94‑1 (MQ=60)
TTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTT < SRR4302534.5145468/94‑1 (MQ=60)
CATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCA < SRR4302534.3983915/94‑1 (MQ=60)
TGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAAC < SRR4302534.3518479/94‑1 (MQ=60)
TGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAAC > SRR4302534.5551921/1‑94 (MQ=60)
TGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAAC > SRR4302534.366619/1‑94 (MQ=60)
TGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAAC > SRR4302534.1756084/1‑94 (MQ=60)
TGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAAC > SRR4302534.1141510/1‑94 (MQ=60)
GACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACG < SRR4302534.26844/94‑1 (MQ=60)
CAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTC > SRR4302534.2903700/1‑94 (MQ=60)
CAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTC < SRR4302534.6496160/94‑1 (MQ=60)
CAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTC > SRR4302534.4568723/1‑94 (MQ=60)
AACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCT < SRR4302534.3078548/94‑1 (MQ=60)
AACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGCTTCAACGTCT > SRR4302534.2604109/1‑94 (MQ=60)
AACCGGCACCCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCT > SRR4302534.4759113/1‑94 (MQ=60)
CCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTT < SRR4302534.2342377/94‑1 (MQ=60)
CGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTG < SRR4302534.6317274/94‑1 (MQ=60)
CGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTG < SRR4302534.3366350/94‑1 (MQ=60)
CGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTG < SRR4302534.3334401/94‑1 (MQ=60)
CGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTG < SRR4302534.4016788/94‑1 (MQ=60)
GGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGG > SRR4302534.6526630/1‑94 (MQ=60)
GGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGG < SRR4302534.2806814/94‑1 (MQ=60)
GGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGG > SRR4302534.2662508/1‑94 (MQ=60)
GCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGT > SRR4302534.1429561/1‑94 (MQ=60)
CACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTG > SRR4302534.3674182/1‑94 (MQ=60)
CACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTG < SRR4302534.3466155/94‑1 (MQ=60)
CACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTG < SRR4302534.4354303/94‑1 (MQ=60)
CACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGCTTCAACGTCTTTGGTG > SRR4302534.2376210/1‑94 (MQ=60)
CACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCCCCCATAATGCCCGCACTCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGAGTTCCAACGTCTTTGGTG > SRR4302534.3674183/1‑94 (MQ=60)
CACGCCTTTCCACCCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTG < SRR4302534.1925020/94‑1 (MQ=60)
ACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGTGGTTTCAACGTCTTTGGTGA < SRR4302534.6493877/94‑1 (MQ=60)
ACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGG > SRR4302534.1263546/1‑94 (MQ=60)
ACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGA < SRR4302534.5221828/94‑1 (MQ=60)
CGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAG < SRR4302534.5129436/94‑1 (MQ=60)
CCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGTCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTCTCGGGGTTTCTACGTCTTTGGTGAGTT > SRR4302534.6649425/1‑94 (MQ=60)
CCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTT < SRR4302534.1072555/94‑1 (MQ=60)
TTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCT > SRR4302534.1476170/1‑94 (MQ=60)
TCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTT < SRR4302534.6010139/94‑1 (MQ=60)
TCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTT < SRR4302534.746714/94‑1 (MQ=60)
CACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCG < SRR4302534.1734886/94‑1 (MQ=60)
CACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCG < SRR4302534.3773815/94‑1 (MQ=60)
CACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCG < SRR4302534.5589015/94‑1 (MQ=60)
CACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCG > SRR4302534.3851895/1‑94 (MQ=60)
GCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTT < SRR4302534.2304603/94‑1 (MQ=60)
GCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTT < SRR4302534.1572678/94‑1 (MQ=60)
GCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTT < SRR4302534.3878934/94‑1 (MQ=60)
CAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTT > SRR4302534.3589819/1‑94 (MQ=60)
CAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTT < SRR4302534.3776297/94‑1 (MQ=60)
CAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTT < SRR4302534.3848142/94‑1 (MQ=60)
CAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTT > SRR4302534.6318189/1‑94 (MQ=60)
CAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTT < SRR4302534.3119964/94‑1 (MQ=60)
AGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTG < SRR4302534.75828/94‑1 (MQ=60)
CTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCT > SRR4302534.2991560/1‑94 (MQ=60)
TGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCTT < SRR4302534.5383382/94‑1 (MQ=60)
GGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCTTT < SRR4302534.6276050/94‑1 (MQ=60)
GTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCTTTT < SRR4302534.5790647/94‑1 (MQ=60)
TAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCTTTTA > SRR4302534.2106533/1‑94 (MQ=60)
AGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCTTTTACA < SRR4302534.3761244/94‑1 (MQ=60)
AGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCTTTTACA < SRR4302534.3973006/94‑1 (MQ=60)
AGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTATCTTCGCTTTGCCTTTTACA < SRR4302534.6495784/94‑1 (MQ=60)
GCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCTTTTACAT < SRR4302534.5481498/94‑1 (MQ=60)
CGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGGTTTGCCTTTTACATA < SRR4302534.5264679/94‑1 (MQ=60)
CGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCTTTTACATA > SRR4302534.491706/1‑94 (MQ=60)
CGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGGTTCGGGGGTTCAACGTCTTTGGTGAGGTTCTTCGCTTTGCCTTTTACATA > SRR4302534.2337188/1‑94 (MQ=60)
GATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCTTTTACATAT < SRR4302534.1998037/94‑1 (MQ=60)
GATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCTTTTACATAT > SRR4302534.2879861/1‑94 (MQ=60)
GATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCTTTTACATAT > SRR4302534.1888419/1‑94 (MQ=60)
ATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCTTTTACATATT < SRR4302534.141234/94‑1 (MQ=60)
TGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCTTTTACATATTG < SRR4302534.6541809/94‑1 (MQ=60)
GCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCTTTTACATATTGA > SRR4302534.1624083/1‑94 (MQ=60)
GCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCTTTTACATATTGA < SRR4302534.5010118/94‑1 (MQ=60)
CCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCTTTTACATATTGAT < SRR4302534.1550362/94‑1 (MQ=60)
CGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCTTTTACATATTGATC > SRR4302534.2363192/1‑94 (MQ=60)
CGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCTTTTACATATTGATCGTT < SRR4302534.15880/94‑1 (MQ=60)
CGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCTTTTACATATTGATCGTT > SRR4302534.4106089/1‑94 (MQ=60)
CGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCTTTTACATATTGATCGTT < SRR4302534.6059173/94‑1 (MQ=60)
GCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCTTTTACATATTGATCGTTA > SRR4302534.1884962/1‑94 (MQ=60)
GCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCTTTTACATATTGATCGTTA > SRR4302534.3988912/1‑94 (MQ=60)
CCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCTTTTACATATTGATCGTTAA > SRR4302534.4912488/1‑94 (MQ=60)
CCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCTTTTACATATTGATCGTTAA < SRR4302534.3974003/94‑1 (MQ=60)
CCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGTGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCTTTTACATATTGATCGTTAAG < SRR4302534.2588902/94‑1 (MQ=60)
CCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCTTTTACATATTGATCGTTAAG < SRR4302534.5630925/94‑1 (MQ=60)
CCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCTTTTACATATTGATCGTTAAG < SRR4302534.4783734/94‑1 (MQ=60)
CATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCTTTTACATATTGATCGTTAAGG < SRR4302534.4207739/94‑1 (MQ=60)
ATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCTTTTACATATTGATCGTTAAGGA > SRR4302534.6499324/1‑94 (MQ=60)
TAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCTTTTACATATTGATCGTTAAGGAA > SRR4302534.4303343/1‑94 (MQ=60)
AATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCTTTTACATATTGATCGTTAAGGAAA > SRR4302534.801521/1‑94 (MQ=60)
AATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCTTTTACATATTGATCGTTAAGGAAA < SRR4302534.1645903/94‑1 (MQ=60)
AATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCTTTTACATATTGATAGCTAAGGAAA > SRR4302534.2845994/1‑94 (MQ=60)
ATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCTTTTACATATTGATCGTTAAGGAAAA < SRR4302534.2837929/94‑1 (MQ=60)
TGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCTTTTACATATTGATCGTTAAGGAAAAT < SRR4302534.4436159/94‑1 (MQ=60)
TGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCTTTTACATATTGATCGTTAAGGAAAAT < SRR4302534.5890438/94‑1 (MQ=60)
GCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCTTTTACATATTGATCGTTAAGGAAAATG < SRR4302534.4149536/94‑1 (MQ=60)
CCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCTTTTACATATTGATCGTTAAGGAAAATGCC < SRR4302534.5246867/94‑1 (MQ=60)
CCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCTTTTACATATTGATCGTTAAGGAAAATGCC < SRR4302534.5638711/94‑1 (MQ=60)
CCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCTTTTACATATTGATCGTTAAGGAAAATGCC < SRR4302534.4149623/94‑1 (MQ=60)
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GCCGAGGGTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCTGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCTTTTACATATTGATCGTTAAGGAAAATGCC > NC_000913/4027506‑4027691
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
