Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
884 |
257.2 |
12958910 |
96.9% |
12557183 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,291,199 |
T→A |
Y26* (TAT→TAA) |
nrfG → |
part of formate‑dependent nitrite reductase complex |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,291,199 | 0 | T | A | 100.0%
| 982.0
/ NA
| 257 | Y26* (TAT→TAA) | nrfG | part of formate‑dependent nitrite reductase complex |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base A (123/134); total (123/134) |
Only 100 of 261 total aligned reads displayed.
TGAGGGCGAAGCGATGAAACAGCCCAAAATACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTATCTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAGCGCGATCCGCTACATCAGTTTGCCAGCCAGCAAACCCCGGA > NC_000913/4291109‑4291288
|
aGGGCGAAGCGATGAAACAGCCCAAAATACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGt < 2:1844927/93‑1 (MQ=255)
gggCGAAGCGATGAAACAGCCCAAAATACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGtt < 1:2222060/93‑1 (MQ=255)
ggCGAAGCGATGAAACAGCCCAAAATACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTa > 1:1154319/1‑93 (MQ=255)
ggCGAAGCGATGAAACAGCCCAAAATACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTa > 2:5595494/1‑93 (MQ=255)
ggCGAAGCGATGAAACAGCCCAAAATACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTa > 2:2112216/1‑93 (MQ=255)
gCGAAGCGATGAAACAGCCCAAAATACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTaa < 1:923259/93‑1 (MQ=255)
gCGAAGCGATGAAACAGCCCAAAATACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTaa < 1:5459307/93‑1 (MQ=255)
gCGAAGCGATG‑AACAGCCCAAAATACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAg < 1:2645422/93‑1 (MQ=255)
gCGAAGAGATGAAACAGCCCAAAATACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTaa < 2:3765486/93‑1 (MQ=255)
gAAGCGATGAAACAGCCCAAAATACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGc > 2:4022328/1‑93 (MQ=255)
aaGCGATGAAACAGCCCAAAATACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGcc < 2:1767995/93‑1 (MQ=255)
aaGCGATGAAACAGCCCAAAATACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGcc > 2:3864956/1‑93 (MQ=255)
aaGCGATGAAACAGCCCAAAATACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGcc > 1:2731007/1‑93 (MQ=255)
aGCGATGAAACAGCCCAAAATACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGccc < 1:1521153/93‑1 (MQ=255)
gCGATGAAACAGCCCAAAATACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCa > 1:6212441/1‑93 (MQ=255)
cGATGAAACAGCCCAAAATACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCaa < 1:728383/93‑1 (MQ=255)
cGATGAAACAGCCCAAAATACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCaa < 1:5366612/93‑1 (MQ=255)
aTGAAACAGCCCAAAATACCGGTGAAAATGCTGACAACCCTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCaaaa < 2:223004/93‑1 (MQ=255)
aTGAAACAGCCCAAAATACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCaaaa < 2:2810976/93‑1 (MQ=255)
gAAACAGCCCAAAATACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATg < 2:3140096/93‑1 (MQ=255)
gAAACAGCCCAAAATACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATg < 1:3535648/93‑1 (MQ=255)
aaCAGCCCAAAATACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATgga > 1:4096432/1‑92 (MQ=255)
aaCAGCCCAAAATACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGc > 1:5247437/1‑93 (MQ=255)
aaCAGCCCAAAATACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGc > 1:2248942/1‑93 (MQ=255)
aCAGCCCAAAATACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCa > 2:864823/1‑93 (MQ=255)
aCAGCCCAAAATACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCa > 2:2546353/1‑93 (MQ=255)
aCAGCCCAAAATACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCa < 2:130311/93‑1 (MQ=255)
aCAGCCCAAAATACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCa < 1:4582224/93‑1 (MQ=255)
cAGCCCAAAATACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAg < 1:75728/93‑1 (MQ=255)
cAGCCCAAAATACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGCCGGCAGTTAACCGTTAAGCCCAAAATGGCAg < 2:5835089/93‑1 (MQ=255)
aGCCCAAAATACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAgg < 2:2456277/93‑1 (MQ=255)
aGCCCAAAATACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAgg < 2:1948006/93‑1 (MQ=255)
gCCCAAAATACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGc < 2:5659010/93‑1 (MQ=255)
cccAAAATACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCg > 1:2850056/1‑93 (MQ=255)
ccAAAATACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCgg > 2:2881748/1‑93 (MQ=255)
ccAAAATACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCgg < 2:205675/93‑1 (MQ=255)
ccAAAATACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCgg > 1:170899/1‑93 (MQ=255)
ccAAAATACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCgg < 2:1070543/93‑1 (MQ=255)
ccAAAATACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCgg > 1:3532147/1‑93 (MQ=255)
aaaaTACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTa > 1:5104254/1‑93 (MQ=255)
aaaaTACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTa > 2:4574172/1‑93 (MQ=255)
aaaaTACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTa < 2:1892567/93‑1 (MQ=255)
aaaTACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTAc > 1:2671772/1‑93 (MQ=255)
aaTACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACg < 1:3964734/93‑1 (MQ=255)
aaTACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACg < 1:5859348/93‑1 (MQ=255)
aTACTGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGt < 2:335052/93‑1 (MQ=255)
ccGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCg > 1:5792199/1‑93 (MQ=255)
ccGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCg > 2:4840128/1‑93 (MQ=255)
cGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCgg < 1:1931350/93‑1 (MQ=255)
cGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCgg < 2:3222106/93‑1 (MQ=255)
ggTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGGCCCAAATAGCAGGCGGTAGGTGCGGa > 1:1259675/1‑93 (MQ=255)
ggTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGa > 2:573398/1‑93 (MQ=255)
ggTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGa > 2:6393946/1‑93 (MQ=255)
gTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAg > 2:5181269/1‑93 (MQ=255)
tGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGt < 1:4407393/93‑1 (MQ=255)
gAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAgga > 1:877730/1‑91 (MQ=255)
gAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTa > 2:4120123/1‑93 (MQ=255)
aaTGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTAtca > 2:4175966/1‑93 (MQ=255)
tGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTAtcagc > 1:2978359/1‑93 (MQ=255)
caacaCTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTAtcagcgtcagc > 1:3075641/1‑93 (MQ=255)
acacTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAgcgc > 2:1505561/1‑93 (MQ=255)
acacTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAgcgc > 2:6170934/1‑93 (MQ=255)
acacTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAgcgc < 1:5710985/93‑1 (MQ=255)
acacTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAgcgc > 1:4335668/1‑93 (MQ=255)
acacTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAgcgc > 1:3133639/1‑93 (MQ=255)
acTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAGCGCGa > 1:3799146/1‑93 (MQ=255)
tCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAGCGCGATc < 2:6466039/93‑1 (MQ=255)
tCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAGCGCGATc < 2:125321/93‑1 (MQ=255)
cACGATATTGATGGTATTTCTCTGTCTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAGCGCGATcc < 2:6242479/93‑1 (MQ=255)
aCGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAGCGCGATCCg > 1:2191162/1‑93 (MQ=255)
cGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAGCGCGATCCGc > 2:217691/1‑93 (MQ=255)
gATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAGCGCGATCCGCt < 2:2639602/93‑1 (MQ=255)
gATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAGCGCGATCCGCt > 2:5258688/1‑93 (MQ=255)
gATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAGCGCGATCCGCt < 2:5054103/93‑1 (MQ=255)
tatTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAGCGCGATCCGCTAc > 2:337970/1‑93 (MQ=255)
tatTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAGCGCGATCCGCTAc > 1:49794/1‑93 (MQ=255)
tatTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAGCGCGATCCGCTAc > 1:4735999/1‑93 (MQ=255)
tGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAGCGCGATCCGCTACATc < 1:820034/93‑1 (MQ=255)
gATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAGCGCGCTCCGCTACATCa > 1:5974697/1‑93 (MQ=255)
gATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAGCGCGATCCGCTACATCa < 1:3256050/93‑1 (MQ=255)
tGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAGCGCGATCCGCTACATCAGt > 2:6151694/1‑93 (MQ=255)
tGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAGCGCGATCCGCTACATCAGt > 1:2456466/1‑93 (MQ=255)
ggTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAGCGCGATCCGCTACATCAGtt > 1:6411250/1‑93 (MQ=255)
ggTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAGCGCGATCCGCTACATCAGtt < 2:3079090/93‑1 (MQ=255)
gTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAGCGCGATCCGCTACATCAGttt < 1:4705243/93‑1 (MQ=255)
gTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGCATCAGCGTAAGCGCGATCCGCTACATCAGttt < 2:1012364/93‑1 (MQ=255)
tATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAGCGCGATCCGCTACATCAGTTTg < 2:5859758/93‑1 (MQ=255)
tttCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAGCGCGATCCGCTACATCAGTTTgcc < 1:515093/93‑1 (MQ=255)
ttCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAGCGCGATCCGCTACATCAGTTTgcca < 1:1030934/93‑1 (MQ=255)
tgtgTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAGCGCGATCCGCTACATCAGTTTGccagccag < 2:3419128/93‑1 (MQ=255)
gtgtCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAGCGCGATCCGCTACATCAGTTTGCcagccagc < 1:5002343/93‑1 (MQ=255)
tgtCGGCAGATAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAGCGCGATCCGCTACATCACGTTGTCAGCCAGCa > 1:2571081/1‑93 (MQ=255)
gtCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAGCGCGATCCGCTACATTAGTTTGCCAGCCAGCaa > 2:4513512/1‑93 (MQ=255)
tCGCCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAAGGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAGCGCGATCCCCTACATCAGTTTGCCAGCCAGCaaa < 2:4081622/93‑1 (MQ=255)
gCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAGCGCGATCCGCTACATCAGTTTGCCAGCCAGCAAAccc < 2:4918157/93‑1 (MQ=255)
gCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAGCGCGATCCGCTACATCAGTTTGCCAGCCAGCAAAccc < 1:2031846/93‑1 (MQ=255)
gTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAGCGCGATCCGCTACATCAGTTTGCCAGCCAGCAAACCCCgg > 1:2085287/1‑93 (MQ=255)
gTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAGCGCGATCCGCTACATCAGTTTGCCAGCCAGCAAACCCCgg > 2:2626199/1‑93 (MQ=255)
ttAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAGCGCGATCCGCTACATCAGTTTGCCAGCCAGCAAACCCCGGa > 1:2373097/1‑93 (MQ=255)
ttAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAGCGCGATCCGCTACATCAGTTTGCCAGCCAGCAAACCCCGGa < 1:1834097/93‑1 (MQ=255)
|
TGAGGGCGAAGCGATGAAACAGCCCAAAATACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTATCTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAGCGCGATCCGCTACATCAGTTTGCCAGCCAGCAAACCCCGGA > NC_000913/4291109‑4291288
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GAGTGAGGGCGAAGCGATGAAACAGCCCAAAATACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTATCTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAGCGCGATCCGCTACATCAGTTTGCCAGCCAGCAAACCCCGGAAGCG > NC_000913/4291106‑4291292
|
GAGTGAGGGCGAAGCGATGAAACAGCCCAAAATACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAA > SRR4302534.616020/1‑94 (MQ=60)
GAGTGAGGGCGAAGCGATGAAACAGCCCAAAATACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAA > SRR4302534.382565/1‑94 (MQ=60)
AGTGAGGGCGAAGCGATGAAACAGCCCAAAATACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAAC > SRR4302534.2782873/1‑94 (MQ=60)
GTGAGGGCGAAGCGATGAAACAGCCCAAAATACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACT < SRR4302534.1036052/94‑1 (MQ=60)
GTGAGGGCGAAGCGATGAAACAGCCCAAAATACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACT < SRR4302534.384542/94‑1 (MQ=60)
GTGAGGGCGAAGCGATGAAACAGCCCAAAATACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACT > SRR4302534.1958702/1‑94 (MQ=60)
GTGAGGGCGAAGCGATGAAACAGCCCAAAATACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACT < SRR4302534.1107973/94‑1 (MQ=60)
AGGGCGAAGCGATGAAACAGCCCAAAATACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTT < SRR4302534.2089242/94‑1 (MQ=60)
GGGCGAAGCGATGAAACAGCCCAAAATACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTA < SRR4302534.2280909/94‑1 (MQ=60)
GGGCGAAGCGATGAAACAGCCCAAAATACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTA < SRR4302534.3854376/94‑1 (MQ=60)
GGGCGAAGCGATGAAACAGCCCAAAATACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTA > SRR4302534.1184584/1‑94 (MQ=60)
GGCGAAGCGATGAAACAGCCCAAAATACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAA > SRR4302534.2643585/1‑94 (MQ=60)
GCGAAGCGATGAAACAGCCCAAAATACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAG < SRR4302534.5606435/94‑1 (MQ=60)
GCGAAGCGATGAAACAGCCCAAAATACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAG < SRR4302534.946773/94‑1 (MQ=60)
GCGAAGCGATG‑AACAGCCCAAAATACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGC < SRR4302534.2715369/94‑1 (MQ=60)
CGAAGCGATGAAACAGCCCAAAATACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGC > SRR4302534.168913/1‑94 (MQ=60)
GAAGCGATGAAACAGCCCAAAATACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCC > SRR4302534.3289542/1‑94 (MQ=60)
GAAGCGATGAAACAGCCCAAAATACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCC > SRR4302534.2803016/1‑94 (MQ=60)
AAGCGATGAAACAGCCCAAAATACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCC > SRR4302534.6250446/1‑94 (MQ=60)
AAGCGATGAAACAGCCCAAAATACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCC < SRR4302534.3446939/94‑1 (MQ=60)
AGCGATGAAACAGCCCAAAATACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCA > SRR4302534.6381263/1‑94 (MQ=60)
AGCGATGAAACAGCCCAAAATACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCA > SRR4302534.228046/1‑94 (MQ=60)
AGCGATGAAACAGCCCAAAATACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCA < SRR4302534.1561095/94‑1 (MQ=60)
CGATGAAACAGCCCAAAATACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAA < SRR4302534.5511257/94‑1 (MQ=60)
CGATGAAACAGCCCAAAATACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAA < SRR4302534.746368/94‑1 (MQ=60)
CGATGAAACAGCCCAAAATACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAA < SRR4302534.5641860/94‑1 (MQ=60)
ATGAAACAGCCCAAAATACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAAT < SRR4302534.813850/94‑1 (MQ=60)
ATGAAACAGCCCAAAATACCGGTAAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAAT < SRR4302534.3918055/94‑1 (MQ=60)
GAAACAGCCCAAAATACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGG < SRR4302534.3630753/94‑1 (MQ=60)
AAACAGCCCAAAATACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGC > SRR4302534.5389186/1‑94 (MQ=60)
AAACAGCCCAAAATACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGC > SRR4302534.2308553/1‑94 (MQ=60)
AAACAGCCCAAAATACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGC > SRR4302534.2544160/1‑94 (MQ=60)
AAACAGCCCAAAATACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGC > SRR4302534.427966/1‑94 (MQ=60)
AAACAGCCCAAAATACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGA > SRR4302534.4206532/1‑94 (MQ=60)
AACAGCCCAAAATACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCA < SRR4302534.3087174/94‑1 (MQ=60)
AACAGCCCAAAATACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCA < SRR4302534.3007319/94‑1 (MQ=60)
ACAGCCCAAAATACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAG < SRR4302534.4706536/94‑1 (MQ=60)
CAGCCCAAAATACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGG < SRR4302534.77783/94‑1 (MQ=60)
CAGCCCAAAATACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGG > SRR4302534.2011728/1‑94 (MQ=60)
AGCCCACAATACGGGTGAAAATGCTGACATCTCTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGC < SRR4302534.2589174/94‑1 (MQ=60)
AGCCCAAAATACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGC > SRR4302534.6054508/1‑94 (MQ=60)
AGCCCAAAATACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGC < SRR4302534.6467196/94‑1 (MQ=60)
TCCCAAAATACCGGTGACAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTACTCTGTGTCAGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCG < SRR4302534.3865001/94‑1 (MQ=60)
GCCCAAAATACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCG < SRR4302534.4428974/94‑1 (MQ=60)
GCCCAAAATACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCG < SRR4302534.5859105/94‑1 (MQ=60)
GCCCAAAATACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCG > SRR4302534.2924917/1‑94 (MQ=60)
CCCAAAATACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGG > SRR4302534.5167339/1‑94 (MQ=60)
CCCAAAATACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGG > SRR4302534.175411/1‑94 (MQ=60)
CCCAAAATACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGG > SRR4302534.3627157/1‑94 (MQ=60)
CCAAAATACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTGTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGT < SRR4302534.6512264/94‑1 (MQ=60)
CCAAAATACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGT > SRR4302534.4560591/1‑94 (MQ=60)
CCAAAATACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGT < SRR4302534.1753883/94‑1 (MQ=60)
CCAAAATACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGT < SRR4302534.5929802/94‑1 (MQ=60)
CAAAATACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTA > SRR4302534.5242013/1‑94 (MQ=60)
CAAAATACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTA > SRR4302534.84091/1‑94 (MQ=60)
AAAATACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTAC > SRR4302534.994516/1‑94 (MQ=60)
AAAATACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTAC > SRR4302534.2742383/1‑94 (MQ=60)
AAAATACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTAC < SRR4302534.2787013/94‑1 (MQ=60)
AAATACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGGAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACG > SRR4302534.1243277/1‑94 (MQ=60)
AAATACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACG < SRR4302534.4481417/94‑1 (MQ=60)
AAATACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACG > SRR4302534.2802879/1‑94 (MQ=60)
AAATACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACG > SRR4302534.4100793/1‑94 (MQ=60)
AATACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGT < SRR4302534.4070872/94‑1 (MQ=60)
AATACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGT < SRR4302534.6018432/94‑1 (MQ=60)
ATACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTG < SRR4302534.948038/94‑1 (MQ=60)
TACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGC < SRR4302534.3411244/94‑1 (MQ=60)
ACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCG > SRR4302534.5949348/1‑94 (MQ=60)
CGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGGCCCAAATAGCAGGCGGTAGGTGCGGA > SRR4302534.1292854/1‑94 (MQ=60)
CGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGA < SRR4302534.1981846/94‑1 (MQ=60)
TGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTA < SRR4302534.4526339/94‑1 (MQ=60)
TGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGGA > SRR4302534.899929/1‑94 (MQ=60)
AATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAG > SRR4302534.5984876/1‑94 (MQ=60)
ATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGC < SRR4302534.6033020/94‑1 (MQ=60)
ATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGC > SRR4302534.3056310/1‑94 (MQ=60)
TGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCG < SRR4302534.516995/94‑1 (MQ=60)
TGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCA < SRR4302534.4076072/94‑1 (MQ=60)
TGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCA < SRR4302534.2727426/94‑1 (MQ=60)
GACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAG > SRR4302534.4868869/1‑94 (MQ=60)
ACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAGC > SRR4302534.3156434/1‑94 (MQ=60)
AACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAGCGC > SRR4302534.3130295/1‑94 (MQ=60)
AACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAGCGC < SRR4302534.2037881/94‑1 (MQ=60)
AACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAGCGC > SRR4302534.4452872/1‑94 (MQ=60)
AACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAGCGC > SRR4302534.3216006/1‑94 (MQ=60)
AACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCCGTACGTGCGGAGgattagcgtccgcgg > SRR4302534.4956391/1‑79 (MQ=60)
ACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAGCGCG > SRR4302534.2891433/1‑94 (MQ=60)
ACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAGCGCG < SRR4302534.854849/94‑1 (MQ=60)
ACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAGCGCG < SRR4302534.5865702/94‑1 (MQ=60)
CACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAGCGCGA > SRR4302534.3901157/1‑94 (MQ=60)
ACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAGCGCGAT > SRR4302534.3630215/1‑94 (MQ=60)
ACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAGCGCGAT > SRR4302534.2368234/1‑94 (MQ=60)
CTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAGCGCGATC < SRR4302534.2328865/94‑1 (MQ=60)
CTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAGCGCGATC < SRR4302534.1563692/94‑1 (MQ=60)
CTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAGCGCGATC > SRR4302534.4802619/1‑94 (MQ=60)
CACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAGCGCGATCCG < SRR4302534.4857967/94‑1 (MQ=60)
CACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAGCGCGATCCG > SRR4302534.2249098/1‑94 (MQ=60)
CGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAGCGCGATCCGCT > SRR4302534.3177341/1‑94 (MQ=60)
CGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAGCGCGATCCGCT < SRR4302534.5482100/94‑1 (MQ=60)
CGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCAAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAGCGCGATCCGCT < SRR4302534.747256/94‑1 (MQ=60)
GATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCTGAGCGATCCGCTA > SRR4302534.2454361/1‑94 (MQ=60)
ATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAGCGCGATCCGCTAC > SRR4302534.51123/1‑94 (MQ=60)
ATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAGCGCGATCCGCTAC > SRR4302534.4864581/1‑94 (MQ=60)
TATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAGCGCGATCCGCTACA < SRR4302534.2140807/94‑1 (MQ=60)
TTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAGCGCGATCCGCTACATC > SRR4302534.2235249/1‑94 (MQ=60)
TTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAGCGCGATCCGCTACATC < SRR4302534.2270363/94‑1 (MQ=60)
TGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAGCGCGCTCCGCTACATCA > SRR4302534.6136968/1‑94 (MQ=60)
TGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAGCGCGATCCGCTACATCA > SRR4302534.554435/1‑94 (MQ=60)
TGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAGCGCGATCCGCTACATCA < SRR4302534.5436114/94‑1 (MQ=60)
TGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAGCGCGATCCGCTACATCA < SRR4302534.840658/94‑1 (MQ=60)
GATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAGCGCGATCCGCTACATCAG < SRR4302534.3342767/94‑1 (MQ=60)
ATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAGCGCGATCCGCTACATCAGT > SRR4302534.2521730/1‑94 (MQ=60)
TGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAGCGCGATCCGCTACATCAGTT > SRR4302534.6584247/1‑94 (MQ=60)
GGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAGCGCGATCCGCTACATCAGTTT > SRR4302534.6649033/1‑94 (MQ=60)
GGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGCGCGGAGGATCAGCGTCAGCGCGATCCGCTACATCAGGTT > SRR4302534.4659174/1‑94 (MQ=60)
GTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAGCGCGATCCGCTACATCAGTTTG < SRR4302534.5378994/94‑1 (MQ=60)
GTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAGCGCGATCCGCTACATCAGTTTG < SRR4302534.4832970/94‑1 (MQ=60)
TTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAGCGCGATCCGCTACATCAGTTTGCCA < SRR4302534.527909/94‑1 (MQ=60)
TTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAGCGCGATCCGCTACATCAGTTTGCCA < SRR4302534.1328387/94‑1 (MQ=60)
TTTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAGCGCGATCCGCTACATCAGTTTGCCA < SRR4302534.1086749/94‑1 (MQ=60)
TTCTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAGCGCGATCCGCTACATCAGTTTGCCAG < SRR4302534.1057498/94‑1 (MQ=60)
CTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAGCGCGATCCGCTACATCAGTTTGCCAGCC > SRR4302534.4859210/1‑94 (MQ=60)
CTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAGCGCGATCCGCTACATCAGTTTGCCAGCC < SRR4302534.5368258/94‑1 (MQ=60)
CTCTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCACCGTCAGCGCGATCCGCTACATCAGTTTGCCAGCC < SRR4302534.761617/94‑1 (MQ=60)
CTGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAGCGCGATCCGCTACATCAGTTTGCCAGCCAG < SRR4302534.946406/94‑1 (MQ=60)
TGTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAGCGCGATCCGCTACATCAGTTTGCCAGCCAGC > SRR4302534.512082/1‑94 (MQ=60)
GTGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAGCGCGATCCGCTACATCAGTTTGCCAGCCAGCA < SRR4302534.5137579/94‑1 (MQ=60)
GTGTCGGCAGATAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAGCGCGATCCGCTACATCACGTTGTCAGCCAGCA > SRR4302534.2639210/1‑94 (MQ=60)
TGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAGCGCGATCCGCTACATCAGTTTGCCAGCCAGCAA < SRR4302534.942979/94‑1 (MQ=60)
TGTCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAGCGCGATCCGCTACATCAGTTTGCCAGCCAGCAA < SRR4302534.5268617/94‑1 (MQ=60)
TCGGCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAGCGCGATCCGCTACATCAGTTTGCCAGCCAGCAAAC < SRR4302534.5870260/94‑1 (MQ=60)
GCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAGCGCGATCCGCTACATCAGTTTGCCAGCCAGCAAACCCC < SRR4302534.2084976/94‑1 (MQ=60)
GCAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAGCGCGATCCGCTACATCAGTTTGCCAGCCAGCAAACCCC < SRR4302534.1261901/94‑1 (MQ=60)
CAGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAGCGCGATCCGCTACATCAGTTTGCCAGCCAGCAAACCCCG < SRR4302534.6589131/94‑1 (MQ=60)
AGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAGCGCGATCCGCTACATCAGTTTGCCAGCCAGCAAACCCCGG < SRR4302534.227299/94‑1 (MQ=60)
AGTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAGCGCGATCCGCTACATCAGTTTGCCAGCCAGCAAACCCCGG > SRR4302534.2139933/1‑94 (MQ=60)
GTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAGCGCGATCCGCTACATCAGTTTGCCAGCCAGCAAACCCCGGA > SRR4302534.2436110/1‑94 (MQ=60)
GTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAGCGCGATCCGCTACATCAGTTTGCCAGCCAGCAAACCCCGGA > SRR4302534.3334379/1‑94 (MQ=60)
GTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAGCGCGATCCGCTACATCAGTTTGCCAGCCAGCAAACCCCGGA < SRR4302534.2679402/94‑1 (MQ=60)
GTTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAGCGCGATCCGCTACATCAGTTTGCCAGCCAGCAAACCCCGGA > SRR4302534.2957472/1‑94 (MQ=60)
TTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAGCGCGATCCGCTACATCAGTTTGCCAGCCAGCAAACCCCGGAA < SRR4302534.1881782/94‑1 (MQ=60)
TTAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAGCGCGATCCGCTACATCAGTTTGCCAGCCAGCAAACCCCGGAA < SRR4302534.1881783/94‑1 (MQ=60)
TAACTGTTAAGCGCAAAAGGGCAGGCGGTAGGTGCGGAGTATCAGCGTCAGCGCGATCCGCTACATCAGTTTGCCAGCCAGCAAACCCCGGAAG < SRR4302534.3230120/94‑1 (MQ=60)
TAACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAGCGCGATCCGCTACATCAGTTTGCCAGCCAGCAAACCCCGGAAG < SRR4302534.29022/94‑1 (MQ=60)
AACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAGCGCGATCCGCTACATCAGTTTGCCAGCCAGCAAACCCCGGAAGC > SRR4302534.5902704/1‑94 (MQ=60)
AACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAGCGCGATCCGCTACATCAGTTTGCCAGCCAGCAAACCCCGGAAGC < SRR4302534.259050/94‑1 (MQ=60)
ACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAGCGCGATCCGCTACATCAGTTTGCCAGCCAGCAAACCCCGGAAGCG > SRR4302534.1563787/1‑94 (MQ=60)
ACTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAGCGCGATCCGCTACATCAGTTTGCCAGCCAGCAAACCCCGGAAGCG < SRR4302534.3167135/94‑1 (MQ=60)
|
GAGTGAGGGCGAAGCGATGAAACAGCCCAAAATACCGGTGAAAATGCTGACAACACTCACGATATTGATGGTATTTCTCTGTGTCGGCAGTTATCTGTTAAGCCCAAAATGGCAGGCGGTACGTGCGGAGTATCAGCGTCAGCGCGATCCGCTACATCAGTTTGCCAGCCAGCAAACCCCGGAAGCG > NC_000913/4291106‑4291292
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 7 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
