Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F2 I199 R1
|
220 |
57.5 |
3163680 |
97.0% |
3068769 |
86.1 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP009273 |
3,103,871 |
(A)7→6 |
intergenic (+71/+78) |
BW25113_RS15410 → / ← yghD |
tRNA‑Phe/GspM family type II secretion system protein YghD |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP009273 | 3,103,865 | 0 | A | . | 97.9%
| 194.8
/ ‑3.3
| 48 | intergenic (+65/+84) | BW25113_RS15410/yghD | tRNA‑Phe/GspM family type II secretion system protein YghD |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); new base . (17/30); total (18/30) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.75e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
GGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACGAAAAAAATTAGCTTATAAAGTCTGGGGGAATTACTCTCGCCACGTTAACGAGAGTAATTTTATTGATATTAATCTCCTGATACTTTACCC > NZ_CP009273/3103776‑3103954
|
ggTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACGa < 2:1403966/90‑1 (MQ=255)
gTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACGaa < 1:904055/90‑1 (MQ=255)
tAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACGaaaa > 1:253689/1‑90 (MQ=255)
gATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACGaaaaaa > 1:50215/1‑90 (MQ=255)
aTTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACGaaaaaat < 2:719666/90‑2 (MQ=255)
aTTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACGaaaaaat < 1:592359/90‑2 (MQ=255)
cGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACG‑AAAAAATTAGc < 2:597176/90‑1 (MQ=255)
gAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACG‑AAAAAATTAGCt > 1:1385115/1‑90 (MQ=255)
gAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACG‑AAAAAATTAGCt > 2:1581692/1‑90 (MQ=255)
gAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACG‑AAAAAATTAGCt > 2:565258/1‑90 (MQ=255)
ccGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACG‑AAAAAATTAGCTtata < 1:446001/90‑1 (MQ=255)
ccGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACG‑AAAAAATTAGCTtata > 2:130924/1‑90 (MQ=255)
caccacTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACG‑AAAAAATTAGCTTATAAAGTc < 2:1150715/90‑1 (MQ=255)
caccacTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACG‑AAAAAATTAGCTTATAAAGTc < 1:1225938/90‑1 (MQ=255)
cacTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACG‑AAAAAATTAGCTTATAAAGTCTgg < 1:11213/90‑1 (MQ=255)
cacTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACG‑AAAAAATTAGCTTATAAAGTCTgg > 2:244223/1‑90 (MQ=255)
acTAATTCTTAAGAACCTGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACG‑AAAAAATTAGCTTATAAAGTCTggg < 1:640911/90‑1 (MQ=255)
acTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACG‑AAAAAATTAGCTTATAAAGTCTggg < 1:1301192/90‑1 (MQ=255)
acTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACG‑AAAAAATTAGCTTATAAAGTCTggg < 1:988367/90‑1 (MQ=255)
acTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACG‑AAAAAATTAGCTTATAAAGTCTggg < 2:512116/90‑1 (MQ=255)
ttAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACG‑AAAAAATTAGCTTATAAAGTCTGGGGGAATTAc > 2:1178386/1‑90 (MQ=255)
ttAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACG‑AAAAAATTAGCTTATAAAGGCTGGGGGAATTAc > 1:860635/1‑90 (MQ=255)
aCCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACG‑AAAAAATTAGCTTATAAAGTCTGGGGGAATTACTCTCGc < 2:1395498/90‑1 (MQ=255)
aCCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACG‑AAAAAATTAGCTTATAAAGTCTGGGGGAATTACTCTCGc < 1:1581692/90‑1 (MQ=255)
aCCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACG‑AAAAAATTAGCTTATAAAGTCTGGGGGAATTACTCTCGc < 2:167618/90‑1 (MQ=255)
aCCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACG‑AAAAAATTAGCTTATAAAGTCTGGGGGAATTACTCTCGc < 1:587685/90‑1 (MQ=255)
aCCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACG‑AAAAAATTAGCTTATAAAGTCTGGGGGAATTACTCTCGc < 2:267142/90‑1 (MQ=255)
aCCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACG‑AAAAAATTAGCTTATAAAGTCTGGGGGAATTACTCTCGc < 1:130924/90‑1 (MQ=255)
ccGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACG‑AAAAAATTAGCTTATAAAGTCTGGGGGAATTACTCTCGCCa < 1:1057272/90‑1 (MQ=255)
ccGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACG‑AAAAAATTAGCTTATAAAGTCTGGGGGAATTACTCTCGCCa < 1:1178386/90‑1 (MQ=255)
cGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACG‑AAAAAATTGGCTTATAAAGTCTGGGGGAATTACTCTCGCCAc > 2:1195365/1‑90 (MQ=255)
cGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACG‑AAAAAATTAGCTTATAAAGTCTGGGGGAATTACTCTCGCCAc > 2:218769/1‑90 (MQ=255)
caAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACG‑AAAAAATTAGCTTATAAAGTCTGGGGGAATTACTCTCGCCACGTTAAc < 2:939133/90‑1 (MQ=255)
gCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACG‑AAAAAATTAGCTTATAAAGTCTGGGGGAATTACTCTCGCCACGTTAACgaga < 2:381671/90‑1 (MQ=255)
gggTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACG‑AAAAAATTAGCTTATAAAGTCTGGGGGAATTACTCTCGCCACGTTAACGAGAGt > 2:693056/1‑90 (MQ=255)
gggTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACG‑AAAAAATTAGCTTATAAAGTCTGGGGGAATTACTCTCGCCACGTTAACGAGAGt > 1:1379485/1‑90 (MQ=255)
tttcTTTTGGGTTTGACAAAAAACTTCACGAAAAAAA‑TAGGTTTTAAAGTTTGGGGGGATTTCTCTCCCCCCGTTAACGAGAGGAAtttt > 1:912329/4‑90 (MQ=255)
cTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACG‑AAAAAATTAGCTTATAAAGTCTGGGGGAATTACTCTCGCCACGTTAACGAGAGTAATTTTAtt < 1:613272/90‑1 (MQ=255)
cTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACG‑AAAAAATTAGCTTATAAAGTCTGGGGGAATTACTCTCGCCACGTTAACGAGAGTAATTTTAtt < 2:1010989/90‑1 (MQ=255)
tttGGATCTGACAATAACCTTCACG‑AAAAAATTAGCTTATAAAGTCTGGGGGAATTACTCTCGCCACGTTAACGAGAGTAATTTTATTGa > 1:1157390/1‑90 (MQ=255)
ggATCTGACAATAACCTTCACG‑AAAAAATTAGCTTATAAAGTCTGGGGGAATTACTCTCGCCACGTTAACGAGAGTAATTTTATTGatat < 1:100741/90‑1 (MQ=255)
cTGACAATAACCTTCACG‑AAAAAATTAGCTTATAAAGTCTGGGGGAATTACTCTCGCCACGTTAACGAGAGTAATTTTATTGATATTAAt < 1:218769/90‑1 (MQ=255)
cTGACAATAACCTTCACG‑AAAAAATTAGCTTATAAAGTCTGGGGGAATTACTCTCGCCACGTTAACGAGAGTAATTTTATTGATATTAAt < 1:1484794/90‑1 (MQ=255)
aaCCTTCACG‑AAAAAATTAGCTTATAAAGTCTGGGGGAATTACTCTCGCCACGTTAACGAGAGTAATTTTATTGATATTAATCTCCTGAt < 1:883221/90‑1 (MQ=255)
aaCCTTCACG‑AAAAAATTAGCTTATAAAGTCTGGGGGAATTACTCTCGCCACGTTAACGAGAGTAATTTTATTGATATTAATCTCCTGAt < 2:1003582/90‑1 (MQ=255)
aaCCTTCACG‑AAAAAATTAGCTTATAAAGTCTGGGGGAATTACTCTCGCCACGTTAACGAGAGTAATTTTATTGATATTAATCTCCTGAt < 1:565258/90‑1 (MQ=255)
aaCCTTCACG‑AAAAAATTAGCTTATAAAGTCTGGGGGAATTACTCTCGCCACGTTAACGAGAGTAATTTTATTGATATTAATCTCCTGAt < 1:231189/90‑1 (MQ=255)
aaCCTTCACG‑AAAAAATTAGCTTATAAAGTCTGGGGGAAATACTCTCGCCACGTTAACGAGAGTAATTTTATTGATATTAATCTCCTGAt < 1:188810/90‑1 (MQ=255)
ttCACG‑AAAAAATTAGCTTATAAAGTCTGGGGGAATTACTCTCGCCACGTTAACGAGAGTAATTTTATTGATATTAATCTCCTg < 1:452550/84‑1 (MQ=255)
ttCACG‑AAAAAATTAGCTTATAAAGTCTGGGGGAATTACTCTCGCCACGTTAACGAGAGTAATTTTATTGATATTAATCTCCTg > 2:452550/1‑84 (MQ=255)
ttCACG‑AAAAAATTAGCTTATAAAGTCTGGGGGAATTACTCTCGCCACGTTAACGAGAGTAATTTTATTGATATTAATCTCCTGATACtt > 1:1293275/1‑90 (MQ=255)
ttCACG‑AAAAAATTAGCTTATAAAGTCTGGGGGAATTACTCTCGCCACGTTAACGAGAGTAATTTTATTGATATTAATCTCCTGATACtt > 2:1427811/1‑90 (MQ=255)
ttCACG‑AAAAAATTAGCTTATAAAGTCTGGGGGAATTACTCTCGCCACGTTAACGAGAGTAATTTTATTGATATTAATCTCCTGATACtt > 1:324655/1‑90 (MQ=255)
tCACG‑AAAAAATTAGCTTATAAAGTCTGGGGGAATTACTCTCGCCACGTTAACGAGAGTAATTTTATTGATATTAATCTCCTGATACttt > 2:685820/1‑90 (MQ=255)
aaaaaaaTTAGCTTATAAAGTCTGGGGGAATTACTCTCGCCACGTTAACGAGAGTAATTTTATTGATATTAATCTCCTGATACTTTAccc > 1:1545671/1‑90 (MQ=255)
|
GGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACGAAAAAAATTAGCTTATAAAGTCTGGGGGAATTACTCTCGCCACGTTAACGAGAGTAATTTTATTGATATTAATCTCCTGATACTTTACCC > NZ_CP009273/3103776‑3103954
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACGAAAAAAATTAGCTTATAAAGTCTGGGGGAATTACTCTCGCCACGTTAACGAGAGTAATTTTATTGATATTAATCTCCTGATACTTTACCCCCGTCCAAACTCCA > NZ_CP009273/3103777‑3103968
|
GTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACG‑AAAAAATTAGCT < SRR3722078.916179/100‑1 (MQ=60)
GTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACG‑AAAAAATTAGCT > SRR3722078.1407483/1‑100 (MQ=60)
ATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACG‑AAAAAATTAGCTTATAA < SRR3722078.599240/100‑1 (MQ=60)
CCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACG‑AAAAAATTAGCTTATAAAGTCTGGGG < SRR3722078.451339/100‑1 (MQ=60)
CACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACG‑AAAAAATTAGCTTATAAAGTCTGGGGGAATT < SRR3722078.1245247/100‑1 (MQ=60)
CCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACG‑AAAAAATTAGCTTATAAAGGCTGGGGGAATTAC > SRR3722078.872152/1‑100 (MQ=60)
CACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACG‑AAAAAATTAGCTTATAAAGTCTGGGGGAATTACT < SRR3722078.11338/100‑1 (MQ=60)
ACTAATTCTTAAGAACCTGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACG‑AAAAAATTAGCTTATAAAGTCTGGGGGAATTACTC < SRR3722078.648282/100‑1 (MQ=60)
ACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACG‑AAAAAATTAGCTTATAAAGTCTGGGGGAATTACTC < SRR3722078.1002702/100‑1 (MQ=60)
ACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACG‑AAAAAATTAGCTTATAAAGTCTGGGGGAATTACTC < SRR3722078.1321937/100‑1 (MQ=60)
ACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACG‑AAAAAATTAGCTTATAAAGTCTGGGGGAATTACTCTCGCCACGTTAACG < SRR3722078.132434/100‑1 (MQ=60)
ACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACG‑AAAAAATTAGCTTATAAAGTCTGGGGGAATTACTCTCGCCACGTTAACG < SRR3722078.1607439/100‑1 (MQ=60)
ACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACG‑AAAAAATTAGCTTATAAAGTCTGGGGGAATTACTCTCGCCACGTTAACG < SRR3722078.594524/100‑1 (MQ=60)
CCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACG‑AAAAAATTAGCTTATAAAGTCTGGGGGAATTACTCTCGCCACGTTAACGAG < SRR3722078.1196783/100‑1 (MQ=60)
CCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACG‑AAAAAATTAGCTTATAAAGTCTGGGGGAATTACTCTCGCCACGTTAACGAG < SRR3722078.1073162/100‑1 (MQ=60)
CCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACG‑AAAAAATTAGCTTATAAAGTCTGGGGGAATTACTCTCGCCACGTTAACGAGAGT > SRR3722078.1401740/1‑100 (MQ=60)
GGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACG‑AAAAAATTAGCTTATAAAGTCTGGGGGAATTACTCTCGCCACGTTAACGAGAGTAATTTTATTGA > SRR3722078.1175293/1‑100 (MQ=60)
CTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACG‑AAAAAATTAGCTTATAAAGTCTGGGGGAATTACTCTCGCCACGTTAACGAGAGTAATTTTATTGATATTAATC < SRR3722078.620346/100‑1 (MQ=60)
GGATCTGACAATAACCTTCACG‑AAAAAATTAGCTTATAAAGTCTGGGGGAATTACTCTCGCCACGTTAACGAGAGTAATTTTATTGATATTAATCTCCTG < SRR3722078.101932/100‑1 (MQ=60)
CTGACAATAACCTTCACG‑AAAAAATTAGCTTATAAAGTCTGGGGGAATTACTCTCGCCACGTTAACGAGAGTAATTTTATTGATATTAATCTCCTGATAC < SRR3722078.221413/100‑1 (MQ=60)
CTGACAATAACCTTCACG‑AAAAAATTAGCTTATAAAGTCTGGGGGAATTACTCTCGCCACGTTAACGAGAGTAATTTTATTGATATTAATCTCCTGATAC < SRR3722078.1509004/100‑1 (MQ=60)
GACAATAACCTTCACG‑AAAAAATTAGCTTATAAAGTCTGGGGGAATTACTCTCGCCACGTTAACGAGAGTAATTTTATTGATATTAATCTCCTGATACTT > SRR3722078.328637/1‑100 (MQ=60)
GACAATAACCTTCACG‑AAAAAATTAGCTTATAAAGTCTGGGGGAATTACTCTCGCCACGTTAACGAGAGTAATTTTATTGATATTAATCTCCTGATACTT > SRR3722078.1313868/1‑100 (MQ=60)
ATAACCTTCACG‑AAAAAATTAGCTTATAAAGTCTGGGGGAATTACTCTCGCCACGTTAACGAGAGTAATTTTATTGATATTAATCTCCTGATACTTTACC < SRR3722078.457960/100‑1 (MQ=60)
AACCTTCACGAAAAAAATTAGCTTATAAAGTCTGGGGGAATTACTCTCGCCACGTTAACGAGAGTAATTTTATTGATATTAATCTCCTGATACTTTACCC > SRR3722078.1570853/1‑100 (MQ=60)
AACCTTCACG‑AAAAAATTAGCTTATAAAGTCTGGGGGAATTACTCTCGCCACGTTAACGAGAGTAATTTTATTGATATTAATCTCCTGATACTTTACCCC < SRR3722078.571886/100‑1 (MQ=60)
AACCTTCACG‑AAAAAATTAGCTTATAAAGTCTGGGGGAATTACTCTCGCCACGTTAACGAGAGTAATTTTATTGATATTAATCTCCTGATACTTTACCCC < SRR3722078.233991/100‑1 (MQ=60)
AACCTTCACG‑AAAAAATTAGCTTATAAAGTCTGGGGGAATTACTCTCGCCACGTTAACGAGAGTAATTTTATTGATATTAATCTCCTGATACTTTACCCC < SRR3722078.895091/100‑1 (MQ=60)
AACCTTCACG‑AAAAAATTAGCTTATAAAGTCTGGGGGAAATACTCTCGCCACGTTAACGAGAGTAATTTTATTGATATTAATCTCCTGATACTTTACCCC < SRR3722078.191051/100‑1 (MQ=60)
AAATTAGCTTATAAAGTCTGGGGGAATTACTCctgtctcttatacacatctgacgctgccgacgatggcggtcgtgtagatctcggtggtcggcgtatca > SRR3722078.243536/1‑32 (MQ=60)
|
GTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACGAAAAAAATTAGCTTATAAAGTCTGGGGGAATTACTCTCGCCACGTTAACGAGAGTAATTTTATTGATATTAATCTCCTGATACTTTACCCCCGTCCAAACTCCA > NZ_CP009273/3103777‑3103968
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
