Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F224 I0 R1
|
1457 |
284.0 |
9290224 |
95.7% |
8890744 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
2,204,432 |
G→T |
56.7% |
pseudogene (1854/2001 nt) |
yehQ → |
pseudogene |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 2,204,432 | 0 | G | T | 56.7%
| 13.7
/ inf
| 342 | pseudogene (1854/2001 nt) | yehQ | pseudogene |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (77/71); new base T (90/103); total (168/174) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.28e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 344 total aligned reads displayed.
GCACCGCTACCTTCTGCCAGCGTTTTGCCTGTGCCGTCTACTGCTCATCAGTTGCTGATACGCTGCCAGGCGTTACTTATTCAACTGCTCCATAACGGCTGGCGCTATCAGGAACAGAGTGCTATTGGTCAGGCATAGTTGCTGGCGAATGACCTCACCGCGGTGGGTTTTTATCGGCTGGCACATGTGTTGGGACAATTTCGTAATACAGAAAGCGAGGCACGGGTAGAAGCAATGAATAACGGTGTTTTGCTTTGCGAACAATTATTCCCCATGCTTCAGCAACAAGGATGAAA > CP009273/2204286‑2204581
|
cACCGCTACCTTCTGCCAGCGTTTTGCCTGTGCCGTCTACTGCTCATCAGTTGCTGATACGCTGCCAGGCGTTACTTATTCAACTGCTCCATAACGGCTGGCGCTATCAGGAACAGAGTGCTATTGGTCAGGCATAGTTGCTGGCTAATg > 2:2973018/1‑150 (MQ=255)
cACCGCTACCTTCTGCCAGCGTTTTGCCTGTGCCGTCTACTGCTCATCAGTTGCTGATACGCTGCCAGGCGTTACTTATTCAACTGCTCCATAACGGCTGGCGCTATCAGGAACAGAGTGCTATTGGTCAGGCATAGTTGCTGGCGAATg > 2:4260341/1‑150 (MQ=255)
aCCGCTACCTTCTGCCAGCGTTTTGCCTGTGCCGTCTACTGCTCATCAGTTGCTGATACGCTGCCAGGCGTTACTTATTCAACTGCTCCATAACGGCTGGCGCTATCAGGAACAGAGTGCTATTGGTCAGGCATAGTTGCTGGCGAATGa < 1:3866720/150‑1 (MQ=255)
cGCTACCTTCTGCCAGCGTTTTGCCTGTGCCGTCTACTGCTCATCAGTTGCTGATACGCTGCCAGGCGTTACTTATTCAACTGCTCCATAACGGCTGGCGCTATCAGGAACAGAGTGCTATTGGTCAGGCATAGTTGCTGGCGAATGAcc > 2:312895/1‑150 (MQ=255)
cTACCTTCTGCCAGCGTTTTGCCTGTGCCGTCTACTGCTCATCAGTTGCTGATACGCTGCCAGGCGTTACTTATTCAACTGCTCCATAACGGCTGGCGCTATCAGGAACAGAGTGCTATTGGTCAGGCATAGTTGCTGGCTAATGACCTc < 2:4565847/150‑1 (MQ=255)
ccTTCTGCCAGCGTTTTGCCTGTGCCGTCTACTGCTCATCAGTTGCTGATACGCTGCCAGGCGTTACTTATTCAACTGCTCCATAACGGCTGGCGCTATCAGGAACAGAGTGCTATTGGTCAGGCATAGTTGCTGGCTAATGACCTCAcc < 1:252175/150‑1 (MQ=255)
ccTTCTGCCAGCGTTTTGCCTGTGCCGTCTACTGCTCATCAGTTGCTGATACGCTGCCAGGCGTTACTTATTCAACTGCTCCATAACGGCTGGCGCTATCAGGAACAGAGTGCTATTGGTCAGGCATAGTTGCTGGCTAATGACCTCAcc < 2:3477376/150‑1 (MQ=255)
tCTGCCAGCGTTTTGCCTGTGCCGTCTACTGCTCATCAGTTGCTGATACGCTGCCAGGCGTTACTTATTCAACTGCTCCATAACGGCTGGCGCTATCAGGAACAGAGTGCTATTGGTCAGGCATAGTTGCTGGCTAATGACCTCACcgcg < 2:844627/150‑1 (MQ=255)
cTGCCAGCGTTTTGCCTGTGCCGTCTACTGCTCATCAGTTGCTGATACGCTGCCAGGCGTTACTTATTCAACTGCTCCATAACGGCTGGCGCTATCAGGAACAGAGTGCTATTGGTCAGGCATAGTTGCTGGCGAATGACCTCACCGCgg > 2:4141560/1‑150 (MQ=255)
tGCCAGCGTTTTGCCTGTGCCGTCTACTGCTCATCAGTTGCTGATACGCTGCCAGGCGTTACTTATTCAACTGCTCCATAACGGCTGGCGCTATCAGGAACAGAGTGCTATTGGTCAGGCATAGTTGCTGGCTAATGACCTCACCGCGGt > 2:264650/1‑150 (MQ=255)
ccAGCGTTTTGCCTGTGCCGTCTACTGCTCATCAGTTGCTGATACGCTGCCAGGCGTTACTTATTCAACTGCTCCATAACGGCTGGCGCTATCAGGAACAGAGTGCTATTGGTCAGGCATAGTTGCTGGCTAATGACCTCACCGCGGTgg < 2:3895898/150‑1 (MQ=255)
cGTTTTGCCTGTGCCGTCTACTGCTCATCAGTTGCTGATACGCTGCCAGGCGTTACTTATTCAACTGCTCCATAACGGCTGGCGCTATCAGGAACAGAGTGCTATTGGTCAGGCATAGTTGCTGGCTAATGACCTCACCGCGGTGGGttt < 1:4026551/150‑1 (MQ=255)
gTTTTGCCTGTGCCGTCTACTGCTCATCAGTTGCTGATACGCTGCCAGGCGTTACTTATTCAACTGCTCCATAACGGCTGGCGCTATCAGGAACAGAGTGCTATTGGTCAGGCATAGTTGCTGGCTAATGACCTCACCGCGGTGGGtttt < 1:1595863/150‑1 (MQ=255)
gTTTTGCCTGTGCCGTCTACTGCTCATCAGTTGCTGATACGCTGCCAGGCGTTACTTATTCAACTGCTCCATAACGGCTGGCGCTATCAGGAACAGAGTGCTATTGGTCAGGCATAGTTGCTGGCGAATGACCTCACCGCGGTGGGtttt > 1:824033/1‑150 (MQ=255)
gTTTTGCCTGTGCCGTCTACTGCTCATCAGTTGCTGATACGCTGCCAGGCGTTACTTATTCAACTGCTCCATAACGGCTGGCGCTATCAGGAACAGAGTGCTATTGGTCAGGCATAGTTGCTGGCGAATGACCTCACCGCGGTGGGtttt < 2:2732359/150‑1 (MQ=255)
tGCCTGTGCCGTCTACTGCTCATCAGTTGCTGATACGCTGCCAGGCGTTACTTATTCAACTGCTCCATAACGGCTGGCGCTATCAGGAACAGAGTGCTATTGGTCAGGCATAGTTGCTGGCTAATGACCTCACCGCGGTGGGTTTTTATc < 1:1747968/150‑1 (MQ=255)
tGCCTGTGCCGTCTACTGCTCATCAGTTGCTGATACGCTGCCAGGCGTTACTTATTCAACTGCTCCATAACGGCTGGCGCTATCAGGAACAGAGTGCTATTGGTCAGGCATAGTTGCTGGCTAATGACCTCACCGCGGTGGGTTTTTATc > 2:2042282/1‑150 (MQ=255)
ccTGTGCCGTCTACTGCTCATCAGTTGCTGATACGCTGCCAGGCGTTACTTATTCAACTGCTCCATAACGGCTGGCGCTATCAGGAACAGAGTGCTATTGGTCAGGCATAGTTGCTGGCGAATGACCTCACCGCGGTGGGTTTTTATCgg < 1:1052557/150‑1 (MQ=255)
gtgCCGTCTACTGCTCATCAGTTGCTGATACGCTGCCAGGCGTTACTTATTCAACTGCTCCATAACGGCTGGCGCTATCAGGAACAGAGTGCTATTGGTCAGGCATAGTTGCTGGCTAATGACCTCACCGCGGTGGGTTTTTATCGGCTg < 1:2764595/150‑1 (MQ=255)
cGTCTACTGCTCATCAGTTGCTGATACGCTGCCAGGCGTTACTTATTCAACTGCTCCATAACGGCTGGCGCTATCAGGAACAGAGTGCTATTGGTCAGGCATAGTTGCTGGCTAATGACCTCACCGCGGTGGGTTTTTATCGGCTGGcac < 2:1597207/150‑1 (MQ=255)
cGTCTACTGCTCATCAGTTGCTGATACGCTGCCAGGCGTTACTTATTCAACTGCTCCATAACGGCTGGCGCTATCAGGAACAGAGTGCTATTGGTCAGGCATAGTTGCTGGCTAATGACCTCACCGCGGTGGGTTTTTATCGGCTGGcac > 1:1230971/1‑150 (MQ=255)
tACTGCTCATCAGTTGCTGATACGCTGCCAGGCGTTACTTATTCAACTGCTCCATAACGGCTGGCGCTATCAGGAACAGAGTGCTATTGGTCAGGCATAGTTGCTGGCTAATGACCTCACCGCGGTGGGTTTTTATCGGCTGGCACAtgt > 2:4596455/1‑150 (MQ=255)
aCTGCTCATCAGTTGCTGATACGCTGCCAGGCGTTACTTATTCAACTGCTCCATAACGGCTGGCGCTATCAGGAACAGAGTGCTATTGGTCAGGCATAGTTGCTGGCTAATGACCTCACCGCGGTGGGTTTTTATCGGCTGGCACAtgtg > 1:1245986/1‑150 (MQ=255)
aCTGCTCATCAGTTGCTGATACGCTGCCAGGCGTTACTTATTCAACTGCTCCATAACGGCTGGCGCTATCAGGAACAGAGTGCTATTGGTCAGGCATAGTTGCTGGCTAATGACCTCACCGCGGTGGGTTTTTATCGGCTGGCACAtgtg > 2:3324434/1‑150 (MQ=255)
cTGCTCATCAGTTGCTGATACGCTGCCAGGCGTTACTTATTCAACTGCTCCATAACGGCTGGCGCTATCAGGAACAGAGTGCTATTGGTCAGGCATAGTTGCTGGCGAATGACCTCACCGCGGTGGGTTTTTATCGGCTGGCACATgtgt > 2:4472865/1‑150 (MQ=255)
tcatcaGTTGCTGATACGCTGCCAGGCGTTACTTATTCAACTGCTCCATAACGGCTGGCGCTATCAGGAACAGAGTGCTATTGGTCAGGCATAGTTGCTGGCTAATGACCTCACCGCGGTGGGTTTTTATCGGCTGGCACATGTGTTggg > 1:481423/1‑150 (MQ=255)
atcaGTTGCTGATACGCTGCCAGGCGTTACTTATTCAACTGCTCCATAACGGCTGGCGCTATCAGGAACAGAGTGCTATTGGTCAGGCATAGTTGCTGGCTAATGACCTCACCGCGGTGGGTTTTTATCGGCTGGCACATGTGTTGGGAc > 1:4345595/1‑150 (MQ=255)
tcaGTTGCTGATACGCTGCCAGGCGTTACTTATTCAACTGCTCCATAACGGCTGGCGCTATCAGGAACAGAGTGCTATTGGTCAGGCATAGTTGCTGGCTAATGACCTCACCGCGGTGGGTTTTTATCGGCTGGCACATGTGTTGGGACa < 2:2728991/150‑1 (MQ=255)
caGTTGCTGATACGCTGCCAGGCGTTACTTATTCAACTGCTCCATAACGGCTGGCGCTATCAGGAACAGAGTGCTATTGGTCAGGCATAGTTGCTGGCTAATGACCTCACCGCGGTGGGTTTTTATCGGCTGGCTCATGTGTTGGGACaa < 1:2431271/150‑1 (MQ=255)
caGTTGCTGATACGCTGCCAGGCGTTACTTATTCAACTGCTCCATAACGGCTGGCGCTATCAGGAACAGAGTGCTATTGGTCAGGCATAGTTGCTGGCTAATGACCTCACCGCGGTGGGTTTTTATCGGCTGGCACATGTGTTGGGACaa < 1:134195/150‑1 (MQ=255)
gTTGCTGATACGCTGCCAGGCGTTACTTATTCAACTGCTCCATAACGGCTGGCGCTATCAGGAACAGAGTGCTATTGGTCAGGCATAGTTGCTGGCTAATGACCTCACCGCGGTGGGTTTTTATCGGCTGGCACATGTGTTGGGACAAtt < 1:3678705/150‑1 (MQ=255)
ttGCTGATACGCTGCCAGGCGTTACTTATTCAACTGCTCCATAACGGCTGGCGCTATCAGGAACAGAGTGCTATTGGTCAGGCATAGTTGCTGGCTAATGACCTCACCGCGGTGGGTTTTTATCGGCTGGCACATGTGTTGGGACAAttt > 1:549969/1‑150 (MQ=255)
tGCTGATACGCTGCCAGGCGTTACTTATTCAACTGCTCCATAACGGCTGGCGCTATCAGGAACAGAGTGCTATTGGTCAGGCATAGTTGCTGGCTAATGGCCTCACCGCGGTGGGTTTTTATCGGCTGGCACATGTGTTGGGACAATTTc < 2:2558287/150‑1 (MQ=255)
tGCTGATACGCTGCCAGGCGTTACTTATTCAACTGCTCCATAACGGCTGGCGCTATCAGGAACAGAGTGCTATTGGTCAGGCATAGTTGCTGGCTAATGACCTCACCGCGGTGGGTTTTTATCGGCTGGCACATGTGTTGGGACAATTTc < 2:1165184/150‑1 (MQ=255)
tGCTGATACGCTGCCAGGCGTTACTTAGTCAACTGCTCCATAACGGCTGGCGCTATCAGGAACAGAGTGCTATTGGTCAGGCATAGTTGCTGGCTAATGGCCTCACCGCGGTGGGTTTTTATCGGCTGGCACATGTGTTGGGACAATTTc < 2:1245869/150‑1 (MQ=255)
gATACGCTGCCAGGCGTTACTTATTCAACTGCTCCATAACGGCTGGCGCTATCAGGAACAGAGTGCTATTGGTCAGGCATAGTTGCTGGCTAATGACCTCACCGCGGTGGGTTTTTATCGGCTGGCACATGTGTTGGGACAATTTCGTac > 1:4319011/1‑149 (MQ=255)
gATACGCTGCCAGGCGTTACTTATTCAACTGCTCCATAACGGCTGGCGCTATCAGGAACAGAGTGCTATTGGTCAGGCATAGTTGCTGGCGAATGACCTCACCGCGGTGGGTTTTTATCGGCTGGCACATGTGTTGGGACAATTTCGTaa < 2:626716/150‑1 (MQ=255)
gATACGCTGCCAGGCGTTACTTATTCAACTGCTCCATAACGGCTGGCGCTATCAGGAACAGAGTGCTATTGGTCAGGCATAGTTGCTGGCGAATGACCTCACCGCGGTGGGTTTTTATCGGCTGGCACATGTGTTGGGACAATTTCGTaa > 2:4080237/1‑150 (MQ=255)
tACGCTGCCAGGCGTTACTTATTCAACTGCTCCATAACGGCTGGCGCTATCAGGAACAGAGTGCTATTGGTCAGGCATAGTTGCTGGCGAATGACCTCACCGCGGTGGGTTTTTATCGGCTGGCACATGTGTTGGGACAATTTCGTAATa < 1:2340507/150‑1 (MQ=255)
aCGCTGCCAGGCGTTACTTATTCAACTGCTCCATAACGGCTGGCGCTATCAGGAACAGAGTGCGATTGGTCAGGCATAGTTGCTGGCGAATGACCTCACCGCGGTGGGTTTTTATCGTCTGGCACATGTGTTGGGACAATTTCGTAATAc > 2:533228/1‑150 (MQ=255)
cTGCCAGGCGTTACTTATTCAACTGCTCCATAACGGCTGGCGCTATCAGGAACAGAGTGCTATTGGTCAGGCATAGTTGCTGGCGAATGACCTCACCGCGGTGGGTTTTTATCGGCTGGCACATGTGTTGGGACAATTTCGTAATACAGa < 2:3530245/150‑1 (MQ=255)
tGCCAGGCGTTACTTATTCAACTGCTCCATAACGGCTGGCGCTATCAGGAACAGAGTGCTATTGGTCAGGCATAGTTGCTGGCGAATGACCTCACCGCGGTGGGTTTTTATCGGCTGGCACATGTGTTGGGACAATTTCGTAATACAGaa > 1:1990621/1‑150 (MQ=255)
gCCAGGCGTTACTTATTCAACTGCTCCATAACGGCTGGCGCTATCAGGAACAGAGTGCTATTGGTCAGGCATAGTTGCTGGCTAATGACCTCACCGCGGTGGGTTTTTATCGGCTGGCACATGTGTTGGGACAATTTCGTAATACAGaaa > 1:1928951/1‑150 (MQ=255)
cAGGCGTTACTTATTCAACTGCTCCATAACGGCTGGCGCTATCAGGAACAGAGTGCTATTGGTCAGGCATAGTTGCTGGCTAATGACCTCACCGCGGTGGGTTTTTATCGGCTGGCACATGTGTTGGGACAATTTCGTAATACAGAAAGc > 1:978067/1‑150 (MQ=255)
aGGCGTTACTTATTCAACTGCTCCATAACGGCTGGCGCTATCAGGAACAGAGTGCTATTGGTCAGGCATAGTTGCTGGCTAATGACCTCACCGCGGTGGGTTTTTATCGGCTGGCACATGTGTTGGGACAATTTCGTAATACAGAAAGCg < 1:3454770/150‑1 (MQ=255)
ggCGTTACTTATTCAACTGCTCCATAACGGCTGGCGCTATCAGGAACAGAGTGCTATTGGTCAGGCATAGTTGCTGGCTAATGACCTCACCGCGGTGGGTTTTTATCGGCTGGCACATGTGTTGGGACAATTTCGTAATACAGAAAGCGa > 2:1989177/1‑150 (MQ=255)
gCGTTACTTATTCAACTGCTCCATAACGGCTGGCGCTATCAGGAACAGAGTGCTATTGGTCAGGCATAGTTGCTGGCTAATGACCTCACCGCGGTGGGTTTTTATCGGCTGGCACATGTGTTGGGACAATTTCGTAATACAGAAAGCGAg < 1:3266070/150‑1 (MQ=255)
gCGTTACTTATTCAACTGCTCCATAACGGCTGGCGCTATCAGGAACAGAGTGCTATTGGTCAGGCATAGTTGCTGGCGAATGACCTCACCGCGGTGGGTTTTTATCGGCTGGCACATGTGTTGGGACAATTTCGTAATACAGAAAGCGAg < 1:1078657/150‑1 (MQ=255)
gTTACTTATTCAACTGCTCCATAACGGCTGGCGCTATCAGGAACAGAGTGCTATTGGTCAGGCATAGTTGCTGGCGAATGACCTCACCGCGGTGGGTTTTTATCGGCTGGCACATGTGTTGGGACAATTTCGTAATACAGAAAGCGAGGc > 1:868357/1‑150 (MQ=255)
gTTACTTATTCAACTGCTCCATAACGGCTGGCGCTATCAGGAACAGAGTGCTATTGGTCAGGCATAGTTGCTGGCGAATGACCTCACCGCGGTGGGTTTTTATCGGCTGGCACATGTGTTGGGACAATTTCGTAATACAGAAAGCGAGGc > 1:282675/1‑150 (MQ=255)
tACTTATTCAACTGCTCCATAACGGCTGGCGCTATCAGGAACAGAGTGCTATTGGTCAGGCATAGTTGCTGGCGAATGACCTCACCGCGGTGGGTTTTTATCGGCTGGCACATGTGTTGGGACAATTTCGTAATACAGAAAGCGAGGCAc < 2:3270144/150‑1 (MQ=255)
tATTCAACTGCTCCATAACGGCTGGCGCTATCAGGAACAGAGTGCTATTGGTCAGGCATAGTTGCTGGCTAATGACCTCACCGCGGTGGGTTTTTATCGGCTGGCACATGTGTTGGGACAATTTCGTAATACAGAAAGCGAGGCACGGGt < 1:717901/150‑1 (MQ=255)
tATTCAACTGCTCCATAACGGCTGGCGCTATCAGGAACAGAGTGCTATTGGTCAGGCATAGTTGCTGGCTAATGACCTCACCGCGGTGGGTTTTTATCGGCTGGCACATGTGTTGGGACAATTTCGTAATACAGAAAGCGAGGCACGGGt > 1:3382147/1‑150 (MQ=255)
tATTCAACTGCTCCATAACGGCTGGCGCTATCAGGAACAGAGTGCTATTGGTCAGGCATAGTTGCTGGCGAATGACCTCACCGCGGTGGGTTTTTATCGGCTGGCACATGTGTTGGGACAATTTCGTAATACAGAAAGCGAGGCACGGGt < 2:4192867/150‑1 (MQ=255)
tCAACTGCTCCATAACGGCTGGCGCTATCAGGAACAGAGTGCTATTGGTCAGGCATAGTTGCTGGCTAATGACCTCACCGCGGTGGGTTTTTATCGGCTGGCACATGTGTTGGGACAATTTCGTAATACAGAAAGCGAGGCACGGGTAGa > 1:2874209/1‑150 (MQ=255)
aaCTGCTCCATAACGGCTGGCGCTATCAGGAACAGAGTGCTATTGGTCAGGCATAGTTGCTGGCTAATGACCTCACCGCGGTGGGTTTTTATCGGCTGGCACATGTGTTGGGACAATTTCGTAATACAGAAAGCGAGGCACGGGTAGAAg > 2:121401/1‑150 (MQ=255)
aCTGCTCCATAACGGCTGGCGCTATCAGGAACAGAGTGCTATTGGTCAGGCATAGTTGCTGGCTAATGACCTCACCGCGGTGGGTTTTTATCGGCTGGCACATGTGTTGGGACAATTTCGTAATACAGAAAGCGAGGCACGGGTAGAAGc < 1:3592667/150‑1 (MQ=255)
tGCTCCATAACGGCTGGCGCTATCAGGAACAGAGTGCTATTGGTCAGGCATAGTTGCTGGCGAATGACCTCACCGCGGTGGGTTTTTATCGGCTGGCACATGTGTTGGGACAATTTCGTAATACAGAAAGCGAGGCACGGGTAGAAGCaa > 2:4002752/1‑150 (MQ=255)
cTCCATAACGGCTGGCGCTATCAGGAACAGATTGATATTGGTCAGGCATAGTTGCTGGCTAATGACCTCACCGCGGTGGGTTTTTATCGGATGGCACATTTGTTGGGACAATTTCGTAATACAGAAATCGAGGAACGGGTATAAGCTATg < 2:812439/150‑1 (MQ=255)
cTCCATAACGGCTGGAGCTATCAGGAACAGAGTGCTATTTGTCAGGCATAGTTGCTGGCGAATGACCTCACCGCGGTGGGTTTTTATCGGCTGGCACATGTGTTGGGACAATTTCGTAATACAGAAAGCGAGGCACGGGTAGAAGCAATg < 2:2420788/150‑1 (MQ=255)
ccATAACGGCTGGCGCTATCAGGAACAGAGTGCTATTGGTCAGGCATAGTTGCTGGCGAATGACCTCACCGCGGTGGGTTTTTATCGGCTGGCACATGTGTTGGGACAATTTCGTAATACAGAAAGCGAGGCACGGGTAGAAGCAATGaa < 1:312895/150‑1 (MQ=255)
cATAACGGCTGGCGCTATCAGGAACAGAGTGCTATTGGTCAGGCATAGTTGCTGGCGAATGACCTCACCGCGGTGGGTTTTTATCGGCTGGCACATGTGTTGGGACAATTTCGTAATACAGAAAGCGAGGCACGGGTAGAAGCAATGAAt > 2:1721396/1‑150 (MQ=255)
aTAACGGCTGGCGCTATCAGGAACAGAGTGCTCTTGGTCAGGCATAGTTGCTGGCTAATGACCTCACCGCGGTGGGTTTTTATCGGCTGGCCCATGTGTTGGGACAATTTCGTAATACAGAAAGCGAGGCACGGGTAGAAGCAATGAATa > 2:2926062/1‑150 (MQ=255)
aTAACGGCTGGCGCTATCAGGAACAGAGTGCTATTGGTCAGGCATAGTTGCTGGCGAATGACCTCACCGCGGTGGGTTTTTATCGGCTGGCACATGTGTTGGGACAATTTCGTAATACAGAAAGCGAGGCACGGGTAGAAGCAATGAATa < 2:2104185/150‑1 (MQ=255)
tAACGGCTGGCGCTATCAGGAACAGAGTGCTATTGGTCAGGCATAGTTGCTGGCTAATGACCTCACCGCGGTGGGTTTTTATCGGCTGGCACATGTGTTGGGACAATTTCGTAATACAGAAAGCGAGGCACGGGTAGAAGCAATGAATaa > 1:421077/1‑150 (MQ=255)
tAACGGCTGGCGCTATCAGGAACAGAGTGCTATTGGTCAGGCATAGTTGCTGGCGAATGACCTCACCGCGGTGGGTTTTTATCGGCTGGCACATGTGTTGGGACAATTTCGTAATACAGAAAGCGAGGCACGGGTAGAAGCAATGAATaa > 2:3607365/1‑150 (MQ=255)
ggCTGGCGCTATCAGGAACAGAGTGCTATTGGTCAGGCATAGTTGCTGGCGAATGACCTCACCGCGGTGGGTTTTTATCGGCTGGCACATGTGTTGGGACAATTTCGTAATACAGAAAGCGAGGCACGGGTAGAAGCAATGAATAACGgt < 2:1631783/150‑1 (MQ=255)
ggCTGGCGCTATCAGGAACAGAGTGCTATTGGTCAGGCATAGTTGCTGGCGAATGACCTCACCGCGGTGGGTTTTTATCGGCTGGCACATGTGTTGGGACAATTTCGTAATACAGAAAGCGAGGCACGGGTAGAAGCAATGAATAACGgt > 1:1687379/1‑150 (MQ=255)
cTGGCGCTATCAGGAACAGAGTGCTATTGGTCAGGCATAGTTGCTGGCTAATGACCTCACCGCGGTGGGTTTTTATCGGCTGGCACATGTGTTGGGACAATTTCGTAATACAGAAAGCGAGGCACGGGTAGAAGCAATGAATAACGgtgt < 1:3009448/150‑1 (MQ=255)
tGGCGCTATCAGGAACAGAGTGCTATTGGTCAGGCATAGTTGCTGGCGAATGACCTCACCGCGGTGGGTTTTTATCGGCTGGCACATGTGTTGGGACAATTTCGTAATACAGAAAGCGAGGCACGGGTAGAAGCAATGAATAACGGTGtt > 1:3968106/1‑150 (MQ=255)
ggCGCTATCAGGAACAGAGTGCTATTGGTCAGGCATAGTTGCTGGCTAATGACCTCACCGCGGTGGGTTTTTATCGGCTGGCACATGTGTTGGGACAATTTCGTAATACAGAAAGCGAGGCACGGGTAGAAGCAATGAATAACGGTGttt > 1:2449647/1‑150 (MQ=255)
ggCGCTATCAGGAACAGAGTGCTATTGGTCAGGCATAGTTGCTGGCTAATGACCTCACCGCGGTGGGTTTTTATCGGCTGGCACATGTGTTGGGACAATTTCGTAATACAGAAAGCGAGGCACGGGTAGAAGCAATGAATAACGGTGttt < 2:2165690/150‑1 (MQ=255)
gcgcTATCAGGAACAGAGTGCTATTGGTCAGGCATAGTTGCTGGCTAATGACCTCACCGCGGTGGGTTTTTATCGGCTGGCACATGTGTTGGGACAATTTCGTAATACAGAAAGCGAGGCACGGGTAGAAGCAATGAATAACGGTGtttt < 2:2892525/150‑1 (MQ=255)
cgcTATCAGGAACAGAGTGCTATTGGTCAGGCATAGTTGCTGGCGAATGACCTCACCGCGGTGGGTTTTTATCGGCTGGCACATGTGTTGGGACAATTTCGTAATACAGAAAGCGAGGCACGGGTAGAAGCAATGAATAACGGTGTtttg > 2:1091231/1‑150 (MQ=255)
aTCAGGAACAGAGTGCTATTGGTCAGGCATAGTTGCTGGCTAATGACCTCACCGCGGTGGGTTTTTATCGGCTGGCACATGTGTTGGGACAATTTCGTAATACAGAAAGCGAGGCACGGGTAGAAGCAATGAATAACGGTGTtttgcttt < 1:2687812/150‑1 (MQ=255)
aTCAGGAACAGAGTGCTATTGGTCAGGCATAGTTGCTGGCGAATGACCTCACCGCGGTGGGTTTTTATCGGCTGGCACATGTGTTGGGACAATTTCGTAATACAGAAAGCGAGGCACGGGTAGAAGCAATGAATAACGGTGTtttgcttt > 1:4143683/1‑150 (MQ=255)
tCAGGAACAGAGTGCTATTGGTCAGGCATAGTTGCTGGCGAATGACCTCACCGCGGTGGGTTTTTATCGGCTGGCACATGTGTTGGGACAATTTCGTAATACAGAAAGCGAGGCACGGGTAGAAGCAATGAATAACGGTGTtttgctttg < 2:3373098/150‑1 (MQ=255)
cAGGAACAGAGTGCTATTGGTCAGGCATAGTTGCTGGCGAATGACCTCACCGCGGTGGGTTTTTATCGGCTGGCACATGTGTTGGGACAATTTCGTAATACAGAAAGCGAGGCACGGGTAGAAGCAATGAATAACGGTGTtttgctttgc < 2:1448695/150‑1 (MQ=255)
ggAACAGAGTGCTATTGGTCAGGCATAGTTGCTGGCTAATGACCTCACCGCGGTGGGTTTTTATCGGCTGGCACATGTGTTGGGACAATTTCGTAATACAGAAAGCGAGGCACGGGTAGAAGCAATGAATAACGGTGTTTTGCTTTGCGa > 2:3757048/1‑150 (MQ=255)
gagTGCTATTGGTCAGGCATAGTTGCTGGCTAATGACCTCACCGCGGTGGGTTTTTATCGGCTGGCACATGTGTTGGGACAATTTCGTAATACAGAAAGCGAGGCACGGGTAGAAGCAATGAATAACGGTGTTTTGCTTTGCGAACAatt < 1:2973018/150‑1 (MQ=255)
tGCTATTGGTCAGGCATAGTTGCTGGCTAATGACCTCACCGCGGTGGGTTTTTATCGGCTGGCACATGTGTTGGGACAATTTCGTAATACAGAAAGCGAGGCACGGGTAGAAGCAATGAATAACGGTGTTTTGCTTTGCGAACAattatt > 1:211081/1‑150 (MQ=255)
cTATTGGTCAGGCATAGTTGCTGGCTAATGACCTCACCGCGGTGGGTTTTTATCGGCTGGCACATGTGTTGGGACAATTTCGTAATACAGAAAGCGAGGCACGGGTAGAAGCAATGAATAACGGTGTTTTGCTTTGCGAACAATTATTcc > 1:3502132/1‑150 (MQ=255)
cTATTGGTCAGGCATAGTTGCTGGCTAATGACCTCACCGCGGTGGGTTTTTATCGGCTGGCACATGTGTTGGGACAATTTCGTAATACAGAAAGCGAGGCACGGGTAGAAGCAATGAATAACGGTGTTTTGCTTTGCGAACAATTATTcc > 2:4540622/1‑150 (MQ=255)
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TCAGGCATAGTTGCTGGCGAATGACCTCACCGCGGTGGGTTTTTATCGGCTGGCACATGTGTTGGGACAATTTCGTAATACAGAAAGCGAGGCACGGGTAGAAGCAATGAATAACGGTGTTTTGCTTTGCGAACAATTATTCCCCATGCT > SRR19973072.277987/1‑150 (MQ=60)
TCAGGCATAGTTGCTGGCGAATGACCTCACCGCGGTGGGTTTTTATCGGCTGGCACATGTGTTGGGACAATTTCGTAATACAGAAAGCGAGGCACGGGTAGAAGCAATGAATAACGGTGTTTTGCTTTGCGAACAATTATTCCCCATGCT > SRR19973072.278000/1‑150 (MQ=60)
CAGGCATAGTTGCTGGCTAATGACCTCACCGCGGTGGGTTTTTATCGGCTGGCACATGTGTTGGGACAATTTCGTAATACAGAAAGCGAGGCACGGGTAGAAGCAATGAATAACGGTGTTTTGCTTTGCGAAGAATTATTCCCCATGCTT > SRR19973072.3608514/1‑150 (MQ=60)
CAGGCATAGTTGCTGGCTAATGACCTCACCGCGGTGGGTTTTTATCGGCTGGCACATGTGTTGGGACAATTTCGTAATACAGAAAGCGAGGCACGGGTAGAAGCAATGAATAACGGTGTTTTGCTTTGCGAACAATTATTCCCCATGCTT < SRR19973072.1140426/150‑1 (MQ=60)
CAGGCATAGTTGCTGGCTAATGACCTCACCGCGGTGGGTTTTTATCGGCTGGCACATGTGTTGGGACAATTTCGTAATACAGAAAGCGAGGCACGGGTAGAAGCAATGAATAACGGTGTTTTGCTTTGCGAACAATTATTCCCCATGCTT > SRR19973072.3295698/1‑150 (MQ=60)
AGGCATAGTTGCTGGCGAATGACCTCACCGCGGTGGGTTTTTATCGGCTGGCACATGTGTTGGGACAATTTCGTAATACAGAAAGCGAGGCACGGGTAGAAGCAATGAATAACGGTGTTTTGCTTTGCGAACAATTATTCCCCATGCTTC < SRR19973072.3568293/150‑1 (MQ=60)
GGCATAGTTGCTGGCTAATGACCTCACCGCGGTGGGTTTTTATCGGCTGGCACATGTGTTGGGACAATTTCGTAATACAGAAAGCGAGGCACGGGTAGAAGCAATGAATAACGGTGTTTTGCTTTGCGAACAATTATTCCCCATGCTTCA < SRR19973072.4309083/150‑1 (MQ=60)
GGCATAGTTGCTGGCTAATGACCTCACCGCGGTGGGTTTTTATCGGCTGGCACATGTGTTGGGACAATTTCGTAATACAGAAAGCGAGGCACGGGTAGAAGCAATGAATAACGGTGTTTTGCTTTGCGAACAATTATTCCCCATGCTTCA < SRR19973072.4309010/150‑1 (MQ=60)
GGCATAGTTGCTGGCTAATGACCTCACCGCGGTGGGTTTTTATCGGCTGGCACATGTGTTGGGACAATTTCGTAATACAGAAAGCGAGGCACGGGTAGAAGCAATGAATAACGGTGTTTTGCTTTGCGAACAATTATTCCCCATGCTTCA > SRR19973072.1847191/1‑150 (MQ=60)
GGCATAGTTGCTGGCTAATGACCTCACCGCGGTGGGTTTTTATCGGCTGGCACATGTGTTGGGACAATTTCGTAATACAGAAAGCGAGGCACGGGTAGAAGCAATGAATAACGGTGTTTTGCTTTGCGAACAATTATTCCCCATGCTTCA < SRR19973072.4308953/150‑1 (MQ=60)
GGCATAGTTGCTGGCGAATGACCTCACCGCGGTGGGTTTTTATCGGCTGGCACATGTGTTGGGACAATTTCGTAATACAGAAAGCGAGGCACGGGTAGAAGCAATGAATAACGGTGTTTTGCTTTGCGAACAATTATTCCCCATGCTTCA > SRR19973072.1388858/1‑150 (MQ=60)
ATAGTTGCTGGCTAATGACCTCACCGCGGTGGGTTTTTATCGGCTGGCACATGTGTTGGGACAATTTCGTAATACAGAAAGCGAGGCACGGGTAGAAGCAATGAATAACGGTGTTTTGCTTTGCGAACAATTATTCCCCATGCTTCAGCA < SRR19973072.2627896/150‑1 (MQ=60)
ATAGTTGCTGGCTAATGACCTCACCGCGGTGGGTTTTTATCGGCTGGCACATGTGTTGGGACAATTTCGTAATACAGAAAGCGAGGCACGGGTAGAAGCAATGAATAACGGTGTTTTGCTTTGCGAACAATTATTCCCCATGCTTCAGCA < SRR19973072.2627954/150‑1 (MQ=60)
ATAGTTGCTGGCTAATGACCTCACCGCGGTGGGTTTTTATCGGCTGGCACATGTGTTGGGACAATTTCGTAATACAGAAAGCGAGGCACGGGTAGAAGCAATGAATAACGGTGTTTTGCTTTGCGAACAATTATTCCCCATGCTTCAGCA < SRR19973072.1356327/150‑1 (MQ=60)
AGTTGCTGGCTAATGACCTCACCGCGGTGGGTTTTTATCGGCTGGCACATGTGTTGGGACAATTTCGTAATACAGAAAGCGAGGCACGGGTAGAAGCAATGAATAACGGTGTTTTGCTTTGCGAACAATTATTCCCCATGCTTCAGCAAC < SRR19973072.1221655/150‑1 (MQ=60)
TTGCTGGCTAATGACCTCACCGCGGTGGGTTTTTATCGGCTGGCACATGTGTTGGGACAATTTCGTAATACAGAAAGCGAGGCACGGGTAGAAGCAATGAATAACGGTGTTTTGCTTTGCGAACAATTATTCCCCATGCTTCAGCAACAA < SRR19973072.3942478/150‑1 (MQ=60)
GCTGGCTAATGACCTCACCGCGGTGGGTTTTTATCGGCTGGCACATGTGTTGGGACAATTTCGTAATACAGAAAGCGAGGCACGGGTAGAAGCAATGAATAACGGTGTTTTGCTTTGCGAACAATTATTCCCCATGCTTCAGCAACAAGG > SRR19973072.1657502/1‑150 (MQ=60)
CTGGCGAATGACCTCACCGCGGTGGGTTTTTATCGGCTGGCACATGTGTTGGGACAATTTCGTAATACAGAAAGCGAGGCACGGGTAGAAGCAATGAATAACGGTGTTTTGCTTTGCGAACAATTATTCCCCATGCTTCAGCAACAAGGA > SRR19973072.1260168/1‑150 (MQ=60)
TGGCGAATGACCTCACCGCGGTGGGTTTTTATCGGCTGGCACATGTGTTGGGACAATTTCGTAATACAGAAAGCGAGGCACGGGTAGAAGCAATGAATAACGGTGTTTTGCTTTGCGAACAATTATTCCCCATGCTTCAGCAACAAGGAT < SRR19973072.1584623/150‑1 (MQ=60)
TGGCGAATGACCTCACCGCGGTGGGTTTTTATCGGCTGGCACATGTGTTGGGACAATTTCGTAATACAGAAAGCGAGGCACGGGTAGAAGCAATGAATAACGGTGTTTTGCTTTGCGAACAATTATTCCCCATGCTTCAGCAACAAGGAT < SRR19973072.1584680/150‑1 (MQ=60)
TGGCGAATGACCTCACCGCGGTGGGTTTTTATCGGCTGGCACATGTGTTGGGACAATTTCGTAATACAGAAAGCGAGGCACGGGTAGAAGCAATGAATAACGGTGTTTTGCTTTGCGAACAATTATTCCCCATGCTTCAGCAACAAGGAT < SRR19973072.534494/150‑1 (MQ=60)
GGCTAATGACCTCACCGCGGTGGGTTTTTATCGGCTGGCACATGTGTTGGGACAATTTCGTAATACAGAAAGCGAGGCACGGGTAGAAGCAATGAATAACGGTGTTTTGCTTTGCGAACAATTATTCCCCATGCTTCAGCAACAAGGATG < SRR19973072.3165666/150‑1 (MQ=60)
GGCTAATGACCTCACCGCGGTGGGTTTTTATCGGCTGGCACATGTGTTGGGACAATTTCGTAATACAGAAAGCGAGGCACGGGTAGAAGCAATGAATAACGGTGTTTTGCTTTGCGAACAATTATTCCCCATGCTTCAGCAACAAGGATG < SRR19973072.3165734/150‑1 (MQ=60)
GCTAATGACCTCACCGCGGTGGGTTTTTATCGGCTGGCACATGTGTTGGGACAATTTCGTAATACAGAAAGCGAGGCACGGGTAGAAGCAATGAATAACGGTGTTTTGCTTTGCGAACAATTATTCCCCATGCTTCAGCAACAAGGATGA < SRR19973072.3392721/150‑1 (MQ=60)
GCTAATGACCTCACCGCGGTGGGTTTTTATCGGCTGGCACATGTGTTGGGACAATTTCGTAATACAGAAAGCGAGGCACGGGTAGAAGCAATGAATAACGGTGTTTTGCTTTGCGAACAATTATTCCCCATGCTTCAGCAACAAGGATGA < SRR19973072.3392719/150‑1 (MQ=60)
GCTAATGACCTCACCGCGGTGGGTTTTTATCGGCTGGCACATGTGTTGGGACAATTTCGTAATACAGAAAGCGAGGCACGGGTAGAAGCAATGAATAACGGTGTTTTGCTTTGCGAACAATTATTCCCCATGCTTCAGCAACAAGGATGA < SRR19973072.3392654/150‑1 (MQ=60)
GAATGACCTCACCGCGGTGGGTTTTTATCGGCTGGCACATGTGTTGGGACAATTTCGTAATACAGAAAGCGAGGCACGGGTAGAAGCAATGAATAACGGTGTTTTGCTTTGCGAACAATTATTCCCCATGCTTCAGCAACAAGGATGAAA < SRR19973072.4088801/150‑1 (MQ=60)
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GCACCGCTACCTTCTGCCAGCGTTTTGCCTGTGCCGTCTACTGCTCATCAGTTGCTGATACGCTGCCAGGCGTTACTTATTCAACTGCTCCATAACGGCTGGCGCTATCAGGAACAGAGTGCTATTGGTCAGGCATAGTTGCTGGCGAATGACCTCACCGCGGTGGGTTTTTATCGGCTGGCACATGTGTTGGGACAATTTCGTAATACAGAAAGCGAGGCACGGGTAGAAGCAATGAATAACGGTGTTTTGCTTTGCGAACAATTATTCCCCATGCTTCAGCAACAAGGATGAAA > CP009273/2204286‑2204581
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |