Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F224 I0 R1
|
1457 |
284.0 |
9290224 |
95.7% |
8890744 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
2,549,778 |
C→A |
12.7% |
M293I (ATG→ATT) |
eutC ← |
ethanolamine ammonia‑lyase, small subunit (light chain) |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 2,549,778 | 0 | C | A | 12.7%
| 968.4
/ 70.1
| 277 | M293I (ATG→ATT) | eutC | ethanolamine ammonia‑lyase, small subunit (light chain) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (132/109); new base A (21/15); total (153/124) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.23e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 280 total aligned reads displayed.
GAGTCGGCAGAAATCAGACCGAGGCTACGAATATGCGGCGGCAATTTCAGTTCACGCGCAAAATCGGCGTTAACGGAGGCAATCACCCGCATAGCGGTGACAGACGGTCGAATCAAATCTAAAGCTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTCATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGTGAATGTTAGAGATACAGGTGCGATCGGCCTCAACGGTGGTCGCCATACGCGGCGAGTA > CP009273/2549629‑2549927
|
gTCGGCAGAAATCAGACCGAGGCTACGAATATGCGGCGGCAATTTAAGTTCACGCGCAAAATCGGCGTTAACGGAGGCAATCACCCGCATAGCGGTGACAGACGGTCGAATCAAATCTAAAGCTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTCAt < 2:418562/150‑1 (MQ=255)
cGGCAGAAATCAGACCGAGGCTACGAATATGCGGCGGCAATTTAAGTTCACGCGCAAAATCGGCGTTAACGGAGGCAATCACCCGCATAGCGGTGACAGACGGTCGAATCAAATCTAAAGCTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTCATGt > 1:1948365/1‑150 (MQ=255)
cGGCAGAAATCAGACCGAGGCTACGAATATGCGGCGGCAATTTAAGTTCACGCGCAAAATCGGCGTTAACGGAGGCAATCACCCGCATAGCGGTGACAGACGGTCGAATCAAATCTAAAGCTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTCATGt > 1:2707784/1‑150 (MQ=255)
ggCAGAAATCAGACCGAGGCTACGAATATGCGGCGGCAATTTAAGTTCACGCGCAAAATCGGCGTAAACGGAGGCAATCACCCGCATAGCGGTGACAGACGGTCGAATCAAATCTAAAGCTGGCATGATGCATCCTTAGCGGGTCATGtt > 1:3310453/1‑150 (MQ=255)
aGAAATCAGACCGAGGCTACGAATATGCGGCGGCAATTTAAGTTCACGCGCAAAATCGGCGTTAACGGAGGCAATCACCCGCATAGCGGTGACAGACGGTCGAATCAAATCTAAAGCTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTCATGTTGAt < 1:1994275/150‑1 (MQ=255)
gAAATCAGACCGAGGCTACGAATATGCGGCGGCAATTTCAGTTCACGCGCAAAATCGGCGTTAACGGAGGCAATCACCCGCATAGCGGTGACAGACGGTCGAATCAAATCTAAAGCTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTCATGTTGATg > 2:4397960/1‑150 (MQ=255)
aaTCAGACCGAGGCTACGAATATGCGGCGGCAATTTAAGTTCACGCGCAAAATCGGCGTTAACGGAGGCAATCACCCGCATAGCGGTGACAGACGGTCGAATCAAATCTAAAGCTGGCACGATGCCTCCTTATCGGGTCATGTTGATGcc < 1:2380571/150‑1 (MQ=255)
aGACCGAGGCTACGAATATGCGGCGGCAATTTAAGTTCACGCGCAAAATCGGCGTTAACGGAGGCAATCACCCGCATAGCGGTGACAGACGGTCGAATCAAATCTAAAGCTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTCATGTTGATGCCGGAt > 2:1154627/1‑150 (MQ=255)
cGAGGCTACGAATATGCGGCGGCAATTTAAGTTCACGCGCAAAATCGGCGTTAACGGAGGCAATCACCCGCATAGCGGTGACAGACGGTCGAATCAAATCTAAAGCTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTCATGTTGATGCCGGATGCtt < 2:4243732/150‑1 (MQ=255)
gAGGCTACGAATATGCGGCGGCAATTTAAGTTCACGCGCAAAATCGGCGTTAACGGAGGCAATCACCCGCATAGCGGTGACAGACGGTCGAATCAAATCTAAAGCTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTCATGTTGATGCCGGATGCttt < 2:1306740/150‑1 (MQ=255)
gAGGCTACGAATATGCGGCGGCAATTTAAGTTCACGCGCAAAATCGGCGTTAACGGAGGCAATCACCCGCATAGCGGTGACAGACGGTCGAATCAAATCTAAAGCTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTCATGTTGATGCCGGATGCttt > 2:2653746/1‑150 (MQ=255)
aGGCTACGAATATGCGGCGGCAATTTAAGTTCACGCGCAAAATCGGCGTTAACGGAGGCAATCACCCGCATAGCGGTGACAGACGGTCGAATCAAATCTAAAGCTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTAATGTTGATGCCGGATGCTTTc < 2:2519623/150‑1 (MQ=255)
gCTACGAATATGCGGCGGCAATTTAAGTTCACGCGCAAAATCGGCGTTAACGGAGGCAATCACCCGCATAGCGGTGACAGACGGTCGAATCAAATCTAAAGCTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTCATGTTGATGcc < 1:1023190/138‑1 (MQ=255)
gCTACGAATATGCGGCGGCAATTTAAGTTCACGCGCAAAATCGGCGTTAACGGAGGCAATCACCCGCATAGCGGTGACAGACGGTCGAATCAAATCTAAAGCTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTCATGTTGATGCCGGATGCTTTCTg > 2:3485188/1‑150 (MQ=255)
tACGAATATGCGGCGGCAATTTAAGTTCACGCGCAAAATCGGCGTTAACGGAGGCAATCACCCGCATAGCGGTGACAGACGGTCGAATCAAATCTAAAGCTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTCATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCt < 1:2617949/150‑1 (MQ=255)
tACGAATATGCGGCGGCAATTTAAGTTCACGCGCAAAATCGGCGTTAACGGAGGCAATCACCCGCATAGCGGTGACAGACGGTCGAATCAAATCTAAAGCTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTAATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCt > 2:1024591/1‑150 (MQ=255)
tatGCGGCGGCAATTTAAGTTCACGCGCAAAATCGGCGTTAACGGAGGCAATCACCCGCATAGCGGTGACAGACGGTCGAATCAAATCTAAAGCTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTCATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCa > 2:360694/1‑150 (MQ=255)
tGCGGCGGCAATTTAAGTTCACGCGCAAAATCGGCGTTAACGGAGGCAATCACCCGCATAGCGGTGACAGACGGTCGAATCAAATCTAAAGCTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTCATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATa < 2:4643957/150‑1 (MQ=255)
gcggcgGCAATTTAAGTTCACGCGCAAAATCGGCGTTAACGGAGGCAATCACCCGCATAGCGGTGACAGACGGTCGAATCAAATCTAAAGCTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTCATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATAc < 1:3578259/150‑1 (MQ=255)
ggcggcAATTTAAGTTCACGCGCAAAATCGGCGTTAACGGAGGCAATCACCCGCATAGCGGTGACAGACGGTCGAATCAAATCTAAAGCTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTCATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGt > 1:3703741/1‑150 (MQ=255)
ggcggcAATTTAAGTTCACGCGCAAAATCGGCGTTAACGGAGGCAATCACCCGCATAGCGGTGACAGACGGTCGAATCAAATCTAAAGCTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTCATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGt > 1:3703717/1‑150 (MQ=255)
ggcggcAATTTAAGTTCACGCGCAAAATCGGCGTTAACGGAGGCAATCACCCGCATAGCGGTGACAGACGGTCGAATCAAATCTAAAGCTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTCATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGt > 2:1334322/1‑150 (MQ=255)
gcggcAATTTAAGTTCACGCGCAAAATCGGCGTTAACGGAGGCAATCACCCGCATAGCGGTGACAGACGGTCGAATCAAATCTAAAGCTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTAATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGtt < 2:845092/150‑1 (MQ=255)
cAATTTAAGTTCACGCGCAAAATCGGCGTTAACGGAGGCAATCACCCGCATAGCGGTGACAGACGGTCGAATCAAATCTAAAGCTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTCATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGTTTCGc < 2:3012027/150‑1 (MQ=255)
aaTTTAAGTTCACGCGCAAAATCGGCGTTAACGGAGGCAATCACCCGCATAGCGGTGACAGACGGTCGAATCAAATCTAAAGCTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTCATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGTTTCGcc > 2:3848373/1‑150 (MQ=255)
aaTTTAAGTTCACGCGCAAAATCGGCGTTAACGGAGGCAATCACCCGCATAGCGGTGACAGACGGTCGAATCAAATCTAAAGCTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTCATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGTTTCGcc > 1:2188714/1‑150 (MQ=255)
aaTTTAAGTTCACGCGCAAAATCGGCGTTAACGGAGGCAATCACCCGCATAGCGGTGACAGACGGTCGAATCAAATCTAAAGCTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTCATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGTTTCGcc > 1:2947478/1‑150 (MQ=255)
aaTTTAAGTTCACGCGCAAAATCGGCGTTAACGGAGGCAATCACCCGCATAGCGGTGACAGACGGTCGAATCAAATCTAAAGCTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTAATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGTTTCGcc > 1:2258140/1‑150 (MQ=255)
aaTTTAAGTTCACGCGCAAAATCGGCGTTAACGGAGGCAATCACCCGCATAGCGGTGACAGACGGTCGAATCAAATCTAAAGCTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTAATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGTTTCGcc > 1:207968/1‑150 (MQ=255)
aTTTAAGTTCACGCGCAAAATCGGCGTTAACGGAGGCAATCACCCGCATAGCGGTGACAGACGGTCGAATCAAATCTAAAGCTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTCATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGTTTCGCCa < 1:4003127/150‑1 (MQ=255)
taaGTTCACGCGCAAAATCGGCGTTAACGGAGGCAATCACCCGCATAGCGGTGACAGACGGTCGAATCAAATCTAAAGCTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTAATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGTTTCGCCAAAt > 1:1730458/3‑150 (MQ=255)
taaGTTCACGCGCAAAATCGGCGTTAACGGAGGCAATCACCCGCATAGCGGTGACAGACGGTCGAATCAAATCTAAAGCTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTAATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGTTTCGCCAAAt > 2:4142600/3‑150 (MQ=255)
aGTTCACGCGCAAAATCGGCGTTAACGGAGGCAATCACCCGCATAGCGGTGACAGACGGTCGAATCAAATCTAAAGCTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTCATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGTTTCGCCAAATcc < 2:2166346/150‑1 (MQ=255)
aGTTCACGCGCAAAATCGGCGTTAACGGAGGCAATCACCCGCATAGCGGTGACAGACGGTCGAATCAAATCTAAAGCTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTAATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGTTTCGCCAAATcc > 1:1233949/1‑150 (MQ=255)
gTTCACGCGCAAAATCGGCGTTAACGGAGGCAATCACCCGCATAGCGGTGACAGACGGTCGAATCAAATCTAAAGCTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTAATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGTTTCGCCAAATCca > 2:22788/1‑150 (MQ=255)
aaaaTCGGCGTTAACGGAGGCAATCACCCGCATAGCGGTGACAGACGGTCGAATCAAATCTAAAGCTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTCATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGc > 2:1412608/1‑150 (MQ=255)
aaaaTCGGCGTTAACGGAGGCAATCACCCGCATAGCGGTGACAGACGGTCGAATCAAATCTAAAGCTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTCATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGc < 2:101502/150‑1 (MQ=255)
aaaTCGGCGTTAACGGAGGCAATCACCCGCATAGCGGTGACAGACGGTCGAATCAAATCTAAAGCTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTCATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCt < 1:555919/150‑1 (MQ=255)
aaaTCGGCGTTAACGGAGGCAATCACCCGCATAGCGGTGACAGACGGTCGAATCAAATCTAAAGCTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTCATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCt < 2:3730803/150‑1 (MQ=255)
aaTCGGCGTTAACGGAGGCAATCACCCGCATAGCGGTGACAGACGGTCGAATCAAATCTAAAGCTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTAATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTg < 2:2364952/150‑1 (MQ=255)
aTCGGCGTTAACGGAGGCAATCACCCGCATAGCGGTGACAGACGGTCGAATCAAATCTAAAGCTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTCATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGc > 1:3100837/1‑150 (MQ=255)
aTCGGCGTTAACGGAGGCAATCACCCGCATAGCGGTGACAGACGGTCGAATCAAATCTAAAGCTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTAATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGc < 1:263607/150‑1 (MQ=255)
tCGGCGTTAACGGAGGCAATCACCCGCATAGCGGTGACAGACGGTCGAATCAAATCTAAAGCTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTCATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCg < 1:4054168/150‑1 (MQ=255)
gTTAACGGAGGCAATCACCCGCATAGCGGTGACAGACGGTCGAATCAAATCTAAAGCTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTAATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTc > 2:4602933/1‑150 (MQ=255)
tAACGGAGGCAATCACCCGCATAGCGGTGACAGACGGTCGAATCAAATCTAAAGCTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTAATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCaa > 2:3944137/1‑150 (MQ=255)
aCGGAGGCAATCACCCGCATAGCGGTGACAGACGGTCGAATCAAATCTAAAGCTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTCATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAAcc < 2:2449517/150‑1 (MQ=255)
ggAGGCAATCACCCGCATAGCGGTGACAGACGGTCGAATCAAATCTAAAGCTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTCATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACcgg > 2:3242320/1‑150 (MQ=255)
ggCAATCACCCGCATAGCGGTGACAGACGGTCGAATCAAATCTAAAGCTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTCATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACcggcgg > 1:538160/1‑150 (MQ=255)
gCAATCACCCGCATAGCGGTGACAGACGGTCGAATCAAATCTAAAGCTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTCATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCggcggc < 1:1082105/150‑1 (MQ=255)
cAATCACCCGCATAGCGGTGACAGACGGTCGAATCAAATCTAAAGCTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTAATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGgcggcg < 2:4110396/150‑1 (MQ=255)
aaTCACCCGCATAGCGGTGACAGACGGTCGAATCAAATCTAAAGCTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTCATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGt > 2:3433033/1‑150 (MQ=255)
tCACCCGCATAGCGGTGACAGACGGTCGAATCAAATCTAAAGCTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTCATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTgc < 1:2004903/150‑1 (MQ=255)
tCACCCGCATAGCGGTGACAGACGGTCGAATCAAATCTAAAGCTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTCATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTgc > 1:2366532/1‑150 (MQ=255)
gCATAGCGGTGACAGACGGTCGAATCAAATCTAAAGCTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTCATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCt < 1:2786755/150‑1 (MQ=255)
gCATAGCGGTGACAGACGGTCGAATCAAATCTAAAGCTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTCATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCt < 1:2786979/150‑1 (MQ=255)
gCATAGCGGTGACAGACGGTCGAATCAAATCTAAAGCTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTCATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCt < 2:2458726/150‑1 (MQ=255)
gCATAGCGGTGACAGACGGTCGAATCAAATCTAAAGCTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTAATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCt < 2:3151009/150‑1 (MQ=255)
gCATAGCGGTGACAGACGGTCGAATCAAATCTAAAGCTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTAATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCt < 2:2801352/150‑1 (MQ=255)
cATAGCGGTGACAGACGGTCGAATCAAATCTAAAGCTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTCATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTg < 2:1765072/150‑1 (MQ=255)
aGCGGTGACAGACGGTCGAATCAAATCTAAAGCTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTCATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGTg < 1:4644299/150‑1 (MQ=255)
ggTGACAGACGGTCGAATCAAATCTAAAGCTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTCATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGTGAAt > 2:1651251/1‑150 (MQ=255)
gTGACAGACGGTCGAATCAAATCTAAAGCTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTCATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGTGAATg > 1:682714/1‑150 (MQ=255)
gTGACAGACGGTCGAATCAAATCTAAAGCTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTCATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGTGAATg > 1:683419/1‑150 (MQ=255)
aGACGGTCGAATCAAATCTAAAGCTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTCATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGTGAATGTTaga > 2:4532501/1‑150 (MQ=255)
gACGGTCGAATCAAATCTAAAGCTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTCATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGTGAATGTTagag > 2:3910751/1‑150 (MQ=255)
aCGGTCGAATCAAATCTAAAGCTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTCATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGTGAATGTTAgaga > 2:240824/1‑150 (MQ=255)
cGGTCGAATCAAATCTAAAGCTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTCATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGTGAATGTTAGAGAt < 2:1339397/150‑1 (MQ=255)
cGGTCGAATCAAATCTAAAGCTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTCATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGTGAATGTTAGAGAt > 2:3194687/1‑150 (MQ=255)
ggTCGAATCAAATCTAAAGCTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTAATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGTGAATGTTAGAGATa < 2:1989841/150‑1 (MQ=255)
ggTCGAATCAAATCTAAAGCTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTAATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGTGAATGTTAGAGATa < 2:2894867/150‑1 (MQ=255)
tCGAATCAAATCTAAAGCTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTCATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGTGAATGTTAGAGATACa < 2:2116189/150‑1 (MQ=255)
gAATCAAATCTAAAGCTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTCATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGTGAATGTTAGAGATACAgg > 1:2469549/1‑150 (MQ=255)
gAATCAAATCTAAAGCTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTCATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGTGAATGTTAGAGATACAgg > 2:2610073/1‑150 (MQ=255)
gAATCAAATCTAAAGCTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTCATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGTGAATGTTAGAGATACAgg > 1:3276260/1‑150 (MQ=255)
gAATCAAATCTAAAGCTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTCATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGTGAATGTTAGAGATACAgg < 2:4567049/150‑1 (MQ=255)
aTCAAATCTAAAGCTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTCATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGTGAATGTTAGAGATACAGGTg < 1:4317500/150‑1 (MQ=255)
aTCAAATCTAAAGCTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTCATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGTGAATGTTAGAGATACAGGTg > 1:1577525/1‑150 (MQ=255)
aTCAAATCTAAAGCTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTCATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGTGAATGTTAGAGATACAGGTg < 1:375973/150‑1 (MQ=255)
aTCAAATCTAAAGCTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTCATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGTGAATGTTAGAGATACAGGTg < 2:3561144/150‑1 (MQ=255)
aaaTCTAAAGCTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTCATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGTGAATGTTAGAGATACAGGTGCGa > 2:3010211/1‑150 (MQ=255)
aaaTCTAAAGCTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTCATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGTGAATGTTAGAGATACAGGTGCGa < 1:4074005/150‑1 (MQ=255)
aaaTCTAAAGCTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTCATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGTGAATGTTAGAGATACAGGTGCGa > 2:689397/1‑150 (MQ=255)
aTCTAAAGCTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTCATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGTGAATGTTAGAGATACAGGTGCGATc < 1:4000823/150‑1 (MQ=255)
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aGCTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTCATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGTGAATGTTAGAGATACAGGTGCGATCGGCCTc > 1:4596935/1‑150 (MQ=255)
cTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTCATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGTGAATGTTAGAGATACAGGTGCGATCGGCCTCaa > 1:4273625/1‑150 (MQ=255)
ggCATGATGCCTCCTTATCGGGTCATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGTGAATGTTAGAGATACAGGTGCGATCGGCCTCAACg < 1:4397960/150‑1 (MQ=255)
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cATGATGCCTCCTTATCGGGTCATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGTGAATGTTAGAGATACAGGTGCGATCGGCCTCAACggt > 2:524839/1‑150 (MQ=255)
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cGGGTCATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGTGAATGTTAGAGATACAGGTGCGATCGGCCTCAACGGTGGTCGCCATACgcggc < 2:2744065/150‑1 (MQ=255)
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cATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGTGAATGTTAGAGATACAGGTGCGATCGGCCTCAACGGTGGTCGCCATACGCGGCGAGTa > 1:1478440/1‑150 (MQ=255)
cATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGTGAATGTTAGAGATACAGGTGCGATCGGCCTCAACGGTGGTCGCCATACGCGGCGAGTa > 1:411446/1‑150 (MQ=255)
|
GAGTCGGCAGAAATCAGACCGAGGCTACGAATATGCGGCGGCAATTTCAGTTCACGCGCAAAATCGGCGTTAACGGAGGCAATCACCCGCATAGCGGTGACAGACGGTCGAATCAAATCTAAAGCTGGCATGATGCCTCCTTATCGGGTCATGTTGATGCCGGATGCTTTCTGCTCCAGCATACGTTTCGCCAAATCCACAATGACGGCTGCGGCTTCAACCGGCGGCGTGCCGCCCTGGTGAATGTTAGAGATACAGGTGCGATCGGCCTCAACGGTGGTCGCCATACGCGGCGAGTA > CP009273/2549629‑2549927
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
