Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F534 I1 R1
|
1235 |
230.2 |
7611948 |
95.1% |
7238962 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
411,556 |
C→A |
D285Y (GAT→TAT) |
sbcD ← |
exonuclease, dsDNA, ATP‑dependent |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 411,556 | 0 | C | A | 100.0%
| 687.7
/ NA
| 206 | D285Y (GAT→TAT) | sbcD | exonuclease, dsDNA, ATP‑dependent |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base A (101/105); total (101/105) |
Only 100 of 206 total aligned reads displayed.
GACAGGCAATGATTCGGTTAATGCCTGGATTTTGCGCTGAATATCATGCAGATACTCATCAGTAGTGATTTCGATATCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCGACGCCAGATCGCCTTTCAGCACTGCCATGGGTTGCGTTACCGGTACGTTCAGGTTTTCCACGCTCTCTAATTTGCCGTTTGAAAATGTCACCAGATGGACATATTTACTCTTACCGCATTCATCAAAACTCAGTGGAATGGGGGAGCCGCAATAG > CP009273/411410‑411701
|
gACAGGCAATGATTCGGTTAATGCCTGGATTTTGCGCTGAATATCATGCAGATACTCATCAGTAGTGATTTCGATATCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCGACGCCAGATAGcc > 2:1575003/1‑150 (MQ=255)
ggCAATGATTCGGTTAATGCCTGGATTTTGCGCTGAATATCATGCAGATACTCATCAGTAGTGATTTCGATATCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCGACGCCAGATAGCCTTTc > 1:3752507/1‑150 (MQ=255)
gCAATGATTCGGTTAATGCCTGGATTTTGCGCTGAATATCATGCAGATACTCATCAGTAGTGATTTCGATATCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCGACGCCAGATAGCCTTTCa < 2:3536473/150‑1 (MQ=255)
cAATGATTCGGTTAAGGCCTGGATTTTGCGCTGAATATCATGCAGATACTCATCAGTAGTGATTTCGATATCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCGACGCCAGATAGCCTTTCAg < 2:2025220/150‑1 (MQ=255)
gATTCGGTTAATGCCTGGATTTTGCGCTGAATATCATGCAGATACTCATCAGTAGTGATTTCGATATCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCGACGCCAGATAGCCTTTCAGCACt < 2:1251213/150‑1 (MQ=255)
aTTCGGTTAATGCCTGGATTTTGCGCTGAATATCATGCAGATACTCATCAGTAGTGATTTCGATATCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCGACGCCAGATAGCCTTTCAGCACTg > 2:186961/1‑150 (MQ=255)
ggTTAATGCCTGGATTTTGCGCTGAATATCATGCAGATACTCATCAGTAGTGATTTCGATATCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCGACGCCAGATAGCCTTTCAGCACTGCCAt > 2:1481573/1‑150 (MQ=255)
ggTTAATGCCTGGATTTTGCGCTGAATATCATGCAGATACTCATCAGTAGTGATTTCGATATCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCGACGCCAGATAGCCTTTCAGCACTGCCAt > 1:2668797/1‑150 (MQ=255)
ggTTAATGCCTGGATTTTGCGCTGAATATCATGCAGATACTCATCAGTAGTGATTTCGATATCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCGACGCCAGATAGCCTTTCAGCACTGCCAt > 1:763930/1‑150 (MQ=255)
gTTAATGCCTGGATTTTGCGCTGAATATAATGCAGATACTCATCAGTAGTGATTTCGATATCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCGACGCCAGATAGCCTTTCAGCACTGCCATg > 2:388997/1‑150 (MQ=255)
gTTAATGCCTGGATTTTACGCTGAATATCATGCAGATACTCATCAGTAGTGATTTCGATATCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCGACGCCAGATAGCCTTTCAGCACTGCCATg > 2:1162261/1‑150 (MQ=255)
tAATGCCTGGATTTTGCGCTGAATATCATGCAGATACTCATCAGTAGTGATTTCGATATCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCGACGCCAGATAGCCTTTCAGCACTGCCATggg > 2:1676232/1‑150 (MQ=255)
aTGCCTGGATTTTGCGCTGAATATCATGCAGATACTCATCAGTAGTGATTTCGATATCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCGACGCCAGATAGCCTTTCAGCACTGCCATGGGtt > 2:487252/1‑150 (MQ=255)
aTGCCTGGATTTTGCGCTGAATATCATGCAGATACTCATCAGTAGTGATTTCGATATCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCGACGCCAGATAGCCTTTCAGCACTGCCATGGGtt > 2:3198403/1‑150 (MQ=255)
gCCTGGATTTTGCGCTGAATATCATGCAGATACTCATCAGTAGTGATTTCGATATCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCGACGCCAGATAGCCTTTCAGCACTGCCATGGGTTGc > 2:2572412/1‑150 (MQ=255)
ccTGGATTTTGCGCTGAATATCATGCAGATACTCATCAGTAGTGATTTCGATATCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCGACGCCAGATAGCCTTTCAGCACTGCCCTGGGTTGCg > 2:3014207/1‑150 (MQ=255)
ccTGGATTTTGCGCTGAATATCATGCAGATACTCATCAGTAGCGATTTCGATATCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCGACGCCAGATAGCCTTTCAGCACTGCCATGGGTTGCg > 2:2327613/1‑150 (MQ=255)
gATTTTGCGCTGAATATCATGCAGATACTCATCAGTAGTGATTTCGATATCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCGACGCCAGATAGCCTTTCAGCACTGCCATGGGTTGCGTTAc > 2:2639499/1‑150 (MQ=255)
tttGCGCTGAATATCATGCAGATACTCATCAGTAGTGATTTCGATATCCAGCCAGACATTTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCGACGCCAGATAGCCTTTCAGCACTGCCATGGGTTGCGTTAcctg > 1:1133479/1‑148 (MQ=255)
gcgcTGAATATCATGCAGATACTCATCAGTAGTGATTTCGATATCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCGACGCCAGATAGCCTTTCAGCACTGCCATGGGTTGCGTTACCGGTAc < 1:3274757/150‑1 (MQ=255)
cTGAATATCATGCAGATACTCATCAGTAGTGATTTCGATATCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCGACGCCAGATAGCCTTTCAGCACTGCCATGGGTTGCGTTACCGGTACGtt < 2:3572663/150‑1 (MQ=255)
gAATATCATGCAGATACTCATCAGTAGTGATTTCGATATCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCGACGCCAGATAGCCTTTCAGCACTGCCATGGGTTGCGTTACCGGTACGTTCa > 2:2384294/1‑150 (MQ=255)
aaTATCATGCAGATACTCATCAGTAGTGATTTCGATATCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCGACGCCAGATAGCCTTTCAGCACTGCCATGGGTTGCGTTACCGGTACGTTCAg < 1:1088647/150‑1 (MQ=255)
atatCATGCAGATACTCATCAGTAGTGATTTCGATATCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCGACGCCAGATAGCCTTTCAGCACTGCCATGGGTTGCGTTACCGGTACGTTCAgg > 2:2450850/1‑150 (MQ=255)
atCATGCAGATACTCATCAGTAGTGATTTCGATATCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCGACGCCAGATAGCCTTTCAGCACTGCCATGGGTTGCGTTACCGGTACGTTCAGGtt > 2:1532231/1‑150 (MQ=255)
tGCAGATACTCATCAGTAGTGATTTCGATATCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCGACGCCAGATAGCCTTTCAGCACTGCCATGGGTTGCGTTACCGGTACGTTCAGGTTTTcc < 1:1316384/150‑1 (MQ=255)
tGCAGATACTCATCAGTAGTGATTTCGATATCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCGACGCCAGATAGCCTTTCAGCACTGCCATGGGTTGCGTTACCGGTACGTTCAGGTTTTcc < 1:3440331/150‑1 (MQ=255)
gCAGATACTCATCAGTAGTGATTTCGATATCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCGACGCCAGATAGCCTTTCAGCACTGCCATGGGTTGCGTTACCGGTACGTTCAGGTTTTCCa < 1:87865/150‑1 (MQ=255)
aGATACTCATCAGTAGTGATTTCGATATCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCGACGCCAGATAGCCTTTCAGCACTGCCATGGGTTGCGTTACCGGTACGTTCAGGTTTTCCACg > 1:3398828/1‑150 (MQ=255)
aGATACTCATCAGTAGTGATTTCGATATCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCGACGCCAGATAGCCTTTCAGCACTGCCATGGGTTGCGTTACCGGTACGTTCAGGTTTTCCACg < 1:123810/150‑1 (MQ=255)
aGATACTCATCAGTAGTGATTTCGATATCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCGACGCCAGATAGCCTTTCAGCACTGCCATGGGTTGCGTTACCGGTACGTTCAGGTTTTCCACg > 2:3424434/1‑150 (MQ=255)
gATACTCATCAGTAGTGATTTCGATATCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCGACGCCAGATAGCCTTTCAGCACTGCCATGGGTTGCGTTACCGGTACGTTCAGGTTTTCCACGc > 1:533883/1‑150 (MQ=255)
aCTCATCAGTAGTGATTTCGATATCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCGACGCCAGATAGCCTTTCAGCACTGCCATGGGTTGCGTTACCGGTACGTTCAGGTTTTCCACGctct < 1:1890257/150‑1 (MQ=255)
aCTCATCAGTAGTGATTTCGATATCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCGACGCCAGATAGCCTTTCAGCACTGCCATGGGTTGCGTTACCGGTACGTTCAGGTTTTCCACGctct > 2:1076297/1‑150 (MQ=255)
catcaGTAGTGATTTCGATATCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCGACGCCAGATAGCCTTTCAGCACTGCCATGGGTTGCGTTACCGGTACGTTCAGGTTTTCCACGCTCTCTa < 1:2071716/150‑1 (MQ=255)
attagtagtGATTTCGATATCAAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGAAACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCGACGCCAGATAGCCTTTCAGCACTGCCATGGTTTGCGTTACCGTTACTTTCAGGTTTTCCACGCTCTCTaa < 1:2997262/147‑1 (MQ=255)
tcaGTAGTGATTTCGATATCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCGACGCCAGATAGCCTTTCAGCACTGCCATGGGTTGCGTTACCGGTACGTTCAGGTTTTCCACGCTCTCTAAt < 2:2120768/150‑1 (MQ=255)
tcaGTAGTGATTTCGATATCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCGACGCCAGATAGCCTTTCAGCACTGCCATGGGTTGCGTTACCGGTACGTTCAGGTTTTCCACGCTCTCTAAt > 2:2782066/1‑150 (MQ=255)
caGTAGTGATTTCGATATCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCGACGCCAGATAGCCTTTCAGCACTGCCATGGGTTGCGTTACCGGTACGTTCAGGTTTTCCACGCTCTCTAAtt > 1:1163013/1‑150 (MQ=255)
caGTAGTGATTTCGATATCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCGACGCCAGATAGCCTTTCAGCACTGCCATGGGTTGCGTTACCGGTACGTTCAGGTTTTCCACGCTCTCTAAtt < 2:1709559/150‑1 (MQ=255)
agtagtGATTTCGATATCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCGACGCCAGATAGCCTTTCAGCACTGCCATGGGTTGCGTTACCGGTACGTTCAGGTTTTCCACGCTCTCTAAttt < 2:82370/150‑1 (MQ=255)
gtagtGATTTCGATATCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCGACGCCAGATAGCCTTTCAGCACTGCCATGGGTTGCGTTACCGGTACGTTCAGGTTTTCCACGCTCTCTAATTTg < 2:763930/150‑1 (MQ=255)
gtagtGATTTCGATATCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCGACGCCAGATAGCCTTTCAGCACTGCCATGGGTTGCGTTACCGGTACGTTCAGGTTTTCCACGCTCTCTAATTTg < 2:2668797/150‑1 (MQ=255)
tagtGATTTCGATATCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCGACGCCAGATAGCCTTTCAGCACTGCCATGGGTTGCGTTACCGGTACGTTCAGGTTTTCCACGCTCTCTAATTTGc < 1:2824317/150‑1 (MQ=255)
agtGATTTCGATATCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCGACGCCAGATAGCCTTTCAGCACTGCCATGGGTTGCGTTACCGGTACGTTCAGGTTTTCCACGCTCTCTAATTTGcc < 2:832712/150‑1 (MQ=255)
agtGATTTCGATATCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCGACGCCAGATAGCCTTTCAGCACTGCCATGGGTTGCGTTACCGGTACGTTCAGGTTTTCCACGCTCTCTAATTTGcc < 2:2739212/150‑1 (MQ=255)
gtGATTTCGATATCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCGACGCCAGATAGCCTTTCAGCACTGCCATGGGTTGCGTTACCGGTACGTTCAGGTTTTCCACGCTCTCTAATTTGCCg < 1:2326457/150‑1 (MQ=255)
gtGATTTCGATATCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCGACGCCAGATAGCCTTTCAGCACTGCCATGGGTTGCGTTACCGGTACGTTCAGGTTTTCCACGCTCTCTAATTTGCCg < 2:3424815/150‑1 (MQ=255)
gtGATTTCGATATCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCGACGCCAGATAGCCTTTCAGCACTGCCATGGGTTGCGTTACCGGTACGTTCAGGTTTTCCACGCTCTCTAATTTGCCg < 1:3237020/150‑1 (MQ=255)
gATTTCGATATCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCGACGCCAGATAGCCTTTCAGCACTGCCATGGGTTGCGTTACCGGTACGTTCAGGTTTTCCACGCTCTCTAATTTGCCGtt < 1:275006/150‑1 (MQ=255)
gATTTCGATATCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCGACGCCAGATAGCCTTTCAGCACTGCCATGGGTTGCGTTACCGGTACGTTCAGGTTTTCCACGCTCTCTAATTTGCCGtt < 1:595216/150‑1 (MQ=255)
tCGATATCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCGACGCCAGATAGCCTTTCAGCACTGCCATGGGTTGCGTTACCGGTACGTTCAGGTTTTCCACGCTCTCTAATTTGCCGTTTGaa < 1:1676232/150‑1 (MQ=255)
atatCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCGACGCCAGATAGCCTTTCAGCACTGCCATGGGTTGCGTTACCGGTACGTTCAGGTTTTCCACGCTCTCTAATTTGCCGTTTGAAAAt > 2:943111/1‑150 (MQ=255)
atatCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCGACGCCAGATAGCCTTTCAGCACTGCCATGGGTTGCGTTACCGGTACGTTCAGGTTTTCCACGCTCTCTAATTTGCCGTTTGAAAAt > 1:2630314/1‑150 (MQ=255)
atatCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCGACGCCAGATAGCCTTTCAGCACTGCCATGGGTTGCGTTACCGGTACGTTCAGGTTTTCCACGCTCTCTAATTTGCCGTTTGAAAAt < 1:3170137/150‑1 (MQ=255)
atCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCGACGCCAGATAGCCTTTCAGCACTGCCATGGGTTGCGTTACCGGTACGTTCAGGTTTTCCACGCTCTCTAATTTGCCGTTTGAAAATGt < 2:489423/150‑1 (MQ=255)
ccagccagACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCGACGCCAGATAGCCTTTCAGCACTGCCATTGGTTGCGTTACCGGTACGTTCAGGTTTTCCACGCTCTCTAATTTGCCGTTTGAAAATGTCa > 1:455694/1‑150 (MQ=255)
cagccagACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCGACGCCAGATAGCCTTTCAGCACTGCCATGGGTTGCGTTACCGGTACGTTCAGGTTTTCCACGCTCTCTAATTTGCCGTTTGAAAATGTCAc > 2:1375109/1‑150 (MQ=255)
cagccagACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCGACGCCAGATAGCCTTTCAGCACTGCCATGGGTTGCGTTACCGGTACGTTCAGGTTTTCCACGCTCTCTAATTTGCCGTTTGAAAATGTCAc < 1:1375109/150‑1 (MQ=255)
cagACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCGACGCCAGATAGCCTTTCAGCACTGCCATGGGTTGCGTTACCGGTACGTTCAGGTTTTCCACGCTCTCTAATTTGCCGTTTGAAAATGTCACCAGa > 2:1406843/1‑150 (MQ=255)
gACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCGACGCCAGATAGCCTTTCAGCACTGCCATGGGTTGCGTTACCGGTACGTTCAGGTTTTCCACGCTCTCTAATTTGCCGTTTGAAAATGTCACCAGATg > 1:1941315/1‑150 (MQ=255)
aGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCGACGCCAGATAGCCTTTCAGCACTGCCATGGGTTGCGTTACCGGTACGTTCAGGTTTTCCACGCTCTCTAATTTGCCGTTTGAAAATGTCACCAGATGGAc < 1:1382727/150‑1 (MQ=255)
aGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCGACGCCAGATAGCCTTTCAGCACTGCCATGGGTTGCGTTACCGGTACGTTCAGGTTTTCCACGCTCTCTAATTTGCCGTTTGAAAATGTCACCAGATGGAc > 2:123141/1‑150 (MQ=255)
aGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCGACGCCAGATAGCCTTTCAGCACTGCCATGGGTTGCGTTACCGGTACGATCAGGTTTTCCACGCTCTCTAATTTGCCGTTTGAAAATGTCACCAGATGGAc > 2:2561235/1‑150 (MQ=255)
gTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCGACGCCAGATAGCCTTTCAGCACTGCCATGGGTTGCGTTACCGGTACGTTCAGGTTTTCCACGCTCTCTAATTTGCCGTTTGAAAATGTCACCAGATGGACat < 1:243242/150‑1 (MQ=255)
tGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCGACGCCAGATAGCCTTTCAGCACTGCCATGGGTTGCGTTACCGGTACGTTCAGGTTTTCCACGCTCTCTAATTTGCCGTTTGAAAATGTCACCAGATGGACata < 2:3058907/150‑1 (MQ=255)
tCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCGACGCCAGATAGCCTTTCAGCACTGCCATGGGTTGCGTTACCGGTACGTTCAGGTTTTCCACGCTCTCTAATTTGCCGTTTGAAAATGTCACCAGATGGACATATTTa < 2:3438219/150‑1 (MQ=255)
tCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCGACGCCAGATAGCCTTTCAGCACTGCCATGGGTTGCGTTACCGGTACGTTCAGGTTTTCCACGCTCTCTAATTTGCCGTTTGAAAATGTCACCAGATGGACATATTTa < 2:3157803/150‑1 (MQ=255)
cTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCGACGCCAGATAGCCTTTCAGCACTGCCATGGGTTGCGTTACCGGTACGTTCAGGTTTTCCACGCTCTCTAATTTGCCGTTTGAAAATGTCACCAGATGGACATATTTAct < 2:2446711/150‑1 (MQ=255)
cGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCGACGCCAGATAGCCTTTCAGCACTGCCATGGGTTGCGTTACCGGTACGTTCAGGTTTTCCACGCTCTCTAATTTGCCGTTTGAAAATGTCACCAGATGGACATATTTACTCtt > 2:2056686/1‑150 (MQ=255)
cGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCGACGCCAGATAGCCTTTCAGCACTGCCATGGGTTGCGTTACCGGTACGTTCAGGTTTTCCACGCTCTCTAATTTGCCGTTTGAAAATGTCACCAGATGGACATATTTACTCtt > 2:670398/1‑150 (MQ=255)
aTACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCGACGCCAGATAGCCTTTCAGCACTGCCATGGGTTGCGTTACCGGTACGTTCAGGTTTTCCACGCTCTCTAATTTGCCGTTTGAAAATGTCACCAGATGGACATATTTACTCTTAc > 1:3131467/1‑150 (MQ=255)
aTACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCGACGCCAGATAGCCTTTCAGCACTGCCATGGGTTGCGTTACCGGTACGTTCAGGTTTTCCACGCTCTCTAATTTGCCGTTTGAAAATGTCACCAGATGGACATATTTACTCTTAc > 2:968546/1‑150 (MQ=255)
tACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCGACGCCAGATAGCCTTTCAGCACTGCCATGGGTTGCGTTACCGGTACGTTCAGGTTTTCCACGCTCTCTAATTTGCCGTTTGAAAATGTCACCAGATGGACATATTTACTCTTAcc < 2:1335716/150‑1 (MQ=255)
cATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCGACGCCAGATAGCCTTTCAGCACTGCCATGGGTTGCGTTACCGGTACGTTCAGGTTTTCCACGCTCTCTAATTTGCCGTTTGAAAATGTCACCAGATGGACATATTTACTCTTACCGc > 2:3736775/1‑150 (MQ=255)
tCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCGACGCCAGATAGCCTTTCAGCACTGCCATGGGTTGCGTTACCGGTACGTTCAGGTTTTCCACGCTCTCTAATTTGCCGTTTGAAAATGTCACCAGATGGACATATTTACTCTTACCGCAt < 1:537786/150‑1 (MQ=255)
cgcgACACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCGACGCCAGATAGCCTTTAAGCACTGCCATGGGTTGCGTTACCGGTACGTTCAGGTTTTCCACGCTCTCTAATTTGCCGTTTGAAAATGTCACCAGATGGACATATTTACTCTTACCGCAtt > 2:3748251/1‑150 (MQ=255)
gcgcCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCGACGCCAGATAGCCTTTCAGCACTGCCATGGGTTGCGTTACCGGTACGTTCAGGTTTTCCACGCTCTCTAATTTGCCGTTTGAAAATGTCACCAGATGGACATATTTACTCTTACCGCATtc < 1:1605276/150‑1 (MQ=255)
cTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCGACGCCAGATAGCCTTTCAGCACTGCCATGGGTTGCGTTACCGGTACGTTCAGGTTTTCCACGCTCTCTAATTTGCCGTTTGAAAATGTCACCAGATGGACATATTTACTCTTACCGCATTCATCaaa < 1:1043267/150‑1 (MQ=255)
tCCAGCTGTGCGGTAATCGACGCCAGATAGCCTTTCAGCACTGCCATGGGTTGCGTTACCGGTACGTTCAGGTTTTCCACGCTCTCTAATTTGCCGTTTGAAAATGTCACCAGATGGACATATTTACTCTTACCGCATTCATCAAAACTc < 2:1115553/150‑1 (MQ=255)
tCCAGCTGTGCGGTAATCGACGCCAGATAGCCTTTCAGCACTGCCATGGGTTGCGTTACCGGTACGTTCAGGTTTTCCACGCTCTCTAATTTGCCGTTTGAAAATGTCACCAGATGGACATATTTACTCTTACCGCATTCATCAAAACTc < 2:1115795/150‑1 (MQ=255)
ccAGCTGTGCGGTAATCGACGCCAGATAGCCTTTCAGCACTGCCATGGGTTGCGTTACCGGTACGTTCAGGTTTTCCACGCTCTCTAATTTGCCGTTTGAAAATGTCACCAGATGGACATATTTACTCTTACCGCATTCATCAAAACTCa < 1:3073098/150‑1 (MQ=255)
cAGCTGTGCGGTAATCGACGCCAGATAGCCTTTCAGCACTGCCATGGGTTGCGTTACCGGTACGTTCAGGTTTTCCACGCTCTCTAATTTGCCGTTTGAAAATGTCACCAGATGGACATATTTACTCTTACCGCATTCATCAAAACTCAg < 1:1469811/150‑1 (MQ=255)
aGCTGTGCGGTAATCGACGCCAGATAGCCTTTCAGCACTGCCATGGGTTGCGTTACCGGTACGTTCAGGTTTTCCACGCTCTCTAATTTGCCGTTTGAAAATGTCACCAGATGGACATATTTACTCTTACCGCATTCATCAAAACTCAGt > 1:2563376/1‑150 (MQ=255)
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cTGTGCGGTAATCGACGCCAGATAGCCTTTCAGCACTGCCATGGGTTGCGTTACCGGTACGTTCAGGTTTTCCACGCTCTCTAATTTGCCGTTTGAAAATGTCACCAGATGGACATATTTACTCTTACCGCATTCATCAAAACTCAGTgg > 2:1879509/1‑150 (MQ=255)
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CTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCGACGCCAGATAGCCTTTCAGCACTGCCATGGGTTGCGTTACCGGTACGTTCAGGTTTTCCACGCTCTCTAATTTGCCGTTTGAAAATGTCACCAGATGGACATATTTACTCTTACCGCATTCATCAAA < SRR19973061.1045935/150‑1 (MQ=60)
GTTCCAGCTGTGCGGTAATCGACGCCAGATAGCCTTTCAGCACTGCCATGGGTTGCGTTACCGGTACGTTCAGGTTTTCCACGCTCTCTAATTTGCCGTTTGAAAATGTCACCAGATGGACATATTTACTCTTACCGCATTCATCAAACC < SRR19973061.1777517/150‑1 (MQ=60)
TTCCAGCTGTGCGGTAATCGACGCCAGATAGCCTTTCAGCACTGCCATGGGTTGCGTTACCGGTACGTTCAGGTTTTCCACGCTCTCTAATTTGCCGTTTGAAAATGTCACCAGATGGACATATTTACTCTTACCGCATTCATCAAAACT < SRR19973061.1082141/150‑1 (MQ=60)
CCAGCTGTGCGGTAATCGACGCCAGATAGCCTTTCAGCACTGCCATGGGTTGCGTTACCGGTACGTTCAGGTTTTCCACGCTCTCTAATTTGCCGTTTGAAAATGTCACCAGATGGACATATTTACTCTTACCGCATTCATCAAAACTCA < SRR19973061.3081030/150‑1 (MQ=60)
CAGCTGTGCGGTAATCGACGCCAGATAGCCTTTCAGCACTGCCATGGGTTGCGTTACCGGTACGTTCAGGTTTTCCACGCTCTCTAATTTGCCGTTTGAAAATGTCACCAGATGGACATATTTACTCTTACCGCATTCATCAAAACTCAG < SRR19973061.1473504/150‑1 (MQ=60)
AGCTGTGCGGTAATCGACGCCAGATAGCCTTTCAGCACTGCCATGGGTTGCGTTACCGGTACGTTCAGGTTTTCCACGCTCTCTAATTTGCCGTTTGAAAATGTCACCAGATGGACATATTTACTCTTACCGCATTCATCAAAACTCAGT < SRR19973061.3422220/150‑1 (MQ=60)
AGCTGTGCGGTAATCGACGCCAGATAGCCTTTCAGCACTGCCATGGGTTGCGTTACCGGTACGTTCAGGTTTTCCACGCTCTCTAATTTGCCGTTTGAAAATGTCACCAGATGGACATATTTACTCTTACCGCATTCATCAAAACTCAGT < SRR19973061.2454116/150‑1 (MQ=60)
AGCTGTGCGGTAATCGACGCCAGATAGCCTTTCAGCACTGCCATGGGTTGCGTTACCGGTACGTTCAGGTTTTCCACGCTCTCTAATTTGCCGTTTGAAAATGTCACCAGATGGACATATTTACTCTTACCGCATTCATCAAAACTCAGT > SRR19973061.45168/1‑150 (MQ=60)
AGCTGTGCGGTAATCGACGCCAGATAGCCTTTCAGCACTGCCATGGGTTGCGTTACCGGTACGTTCAGGTTTTCCACGCTCTCTAATTTGCCGTTTGAAAATGTCACCAGATGGACATATTTACTCTTACCGCATTCATCAAAACTCAGT > SRR19973061.2569922/1‑150 (MQ=60)
CTGTGCGGTAATCGACGCCAGATAGCCTTTCAGCACTGCCATGGGTTGCGTTACCGGTACGTTCAAGTTTTCCACGCTCTCTAATTTGCCGTTTGAAAATGTCACCAGATGGACATATTTACTCTTACCGCATTCATCAAAACTCAGTGA < SRR19973061.3323640/150‑1 (MQ=60)
GTAATCGACGCCAGATAGCCTTTCAGCACTGCCATGGGTTGCGTTACCGGTACGTTCAGGTTTTCCACGCTCTCTAATTTGCCGTTTGAAAATGTCACCAGATGGACATATTTACTCTTACCGCATTCATCAAAACTCAGTGGAATGGGG < SRR19973061.3126431/150‑1 (MQ=60)
AATCGACGCCAGATAGCCTTTCAGCACTGCCATGGGTTGCGTTACCGGTACGTTCAGGTTTTCCACGCTCTCTAATTTGCCGTTTGAAAATGTCACCAGATGGACATATTTACTCTTACCGCATTCATCAAAACTCAGTGGAATGGGGGA > SRR19973061.3748785/1‑150 (MQ=60)
AATCGACGCCAGATAGCCTTTCAGCACTGCCATGGGTTGCGTTACCGGTACGTTCAGGTTTTCCACGCTCTCTAATTTGCCGTTTGAAAATGTCACCAGATGGACATATTTACTCTTACCGCATTCATCAAAACTCAGTGGAATGGGGGA > SRR19973061.3748810/1‑150 (MQ=60)
ATCGACGCCAGATAGCCTTTCAGCACTGCCATGGGTTGCGTTACCGGTACGTTCAGGTTTTCCACGCTCTCTAATTTGCCGTTTGAAAATGTCACCAGATGGACATATTTACTCTTACCGCATTCATCAAAACTCAGTGGAATGGGGGAG > SRR19973061.1284388/1‑150 (MQ=60)
TCGACGCCAGATAGCCTTTCAGCACTGCCATGGGTTGCGTTACCGGTACGTTCAGGTTTTCCACGCTCTCTAATTTGCCGTTTGAAAATGTCACCAGATGGACATATTTACTCTTACCGCATTCATCAAAACTCAGTGGAATGGGGGAGC < SRR19973061.463118/150‑1 (MQ=60)
CGACGCCAGATAGCCTTTCAGCACTGCCATGGGTTGCGTTACCGGTACGTTCAGGTTTTCCACGCTCTCTAATTTGCCGTTTGAAAATGTCACCAGATGGACATATTTACTCTTACCGCATTCATCAAAACTCAGTGGAATGGGGGAGCC < SRR19973061.30314/150‑1 (MQ=60)
GACGCCAGATAGCCTTTCAGCACTGCCATGGGTTGCGTTACCGGTACGTTCAGGTTTTCCACGCTCTCTAATTTGCCGTTTGAAAATGTCACCAGATGGACATATTTACTCTTACCGCATTCATCAAAACTCAGTGGAATGGGGGAGCCG < SRR19973061.1118629/150‑1 (MQ=60)
ACGCCAGATAGCCTTTCAGCACTGCCATGGGTTGCGTTACCGGTACGTTCAGGTTTTCCACGCTCTCTAATTTGCCGTTTGAAAATGTCACCAGATGGACATATTTACTCTTACCGCATTCATCAAAACTCAGTGGAATGGGGGAGCCGC > SRR19973061.2855417/1‑150 (MQ=60)
CAGATAGCCTTTCAGCACTGCCTTGGGTTGCGTTAACGGTACGTTCAGGTTTTCCACGCTCTCTAATTTGCCGTTTGAAAATGTCACCAGATGGACATATTTACTCTTACCGCATTCATCAAAACTCAGTGGAATGGGGGAGCCGCTATA < SRR19973061.956819/150‑1 (MQ=60)
TAGCCTTTCAGCACTGTCATGGGTTGCGTTACCGGTACGTTCAGGTTTTCCACGCTCTCTAATTTGCCGTTTGAAAATGTCACCAGATGGACATATTTACTCTTACCGCATTCATCAAAACTCAGTGGAATGGGGGAGCCGCAATAGCGA < SRR19973061.187527/150‑1 (MQ=60)
TAGCCTTTCAGCACTGCCATGGGTTGCGTTACCGGTACGTTCAGGTTTTCCACGCTCTCTAATTTGCCGTTTGAAAATGTCACCAGATGGACATATTTACTCTTACCGCATTCATCAAAACTCAGTGGAATGGGGGAGCCGCAATAGCGA > SRR19973061.262138/1‑150 (MQ=60)
AGCCTTTCAGCACTGCCATGGGTTGCGTTACCGGTACGTTCAGGTTTTCCACGCTCTCTAATTTGCCGTTTGAAAATGTCACCAGATGGACATATTTACTCTTACCGCATTCATCAAAACTCAGTGGAATGGGGGAGCCGCAATAGCGAA < SRR19973061.500171/150‑1 (MQ=60)
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TCGACAGGCAATGATTCGGTTAATGCCTGGATTTTGCGCTGAATATCATGCAGATACTCATCAGTAGTGATTTCGATATCCAGCCAGACAGGTGGCTCCTGCGATACATCGCGCCACTGTTCCAGCTGTGCGGTAATCGACGCCAGATCGCCTTTCAGCACTGCCATGGGTTGCGTTACCGGTACGTTCAGGTTTTCCACGCTCTCTAATTTGCCGTTTGAAAATGTCACCAGATGGACATATTTACTCTTACCGCATTCATCAAAACTCAGTGGAATGGGGGAGCCGCAATAGCGAA > CP009273/411408‑411705
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |