Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F534 I1 R1
|
1235 |
230.2 |
7611948 |
95.1% |
7238962 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
2,478,201 |
G→T |
E117* (GAA→TAA) |
evgS → |
hybrid sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with EvgA |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 2,478,201 | 0 | G | T | 100.0%
| 641.8
/ NA
| 191 | E117* (GAA→TAA) | evgS | hybrid sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with EvgA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base T (98/93); total (98/93) |
Only 100 of 191 total aligned reads displayed.
TACGTTGTTGCATACCGATTCGCAGCAACGGGTTCGTGGTATTAATGCTGATTATTTAAATCTTTTAAAAAGAGCGTTAAATATCAAATTAACACTCCGGGAATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTGAAGTCGATATAGTGTTATCACATTTAGTTACTTCGCCGCCTCTTAATAATGACATTGCTGCAACCAAACCATTGATAATTACCTTTCCGGCGCTGGTAACCACCCTTCACGACTCAATGCGACCGCTTACCTCACCAAAACCAGT > CP009273/2478056‑2478346
|
tACGTTGTTGCATACCGATTCGCAGCAACGGGTTCGTGGTATTAATGCTGATTATTTAAATCTTTTAAAAAGAGCGTTAAATATCAAATTAACACTCCGGGAATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGt < 2:1890294/150‑1 (MQ=255)
aCGTTGTTGCATACCGATTCGCAGCAACGGGTTCGTGGTATTAATGCTGATTATTTAAATCTTTTAAAAAGAGCGTTAAATATCAAATTAACACTCCGGGAATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTc < 2:2675536/150‑1 (MQ=255)
gttgttGCATACCGATTCGCAGCAACGGGTTCGTGGTATTAATGCTGATTATTTAAATCTTTTAAAAAGAGCGTTAAATATCAAATTAACACTCCGGGAATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGa > 1:498570/1‑150 (MQ=255)
ttgttgCATACCGATTCGCAGCAACGGGTTCGTGGTATTAATGCTGATTATTTAAATCTTTTAAAAAGAGCGTTAAATATCAAATTAACACTCCGGGAATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGat < 1:442877/150‑1 (MQ=255)
ttgttgCATACCGATTCGCAGCAACGGGTTCGTGGTATTAATGCTGATTATTTAAATCTTTTAAAAAGAGCGTTAAATATCAAATTAACACTCCGGGAATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGat < 1:3151245/150‑1 (MQ=255)
ttgttgCATACCGATTCGCAGCAACGGGTTCGTGGTATTAATGCTGATTATTTAAATCTTTTAAAAAGAGCGTTAAATATCAAATTAACACTCCGGGAATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGat < 1:1508199/150‑1 (MQ=255)
tgttgCATACCGATTCGTAGCAACGGGTTCGTGGTATTAATGCTGATTATTTAAATCTTTTAAAAAGAGCGTTAAATATCAAATTAACACTCCGGGAATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGata < 1:1804007/150‑1 (MQ=255)
tgttgCATACCGATTCGCAGCAACGGGTTCGTGGTATTAATGCTGATTATTTAAATCTTTTAAAAAGAGCGTTAAATATCAAATTAACACTCCGGGAATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGata < 2:970778/150‑1 (MQ=255)
tgttgCATACCGATTCGCAGCAACGGGTTCGTGGTATTAATGCTGATTATTTAAATCTTTTAAAAAGAGCGTTAAATATCAAATTAACACTCCGGGAATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGata < 1:1594151/150‑1 (MQ=255)
gttgCATACCGATTCGCAGCAACGGGTTCGTGGTATTAATGCTGATTATTTAAATCTTTTAAAAAGAGCGTTAAATATCAAATTAACACTCCGGGAATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGatat < 2:2797699/150‑1 (MQ=255)
ttgCATACCGATTCGCAGCATCGGGTTCGTGGTATTAATGCTGATTATTTAAATCTTTTAAAAAGAGCGTTAAATATCAAATTAACACTCCGGGAATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGAtata < 2:488571/150‑1 (MQ=255)
tgCATACCGATTCGCAGCAACGGGTTCGTGGTATTAATGCTGATTATTTAAATCTTTTAAAAAGAGCGTTAAATATCAAATTAACACTCCGGGAATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGATATAg > 2:353030/1‑150 (MQ=255)
cATACCGATTCGCAGCAACGGGTTCGTGGTATTAATGCTGATTATTTAAATCTTTTAAAAAGAGCGTTAAATATCAAATTAACACTCCGGGAATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGATATAgtg < 1:1496115/150‑1 (MQ=255)
cATACCGATTCGCAGCAACGGGTTCGTGGTATTAATGCTGATTATTTAAATCTTTTAAAAAGAGCGTTAAATATCAAATTAACACTCCGGGAATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGATATAgtg < 1:3393402/150‑1 (MQ=255)
aCCGATTCGCAGCAACGGGTTCGTGGTATTAATGCTGATTATTTAAATCTTTTAAAAAGAGCGTTAAATATCAAATTAACACTCCGGGAATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGATATAGTGTTa > 2:910109/1‑150 (MQ=255)
cGCAGCAACGGGTTCGTGGTATTAATGCTGATTATTTAAATCTTTTAAAAAGAGCGTTAAATATCAAATTAACACTCCGGGAATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGATATAGTGTTATCACAtt > 1:3518233/1‑150 (MQ=255)
gcagcaACGGGTTCGTGGTATTAATGCTGATTATTTAAATCTTTTAAAAAGAGCGTTAAATATCAAATTAACACTCCGGGAATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGATATAGTGTTATCACAttt < 2:2239048/150‑1 (MQ=255)
gcaACGGGTTCGTGGTATTAATGCTGATTATTTAAATCTTTTAAAAAGAGCGTTAAATATCAAATTAACACTCCGGGAATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGATATAGTGTTATCACATTTAGt < 1:400716/150‑1 (MQ=255)
caACGGGTTCGTGGTATTAATGCTGATTATTTAAATCTTTTAAAAAGAGCGTTAAATATCAAATTAACACTCCGGGAATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGATATAGTGTTATCACATTTAGtt < 1:3223246/150‑1 (MQ=255)
caACGGGTTCGTGGTATTAATGCTGATTATTTAAATCTTTTAAAAAGAGCGTTAAATATCAAATTAACACTCCGGGAATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGATATAGTGTTATCACATTTAGtt > 2:1940849/1‑150 (MQ=255)
caACGGGTTCGTGGTATTAATGCTGATTATTTAAATCTTTTAAAAAGAGCGTTAAATATCAAATTAACACTCCGGGAATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGATATAGTGTTATCACATTTAGtt > 2:1940845/1‑150 (MQ=255)
caACGGGTTCGTGGTATTAATGCTGATTATTTAAATCTTTTAAAAAGAGCGTTAAATATCAAATTAACACTCCGGGAATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGATATAGTGTTATCACATTTAGtt < 2:1061057/150‑1 (MQ=255)
aaCGGGTTCGTGGTATTAATGCTGATTATTTAAATCTTTTAAAAAGAGCGTTAAATATCAAATTAACACTCCGGGAATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGATATAGTGTTATCACATTTAGTTa > 2:3305565/1‑150 (MQ=255)
cGGGTTCGTGGTATTAATGCTGATTATTTAAATCTTTTAAAAAGAGCGTTAAATATCAAATTAACACTCCGGGAATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGATATAGTGTTATCACATTTAGTTACt > 2:1670743/1‑150 (MQ=255)
cGGGTTCGTGGTATTAATGCTGATTATTTAAATCTTTTAAAAAGAGCGTTAAATATCAAATTAACACTCCGGGAATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGATATAGTGTTATCACATTTAGTTACt < 1:687802/150‑1 (MQ=255)
cGGGTTCGTGGTATTAATGCTGATTAATTAAATCTTTTAAAAAGAGCGTTAAATATCAAATTAACACTCCGGGAATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGATATAGTGTTATCACATTTAGTTACt < 1:2879106/150‑1 (MQ=255)
gTTCGTGGTATTAATGCTGATTATTTAAATCTTTTAAAAAGAGCGTTAAATATCAAATTAACACTCCGGGAATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGATATAGTGTTATCACATTTAGTTACTTcg > 1:3587820/1‑150 (MQ=255)
cGTGGTATTAATGCTGATTATTTAAATCTTTTAAAAAGAGCGTTAAATATCAAATTAACACTCCGGGAATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGATATAGTGTTATCACATTTAGTTACTTcgccg < 2:995623/150‑1 (MQ=255)
gTGGTATTAATGCTGATTATTTAAATCTTTTAAAAAGAGCGTTAAATATCAAATTAACACTCCGGGAATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGATATAGTGTTATCACATTTAGTTACTTcgccgc > 2:2979514/1‑150 (MQ=255)
ttAATGCTGATTATTTAAATCTTTTAAAAAGAGCGTTAAATATCAAATTAACACTCCGGGAATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGATATAGTGTTATCACATTTAGTTACTTCGCCGCCTCTta < 2:2384321/150‑1 (MQ=255)
ttAATGCTGATTATTTAAATCTTTTAAAAAGAGCGTTAAATATCAAATTAACACTCCGGGAATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGATATAGTGTTATCACATTTAGTTACTTCGCCGCCTCTta < 2:3099259/150‑1 (MQ=255)
tGCTGATTATTTAAATCTTTTAAAAAGAGCGTTAAATATCAAATTAACACTCCGGGAATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGATATAGTGTTATCACATTTAGTTACTTCGCCGCCTCTtaataa > 1:1130892/1‑150 (MQ=255)
gCTGATTATTTAAATCTTTTAAAAAGAGCGTTAAATATCAAATTAACACTCCGGGAATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGATATAGTGTTATCACATTTAGTTACTTCGCCGCCTCTTaataat > 1:2743453/1‑150 (MQ=255)
ttattTAAATCTTTTAAAAAGAGCGTTAAATATCAAATTAACACTCCGGGAATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGATATAGTGTTATCACATTTAGTTACTTCGCCGCCTCTTAATAATGACAt > 1:181860/1‑150 (MQ=255)
tattTAAATCTTTTAAAAAGAGCGTTAAATATCAAATTAACACTCCGGGAATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGATATAGTGTTATCACATTTAGTTACTTCGCCGCCTCTTAATAATGACAtt > 2:877535/1‑150 (MQ=255)
attTAAATCTTTTAAAAAGAGCGTTAAATATCAAATTAACACTCCGGGAATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGATATAGTGTTATCACATTTAGTTACTTCGCCGCCTCTTAATAATGACATtg < 2:2909682/150‑1 (MQ=255)
attTAAATCTTTTAAAAAGAGCGTTAAATATCAAATTAACACTCCGGGAATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGATATAGTGTTATCACATTTAGTTACTTCGCCGCCTCTTAATAATGACATtg > 2:575695/1‑150 (MQ=255)
attTAAATCTTTTAAAAAGAGCGTTAAATATCAAATTAACACTCCGGGAATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGATATAGTGTTATCACATTTAGTTACTTCGCCGCCTCTTAATAATGACATtg > 2:331878/1‑150 (MQ=255)
attTAAATCTTTTAAAAAGAGCGTTAAATATCAAATTAACACTCCGGGAATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGATATAGTGTTATCACATTTAGTTACTTCGCCGCCTCTTAATAATGACATtg > 1:2252918/1‑150 (MQ=255)
ttAAATCTTTTAAAAAGAGCGTTAAATATCAAATTAACACTCCGGGAATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGATATAGTGTTATCACATTTAGTTACTTCGCCGCCTCTTAATAATGACATtgct < 2:118336/150‑1 (MQ=255)
ttAAATCTTTTAAAAAGAGCGTTAAATATCAAATTAACACTCCGGGAATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGATATAGTGTTATCACATTTAGTTACTTCGCCGCCTCTTAATAATGACATtgct > 1:945488/1‑150 (MQ=255)
tAAATCTTTTAAAAAGAGCGTTAAATATCAAATTAACACTCCGGGAATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGATATAGTGTTATCACATTTAGTTACTTCGCCGCCTCTTAATAATGACATtgctg < 2:3446560/150‑1 (MQ=255)
tAAATCTTTTAAAAAGAGCGTTAAATATCAAATTAACACTCCGGGAATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGATATAGTGTTATCACATTTAGTTACTTCGCCGCCTCTTAATAATGACATtgctg < 1:2628199/150‑1 (MQ=255)
tCTTTTAAAAAGAGCGTTAAATATCAAATTAACACTCCGGGAATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGATATAGTGTTATCACATTTAGTTACTTCGCCGCCTCTTAATAATGACATTGCTGCaac < 1:2362162/150‑1 (MQ=255)
tCTTTTAAAAAGAGCGTTAAATATCAAATTAACACTCCGGGAATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGATATAGTGTTATCACATTTAGTTACTTCGCCGCCTCTTAATAATGACATTGCTGCaac > 2:25114/1‑150 (MQ=255)
cTTTTAAAAAGAGCGTTAAATATCAAATTAACACTCCGGGAATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGATATAGTGTTATCACATTTAGTTACTTCGCCGCCTCTTAATAATGACATTGCTGCaacc < 2:3040714/150‑1 (MQ=255)
cTTTTAAAAAGAGCGTTAAATATCAAATTAACACTCCGGGAATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGATATAGTGTTATCACATTTAGTTACTTCGCCGCCTCTTAATAATGACATTGCTGCaacc > 1:759453/1‑150 (MQ=255)
cTTTTAAAAAGAGCGTTAAATATCAAATTAACACTCCGGGAATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGATATAGTGTTATCACATTTAGTTACTTCGCCGCCTCTTAATAATGACATTGCTGCaacc < 1:1670743/150‑1 (MQ=255)
ttttAAAAAGAGCGTTAAATATCAAATTAACACTCCGGGAATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGATATAGTGTTATCACATTTAGTTACTTCGCCGCCTCTTAATAATGACATTGCTGCaacca > 2:206584/1‑150 (MQ=255)
ttttAAAAAGAGCGTTAAATATCAAATTAACACTCCGGGAATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGATATAGTGTTATCACATTTAGTTACTTCGCCGCCTCTTAATAATGACATTGCTGCaacca < 1:3674073/150‑1 (MQ=255)
tttAAAAAGAGCGTTAAATATCAAATTAACACTCCGGGAATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGATATAGTGTTATCACATTTAGTTACTTCGCCGCCTCTTAATAATGACATTGCTGCaaccaa < 2:190003/150‑1 (MQ=255)
tAAAAAGAGCGTTAAATATCAAATTAACACTCCGGGAATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGATATAGTGTTATCACATTTAGTTACTTCGCCGCCTCTTAATAATGACATTGCTGCaaccaaac < 2:94613/150‑1 (MQ=255)
aaaaaGAGCGTTAAATATCAAATTAACACTCCGGGAATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGATATAGTGTTATCACATTTAGTTACTTCGCCGCCTCTTAATAATGACATTGCTGCaaccaaacc > 2:3547293/1‑150 (MQ=255)
aaaaaGAGCGTTAAATATCAAATTAACACTCCGGGAATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGATATAGTGTTATCACATTTAGTTACTTCGCCGCCTCTTAATAATGACATTGCTGCaaccaaacc > 2:1782166/1‑150 (MQ=255)
agagCGTTAAATATCAAATTAACACTCCGGGAATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGATATAGTGTTATCACATTTAGTTACTTCGCCGCCTCTTAATAATGACATTGCTGCAACCAAACCATTg < 1:329919/150‑1 (MQ=255)
gCGTTAAATATCAAATTAACACTCCGGGAATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGATATAGTGTTATCACATTTAGTTACTTCGCCGCCTCTTAATAATGACATTGCTGCAACCAAACCATTGATa < 2:2226284/150‑1 (MQ=255)
cGTTAAATATCAAATTAACACTCCGGGAATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGATATAGTGTTATCACATTTAGTTACTTCGCCGCCTCTTAATAATGACATTGCTGCAACCAAACCATTGATaa < 2:1181348/150‑1 (MQ=255)
gTTAAATATCAAATTAACACTCCGGGAATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGATATAGTGTTATCACATTTAGTTACTTCGCCGCCTCTTAATAATGACATTGCTGCAACCAAACCATTGATAAt < 1:70955/150‑1 (MQ=255)
gTTAAATATCAAATTAACACTCCGGGAATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGATATAGTGTTATCACATTTAGTTACTTCGCCGCCTCTTAATAATGACATTGCTGCAACCAAACCATTGATAAt > 2:3721269/1‑150 (MQ=255)
gTTAAATATCAAATTAACACTCCGGGAATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGATATAGTGTTATCACATTTAGTTACTTCGCCGCCTCTTAATAATGACATTGCTGCAACCAAACCATTGATAAt > 1:2402694/1‑150 (MQ=255)
gTTAAATATCAAATTAACACTCCGGGAATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGATATAGTGTTATCACATTTAGTTACTTCGCCGCCTCTTAATAATGACATTGCTGCAACCAAACCATTGATAAt < 2:2813251/150‑1 (MQ=255)
aaaTATCAAATTAACACTCCGGGAATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGATATAGTGTTATCACATTTAGTTACTTCGCCGCCTCTTAATAATGACATTGCTGCAACCAAACCATTGATAATTAc < 1:1422867/150‑1 (MQ=255)
aaaTATCAAATTAACACTCCGGGAATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGATATAGTGTTATCACATTTAGTTACTTCGCCGCCTCTTAATAATGACATTGCTGCAACCAAACCATTGATAATTAc < 1:1109258/150‑1 (MQ=255)
aaaTATCAAATTAACACTCCGGGAATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGATATAGTGTTATCACATTTAGTTACTTCGCCGCCTCTTAATAATGACATTGCTGCAACCAAACCATTGATAATTAc < 2:1421273/150‑1 (MQ=255)
aaaTATCAAATTAACACTCCGGGAATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGATATAGTGTTATCACATTTAGTTACTTCGCCGCCTCTTAATAATGACATTGCTGCAACCAAACCATTGATAATTAc < 1:2993071/150‑1 (MQ=255)
aaTATCAAATTAACACTCCGGGAATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGATATAGTGTTATCACATTTAGTTACTTCGCCGCCTCTTAATAATGACATTGCTGCAACCAAACCATTGATAATTAcc > 2:1088412/1‑150 (MQ=255)
atatCAAATTAACACTCCGGGAATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGATATAGTGTTATCACATTTAGTTACTTCGCCGCCTCTTAATAATGACATTGCTGCAACCAAACCATTGATAATTACCt > 2:1562824/1‑150 (MQ=255)
atCAAATTAACACTCCGGGAATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGATATAGTGTTATCACATTTAGTTACTTCGCCGCCTCTTAATAATGACATTGCTGCAACCAAACCATTGATAATTACCttt < 1:3391154/150‑1 (MQ=255)
tCAAATTAACACTCCGGGAATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGATATAGTGTTATCACATTTAGTTACTTCGCCGCCTCTTAATAATGACATTGCTGCAACCAAACCATTGATAATTACCTTTc < 2:3735649/150‑1 (MQ=255)
aaaTTAACACTCCGGGAATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGATATAGTGTTATCACATTTAGTTACTTCGCCGCCTCTTAATAATGACATTGCTGCAACCAAACCATTGATAATTACCTTTCCg > 1:1912136/1‑150 (MQ=255)
aaaTTAACACTCCGGGAATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGATATAGTGTTATCACATTTAGTTACTTCGCCGCCTCTTAATAATGACATTGCTGCAACCAAACCATTGATAATTACCTTTCCg > 2:2357955/1‑150 (MQ=255)
aaaTTAACACTCCGGGAATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGATATAGTGTTATCACATTTAGTTACTTCGCCGCCTCTTAATAATGACATTGCTGCAACCAAACCATTGATAATTACCTTTCCg > 2:1628541/1‑150 (MQ=255)
aaTTAACACTCCGGGAATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGATATAGTGTTATCACATTTAGTTACTTCGCCGCCTCTTAATAATGACATTGCTGCAACCAAACCATTGATAATTACCTTTCCgg > 1:2508538/1‑150 (MQ=255)
aTTAACACTCCGGGAATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGATATAGTGTTATCACATTTAGTTACTTCGCCGCCTCTTAATAATGACATTGCTGCAACCAAACCATTGATAATTACCTTTCCGgc < 2:1493342/150‑1 (MQ=255)
acacTCCGGGAATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGATATAGTGTTATCACATTTAGTTACTTCGCCGCCTCTTAATAATGACATTGCTGCAACCAAACCATTGATAATTACCTTTCCGGCGCTg < 1:3019106/150‑1 (MQ=255)
cacTCCGGGAATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGATATAGTGTTATCACATTTAGTTACTTCGCCGCCTCTTAATAATGACATTGCTGCAACCAAACCATTGATAATTACCTTTCCGGCGCTgg < 1:3714766/150‑1 (MQ=255)
cacTCCGGGAATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGATATAGTGTTATCACATTTAGTTACTTCGCCGCCTCTTAATAATGACATTGCTGCAACCAAACCATTGATAATTACCTTTCCGGCGCTgg > 1:903218/1‑150 (MQ=255)
cacTCCGGGAATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGATATAGTGTTATCACATTTAGTTACTTCGCCGCCTCTTAATAATGACATTGCTGCAACCAAACCATTGATAATTACCTTTCCGGCGCTgg < 1:3336985/150‑1 (MQ=255)
ccGGGAATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGATATAGTGTTATCACATTTAGTTACTTCGCCGCCTCTTAATAATGACATTGCTGCAACCAAACCATTGATAATTACCTTTCCGGCGCTGGTAac > 1:1241714/1‑150 (MQ=255)
cGGGAATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGATATAGTGTTATCACATTTAGTTACTTCGCCGCCTCTTAATAATGACATTGCTGCAACCAAACCATTGATAATTACCTTTCCGGCGCTGGTAacc < 1:22084/150‑1 (MQ=255)
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aaTACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGATATAGTGTTATCACATTTAGTTACTTCGCCGCCTCTTAATAATGACATTGCTGCAACCAAACCATTGATAATTACCTTTCCGGCGCTGGTAACCAccc > 1:2929288/1‑150 (MQ=255)
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tcatcaAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGATATAGTGTTATCACATTTAGTTACTTCGCCGCCTCTTAATAATGACATTGCTGCAACCAAACCATTGATAATTACCTTTCCGGCGCTGGTAACCACCCTTCACGACTc > 1:2000242/1‑150 (MQ=255)
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AAATATCAAATTAACACTCCGGGAATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGATATAGTGTTATCACATTTAGTTACTTCGCCGCCTCTTAATAATGACATTGCTGCAACCAAACCATTGATAATTAC < SRR19973061.1426454/150‑1 (MQ=60)
ATCAAATTAACACTCCGGGAATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGATATAGTGTTATCACATTTAGTTACTTCGCCGCCTCTTAATAATGACATTGCTGCAACCAAACCATTGATAATTACCTTT < SRR19973061.3399865/150‑1 (MQ=60)
TCAAATTAACACTCCGGGAATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGATATAGTGTTATCACATTTAGTTACTTCGCCGCCTCTTAATAATGACATTGCTGCAACCAAACCATTGATAATTACCTTTC > SRR19973061.712382/1‑150 (MQ=60)
CAAATTAACACTCCGGGAATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGATATAGTGTTATCACATTTAGTTACTTCGCCGCCTCTTAATAATGACATTGCTGCAACCAAACCATTGATAATTACCTTTCC < SRR19973061.904378/150‑1 (MQ=60)
AAATTAACACTCCGGGAATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGATATAGTGTTATCACATTTAGTTACTTCGCCGCCTCTTAATAATGACATTGCTGCAACCAAACCATTGATAATTACCTTTCCG > SRR19973061.1916864/1‑150 (MQ=60)
AAATTAACACTCCGGGAATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGATATAGTGTTATCACATTTAGTTACTTCGCCGCCTCTTAATAATGACATTGCTGCAACCAAACCATTGATAATTACCTTTCCG > SRR19973061.759078/1‑150 (MQ=60)
AATTAACACTCCGGGAATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGATATAGTGTTATCACATTTAGTTACTTCGCCGCCTCTTAATAATGACATTGCTGCAACCAAACCATTGATAATTACCTTTCCGG > SRR19973061.2514930/1‑150 (MQ=60)
TAACACTCCGGGAATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGATATAGTGTTATCACATTTAGTTACTTCGCCGCCTCTTAATAATGACATTGCTGCAACCAAACCATTGATAATTACCTTTCCGGCGC > SRR19973061.218491/1‑150 (MQ=60)
ACACTCCGGGAATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGATATAGTGTTATCACATTTAGTTACTTCGCCGCCTCTTAATAATGACATTGCTGCAACCAAACCATTGATAATTACCTTTCCGGCGCTG < SRR19973061.3026900/150‑1 (MQ=60)
ACACTCCGGGAATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGATATAGTGTTATCACATTTAGTTACTTCGCCGCCTCTTAATAATGACATTGCTGCAACCAAACCATTGATAATTACCTTTCCGGCGCTG < SRR19973061.1506317/150‑1 (MQ=60)
CACTCCGGGAATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGATATAGTGTTATCACATTTAGTTACTTCGCCGCCTCTTAATAATGACATTGCTGCAACCAAACCATTGATAATTACCTTTCCGGCGCTGG < SRR19973061.3345580/150‑1 (MQ=60)
CACTCCGGGAATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGATATAGTGTTATCACATTTAGTTACTTCGCCGCCTCTTAATAATGACATTGCTGCAACCAAACCATTGATAATTACCTTTCCGGCGCTGG > SRR19973061.905538/1‑150 (MQ=60)
CACTCCGGGAATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGATATAGTGTTATCACATTTAGTTACTTCGCCGCCTCTTAATAATGACATTGCTGCAACCAAACCATTGATAATTACCTTTCCGGCGCTGG < SRR19973061.3724263/150‑1 (MQ=60)
ACTCCGGGAATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGATATAGTGTTATCACATTTAGTTACTTCGCCGCCTCTTAATAATGACATTGCTGCAACCAAACCATTGATAATTACCTTTCCGGCGCTGGT > SRR19973061.3683756/1‑150 (MQ=60)
CTCCGGGAATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGATATAGTGTTATCACATTTAGTTACTTCGCCGCCTCTTAATAATGACATTGCTGCAACCAAACCATTGATAATTACCTTTCCGGCGCTGGTA < SRR19973061.2888766/150‑1 (MQ=60)
CCGGGAATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGATATAGTGTTATCACATTTAGTTACTTCGCCGCCTCTTAATAATGACATTGCTGCAACCAAACCATTGATAATTACCTTTCCGGCGCTGGTAAC > SRR19973061.1244795/1‑150 (MQ=60)
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CGGGAATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGATATAGTGTTATCACATTTAGTTACTTCGCCGCCTCTTAATAATGACATTGCTGCAACCAAACCATTGATAATTACCTTTCCGGCGCTGGTAACC < SRR19973061.22169/150‑1 (MQ=60)
CGGGAATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGATATAGTGTTATCACATTTAGTTACTTCGCCGCCTCTTAATAATGACATTGCTGCAACCAAACCATTGATAATTACCTTTCCGGCGCTGGTAACC > SRR19973061.3758977/1‑150 (MQ=60)
GGGAATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGATATAGTGTTATCACATTTAGTTACTTCGCCGCCTCTTAATAATGACATTGCTGCAACCAAACCATTGATAATTACCTTTCCGGCGCTGGTAACCA > SRR19973061.2252852/1‑150 (MQ=60)
GAATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGATATAGTGTTATCACATTTAGTTACTTCGCCGCCTCTTAATAATGACATTGCTGCAACCAAACCATTGATAATTACCTTTCCGGCGCTGGTAACCACC > SRR19973061.2842839/1‑150 (MQ=60)
GAATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGATATAGTGTTATCACATTTAGTTACTTCGCCGCCTCTTAATAATGACATTGCTGCAACCAAACCATTGATAATTACCTTTCCGGCGCTGGTAACCACC > SRR19973061.364348/1‑150 (MQ=60)
AATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGATATAGTGTTATCACATTTAGTTACTTCGCCGCCTCTTAATAATGACATTGCTGCAACCAAACCATTGATAATTACCTTTCCGGCGCTGGTAACCACCC > SRR19973061.2936818/1‑150 (MQ=60)
AATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGATATAGTGTTATCACATTTAGTTACTTCGCCGCCTCTTAATAATGACATTGCTGCAACCAAACCATTGATAATTACCTTTCCGGCGCTGGTAACCACCC < SRR19973061.1917623/150‑1 (MQ=60)
AATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGATATAGTGTTATCACATTTAGTTACTTCGCCGCCTCTTAATAATGACATTGCTGCAACCAAACCATTGATAATTACCTTTCCGGCGCTGGTAACCACCC > SRR19973061.2936817/1‑150 (MQ=60)
ATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGATATAGTGTTATCACATTTAGTTACTTCGCCGCCTCTTAATAATGACATTGCTGCAACCAAACCATTGATAATTACCTTTCCGGCGCTGGTAACCACCCT < SRR19973061.450336/150‑1 (MQ=60)
GCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGATATAGTGTTATCACATTTAGTTACTTCGCCGCCTCTTAATAATGACATTGCTGCAACCAAACCATTGATAATTACCTTTCCGGCGCTGGTAACCACCCTTCAC < SRR19973061.1081285/150‑1 (MQ=60)
TCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGATATAGTGTTATCACATTTAGTTACTTCGCCGCCTCTTAATAATGACATTGCTGCAACCAAACCATTGATAATTACCTTTCCGGCGCTGGTAACCACCCTTCACGACTC > SRR19973061.2005246/1‑150 (MQ=60)
TCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTAGATATAGTGTTATCACATTTAGTTACTTCGCCGCCTCTTAATAATGACATTGCTGCAACCAAACCATTGATAATTACCTTTCCGGCGCTGGTAACCACCCTTCACGACTCAAT < SRR19973061.3688799/150‑1 (MQ=60)
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AAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGATATAGTGTTATCACATTTAGTTACTTCGCCGCCTCTTAATAATGACATTGCTGCAACCAAACCATTGATAATTACCTTTCCGGCGCTGGTAACCACCCTTCACGACTCAATGCG > SRR19973061.1699289/1‑150 (MQ=60)
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AATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGATATAGTGTTATCACATTTAGTTACTTCGCCGCCTCTTAATAATGACATTGCTGCAACCAAACCATTGATAATTACCTTTCCGGCGCTGGTAACCACCCTTCACGACTCAATGCGACCGCT > SRR19973061.678704/1‑150 (MQ=60)
ATGGACGCGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGATATAGTGTTATCACATTTAGTTACTTCGCCGCCTCTTAATAATGACATTGCTGCAACCAAACCATTGATAATTACCTTTCCGGCGCTGGTAACCACCCTTCACGACTCAATGCGACCGCTT > SRR19973061.1087061/1‑150 (MQ=60)
CGCTTGCAGAAGGTTAAGTCGATATAGTGTTATCACATTTAGTTACTTCGCCGCCTCTTAATAATGACATTGCTGCAACCAAACCATTGATAATTACCTTTCCGGCGCTGGTAACCACCCTTCACGACTCAATGCGACCGCTTACCTCAC > SRR19973061.712503/1‑150 (MQ=60)
CAGAAGGTTAAGTCGATATAGTGTTATCACATTTAGTTACTTCGCCGCCTCTTAATAATGACATTGCTGCAACCAAACCATTGATAATTACCTTTCCGGCGCTGGTAACCACCCTTCACGACTCAATGCGACCGCTTACCTCACCAAAAC > SRR19973061.3714238/1‑150 (MQ=60)
GAAGGTTAAGTCGATATAGTGTTATCACATTTAGTTACTTCGCCGCCTCTTAATAATGACATTGCTGCAACCAAACCATTGATAATTACCTTTCCGGCGCTGGTAACCACCCTTCACGACTCAATGCGACCGCTTACCTCACCAAAACCA < SRR19973061.619242/150‑1 (MQ=60)
AAGGTTAAGTCGATATAGTGTTATCACATTTAGTTACTTCGCCGCCTCTTAATAATGACATTGCTGCAACCAAACCATTGATAATTACCTTTCCGGCGCTGGTAACCACCCTTCACGACTCAATGCGACCGCTTACCTCACCAAAACCAG < SRR19973061.1091201/150‑1 (MQ=60)
TAAGTCGATATAGTGTTATCACATTTAGTTACTTCGCCGCCTCTTAATAATGACATTGCTGCAACCAAACCATTGATAATTACCTTTCCGGCGCTGGTAACCACCCTTCACGACTCAATGCGACCGCTTACCTCACCAAAACCAGTAAAT < SRR19973061.577197/150‑1 (MQ=60)
|
GGCTACGTTGTTGCATACCGATTCGCAGCAACGGGTTCGTGGTATTAATGCTGATTATTTAAATCTTTTAAAAAGAGCGTTAAATATCAAATTAACACTCCGGGAATACGCAGATCATCAAAAAGCAATGGACGCGCTTGCAGAAGGTGAAGTCGATATAGTGTTATCACATTTAGTTACTTCGCCGCCTCTTAATAATGACATTGCTGCAACCAAACCATTGATAATTACCTTTCCGGCGCTGGTAACCACCCTTCACGACTCAATGCGACCGCTTACCTCACCAAAACCAGTAAAT > CP009273/2478053‑2478350
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
