Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F534 I1 R1
|
1235 |
230.2 |
7611948 |
95.1% |
7238962 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
4,057,396 |
A→T |
L87* (TTA→TAA) |
ompL ← |
outer membrane porin L |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 4,057,396 | 0 | A | T | 100.0%
| 711.7
/ NA
| 214 | L87* (TTA→TAA) | ompL | outer membrane porin L |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base T (110/104); total (110/104) |
Only 100 of 214 total aligned reads displayed.
AATCTGTTGAACTATAGTTATTATGGTTATAGCGATTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTAATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATACCCGCGCCCATATCGAAGTTATAACCCACACGTAGCATAAC > CP009273/4057250‑4057541
|
aaTCTGTTGAACTATAGTTATTATGGTTATAGCGATTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTAtt > 1:87038/1‑150 (MQ=255)
aaTCTGTTGAACTATAGTTATTATGGTTATAGCGATTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTAtt > 2:1577044/1‑150 (MQ=255)
aTCTGTTGAACTATAGTTATTATGGTTATAGCGATTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTAttt > 1:1702727/1‑150 (MQ=255)
tGTTGAACTATAGTTATTATGGTTATAGCGATTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATc > 1:2820829/1‑150 (MQ=255)
tGTTGAACTATAGTTATTATGGTTATAGCGATTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATc > 1:2625457/1‑150 (MQ=255)
tGTTGAACTATAGTTATTATGGTTATAGCGATTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATc > 1:2442341/1‑150 (MQ=255)
tGAACTATAGTTATTATGGTTATAGCGATTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCggt > 1:1876860/1‑150 (MQ=255)
gAACTATAGTTATTATGGTTATAGCGATTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCggtt > 2:1430373/1‑150 (MQ=255)
gAACTATAGTTATTATGGTTATAGCGATTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCggtt > 1:1718376/1‑150 (MQ=255)
cTATAGTTATTATGGTTATAGCGATTTCGTTCTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCggttggt < 1:2910613/150‑1 (MQ=255)
tataGTTATTATGGTTATAGCGATTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCggttggtt > 2:734926/1‑150 (MQ=255)
ataGTTATTATGGTTATAGCGATTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGttt > 2:3789582/1‑150 (MQ=255)
aGTTATTATGGTTATAGCGATTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTaa < 1:2754536/150‑1 (MQ=255)
aGTTATTATGGTTATAGCGATTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTaa > 1:3366669/1‑150 (MQ=255)
gTTATTATGGTTATAGCGATTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTaaa > 2:353593/1‑150 (MQ=255)
ttattaTGGTTATAGCGATTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAAt < 1:3080267/150‑1 (MQ=255)
ttattaTGGTTATAGCGATTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAAt > 1:2794924/1‑150 (MQ=255)
ttatGGTTATAGCGATTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAAc > 1:3402211/1‑150 (MQ=255)
tatGGTTATAGCGATTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACg > 2:3390861/1‑150 (MQ=255)
tatGGTTATAGCGATTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACg > 1:3441330/1‑150 (MQ=255)
ggTTATAGCGATTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGAt < 1:1474595/150‑1 (MQ=255)
ggTTATAGCGATTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGAt > 2:267189/1‑150 (MQ=255)
ataGCGATTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCa < 1:850406/150‑1 (MQ=255)
aGCGATTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGc > 1:756633/1‑150 (MQ=255)
cGATTTCGTACTGTCAGATTAAACCCTGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCt < 2:2019303/150‑1 (MQ=255)
cGATTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCt < 2:363095/150‑1 (MQ=255)
gATTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCtt < 1:2082190/150‑1 (MQ=255)
gATTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCtt < 2:177616/150‑1 (MQ=255)
aTTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTc > 1:3222282/1‑150 (MQ=255)
gTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAAttt > 1:1301751/1‑150 (MQ=255)
gTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAAttt > 2:111944/1‑150 (MQ=255)
aCTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCg < 2:1252756/150‑1 (MQ=255)
aCTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCg > 2:2631216/1‑150 (MQ=255)
gTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCAGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTta > 1:730223/1‑150 (MQ=255)
aGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTatat > 1:908858/1‑150 (MQ=255)
ttAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCa > 2:1658737/1‑150 (MQ=255)
ttAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCa > 2:3178008/1‑150 (MQ=255)
tAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCAt > 1:952749/1‑150 (MQ=255)
aaaCCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATg < 1:1726068/150‑1 (MQ=255)
aCCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGtt < 2:656270/150‑1 (MQ=255)
aTGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTa < 2:894173/150‑1 (MQ=255)
aTGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTa < 2:3224330/150‑1 (MQ=255)
tGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAg > 2:540782/1‑150 (MQ=255)
gaaCAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGtt < 2:491726/148‑1 (MQ=255)
gTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGtt < 1:678455/150‑1 (MQ=255)
gTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGtt < 2:184214/150‑1 (MQ=255)
attttgaGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCGGAACCGATACTCTTATCATTTATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTTTATCCATGTTTTAGTTCAtctt < 2:730223/144‑1 (MQ=255)
aTTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCAtctt > 2:401265/1‑150 (MQ=255)
aTTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCAtctt > 2:400729/1‑150 (MQ=255)
aTTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACAGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCAtctt < 1:2501710/150‑1 (MQ=255)
ttATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCAtcttct < 2:87038/150‑1 (MQ=255)
ttATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCAtcttct < 2:2558476/150‑1 (MQ=255)
ataGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCg < 2:2240708/150‑1 (MQ=255)
aGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCt < 1:3277131/150‑1 (MQ=255)
tGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGaa < 1:2223195/150‑1 (MQ=255)
gACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGaaa > 1:1523600/1‑150 (MQ=255)
cGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGt > 2:1989306/1‑150 (MQ=255)
cGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGt < 1:111944/150‑1 (MQ=255)
gTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGtt < 1:703289/150‑1 (MQ=255)
cAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTa < 1:2624402/150‑1 (MQ=255)
gATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAgg < 1:1024383/150‑1 (MQ=255)
aTACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGt > 1:1438654/1‑150 (MQ=255)
aTACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGt < 2:3734693/150‑1 (MQ=255)
aTACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGt > 1:302373/1‑150 (MQ=255)
acacTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTAt > 2:1314019/1‑150 (MQ=255)
acacTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTAt < 1:3194600/150‑1 (MQ=255)
acacTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTAt > 1:3585865/1‑150 (MQ=255)
acTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTg < 1:852349/150‑1 (MQ=255)
tGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGt < 1:1745002/150‑1 (MQ=255)
gCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGtt < 2:1637201/150‑1 (MQ=255)
caccacCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTa < 2:2374093/150‑1 (MQ=255)
aaCAGATAATATTATCATTAATTAAGCCATCGGGCTGGATGGTTTATTTATTGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATAc < 1:1430373/150‑1 (MQ=255)
aCCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATAcc < 1:1577044/150‑1 (MQ=255)
aTACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATACCcgcg > 1:1950627/1‑150 (MQ=255)
ctctTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATACCCGCGccc > 1:21260/1‑150 (MQ=255)
ctTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATACCCGCGCCCat < 1:267189/150‑1 (MQ=255)
ctTATCATTAATTAAGCCAACGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATACCCGCGCCCat < 1:399938/150‑1 (MQ=255)
tATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATACCCGCGCCCatat > 1:283591/1‑150 (MQ=255)
tCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATACCCGCGCCCATATCg < 1:3670952/150‑1 (MQ=255)
tCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATACCCGCGCCCATATCg > 2:3100563/1‑150 (MQ=255)
tCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATACCCGCGCCCATATCg < 2:2823291/150‑1 (MQ=255)
attaattaAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATACCCGCGCCCATATCGaa < 1:1876557/150‑1 (MQ=255)
taattaaGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATACCCGCGCCCATATCGAAGt > 2:3443734/1‑150 (MQ=255)
aattaaGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATACCCGCGCCCATATCGAAGtt > 1:3751160/1‑150 (MQ=255)
ttaaGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATACCCGCGCCCATATCGAAGTtat < 2:2442341/150‑1 (MQ=255)
gCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATACCCGCGCCCATATCGAAGTTATAAcc < 2:2494448/150‑1 (MQ=255)
ccACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATACCCGCGCCCATATCGAAGTTATAAccc > 2:2353473/1‑150 (MQ=255)
cACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATACCCGCGCCCATATCGAAGTTATAACCca > 1:1736486/1‑150 (MQ=255)
cACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATACCCGCGCCCATATCGAAGTTATAACCca > 1:564915/1‑150 (MQ=255)
cGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATACCCGCGCCCATATCGAAGTTATAACCCacac < 2:303141/150‑1 (MQ=255)
ggCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATACCCGCGCCCATATCGAAGTTATAACCCACACGt < 2:1702727/150‑1 (MQ=255)
ggCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATACCCGCGCCCATATCGAAGTTATAACCCACACGt > 2:1462608/1‑150 (MQ=255)
cTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATACCCGCGCCCATATCGAAGTTATAACCCACACGTAg > 1:1036277/1‑150 (MQ=255)
tGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATACCCGCGCCCATATCGAAGTTATAACCCACACGTAGc < 2:2003646/150‑1 (MQ=255)
tGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATACCCGCGCCCATATCGAAGTTATAACCCACACGTAGc > 2:304426/1‑150 (MQ=255)
ggATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATACCCGCGCCCATATCGAAGTTATAACCCACACGTAGCa > 1:3626829/1‑150 (MQ=255)
tGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATACCCGCGCCCATATCGAAGTTATAACCCACACGTAGCATaa > 2:3617675/1‑150 (MQ=255)
ggTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATACCCGCGCCCATATCGAAGTTATAACCCACACGTAGCATAAc > 1:2694700/1‑150 (MQ=255)
ggTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATACCCGCGCCCATATCGAAGTTATAACCCACACGTAGCATAAc < 1:108815/150‑1 (MQ=255)
ggTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATACCCGCGCCCATATCGAAGTTATAACCCACACGTAGCATAAc > 1:2326672/1‑150 (MQ=255)
|
AATCTGTTGAACTATAGTTATTATGGTTATAGCGATTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTAATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATACCCGCGCCCATATCGAAGTTATAACCCACACGTAGCATAAC > CP009273/4057250‑4057541
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TCAAATCTGTTGAACTATAGTTATTATGGTTATAGCGATTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTAATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATACCCGCGCCCATATCGAAGTTATAACCCACACGTAGCATAACCT > CP009273/4057247‑4057543
|
TCAAATCTGTTGAACTATAGTTATTATGGTTATAGCGATTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTT < SRR19973061.1785852/150‑1 (MQ=60)
TCAAATCTGTTGAACTATAGTTATTATGGTTATAGCGATTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTT < SRR19973061.3684089/150‑1 (MQ=60)
TCAAATCTGTTGAACTATAGTTATTATGGTTATAGCGATTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTT > SRR19973061.1573500/1‑150 (MQ=60)
CAAATCTGTTGAACTATAGTTATTATGGTTATAGCGATTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTA > SRR19973061.2500801/1‑150 (MQ=60)
CAAATCTGTTGAACTATAGTTATTATGGTTATAGCGATTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTA > SRR19973061.2661328/1‑150 (MQ=60)
AATCTGTTGAACTATAGTTATTATGGTTATAGCGATTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATT > SRR19973061.87336/1‑150 (MQ=60)
ATCTGTTGAACTATAGTTATTATGGTTATAGCGATTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTT > SRR19973061.1707002/1‑150 (MQ=60)
TGTTGAACTATAGTTATTATGGTTATAGCGATTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATC > SRR19973061.2448570/1‑150 (MQ=60)
TGTTGAACTATAGTTATTATGGTTATAGCGATTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATC > SRR19973061.2632205/1‑150 (MQ=60)
TGTTGAACTATAGTTATTATGGTTATAGCGATTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATC > SRR19973061.2828061/1‑150 (MQ=60)
GTTGAACTATAGTTATTATGGTTATAGCGATTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCG > SRR19973061.2830526/1‑150 (MQ=60)
TTGAACTATAGTTATTATGGTTATAGCGATTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGG < SRR19973061.721525/150‑1 (MQ=60)
TGAACTATAGTTATTATGGTTATAGCGATTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGT > SRR19973061.1881531/1‑150 (MQ=60)
GAACTATAGTTATTATGGTTATAGCGATTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTT < SRR19973061.3081409/150‑1 (MQ=60)
GAACTATAGTTATTATGGTTATAGCGATTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTT > SRR19973061.1722682/1‑150 (MQ=60)
CTATAGTTATTATGGTTATAGCGATTTCGTTCTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGT < SRR19973061.2918083/150‑1 (MQ=60)
CTATAGTTATTATGGTTATAGCGATTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGT < SRR19973061.3416417/150‑1 (MQ=60)
AGTTATTATGGTTATAGCGATTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAA > SRR19973061.3375323/1‑150 (MQ=60)
AGTTATTATGGTTATAGCGATTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAA < SRR19973061.2761631/150‑1 (MQ=60)
TTATTATGGTTATAGCGATTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAAT < SRR19973061.3088208/150‑1 (MQ=60)
TTATTATGGTTATAGCGATTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAAT > SRR19973061.2802104/1‑150 (MQ=60)
TTATTATGGTTATAGCGATTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAAT > SRR19973061.2801264/1‑150 (MQ=60)
ATTATGGTTATAGCGATTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAA < SRR19973061.2793/150‑1 (MQ=60)
ATTATGGTTATAGCGATTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAA < SRR19973061.1920189/150‑1 (MQ=60)
TTATGGTTATAGCGATTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAAC > SRR19973061.3410950/1‑150 (MQ=60)
TATGGTTATAGCGATTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACG > SRR19973061.3450160/1‑150 (MQ=60)
GGTTATAGCGATTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGAT < SRR19973061.1478297/150‑1 (MQ=60)
GGTTATAGCGATTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGAT < SRR19973061.3768027/150‑1 (MQ=60)
GTTATAGCGATTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATA < SRR19973061.871351/150‑1 (MQ=60)
TTATAGCGATTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATAC > SRR19973061.3544567/1‑150 (MQ=60)
ATAGCGATTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCA < SRR19973061.749844/150‑1 (MQ=60)
ATAGCGATTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCA < SRR19973061.749848/150‑1 (MQ=60)
ATAGCGATTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCA < SRR19973061.852625/150‑1 (MQ=60)
AGCGATTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGC > SRR19973061.1500173/1‑150 (MQ=60)
AGCGATTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGC > SRR19973061.758622/1‑150 (MQ=60)
GATTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTT < SRR19973061.2087414/150‑1 (MQ=60)
ATTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTC > SRR19973061.3230565/1‑150 (MQ=60)
TTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCA < SRR19973061.573191/150‑1 (MQ=60)
GTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAATCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTT > SRR19973061.2936384/1‑150 (MQ=60)
GTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTT > SRR19973061.1304994/1‑150 (MQ=60)
GTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTT > SRR19973061.1305040/1‑150 (MQ=60)
TACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTC > SRR19973061.2401160/1‑150 (MQ=60)
GTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTA < SRR19973061.1042726/150‑1 (MQ=60)
GTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCAGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTA > SRR19973061.732136/1‑150 (MQ=60)
AGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATAT > SRR19973061.911190/1‑150 (MQ=60)
TAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCAT < SRR19973061.185914/150‑1 (MQ=60)
TAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCAT > SRR19973061.955153/1‑150 (MQ=60)
AAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATG < SRR19973061.1729960/150‑1 (MQ=60)
AAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATG < SRR19973061.1730402/150‑1 (MQ=60)
ACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTT > SRR19973061.2355552/1‑150 (MQ=60)
CCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTT < SRR19973061.1711881/150‑1 (MQ=60)
GTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTT < SRR19973061.680214/150‑1 (MQ=60)
GTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTT < SRR19973061.1438645/150‑1 (MQ=60)
TACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTC > SRR19973061.229917/1‑150 (MQ=60)
TACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTC > SRR19973061.8936/1‑150 (MQ=60)
CAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCAT < SRR19973061.1678802/150‑1 (MQ=60)
AAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATC < SRR19973061.1301103/150‑1 (MQ=60)
ATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACAGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTT < SRR19973061.2508078/150‑1 (MQ=60)
TTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCTATACTCTTATCATTAATTAAGCCATCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTC < SRR19973061.2651410/150‑1 (MQ=60)
AGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCT < SRR19973061.3285569/150‑1 (MQ=60)
AGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCT < SRR19973061.2526633/150‑1 (MQ=60)
TTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGA < SRR19973061.3208166/150‑1 (MQ=60)
TGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAA < SRR19973061.2228773/150‑1 (MQ=60)
GACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAA > SRR19973061.1527405/1‑150 (MQ=60)
CGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGT < SRR19973061.112318/150‑1 (MQ=60)
GTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTT < SRR19973061.705121/150‑1 (MQ=60)
GTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTT > SRR19973061.933787/1‑150 (MQ=60)
GTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTT > SRR19973061.173259/1‑150 (MQ=60)
CAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTA < SRR19973061.2631157/150‑1 (MQ=60)
CAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTA < SRR19973061.1555452/150‑1 (MQ=60)
CAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTA < SRR19973061.2631146/150‑1 (MQ=60)
AGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAG > SRR19973061.820625/1‑150 (MQ=60)
GATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGG < SRR19973061.1027002/150‑1 (MQ=60)
ATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGT > SRR19973061.303172/1‑150 (MQ=60)
ATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGT > SRR19973061.1442285/1‑150 (MQ=60)
ATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGT > SRR19973061.1442300/1‑150 (MQ=60)
ATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGT > SRR19973061.2215465/1‑150 (MQ=60)
ACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTAT > SRR19973061.3595058/1‑150 (MQ=60)
ACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTAT < SRR19973061.3202801/150‑1 (MQ=60)
ACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTAT < SRR19973061.3203343/150‑1 (MQ=60)
ACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTG < SRR19973061.854569/150‑1 (MQ=60)
ACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTG < SRR19973061.854558/150‑1 (MQ=60)
TGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGT < SRR19973061.1749386/150‑1 (MQ=60)
TGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGT < SRR19973061.1748883/150‑1 (MQ=60)
GCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTT > SRR19973061.3283654/1‑150 (MQ=60)
ACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAA < SRR19973061.3313037/150‑1 (MQ=60)
AACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGACACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATAC < SRR19973061.3621727/150‑1 (MQ=60)
AACAGATAATATTATCATTAATTAAGCCATCGGGCTGGATGGTTTATTTATTGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATAC < SRR19973061.1433974/150‑1 (MQ=60)
ACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATACC < SRR19973061.1580963/150‑1 (MQ=60)
CGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATACCCG > SRR19973061.1091021/1‑150 (MQ=60)
ATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATACCCGCG > SRR19973061.1835074/1‑150 (MQ=60)
ATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATACCCGCG > SRR19973061.1955496/1‑150 (MQ=60)
ACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATACCCGCGCC > SRR19973061.3091117/1‑150 (MQ=60)
ACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATACCCGCGCC > SRR19973061.680662/1‑150 (MQ=60)
CTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATACCCGCGCCC > SRR19973061.21342/1‑150 (MQ=60)
CTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATACCCGCGCCCAT < SRR19973061.267926/150‑1 (MQ=60)
CTTATCATTAATTAAGCCAACGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATACCCGCGCCCAT < SRR19973061.401030/150‑1 (MQ=60)
TATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATTACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATACCCGCGCCCATAT < SRR19973061.2683192/150‑1 (MQ=60)
TATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATACCCGCGCCCATAT > SRR19973061.284352/1‑150 (MQ=60)
TATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATACCCGCGCCCATAT > SRR19973061.284478/1‑150 (MQ=60)
TCATTAATTAAGCCCCCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGCTACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATACCCGCGCCCATATCG < SRR19973061.2106223/150‑1 (MQ=60)
TCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATACCCGCGCCCATATCG < SRR19973061.3680337/150‑1 (MQ=60)
TCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATACCCGCGCCCATATCG < SRR19973061.3680327/150‑1 (MQ=60)
TCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGGTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATACCCGCGCCCATATCG < SRR19973061.3680205/150‑1 (MQ=60)
CATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATACCCGCGCCCATATCGA > SRR19973061.1997887/1‑150 (MQ=60)
ATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATACCCGCGCCCATATCGAA < SRR19973061.1881228/150‑1 (MQ=60)
ATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATACCCGCGCCCATATCGAA < SRR19973061.1881458/150‑1 (MQ=60)
TAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATACCCGCGCCCATATCGAAGT > SRR19973061.1511043/1‑150 (MQ=60)
TAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATACCCGCGCCCATATCGAAGT > SRR19973061.2810692/1‑150 (MQ=60)
AATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATACCCGCGCCCATATCGAAGTT > SRR19973061.3760760/1‑150 (MQ=60)
TAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATACCCGCGCCCATATCGAAGTTATA < SRR19973061.542204/150‑1 (MQ=60)
TAAGCCACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATACCCGCGCCCATATCGAAGTTATA < SRR19973061.2451797/150‑1 (MQ=60)
CACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATACCCGCGCCCATATCGAAGTTATAACCCA > SRR19973061.566392/1‑150 (MQ=60)
CACCGGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATACCCGCGCCCATATCGAAGTTATAACCCA > SRR19973061.1740851/1‑150 (MQ=60)
GGGCTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATACCCGCGCCCATATCGAAGTTATAACCCACACG > SRR19973061.3376189/1‑150 (MQ=60)
CTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATACCCGCGCCCATATCGAAGTTATAACCCACACGTAG > SRR19973061.1038897/1‑150 (MQ=60)
CTGGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATACCCGCGCCCATATCGAAGTTATAACCCACACGTAG > SRR19973061.1038935/1‑150 (MQ=60)
GGATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATACCCGCGCCCATATCGAAGTTATAACCCACACGTAGCA > SRR19973061.3636104/1‑150 (MQ=60)
GATGGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATACCCGCGCCCATATCGAAGTTATAACCCACACGTAGCAT < SRR19973061.3734798/150‑1 (MQ=60)
GGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATACCCGCGCCCATATCGAAGTTATAACCCACACGTAGCATAAC > SRR19973061.2701638/1‑150 (MQ=60)
GGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATACCCGCGCCCATATCGAAGTTATAACCCACACGTAGCATAAC > SRR19973061.2701623/1‑150 (MQ=60)
GGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATACCCGCGCCCATATCGAAGTTATAACCCACACGTAGCATAAC > SRR19973061.2332575/1‑150 (MQ=60)
GGTTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATACCCGCGCCCATATCGAAGTTATAACCCACACGTAGCATAAC < SRR19973061.109175/150‑1 (MQ=60)
TTTATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATACCCGCGCCCATATCGAAGTTATAACCCACACGTAGCATAACCT > SRR19973061.3441353/1‑150 (MQ=60)
|
TCAAATCTGTTGAACTATAGTTATTATGGTTATAGCGATTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTAATTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATACCCGCGCCCATATCGAAGTTATAACCCACACGTAGCATAACCT > CP009273/4057247‑4057543
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
