Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F488 I0 R1
|
1275 |
300.1 |
10328444 |
91.0% |
9398884 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
425,143 |
G→T |
100% |
T61T (ACG→ACT) |
secF → |
SecYEG protein translocase auxillary subunit |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 425,143 | 0 | G | T | 97.4%
| 866.8
/ 10.2
| 274 | T61T (ACG→ACT) | secF | SecYEG protein translocase auxillary subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (3/4); new base T (120/146); total (124/150) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.68e-01 |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 282 total aligned reads displayed.
CGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACGCTCGAAAAACCGGCTGAAATTGACGTAATGCGTGATGCATTGCAAAAAGCCGGTTTTGAAGAGCCGATGCTGCAAAACTTTGGTAGCAGCCATGACATCATGGTCCGTATGCCGCCTGCTGAAGGCGAAACCGGCGGTCAGGTGTT > CP009273/424996‑425289
|
cGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTActct < 2:949648/150‑1 (MQ=255)
cGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTActct < 2:2376754/150‑1 (MQ=255)
ggCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACtctc < 2:62028/150‑1 (MQ=255)
cGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACTCTCGaa < 1:2381844/150‑1 (MQ=255)
aaGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACTCTCGAAAAAc < 2:1311708/150‑1 (MQ=255)
aGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACTCTCGAAAAAcc < 1:3884851/150‑1 (MQ=255)
gTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACTCTCGAAAAACCg < 1:4371613/150‑1 (MQ=255)
gTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACTCTCGAAAAACCg > 2:2939853/1‑150 (MQ=255)
tCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACTCTCGAAAAACCgg > 2:1264399/1‑150 (MQ=255)
tCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACTCTCGAAAAACCgg < 2:4561222/150‑1 (MQ=255)
cTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACTCTCGAAAAACCGGCTGAAAt < 2:1457640/150‑1 (MQ=255)
tttATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACTCTCGAAAAACCGGCTGAAAtt > 2:4484062/1‑150 (MQ=255)
ttgaggcgcTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACTCTCGAAAAACCGGCTGAAAtt < 1:3788923/145‑1 (MQ=255)
ttATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACTCTCGAAAAACCGGCTGAAATTg > 2:4261685/1‑150 (MQ=255)
ttATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACTCTCGAAAAACCGGCTGAAATTg < 2:3175302/150‑1 (MQ=255)
ttATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACTCTCGAAAAACCGGCTGAAATTg > 2:1900575/1‑150 (MQ=255)
ttATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACTCTCGAAAAACCGGCTGAAATTg > 2:1684195/1‑150 (MQ=255)
ttATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACTCTCGAAAAACCGGCTGAAATTg < 2:1126066/150‑1 (MQ=255)
cgcTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACTCTCGAAAAACCGGCTGAAATTGACGTa < 2:3985657/150‑1 (MQ=255)
cgcTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCCCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACTCTCGAAAAACCGGCTGAAATTGACGTa < 2:1424610/150‑1 (MQ=255)
cTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACTCTCGAAAAACCGGCTGAAATTGACGTAAt > 2:2232645/1‑150 (MQ=255)
gggACTACTGGGCTTTCTGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTTTCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACTCTCGAAAAACCGGCTGAAATTGACGTAATGc < 2:150116/150‑1 (MQ=255)
gggACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACTCTCGAAAAACCGGCTGAAATTGACGTAATGc > 2:912039/1‑150 (MQ=255)
ggACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACTCTCGAAAAACCGGCTGAAATTGACGTAATGCg < 1:4958811/150‑1 (MQ=255)
ggACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACTCTCGAAAAACCGGCTGAAATTGACGTAATGCg < 2:3685675/150‑1 (MQ=255)
ggACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACTCTCGAAAAACCGGCTGAAATTGACGTAATGCg < 1:3984970/150‑1 (MQ=255)
ggACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACTCTCGAAAAACCGGCTGAAATTGACGTAATGCg < 1:3656159/150‑1 (MQ=255)
ggACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCGATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACTCTCGAAAAACCGGCTGAAATTGACGTAATGCg < 2:4742857/150‑1 (MQ=255)
gACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACTCTCGAAAAACCGGCTGAAATTGACGTAATGCGt < 2:3381229/150‑1 (MQ=255)
gACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACTCTCGAAAAACCGGCTGAAATTGACGTAATGCGt < 1:3067563/150‑1 (MQ=255)
actactGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACTCTCGAAAAACCGGCTGAAATTGACGTAATGCGTg > 1:1846175/1‑150 (MQ=255)
actactGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACTCTCGAAAAACCGGCTGAAATTGACGTAATGCGTg < 1:2524651/150‑1 (MQ=255)
actGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACTCTCGAAAAACCGGCTGAAATTGACGTAATGCGTGATg > 1:1546334/1‑150 (MQ=255)
ctGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACTCTCGAAAAACCGGCTGAAATTGACGTAATGCGTGATGc < 1:1453487/150‑1 (MQ=255)
tGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACTCTCGAAAAACCGGCTGAAATTGACGTAATGCGTGATGCa > 1:2013264/1‑150 (MQ=255)
tGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACTCTCGAAAAACCGGCTGAAATTGACGTAATGCGTGATGCa < 1:190083/150‑1 (MQ=255)
cGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACTCTCGAAAAACCGGCTGAAATTGACGTAATGCGTGATGCATTGCaaaa > 1:2247211/1‑150 (MQ=255)
cGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACTCTCGAAAAACCGGCTGAAATTGACGTAATGCGTGATGCATTGCaaaa > 2:3719448/1‑150 (MQ=255)
gCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACTCTCGAAAAACCGGCTGAAATTGACGTAATGCGTGATGCATTGCAAAAAg < 1:181393/150‑1 (MQ=255)
aTCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACTCTCGAAAAACCGGCTGAAATTGACGTAATGCGTGATGCATTGCAAAAAGcc > 1:1648154/1‑150 (MQ=255)
aTCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACTCTCGAAAAACCGGCTGAAATTGACGTAATGCGTGATGCATTGCAAAAAGcc > 1:4730980/1‑150 (MQ=255)
aTCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACTCTCGAAAAACCGGCTGAAATTGACGTAATGCGTGATGCATTGCAAAAAGcc < 2:438068/150‑1 (MQ=255)
tctcTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACTCTCGAAAAACCGGCTGAAATTGACGTAATGCGTGATGCATTGCAAAAAGCCg < 2:3872211/150‑1 (MQ=255)
ctctGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACTCTCGAAAAACCGGCTGAAATTGACGTAATGCGTGATGCATTGCAAAAAGCCgg < 1:968004/150‑1 (MQ=255)
ctctGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACTCTCGAAAAACCGGCTGAAATTGACGTAATGCGTGATGCATTGCAAAAAGCCgg < 1:3548263/150‑1 (MQ=255)
tctGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACTCTCGAAAAACCGGCTGAAATTGACGTAATGCGTGATGCATTGCAAAAAGCCGGt < 1:879551/150‑1 (MQ=255)
tctGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACTCTCGAAAAACCGGCTGAAATTGACGTAATGCGTGATGCATTGCAAAAAGCCGGt > 2:4285759/1‑150 (MQ=255)
tctGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACTCTCGAAAAACCGGCAGAAAATGACGTAATGCGTGATGCATTGCAAAAAGACGGt > 2:2774864/1‑150 (MQ=255)
ctGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACTCTCGAAAAACCGGCTGAAATTGACGTAATGCGTGATGCATTGCAAAAAGCCGGtt < 1:670124/150‑1 (MQ=255)
ctGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACTCTCGAAAAACCGGCTGAAATTGACGTAATGCGTGATGCATTGCAAAAAGCCGGtt > 1:4637704/1‑150 (MQ=255)
tGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACTCTCGAAAAACCGGCTGAAATTGACGTAATGCGTGATGCATTGCAAAAAGCCGGttt > 2:3150451/1‑150 (MQ=255)
ggTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACTCTCGAAAAACCGGCTGAAATTGACGTAATGCGTGATGCATTGCAAAAAGCCGGtttt > 1:1052012/1‑150 (MQ=255)
tgctgTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACGCTCGAAAAACCGGCTGAAATTGACGTAATGCGTGATGCATTGCAAAAAGCCGGTTTTGAag > 1:3703572/1‑150 (MQ=255)
ctgTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACTCTCGAAAAACCGGCTGAAATTGACGTAATGCGTGATGCATTGCAAAAAGCCGGTTTTGAagag > 2:3706419/1‑150 (MQ=255)
ctgTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACTCTCGAAAAACCGGCTGAAATTGACGTAATGCGTGATGCATTGCAAAAAGCCGGTTTTGAagag < 2:299821/150‑1 (MQ=255)
tgTTAATCGCTGCTATCGGTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACTCTCGAAAAACCGGCTGAAATTGACGTAATGCGTGATGCATTGCAAAAAGCCGGTTTTGAAGAGc > 2:2724302/1‑150 (MQ=255)
aaTCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACTCTCGAAAAACCGGCTGAAATTGACGTAATGCGTGATGCATTGCAAAAAGCCGGTTTTGAAGAGCCGAt < 1:1531273/150‑1 (MQ=255)
cGCTGCTATCGTTATTATGGGAGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACTCTCGAAAAACCGGCTGAAATTGACGTAATGCGTGATGCATTGCAAAAAGCCGGTTTTGAAGAGCCGAtgct < 1:1692244/150‑1 (MQ=255)
gctgctATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACTCTCGAAAAACCGGCTGAAATTGACGTAATGCGTGATGCATTGCAAAAAGCCGGTTTTGAAGAGCCGAtgctg > 1:1117265/1‑150 (MQ=255)
ctgctATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACTCTCGAAAAACCGGCTGAAATTGACGTAATGCGTGATGCATTGCAAAAAGCCGGTTTTGAAGAGCCGAtgctgc > 2:4972656/1‑150 (MQ=255)
tgctATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACTCTCGAAAAACCGGCTGAAATTGACGTAATGCGTGATGCATTGCAAAAAGCCGGTTTTGAAGAGCCGATGCTGCa > 2:2125304/1‑150 (MQ=255)
tATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACTCTCGAAAAACCGGCTGAAATTGACGTAATGCGTGATGCATTGCAAAAAGCCGGTTTTGAAGAGCCGATGCTGCaaaa > 2:2020885/1‑150 (MQ=255)
attatGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACTCTCGAAAAACCGGCTGAAATTGACGTAATGCGTGATGCATTGCAAAAAGCCGGTTTTGAAGAGCCGATGCTGCAAAACTTTGGt < 1:4542139/150‑1 (MQ=255)
attatGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACTCTCGAAAAACCGGCTGAAATTGACGTAATGCGTGATGCATTGCAAAAAGCCGGTTTTGAAGAGCCGATGCTGCAAAACTTTGGt < 2:2740144/150‑1 (MQ=255)
ttatGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACTCTCGAAAAACCGGCTGAAATTGACGTAATGCGTGATGCATTGCAAAAAGCCGGTTTTGAAGAGCCGATGCTGCAAAACTTTGGTa > 1:598180/1‑150 (MQ=255)
tGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACTCTCGAAAAACCGGCTGAAATTGACGTAATGCGTGATGCATTGCAAAAAGCCGGTTTTGAAGAGCCGATGCTGCAAAACTTTGGTagca > 2:3898260/1‑150 (MQ=255)
gggCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACTCTCGAAAAACCGGCTGAAATTGACGTAATGCGTGATGCATTGCAAAAAGCCGGTTTTGAAGAGCCGATGCTGCAAAACTTTGGTagcag < 1:2821670/150‑1 (MQ=255)
cGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACTCTCGAAAAACCGGCTGAAATTGACGTAATGCGTGATGCATTGCAAAAAGCCGGTTTTGAAGAGCCGATGCTGCAAAACTTTGGTAGCAGCCa > 2:3009183/1‑150 (MQ=255)
gTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACTCTCGAAAAACCGGCTGAAATTGACGTAATGCGTGATGCATTGCAAAAAGCCGGTTTTGAAGAGCCGATGCTGCAAAACTTTGGTAGCAGCCAt < 2:4775865/150‑1 (MQ=255)
tGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACTCTCGAAAAACAGGCTGAAATTGACGTAATGCGTGATGCATTGCAAAAAGCCGGTTTTGAAGAGCCGATGCTGCAAAACTTTGTTAGCAGCCATg > 2:670344/1‑150 (MQ=255)
cgGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACTCTCGAAAAACCGGCTGAAATTGACGTAATGCGTGATGCATTGCAAAAAGCCGGTTTTGAAGAGCCGATGCTGCAAAACTTTGGTAGCAGCCATGAcat > 2:1422470/1‑150 (MQ=255)
gCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACTCTCGAAAAACCGGCTGAAATTGACGTAATGCGTGATGCATTGCAAAAAGCCGGTTTTGAAGAGCCGATGCTGCAAAACTTTGGTAGCAGCCATGAcatca < 2:4862613/150‑1 (MQ=255)
cTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACTCTCGAAAAACCGGCTGAAATTGACGTAATGCGTGATGCATTGCAAAAAGCCGGTTTTGAAGAGCCGATGCTGCAAAACTTTGGTAGCAGCCATGAcatcat < 2:5050924/150‑1 (MQ=255)
cTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACTCTCGAAAAACCGGCTGAAATTGACGTAATGCGTGATGCATTGCAAAAAGCCGGTTTTGAAGAGCCGATGCTGCAAAACTTTGGTAGCAGCCATGAcatcat > 1:3373179/1‑150 (MQ=255)
ttAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACTCTCGAAAAACCGGCTGAAATTGACGTAATGCGTGATGCATTGCAAAAAGCCGGTTTTGAAGAGCCGATGCTGCAAAACTTTGGTAGCAGCCATGACATCATgg < 2:1846159/150‑1 (MQ=255)
tAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACTCTCGAAAAACCGGCTGAAATTGACGTAATGCGTGATGCATTGCAAAAAGCCGGTTTTGAAGAGCCGATGCTGCAAAACTTTGGTAGCAGCCATGACATCATGGt < 1:3820054/150‑1 (MQ=255)
cTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACTCTCGAAAAACCGGCTGAAATTGACGTAATGCGTGATGCATTGCAAAAAGCCGGTTTTGAAGAGCCGATGCTGCAAAACTTTGGTAGCAGCCATGACATCATGGTCCg > 1:79129/1‑150 (MQ=255)
cTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACTCTCGAAAAACCGGCTGAAATTGACGTAATGCGTGATGCATTGCAAAAAGCCGGTTTTGAAGAGCCGATGCTGCAAAACTTTGGTAGCAGCCATGACATCATGGTCCg > 1:2352415/1‑150 (MQ=255)
cTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACTCTCGAAAAACCGGCTGAAATTGACGTAATGCGTGATGCATTGCAAAAAGCCGGTTTTGAAGAGCCGATGCTGCAAAACTTTGGTAGCAGCCATGACATCATGGTCCg < 2:2261978/150‑1 (MQ=255)
tGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACTCTCGAAAAACCGGCTGAAATTGACGTAATGCGTGATGCATTGCAAAAAGCCGGTTTTGAAGAGCCGATGCTGCAAAACTTTGGTAGCAGCCATGACATCATGGTCCGt < 1:1217235/150‑1 (MQ=255)
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cTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACTCTCGAAAAACCGGCTGAAATTGACGTAATGCGTGATGCATTGCAAAAAGCCGGTTTTGAAGAGCCGATGCTGCAAAACTTTGGTAGCAGCCATGACATCATGGTCCGTATgccg > 2:1642506/1‑150 (MQ=255)
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ATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACTCTCGAAAAACCGGCTGAAATTGACGTAATGCGTGATGCATTGCAAAAAGCCGGTTTTGAAGAGCCGATGCTGCAAAACTTTGGT < SRR19973063.4556701/150‑1 (MQ=60)
TTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACTCTCGAAAAACCGGCTGAAATTGACGTAATGCGTGATGCATTGCAAAAAGCCGGTTTTGAAGAGCCGATGCTGCAAAACTTTGGTA > SRR19973063.599942/1‑150 (MQ=60)
TATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACTCTCGAAAAACCGGCTGAAATTGACGTAATGCGTGATGCATTGCAAAAAGCCGGTTTTGAAGAGCCGATGCTGCAAAACTTTGGTAG > SRR19973063.1743683/1‑150 (MQ=60)
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TACTCTCGAAAAACCGGCTGAAATTGACGTAATGCGTGATGCATTGCAAAAAGCCGGTTTTGAAGAGCCGATGCTGCAAAACTTTGGTAGCAGCCATGACATCATGGTCCGTATGCCGCCTGCTGAAGGCGAAACCGGCGGTCAGGTGTT < SRR19973063.2615642/150‑1 (MQ=60)
ACTCTCGAAAAACCGGCTGAAATTGACGTAATGCGTGATGCATTGCAAAAAGCCGGTTTTGAAGAGCCGATGCTGCAAAACTTTGGTAGCAGCCATGACATCATGGTCCGTATGCCGCCTGCTGAAGGCGAAACCGGCGGTCAGGTGTTG > SRR19973063.2291064/1‑150 (MQ=60)
CTCTCGAAAAACCGGCTGAAATTGACGTAATGCGTGATGCATTGCAAAAAGCCGGTTTTGAAGAGCCGATGCTGCAAAACTTTGGTAGCAGCCATGACATCATGGTCCGTATGCCGCCTGCTGAAGGCGAAACCGGCGGTCAGGTGTTGG < SRR19973063.4223997/150‑1 (MQ=60)
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CACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACGCTCGAAAAACCGGCTGAAATTGACGTAATGCGTGATGCATTGCAAAAAGCCGGTTTTGAAGAGCCGATGCTGCAAAACTTTGGTAGCAGCCATGACATCATGGTCCGTATGCCGCCTGCTGAAGGCGAAACCGGCGGTCAGGTGTTGG > CP009273/424994‑425291
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
