Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F488 I0 R1
|
1275 |
300.1 |
10328444 |
91.0% |
9398884 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
3,186,181 |
G→C |
79.9% |
W205C (TGG→TGC) |
yqiJ → |
DUF1449 family inner membrane protein |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 3,186,181 | 0 | G | C | 79.9%
| 590.3
/ 153.3
| 214 | W205C (TGG→TGC) | yqiJ | DUF1449 family inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (18/25); new base C (95/76); total (113/101) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.25e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.18e-01 |
Only 100 of 214 total aligned reads displayed.
GCGAAGGAAAACTCACCGATCAATTTGGCCAAATACATTATTTACTACTGGAGCCTGAAGAAGGAAAAATTTTCACTAAAGGAGACAAAGTGTTAATTATTTGCCGACTTTCTGCAACGCGATATTTGGCGGAAAATAATCCCTGGCCCCAAATATTGTAATTTATTAATCAAAAGGAAATTTAATAATGGATGATATTGTTAATTCTGTGCCCTCCTGGATGTTTACCGCAATTATTGCCGTATGCATTCTGTTTATTATTGGAATTATTTTCGCCAGGCTCTATCGTCGCG > CP009273/3186036‑3186328
|
gCGAAGGAAAACTCACCGATCAATTTGGCCAAATACATTATTTACTACTGGAGCCTGAAGAAGGAAAAATTTTCACTAAAGGAGACAAAGTGTTAATTATTTGCCGACTTTCTGCAACGCGATATTTGGCGGAAAATAATCCCTGCcccc > 2:164053/1‑150 (MQ=255)
cgaacgaaCACTCACCGATCACTATGTCCAAATACATTATGCACGACGGGAGCCTGAAGAAGGAAAAATTTTCACTAAAGGAGACAAAGTGTTAATTATTTGCCGACTTTCTGCAACGCGATATTTGGCGGAAAATAATCCCTGCCCCCa < 2:2949021/150‑1 (MQ=255)
cGAAGGAAAACTCACCGATCAATTTGGCCAAATACATTATTTACTACTGGAGCCTGAAGAAGGAAAAATTTTCACTAAAGGAGACAAAGTGTTAATTATTTGCCGACTTTCTGCAACGCGATATTTGGCGGAAAATAATCCCTGCCCCCa > 1:4797464/1‑150 (MQ=255)
cGAAGGAAAACTCACCGATCAATTTGGCCAAATACATTATTTACTACTGGAGCCTGAAGAAGGAAAAATTTTCACTAAAGGAGACAAAGTGTTAATTATTTGCCGACTTTCTGCAACGCGATATTTGGCGGAAAATAATCCCTGCCCCCa < 1:298804/150‑1 (MQ=255)
gAAGGAAAACTCACCGATCAATTTGGCCAAATACATTATTTACTACTGGAGCCTGAAGAAGGAAAAATTTTCACTAAAGGAGACAAAGTGTTAATTATTTGCCGACTTTCTGCAACGCGATATTTGGCGGAAAATAATCCCTGGCCCCaa > 1:2206209/1‑150 (MQ=255)
gAAGGAAAACTCACCGATCAATTTGGCCAAATACATTATTTACTACTGGAGCCTGAAGAAGGAAAAATTTTCACTAAAGGAGACAAAGTGTTAATTATTTGCCGACTTTCTGCAACGCGATATTTGGCGGAAAATAATCCCTGCCCCCaa > 1:342821/1‑150 (MQ=255)
gAAGGAAAACTCACCGATCAATTTGGCCAAATACATTATTTACTACTGGAGCCTGAAGAAGGAAAAATTTTCACTAAAGGAGACAAAGTGTTAATTATTTGCCGACTTTCTGCAACGCGATATTTGGCGGAAAATAATCACTGCCCCCaa > 1:487089/1‑150 (MQ=255)
aaaaCTCACCGATCAATTTGGCCAAATACATTATTTACTACTGGAGCCTGAAGAAGGAAAAATTTTCACTAAAGGAGACAAAGTGTTAATTATTTGCCGACTTTCTGCAACGCGATATTTGGCGGAAAATAATCCCTGCCCCCAAATAtt > 1:2995114/1‑150 (MQ=255)
aCTCACCGATCAATTTGGCCAAATACATTATTTACTACTGGAGCCTGAAGAAGGAAAAATTTTCACTAAAGGGGACAAAGTGTTAATTATTTGCCGACTTTCTGCAACGCGATATTTGGCGGAAAATAATCCCTGCCCCCAAATATTGTa > 1:91995/1‑150 (MQ=255)
aCTCACCGATCAATTTGGCCAAATACATTATTTACTACTGGAGCCTGAAGAAGGAAAAATTTTCACTAAAGGAGACAAAGTGTTAATTATTTGCCGACTTTCTGCAACGCGATATTTGGCGGAAAATAATCCCTGGCCCCAAATATTGTa > 2:4906083/1‑150 (MQ=255)
cTCACCGATCAATTTGGCCAAATACATTATTTACTACTGGAGCCTGAAGAAGGAAAAATTTTCACTAAAGGAGACAAAGTGTTAATTATTTGCCGACTTTCTGCAACGCGATATTTGGCGGAAAATAATCCCTGCCCCCAAATATTGTaa < 1:1131941/150‑1 (MQ=255)
aTCAATTTGGCCAAATACATTATTTACTACTGGAGCCTGAAGAAGGAAAAATTTTCACTAAAGGAGACAAAGTGTTAATTATTTGCCGACTTTCTGCAACGCGATATTTGGCGGAAAATAATCCCTGCCCCCAAATATTGTAATttatta > 2:2545063/1‑150 (MQ=255)
cAATTTGGCCAAATACATTATTTACTACTGGAGCCTGAAGAAGGAAAAATTTTCACTAAAGGAGACAAAGTGTTAATTATTTGCCGACTTTCTGCAACGCGATATTTGGCGGAAAATAATCCCTGCCCCCAAATATTGTAATTTATTAAt > 1:4026129/1‑150 (MQ=255)
aaTTTGGCCAAATACATTATTTACTACTGGAGCCTGAAGAAGGAAAAATTTTCACTAAAGGAGACAAAGTGTTAATTATTTGCCGACTTTCTGCAACGCGATATTTGGCGGAAAATAATCCCTGCCCCCAAATATTGTAATTTATTAATc > 2:2472498/1‑150 (MQ=255)
aTTTGGCCAAATACATTATTTACTACTGGAGCCTGAAGAAGGAAAAATTTTCACTAAAGGAGACAAAGTGTTAATTATTTGCCGACTTTCTGCAACGCGATATTTGGCGGAAAATAATCCCTGCCCCCAAATATTGTAATTTATTAATCa > 1:3323482/1‑150 (MQ=255)
tGGCCAAATACATTATTTACTACTGGAGCCTGAAGAAGGAAAAATTTTCACTAAAGGAGACAAAGTGTTAATTATTTGCCGACTTTCTGCAACGCGATATTTGGCGGAAAATAATCCCTGCCCCCAAATATTGTAATTTATTAATCaaaa > 1:964241/1‑150 (MQ=255)
ggCCAAATACATTATTTACTACTGGAGCCTGAAGAAGGAAAAATTTTCACTAAAGGAGACAAAGTGTTAATTATTTGCCGACTTTCTGCAACGCGATATTTGGCGGAAAATAATCCCTGCCCCCAAATATTGTAATTTATTAATCAAAAg < 1:1179983/150‑1 (MQ=255)
ccAAATACATTATTTACTACTGGAGCCTGAAGAAGGAAAAATTTTCACTAAAGGAGACAAAGTGTTAATTATTTGCCGACTTTCTGCAACGCGATATTTGGCGGAAAATAATCCCTGCCCCCAAATATTGTAATTTATTAATCAAAAGGa < 2:2787910/150‑1 (MQ=255)
cATTATTTACTACTGGAGCCTGAAGAAGGAAAAATTTTCACTAAAGGAGACAAAGTGTTAATTATGTGCCGACTTTCTGCAACGCGATATTTGGCGGAAAATAATCCCTGCCCCCAAATATTGTAATTTATTAATCAAAAGGAAATTtaa < 2:1870143/150‑1 (MQ=255)
tattTACTACTGGAGCCTGAAGAAGGAAAAATTTTCACTAAAGGAGACAAAGTGTTAATTATTTGCCGACTTTCTGCAACGCGATATTTGGCGGAAAATAATCCCTGCCCCCAAATATTGTAATTTATTAATCAAAAGGAAATTtaataa > 1:1799081/1‑150 (MQ=255)
attTACTACTGGAGCCTGAAGAAGGAAAAATTTTCACTAAAGGAGACAAAGTGTTAATTATTTGCCGACTTTCTGCAACGCGATATTTGGCGGAAAATAATCCCTGCCCCCAAATATTGTAATTTATTAATCAAAAGGAAATTTaataat > 2:543669/1‑150 (MQ=255)
attTACTACTGGAGCCTGAAGAAGGAAAAATTTTCACTAAAGGAGACAAAGTGTTAATTATTTGCCGACTTTCTGCAACGCGATATTTGGCGGAAAATAATCCCTGCCCCCAAATATTGTAATTTATTAATCAAAAGGAAATTTaataat > 2:1646740/1‑150 (MQ=255)
tttACTACTGGAGCCTGAAGAAGGAAAAATTTTCACTAAAGGAGACAAAGTGTTAATTATTTTCCGACTATCTGCAACGCGATATTTGGCGGAAAATAATCCCTGCCCCCAAATATAGTAATTTATTAATCAAAAGGAAATATAATAATg > 2:3620916/1‑150 (MQ=255)
tttACTACTGGAGCCTGAAGAAGGAAAAATTTTCACTAAAGGAGACAAAGTGTTAATTATTTGCCGACTTTCTGCAACGCGATATTTGGCGGAAAATAATCCCTGGCCCCAAATATTGTAATTTATTAATCAAAAGGAAATTTAATAATg > 2:2393724/1‑150 (MQ=255)
tttACTACTGGAGCCTGAAGAAGGAAAAATTTTCACTAAAGGAGACAAAGTGTTAATTATTTGCCGACTTTCTGCAACGCGATATTTGGCGGAAAATAATCCCTGCCCCCAAATATTGTAATTTATTAATCAAAAGGAAATTTAATAATg > 2:4666449/1‑150 (MQ=255)
tactacTGGAGCCTGAAGAAGGAAAAATTTTCACTAAAGGAGACAAAGTGTTAATTATTTGCCGACTTTCTGCAACGCGATATTTGGCGGAAAATAATCCCTGGCCCCAAATATTGTAATTTATTAATCAAAAGGAAATTTAATAATGga < 1:3896659/150‑1 (MQ=255)
ctGGAGCCTGAAGAAGGAAAAATTTTCACTAAAGGAGACAAAGTGTTAATTATTTGCCGACTTTCTGCAACGCGATATTTGGCGGAAAATAATCCCTGGCCCCAAATATTGTAATTTATTAATCAAAAGGAAATTTAATAATGGATGata > 2:5061770/1‑150 (MQ=255)
ctGGAGCCTGAAGAAGGAAAAATTTTCACTAAAGGAGACAAAGTGTTAATTATTTGCCGACTTTCTGCAACGCGATATTTGGCGGAAAATAATCCCTGCCCCCAAATATTGTAATTTATTAATCAAAAGGAAATTTAATAATGGATGata > 1:2262694/1‑150 (MQ=255)
ggAGCCTGAAGAAGGAAAAATTTTCACTAAAGGAGACAAAGTGTTAATTATTTGCCGACTTTCTGCAACGCGATATTTGGCGGAAAATAATCCCTGCCCCCAAATATTGTAATTTATTAATCAAAAGGAAATTTAATAATGGATGATAtt < 1:183953/150‑1 (MQ=255)
gAGCCTGAAGAAGGAAAAATTTTCACTAAAGGAGACAAAGTGTTAATTATTTGCCGACTTTCTGCAACGCGATATTTGGCGGAAAATAATCCCTGCCCCCAAATATTGTAATTTATTAATCAAAAGGAAATTTAATAATGGATGATATTg < 2:1469875/150‑1 (MQ=255)
gCCTGAAGAAGGAAAAATTTTCACTAAAGGAGACAAAGTGTTAATTATTTGCCGACTTTCTGCAACGCGATATTTGGCGGAAAATAATCCCTGCCCCCAAATATTGTAATTTATTAATCAAAAGGAAATTTAATAATGGATGATATTGtt < 2:3610436/150‑1 (MQ=255)
ccTGAAGAAGGAAAAATTTTCACTAAAGGAGACAAAGTGTTAATTATTTGCCGACTTTCTGCAACGCGATATTTGGCGGAAAATAATCCCTGCCCCCAAATATTGTAATTTATTAATCAAAAGGAAATTTAATAATGGATGATATTGTTa > 1:470555/1‑150 (MQ=255)
cTGAAGAAGGAAAAATTTTCACTAAAGGAGACAAAGTGTTAATTATTTGCCGACTTTCTGCAACGCGATATTTGGCGGAAAATAATCCCTGGCCCCAAATATTGTAATTTATTAATCAAAAGGAAATTTAATAATGGATGATATTGTTaa > 1:3622508/1‑150 (MQ=255)
cTGAAGAAGGAAAAATTTTCACTAAAGGAGACAAAGTGTTAATTATTTGCCGACTTTCTGCAACGCGATATTTGGCGGAAAATAATCCCTGCCCCCAAATATTGTAATTTATTAATCAAAAGGAAATTTAATAATGGATGATATTGTTaa > 2:2505480/1‑150 (MQ=255)
tGAAGAAGGAAAAATTTTCACTAAAGGAGACAAAGTGTTAATTATTTGCCGACTTTCTGCAACGCGATATTTGGCGGAAAATAATCCCTGCCCCCAAATATTGTAATTTATTAATCAAAAGGAAATTTAATAATGGATGATATTGTTAAt > 1:4044405/1‑150 (MQ=255)
aagaagGAAAAATTTTCACTAAAGGAGACAAAGTGTTAATTATTTGCCGACTTTCTGCAACGCGATATTTGGCGGAAAATAATCCCTGCCCCCAAATATTGTAATTTATTAATCAAAAGGAAATTTAATAATGGATGATATTGTTAATTc > 2:2127785/1‑150 (MQ=255)
agaagGAAAAATTTTCACTAAAGGAGACAAAGTGTTAATTATTTGCCGACTTTCTGCAACGCGATATTTGGCGGAAAATAATCCCTGCCCCCAAATATTGTAATTTATTAATCAAAAGGAAATTTAATAATGGATGATATTGTTAATTCt > 2:2226146/1‑150 (MQ=255)
agaagGAAAAATTTTCACTAAAGGAGACAAAGTGTTAATTATTTGCCGACTTTCTGCAACGCGATATTTGGCGGAAAATAATCCCTGCCCCCAAATATTGTAATTTATTAATCAAAAGGAAATTTAATAATGGATGATATTGTTAATTCt > 1:252061/1‑150 (MQ=255)
aagGAAAAATTTTCACTAAAGGAGACAAAGTGTTAATTATTTGCCGACTTTCTGCAACGCGATATTTGGCGGAAAATAATCCCTGGCCCCAAATATTGTAATTTATTAATCAAAAGGAAATTTAATAATGGATGAGATTGTTAATTCtgt > 2:3940092/1‑150 (MQ=255)
aagGAAAAATTTTCACTAAAGGAGACAAAGTGTTAATTATTTGCCGACTTTCTGCAACGCGATATTTGGCGGAAAATAATCCCTGCCCCCAAATATTGTAATTTATTAATCAAAAGGAAATTTAATAATGGATGATATTGTTAATTCtgt < 2:3155669/150‑1 (MQ=255)
aagGAAAAATTTTCACTAAAGGAGACAAAGTGTTAATTATTTGCCGACTTTCTGCAACGCGATATTTGGCGGAAAATAATCCCTGCCCCCAAATATTGTAATTTATTAATCAAAAGGAAATTTAATAATGGATGATATTGTTAATTCtgt < 2:1064798/150‑1 (MQ=255)
agGAAAAATTTTCACTAAAGGAGACAAAGTGTTAATTATTTGCCGACTTTCTGCAACGCGATATTTGGCGGAAAATAATCCCTGCCCCCAAATATTGTAATTTATTAATCAAAAGGAAATTTAATAATGGATGATATTGTTAATTCtgtg > 2:2521636/1‑150 (MQ=255)
aaaaTTTTCACTAAAGGAGACAAAGTGTTAATTATTTGCCGACTTTCTGCAACGCGATATTTGGCGGAAAATAATCCCTGCCCCCAAATATTGTAATTTATTAATCAAAAGGAAATTTAATAATGGATGATATTGTTAATTCTGTGccca < 1:4288928/150‑2 (MQ=255)
aaaaTTTTCACTAAAGGAGACAAAGTGTTAATTATTTGCCGACTTTCTGCAACGCGATATTTGGCGGAAAATAATCCCTGCCCCCAAATATTGTAATTTATTAATCAAAAGGAAATTTAATAATGGATGATATTGTTAATTCTGTGCcct < 2:320085/150‑1 (MQ=255)
ttttCACTAAAGGAGACAAAGTGTTAATTATTTGCCGACTTTCTGCAACGCGATATTTGGCGGAAAATAATCCCTGCCCCCAAATATTGTAATTTATTAATCAAAAGGAAATTTAATAATGGATGATATTGTTAATTCTGTGCCCTCCTg < 1:2381467/150‑1 (MQ=255)
cACTAAAGGAGACAAAGTGTTAATTATTTGCCGACTTTCTGCAACGCGATATTTGGCGGAAAATAATCCCTGCCCCCAAATATTGTAATTTATTAATCAAAAGGAAATTTAATAATGGATGATATTGTTAATTCTGTGCCCTCCTGGATg > 2:3358955/1‑150 (MQ=255)
cTAAAGGAGACAAAGTGTTAATTATTTGCCGACTTTCTGCAACGCGATATTTGGCGGAAAATAATCCCTGCCCCCAAATAATCTAATTTATTAATCAAAATGAAATTTAATAATGGATGATATTGTTAATTCTGTGCCCTCCTGGATGtt > 2:2826251/1‑150 (MQ=255)
tAAAGGAGACAAAGTGTTAATTATTTGCCGACTTTCTGCAACGCGATATTTGGCGGAAAATAATCCCTGCCCCCAAATATTGTAATTTATTAATCAAAAGGAAATTTAATAATGGATGATATTGTTAATTCTGTGCCCTCCTGGATGttt > 2:3540164/1‑150 (MQ=255)
aaaGGAGACAAAGTGTTAATTATTTGCCGACTTTCTGCAACGCGATATTTGGCGGAAAATAATCCCTGGCCCCAAATATTGTAATTTATTAATCAAAAGGAAATTTAATAATGGATGATATTGTTAATTCTGTGCCCTCCTGGATGTTTa > 1:4980395/1‑150 (MQ=255)
aGGAGACAAAGTGTTAATTATTTGCCGACTTTCTGCAACGCGATATTTGGCGGAAAATAATCCCTGCCCCCAAATATTGTAATTTATTAATCAAAAGGAAATTTAATAATGGATGATATTGTTAATTCTGTGCCCTCCTGGATGTTTAcc > 1:4444505/1‑150 (MQ=255)
ggAGACAAAGTGTTAATTATTTGCCGACTTTCTGCAACGCGATATTTGGCGGAAAATAATCCCTGGCCCCAAATATTGTAATTTATTAATCAAAAGGAAATTTAATAATGGATGATATTGTTAATTCTGTGCCCTCCTGGATGTTTACCg < 1:1015074/150‑1 (MQ=255)
ggAGACAAAGTGTTAATTATTTGCCGACTTTCTGCAACGCGATATTTGGCGGAAAATAATCCCTGCCCCCAAATATTGTAATTTATTAATCAAAAGGAAATTTAATAATGTATGATATTGTTAATTCTGTGCCCTCCTGGATGTTTACCg < 2:1794214/150‑1 (MQ=255)
agaCAAAGTGTTAATTATTTGCCGACTTTCTGCAACGCGATATTTGGCGGAAAATAATCCCTGCCCCCAAATATTGTAATTTATTAATCAAAAGGAAATTTAATAATGGATGATATTGTTAATTCTGTGCCCTCCTGGATGTTTACCGCa > 1:4122664/1‑150 (MQ=255)
aaaGTGTTAATTATTTGCCGACTTTCTGCAACGCGATATTTGGCGGAAAATAATCCCTGCCCCCAAATATTGTAATTTATTAATCAAAAGGAAATTTAATAATGGATGATATTGTTAATTCTGTGCCCTCCTGGATGTTTACCGCAatta > 1:3167190/1‑150 (MQ=255)
aaGTGTTAATTATTTGCCGACTTTCTGCAACGCGATATTTGGCGGAAAATAATCCCTGCCCCCAAATATTGTAATTTATTAATCAAAAGGAAATTTAATAATGGATGATATTGTTAATTCTGTGCCCTCCTGGATGTTTACCGCAattat < 2:3538899/150‑1 (MQ=255)
aGTGTTAATTATTTGCCGACTTTCTGCAACGCGATATTTGGCGGAAAATAATCCCTGGCCCCAAATATTGTAATTTATTAATCAAAAGGAAATTTAATAATGGATGATATTGTTAATTCTGTGCCCTCCTGGATGTTTACCGCAattatt < 2:47484/150‑1 (MQ=255)
aGTGTTAATTATTTGCCGACTTTCTGCAACGCGATATTTGGCGGAAAATAATCCCTGGCCCCAAATATTGTAATTTATTAATCAAAAGGAAATTTAATAATGGATGATATTGTTAATTCTGTGCCCTCCTGGATGTTTACCGCAattatt < 1:4908668/150‑1 (MQ=255)
gtgtTAATTATTTGCCGACTTTCTGCAACGCGATATTTGGCGGAAAATAATCCCTGCCCCCAAATATTGTAATTTATTAATCAAAAGGAAATTTAATAATGGATGATATTGTTAATTCTGTGCCCTCCTGGATGTTTACCGCAATTATTg < 2:40998/150‑1 (MQ=255)
gtTAATTATTTGCCGACTTTCTGCAACGCGATATTTGGCGGAAAATAATCCCTGCCCCCAAATATTGTAATTTATTAATCAAAAGGAAATTTAATAATGGATGATATTGTTAATTCTGTGCCCTCCTGGATGTTTACCGCAATTATTGcc < 2:2383112/150‑1 (MQ=255)
ttAATTATTTGCCGACTTTCTGCAACGCGATATTTGGCGGAAAATAATCCCTGCCCCCAAATATTGTAATTTATTAATCAAAAGGAAATTTAATAATGGATGATATTGTTAATTCTGTGCCCTCCTGGATGTTTACCGCAATTATTGCCg > 2:4165972/1‑150 (MQ=255)
ttAATTATTTGCCGACTTTCTGCAACGCGATATTTGGCGGAAAATAATCCCTGCCCCCAAATATTGTAATTTATTAATCAAAAGGAAATTTAATAATGGATGATATTGTTAATTCTGTGCCCTCCTGGATGTTTACCGCAATTATTGCCg < 2:2649983/150‑1 (MQ=255)
aaTTATTTGCCGACTTTCTGCAACGCGATATTTGGCGGAAAATAATCCCTGGCCCCAAATATTGTAATTTATTAATCAAAAGGAAATTTAATAATGGATGATATTGTTAATTCTGTGCCCTCCTGGATGTTTACCGCAATTATTGCCGTa < 2:2172452/150‑1 (MQ=255)
aaTTATTTGCCGACTTTCTGCAACGCGATATTTGGCGGAAAATAATCCCTGCCCCCAAATATTGTAATTTATTAATCAAAAGGAAATTTAATAATGGATGATATTGTTAATTCTGTGCCCTCCTGGATGTTTACCGCAATTATTGCCGTa < 2:2291218/150‑1 (MQ=255)
aaTTATTTGCCGACTTTCTGCAACGCGATATTTGGCGGAAAATAATCCCTGCCCCCAAATATTGTAATTTATTAATCAAAAGGAAATTTAATAATGGATGATATTGTTAATTCTGTGCCCTCCTGGATGTTTACCGCAATTATTGCCGTa > 1:3949535/1‑150 (MQ=255)
aaTTATTTGCCGACTTTCTGCAACGCGATATTTGGCGGAAAATAATCCCTGCCCCCAAATATTGTAATTTATTAATCAAAAGGAAATTTAATAATGGATGATATTGTTAATTCTGTGCCCTCCTGGATGTTTACCGCAATTATTGCCGTa < 2:4393790/150‑1 (MQ=255)
aaTTATTTGCCGACTTTCTGCAACGCGATATTTGGCGGAAAATAATCCCTGCCCCCAAATATTGTAATTTATTAATCAAAAGGAAATTTAATAATGGATGATATTGTTAATTCTGTGCCCTCCTGGATGTTTACCGCAATTATTGCCGTa > 1:1897776/1‑150 (MQ=255)
tGCCGACTTTCTGCAACGCGATATTTGGCGGAAAATAATCCCTGGCCCCAAATATTGTAATTTATTAATCAAAAGGAAATTTAATAATGGATGATATTGTTAATTCTGTGCCCTCCTGGATGTTTACCGCAATTATTGCCGTATGCATTc > 1:910272/1‑150 (MQ=255)
cGACTTTCTGCAACGCGATATTTGGCGGAAAATAATCCCTGCCCCCAAATATTGTAATTTATTAATCAAAAGGAAATTTAATAATGGATGATATTGTTAATTCTGTGCCCTCCTGGATGTTTACCGCAATTATTGCCGTATGCATTCTGt > 2:3731034/1‑150 (MQ=255)
cGACTTTCTGCAACGCGATATTTGGCGGAAAATAATCCCTGCCCCCAAATATTGTAATTTATTAATCAAAAGGAAATTTAATAATGGATGATATTGTTAATTCTGTGCCCTCCTGGATGTTTACCGCAATTATTGCCGTATGCATTCTGt > 2:3087649/1‑150 (MQ=255)
gACTTTCTGCAACGCGATATTTGTCGGAAAATAATCCCTGCCCCCAAATATTGTAATTTATTAATCAAAAGGAAATTTAATAATGGATGATATTGTTAATTCTGTGCCCTCCGGGCTGTTTACCGCCATTCTTGCCGTATGCATTCTGtt > 2:3397994/1‑150 (MQ=255)
gACTTTCTGCAACGCGATATTTGGCGGAAAATAATCCCTGCCCCCAAATATTGTAATTTATTAATCAAAAGGAAATTTAATAATGGATGATATTGTTAATTCTGTGCCCTCCTGGATGTTTACCGCAATTATTGCCGTATGCATTCTGtt < 2:4132330/150‑1 (MQ=255)
ttCTGCAACGCGATATTTGGCGGAAAATAATCCCTGCCCCCAAATATTGTAATTTATTAATCAAAAGGAAATTTAATAATGGTTGATATTGTTAATTCTGTGCCCTCCTGGATGTTTACCGCAATTATTGCCGTATGCATTCTGTttatt < 1:3758261/150‑1 (MQ=255)
tCTGCAACGCGATATTTGGCGGAAAATAATCCCTGGCCCCAAATATTGTAATTTATTAATCAAAAGGAAATTTAATAATGGATGATATTGTTAATTCTGTGCCCTCCTGGATGTTTACCGCAATTATTGCCGTATGCATTCTGTttatta < 1:3325795/150‑1 (MQ=255)
cTGCAACGCGATATTTGGCGGAAAATAATCCCTGCCCCCAAATATTGTAATTTATTAATCAAAAGGAAATTTAATAATGGATGATATTGTTAATTCTGTGCCCTCCTGGATGTTTACCGCAATTATTGCCGTATGCATTCTGTTtattat > 1:1378168/1‑150 (MQ=255)
tGCAACGCGATATTTGGCGGAAAATAATCCCTGCCCCCAAATATTGTAATTTATTAATCAAAAGGAAATTTAATAATGGATGATATTGTTAATTCTGTGCCCTCCTGGATGTTTACCGCAATTATTGCCGTATGCATTCTGTTTattatt > 1:1473845/1‑150 (MQ=255)
gCAACGCGATATTTGGCGGAAAATAATCCCTGCCCCCAAATATTGTAATTTATTAATCAAAAGGAAATTTAATCATGGATGATATTGTTAATTCTGTGCCCTCCTGGATGTTTACCGCAATTATTGCCGTATGCATTCTGTTTATTATTg > 2:4375204/1‑150 (MQ=255)
aaCGCGATATTTGGCGGAAAATAATCCCTGCCCCCAAATATTGTAATTTATTAATCAAAAGGAAATTTAATAATGGATGATATTGTTAATTCTGTGCCCTCCTGGATGTTTACCGCAATTATTGCCGTATGCATTCTGTTTATTATTGGa > 2:4234178/1‑150 (MQ=255)
cgcgATATTTGGCGGAAAATAATCCCTGGCCCCAAATATTGTAATTTATTAATCAAAAGGAAATTTAATAATGGATGATATTGTTAATTCTGTGCCCTCCTGGATGTTTACCGCAATTATTGCCGTATGCATTCTGTTTATTATTGGAat > 1:1873718/1‑150 (MQ=255)
atatTTGGCGGAAAATAATCCCTGCCCCCAAATATTGTAATTTATTAATCAAAAGGAAATTTAATAATGGATGATATTGTTAATTCTGTGCCCTCCTGGATGTTTACCGCAATTATTGCCGTATGCATTCTGTTTATTATTGGAattatt > 2:3258235/1‑150 (MQ=255)
tatTTGGCGGAAAATAATCCCTGGCCCCAAATATTGTAATTTATTAATCAAAAGGAAATTTAATAATGGATGATATTGTTAATTCTGTGCCCTCCTGGATGTTTACCGCAATTATTGCCGTATGCATTCTGTTTATTATTGGAATTAttt < 2:3100348/150‑1 (MQ=255)
atTTGGCGGAAAATAATCCCTGGCCCCAAATATTGTAATTTATTAATCAAAAGGAAATTTAATAATGGATGATATTGTTAATTCTGTGCCCTCCTGGATGTTTACCGCAATTATTGCCGTATGCATTCTGTTTATTATTGGAATTAtttt < 1:1474178/150‑1 (MQ=255)
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AGACAAAGTGTTAATTATTTGCCGACTTTCTGCAACGCGATATTTGGCGGAAAATAATCCCTGCCCCCAAATATTGTAATTTATTAATCAAAAGGAAATTTAATAATGGATGATATTGTTAATTCTGTGCCCTCCTGGATGTTTACCGCA > SRR19973063.4135861/1‑150 (MQ=60)
AGACAAAGTGTTAATTATTTGCCGACTTTCTGCAACGCGATATTTGGCGGAAAATAATCCCTGCCCCCAAATATTGTAATTTATTAATCAAAAGGAAATTTAATAATGGATGATATTGTTAATTCTGTGCCCTCCTGGATGTTTACCGCA < SRR19973063.4762609/150‑1 (MQ=60)
AAAGTGTTAATTATTTGCCGACTTTCTGCAACGCGATATTTGGCGGAAAATAATCCCTGCCCCCAAATATTGTAATTTATTAATCAAAAGGAAATTTAATAATGGATGATATTGTTAATTCTGTGCCCTCCTGGATGTTTACCGCAATTA > SRR19973063.3177389/1‑150 (MQ=60)
AAGTGTTAATTATTTGCCGACTTTCTGCAACGCGATATTTGGCGGAAAATAATCCCTGCCCCCAAATATTGTAATTTATTAATCAAAAGGAAATTTAATAATGGATGATATTGTTAATTCTGTGCCCTCCTGGATGTTTACCGCAATTAT < SRR19973063.2313276/150‑1 (MQ=60)
AGTGTTAATTATTTGCCGACTTTCTGCAACGCGATATTTGGCGGAAAATAATCCCTGGCCCCAAATATTGTAATTTATTAATCAAAAGGAAATTTAATAATGGATGATATTGTTAATTCTGTGCCCTCCTGGATGTTTACCGCAATTATT < SRR19973063.4924518/150‑1 (MQ=60)
AATTATTTGCCGACTTTCTGCAACGCGATATTTGGCGGAAAATAATCCCTGCCCCCAAATATTGTAATTTATTAATCAAAAGGAAATTTAATAATGGATGATATTGTTAATTCTGTGCCCTCCTGGATGTTTACCGCAATTATTGCCGTA > SRR19973063.3962169/1‑150 (MQ=60)
AATTATTTGCCGACTTTCTGCAACGCGATATTTGGCGGAAAATAATCCCTGCCCCCAAATATTGTAATTTATTAATCAAAAGGAAATTTAATAATGGATGATATTGTTAATTCTGTGCCCTCCTGGATGTTTACCGCAATTATTGCCGTA > SRR19973063.1903714/1‑150 (MQ=60)
ATTTGCCGACTTTCTGCAACGCGATATTTGGCGGAAAATAATCCCTGCCCCCAAATATTGTAATTTATTAATCAAAAGGAAATTTAATAATGGATGATATTGTTAATTCTGTGCCCTCCTGGATGTTTACCGCAATTATTGCCGTATGCA > SRR19973063.4838290/1‑150 (MQ=60)
TGCCGACTTTCTGCAACGCGATATTTGGCGGAAAATAATCCCTGGCCCCAAATATTGTAATTTATTAATCAAAAGGAAATTTAATAATGGATGATATTGTTAATTCTGTGCCCTCCTGGATGTTTACCGCAATTATTGCCGTATGCATTC > SRR19973063.912946/1‑150 (MQ=60)
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TCTGCAACGCGATATTTGGCGGAAAATAATCCCTGGCCCCAAATATTGTAATTTATTAATCAAAAGGAAATTTAATAATGGATGATATTGTTAATTCTGTGCCCTCCTGGATGTTTACCGCAATTATTGCCGTATGCATTCTGTTTATTA < SRR19973063.3336409/150‑1 (MQ=60)
CTGCAACGCGATATTTGGCGGAAAATAATCCCTGCCCCCAAATATTGTAATTTATTAATCAAAAGGAAATTTAATAATGGATGATATTGTTAATTCTGTGCCCTCCTGGATGTTTACCGCAATTATTGCCGTATGCATTCTGTTTATTAT > SRR19973063.1382324/1‑150 (MQ=60)
TGCAACGCGATATTTGGCGGAAAATAATCCCTGCCCCCAAATATTGTAATTTATTAATCAAAAGGAAATTTAATAATGGATGATATTGTTAATTCTGTGCCCTCCTGGATGTTTACCGCAATTATTGCCGTATGCATTCTGTTTATTATT > SRR19973063.1478350/1‑150 (MQ=60)
CAACGCGATATTTGGCGGAAAATAATCCCTGCCCCCAAATATTGTAATTTATTAATCAAAAGGAAATTTAATAATGGATGATATTGTTAATTCTGTGCCCTCCTGGATGTTTACCGCAATTATTGCCGTATGCATTCTGTTTATTATTGG > SRR19973063.3851975/1‑150 (MQ=60)
CGCGATATTTGGCGGAAAATAATCCCTGGCCCCAAATATTGTAATTTATTAATCAAAAGGAAATTTAATAATGGATGATATTGTTAATTCTGTGCCCTCCTGGATGTTTACCGCAATTATTGCCGTATGCATTCTGTTTATTATTGGAAT > SRR19973063.1879576/1‑150 (MQ=60)
GATATTTGGCGGAAAATAATCCCTGCCCCCAAATATTGTAATTTATTAATCAAAAGGAAATTTAATAATGGATGATATTGTTAATTCTGTGCCCTCCTGGATGTTTACCGCAATTATTGCCGTATGCATTCTGTTTATTATTGGAATTAT < SRR19973063.2546088/150‑1 (MQ=60)
ATTTGGCGGAAAATAATCCCTGGCCCCAAATATTGTAATTTATTAATCAAAAGGAAATTTAATAATGGATGATATTGTTAATTCTGTGCCCTCCTGGATGTTTACCGCAATTATTGCCGTATGCATTCTGTTTATTATTGGAATTATTTT < SRR19973063.1478672/150‑1 (MQ=60)
ATTTGGCGGAAAATAATCCCTGGCCCCAAATATTGTAATTTATTAATCAAAAGGAAATTTAATAATGGATGATATTGTTAATTCTGTGCCCTCCTGGATGTTTACCGCAATTATTGCCGTATGCATTCTGTTTATTATTGGAATTATTTT < SRR19973063.1478684/150‑1 (MQ=60)
TTGGCGGAAAATAATCCCTGCCCCCAAATATTGTAATTTATTAATCAAAAGGAAATTTAATAATGGATGATATTGTTAATTCTGTGCCCTCCTGGATGTTTACCGCAATTATTGCCGTATGCATTCTGTTTATTATTGGAATTATTTTCG < SRR19973063.4681334/150‑1 (MQ=60)
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GGCGGAAAATAATCCCTGGCCCCAAATATTGTAATTTATTAATCAAAAGGAAATTTAATAATGGATGATATTGTTAATTCTGTGCCCTCCTGGATGTTTACCGCAATTATTGCCGTATGCATTCTGTTTATTATTGGAATTATTTTCGCC < SRR19973063.1861005/150‑1 (MQ=60)
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GGAAAATAATCCCTGCCCCCAAATATTGTAATTTATTAATCAAAAGGAAATTTAATAATGGATGATATTGTTAATTCTGTGCCCTCCTGGATGTTTACCGCAATTATTGCCGTATGCATTCTGTTTATTATTGGAATTATTTTCGCCAGG < SRR19973063.8785/150‑1 (MQ=60)
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AATCCCTGCCCCCAAATATTGTAATTTATTAATCAAAAGGAAATTTAATAATGGATGATATTGTTAATTCTGTGCCCTCCTGGATGTTTACCGCAATTATTGCCGTATGCATTCTGTTTATTATTGGAATTATTTTCGCCAGGCTCTATC < SRR19973063.2630172/150‑1 (MQ=60)
CCCTGGCCCCAAATCTTGTAATTTATTAATCAAAAGGAAATTTAATAATGGAGGATATTGTTAATTCTGTGCCCTCCTGGATGTGTACCGCAATTATTGCCGGATGCATTCTGTTTAATATTGGAATTATGTTCGCCAGGCTCTATCGTC > SRR19973063.817513/1‑150 (MQ=60)
CCTGCCCCCAAATATTGTAATTTATTAATCAAAAGGAAATTTAATAATGGATGATATTGTTAATTCTGTGCCCTCCTGGATGTTTACCGCAATTATTGCCGTATGCATTCTGTTTATTATTGGAATTATTTTCGCCAGGCTCTATCGTCG < SRR19973063.3813923/150‑1 (MQ=60)
CCCCCAAATATTGTAATTTATTAATCAAAAGGAAATTTAATAATGGATGATATTGTTAATTCTGTGCCCTCCTGGATGTTTACCGCAATTATTGCCGTATGCATTCTGTTTATTATTGGAATTATTTTCGCCAGGCTCTATCGTCGCGCT < SRR19973063.1083003/150‑1 (MQ=60)
CCCCCAAATATTGTAATTTATTAATCAAAAGGAAATTTAATAATGGATGATATTGTTAATTCTGTGCCCTCCTGGATGTTTACCGCAATTATTGCCGTATGCATTCTGTTTATTATTGGAATTATTTTCGCCAGGCTCTATCGTCGCGCT > SRR19973063.1063796/1‑150 (MQ=60)
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CCTGCGAAGGAAAACTCACCGATCAATTTGGCCAAATACATTATTTACTACTGGAGCCTGAAGAAGGAAAAATTTTCACTAAAGGAGACAAAGTGTTAATTATTTGCCGACTTTCTGCAACGCGATATTTGGCGGAAAATAATCCCTGGCCCCAAATATTGTAATTTATTAATCAAAAGGAAATTTAATAATGGATGATATTGTTAATTCTGTGCCCTCCTGGATGTTTACCGCAATTATTGCCGTATGCATTCTGTTTATTATTGGAATTATTTTCGCCAGGCTCTATCGTCGCGCT > CP009273/3186033‑3186330
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |