Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F434 I0 R1
|
1130 |
215.9 |
7031662 |
97.1% |
6827743 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
2,067,908 |
T→A |
92.4% |
V963V (GTT→GTA) |
flu → |
CP4‑44 prophage; antigen 43 (Ag43) phase‑variable biofilm formation autotransporter |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 2,067,908 | 0 | T | A | 92.4%
| 555.9
/ 29.7
| 183 | V963V (GTT→GTA) | flu | CP4‑44 prophage; antigen 43 (Ag43) phase‑variable biofilm formation autotransporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (9/5); new base A (77/91); total (87/96) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.65e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.56e-01 |
Only 100 of 185 total aligned reads displayed.
TGCACAACATGTGCGTGCCGGTTTCCGTCTGGGCAGCCACAACGATATGACCTTTGGCGAAGGCACCTCATCCCGTGCCCCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGATGACGTTCTCTCCCTCACAGAATGGCACATCACTGGACCTGCAGGCCGGACTGGAAGCCCGTGTCCGGGAAAATATCACCCTG > CP009273/2067761‑2068052
|
tGCACAACATGTGCGTGCCGGTTTCCGTCTGGGCAGCCATAACGATATGACCTTTGGCGAAGGCACCTCATCCCGTGCCCCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACAGCCTTCTGtt > 1:834679/1‑148 (MQ=255)
cacaACATGTGCGTGCCGGTTTCCGTCTGGGCAGCCACAACGATATGACCTTTGGCGAAGGCACCTCATCCCGTGCCCCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTAAt < 2:2235284/148‑1 (MQ=255)
acaacaTGTGCGTGCCGGTTTCCGTCTGGGCAGCCACAACGATATGACCTTTGGCGAAGGCACCTCATCCCGTGCCCCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTAATc < 1:2011886/148‑1 (MQ=255)
caacaTGTGCGTGCCGGTTTCCGTCTGGGCAGCCACAACGATATGACCTTTGGCGAAGGCACCTCATCCCGTGCCCCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTAATcc > 1:2476590/1‑148 (MQ=255)
aacaTGTGCGTGCCGGTTTCCGTCTGGGCAGCCACAACGATATGACCTTTGGCGAAGGCACCTCATCCCGTGCCCCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTAATCCg > 1:1719708/1‑148 (MQ=255)
aacaTGTGCGTGCCGGTTTCCGTCTGGGCAGCCACAACGATATGACCTTTGGCGAAGGCACCTCATCCCGTGCCCCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTAATCCg > 1:3458230/1‑148 (MQ=255)
aacaTGTGCGTGCCGGTTTCCGTCTGGGCAGCCACAACGATATGACCTTTGGCGAAGGCACCTCATCCCGTGCCCCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTAATCCg < 1:3411418/148‑1 (MQ=255)
acaTGTGCGTGCCGGTTTCCGTCTGGGCAGCCACAACGATATGACCTTTGGCGAAGGCACCTCATCCCGTGCCCCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTAATCCGc < 2:2690316/148‑1 (MQ=255)
aTGTGCGTGCCGGTTTCCGTCTGGGCAGCCACAACGATATGACCTTTGGCGAAGGCACCTCATCCCGTGCCCCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTAATCCGCAc < 1:2277134/148‑1 (MQ=255)
tgtgCGTGCCGGTTTCCGTCTGGGCAGCCACAACGATATGACCTTTGGCGAAGGCACCTCATCCCGTGCCCCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTAATCCGCAcc > 2:1281938/1‑148 (MQ=255)
gtgcgtgcCGGTTTCCGTCTGGGCAGCCACAACGATATGACCTTTGGCGAAGGCACCTCATCCCGTGCCCCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTAATCCGCACCt > 1:161388/1‑148 (MQ=255)
gtgcgtgcCGGTTTCCGTCTGGGCAGCCACAACGATATGACCTTTGGCGAAGGCACCTCATCCCGTGCCCCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTAATCCGCACCt < 2:1962402/148‑1 (MQ=255)
gtgcgtgcCGGTTTCCGTCTGGGCAGCCACAACGATATGACCTTTGGCGAAGGCACCTCATCCCGTGCCCCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTAATCCGCACCt < 2:187781/148‑1 (MQ=255)
tgcgtgcCGGTTTCCGTCTGGGCAGCCACAACGATATGACCTTTGGCGAAGGCACCTCATCCCGTGCCCCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGACCTGGTGGGTACAGCCTTCTGTAATCCGCACCtt > 2:2328117/1‑148 (MQ=255)
tgcgtgcCGGTTTCCGTCTGGGCAGCCACAACGATATGACCTTTGGCGAAGGCACCTCATCCCGTGCCCCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTAATCCGCACCtt < 1:66950/148‑1 (MQ=255)
gtgcCGGTTTCCGTCTGGGCAGCCACAACGATATGACCTTTGGCGAAGGCACCTCATCCCGTGCCCCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAg < 1:1742024/148‑1 (MQ=255)
gcCGGTTTCCGTCTGGGCAGCCACAACGATATGACCTTTGGCGAAGGCACCTCATCCCGTGCCCCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTAATCCGCACCTTCAGCt > 1:1172162/1‑148 (MQ=255)
ccGGTTTCCGTCTGGGCAGCCACAACGATATGACCTTTGGCGAAGGCACCTCATCCCGTGCCCCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTAATCCGCACCTTCAGCTc < 1:506917/148‑1 (MQ=255)
ccGGTTTCCGTCTGGGCAGCCACAACGATATGACCTTTGGCGAAGGCACCTCATCCCGTGCCCCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTAATCCGCACCTTCAGCTc < 1:1816286/148‑1 (MQ=255)
gTTTCCGTCTGGGCAGCCACAACGATATGACCTTTGGCGAAGGCACCTCATCCCGTGCCCCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTAATCCGCACCTTCAGCTCCCg < 2:1761300/148‑1 (MQ=255)
ccGTCTGGGCAGCCACAACGATATGACCTTTGGCGAAGGCACCTCATCCCGTGCCCCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTAATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGga > 2:787539/1‑148 (MQ=255)
tCTGGGCAGCCACAACGATATGACCTTTGGCGAAGGCACCTCATCCCGTGCCCCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTAATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGat < 1:1578972/148‑1 (MQ=255)
cTGGGCAGCCACAACGATATGACCTTTGGCGAAGGCACCTCATCCCGTGCCCCCCTGCGTGACAGTGCACAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTAATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGgagaga > 1:1985080/1‑146 (MQ=255)
tGGGCAGCCACAACGATATGACCTTTGGCGAAGGCACCTCATCCCGTGCCCCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGatat < 2:3271786/148‑1 (MQ=255)
gggCAGCCACAACGATATGACCTTTGGCGAAGGCACCTCATCCCGTGCCCCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTAATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATg < 2:1352495/148‑1 (MQ=255)
ggCAGCCACAACGATATGACCTTTGGCGAAGGCACCTCATCCCGTGCCCCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTAATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGc > 2:1284318/1‑148 (MQ=255)
ggCAGCCACAACGATATGACCTTTGGCGAAGGCACCTCATCCCGTGCCCCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTAATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGc > 1:2973836/1‑148 (MQ=255)
gCAGCCACAACGATATGACCTTTGGCGAAGGCACCTCATCCCGTGCCCCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTAATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCg > 1:452910/1‑148 (MQ=255)
gCAGCCACAACGATATGACCTTTGGCGAAGGCACCTCATCCCGTGCCCCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTAATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCg > 1:452658/1‑148 (MQ=255)
gCAGCCACAACGATATGACCTTTGGCGAAGGCACCTCATCCCGTGCCCCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTAATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCg < 1:296898/148‑1 (MQ=255)
gCAGCCACAACGATATGACCTTTGGCGAAGGCACCTCATCCCGTGCCCCCCTGCGTGACAGTGCAAAAAACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTAATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCg < 1:717716/148‑1 (MQ=255)
cAGCCACAACGATATGACCTTTGGCGTAGGCACCTCATCCCGTGCCCCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTAATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCgt < 2:2044534/148‑1 (MQ=255)
cAGCCACAACGATATGACCTTTGGCGAAGGCACCTCATCCCGTGCCCCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTTAACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTAATCCGCACATTCAGCTCCCGGGGAGATATGCgt < 2:675056/148‑1 (MQ=255)
cAGCCACAACGATATGACCTTTGGCGAAGGCACCTCATCCCGTGCCCCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTAATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCgt < 2:674975/148‑1 (MQ=255)
ccACAACGATATGACCTTTGGCGAAGGCACCTCATCCCGTGCCCCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTAATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGtgtg > 2:95995/1‑148 (MQ=255)
caACGATATGACCTTTGGCGAAGGCACCTCATCCCGTGCCCCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTAATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTgggg > 2:1907693/1‑148 (MQ=255)
aaCGATATGACCTTTGGCGAAGGCACCTCATCCCGTGCCCCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTAATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGa < 2:1361549/148‑1 (MQ=255)
aaCGATATGACCTTTGGCGAAGGCACCTCATCCCGTGCCCCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTAATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGa > 1:2846778/1‑148 (MQ=255)
aCGATATGACCTTTGGCGAAGGCACCTCATCCCGTGCCCCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTAATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGAc < 1:1337933/148‑1 (MQ=255)
cGATATGACCTTTGGCGAAGGCACCTCATCCCGTGCCCCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTAATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACt > 2:2458947/1‑148 (MQ=255)
atGACCTTTGGCGAAGGCACCTCATCCCGTGCCCCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTAATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCa < 1:2927299/148‑1 (MQ=255)
atGACCTTTGGCGAAGGCACCTCATCCCGTGCCCCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTAATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCa < 2:2435126/148‑1 (MQ=255)
atGACCTTTGGCGAAGGCACCTCATCCCGTGCCCCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTAATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCa > 2:2856360/1‑148 (MQ=255)
ccTTTGGCGAAGGCACCTCATCCCGTGCCCCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTAATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTgc < 1:505678/148‑1 (MQ=255)
tttGGCGAAGGCACCTCATCCCGTGCCCCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTAATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTgcag < 1:3302351/148‑1 (MQ=255)
tttGGCGAAGGCACCTCATCCCGTGCCCCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTAATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTgcag > 1:2095963/1‑148 (MQ=255)
tGGCGAAGGCACCTCATCCCGTGCCCCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTAATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTgcaggc < 2:709532/148‑1 (MQ=255)
aGGCACCTCATCCCGTGCCCCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCggg > 2:1915276/1‑148 (MQ=255)
aGGCACCTCATCCCGTGCCCCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTAATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCggg < 2:2055894/148‑1 (MQ=255)
ggCACCTCATCCCGTGCCCCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTAATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGa < 1:2635160/148‑1 (MQ=255)
gCACCTCATCCCGTGCCCCCCTGCGTGACAGTGCGAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTAATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGAt > 2:3410940/1‑148 (MQ=255)
gCACCTCATCCCGTGCCCCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTAATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGAt > 2:2558587/1‑148 (MQ=255)
aCCTCATCCCGTGCCCCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTAATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGATGa > 2:937838/1‑148 (MQ=255)
ccTCATCCCGTGCCCCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTAATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGATGAc > 1:349994/1‑148 (MQ=255)
tCATCCCGTGCCCCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTAATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGATGACGt > 2:1513944/1‑148 (MQ=255)
aTCCCGTGCCCCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTAATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGATGACGTtc < 2:290540/148‑1 (MQ=255)
tCCCGTGCCCCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTAATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGATGACGTtct < 2:610918/148‑1 (MQ=255)
tCCCGTGCCCCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTAATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGATGACGTtct > 2:1292626/1‑148 (MQ=255)
tCCCGTGCCCCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTAATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGATGACGTtct < 1:1040396/148‑1 (MQ=255)
cGTGCCCCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTAATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGATGACGTtctctc < 1:2724904/148‑1 (MQ=255)
tGCCCCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTAATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGATGACGTTCTCTccc < 1:108659/148‑1 (MQ=255)
cccTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTAATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGATGACGTTCTCTCCCTcaca > 2:2990133/1‑148 (MQ=255)
cccTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTAATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGATGACGTTCTCTCCCTcaca > 2:2990433/1‑148 (MQ=255)
tGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTAATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGATGACGTTCTCTCCCTCACAGaa < 2:3244337/148‑1 (MQ=255)
gCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGATGACGTTCTCTCCCTCACAGAAt < 1:598459/148‑1 (MQ=255)
tGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGATGACGTTCTCTCCCTCACAGAATGGc > 1:2750903/1‑148 (MQ=255)
tGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGATGACGTTCTCTCCCTCACAGAATGGc > 1:2750999/1‑148 (MQ=255)
tGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTAATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGATGACGTTCTCTCCCTCACAGAATGGc > 2:1178534/1‑148 (MQ=255)
aCAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTAATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGATGACGTTCTCTCCCTCACAGAATGGcac > 2:3108445/1‑148 (MQ=255)
gTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTAATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGATGACGTTCTCTCCCTCACAGAATGGCACATc < 2:3458230/148‑1 (MQ=255)
tGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTAATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGATGACGTTCTCTCCCTCACAGAATGGCACATCa < 1:400821/148‑1 (MQ=255)
cAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTAATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGATGACGTTCTCTCCCTCACAGAATGGCACATCACt > 1:1327589/1‑148 (MQ=255)
cAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTAATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGATGACGTTCTCTCCCTCACAGAATGGCACATCACt > 1:2744886/1‑148 (MQ=255)
aGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTAATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGATGACGTTCTCTCCCTCACAGAATGGCACATCACTGGACCTGc < 2:2415018/148‑1 (MQ=255)
gtgtGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTAATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGATGACGTTCTCTCCCTCACAGAATGGCACATCACTGGACCTGCa < 2:1481192/148‑1 (MQ=255)
gtgtGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTAATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGATGACGTTCTCTCCCTCACAGAATGGCACATCACTGGACCTGCa < 2:500897/148‑1 (MQ=255)
gtgagtgaATTACCGGTGAACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTAATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGATGACGTTCTCTCCCTCACAGAATGGCACATCACTGGACCTGCAgg < 2:2098174/148‑1 (MQ=255)
gtgagtgaATTACCGGTGAACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTAATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGATGACGTTCTCTCCCTCACAGAATGGCACATCACTGGACCTGCAgg > 1:167312/1‑148 (MQ=255)
gtgagtgaATTACCGGTGAACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTAATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGATGACGTTCTCTCCCTCACAGAATGGCACATCACTGGACCTGCAgg > 1:2184605/1‑148 (MQ=255)
tgagtgaATTACCGGTGAACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTAATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGATGACGTTCTCTCCCTCACAGAATGGCACATCACTGGACCTGCAGGc > 1:1115113/1‑148 (MQ=255)
gtgaATTACCGGTGAACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTAATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGATGACGTTCTCTCCCTCACAGAATGGCACATCACTGGACCTGCAGGCCgg > 1:2292519/1‑148 (MQ=255)
ttACCGGTGAACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTAATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGATGACGTTCTCTCCCTCACAGAATGGCACATCACTGGACCTGCAGGCCGGACTgg > 1:3077279/1‑148 (MQ=255)
tACCGGTGAACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTAATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGATGACGTTCTCTCCCTCACAGAATGGCACATCACTGGACCTGCAGGCCGGACTGGa > 2:813978/1‑148 (MQ=255)
aCCGGTGAACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTAATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGATGACGTTCTCTCCCTCACAGAATGGCACATCACTGGACCTGCAGGCCGGACTGGaa > 2:2967297/1‑148 (MQ=255)
ggTGAACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTAATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGATGACGTTCTCTCCCTCACAGAATGGCACATCACTGGACCTGCAGGCCGGACTGGAAGcc > 2:1195018/1‑148 (MQ=255)
gTGAACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGATGACGTTCTCTCCCTCACAGAATGGCACATCACTGGACCTGCAGGCCGGACTGGAAGccc > 1:2538430/1‑148 (MQ=255)
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TGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTAATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGATGACGTTCTCTCCCTCACAGAATGGCACATCACT > SRR19973065.1336368/1‑150 (MQ=60)
TGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTAATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGATGACGTTCTCTCCCTCACAGAATGGCACATCACT < SRR19973065.403630/150‑1 (MQ=60)
GTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTAATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGATGACGTTCTCTCCCTCACAGAATGGCACATCACTGGACCTGCAGG > SRR19973065.2198621/1‑150 (MQ=60)
GTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTAATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGATGACGTTCTCTCCCTCACAGAATGGCACATCACTGGACCTGCAGG > SRR19973065.168673/1‑150 (MQ=60)
GTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTAATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGATGACGTTCTCTCCCTCACAGAATGGCACATCACTGGACCTGCAGG > SRR19973065.168729/1‑150 (MQ=60)
TGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTAATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGATGACGTTCTCTCCCTCACAGAATGGCACATCACTGGACCTGCAGGC > SRR19973065.1122394/1‑150 (MQ=60)
GAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTAATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGATGACGTTCTCTCCCTCACAGAATGGCACATCACTGGACCTGCAGGCCGG > SRR19973065.2306966/1‑150 (MQ=60)
GTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTAATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGATGACGTTCTCTCCCTCACAGAATGGCACATCACTGGACCTGCAGGCCGGAC < SRR19973065.2133380/150‑1 (MQ=60)
GTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTAATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGATGACGTTCTCTCCCTCACAGAATGGCACATCACTGGACCTGCAGGCCGGAC < SRR19973065.418821/150‑1 (MQ=60)
AATTACCGGTGAACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTAATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGATGACGTTCTCTCCCTCACAGAATGGCACATCACTGGACCTGCAGGCCGGACTGG > SRR19973065.3096075/1‑150 (MQ=60)
CGGTGAACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGATGACGTTCTCTCCCTCACAGAATGGCACATCACTGGACCTGCAGGCCGGACTGGAAGCCC > SRR19973065.2554344/1‑150 (MQ=60)
CGGTGAACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGATGACGTTCTCTCCCTCACAGAATGGCACATCACTGGACCTGCAGGCCGGACTGGAAGCCC > SRR19973065.2554497/1‑150 (MQ=60)
GAACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTAATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGATGACGTTCTCTCCCTCACAGAATGGCACATCACTGGACCTGCAGGCCGGACTGGAAGCCCGTGT < SRR19973065.1523828/150‑1 (MQ=60)
AACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTAATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGATGACGTTCTCTCCCTCACAGAATGGCACATCACTGGACCTGCAGGCCGGACTGGAAGCCCGTGTC > SRR19973065.351329/1‑150 (MQ=60)
AACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTAATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGATGACGTTCTCTCCCTCACAGAATGGCACATCACTGGACCTGCAGGCCGGACTGGAAGCCCGTGTC < SRR19973065.158230/150‑1 (MQ=60)
AACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTAATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGATGACGTTCTCTCCCTCACAGAATGGCACATCACTGGACCTGCAGGCCGGACTGGAAGCCCGTGTC > SRR19973065.2424934/1‑150 (MQ=60)
ACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTAATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGATGACGTTCTCTCCCTCACAGAATGGCACATCACTGGACCTGCAGGCCGGACTGGAAGCCCGTGTCC < SRR19973065.772843/150‑1 (MQ=60)
ACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTAATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGATGACGTTCTCTCCCTCACAGAATGGCACATCACTGGACCTGCAGGCCGGACTGGAAGCCCGTGTCC < SRR19973065.772685/150‑1 (MQ=60)
ACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTAATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGATGACGTTCTATCCCTCACAGAATGGCACATCACTGGACCTGCAGGCCGGACTGGAAGCCCGTGTCC < SRR19973065.918193/150‑1 (MQ=60)
CTGGTGGGTACAGCCTTCTGTAATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGATGACGTTCTCTCCCTCACAGAATGGCACATCACTGGACCTGCAGGCCGGACTGGAAGCCCGTGTCCG < SRR19973065.3127402/150‑1 (MQ=60)
GGGTACAGCCTTCTGTAATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGATGACGTTCTCTCCCTCACAGAATGGCACATCACTGGACCTGCAGGCCGGACTGGAAGCCCGTGTCCGGGAAA > SRR19973065.1167233/1‑150 (MQ=60)
AGCCTTCTGTAATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGATGACGTTCTCTCCCTCACAGAATGGCACATCACTGGACCTGCAGGCCGGACTGGAAGCCCGTGTCCGGGAAAATATCA < SRR19973065.635456/150‑1 (MQ=60)
TCTGTAATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGATGACGTTCTCTCCCTCACAGAATGGCACATCACTGGACCTGCAGGCCGGACTGGAAGCCCGTGTCCGGGAAAATATCACCCTA > SRR19973065.2305085/1‑150 (MQ=60)
CTGTAATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGATGACGTTCTCTCCCTCACAGAATGGCACATCACTGGACCTGCAGGCCGGACTGGAAGCCCGTGTCCGGGAAAATATCACCCTGG > SRR19973065.1238171/1‑150 (MQ=60)
CTGTAATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGATGACGTTCTCTCCCTCACAGAATGGCACATCACTGGACCTGCAGGCCGGACTGGAAGCCCGTGTCCGGGAAAATATCACCCTGG < SRR19973065.2996609/150‑1 (MQ=60)
CTGTAATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGATGACGTTCTCTCCCTCACAGAATGGCACATCACTGGACCTGCAGGCCGGACTGGAAGCCCGTGTCCGGGAAAATATCACCCTGG < SRR19973065.1239296/150‑1 (MQ=60)
TGTAATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGATGACGTTCTCTCCCTCACAGAATGGCACATCACTGGACCTGCAGGCCGGACTGGAAGCCCGTGTCCGGGAAAATATCACCCTGGG < SRR19973065.3431778/150‑1 (MQ=60)
TGTAATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGATGACGTTCTCTCCCTCACAGAATGGCACATCACTGGACCTGCAGGCCGGACTGGAAGCCCGTGTCCGGGAAAATATCACCCTGGG < SRR19973065.2574586/150‑1 (MQ=60)
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AGTGCACAACATGTGCGTGCCGGTTTCCGTCTGGGCAGCCACAACGATATGACCTTTGGCGAAGGCACCTCATCCCGTGCCCCCCTGCGTGACAGTGCAAAACACAGTGTGAGTGAATTACCGGTGAACTGGTGGGTACAGCCTTCTGTTATCCGCACCTTCAGCTCCCGGGGAGATATGCGTGTGGGGACTTCCACTGCAGGCAGCGGGATGACGTTCTCTCCCTCACAGAATGGCACATCACTGGACCTGCAGGCCGGACTGGAAGCCCGTGTCCGGGAAAATATCACCCTGGG > CP009273/2067759‑2068054
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
