Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F434 I0 R1
|
1130 |
215.9 |
7031662 |
97.1% |
6827743 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
2,122,453 |
C→T |
100% |
A227T (GCT→ACT) |
wcaE ← |
putative glycosyl transferase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 2,122,453 | 0 | C | T | 98.5%
| 861.1
/ 2.3
| 262 | A227T (GCT→ACT) | wcaE | putative glycosyl transferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (3/1); new base T (123/135); total (126/136) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.54e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.90e-01 |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 262 total aligned reads displayed.
TTTAATAGCGTTGCCGCCCCGGAACCCTTTCGGCACCGAGAAACCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGCCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATACCCCACCCATGGAAAATTCAGACACCAGGCCATTGAGTTTTTTAAATGCATAACCGGCTTTAT > CP009273/2122310‑2122596
|
aaTAGCGTTGCCGCCCCGGAACCCTTTCGGCACCGAGAAACCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAg < 1:1974209/148‑1 (MQ=255)
gTTGCCGCCCCGGAACCCTTTCGGCACCGAGAAACCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGc < 1:3431612/148‑1 (MQ=255)
tGCCGCCCCGGAACCCTTTCGGCACCGAGAAACCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGcac > 1:212575/1‑148 (MQ=255)
tGCCGCCCCGGAACCCTTTCGGCACCGAGAAACCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGcac > 1:2410450/1‑148 (MQ=255)
ccgccCCGGAACCCTTTCGGCACCGAGAAACCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACAt < 2:2845184/148‑1 (MQ=255)
ccgccCCGGAACCCTTTCGGCACCGAGAAACCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACAt < 1:3475278/148‑1 (MQ=255)
ccgccCCGGAACCCTTTCGGCACCGAGAAACAGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGCCCAAAAGCCAGGCACAt > 2:1548927/1‑148 (MQ=255)
ccccGGAACCCTTTCGGCACCGAGAAACCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTa > 2:1925255/1‑148 (MQ=255)
ccccGGAACCCTTTCGGCACCGAGAAACCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGCCCAAAAGCCAGGCACATGTa < 2:1771864/148‑1 (MQ=255)
ccGGAACCCTTTCGGCACCGAGAAACCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAat < 1:485850/148‑1 (MQ=255)
ccGGAACCCTTTCGGCACCGAGAAACCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAat < 1:2161086/148‑1 (MQ=255)
gAACCCTTTCGGCACCGAGAAACCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATAtt > 2:1482778/1‑148 (MQ=255)
gAACCCTTTCGGCACCGAGAAACCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATAtt > 2:1001778/1‑148 (MQ=255)
gAACCCTTTCGGCACCGAGAAACCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATAtt > 2:2757414/1‑148 (MQ=255)
aaCCCTTTCGGCACCGAGAAACCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATAttt > 2:1213629/1‑148 (MQ=255)
aaCCCTTTCGGCACCGAGAAACCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATAttt > 1:928713/1‑148 (MQ=255)
cccTTTCGGCACCGAGAAACCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGt < 2:1748419/148‑1 (MQ=255)
ccTTTCGGCACCGAGAAACCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTc < 1:1148198/148‑1 (MQ=255)
cTTTCGGCACCGAGAAACCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCg < 1:3508056/148‑1 (MQ=255)
tCGGCACCGAGAAACCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTg < 1:2093188/148‑1 (MQ=255)
ggCACCGAGAAACCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGa < 2:1065643/148‑1 (MQ=255)
cACCGAGAAACCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACt < 1:430131/148‑1 (MQ=255)
ccGAGAAACCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACttt < 2:849180/148‑1 (MQ=255)
gagaAACCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACttttt < 1:536612/148‑1 (MQ=255)
agaAACCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACtttttt < 2:320643/148‑1 (MQ=255)
agaAACCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACtttttt > 2:26939/1‑148 (MQ=255)
gaAACCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTc > 2:3405940/1‑148 (MQ=255)
gaAACCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTc > 1:198458/1‑148 (MQ=255)
gaAACCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTCGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTAAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTc > 1:197971/1‑148 (MQ=255)
aaaCCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTcg < 2:2096372/148‑1 (MQ=255)
aaaCCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTcg > 1:1247281/1‑148 (MQ=255)
aaCCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTcgc > 2:1661444/1‑148 (MQ=255)
ccGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGt > 1:871424/1‑148 (MQ=255)
tAAATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGca < 2:2196653/148‑1 (MQ=255)
aaaTCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGcac < 1:1746398/148‑1 (MQ=255)
cTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCATTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACaa < 1:737369/148‑1 (MQ=255)
ttGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAAt > 1:1619887/1‑148 (MQ=255)
ttGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAAt < 2:2500746/148‑1 (MQ=255)
ttGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAAt < 2:1598238/148‑1 (MQ=255)
tGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAAtt > 1:2020874/1‑148 (MQ=255)
cATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTcc > 2:257241/1‑148 (MQ=255)
aTTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCa < 1:2398942/148‑1 (MQ=255)
ttGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCat > 1:1859648/1‑148 (MQ=255)
ttGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCat > 2:1646068/1‑148 (MQ=255)
ttGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACATTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCat > 1:1859653/1‑148 (MQ=255)
tGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCata > 1:373207/1‑148 (MQ=255)
tGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCata < 2:1322801/148‑1 (MQ=255)
ttttCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCCtatta > 2:3320937/1‑148 (MQ=255)
tttCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACATAATTCCAtattat > 2:1671718/1‑148 (MQ=255)
ttCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATattatt < 2:2904397/148‑1 (MQ=255)
tCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATtg < 1:2326417/148‑1 (MQ=255)
cTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACCATTCCATATTATtggt > 2:2273551/1‑148 (MQ=255)
cTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATtggt < 2:1094013/148‑1 (MQ=255)
ttATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATtggtg < 2:3052201/148‑1 (MQ=255)
atTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAg > 2:2877906/1‑148 (MQ=255)
atTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAg < 1:2648427/148‑1 (MQ=255)
ttCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGa < 1:2642617/148‑1 (MQ=255)
ttCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGa > 2:1579426/1‑148 (MQ=255)
tCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGAt < 1:126192/148‑1 (MQ=255)
cAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATa > 1:568397/1‑148 (MQ=255)
cAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATa < 1:1925255/148‑1 (MQ=255)
cAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATa < 2:3368467/148‑1 (MQ=255)
aCTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATAccc > 1:1344600/1‑148 (MQ=255)
aCTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATAccc < 1:157137/148‑1 (MQ=255)
aCTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATAccc < 1:789199/148‑1 (MQ=255)
ttGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATACcccac > 2:2189063/1‑148 (MQ=255)
ttATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATACcccaccca < 1:3189687/148‑1 (MQ=255)
tatataAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATACCCCACCCAt < 1:1991525/148‑1 (MQ=255)
tataAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATACCCCACCCATgg > 2:1150352/1‑148 (MQ=255)
taAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGCCGTAAATCCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATATGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATACCCCACCCATGGaa > 1:1825488/1‑148 (MQ=255)
aaGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATACCCCACCCATGGaaa > 2:1634026/1‑148 (MQ=255)
aaGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATACCCCACCCATGGaaa > 2:1393908/1‑148 (MQ=255)
ggCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATACCCCACCCATGGAAAAt > 1:1519772/1‑148 (MQ=255)
gCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATACCCCACCCATGGAAAAtt < 1:3136962/148‑1 (MQ=255)
gCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATACCCCACCCATGGAAAAtt > 2:2620009/1‑148 (MQ=255)
cGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATACCCCACCCATGGAAAATTCAGac > 2:69665/1‑148 (MQ=255)
tCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATACCCCACCCATGGAAAATTCAGacac > 1:1025283/1‑148 (MQ=255)
tCTTTGAGGTAGTACGGTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGAACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATACCCCACCCATGGAAAATTCAGacac < 2:1581943/148‑1 (MQ=255)
cTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATACCCCACCCATGGAAAATTCAGACAcc > 1:2824091/1‑148 (MQ=255)
ggTAGTACGTTTGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATACCCCACCCATGGAAAATTCAGACACCAGGCCa < 1:2148937/148‑1 (MQ=255)
ggTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATACCCCACCCATGGAAAATTCAGACACCAGGCCa < 2:621532/148‑1 (MQ=255)
ggTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATACCCCACCCATGGAAAATTCAGACACCAGGCCa < 2:488563/148‑1 (MQ=255)
gtagtaCGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATACCCCACCCATGGAAAATTCAGACACCAGGCCAt < 2:3515799/148‑1 (MQ=255)
agtaCGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATACCCCACCCATGGAAAATTCAGACACCAGGCCATTg < 1:2875038/148‑1 (MQ=255)
gtaCGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATACCCCACCCATGGAAAATTCAGACACCAGGCCATTGa < 2:441981/148‑1 (MQ=255)
taCGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATACCCCACCCATGGAAAATTCAGACACCAGGCCATTGAg > 1:701442/1‑148 (MQ=255)
taCGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGCCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATACCCCACCCATGGAAAATTCAGACACCAGGCCATTGAg > 1:2097777/1‑148 (MQ=255)
aCGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATACCCCACCCATGGAAAATTCAGACACCAGGCCATTGAGt < 2:1770476/148‑1 (MQ=255)
tGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATACCCCACCCATGGAAAATTCAGACACCAGGCCATTGAGttttt < 1:3263271/148‑1 (MQ=255)
tGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATACCCCACCCATGGAAAATTCAGACACCAGGCCATTGAGttttt < 1:2052461/148‑1 (MQ=255)
gCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATACCCCACCCATGGAAAATTCAGACACCAGGCCATTGAGTTTTTTa > 1:727063/1‑148 (MQ=255)
tAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATACCCCACCCATGGAAAATTCAGACACCAGGCCATTGAGTTTTTTAAAt > 2:914277/1‑148 (MQ=255)
aTGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATACCCCACCCATGGAAAATTCAGACACCAGGCCATTGAGTTTTTTAAATGCa < 2:2095181/148‑1 (MQ=255)
gCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATACCCCACCCATGGAAAATTCAGACACCAGGCGATTGAGTTTTTTAAATGCATa < 2:2402228/148‑1 (MQ=255)
gCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATACCCCACCCATGGAAAATTCAGACACCAGGCCATTGAGTTTTTTAAATGCATa < 1:2195214/148‑1 (MQ=255)
aTAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATACCCCACCCATGGAAAATTCAGACACCAGGCCAGTGAGTTTTTTAAATGCATAACCGGc > 1:2717587/1‑148 (MQ=255)
aaTTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATACCCCACCCATGGAAAATTCAGACACCAGGCCATTGAGTTTTTTAAATGCATAACCGGCtt > 2:639129/1‑148 (MQ=255)
ttCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATACCCCACCCATGGAAAATTCAGACACCAGGCCATTGAGTTTTTTAAATGCATAACCGGCTTta > 2:823567/1‑148 (MQ=255)
ttCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGAC‑TTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATACCCCACCCATGGAAAATTCAGACACCAGGCCATTGAGTTTTTTAAATGCATAACCGGCTTtat > 2:3098857/1‑148 (MQ=255)
tCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATACCCCACCCATGGAAAATTCAGACACCAGGCCATTGAGTTTTTTAAATGCATAACCGGCTTtat > 2:146/1‑148 (MQ=255)
|
TTTAATAGCGTTGCCGCCCCGGAACCCTTTCGGCACCGAGAAACCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGCCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATACCCCACCCATGGAAAATTCAGACACCAGGCCATTGAGTTTTTTAAATGCATAACCGGCTTTAT > CP009273/2122310‑2122596
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TTGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCGGAACCCTTTCGGCACCGAGAAACCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGCCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATACCCCACCCATGGAAAATTCAGACACCAGGCCATTGAGTTTTTTAAATGCATAACCGGCTTTATACATT > CP009273/2122304‑2122601
|
TTGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCGGAACCCTTTCGGCACCGAGAAACCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGT < SRR19973065.2525030/150‑1 (MQ=60)
TTGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCGGAACCCTTTCGGCACCGAGAAACCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGT > SRR19973065.638671/1‑150 (MQ=60)
TGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCGGAACCCTTTCGGCACCGAGAAACCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTC < SRR19973065.126984/150‑1 (MQ=60)
ACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCGGAACCCTTTCGGCACCGAGAAACCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAA > SRR19973065.118149/1‑150 (MQ=60)
TTAATAGCGTTGCCGCCCCGGAACCCTTTCGGCACCGAGAAACCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAG < SRR19973065.1130602/150‑1 (MQ=60)
AATAGCGTTGCCGCCCCGGAACCCTTTCGGCACCGAGAAACCGCTTAAATCTTTCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCC > SRR19973065.2634249/1‑150 (MQ=60)
AATAGCGTTGCCGCCCCGGAACCCTTTCGGCACCGAGAAACCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCC < SRR19973065.1988425/150‑1 (MQ=60)
AATAGCGTTGCCGCCCCGGAACCCTTTCGGCACCGAGAAACCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCC < SRR19973065.1987063/150‑1 (MQ=60)
TAGCGTTGCCGCCCCGGAACCCTTTCGGCACCGAGAAACCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAG > SRR19973065.3401856/1‑150 (MQ=60)
AGCGTTGCCGCCCCGGAACCCTTTCGGCACCGAGAAACCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGG < SRR19973065.570578/150‑1 (MQ=60)
GTTGCCGCCCCGGAACCCTTTCGGCACCGAGAAACCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCAC > SRR19973065.2425627/1‑150 (MQ=60)
GTTGCCGCCCCGGAACCCTTTCGGCACCGAGAAACCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCAC > SRR19973065.214188/1‑150 (MQ=60)
GTTGCCGCCCCGGAACCCTTTCGGCACCGAGAAACCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCAC < SRR19973065.3452321/150‑1 (MQ=60)
GTTGCCGCCCCGGAACCCTTTCGGCACCGAGAAACCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCAC < SRR19973065.3452548/150‑1 (MQ=60)
GCCGCCCCGGAACCCTTTCGGCACCGAGAAACCGATTAAATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATG < SRR19973065.2385379/150‑1 (MQ=60)
CCGCCCCGGAACCCTTTCGGCACCGAGAAACCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGT < SRR19973065.3496422/150‑1 (MQ=60)
CCGCCCCGGAACCCTTTCGGCACCGAGAAACCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGT < SRR19973065.1749574/150‑1 (MQ=60)
CCCCGGAACCCTTTCGGCACCGAGAAACCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAAT < SRR19973065.2673338/150‑1 (MQ=60)
CCCGGAACCCTTTCGGCACCGAGAAACCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATA < SRR19973065.871824/150‑1 (MQ=60)
CCCGGAACCCTTTCGGCACCGAGAAACCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATA > SRR19973065.2821623/1‑150 (MQ=60)
CCGGAACCCTTTCGGCACCGAGAAACCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATAT < SRR19973065.2175208/150‑1 (MQ=60)
CCGGAACCCTTTCGGCACCGAGAAACCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATAT < SRR19973065.2174980/150‑1 (MQ=60)
CCGGAACCCTTTCGGCACCGAGAAACCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATAT < SRR19973065.489145/150‑1 (MQ=60)
GGAACCCTTTCGGCACCGAGAAACCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTT > SRR19973065.934822/1‑150 (MQ=60)
CCCTTTCGGCACCGAGAAACCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCG < SRR19973065.3204926/150‑1 (MQ=60)
CCTTTCGGCACCGAGAAACCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGT < SRR19973065.1155600/150‑1 (MQ=60)
CCTTTCGGCACCGAGAAACCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGT < SRR19973065.1156589/150‑1 (MQ=60)
CTTTCGGCACCGAGAAACCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTT < SRR19973065.1577932/150‑1 (MQ=60)
CTTTCGGCACCGAGAAACCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTT < SRR19973065.3529344/150‑1 (MQ=60)
CTTTCGGCACCGAGAAACCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTT < SRR19973065.3528403/150‑1 (MQ=60)
TCGGCACCGAGAAACCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGA < SRR19973065.2106637/150‑1 (MQ=60)
CACCGAGAAACCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGAGTTT > SRR19973065.2172150/1‑150 (MQ=60)
CACCGAGAAACCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTT < SRR19973065.433116/150‑1 (MQ=60)
CCGAGAAACCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTT < SRR19973065.3233055/150‑1 (MQ=60)
CGAGAAACCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTT < SRR19973065.925948/150‑1 (MQ=60)
CGAGAAACCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTT < SRR19973065.926544/150‑1 (MQ=60)
GAGAAACCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTC < SRR19973065.540105/150‑1 (MQ=60)
GAGAAACCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTC > SRR19973065.199996/1‑150 (MQ=60)
GAGAAACCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTC < SRR19973065.540107/150‑1 (MQ=60)
GAGAAACCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTC > SRR19973065.199777/1‑150 (MQ=60)
GAGAAACCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTC > SRR19973065.1324877/1‑150 (MQ=60)
GAGAAACCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTCGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTAAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTC > SRR19973065.199509/1‑150 (MQ=60)
AGAAACCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCG > SRR19973065.1255496/1‑150 (MQ=60)
AAACCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCG < SRR19973065.347647/150‑1 (MQ=60)
AACCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGT > SRR19973065.877001/1‑150 (MQ=60)
CGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAG > SRR19973065.2924345/1‑150 (MQ=60)
CTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCA < SRR19973065.1333518/150‑1 (MQ=60)
AAATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACAC < SRR19973065.1986518/150‑1 (MQ=60)
AAATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACAC < SRR19973065.1757909/150‑1 (MQ=60)
ATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAA < SRR19973065.372606/150‑1 (MQ=60)
ATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAA < SRR19973065.2048589/150‑1 (MQ=60)
ATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAA < SRR19973065.1784904/150‑1 (MQ=60)
TCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAAT > SRR19973065.1630391/1‑150 (MQ=60)
TCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAAT > SRR19973065.1630750/1‑150 (MQ=60)
CTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATT < SRR19973065.742283/150‑1 (MQ=60)
CTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATT > SRR19973065.2033878/1‑150 (MQ=60)
CTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCATTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAAGT < SRR19973065.742299/150‑1 (MQ=60)
TGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCC > SRR19973065.2165203/1‑150 (MQ=60)
CATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCAT < SRR19973065.2668110/150‑1 (MQ=60)
CATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCAT > SRR19973065.1871887/1‑150 (MQ=60)
CATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCAT > SRR19973065.1871883/1‑150 (MQ=60)
CATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCAT > SRR19973065.1871459/1‑150 (MQ=60)
CATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCAT > SRR19973065.1871303/1‑150 (MQ=60)
CATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACATTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCAT > SRR19973065.1871888/1‑150 (MQ=60)
ATTGGTTTTCCTTCTATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATA < SRR19973065.2414100/150‑1 (MQ=60)
ATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATA > SRR19973065.375817/1‑150 (MQ=60)
ATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATA < SRR19973065.2414025/150‑1 (MQ=60)
GGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTA < SRR19973065.3502153/150‑1 (MQ=60)
TTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTG < SRR19973065.739047/150‑1 (MQ=60)
TCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGT < SRR19973065.2340976/150‑1 (MQ=60)
TCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGT < SRR19973065.2340968/150‑1 (MQ=60)
CTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGG > SRR19973065.2602876/1‑150 (MQ=60)
TTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGT < SRR19973065.2790244/150‑1 (MQ=60)
ATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGAT > SRR19973065.2042901/1‑150 (MQ=60)
ATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGAT < SRR19973065.2664748/150‑1 (MQ=60)
ATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGAT < SRR19973065.2664754/150‑1 (MQ=60)
TTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATA > SRR19973065.2347465/1‑150 (MQ=60)
TTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATA > SRR19973065.571997/1‑150 (MQ=60)
TTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATA < SRR19973065.2658924/150‑1 (MQ=60)
TCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATAC > SRR19973065.1999063/1‑150 (MQ=60)
TCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATAC > SRR19973065.1996687/1‑150 (MQ=60)
TCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATAC > SRR19973065.372746/1‑150 (MQ=60)
TCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATAC < SRR19973065.126751/150‑1 (MQ=60)
TCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATAC < SRR19973065.127281/150‑1 (MQ=60)
CAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATACC < SRR19973065.1937873/150‑1 (MQ=60)
AGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATACCC > SRR19973065.1353491/1‑150 (MQ=60)
ACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATACCCCA < SRR19973065.158439/150‑1 (MQ=60)
ACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATACCCCA < SRR19973065.158711/150‑1 (MQ=60)
ACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATACCCCA < SRR19973065.794429/150‑1 (MQ=60)
TTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATACCCCACCC < SRR19973065.1909027/150‑1 (MQ=60)
TGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCAAACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATACCCCACCCA > SRR19973065.3179155/1‑150 (MQ=60)
TTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATACCCCACCCATG < SRR19973065.3208930/150‑1 (MQ=60)
TATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATACCCCACCCATGG < SRR19973065.2005133/150‑1 (MQ=60)
TATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATACCCCACCCATGG < SRR19973065.2004441/150‑1 (MQ=60)
TATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATACCCCACCCATGG < SRR19973065.2005069/150‑1 (MQ=60)
ATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATACCCCACCCATGGA < SRR19973065.433558/150‑1 (MQ=60)
TATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGCCGTAAATCCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATATGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATACCCCACCCATGGAA > SRR19973065.1837511/1‑150 (MQ=60)
AAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATACCCCACCCATGGAAAAT > SRR19973065.3110330/1‑150 (MQ=60)
AAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATACCCCACCCATGGAAAAT > SRR19973065.2161165/1‑150 (MQ=60)
AAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATACCCCACCCATGGAAAAT > SRR19973065.1529724/1‑150 (MQ=60)
GGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATACCCCACCCATGGAAAATTC < SRR19973065.2116724/150‑1 (MQ=60)
GCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATACCCCACCCATGGAAAATTCA < SRR19973065.3156041/150‑1 (MQ=60)
TTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATACCCCACCCATGGAAAATTCAGAC < SRR19973065.432147/150‑1 (MQ=60)
TCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATACCCCACCCATGGAAAATTCAGACA < SRR19973065.2071092/150‑1 (MQ=60)
CGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATACCCCACCCATGGAAAATTCAGACAC > SRR19973065.1032068/1‑150 (MQ=60)
GTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATACCCCACCCATGGAAAATTCAGACACC > SRR19973065.2841527/1‑150 (MQ=60)
GGTAGTACGTTTGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATACCCCACCCATGGAAAATTCAGACACCAGGCCATT < SRR19973065.2162753/150‑1 (MQ=60)
GGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATACCCCACCCATGGAAAATTCAGACACCAGGCCATT < SRR19973065.787050/150‑1 (MQ=60)
AGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGTACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATACCCCACCCATGGAAAATTCAGACACCAGGCCATTGAG < SRR19973065.459296/150‑1 (MQ=60)
AGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTTGTGGTAGATACCCCACCCATGGAAAATTCAGACACCAGGCCATTGAG > SRR19973065.705243/1‑150 (MQ=60)
AGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATACCCCACCCATGGAAAATTCAGACACCAGGCCATTGAG > SRR19973065.706110/1‑150 (MQ=60)
AGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATACCCCACCCATGGAAAATTCAGACACCAGGCCATTGAG > SRR19973065.1919976/1‑150 (MQ=60)
AGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATACCCCACCCATGGAAAATTCAGACACCAGGCCATTGAG < SRR19973065.2892652/150‑1 (MQ=60)
AGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGCCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATACCCCACCCATGGAAAATTCAGACACCAGGCCATTGAG > SRR19973065.2111270/1‑150 (MQ=60)
AGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGCCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATACCCCACCCATGGAAAATTCAGACACCAGGCCATTGAG > SRR19973065.2111289/1‑150 (MQ=60)
CGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATACCCCACCCATGGAAAATTCAGACACCAGGCCATTGAGTTTT > SRR19973065.989439/1‑150 (MQ=60)
CGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATACACCACACATGGAAAATTCAGACACCAGGCCATTGAGTTTT > SRR19973065.2870161/1‑150 (MQ=60)
GTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATACCCCACCCATGGAAAATTCAGACACCAGGCCATTGAGTTTTT < SRR19973065.1492241/150‑1 (MQ=60)
GTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATACCCCACCCATGGAAAATTCAGACACCAGGCCATTGAGTTTTT < SRR19973065.1492025/150‑1 (MQ=60)
TGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATACCCCACCCATGGAAAATTCAGACACCAGGCCATTGAGTTTTTTA < SRR19973065.2065566/150‑1 (MQ=60)
TGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATACCCCACCCATGGAAAATTCAGACACCAGGCCATTGAGTTTTTTA < SRR19973065.3283050/150‑1 (MQ=60)
TGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATACCCCACCCATGGAAAATTCAGACACCAGGCCATTGAGTTTTTTA > SRR19973065.731937/1‑150 (MQ=60)
CGTAAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATACCCCACCCATGGAAAATTCAGACACCAGGCCATTGAGTTTTTTAAAT > SRR19973065.791342/1‑150 (MQ=60)
AAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATACCCCACCCATGGAAAATTCAGACACCAGGCCATTGAGTTTTTTAAATGCA > SRR19973065.2110709/1‑150 (MQ=60)
AAATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATACCCCACCCATGGAAAATTCAGACACCAGGCCATTGAGTTTTTTAAATGCA > SRR19973065.2110660/1‑150 (MQ=60)
AATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATACCCCACCCATGGAAAATTCAGACACCAGGCCATTGAGTTTTTTAAATGCAT < SRR19973065.610390/150‑1 (MQ=60)
AATGCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATACCCCACCCATGGAAAATTCAGACACCAGGCCATTGAGTTTTTTAAATGCAT > SRR19973065.716150/1‑150 (MQ=60)
AATGCCAGGAAAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTattccattgactttttacgcttaagaacacaattacaaaaaaatgctggtacataaccaacacaagcaaaaatcacacaccattccaaagagattattaaatccaa > SRR19973065.2274831/1‑44 (MQ=60)
GCCAGGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATACCCCACCCATGGAAAATTCAGACACCAGGCCATTGAGTTTTTTAAATGCATAAC < SRR19973065.2209282/150‑1 (MQ=60)
GGATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATACCCCACCCATGGAAAATTCAGACACCAGGCCAGTGAGTTTTTTAAATGCATAACCGGC > SRR19973065.2734493/1‑150 (MQ=60)
ATAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATACCCCACCCATGGAAAATTCAGACACCAGGCCATTGAGTTTTTTAAATGCATAACCGGCTT > SRR19973065.510064/1‑150 (MQ=60)
TAATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATACCCCACCCATGGAAAATTCAGACACCAGGCCATTGAGTTTTTTAAATGCATAACCGGCTTT < SRR19973065.1780941/150‑1 (MQ=60)
ATTCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATACCCCACCCATGGAAAATTCAGACACCAGGCCATTGAGTTTTTTAAATGCATAACCGGCTTTAT > SRR19973065.1975018/1‑150 (MQ=60)
TCAGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATACCCCACCCATGGAAAATTCAGACACCAGGCCATTGAGTTTTTTAAATGCATAACCGGCTTTATAC > SRR19973065.483339/1‑150 (MQ=60)
AGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATACCCCACCCATGGAAAATTCAGACACCAGGCCATTGAGTTTTTTAAATGCATAACCGGCTTTATACAT > SRR19973065.3105566/1‑150 (MQ=60)
AGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATACCCCACCCATGGAAAATTCAGACACCAGGCCATTGAGTTTTTTAAATGCATAACCGGCTTTATACAT > SRR19973065.3105570/1‑150 (MQ=60)
AGTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATACCCCACCCATGGAAAATTCAGACACCAGGCCATTGAGTTTTTTAAATGCATAACCGGCTTTATACAT < SRR19973065.1193654/150‑1 (MQ=60)
GTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATACCCCACCCATGGAAAATTCAGACACCAGGCCATTGAGTTTTTTAAATGCATAACCGGCTTTATACATT < SRR19973065.1382420/150‑1 (MQ=60)
GTCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATACCCCACCCATGGAAAATTCAGACACCAGGCCATTGAGTTTTTTAAATGCATAACCGGCTTTATACATT < SRR19973065.1177882/150‑1 (MQ=60)
|
TTGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCGGAACCCTTTCGGCACCGAGAAACCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTTGAGGTAGTACGTTGGCGTAAATGCCAGGATAATTCAGCCCAAAAGCCAGGCACATGTAATATTTGTCGTTGGACTTTTTTCGCGTCAGCACACAATTCCATATTATTGGTGGTAGATACCCCACCCATGGAAAATTCAGACACCAGGCCATTGAGTTTTTTAAATGCATAACCGGCTTTATACATT > CP009273/2122304‑2122601
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
