Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F247 I0 R1
|
1496 |
299.8 |
9582018 |
97.8% |
9371213 |
149.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
512,167 |
G→T |
5.4% |
A43A (GCG→GCT) |
fetB → |
iron exporter permease subunit, ABC transporter FetAB; peroxide resistance protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 512,167 | 0 | G | T | 5.4%
| 1143.8
/ 19.7
| 295 | A43A (GCG→GCT) | fetB | iron exporter permease subunit, ABC transporter FetAB; peroxide resistance protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (128/148); new base T (4/14); total (133/162) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.23e-02 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 308 total aligned reads displayed.
AAATGCAGGAAGCACGCTATGAACTCGCATAATATTACTAACGAATCATTAGCACTGGCATTAATGCTGGTGGTGGTGGCAATCTTAATTAGCCATAAAGAAAAACTGGCGCTGGAGAAAGATATTCTCTGGAGCGTCGGGCGAGCGATAATTCAGCTGATTATTGTCGGCTATGTGCTGAAGTATATTTTCAGCGTGGATGATGCCAGCCTGACATTATTGATGGTGTTATTTATCTGCTTTAATGCGGCGTGGAACGCGCAAAAACGCAGTAAATATATTGCTAAAGCTTTT > CP009273/512021‑512314
|
aaaTGCAGGAAGCACGCTATGAACTCGCATAATATTACTAACGAATCATTAGCACTGGCATTAATGCTGGTGGTGGTGGCAATCTTAATTAGCCATAAAGAAAAACTGGCGCTGGAGAAAGATATTCTCTGGAGCGTCGGGCGAGCGAt < 2:799778/149‑1 (MQ=255)
aaaTGCAGGAAGCACGCTATGAACTCGCATAATATTACTAACGAATCATTAGCACTGGCATTAATGCTGGTGGTGGTGGCAATCTTAATTAGCCATAAAGAAAAACTGGCGCTGGAGAAAGATATTCTCTGGAGCGTCGGGCGAGCGAt < 1:4014052/149‑1 (MQ=255)
aTGCAGGAAGCACGCTATGAACTCGCATAATATTACTAACGAATCATTAGCACTGGCATTAATGCTGGTGGTGGTGGCAATCTTAATTAGCCATAAAGAAAAACTGGCGCTGGAGAAAGATATTCTCTGGAGCGTCGGGCGAGCGATaa > 1:1185078/1‑149 (MQ=255)
aTGCAGGAAGCACGCTATGAACTCGCATAATATTACTAACGAATCATTAGCACTGGCATTAATGCTGGTGGTGGTGGCAATCTTAATTAGCCATAAAGAAAAACTGGCGCTGGAGAAAGATATTCTCTGGAGCGTCGGGCGAGCGATaa > 1:189615/1‑149 (MQ=255)
cAGGAAGCACGCTATGAACTCGCATAATATTACTAACGAATCATTAGCACTGGCATTAATGCTGGTGGTGGTGGCAATCTTAATTAGCCATAAAGAAAAACTGGCGCTGGAGAAAGATATTCTCTGGAGCGTCGGGCGAGCGATAATTc > 2:3000041/1‑149 (MQ=255)
cAGGAAGCACGCTATGAACTCGCATAATATTACTAACGAATCATTAGCACTGGCATTAATGCTGGTGGTGGTGGCAATCTTAATTAGCCATAAAGAAAAACTGGCGCTGGAGAAAGATATTCTCTGGAGCGTCGGGCGAGCGATAATTc < 2:2790515/149‑1 (MQ=255)
gAAGCACGCTATGAACTCGCATAATATTACTAACGAATCATTAGCACTGGCATTAATGCTGGTGGTGGTGGCAATCTTAATTAGCCATAAAGAAAAACTGGCGCTGGAGAAAGATATTCTCTGGAGCGTCGGGCGAGCGATAATTCAGc > 1:2387197/1‑149 (MQ=255)
aaGCACGCTATGAACTCGCATAATATTACTAACGAATCATTAGCACTGGCATTAATGCTGGTGGTGGTGGCAATCTTAATTAGCCATAAAGAAAAACTGGCGCTGGAGAAAGATATTCTCTGGAGCGTCGGGCGAGCGATAATTCAGCt < 2:2217040/149‑1 (MQ=255)
aGCACGCTATGAACTCGCATAATATTACTAACGAATCATTAGCACTGGCATTAATGCTGGTGGTGGTGGCAATCTTAATTAGCCATAAAGAAAAACTGGCGCTGGAGAAAGATATTCTCTGGAGCGTCGGGCGAGCGATAATTCAGCTg > 1:1255199/1‑149 (MQ=255)
aGCACGCTATGAACTCGCATAATATTACTAACGAATCATTAGCACTGGCATTAATGCTGGTGGTGGTGGCAATCTTAATTAGCCATAAAGAAAAACTGGCGCTGGAGAAAGATATTCTCTGGAGCGTCGGGCGAGCGATAATTCAGCTg > 1:2205205/1‑149 (MQ=255)
cACGCTATGAACTCGCATAATATTACTAACGAATCATTAGCACTGGCATTAATGCTGGTGGTGGTGGCAATCTTAATTAGCCATAAAGAAAAACTGGCGCTGGAGAAAGATATTCTCTGGAGCGTCGGGCGAGCGATAATTCAGCTGat > 1:3957532/1‑149 (MQ=255)
cGCTATGAACTCGCATAATATTACTAACGAATCATTAGCACTGGCATTAATGCTGGTGGTGGTGGCAATCTTAATTAGCCATAAAGAAAAACTGGCGCTGGAGAAAGATATTCTCTGGAGCGTCGGGCGAGCGATAATTCAGCTGatta < 1:787063/149‑1 (MQ=255)
cGCTATGAACTCGCATAATATTACTAACGAATCATTAGCACTGGCATTAATGCTGGTGGTGGTGGCAATCTTAATTAGCCATAAAGAAAAACTGGCGCTGGAGAAAGATATTCTCTGGAGCGTCGGGCGAGCGATAATTCAGCTGatta > 1:1617789/1‑149 (MQ=255)
gCTATGAACTCGCATAATATTACTAACGAATCATTAGCACTGGCATTAATGCTGGTGGTGGTGGCAATCTTAATTAGCCATAAAGAAAAACTGGCGCTGGAGAAAGATATTCTCTGGAGCGTCGGGCGAGCGATAATTCAGCTGattat < 2:3486457/149‑1 (MQ=255)
cTCGCATAATATTACTAACGAATCATTAGCACTGGCATTAATGCTGGTGGTGGTGGCAATCTTAATTAGCCATAAAGAAAAACTGGCGCTGGAGAAAGATATTCTCTGGAGCGTCGGGCGAGCGATAATTCAGCTGATTATTGTCGGCt < 2:2225192/149‑1 (MQ=255)
ataataTTACTAACGAATCATTAGCACTGGCATTAATGCTGGTGGTGGTGGCAATCTTAATTAGCCATAAAGAAAAACTGGCGCTGGAGAAAGATATTCTCTGGAGCGTCGGGCGAGCGATAATTCAGCTGATTATTGTCGGCTAtgtg > 1:4570340/1‑149 (MQ=255)
aataTTACTAACGAATCATTAGCACTGGCATTAATGCTGGTGGTGGTGGCAATCTTAATTAGCCATAAAGAAAAACTGGCGCTGGAGAAAGATATTCTCTGGAGCGTCGGGCGAGCGATAATTCAGCTGATTATTGTCGGCTATGTGCt < 1:3294151/149‑1 (MQ=255)
tatTACTAACGAATCATTAGCACTGGCATTAATGCTGGTGGTGGTGGCAATCTTAATTAGCCATAAAGAAAAACTGGCGCTGGAGAAAGATATTCTCTGGAGCGTCGGGCGAGCGATAATTCAGCTGATTATTGTCGGCTATGTGCTGa > 2:2911575/1‑149 (MQ=255)
aaCGAATCATTAGCACTGGCATTAATGCTGGTGGTGGTGGCAATCTTAATTAGCCATAAAGAAAAACTGGCGCTGGAGAAAGATATTCTCTGGAGCGTCGGGCGAGCGATAATTCAGCTGATTATTGTCGGCTATGTGCTGAAGTatat > 1:2343695/1‑149 (MQ=255)
gAATCATTAGCACTGGCATTAATGCTGGTGGTGGTGGCAATCTTAATTAGCCATAAAGAAAAACTGGCGCTGGAGAAAGATATTCTCTGGAGCGTCGGGCGAGCGATAATTCAGCTGATTATTGTCGGCTATGTGCTGAAGTATAtttt < 1:2823197/149‑1 (MQ=255)
aaTCATGAGCACTGGCATTAATGCTGGTGGTGGTGGCAATCTTAATTAGCCATAAAGAAAAACTGGCGCTGGAGAAAGATATTCTCTGGAGCGTCGGGCGAGCGATAATTCAGCTGATTATTGTCGGCTATGTGCTGAAGTATATTTTc < 2:511991/149‑1 (MQ=255)
aTCATTAGCACTGGCATTAATGCTGGTGGTGGTGGCAATCTTAATTAGCCATAAAGAAAAACTGGCGCTGGAGAAAGATATTCTCTGGAGCGTCGGGCGAGCGATAATTCAGCTGATTATTGTCGGCTATGTGCTGAAGTATATTTTCa > 2:1192925/1‑149 (MQ=255)
aTCATTAGCACTGGCATTAATGCTGGTGGTGGTGGCAATCTTAATTAGCCATAAAGAAAAACTGGCGCTGGAGAAAGATATTCTCTGGAGCGTCGGGCGAGCGATAATTCAGCTGATTATTGTCGGCTATGTGCTGAAGTATATTTTCa < 1:3259073/149‑1 (MQ=255)
cACTGGCATTAATGCTGGTGGTGGTGGCAATCTTAATTAGCCATAAAGAAAAACTGGCGCTGGAGAAAGATATTCTCTGGAGCGTCGGGCGAGCGATAATTCAGCTGATTATTGTCGGCTATGTGCTGAAGTATATTTTCAGCGTGgat < 2:1690705/149‑1 (MQ=255)
tGGCATTAATGCTGGTGGTGGTGGCAATCTTAATTAGCCATAAAGAAAAACTGGCGCTGGAGAAAGATATTCTCTGGAGCGTCGGGCGAGCTATAATTCAGCTGATTATTGTCGGCTATGTGCTGAAGTATATTTTCAGCGTGgatgat < 1:418667/149‑1 (MQ=255)
tGGCATTAATGCTGGTGGTGGTGGCAATCTTAATTAGCCATAAAGAAAAACTGGCGCTGGAGAAAGATATTCTCTGGAGCGTCGGGCGAGCTATAATTCAGCTGAGTATTGTCGGCTATGTGCTGAAGTATATTTTCAGCGTGgatgat < 1:3050752/149‑1 (MQ=255)
tGGCATTAATGCTGGTGGTGGTGGCAATCTTAATTAGCCATAAAGAAAAACTGGCGCTGGAGAAAGATATTCTCTGGAGCGTCGGGCGAGCGATAATTCAGCTGATTATTGTCGGCTATGTGCTGAAGTATATTTTCAGCGTGgatgat > 1:597848/1‑149 (MQ=255)
cATTAATGCTGGTGGTGGTGGCAATCTTAATTAGCCATAAAGAAAAACTGGCGCTGGAGAAAGATATTCTCTGGAGCGTCGGGCGAGCGATAATTCAGCTGATTATTGTCGGCTATGTGCTGAAGTATATTTTCAGCGTGGATGATGcc < 2:1101859/149‑1 (MQ=255)
cATTAATGCTGGTGGTGGTGGCAATCTTAATTAGCCATAAAGAAAAACTGGCGCTGGAGAAAGATATTCTCTGGAGCGTCGGGCGAGCGATAATTCAGCTGATTATTGTCGGCTATGTGCTGAAGTATATTTTCAGCGTGGATGATGcc < 2:2930682/149‑1 (MQ=255)
aTTAATGCTGGTGGTGGTGGCAATCTTAATTAGCCATAAAGAAAAACTGGCGCTGGAGAAAGATATTCTCTGGAGCGTCGGGCGAGCGATAATTCAGCTGATTATTGTCGGCTATGTGCTGAAGTATATTTTCAGCGTGGATGATGCCa < 1:2718648/149‑1 (MQ=255)
tAATGCTGGTGGTGGTGGCAATCTTAATTAGCCATAAAGAAAAACTGGCGCTGGAGAAAGATATTCTCTGGAGCGTCGGGCGAGCGATAATTCAGCTGATTATTGTCGGCTATGTGCTGAAGTATATTTTCAGCGTGGATGATGCCAGc < 2:4631009/149‑1 (MQ=255)
aaTGCTGGTGGTGGTGGCAATCTTAATTAGCCATAAAGAAAAACTGGCGCTGGAGAAAGATATTCTCTGGAGCGTCGGGCGAGCGATAATTCAGCTGATTATTGTCGGCTATGTGCTGAAGTATATTTTCAGCGTGGATGATGCCAGcc < 1:1266491/149‑1 (MQ=255)
ggtggtggtggCAATCTTAATTAGCCATAAAGAAAAACTGGCGCTGGAGAAAGATATTCTCTGGAGCGTCGGGCGAGCGATAATTCAGCTGATTATTGTCGGCTATGTGCTGAAGTATATTTTCAGCGTGGATGATGCCAGCCTGACat < 1:4504390/149‑1 (MQ=255)
gtggtggtggCAATCTTAATTAGCCATAAAGAAAAACTGGCGCTGGAGAAAGATATTCTCTGGAGCGTCGGGCGAGCGATAATTCAGCTGATTATTGTCGGCTATGTGCTGAAGTATATTTTCAGCGTGGATGATGCCAGCCTGACatt < 1:409476/149‑1 (MQ=255)
gtggtggtggCAATCTTAATTAGCCATAAAGAAAAACTGGCGCTGGAGAAAGATATTCTCTGGAGCGTCGGGCGAGCGATAATTCAGCTGATTATTGTCGGCTATGTGCTGAAGTATATTTTCAGCGTGGATGATGCCAGCCTGACatt < 2:269794/149‑1 (MQ=255)
ggtggtggCAATCTTAATTAGCCATAAAGAAAAACTGGCGCTGGAGAAAGATATTCTCTGGAGCGTCGGGCGAGCGATAATTCAGCTGATTATTGTCGGCTATGTGCTGAAGTATATTTTCAGCGTGGATGATGCCAGCCTGACattat < 1:863826/149‑1 (MQ=255)
ggtggCAATCTTAATTAGCCATAAAGAAAAACTGGCGCTGGAGAAAGATATTCTCTGGAGCGTCGGGCGAGCGATAATTCAGCTGATTATTGTCGGCTATGTGCTGAAGTATATTTTCAGCGTGGATGATGCCAGCCTGACATTATTGa > 2:2312383/1‑149 (MQ=255)
gtggCAATCTTAATTAGCCATAAAGAAAAACTGGCGCTGGAGAAAGATATTCTCTGGAGCGTCGGGCGAGCGATACTTCAGCTGATTATTGTCGGCTATGTGCTGAAGTATATTTTCAGCGTGGATGATGCCAGCCTGACATTATTGAt > 2:1801784/1‑149 (MQ=255)
gtggCAATCTTAATTAGCCATAAAGAAAAACTGGCGCTGGAGAAAGATATTCTCTGGAGCGTCGGGCGAGCGATAATTCAGCTGATTATTGTCGGCTATGTGCTGAAGTATATTTTCAGCGTGGATGATGCCAGCCTGACATTATTGAt < 1:2581415/149‑1 (MQ=255)
gtggCAATCTTAATTAGCCATAAAGAAAAACTGGCGCTGGAGAAAGATATTCTCTGGAGCGTCGGGCGAGCGATAATTCAGCTGATTATTGTCGGCTATGTGCTGAAGTATATTTTCAGCGTGGATGATGCCAGCCTGACATTATTGAt < 1:6670/149‑1 (MQ=255)
tggCAATCTTAATTAGCCATAAAGAAAAACTGGCGCTGGAGAAAGATATTCTCTGGAGCGTCGGGCGAGCTATAATTCAGCTGATTATTGTCGGCTATGTGCTGAAGTATATTTTCAGCGTGGATGATGCCAGCCTGACATTATTGATg > 1:4475067/1‑149 (MQ=255)
ggCAATCTTAATTAGCCATAAAGAAAAACTGGCGCTGGAGAAAGATATTCTCTGGAGCGTCGGGCGAGCGATAATTCAGCTGATTATTGTCGGCTATGTGCTGAAGTATATTTTCAGCGTGGATGATGCCAGCCTGACATTATTGATgg > 2:4174275/1‑149 (MQ=255)
gCAATCTTAATTAGCCATAAAGAAAAACTGGCGCTGGAGAAAGATATTCTCTGGAGCGTCGGGCGAGCGATAATTCAGCTGATTATTGTCGGCTATGTGCTGAAGTATATTTTCAGCGTGGATGATGCCAGCCTGACATTATTGATGgt < 1:4384968/149‑1 (MQ=255)
gCAATCTTAATTAGCCATAAAGAAAAACTGGCGCTGGAGAAAGATATTCTCTGGAGCGTCGGGCGAGCGATAATTCAGCTGATTATTGTCGGCTATGTGCTGAAGTATATTTTCAGCGTGGATGATGCCAGCCTGACATTATTGATGgt > 1:4028557/1‑149 (MQ=255)
aTCTTAATTAGCCATAAAGAAAAACTGGCGCTGGAGAAAGATATTCTCTGGAGCGTCGGGCGAGCGATAATTCAGCTGATTATTGTCGGCTATGTGCTGAAGTATATTTTCAGCGTGGATGATGCCAGCCTGACATTATTGATGGTGtt < 1:2435226/149‑1 (MQ=255)
ttAATTAGCCATAAAGAAAAACTGGCGCTGGAGAAAGATATTCTCTGGAGCGTCGGGCGAGCGATAATTCAGCTGATTATTGTCGGCTATGTGCTGAAGTATATTTTCAGCGTGGATGATGCCAGCCTGACATTATTGATGGTGttatt < 1:4630586/149‑1 (MQ=255)
ttAATTAGCCATAAAGAAAAACTGGCGCTGGAGAAAGATATTCTCTGGAGCGTCGGGCGAGCGATAATTCAGCTGATTATTGTCGGCTATGTGCTGAAGTATATTTTCAGCGTGGATGATGCCAGCCTGACATTATTGATGGTGttatt > 1:940279/1‑149 (MQ=255)
ttAATTAGCCATAAAGAAAAACTGGCGCTGGAGAAAGATATTCTCTGGAGCGTCGGGCGAGCGATAATTCAGCTGATTATTGTCGGCTATGTGCTGAAGTATATTTTCAGCGTGGATGATGCCAGCCTGACATTATTGATGGTGttatt > 1:2179209/1‑149 (MQ=255)
aaTTAGCCATAAAGAAAAACTGGCGCTGGAGAAAGATATTCTCTGGAGCGTCGGGCGAGCGATAATTCAGCTGATTATTGTCGGCTATGTGCTGAAGTATATTTTCAGCGTGGATGATGCCAGCCTGACATTATTGATGGTGttattta > 1:4334183/1‑149 (MQ=255)
aaTTAGCCATAAAGAAAAACTGGCGCTGGAGAAAGATATTCTCTGGAGCGTCGGGCGAGCGATAATTCAGCTGATTATTGTCGGCTATGTGCTGAAGTATATTTTCAGCGTGGATGATGCCAGCCTGACATTATTGATGGTGttattta > 1:1690202/1‑149 (MQ=255)
ttAGCCATAAAGAAAAACTGGCGCTGGAGAAAGATATTCTCTGGAGCGTCGGGCGAGCGATAATTCAGCTGATTATTGTCGGCTATGTGCTGAAGTATATTTTCAGCGTGGATGATGCCAGCCTGACATTATTGATGGTGTTATTTATc < 2:4699493/149‑1 (MQ=255)
tAGCCATAAAGAAAAACTGGCGCTGGAGAAAGATATTCTCTGGAGCGTCGGGCGAGCGATAATTCAGCTGATTATTGTCGGCTATGTGCTGAAGTATATTTTCAGCGTGGATGATGCCAGCCTGACATTATTGATGGTGTTATTTATCt < 2:614155/149‑1 (MQ=255)
aGCCATAAAGAAAAACTGGCGCTGGAGAAAGATATTCTCTGGAGCGTCGGGCGAGCGATAATTCAGCTGATTATTGTCGGCTATGTGCTGAAGTATATTTTCAGCGTGGATGATGCCAGCCTGACATTATTGATGGTGTTATTTATCTg > 2:3707681/1‑149 (MQ=255)
gCCATAAAGAAAAACTGGCGCTGGAGAAAGATATTCTCTGGAGCGTCGGGCGAGCGATAATTCAGCTGATTATTGTCGGCTATGTGCTGAAGTATATTTTCAGCGTGGATGATGCCAGCCTGACATTATTGATGGTGTTATTTATCTGc > 2:3841576/1‑149 (MQ=255)
gCCATAAAGAAAAACTGGCGCTGGAGAAAGATATTCTCTGGAGCGTCGGGCGAGCGATAATTCAGCTGATTATTGTCGGCTATGTGCTGAAGTATATTTTCAGCGTGGATGATGCCAGCCTGACATTATTGATGGTGTTATTTATCTGc < 2:2846146/149‑1 (MQ=255)
gCCATAAAGAAAAACTGGCGCTGGAGAAAGATATTCTCTGGAGCGTCGGGCGAGCGATAATTCAGCTGATTATTGTCGGCTATGTGCTGAAGTATATTTTCAGCGTGGATGATGCCAGCCTGACATTATTGATGGTGTTATTTATCTGc > 1:4582782/1‑149 (MQ=255)
gCCATAAAGAAAAACTGGCGCTGGAGAAAGATATTCTCTGGAGCGTCGGGCGAGCGATAATTCAGCTGATTATTGTCGGCTATGTGCTGAAGTATATTTTCAGCGTGGATGATGCCAGCCTGACATTATTGATGGTGTTATTTATCTGc > 2:2588868/1‑149 (MQ=255)
cATAAAGAAAAACTGGCGCTGGAGAAAGATATTCTCTGGAGCGTCGGGCGAGCGATAATTCAGCTGATTATTGTCGGCTATGTGCTGAAGTATATTTTCAGCGTGGATGATGCCAGCCTGACATTATTGATGGTGTTATTTATCTGCtt < 2:3087591/149‑1 (MQ=255)
tAAAGAAAAACTGGCGCTGGAGAAAGATATTCTCTGGAGCGTCGGGCGAGCGATAATTCAGCTGATTATTGTCGGCTATGTGCTGAAGTATATTTTCAGCGTGGATGATGCCAGCCTGACATTATTGATGGTGTTATTTATCTGCTTTa > 1:110002/1‑149 (MQ=255)
aaGAAAAACTGGCGCTGGAGAAAGATATTCTCTGGAGCGTCGGGCGAGCGGTAATTCAGCTGATTATTGTCGGCTATGTGCTGAAGTATATTTTCAGCGTGGATGATGCCAGCCTGACATTATTGATGGTGTTATTTATCTGCTTTAAt > 1:902724/1‑149 (MQ=255)
aGAAAAACTGGCGCTGGAGAAAGATATTCTCTGGAGCGTCGGGCGAGCGATAATTCAGCTGATTATTGTCGGCTATGTGCTGAAGTATATTTTCAGCGTGGATGATGCCAGCCTGACATTATTGATGGTGTTATTTATCTGCTTTAATg > 1:3799352/1‑149 (MQ=255)
aGAAAAACTGGCGCTGGAGAAAGATATTCTCTGGAGCGTCGGGCGAGCGATAATTCAGCTGATTATTGTCGGCTATGTGCTGAAGTATATTTTCAGCGTGGATGATGCCAGCCTGACATTATTGATGGTGTTATTTATCTGCTTTAATg > 2:3402999/1‑149 (MQ=255)
aGAAAAACTGGCGCTGGAGAAAGATATTCTCTGGAGCGTCGGGCGAGCGATAATTCAGCTGATTATTGTCGGCTATGTGCTGAAGTATATTTTCAGCGTGGATGATGCCAGCCTGACATTATTGATGGTGTTATTTATCTGCTTTAATg > 2:1341157/1‑149 (MQ=255)
gAAAAACTGGCGCTGGAGAAAGATATTCTCTGGAGCGTCGGGCGAGCGATAATTCAGCTGATTATTGTCGGCTATGTGCTGAAGTATATTTTCAGCGTGGATGATGCCAGCCTGACATTATTGATGGTGTTATTTATCTGCTTTAATgc < 1:3447836/149‑1 (MQ=255)
gAAAAACTGGCGCTGGAGAAAGATATTCTCTGGAGCGTCGGGCGAGCGATAATTCAGCTGATTATTGTCGGCTATGTGCTGAAGTATATTTTCAGCGTGGATGATGCCAGCCTGACATTATTGATGGTGTTATTTATCTGCTTTAATgc > 2:3296299/1‑149 (MQ=255)
gAAAAACTGGCGCTGGAGAAAGATATTCTCTGGAGCGTCGGGCGAGCGATAATTCAGCTGATTATTGTCGGCTATGTGCTGAAGTATACTTTCAGCGTGGATGATGCCAGCCTGACATTATTGATGGTGTTATTTATCTGCTTTAATgc > 1:3930379/1‑149 (MQ=255)
aaaaCTGGCGCTGGAGAAAGATATTCTCTGGAGCGTCGGGCGAGCGATAATTCAGCTGATTATTGTCGGCTATGTGCTGAAGTATATTTTCAGCGTGGATGATGCCAGCCTGACATTATTGATGGTGTTATTTATCTGCTTTAATgcgg < 2:4596829/149‑1 (MQ=255)
aaaaCTGGCGCTGGAGAAAGATATTCTCTGGAGCGTCGGGCGAGCGATAATTCAGCTGATTATTGTCGGCTATGTGCTGAAGTATATTTTCAGCGTGGATGATGCCAGCCTGACATTATTGATGGTGTTATTTATCTGCTTTAATgcgg > 2:3181383/1‑149 (MQ=255)
aaCTGGCGCTGGAGAAAGATATTCTCTGGAGCGTCGGGCGAGCGATAATTCAGCTGATTATTGTCGGCTATGTGCTGAAGTATATTTTCAGCGTGGATGATGCCAGCCTGACATTATTGATGGTGTTATTTATCTGCTTTAATgcggcg > 1:3720090/1‑149 (MQ=255)
aaCTGGCGCTGGAGAAAGATATTCTCTGGAGCGTCGGGCGAGCGATAATTCAGCTGATTATTGTCGGCTATGTGCTGAAGTATATTTTCAGCGTGGATGATGCCAGCCTGACATTATTGATGGTGTTATTTATCTGCTTTAATgcggcg > 1:4672514/1‑149 (MQ=255)
aCTGGCGCTGGAGAAAGATATTCTCTGGAGCGTCGGGCGAGCGATAATTCAGCTGATTATTGTCGGCTATGTGCTGAAGTATATTTTCAGCGTGGATGATGCCAGCCTGACATTATTGATGGTGTTATTTATCTGCTTTAATGCGGCGt > 1:2052675/1‑149 (MQ=255)
tGGCGCTGGAGAAAGATATTCTCTGGAGCGTCGGGCGAGCTATAATTCAGCTGATTATTGTCGGCTATGTGCTGAAGTATATTTTCAGCGTGGATGATGCCAGCCTGACATTATTGATGGTGTTATTTATCTGCTTTAATGCGGCGTgg < 1:115542/149‑1 (MQ=255)
ggCGCTGGAGAAAGATATTCTCTGGAGCGTCGGGCGAGCGATAATTCAGCTGATTATTGTCGGCTATGTGCTGAAGTATATTTTCAGCGTGGATGATGCCAGCCTGACATTATTGATGGTGTTATTTATCTGCTTTAATGCGGCGTGGa > 1:309704/1‑149 (MQ=255)
cTGGAGAAAGATATTCTCTGGAGCGTCGGGCGAGCGATAATTCAGCTGATTATTGTCGGCTATGTGCTGAAGTATATTTTCAGCGTGGATGATGCCAGCCTGACATTATTGATGGTGTTATTTATCTGCTTTAATGCGGCGTGGAAcgc < 2:1014096/149‑1 (MQ=255)
cTGGAGAAAGATATTCTCTGGAGCGTCGGGCGAGCGATAATTCAGCTGATTATTGTCGGCTATGTGCTGAAGTATATTTTCAGCGTGGATGATGCCAGCCTGACATTATTGATGGTGTTATTTATCTGCTTTAATGCGGCGTGGAAcgc < 1:14615/149‑1 (MQ=255)
tGGAGAAAGATATTCTCTGGAGCGTCGGGCGAGCGATAATTCAGCTGATTATTGTCGGCTATGTGCTGAAGTATATTTTCAGCGTGGATGATGCCAGCCTGACATTATTGATGGTGTTATTTATCTGCTTTAATGCGGCGTGGAAcgcg > 1:1384977/1‑149 (MQ=255)
aaGATATTCTCTGGAGCGTCGGGCGAGCGATAATTCAGCTGATTATTGTCGGCTATGTGCTGAAGTATATTTTCAGCGTGGATGATGCCAGCCTGACATTATTGATGGTGTTATTTATCTGCTTTAATGCGGCGTGGAACGCGCaaaaa < 2:3628196/149‑1 (MQ=255)
aaGATATTCTCTGGAGCGTCGGGCGAGCGATAATTCAGCTGATTATTGTCGGCTATGTGCTGAAGTATATTTTCAGCGTGGATGATGCCAGCCTGACATTATTGATGGTGTTATTTATCTGCTTTAATGCGGCGTGGAACGCGCaaaaa > 2:163654/1‑149 (MQ=255)
aGATATTCTCTGGAGCGTCGGGCGAGCGATAATTCAGCTGATTATTGTCGGCTATGTGCTGAAGTATATTTTCAGCGTGGATGATGCCAGCCTGACATTATTGATGGTGTTATTTATCTGCTTTAATGCGGCGTGGAACGCGCAAAAAc < 2:2318259/149‑1 (MQ=255)
atatTCTCTGGAGCGTCGGGCGAGCGATAATTCAGCTGATTAGTGTCGGCTATGTGCTGAAGTATATTTTCAGCGTGGATGATGCCAGCCTGACATTATTGATGGTGTTATTTATCTGCTTTAATGCGGCGTGGAACGCGCAAAAACGc < 2:1402895/149‑1 (MQ=255)
tatTCTCTGGAGCGTCGGGCGAGCTATAATTCAGCTGATTATTGTCGGCTATGTGCTGAAGTATATTTTCAGCGTGGATGATGCCAGCCTGACATTATTGATGGTGTTATTTATCTGCTTTAATGCGGCGTGGAACGCGCAAAAACGCa < 2:501650/149‑1 (MQ=255)
ttCTCTGGAGCGTCGGGCGAGCGATAATTCAGCTGATTATTGTCGGCTATGTGCTGAAGTATATTTTCAGCGTGGATGATGCCAGCCTGACATTATTGATGGTGTTATTTATCTGCTTTAATGCGGCGTGGAACGCGCAAAAACGCAGt > 2:3100515/1‑149 (MQ=255)
ttCTCTGGAGCGTCGGGCGAGCGATAATTCAGCTGATTATTGTCGGCTATGTGCTGAAGTATATTTTCAGCGTGGATGATGCCAGCCTGACATTATTGATGGTGTTATTTATCTGCTTTAATGCGGCGTGGAACGCGCAAAAACGCAGt > 1:292851/1‑149 (MQ=255)
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agcgaTAAGTCAGCTGATTATTGTCGGCTATGTGCTGAAGTATATTTTCAGCGTGGATGATGCCAGCCTGACATTATTGATGGTGTTATTTATCTGCTTTAATGCGGCGTGGAACGCGCAAAAACGCAGTAAATATATTGCTAAAGCtt < 1:3191348/149‑1 (MQ=255)
|
AAATGCAGGAAGCACGCTATGAACTCGCATAATATTACTAACGAATCATTAGCACTGGCATTAATGCTGGTGGTGGTGGCAATCTTAATTAGCCATAAAGAAAAACTGGCGCTGGAGAAAGATATTCTCTGGAGCGTCGGGCGAGCGATAATTCAGCTGATTATTGTCGGCTATGTGCTGAAGTATATTTTCAGCGTGGATGATGCCAGCCTGACATTATTGATGGTGTTATTTATCTGCTTTAATGCGGCGTGGAACGCGCAAAAACGCAGTAAATATATTGCTAAAGCTTTT > CP009273/512021‑512314
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
